1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_116 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.2 0.27 0.29 0.26 0.31 0.41 0.33 0.47 0.37 0.32 0.23 0.29 0.53 0.61 1.0 0.51 0.22 0.05 0.39 0.13 0.21 0.26 0.37 0.45 0.53 0.73 0.58 0.74 0.23 0.29 0.19 0.14
0.38 0.37 0.39 0.46 0.44 0.4 0.45 0.53 0.51 0.5 0.52 0.47 0.72 0.88 1.0 0.66 0.38 0.31 0.52 0.33 0.38 0.11 0.49 0.57 0.4 0.75 0.72 0.7 0.37 0.38 0.38 0.43
0.26 0.34 0.34 0.45 0.54 0.54 0.44 0.42 0.38 0.32 0.32 0.24 0.31 0.53 1.0 0.35 0.26 0.18 0.41 0.22 0.24 0.23 0.28 0.32 0.83 0.23 0.44 0.41 0.21 0.26 0.14 0.16
0.39 0.39 0.42 0.47 0.5 0.45 0.48 0.62 0.65 0.56 0.57 0.47 0.98 0.88 1.0 0.61 0.33 0.31 0.43 0.42 0.35 0.49 0.56 0.72 0.45 0.82 0.5 0.41 0.37 0.36 0.38 0.37
0.15 0.15 0.27 0.2 0.16 0.26 0.23 0.28 0.28 0.16 0.15 0.12 0.44 0.62 1.0 0.36 0.13 0.08 0.14 0.01 0.15 0.02 0.1 0.18 0.12 0.06 0.21 0.25 0.11 0.1 0.04 0.05
0.32 0.35 0.37 0.42 0.42 0.36 0.43 0.45 0.47 0.54 0.51 0.43 0.81 0.92 1.0 0.72 0.25 0.2 0.38 0.18 0.23 0.15 0.39 0.46 0.41 0.86 0.34 0.36 0.26 0.28 0.26 0.25
0.37 0.41 0.35 0.4 0.47 0.53 0.39 0.32 0.34 0.29 0.3 0.28 0.32 0.32 1.0 0.38 0.29 0.27 0.38 0.16 0.11 0.43 0.26 0.29 0.17 0.2 0.31 0.34 0.28 0.32 0.17 0.21
0.14 0.14 0.16 0.19 0.23 0.18 0.12 0.18 0.19 0.15 0.22 0.13 0.07 0.9 1.0 0.26 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.09 0.16 0.15 0.2 0.01 0.02 0.01 0.01
0.23 0.25 0.25 0.2 0.28 0.28 0.21 0.14 0.16 0.18 0.2 0.2 0.13 1.0 0.95 0.22 0.03 0.01 0.04 0.11 0.0 0.0 0.02 0.02 0.15 0.3 0.16 0.28 0.03 0.03 0.01 0.01
0.41 0.42 0.42 0.42 0.49 0.49 0.41 0.45 0.44 0.48 0.49 0.39 0.66 0.85 1.0 0.68 0.33 0.31 0.59 0.52 0.36 0.5 0.44 0.51 0.4 0.75 0.46 0.4 0.31 0.32 0.34 0.34
0.28 0.25 0.25 0.29 0.32 0.3 0.32 0.4 0.43 0.41 0.42 0.39 0.63 0.74 1.0 0.55 0.22 0.22 0.38 0.17 0.26 0.25 0.27 0.35 0.49 0.61 0.48 0.45 0.25 0.29 0.23 0.25
0.32 0.37 0.36 0.37 0.45 0.41 0.44 0.43 0.47 0.48 0.52 0.42 0.54 0.34 1.0 0.59 0.29 0.24 0.39 0.29 0.31 0.51 0.32 0.4 0.46 0.54 0.34 0.32 0.3 0.32 0.23 0.27
0.2 0.33 0.31 0.38 0.44 0.39 0.43 0.32 0.3 0.26 0.29 0.22 0.52 0.17 1.0 0.35 0.34 0.38 0.28 0.15 0.2 0.09 0.36 0.33 0.39 0.26 0.56 0.7 0.28 0.34 0.14 0.1
0.32 0.38 0.43 0.47 0.47 0.49 0.48 0.43 0.46 0.37 0.35 0.35 0.38 0.88 1.0 0.33 0.36 0.36 0.25 0.25 0.42 0.35 0.31 0.25 0.52 0.23 0.65 0.68 0.31 0.37 0.25 0.25
0.45 0.44 0.47 0.49 0.48 0.5 0.53 0.54 0.55 0.55 0.54 0.48 0.44 0.69 1.0 0.46 0.3 0.26 0.53 0.33 0.24 0.34 0.38 0.42 0.61 0.71 0.61 0.62 0.3 0.33 0.34 0.38
0.29 0.27 0.23 0.24 0.25 0.25 0.25 0.32 0.3 0.32 0.33 0.3 0.53 0.75 1.0 0.58 0.2 0.25 0.38 0.05 0.5 0.19 0.32 0.36 0.72 0.74 0.44 0.4 0.26 0.26 0.37 0.45
0.5 0.48 0.52 0.51 0.45 0.53 0.43 0.5 0.52 0.53 0.54 0.5 0.75 1.0 1.0 0.88 0.39 0.38 0.68 0.65 0.19 0.71 0.55 0.62 0.27 0.68 0.46 0.49 0.41 0.45 0.35 0.36
0.42 0.42 0.41 0.42 0.45 0.44 0.5 0.53 0.46 0.48 0.45 0.43 0.44 0.51 1.0 0.5 0.31 0.32 0.62 0.4 0.13 0.29 0.38 0.42 0.54 0.51 0.48 0.46 0.36 0.38 0.37 0.38
0.37 0.42 0.46 0.49 0.49 0.46 0.47 0.47 0.5 0.47 0.46 0.41 0.39 0.71 1.0 0.43 0.3 0.2 0.36 0.32 0.06 0.09 0.36 0.37 0.28 0.45 0.56 0.63 0.26 0.31 0.25 0.26
0.33 0.33 0.23 0.21 0.13 0.13 0.13 0.07 0.07 0.11 0.11 0.2 0.45 0.5 1.0 0.62 0.24 0.23 0.19 0.04 0.27 0.13 0.26 0.31 0.42 0.07 0.07 0.1 0.2 0.22 0.12 0.13
0.62 0.61 0.53 0.61 0.66 0.61 0.55 0.65 0.63 0.64 0.56 0.53 0.59 0.61 1.0 0.66 0.39 0.28 0.57 0.36 0.33 0.4 0.54 0.61 0.52 0.8 0.76 0.79 0.42 0.49 0.4 0.49
0.37 0.36 0.38 0.44 0.45 0.43 0.47 0.5 0.41 0.4 0.4 0.37 0.5 0.73 1.0 0.51 0.33 0.28 0.42 0.44 0.18 0.27 0.35 0.38 0.4 0.56 0.5 0.51 0.33 0.34 0.32 0.33
0.41 0.4 0.43 0.5 0.54 0.56 0.51 0.54 0.49 0.44 0.46 0.36 0.37 0.45 1.0 0.42 0.29 0.23 0.46 0.23 0.17 0.57 0.33 0.37 0.38 0.48 0.53 0.44 0.26 0.28 0.29 0.32
0.37 0.38 0.36 0.51 0.48 0.48 0.5 0.55 0.51 0.46 0.43 0.43 0.38 0.6 1.0 0.36 0.17 0.14 0.38 0.28 0.32 0.29 0.23 0.28 0.73 0.75 0.78 0.63 0.19 0.23 0.15 0.16
0.23 0.28 0.26 0.31 0.3 0.31 0.3 0.27 0.3 0.24 0.26 0.22 0.44 1.0 0.96 0.66 0.18 0.21 0.46 0.17 0.28 0.28 0.54 0.67 0.24 0.44 0.39 0.37 0.19 0.21 0.26 0.19
0.36 0.4 0.43 0.52 0.56 0.6 0.55 0.54 0.43 0.44 0.39 0.32 0.42 0.52 1.0 0.47 0.4 0.33 0.39 0.25 0.17 0.34 0.35 0.37 0.47 0.59 0.73 0.77 0.32 0.34 0.26 0.26
0.26 0.24 0.23 0.29 0.26 0.31 0.25 0.28 0.32 0.53 0.36 0.35 0.37 0.52 1.0 0.33 0.14 0.15 0.25 0.02 0.17 0.0 0.21 0.27 0.31 0.54 0.28 0.34 0.16 0.2 0.13 0.17
0.28 0.32 0.35 0.35 0.41 0.39 0.38 0.33 0.32 0.3 0.27 0.25 0.54 0.53 1.0 0.52 0.25 0.2 0.47 0.25 0.16 0.09 0.32 0.36 0.65 0.45 0.64 0.71 0.26 0.26 0.13 0.14
0.28 0.28 0.32 0.39 0.43 0.39 0.4 0.48 0.51 0.48 0.46 0.41 0.82 0.8 1.0 0.55 0.21 0.17 0.27 0.33 0.17 0.34 0.28 0.31 0.46 0.75 0.55 0.56 0.21 0.23 0.22 0.28
0.29 0.36 0.43 0.45 0.5 0.56 0.58 0.52 0.41 0.39 0.37 0.32 0.41 0.82 1.0 0.4 0.32 0.24 0.43 0.28 0.33 0.25 0.36 0.35 0.6 0.46 0.76 0.75 0.26 0.28 0.22 0.24
0.27 0.3 0.3 0.32 0.33 0.32 0.4 0.43 0.44 0.43 0.46 0.38 0.64 0.81 1.0 0.68 0.26 0.25 0.36 0.1 0.15 0.12 0.31 0.36 0.33 0.78 0.62 0.6 0.33 0.34 0.27 0.28
0.45 0.52 0.47 0.56 0.55 0.58 0.5 0.61 0.51 0.51 0.48 0.42 0.65 0.64 0.87 0.7 0.33 0.18 0.58 0.31 0.36 0.36 0.48 0.62 0.67 0.84 1.0 0.88 0.34 0.38 0.27 0.34
0.21 0.26 0.19 0.24 0.12 0.2 0.16 0.17 0.18 0.16 0.14 0.15 0.38 0.5 1.0 0.33 0.05 0.03 0.28 0.14 0.08 0.01 0.15 0.12 0.14 0.1 0.21 0.19 0.05 0.07 0.1 0.09
0.17 0.16 0.15 0.18 0.21 0.21 0.12 0.15 0.16 0.14 0.14 0.12 0.23 0.79 1.0 0.14 0.04 0.02 0.07 0.02 0.03 0.0 0.04 0.05 0.05 0.3 0.39 0.53 0.05 0.06 0.03 0.03
0.38 0.4 0.35 0.42 0.46 0.47 0.36 0.36 0.31 0.3 0.29 0.27 0.38 0.41 1.0 0.44 0.26 0.16 0.45 0.37 0.21 0.18 0.29 0.34 0.73 0.39 0.58 0.55 0.24 0.25 0.21 0.16
0.22 0.23 0.23 0.25 0.26 0.23 0.29 0.2 0.26 0.22 0.21 0.19 0.2 1.0 0.9 0.27 0.07 0.03 0.15 0.0 0.02 0.0 0.12 0.15 0.05 0.42 0.49 0.49 0.07 0.09 0.14 0.12
0.38 0.37 0.31 0.38 0.27 0.31 0.31 0.33 0.35 0.36 0.42 0.39 0.66 0.61 1.0 0.78 0.39 0.34 0.42 0.06 0.32 0.36 0.48 0.5 0.46 0.5 0.36 0.44 0.4 0.38 0.35 0.41
0.25 0.35 0.48 0.11 0.21 0.16 0.22 0.25 0.1 0.26 0.17 0.29 0.12 0.76 0.99 0.11 0.07 0.03 0.42 0.07 0.0 0.0 0.15 0.05 0.31 0.78 1.0 0.51 0.09 0.12 0.07 0.08
0.11 0.12 0.31 0.18 0.24 0.24 0.21 0.15 0.23 0.25 0.14 0.12 0.13 0.83 1.0 0.17 0.13 0.02 0.39 0.04 0.0 0.0 0.12 0.07 0.22 0.51 0.66 0.63 0.09 0.13 0.09 0.06
0.12 0.12 0.21 0.15 0.06 0.12 0.13 0.18 0.16 0.12 0.11 0.19 0.4 0.82 1.0 0.43 0.05 0.01 0.08 0.06 0.03 0.03 0.07 0.1 0.06 0.45 0.46 0.47 0.05 0.07 0.03 0.05
0.27 0.23 0.33 0.36 0.29 0.32 0.31 0.37 0.36 0.36 0.32 0.3 0.17 0.43 1.0 0.25 0.11 0.01 0.1 0.09 0.23 0.12 0.09 0.07 0.28 0.49 0.4 0.37 0.1 0.12 0.07 0.05
0.17 0.28 0.3 0.29 0.34 0.31 0.23 0.3 0.32 0.29 0.32 0.24 0.36 0.42 1.0 0.45 0.11 0.08 0.25 0.19 0.08 0.21 0.1 0.09 0.3 0.43 0.4 0.36 0.08 0.12 0.07 0.08
0.09 0.16 0.16 0.16 0.13 0.13 0.18 0.14 0.12 0.1 0.12 0.13 0.17 1.0 0.86 0.22 0.06 0.02 0.14 0.01 0.03 0.02 0.12 0.14 0.13 0.48 0.55 0.47 0.05 0.07 0.11 0.08
0.29 0.29 0.31 0.3 0.34 0.31 0.31 0.35 0.36 0.36 0.34 0.29 0.34 0.65 1.0 0.37 0.09 0.02 0.14 0.07 0.03 0.02 0.18 0.19 0.12 0.39 0.42 0.42 0.1 0.12 0.08 0.08
0.24 0.32 0.22 0.24 0.28 0.19 0.23 0.24 0.26 0.25 0.22 0.28 0.28 0.75 1.0 0.33 0.04 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.31 0.21 0.33 0.06 0.08 0.06 0.06
0.37 0.31 0.33 0.36 0.37 0.35 0.32 0.37 0.42 0.4 0.38 0.35 0.62 0.43 1.0 0.57 0.19 0.1 0.39 0.13 0.18 0.23 0.16 0.19 0.44 0.59 0.4 0.38 0.21 0.25 0.16 0.16
0.34 0.36 0.38 0.41 0.39 0.4 0.42 0.43 0.51 0.49 0.5 0.46 1.0 0.8 0.94 0.7 0.31 0.25 0.31 0.34 0.14 0.19 0.44 0.54 0.47 0.47 0.34 0.33 0.32 0.36 0.31 0.4
0.21 0.2 0.16 0.18 0.25 0.19 0.15 0.2 0.16 0.15 0.17 0.14 0.26 0.92 1.0 0.14 0.04 0.02 0.07 0.1 0.17 0.0 0.04 0.05 0.25 0.42 0.54 0.63 0.07 0.09 0.03 0.03
0.29 0.32 0.34 0.35 0.37 0.37 0.37 0.38 0.44 0.44 0.46 0.4 0.46 0.4 1.0 0.46 0.21 0.13 0.33 0.3 0.33 0.12 0.32 0.38 0.48 0.46 0.24 0.29 0.21 0.25 0.16 0.19
0.16 0.19 0.2 0.22 0.27 0.36 0.28 0.3 0.2 0.19 0.17 0.11 0.35 0.27 1.0 0.35 0.17 0.16 0.28 0.1 0.07 0.05 0.23 0.31 0.61 0.26 0.51 0.57 0.18 0.23 0.06 0.07
0.24 0.31 0.28 0.35 0.46 0.49 0.4 0.45 0.37 0.38 0.31 0.28 0.47 0.47 1.0 0.51 0.22 0.24 0.34 0.21 0.17 0.39 0.29 0.4 0.51 0.5 0.44 0.45 0.21 0.29 0.13 0.15
0.31 0.35 0.32 0.37 0.39 0.36 0.4 0.47 0.44 0.41 0.43 0.36 0.49 0.86 1.0 0.46 0.26 0.19 0.34 0.22 0.18 0.02 0.27 0.26 0.22 0.59 0.46 0.43 0.25 0.27 0.25 0.25
0.28 0.25 0.25 0.27 0.4 0.43 0.25 0.27 0.32 0.31 0.33 0.23 0.46 0.69 1.0 0.61 0.19 0.36 0.51 0.03 0.06 0.51 0.43 0.42 0.72 0.53 0.66 0.67 0.22 0.28 0.28 0.43
0.53 0.46 0.44 0.53 0.61 0.57 0.47 0.63 0.64 0.65 0.62 0.54 0.66 0.64 0.93 0.71 0.37 0.27 0.76 0.19 0.21 0.15 0.46 0.54 0.47 1.0 0.76 0.86 0.45 0.47 0.34 0.46
0.38 0.35 0.3 0.35 0.31 0.38 0.31 0.34 0.37 0.39 0.37 0.38 0.6 0.68 1.0 0.64 0.41 0.34 0.54 0.3 0.24 0.36 0.45 0.48 0.69 0.71 0.61 0.54 0.42 0.44 0.41 0.5
0.23 0.24 0.25 0.29 0.31 0.34 0.3 0.25 0.25 0.24 0.25 0.21 0.62 0.45 1.0 0.54 0.16 0.07 0.3 0.26 0.05 0.14 0.18 0.27 0.06 0.17 0.33 0.41 0.12 0.16 0.06 0.04
0.19 0.19 0.21 0.19 0.21 0.28 0.19 0.2 0.2 0.21 0.16 0.16 0.38 0.31 1.0 0.42 0.12 0.14 0.15 0.38 0.08 0.18 0.2 0.3 0.14 0.11 0.17 0.25 0.12 0.16 0.1 0.09
0.28 0.36 0.37 0.4 0.53 0.53 0.46 0.48 0.4 0.33 0.31 0.27 0.47 0.55 1.0 0.45 0.29 0.23 0.42 0.25 0.13 0.39 0.33 0.37 0.45 0.35 0.54 0.59 0.27 0.3 0.2 0.23
0.3 0.34 0.39 0.45 0.4 0.37 0.39 0.37 0.39 0.38 0.37 0.33 0.72 1.0 0.89 0.76 0.36 0.24 0.43 0.22 0.28 0.11 0.41 0.41 0.59 0.76 0.58 0.65 0.32 0.36 0.16 0.16
0.44 0.48 0.44 0.49 0.53 0.48 0.48 0.51 0.5 0.51 0.47 0.46 0.62 0.68 1.0 0.6 0.28 0.2 0.52 0.45 0.23 0.55 0.36 0.39 0.44 0.89 0.7 0.71 0.32 0.34 0.34 0.43
0.27 0.3 0.37 0.4 0.35 0.36 0.37 0.35 0.36 0.34 0.32 0.26 0.71 0.86 1.0 0.76 0.28 0.21 0.46 0.29 0.18 0.26 0.42 0.46 0.31 0.64 0.45 0.45 0.28 0.32 0.28 0.28
0.47 0.4 0.44 0.5 0.5 0.46 0.39 0.46 0.35 0.33 0.34 0.33 0.47 0.34 1.0 0.53 0.32 0.28 0.41 0.17 0.16 0.61 0.29 0.33 0.23 0.37 0.34 0.37 0.32 0.32 0.24 0.31
0.28 0.33 0.43 0.49 0.55 0.57 0.51 0.49 0.44 0.33 0.36 0.27 0.48 0.82 1.0 0.46 0.45 0.32 0.46 0.46 0.22 0.28 0.55 0.56 0.47 0.41 0.6 0.66 0.36 0.41 0.21 0.21
0.18 0.23 0.22 0.27 0.26 0.38 0.29 0.29 0.28 0.23 0.27 0.22 0.28 0.29 1.0 0.22 0.12 0.09 0.17 0.25 0.02 0.32 0.18 0.23 0.4 0.3 0.39 0.37 0.11 0.13 0.09 0.09
0.26 0.29 0.3 0.38 0.42 0.42 0.37 0.36 0.4 0.33 0.37 0.29 0.63 0.89 1.0 0.61 0.28 0.29 0.54 0.2 0.35 0.21 0.34 0.42 0.56 0.69 0.74 0.68 0.29 0.36 0.22 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)