Heatmap: Cluster_115 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.29 -0.61 -1.08 -0.65 -0.39 -1.0 -1.02 -0.01 -0.25 0.26 0.34 0.06 1.7 0.63 -1.4 1.57 -1.82 -2.28 0.14 -4.01 -3.1 - -0.91 -0.16 -0.43 2.29 0.28 -0.16 -0.9 -1.03 0.32 -0.08
-0.25 -0.12 -0.03 -0.06 0.18 -0.01 -0.22 -0.53 -0.21 -0.16 -0.21 -0.28 1.22 0.6 0.35 1.03 -0.26 -0.83 0.93 -2.19 -1.36 -0.26 -0.16 -0.15 0.02 1.17 -0.03 0.02 -0.65 -0.64 -1.19 -1.02
-0.77 -0.54 -0.1 -0.36 0.04 -0.28 -0.43 0.37 0.12 0.61 -0.06 -0.15 1.81 0.9 -0.24 1.56 -2.27 -1.82 -0.15 -0.99 -1.32 -1.88 -0.05 0.19 -0.46 1.53 -0.43 -0.18 -1.13 -1.06 -1.39 -1.87
-0.89 -1.61 -1.21 -0.23 -0.23 -0.61 -0.41 0.72 0.71 0.94 0.38 -0.23 1.3 -1.07 -3.24 1.32 -3.9 -2.94 0.89 -1.49 -1.1 - -2.09 -0.57 -0.22 2.47 0.51 -0.46 -1.18 -1.23 -0.0 -1.09
-0.0 -0.26 -0.32 0.13 0.27 0.14 -0.14 0.26 0.21 0.19 0.08 0.07 0.31 0.37 -0.22 0.59 -0.37 -0.93 0.18 -1.83 -1.32 0.07 -0.05 0.14 0.46 0.64 0.13 0.47 -0.22 -0.18 -0.73 -0.81
-0.4 -0.29 -0.37 -0.26 0.05 -0.1 -0.02 0.32 0.34 0.55 0.28 0.08 0.79 -0.04 -0.44 0.82 -0.73 -1.19 0.3 -0.88 -1.18 -2.97 -0.37 0.29 -0.89 1.23 0.68 0.63 -0.27 -0.29 -0.75 -0.43
-0.04 -0.01 0.14 0.29 0.32 0.09 -0.16 -0.08 0.06 -0.04 -0.01 -0.24 1.19 0.48 -0.27 0.64 -0.51 -0.68 -0.32 -3.86 -1.84 -4.51 0.15 0.37 0.12 1.04 0.55 0.8 -0.64 -0.55 -0.9 -0.99
1.25 -0.03 -0.76 -0.45 -0.39 -0.9 -1.71 -1.56 -1.22 -0.82 -0.15 0.46 2.2 -0.63 -1.45 2.52 -0.78 -0.88 0.76 -8.14 - -6.15 -0.94 -0.55 - -1.09 -1.0 -0.52 0.77 1.13 -0.64 -0.98
-0.04 -0.24 -0.22 -0.28 -0.1 -0.07 -0.06 0.35 0.38 0.43 0.41 0.25 0.55 0.32 -0.73 0.45 -0.32 -0.44 0.36 -1.68 -1.11 -0.69 -0.06 0.01 -1.34 0.94 0.14 0.33 0.03 -0.0 -0.24 -0.32
-0.48 -0.91 -0.92 -0.54 -0.48 -0.89 -0.63 0.24 0.43 0.53 0.49 0.15 2.35 0.72 -0.45 2.42 -1.47 -1.47 0.03 -4.54 -5.74 -7.93 -1.24 -0.34 -4.5 0.94 -1.48 -1.66 -0.38 -0.26 -0.88 -0.98
-0.66 -0.46 -0.07 -0.17 -0.22 -0.51 -1.29 -1.06 -1.57 -1.81 -1.98 -1.5 1.68 1.68 -1.15 1.8 0.11 -1.85 0.75 -2.58 -1.8 -3.07 -0.17 -0.17 -0.6 1.42 0.93 0.83 -0.68 -0.41 -1.42 -0.7
-0.37 -0.27 -0.22 -0.19 -0.31 -0.71 -0.49 -0.34 -0.41 -0.15 -0.56 -0.34 1.37 1.63 -0.68 1.25 -0.69 -1.81 -0.61 0.47 -0.04 -0.4 -1.17 -1.01 0.91 1.08 0.05 0.32 -0.72 -0.6 -1.38 -1.34
0.39 -0.45 -0.82 -0.75 -0.3 0.05 0.32 0.62 0.34 0.27 -0.01 -0.08 1.05 1.43 -0.56 1.64 -1.22 -0.16 -0.99 -1.98 0.3 -4.46 -0.94 -0.52 -0.04 -0.28 0.35 0.21 -0.83 -0.34 -0.69 -1.22
0.28 -0.53 -0.83 -0.94 -0.67 -1.23 -1.18 -0.3 -0.39 -0.24 0.08 0.23 2.2 -0.23 -1.47 1.99 -1.75 -2.54 1.09 -4.24 -2.02 -3.17 -1.09 -0.04 -1.69 2.09 -0.36 -0.79 -0.59 -0.45 -0.24 -1.14
-0.72 -1.42 -0.29 -0.63 -1.18 -1.42 -1.05 0.38 0.08 1.1 0.8 -0.03 1.57 -0.97 -0.31 0.63 -1.42 -0.65 -0.69 - -2.4 -4.03 -1.96 -1.62 1.07 2.56 0.58 -1.77 -0.96 -1.18 0.11 -0.12
-0.39 -0.14 -0.08 -0.34 -0.31 -0.4 -0.33 -0.18 0.16 0.27 0.07 -0.01 1.37 -0.04 -0.75 1.14 -0.43 -0.42 0.3 -1.5 -0.9 -1.53 0.35 0.45 -1.0 0.93 0.21 0.17 -0.11 -0.09 -0.45 -0.42
-0.05 -0.44 -1.31 -0.75 -0.76 -0.97 -1.25 0.2 -0.12 0.17 -0.17 0.07 0.51 1.79 -0.32 1.17 -2.52 -2.16 0.15 -10.22 -1.39 - -1.24 -0.17 0.98 1.7 0.74 0.11 -0.39 -0.76 0.23 0.02
-2.11 -0.94 0.01 0.56 0.67 0.64 0.28 -0.27 -0.49 -0.99 -1.54 -2.25 1.95 1.86 -2.29 1.66 0.09 -2.89 -0.95 -2.46 -0.19 -7.26 -0.0 -0.51 -0.64 -0.08 0.59 1.03 -1.39 -1.0 -2.87 -1.79
0.03 0.07 -0.06 -0.02 0.44 0.31 0.19 0.07 -0.02 -0.17 -0.03 -0.17 0.05 0.0 0.24 0.43 -0.41 -0.41 0.51 -1.84 -1.61 0.31 -0.03 0.19 0.36 0.08 -0.02 -0.02 0.02 0.1 -0.31 -0.32
-0.11 -0.27 -0.37 -0.36 0.15 -0.09 -0.7 -0.29 0.01 -0.38 -0.12 -0.5 1.25 0.55 -1.82 1.51 -0.8 -0.16 0.83 -1.2 -0.35 -6.03 -0.01 0.42 -0.79 0.68 -0.23 -0.25 -0.49 -0.49 0.45 0.43
-0.09 -0.03 -0.49 0.08 0.57 0.5 0.59 0.59 0.36 0.17 0.32 -0.02 0.53 -1.0 0.7 0.96 -0.15 -0.25 0.5 -2.51 -3.14 -0.18 0.3 0.33 -2.7 -0.71 -0.95 -1.13 0.21 0.39 -0.71 -0.68
-0.06 -0.38 -0.32 -0.23 -0.06 -0.16 -0.41 0.07 0.05 0.21 0.22 -0.04 1.05 0.37 -0.47 1.03 -0.26 -0.27 0.33 -0.9 -0.76 -0.64 0.18 0.5 -0.9 0.58 0.01 -0.1 -0.08 -0.1 -0.48 -0.51
-0.25 0.03 -0.46 0.15 -0.01 0.07 -0.21 0.06 -0.81 0.4 0.65 -0.62 1.01 0.1 -0.64 1.67 0.23 0.49 0.02 - - - 0.57 0.42 - 0.16 -0.96 -0.03 0.6 0.7 -0.72 -0.85
-1.06 -1.45 -0.8 -0.57 -0.67 -0.44 -0.5 -0.41 -0.71 -0.34 -0.72 -1.15 2.37 1.47 0.6 1.56 -0.9 -1.27 -0.09 - - - -0.31 -0.16 -3.09 1.21 0.95 0.97 -0.88 -0.64 -0.94 -0.73
0.06 -0.29 -0.22 -0.21 -0.01 -0.07 -0.23 0.21 0.28 0.23 0.33 0.26 0.83 0.29 0.06 0.65 -0.69 -0.53 -0.0 -2.29 -1.26 -1.21 0.17 0.38 -1.43 1.19 0.12 -0.04 -0.14 -0.22 -0.2 -0.23
-0.05 0.27 0.04 -0.12 -0.11 -0.06 -0.75 -0.62 -0.11 -0.12 -0.08 -0.08 2.09 0.01 -4.13 1.43 -0.26 -0.45 1.4 - - - 0.54 0.18 -3.56 1.26 -0.71 -0.4 -0.35 -0.33 -1.85 -1.06
-0.36 -0.68 -0.3 -0.85 -0.73 -0.55 -0.27 -0.04 -0.06 0.21 -0.1 -0.2 0.93 1.72 0.52 0.84 -1.88 -1.05 0.06 -2.16 -1.05 - -0.81 -0.14 0.47 1.33 0.95 0.66 -0.83 -0.62 -0.71 -0.76
-0.28 0.56 0.83 0.79 0.81 0.51 -0.5 -0.66 -1.37 -1.47 -1.32 -1.39 1.57 1.66 -1.31 1.56 -0.59 -1.79 0.22 -1.59 0.03 -6.3 -0.35 -0.37 -0.7 0.58 0.11 0.14 -0.87 -1.14 -2.37 -2.67
-0.38 -0.48 -0.38 -0.48 -0.56 -0.47 -0.14 0.2 0.51 0.64 0.54 0.17 1.04 0.18 -1.5 0.95 -1.67 -0.88 -0.45 -2.31 -0.87 -3.09 0.35 0.79 -1.08 1.53 0.36 0.21 -0.45 -0.35 -0.4 -0.03
-0.97 -0.87 -2.37 -1.53 -0.82 -0.81 -1.23 0.27 -0.46 -0.28 -0.78 -1.23 2.03 1.49 -4.42 2.14 -3.4 -2.95 0.39 - 0.36 - -1.63 0.32 0.06 2.05 -0.05 -0.68 -0.75 -1.13 -0.05 -0.95
-0.37 -0.32 -0.57 -0.52 -0.42 -0.51 -0.24 0.13 -0.24 -0.05 -0.56 -0.46 1.88 1.17 -2.12 2.07 -1.21 -2.22 0.06 -2.91 -1.46 - -1.25 -0.73 -0.96 1.27 0.87 0.33 -0.38 -0.63 -0.21 -0.72
-0.55 -0.66 -0.65 -0.23 0.31 -0.24 -0.65 -0.33 -0.47 -0.13 -0.0 -0.38 1.74 0.85 -0.15 1.71 -2.2 -2.39 -0.96 - - - 0.46 1.03 0.28 0.99 0.58 1.2 -1.48 -1.16 -1.75 -0.97
1.18 0.2 -0.15 -0.45 -0.39 -1.02 -1.99 -1.81 -1.36 -0.83 -0.18 0.35 2.22 -1.02 -1.54 2.61 -0.68 -0.67 0.79 - - - -1.08 -0.55 -7.0 -1.21 -1.34 -0.55 0.71 1.03 -0.75 -1.01
0.15 -0.19 -0.31 -0.04 0.14 0.18 -0.03 0.26 0.26 -0.05 0.3 -0.29 1.35 -0.5 0.13 2.02 -0.17 -0.01 0.55 - - - 0.29 0.23 - -0.68 -0.7 -0.87 0.18 0.07 -0.44 -0.4
-0.24 -0.06 0.04 0.33 0.31 0.17 -0.03 0.15 0.06 0.15 -0.05 -0.18 1.3 0.52 0.36 0.9 -0.66 -1.51 -0.18 -2.45 -1.3 -1.54 -0.38 -0.3 -0.2 1.06 0.43 0.45 -0.79 -0.78 -0.83 -0.68
-0.71 -0.23 -0.71 -0.13 -0.06 -0.45 0.43 0.47 -0.07 0.46 -0.23 0.2 0.95 0.35 -0.05 1.18 -0.8 -1.4 0.65 - - - -0.18 -0.14 -1.16 1.58 0.61 0.36 -0.23 -0.13 -0.62 -0.25
0.02 0.14 -0.51 -0.08 0.43 0.01 -0.32 -0.11 -0.36 -0.13 0.04 0.04 0.81 0.38 0.12 0.89 -0.8 -2.83 0.52 -3.8 -1.96 -0.17 -0.46 -0.19 -0.11 1.42 0.85 0.52 -0.56 -0.59 -0.83 -0.46
-0.08 -0.08 -0.08 0.19 0.4 -0.19 -0.21 -0.24 0.21 0.07 0.33 -0.13 0.96 -0.22 -1.32 0.94 -1.27 -2.34 -0.48 -3.14 -2.04 -0.26 0.33 0.78 -0.17 1.25 0.86 0.9 -0.85 -0.72 -0.93 -1.08
0.3 -0.21 -0.02 0.19 -0.26 -0.07 0.01 0.26 0.15 0.72 0.21 0.45 1.74 0.78 -0.84 1.59 -1.96 -3.21 -0.53 -4.15 -2.42 -3.74 -0.03 0.47 -1.16 0.67 0.07 0.04 -0.85 -0.53 -1.49 -1.25
-0.1 -0.54 0.31 0.04 0.09 0.07 -0.34 0.07 -0.19 0.05 -0.03 -0.12 0.89 -0.12 -1.46 0.79 -1.39 -2.41 0.83 -5.07 -2.51 0.49 0.23 0.8 -1.22 0.99 0.98 1.33 -1.26 -0.91 -1.41 -1.34
-0.07 -0.09 -0.3 -0.03 -0.0 -0.04 -0.15 0.18 0.22 0.09 0.37 0.03 0.02 0.23 -0.18 0.34 -0.26 0.02 0.28 -0.93 -1.72 0.42 0.15 0.25 0.38 0.36 -0.06 -0.32 -0.44 -0.24 -0.15 0.11
-0.36 -0.35 -0.46 -0.51 -0.56 -1.16 -0.91 -0.44 -0.46 -0.14 -0.45 -0.49 1.69 1.03 -1.45 1.7 -1.45 -2.48 0.38 - -1.43 - 0.33 0.77 -0.57 1.88 0.45 -0.1 -0.79 -0.91 -0.27 -0.22
0.21 -0.4 -0.33 -0.31 0.4 -0.28 -0.4 0.03 -0.07 0.45 0.3 -0.15 1.11 -1.77 -0.2 0.65 -0.65 -0.87 0.25 -6.58 -2.17 -3.27 0.39 0.35 -2.56 1.4 0.92 1.15 -0.19 -0.06 -1.13 -0.51
-0.02 -0.38 -0.53 -0.56 -0.5 -0.85 -1.12 -0.74 -0.05 -0.03 -0.01 -0.11 1.23 -0.39 -0.3 1.57 -1.08 -1.43 1.21 -1.78 -2.43 -3.02 -0.1 0.55 -0.11 1.8 0.34 0.42 -0.83 -0.6 -0.5 -0.54
0.08 -0.89 -1.52 -0.96 -0.62 -1.0 -1.45 0.04 0.14 -0.18 0.51 -0.05 1.67 -0.19 -1.1 1.6 -1.48 -2.74 0.82 -1.67 -3.08 - -1.91 -0.82 1.18 2.14 0.26 0.47 -0.9 -1.23 -0.87 -0.39
0.13 0.13 -0.43 -0.05 0.09 0.18 -0.07 0.45 0.5 0.25 -0.16 -0.17 1.5 1.99 -0.44 1.16 -2.92 -0.59 -2.35 -3.66 -3.09 - -0.52 -0.32 1.71 -0.51 -0.53 0.27 -2.38 -1.62 -3.04 -2.19
-0.51 -0.26 -0.2 -0.19 -0.03 -0.19 -0.18 -0.24 -0.02 0.09 -0.22 -0.25 0.99 1.25 0.08 1.24 -0.84 0.34 -0.14 -1.18 -0.32 -4.77 -0.04 -0.05 0.91 0.44 -0.01 -0.1 -0.58 -0.72 -0.8 -0.65
0.87 -0.56 -1.47 -1.32 -0.7 -1.38 -2.25 0.33 0.74 0.92 1.3 1.0 2.5 -3.78 -7.66 2.2 -2.7 -2.72 -0.18 - - - -1.8 -1.59 -2.32 1.99 -1.68 - -1.53 -2.52 -0.74 -0.96
-0.47 -0.65 -0.34 -0.94 -1.01 -0.89 -0.71 -0.83 -0.19 -0.53 0.07 -0.15 2.07 1.27 1.26 1.81 -0.9 -1.7 0.12 - -5.37 -5.44 -0.29 -0.46 -3.47 1.08 -0.13 -0.4 -0.09 -0.06 -0.47 0.08
0.12 -0.46 -0.43 -0.1 0.28 -0.03 -0.02 0.1 -0.05 -0.17 0.25 -0.06 -0.13 0.09 0.74 -0.09 -0.39 0.36 0.59 -2.52 -1.79 0.61 0.02 0.15 0.12 -0.21 0.71 0.25 -0.44 -0.14 -0.63 -0.09
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-0.69 -0.37 -0.64 -0.4 -0.4 -0.42 -0.39 -0.27 -0.1 0.01 -0.29 -0.3 1.59 0.99 0.39 1.41 -0.96 -1.22 -0.21 -2.21 -4.38 -1.61 -0.11 0.16 -2.43 1.25 0.96 0.6 -0.55 -0.35 -0.38 -0.2
-0.41 -0.18 -0.17 0.14 0.21 -0.11 -0.53 -0.06 -0.33 -0.49 -0.43 -0.63 1.38 0.94 -0.34 1.56 -0.98 -1.57 0.01 -6.59 -2.35 -3.84 -0.52 -0.23 0.46 1.59 0.84 0.97 -0.91 -0.76 -1.98 -1.71
-0.39 -0.08 -0.23 -0.2 -0.33 -0.12 -0.49 0.15 -0.16 0.12 -0.13 0.06 1.11 -1.32 -0.85 1.29 -0.94 -2.42 -0.02 -4.73 -2.67 0.14 0.35 0.79 -0.14 1.58 0.46 0.88 -0.36 -0.37 -0.87 -1.55
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-2.21 -1.22 -0.08 0.31 -0.07 -0.66 0.55 0.83 0.32 0.39 0.02 -0.59 1.27 0.14 -1.17 0.46 -3.19 -2.5 -0.29 -3.45 -3.03 -1.9 -1.8 -1.21 -1.56 2.85 0.35 -0.4 -1.14 -1.37 -0.15 0.2
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0.27 -0.28 -0.42 -0.46 -0.22 -0.58 -0.2 0.01 -0.0 0.1 0.28 0.17 1.6 0.63 -0.97 1.48 -0.85 -0.44 0.42 -4.65 -2.48 - -0.36 0.14 -3.52 1.1 -0.09 -0.5 0.3 0.06 0.09 -0.19
-0.37 -0.8 -0.81 -0.64 -0.37 -0.79 -0.61 0.17 -0.06 0.05 0.05 -0.18 1.76 1.0 0.21 1.18 -1.0 -0.98 0.47 -2.93 -2.31 -3.23 -0.39 0.43 -0.87 1.37 0.01 -0.17 -0.23 -0.42 -0.01 0.04
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-0.01 0.22 -0.02 0.02 0.31 0.16 -0.05 0.26 -0.22 0.05 -0.26 -0.29 1.26 1.08 0.04 1.19 -0.91 -1.07 -0.24 -0.85 -2.31 -2.39 -0.27 -0.27 0.18 -0.03 0.61 0.82 -0.75 -0.55 -1.46 -1.11
0.06 -0.43 -0.59 -0.29 0.22 -0.12 -0.54 -0.04 -0.43 -0.14 -0.05 -0.42 1.41 1.13 0.34 1.4 -1.22 -1.06 0.96 -6.51 -2.22 -1.09 -0.33 0.5 0.28 0.23 0.34 0.18 -0.72 -0.45 -0.92 -1.02
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-0.78 -0.2 0.0 -0.03 -0.19 -0.66 1.23 0.16 -0.11 0.05 0.23 -0.32 1.94 1.09 0.28 1.28 -1.55 -0.27 0.12 - - - -0.46 0.02 -3.63 1.59 -0.61 -0.85 -1.33 -1.4 -0.91 -1.17
-1.07 -0.86 -0.53 -0.33 -0.02 -0.48 -0.51 0.08 -0.14 0.16 0.08 -0.37 2.56 -0.37 -2.13 1.35 -2.38 -1.5 -0.31 - -1.94 - 0.22 0.83 -1.96 2.01 -0.69 -0.46 -1.07 -1.2 -0.35 -0.3
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-0.33 -1.26 -1.24 -1.22 -1.22 -1.54 -1.24 -0.03 0.25 0.67 0.44 0.11 2.38 -0.94 -2.0 2.53 -1.82 -3.0 -0.57 -8.83 -5.96 -8.34 -1.45 -1.15 -2.41 1.82 0.29 0.2 -1.42 -1.51 -0.03 0.13
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0.08 -0.49 -0.23 -0.19 -0.19 -0.71 -0.47 0.1 -0.01 0.39 0.42 0.09 1.72 -0.92 -2.9 1.33 -1.56 -0.75 0.34 -7.01 - -3.98 0.34 1.03 -1.59 1.54 0.37 -0.01 -0.43 -0.36 -0.46 -0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.