Heatmap: Cluster_211 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102916	0.49	0.49	0.59	0.66	0.68	0.76	0.59	0.52	0.48	0.49	0.52	0.55	0.31	0.19	0.19	0.33	0.48	0.48	0.34	0.0	0.17	0.24	0.7	0.54	1.0	0.46	0.36	0.32	0.5	0.52	0.47	0.51
Smo104906	0.35	0.46	0.45	0.49	0.45	0.43	0.45	0.36	0.37	0.35	0.34	0.37	0.11	0.14	0.1	0.27	0.44	0.36	0.57	0.02	0.05	0.0	0.32	0.27	0.35	1.0	0.8	0.89	0.41	0.43	0.32	0.25
Smo110074	0.51	0.59	0.67	0.69	0.71	0.83	0.51	0.52	0.53	0.44	0.43	0.4	0.61	0.64	0.5	0.7	0.79	0.71	0.75	0.03	0.06	0.02	1.0	0.88	0.11	0.32	0.54	0.71	0.62	0.76	0.51	0.49
Smo111765	0.71	0.42	0.43	0.53	0.57	0.54	0.69	0.81	0.98	0.77	0.89	0.72	0.6	0.56	0.84	0.67	0.6	0.47	0.82	0.32	0.67	0.26	0.66	0.68	0.14	1.0	0.77	0.53	0.79	0.81	0.78	0.93
Smo118063	0.49	0.5	0.48	0.47	0.54	0.51	0.54	0.57	0.5	0.51	0.55	0.49	0.44	0.68	0.7	0.55	0.41	0.4	0.68	0.2	0.22	0.17	0.48	0.46	0.58	0.86	1.0	0.96	0.44	0.43	0.48	0.44
Smo118982	0.49	0.52	0.52	0.57	0.58	0.57	0.65	0.64	0.67	0.68	0.67	0.61	0.56	0.58	0.5	0.53	0.44	0.38	0.73	0.1	0.26	0.13	0.8	1.0	0.79	0.98	0.81	0.97	0.5	0.53	0.42	0.37
Smo127964	0.26	0.27	0.2	0.22	0.26	0.22	0.16	0.32	0.27	0.38	0.29	0.31	0.07	0.26	0.19	0.35	0.06	0.11	0.43	0.01	0.0	0.04	0.09	0.17	0.6	1.0	0.75	0.44	0.07	0.07	0.06	0.04
Smo140962	0.73	0.63	0.59	0.59	0.61	0.6	0.55	0.6	0.61	0.64	0.61	0.59	0.48	0.3	0.27	0.5	0.52	0.51	0.67	0.14	0.33	0.03	0.57	0.62	0.93	0.66	0.85	0.86	0.56	0.61	1.0	0.98
Smo143846	0.53	0.45	0.39	0.53	0.53	0.54	0.5	0.58	0.64	0.6	0.64	0.54	0.45	0.46	0.5	0.53	0.41	0.4	0.82	0.08	0.13	0.08	0.65	0.71	0.29	0.88	0.92	0.83	0.49	0.53	0.97	1.0
Smo147913	0.45	0.48	0.43	0.44	0.47	0.45	0.41	0.36	0.4	0.41	0.41	0.41	0.35	0.36	0.11	0.5	0.19	0.22	0.78	0.02	0.07	0.0	0.28	0.32	0.17	1.0	0.73	0.66	0.38	0.33	0.87	0.66
Smo147933	0.41	0.45	0.29	0.27	0.25	0.19	0.16	0.18	0.19	0.21	0.22	0.27	0.37	0.34	0.12	0.41	0.15	0.2	0.52	0.02	0.04	0.0	0.11	0.15	0.29	1.0	0.38	0.43	0.16	0.19	0.09	0.15
Smo148418	0.45	0.53	0.56	0.6	0.63	0.63	0.58	0.52	0.51	0.46	0.43	0.39	0.46	0.5	0.33	0.57	0.51	0.37	0.65	0.09	0.26	0.06	0.57	0.54	0.37	0.7	0.96	1.0	0.48	0.49	0.45	0.45
Smo149210	0.42	0.38	0.27	0.23	0.24	0.19	0.18	0.2	0.24	0.22	0.23	0.23	0.23	0.21	0.08	0.52	0.11	0.26	0.83	0.01	0.12	0.0	0.18	0.2	0.14	1.0	0.52	0.5	0.26	0.26	0.34	0.38
Smo150195	0.51	0.52	0.55	0.58	0.56	0.55	0.53	0.63	0.7	0.72	0.68	0.58	0.38	0.53	0.47	0.38	0.42	0.3	0.4	0.17	0.29	0.11	0.67	0.62	0.86	1.0	0.53	0.61	0.45	0.47	0.41	0.35
Smo165705	0.33	0.27	0.27	0.24	0.17	0.18	0.32	0.48	0.46	0.48	0.44	0.36	0.12	0.02	0.01	0.48	0.33	0.35	0.84	0.11	0.27	0.0	0.37	0.36	0.46	1.0	0.22	0.22	0.48	0.45	0.38	0.32
Smo172529	0.47	0.39	0.46	0.43	0.46	0.48	0.39	0.56	0.55	0.55	0.6	0.48	0.62	0.51	0.45	0.66	0.44	0.34	0.65	0.25	0.55	0.1	0.69	0.8	0.84	1.0	0.54	0.5	0.5	0.49	0.36	0.37
Smo173629	0.6	0.49	0.54	0.55	0.7	0.69	0.71	0.89	0.96	1.0	0.91	0.85	0.63	0.76	0.72	0.62	0.45	0.46	0.66	0.28	0.55	0.32	0.57	0.67	0.57	0.82	0.67	0.71	0.62	0.6	0.35	0.36
Smo179756	0.37	0.41	0.5	0.55	0.55	0.52	0.69	0.81	0.72	0.69	0.59	0.43	0.46	0.69	0.48	0.62	0.45	0.31	0.56	0.0	0.05	0.01	0.42	0.43	0.1	0.86	0.97	1.0	0.55	0.59	0.77	0.71
Smo230356	0.59	0.61	0.71	0.64	0.55	0.6	0.55	0.6	0.54	0.58	0.59	0.58	0.43	0.34	0.37	0.4	0.37	0.3	0.69	0.17	0.58	0.08	0.42	0.41	0.67	1.0	0.5	0.48	0.5	0.5	0.3	0.32
Smo231563	0.53	0.49	0.44	0.57	0.63	0.48	0.61	1.0	0.94	0.9	0.97	0.75	0.7	0.68	0.73	0.76	0.45	0.36	0.78	0.13	0.5	0.37	0.58	0.65	0.31	0.66	0.52	0.41	0.62	0.59	0.35	0.43
Smo234236	0.62	0.64	0.66	0.68	0.76	0.68	0.73	0.91	0.91	0.87	0.77	0.73	0.57	0.48	0.53	0.78	0.66	0.4	0.91	0.17	0.31	0.37	0.77	0.79	0.88	1.0	0.6	0.65	0.8	0.77	0.6	0.52
Smo234911	0.58	0.56	0.57	0.72	0.67	0.65	0.59	0.55	0.77	0.76	0.72	0.63	0.41	0.54	0.32	0.56	0.4	0.35	0.75	0.07	0.53	0.02	0.83	0.92	0.28	1.0	0.67	0.81	0.4	0.46	0.27	0.41
Smo267465	0.62	0.6	0.56	0.56	0.63	0.64	0.46	0.52	0.54	0.48	0.46	0.43	0.58	0.38	0.16	0.72	0.6	0.83	0.7	0.01	0.09	0.01	1.0	0.99	0.12	0.71	0.53	0.57	0.57	0.62	0.46	0.45
Smo270214	0.49	0.49	0.5	0.53	0.54	0.5	0.51	0.58	0.59	0.6	0.56	0.57	0.41	0.68	0.54	0.37	0.41	0.34	0.58	0.12	0.41	0.12	0.5	0.55	0.42	1.0	0.66	0.64	0.43	0.45	0.38	0.38
Smo270329	0.5	0.46	0.51	0.52	0.57	0.52	0.53	0.67	0.78	0.82	0.84	0.76	0.7	0.45	0.58	0.73	0.46	0.35	0.61	0.16	0.44	0.15	0.57	0.73	0.95	1.0	0.47	0.51	0.65	0.64	0.54	0.53
Smo410232	0.5	0.43	0.4	0.5	0.55	0.51	0.57	0.64	0.67	0.53	0.54	0.52	0.34	0.43	0.36	0.45	0.51	0.52	0.68	0.0	0.09	0.01	0.44	0.46	0.35	1.0	1.0	0.94	0.6	0.6	0.85	0.82
Smo419336	0.65	0.62	0.78	0.66	0.71	0.75	0.72	0.79	0.75	0.73	0.61	0.65	0.03	0.03	0.04	0.05	0.29	0.59	0.75	0.07	0.36	0.11	0.58	0.58	0.58	1.0	0.77	0.51	0.37	0.35	0.4	0.62
Smo422623	0.43	0.3	0.28	0.34	0.36	0.25	0.33	0.35	0.39	0.37	0.54	0.44	0.27	0.09	0.22	0.41	0.46	0.4	0.72	0.15	0.37	0.55	0.53	0.53	0.45	1.0	0.39	0.46	0.46	0.54	0.51	0.48
Smo423173	0.36	0.42	0.43	0.42	0.46	0.45	0.47	0.45	0.45	0.44	0.38	0.33	0.34	0.37	0.39	0.6	0.33	0.42	0.75	0.07	0.13	0.04	0.29	0.32	0.32	1.0	0.66	0.73	0.49	0.54	0.46	0.52
Smo426330	0.63	0.52	0.45	0.54	0.53	0.55	0.52	0.62	0.63	0.5	0.83	0.71	0.69	0.29	0.25	0.86	0.74	0.52	0.78	0.06	0.53	0.47	1.0	0.97	0.76	1.0	0.44	0.45	0.75	0.69	0.82	0.67
Smo427724	0.4	0.34	0.39	0.45	0.42	0.45	0.51	0.68	0.62	0.63	0.57	0.51	0.37	0.25	0.29	0.48	0.41	0.33	0.35	0.08	0.47	0.18	0.57	0.61	1.0	0.71	0.73	0.74	0.49	0.5	0.59	0.47
Smo43841	0.3	0.28	0.23	0.23	0.21	0.19	0.16	0.25	0.2	0.25	0.22	0.26	0.25	0.34	0.03	0.26	0.09	0.05	0.27	0.05	0.16	0.0	0.07	0.06	0.28	1.0	0.38	0.37	0.12	0.11	0.09	0.08
Smo438663	0.42	0.48	0.47	0.46	0.52	0.54	0.51	0.57	0.6	0.58	0.58	0.47	0.6	0.46	0.5	0.6	0.38	0.28	0.57	0.36	0.24	0.28	0.58	0.66	0.53	1.0	0.7	0.8	0.41	0.4	0.2	0.2
Smo440557	0.31	0.33	0.29	0.29	0.18	0.11	0.1	0.06	0.05	0.05	0.06	0.11	0.28	0.07	0.03	0.29	0.34	0.28	0.83	0.02	0.09	0.0	0.28	0.41	0.1	1.0	0.13	0.13	0.28	0.3	0.42	0.45
Smo441645	0.48	0.52	0.55	0.59	0.64	0.6	0.66	0.71	0.59	0.57	0.57	0.52	0.5	0.54	0.55	0.56	0.43	0.28	0.5	0.01	0.08	0.13	0.44	0.41	0.45	0.88	0.94	1.0	0.47	0.5	0.32	0.3
Smo441764	0.68	0.58	0.52	0.62	0.72	0.61	0.58	0.71	0.72	0.72	0.65	0.75	0.66	0.52	0.46	0.65	0.59	0.46	0.93	0.24	0.9	0.13	0.73	0.76	0.61	1.0	0.71	0.57	0.75	0.68	0.58	0.55
Smo441904	0.18	0.21	0.24	0.31	0.37	0.28	0.28	0.34	0.22	0.2	0.2	0.18	0.28	0.16	0.01	0.55	0.17	0.09	0.38	0.01	0.04	0.0	0.19	0.19	0.28	1.0	0.67	0.68	0.26	0.26	0.2	0.15
Smo442281	0.41	0.39	0.47	0.54	0.68	0.7	0.6	0.65	0.52	0.53	0.52	0.47	0.26	0.07	0.07	0.45	0.59	0.33	0.72	0.24	0.12	0.0	0.55	0.38	0.48	0.82	0.83	1.0	0.48	0.38	0.97	0.84
Smo442676	0.87	0.88	0.85	0.76	0.83	0.9	0.66	0.67	0.72	0.69	0.75	0.62	0.37	0.17	0.2	0.61	0.73	0.47	0.6	0.16	0.17	0.11	0.76	0.67	0.39	0.5	0.81	0.8	0.92	0.82	0.9	1.0
Smo443883	0.36	0.24	0.2	0.23	0.24	0.34	0.27	0.29	0.27	0.33	0.31	0.32	0.36	0.19	0.12	0.44	0.2	0.3	0.29	0.0	0.07	0.0	0.24	0.22	0.2	1.0	0.74	0.67	0.28	0.29	0.22	0.25
Smo446907	0.64	0.41	0.47	0.44	0.52	0.58	0.75	0.69	0.84	0.96	0.79	0.79	0.44	0.52	0.5	0.73	0.54	0.41	0.89	0.33	0.62	0.12	0.61	0.69	0.53	0.84	1.0	0.91	0.9	0.97	0.57	0.63
Smo448268	0.65	0.79	1.0	0.7	0.8	0.85	0.65	0.77	0.81	0.82	0.85	0.67	0.0	0.0	0.0	0.01	0.61	0.52	0.57	0.0	0.02	0.0	0.65	0.32	1.0	0.3	0.29	0.18	0.67	0.59	0.89	0.6
Smo49619	0.52	0.37	0.52	0.39	0.33	0.3	0.51	0.73	0.72	0.79	0.71	0.66	0.18	0.2	0.13	0.46	0.34	0.55	0.48	0.35	0.38	0.05	0.48	0.5	0.48	1.0	0.3	0.34	0.66	0.65	0.53	0.49
Smo52537	0.41	0.29	0.18	0.19	0.28	0.33	0.37	0.51	0.4	0.54	0.44	0.42	0.28	0.08	0.11	0.42	0.38	0.37	0.43	0.0	0.0	0.1	0.45	0.43	0.39	0.71	0.43	0.41	0.44	0.35	1.0	0.94
Smo54463	0.6	0.62	0.66	0.59	0.58	0.65	0.62	0.69	0.55	0.55	0.6	0.53	0.32	0.26	0.28	0.61	0.5	0.43	0.7	0.01	0.14	0.14	0.42	0.37	0.6	0.82	1.0	0.9	0.53	0.51	0.84	0.66
Smo54652	0.58	0.66	0.72	0.71	0.72	0.82	0.75	0.75	0.8	0.86	0.84	0.75	0.51	0.35	0.25	0.59	0.79	0.36	1.0	0.22	0.57	0.23	0.79	0.75	0.53	0.55	0.58	0.69	0.72	0.76	0.36	0.34
Smo54701	0.46	0.51	0.53	0.57	0.64	0.63	0.53	0.64	0.55	0.54	0.51	0.48	0.7	0.33	0.25	0.88	0.44	0.27	0.59	0.16	0.4	0.09	0.48	0.54	0.65	1.0	0.59	0.81	0.51	0.49	0.29	0.2
Smo62955	0.58	0.54	0.59	0.65	0.64	0.71	0.49	0.53	0.62	0.56	0.54	0.47	0.44	0.53	0.22	0.65	0.59	0.41	0.64	0.17	0.1	0.0	0.99	0.78	0.6	1.0	0.87	0.95	0.52	0.56	0.53	0.5
Smo64025	0.57	0.6	0.7	0.71	0.86	0.84	0.7	0.66	0.57	0.52	0.52	0.46	0.62	0.65	0.15	0.72	0.71	0.42	0.68	0.0	0.05	0.01	0.93	0.85	0.13	0.55	0.9	1.0	0.53	0.5	0.61	0.52
Smo74927	0.54	0.49	0.61	0.63	0.7	0.63	0.66	0.88	0.86	0.85	0.86	0.67	0.83	0.51	0.53	0.89	0.66	0.46	0.84	0.19	0.47	0.59	0.72	0.79	0.47	1.0	0.55	0.71	0.76	0.75	0.37	0.31
Smo75008	0.47	0.52	0.42	0.5	0.52	0.48	0.52	0.8	0.73	0.59	0.63	0.61	0.25	0.25	0.41	0.49	0.51	0.28	0.72	0.01	0.66	0.21	0.54	0.46	0.13	1.0	0.5	0.4	0.63	0.6	0.68	0.66
Smo75049	0.54	0.33	0.34	0.39	0.36	0.32	0.48	0.61	0.7	0.72	0.7	0.63	0.54	0.46	0.34	0.55	0.38	0.09	0.69	0.1	0.44	0.09	0.64	0.57	0.47	1.0	0.35	0.38	0.7	0.67	0.53	0.56
Smo75074	0.42	0.34	0.17	0.15	0.21	0.15	0.09	0.1	0.09	0.09	0.1	0.19	0.07	0.25	0.05	0.34	0.1	0.34	1.0	0.03	0.09	0.0	0.16	0.3	0.37	0.65	0.69	0.67	0.2	0.21	0.75	0.7
Smo77428	0.6	0.68	0.79	0.88	0.78	0.72	0.8	0.96	0.85	0.84	0.79	0.73	0.91	0.87	0.65	0.83	0.55	0.32	0.41	0.04	0.06	0.02	0.59	0.71	0.36	0.93	1.0	0.95	0.52	0.6	0.96	0.87
Smo78058	0.38	0.28	0.38	0.45	0.35	0.33	0.47	0.71	0.7	0.79	0.67	0.52	0.2	0.21	0.06	0.09	0.3	0.2	0.11	0.13	0.35	0.0	0.88	0.49	0.48	1.0	0.38	0.41	0.41	0.36	0.3	0.32
Smo80357	0.6	0.48	0.58	0.69	0.84	0.73	0.74	0.85	0.98	0.93	1.0	0.73	0.16	0.28	0.21	0.22	0.48	0.65	0.87	0.12	0.5	0.0	0.83	0.94	0.54	0.81	0.8	0.81	0.48	0.46	0.27	0.22
Smo81531	0.49	0.58	0.62	0.65	0.7	0.61	0.67	0.64	0.59	0.61	0.54	0.48	0.53	0.57	0.45	0.76	0.59	0.4	0.79	0.04	0.28	0.22	0.66	0.59	0.67	1.0	0.81	0.94	0.63	0.62	0.42	0.37
Smo84376	0.32	0.28	0.38	0.38	0.4	0.31	0.46	0.54	0.61	0.64	0.57	0.48	0.74	0.35	0.07	0.66	0.28	0.16	0.65	0.03	0.5	0.01	0.43	0.49	0.87	1.0	0.34	0.38	0.48	0.44	0.37	0.56
Smo88196	0.66	0.81	0.82	0.93	0.91	0.98	0.84	0.74	0.78	0.77	0.69	0.77	0.76	0.63	0.4	0.94	0.7	0.61	0.96	0.15	0.3	0.11	0.99	1.0	1.0	0.97	0.88	1.0	0.69	0.73	0.8	0.74
Smo89183	0.33	0.3	0.27	0.3	0.34	0.34	0.4	0.52	0.56	0.62	0.57	0.55	0.31	0.16	0.23	0.41	0.3	0.28	0.52	0.07	0.58	0.15	0.34	0.41	0.98	1.0	0.5	0.45	0.44	0.45	0.52	0.63
Smo90072	0.55	0.6	0.52	0.58	0.58	0.62	0.59	0.64	0.66	0.65	0.61	0.62	0.52	0.69	0.77	0.67	0.62	0.39	0.78	0.09	0.25	0.22	0.67	0.69	0.56	1.0	0.66	0.63	0.66	0.62	0.45	0.48
Smo90433	0.55	0.57	0.44	0.54	0.47	0.54	0.51	0.62	0.63	0.68	0.59	0.57	0.56	0.42	0.31	0.75	0.35	0.27	1.0	0.15	0.41	0.07	0.39	0.44	0.6	0.94	0.4	0.48	0.58	0.55	0.28	0.16
Smo98239	0.37	0.36	0.46	0.47	0.63	0.53	0.49	0.57	0.51	0.5	0.47	0.38	0.57	0.31	0.36	0.61	0.34	0.35	0.66	0.0	0.22	0.1	0.48	0.56	0.24	1.0	0.71	0.61	0.5	0.5	0.29	0.36
Smo99947	0.47	0.52	0.53	0.56	0.43	0.47	0.6	0.64	0.67	0.7	0.64	0.66	0.45	0.32	0.17	0.57	0.44	0.28	0.54	0.09	0.46	0.13	0.5	0.47	1.0	0.71	0.58	0.58	0.64	0.58	0.52	0.54

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)