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Heatmap: Cluster_209 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.08 0.06 0.03 0.18 0.19 0.29 -0.03 0.04 0.04 -0.09 -0.05 -0.14 0.3 0.3 0.31 0.51 -0.09 -0.44 0.33 -1.22 -0.31 -2.4 0.53 0.59 -0.27 -0.07 -0.01 -0.03 -0.12 -0.15 -0.37 -0.41
-0.76 -1.0 -0.71 -0.49 -0.66 0.06 -0.01 0.14 0.13 -0.22 -0.38 -0.32 0.66 -0.57 0.74 0.47 -0.08 0.55 0.72 -5.25 - -1.28 0.54 0.71 -2.82 0.34 0.73 -0.07 0.44 0.56 0.36 0.33
-0.21 -0.06 -0.18 0.33 0.41 0.33 0.0 -0.08 0.24 0.18 -0.26 -0.31 0.82 -0.12 -0.24 0.91 -0.11 -0.98 0.59 -6.86 - - 0.6 0.54 -1.49 0.83 0.46 0.7 0.02 0.08 -1.15 -0.82
0.29 -0.07 -0.43 -0.07 0.04 0.04 -0.32 -0.18 -0.18 0.07 0.08 0.08 0.72 -0.07 0.94 0.61 -0.31 0.22 0.53 -5.04 -4.1 -7.02 -0.29 -0.02 -3.23 0.38 0.76 0.48 -0.27 -0.28 0.31 0.67
-0.27 0.0 0.15 0.31 0.36 0.22 0.44 0.33 0.07 -0.13 -0.08 -0.24 0.38 -0.11 0.66 0.85 -0.43 -0.7 0.77 -3.53 -1.48 -1.48 -0.32 -0.43 -0.08 0.46 0.55 0.72 -0.15 -0.02 -1.61 -1.64
-0.03 -0.33 -0.43 -0.25 -0.06 0.11 -0.27 -0.04 0.17 -0.12 -0.03 -0.65 0.53 0.35 0.51 0.83 0.02 0.35 0.44 -1.35 -1.93 -0.8 0.62 0.76 -0.77 0.27 -0.2 -0.11 0.05 0.36 -0.72 -0.74
-0.52 -0.34 -0.11 -0.24 -0.84 -0.42 -0.21 0.08 -0.37 -0.54 0.04 -0.51 0.62 -0.92 1.67 1.17 0.46 -0.38 0.58 - - - 0.37 0.32 - 0.34 0.22 0.44 0.56 0.52 -0.13 0.08
-0.29 0.21 -0.97 -0.12 -0.34 0.09 -0.34 -0.68 -0.09 -0.18 -0.45 -0.57 0.99 0.37 0.93 1.14 0.16 -0.53 0.96 - - - 0.99 1.26 -2.24 -0.22 -0.53 -0.91 0.31 0.32 -0.26 -0.06
-0.43 0.02 -0.06 0.15 -0.01 -0.01 0.13 0.09 0.13 0.1 -0.31 -0.23 0.36 0.59 0.42 0.18 -0.12 -0.83 0.14 -2.84 -2.09 -4.39 0.9 1.0 -0.21 0.17 0.22 0.46 -0.17 -0.02 -0.24 -0.29
-0.18 0.17 0.2 -0.05 0.25 0.22 -0.06 -0.0 0.14 -0.45 -0.39 -0.2 0.49 0.01 0.26 0.37 -0.09 0.27 0.43 -1.31 -1.16 -0.76 0.09 0.33 -1.32 0.52 0.32 0.51 -0.09 0.06 -0.58 -0.35
-1.32 -2.06 -0.85 -0.85 -0.68 -0.14 -0.62 0.48 0.5 -0.76 -0.66 -0.52 0.97 -0.26 1.13 0.83 0.17 0.38 0.32 - - - 0.24 0.72 - -0.54 0.19 -0.95 0.46 0.67 1.19 1.32
0.06 0.09 0.15 -0.18 0.22 0.17 -0.02 0.05 -0.15 -0.23 -0.05 -0.23 0.55 -0.33 1.18 0.48 0.02 0.23 0.71 -2.89 - - 0.12 0.14 -0.91 -0.23 0.18 -0.23 0.01 -0.01 0.35 0.39
0.11 0.03 0.12 0.23 0.35 0.12 0.04 0.02 0.15 -0.11 -0.22 -0.32 0.5 0.06 0.52 0.85 -0.31 -0.49 0.65 -3.68 -3.38 -1.07 0.14 0.12 -0.59 0.26 0.4 0.5 -0.08 0.06 -0.56 -0.63
-0.51 -0.27 -0.13 -0.18 -0.05 -0.06 -0.19 -0.41 -0.33 -0.35 -0.36 -0.62 0.6 0.65 0.54 0.94 -0.15 -0.05 0.47 -0.6 -2.51 -3.23 0.0 0.04 -1.62 0.34 0.53 0.4 -0.06 0.1 0.57 0.63
-0.02 0.06 0.13 0.31 0.43 0.38 0.3 0.18 0.15 0.07 -0.08 -0.17 0.25 -0.15 0.71 0.54 -0.41 -0.42 0.31 -2.21 -1.38 -1.41 -0.32 -0.4 -0.3 0.01 0.61 0.62 0.07 0.2 -1.03 -0.75
-0.16 -0.09 -0.07 0.1 -0.06 -0.2 -0.08 0.16 0.45 0.34 0.22 0.14 0.53 0.58 0.77 0.79 -0.35 -0.86 0.43 -0.77 -1.84 -3.83 0.26 0.35 0.18 0.44 -0.45 -0.47 0.01 -0.0 -0.91 -1.25
-0.18 -0.07 0.01 0.16 0.41 0.35 0.33 0.31 0.09 0.13 0.04 -0.16 0.39 0.27 0.88 0.69 -0.46 -0.05 0.22 -3.55 -4.4 -2.74 -0.08 -0.05 -3.22 0.6 0.7 0.79 -0.38 -0.24 -0.69 -0.63
-0.63 -0.42 -0.14 -0.04 -0.04 0.11 0.01 -0.07 0.22 -0.06 -0.02 -0.34 1.42 0.08 1.31 1.25 -0.4 0.11 -0.66 -2.17 -2.2 -1.65 -0.76 -0.59 -0.87 0.22 0.65 1.05 -0.35 -0.24 -1.32 -1.49
0.18 0.0 0.02 -0.1 0.02 0.02 -0.04 -0.04 0.01 -0.08 -0.09 -0.25 0.06 0.38 0.18 0.28 -0.12 -0.06 0.68 -5.47 -2.45 -3.04 0.48 0.46 -0.38 0.33 0.6 0.54 0.13 0.2 -0.32 -0.14
-0.48 -0.48 -0.45 -0.44 -0.19 -0.43 -0.12 0.14 -0.38 -0.25 -0.06 -0.41 0.51 -0.02 0.91 0.46 0.36 0.87 0.36 -1.98 -1.63 -1.75 0.27 0.41 -1.75 0.49 -0.03 -0.17 0.41 0.37 0.25 0.37
-0.09 -0.15 -0.01 0.23 0.13 0.22 -0.29 -0.05 -0.48 -0.28 -0.27 -0.28 0.75 0.14 0.38 0.84 0.1 0.33 0.66 - -5.9 - 0.74 0.68 -1.66 -0.5 0.04 0.46 0.1 0.48 -0.14 -0.16
-0.54 -0.75 -0.61 -0.44 -0.45 -0.46 0.02 -0.01 0.13 0.28 0.28 0.08 0.49 0.56 0.66 0.47 -0.06 -0.09 0.01 -1.52 -0.76 -0.97 0.42 0.69 -0.3 0.44 -0.03 -0.36 0.14 0.31 -0.15 -0.06
-0.42 -0.6 -0.67 -0.61 -0.1 0.02 0.01 -0.02 -0.06 -0.36 -0.23 -0.27 0.88 0.36 1.31 1.23 -0.16 -0.4 0.49 -1.95 -3.1 -0.72 -0.31 -0.3 0.29 1.17 -0.04 0.11 0.01 0.18 -1.3 -2.01
-0.76 -0.5 -0.55 -0.26 -0.02 -0.05 -0.08 -0.18 -0.38 -0.32 -0.6 -0.94 0.75 0.15 0.56 1.11 -0.12 -0.14 0.57 -5.73 -3.94 - 0.4 0.55 -1.47 -0.0 0.64 0.51 -0.03 0.27 0.96 0.67
-0.08 0.13 -0.03 0.21 0.26 0.18 0.23 -0.07 0.03 -0.02 0.0 -0.17 1.09 0.01 0.79 1.28 -0.17 0.04 0.51 -3.88 -6.36 -0.6 -0.28 -0.37 -2.15 -0.12 0.34 0.71 -0.21 -0.19 -1.5 -1.51
-0.02 0.14 0.33 0.35 0.41 0.23 0.0 0.01 -0.05 -0.13 -0.05 -0.17 0.54 0.5 0.56 0.64 -0.1 -0.92 0.69 -6.63 -1.54 -2.2 0.38 0.42 -0.94 0.13 0.13 0.28 0.15 0.2 -1.26 -1.53
-0.19 0.0 -0.01 0.42 0.29 0.25 0.28 0.15 0.33 -0.03 0.13 -0.12 0.62 0.22 0.88 0.68 -0.31 -0.13 0.27 -4.14 -6.48 -3.29 -0.32 -0.45 -2.25 0.71 0.74 0.6 -0.38 -0.49 -0.39 -0.43
-0.22 -1.03 -0.68 -0.0 -0.18 0.6 -0.19 0.08 -0.57 -0.53 -0.96 -0.88 0.47 0.76 1.74 0.81 -0.91 0.27 0.17 -3.16 -1.92 -1.49 -0.32 -0.46 -0.48 -0.21 1.65 0.83 -0.83 -0.58 -0.96 -0.41
-0.3 -0.06 -0.05 0.09 0.32 0.27 0.4 0.38 0.16 0.22 -0.07 -0.07 0.68 -0.26 0.75 -0.03 -0.3 -0.4 0.5 -3.42 -5.23 -1.93 -0.33 -0.28 -0.85 0.59 0.88 1.06 -0.36 -0.18 -0.81 -0.7
-0.48 -0.1 -0.35 0.13 -0.11 -0.23 -0.11 0.22 -0.12 -0.16 -0.64 -0.56 1.32 0.68 1.69 1.42 -2.38 -2.34 -0.03 -7.42 -6.97 -4.71 -1.98 -0.72 -2.4 -0.24 1.88 1.59 -2.34 -1.46 -1.69 -0.79
-0.47 -0.79 -0.51 -0.63 -0.13 -0.44 -0.6 -0.3 -0.23 -0.28 -0.17 -0.4 0.92 0.52 0.73 1.02 -0.04 0.1 0.66 -1.08 -1.51 -2.23 0.59 1.03 -1.17 0.68 -0.07 -0.08 0.15 0.19 -0.38 -0.5
-0.6 -1.72 -0.1 -0.67 0.09 -0.41 -1.57 0.02 0.12 -0.27 -0.65 -0.63 0.61 0.28 1.3 1.09 0.41 0.07 0.84 - - - 0.19 0.7 - 0.25 0.2 -1.21 0.32 0.71 0.83 0.5
-0.2 -0.55 -0.36 -0.25 -0.17 0.06 -0.4 0.1 -0.02 0.08 0.16 -0.18 0.92 0.4 0.83 1.22 -0.28 -0.27 0.53 -5.5 -2.67 -6.59 0.21 0.26 -0.04 0.28 -0.06 0.37 0.07 0.1 -0.23 -0.61
-0.32 -0.24 -0.11 -0.16 0.02 -0.02 -0.15 0.12 0.29 0.1 0.15 0.01 0.57 0.45 0.55 0.82 -0.37 0.48 0.45 -2.74 -1.32 -2.72 -0.09 0.18 -0.6 0.56 0.23 0.28 -0.14 -0.03 -0.69 -0.48
-0.59 -0.36 -1.29 -1.09 -0.16 -0.22 -1.01 -0.83 -0.9 -0.6 -0.4 -1.05 2.02 0.24 1.03 2.32 -1.77 -5.92 -0.12 - - -3.41 -0.73 -0.5 -1.06 1.07 1.54 1.01 -1.26 -1.07 -0.72 -0.92
-0.0 -0.16 -0.27 -0.27 0.27 -0.18 -0.27 -0.05 -0.42 -0.51 -0.66 -0.53 0.91 1.03 0.45 0.99 -0.02 -0.7 0.36 - - - 0.76 0.34 - 0.67 0.52 0.85 0.13 0.12 -0.44 -0.11
-0.12 -0.36 0.04 -0.12 -0.16 0.2 -0.14 0.31 0.36 0.21 0.1 -0.1 0.62 -0.05 -0.36 0.46 -0.08 0.4 0.47 -3.27 -1.62 -3.73 0.16 0.31 -1.55 1.07 0.21 0.28 0.01 0.1 -0.34 -0.19
-0.56 -0.64 -0.52 -0.34 -0.21 -0.14 -0.11 0.2 0.01 -0.07 -0.23 -0.29 -0.08 0.2 0.95 0.28 -0.23 0.29 0.63 -3.59 -6.84 -3.43 0.64 0.97 -1.33 0.9 0.17 0.09 -0.08 -0.01 0.5 0.42
-0.84 -1.2 -1.59 -1.02 -1.77 -1.15 -0.68 0.04 0.21 -0.12 -0.01 -0.03 1.22 -0.07 0.85 0.8 -0.39 -2.52 0.77 -3.6 - -3.19 0.88 1.46 -2.84 1.47 0.42 0.03 0.21 0.36 -0.14 -0.21
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-0.17 -0.12 -0.19 -0.02 0.24 0.25 -0.08 -0.09 -0.23 -0.28 -0.1 -0.33 0.78 0.28 0.04 0.81 -0.15 -0.24 0.15 -5.39 -2.17 -1.53 0.52 0.68 -0.43 0.07 0.35 0.46 -0.04 0.18 -0.13 0.03
-0.22 -0.35 -0.31 -0.17 -0.26 -0.17 -0.14 0.34 0.31 0.45 0.48 0.32 0.2 -0.48 1.09 0.32 -0.49 -0.58 0.3 -4.28 -4.18 -2.69 0.02 0.36 -2.67 0.96 -0.02 0.04 0.06 0.17 0.32 0.64
-0.2 -0.17 -0.23 0.03 -0.0 0.09 0.09 -0.24 0.09 0.06 0.02 -0.03 0.2 -0.11 0.8 0.29 0.27 0.34 -0.04 -4.0 -1.81 -2.12 0.32 0.39 -0.74 -0.03 0.33 0.37 0.11 0.39 0.01 0.21
-0.22 -0.26 0.08 0.03 0.07 0.14 -0.09 0.08 -0.08 -0.09 -0.21 -0.21 0.28 0.09 0.59 0.49 -0.33 -0.78 0.43 -2.24 -2.86 -2.36 0.29 0.58 0.33 0.88 0.66 0.84 -0.22 -0.23 -0.8 -0.86
0.11 -0.14 0.02 0.45 -0.17 -0.04 0.09 0.03 -0.12 -0.14 0.02 -0.42 0.78 -0.15 0.75 0.73 0.5 0.09 0.62 - - - 0.66 0.25 - -1.08 -1.41 -0.52 0.36 0.68 0.42 0.66
-0.05 0.15 -0.1 0.03 -0.11 0.26 -0.08 -0.24 -0.24 -0.09 -0.24 -0.39 -0.05 0.56 0.18 0.79 -0.08 0.23 0.49 -1.07 -0.92 -3.09 0.8 0.5 -0.24 0.35 -0.15 0.14 0.16 0.25 -0.8 -0.85
-0.05 0.07 -0.14 0.24 0.16 0.18 0.16 0.04 0.0 -0.12 -0.1 -0.08 1.16 0.06 0.93 1.3 -0.96 -4.22 -0.48 -3.11 -1.68 0.14 -0.58 -0.58 -0.4 0.34 1.03 0.77 -0.93 -0.84 -1.02 -0.85
-0.08 0.07 0.01 0.36 0.56 0.34 0.15 0.11 -0.2 -0.11 0.22 -0.48 0.87 0.63 0.96 0.72 -0.64 -0.66 0.29 -1.13 -10.93 -6.25 -0.28 -0.24 -1.63 0.48 0.97 0.6 -0.58 -0.3 -1.53 -1.02
-0.33 0.32 -0.17 -0.03 0.59 -0.09 -0.64 -0.21 -0.01 -0.63 -0.59 -0.57 1.13 -0.98 0.76 1.12 -0.25 -1.1 0.79 -5.56 -3.56 - 0.16 0.42 -0.89 1.22 0.75 0.42 0.09 0.14 -0.73 -1.58
-0.42 0.09 0.2 -0.25 0.06 -0.24 -0.4 -0.22 -0.06 -0.14 -0.32 -0.36 1.2 -0.07 0.94 1.26 0.47 0.33 0.54 - -6.28 - -0.07 -0.42 -2.67 0.39 0.14 0.39 0.15 0.32 -0.21 -0.4
-0.49 -0.52 -0.85 -0.69 -0.06 -0.11 -0.28 0.03 -0.53 -0.07 -0.25 -0.71 0.71 -0.35 0.18 0.68 0.27 0.01 1.04 - -1.39 - 0.29 0.2 -0.72 -0.17 0.72 0.09 0.5 0.63 0.63 0.77
-0.83 -0.46 -0.56 -0.26 0.04 0.11 -0.08 0.31 -0.02 0.31 -0.37 -0.4 0.64 -0.69 0.8 0.79 -0.16 -0.76 0.74 -2.12 -1.48 -0.23 0.14 0.23 -0.07 0.74 0.32 0.53 0.04 0.3 -1.05 -0.82
-0.12 0.22 0.21 0.39 0.36 0.36 0.13 -0.2 -0.16 -0.43 -0.39 -0.65 0.55 0.33 0.39 0.72 0.17 -0.86 0.52 -6.79 - - 0.83 0.91 -4.49 0.4 0.43 0.39 -0.0 0.18 -0.37 -1.03
-0.42 0.15 0.19 0.15 0.08 0.0 0.19 -0.03 0.04 -0.05 0.02 -0.34 -0.04 0.62 0.59 0.45 0.0 -0.46 0.34 -3.79 -4.05 -4.54 0.78 0.44 -2.05 1.05 0.19 0.47 -0.11 0.11 -0.6 -0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.