1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.18 0.18 0.15 0.19 0.21 0.18 0.21 0.2 0.21 0.21 0.22 0.2 0.16 0.19 0.16 0.15 0.12 0.14 0.1 0.01 0.04 0.01 0.15 0.15 0.08 0.22 0.21 0.13 0.12 0.12 1.0 0.54
0.03 0.04 0.12 0.18 0.29 0.28 0.13 0.06 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.04 0.12 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.25 0.25 0.0 0.05 0.34 0.35 0.02 0.03 1.0 0.29
0.21 0.17 0.21 0.23 0.23 0.21 0.3 0.38 0.32 0.31 0.29 0.24 0.11 0.09 0.05 0.24 0.14 0.2 0.23 0.06 0.28 0.09 0.15 0.23 0.4 0.64 0.84 0.59 0.23 0.22 0.98 1.0
0.34 0.32 0.3 0.33 0.33 0.33 0.4 0.53 0.58 0.57 0.53 0.52 0.37 0.52 0.38 0.47 0.19 0.19 0.33 0.19 0.3 0.04 0.3 0.37 0.51 1.0 0.91 0.81 0.32 0.34 0.71 0.48
0.35 0.32 0.29 0.37 0.36 0.35 0.42 0.39 0.4 0.37 0.36 0.34 0.41 0.53 0.29 0.58 0.28 0.26 0.69 0.02 0.0 0.0 0.27 0.35 0.05 0.7 0.99 1.0 0.41 0.44 0.81 0.56
0.48 0.52 0.46 0.5 0.54 0.47 0.57 0.63 0.62 0.6 0.56 0.53 0.17 0.57 0.46 0.4 0.32 0.36 0.45 0.11 0.26 0.09 0.34 0.42 0.76 0.97 1.0 0.69 0.39 0.44 0.7 0.81
0.2 0.22 0.23 0.25 0.28 0.28 0.33 0.31 0.23 0.18 0.17 0.14 0.12 0.15 0.38 0.1 0.2 0.18 0.13 0.05 0.02 0.08 0.12 0.17 0.12 0.23 1.0 0.78 0.14 0.14 0.52 0.61
0.15 0.09 0.1 0.13 0.11 0.1 0.17 0.43 0.23 0.36 0.27 0.33 0.02 0.06 0.01 0.03 0.02 0.04 0.08 0.02 0.1 0.0 0.03 0.04 0.21 1.0 0.74 0.29 0.07 0.05 0.09 0.1
0.17 0.17 0.13 0.09 0.08 0.07 0.06 0.06 0.04 0.05 0.06 0.09 0.02 0.03 0.02 0.03 0.05 0.08 0.07 0.0 0.01 0.0 0.05 0.05 0.03 0.05 0.16 0.13 0.05 0.05 1.0 0.37
0.25 0.21 0.17 0.17 0.15 0.17 0.16 0.16 0.15 0.15 0.15 0.15 0.11 0.16 0.25 0.09 0.08 0.11 0.1 0.07 0.04 0.03 0.14 0.19 0.22 0.14 0.2 0.16 0.07 0.07 1.0 0.83
0.46 0.33 0.37 0.38 0.38 0.34 0.36 0.48 0.54 0.54 0.59 0.5 0.28 0.25 0.21 0.31 0.31 0.28 0.74 0.26 0.24 0.41 0.25 0.24 0.38 1.0 0.54 0.62 0.35 0.38 0.24 0.31
0.2 0.25 0.26 0.28 0.27 0.31 0.38 0.3 0.27 0.25 0.22 0.16 0.26 0.27 0.2 0.33 0.21 0.26 0.47 0.01 0.03 0.02 0.24 0.29 0.2 0.34 1.0 0.92 0.21 0.25 0.7 0.67
0.29 0.26 0.31 0.31 0.4 0.25 0.22 0.26 0.3 0.63 0.36 0.39 0.19 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.2 1.0 0.52 0.97 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.04 0.01 0.05 0.26 0.05 0.1 0.0 0.03 0.09 0.03 0.08 0.03 0.01 0.05 0.06 1.0 0.83
0.58 0.48 0.33 0.28 0.29 0.27 0.25 0.26 0.21 0.2 0.23 0.25 0.07 0.16 0.17 0.09 0.25 0.27 0.19 0.02 0.03 0.04 0.17 0.19 0.09 0.29 0.75 0.64 0.18 0.18 1.0 0.74
0.18 0.17 0.17 0.23 0.23 0.22 0.29 0.29 0.3 0.28 0.27 0.24 0.2 0.19 0.2 0.21 0.14 0.13 0.29 0.0 0.01 0.0 0.18 0.22 0.07 0.46 0.42 0.34 0.2 0.21 1.0 0.61
0.39 0.44 0.48 0.44 0.48 0.49 0.47 0.41 0.36 0.3 0.3 0.29 0.15 0.21 0.39 0.19 0.44 0.35 0.26 0.07 0.11 0.2 0.26 0.27 0.26 0.22 0.58 0.51 0.3 0.29 0.9 1.0
0.49 0.24 0.12 0.12 0.19 0.15 0.1 0.11 0.07 0.14 0.11 0.19 0.07 0.25 0.02 0.2 0.06 0.32 0.3 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.13 0.2 0.1 0.14 0.1 1.0 0.75
0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.0 0.18 0.14 0.0 0.0 1.0 0.87
0.24 0.22 0.29 0.3 0.36 0.29 0.36 0.39 0.37 0.35 0.34 0.26 0.35 0.16 0.49 0.28 0.16 0.13 0.36 0.04 0.25 0.11 0.23 0.25 0.26 0.6 0.63 0.54 0.22 0.25 0.7 1.0
0.08 0.05 0.05 0.06 0.08 0.06 0.11 0.07 0.11 0.07 0.07 0.04 0.02 0.04 0.09 0.03 0.05 0.15 0.05 0.04 0.14 0.26 0.06 0.07 0.15 0.04 0.32 0.2 0.03 0.04 0.94 1.0
0.52 0.46 0.38 0.5 0.54 0.49 0.59 0.66 0.66 0.74 0.78 0.68 0.46 0.4 0.26 0.55 0.34 0.28 0.58 0.5 0.26 0.46 0.42 0.44 0.47 1.0 0.81 0.73 0.43 0.45 0.73 0.72
0.4 0.38 0.39 0.42 0.38 0.44 0.41 0.45 0.44 0.49 0.44 0.42 0.18 0.22 0.37 0.29 0.31 0.14 0.35 0.05 0.16 0.01 0.29 0.26 0.47 1.0 0.54 0.47 0.29 0.24 0.4 0.42
0.27 0.28 0.3 0.32 0.35 0.32 0.33 0.35 0.28 0.3 0.27 0.22 0.29 0.22 0.25 0.28 0.16 0.13 0.31 0.04 0.11 0.06 0.24 0.31 0.29 0.49 0.59 0.5 0.16 0.15 1.0 0.74
0.27 0.26 0.26 0.28 0.34 0.31 0.37 0.46 0.44 0.53 0.5 0.43 0.34 0.25 0.23 0.25 0.13 0.15 0.25 0.14 0.17 0.29 0.23 0.28 0.48 1.0 0.87 0.76 0.16 0.17 0.52 0.78
0.17 0.18 0.18 0.21 0.28 0.28 0.29 0.28 0.2 0.17 0.13 0.12 0.09 0.18 0.35 0.12 0.1 0.07 0.15 0.05 0.02 0.08 0.11 0.12 0.09 0.32 0.54 0.5 0.1 0.11 1.0 0.41
0.42 0.42 0.42 0.39 0.44 0.36 0.41 0.51 0.49 0.48 0.54 0.47 0.43 0.35 0.55 0.48 0.28 0.21 0.49 0.48 0.45 0.42 0.27 0.32 0.48 1.0 0.61 0.59 0.35 0.36 0.44 0.47
0.18 0.19 0.23 0.23 0.23 0.22 0.25 0.32 0.25 0.25 0.22 0.18 0.04 0.07 0.02 0.04 0.13 0.12 0.22 0.01 0.12 0.06 0.11 0.11 0.22 0.4 0.42 0.36 0.14 0.13 1.0 0.85
0.1 0.07 0.05 0.06 0.05 0.06 0.05 0.07 0.05 0.06 0.06 0.05 0.09 0.11 0.1 0.08 0.03 0.08 0.09 0.12 0.06 0.02 0.06 0.09 0.12 0.11 0.15 0.12 0.03 0.03 1.0 0.53
0.09 0.07 0.06 0.05 0.06 0.06 0.06 0.07 0.08 0.08 0.08 0.08 0.11 0.14 0.23 0.1 0.06 0.07 0.13 0.18 0.23 0.07 0.1 0.12 0.07 0.1 0.06 0.04 0.07 0.07 1.0 0.92
0.12 0.2 0.34 0.45 0.5 0.44 0.54 0.49 0.33 0.25 0.17 0.13 0.26 0.57 0.33 0.58 0.31 0.26 0.3 0.02 0.09 0.03 0.17 0.16 0.27 0.56 0.75 0.47 0.25 0.22 1.0 0.85
0.26 0.31 0.29 0.37 0.4 0.35 0.32 0.34 0.36 0.34 0.28 0.27 0.38 0.3 0.29 0.43 0.15 0.12 0.26 0.03 0.04 0.0 0.27 0.27 0.53 1.0 0.8 0.68 0.18 0.22 0.55 0.53
0.48 0.48 0.45 0.49 0.53 0.49 0.48 0.47 0.45 0.51 0.47 0.49 0.42 0.28 0.35 0.39 0.28 0.22 0.4 0.08 0.37 0.53 0.31 0.35 0.36 1.0 0.97 0.98 0.27 0.28 0.55 0.59
0.22 0.23 0.26 0.28 0.27 0.28 0.34 0.5 0.52 0.54 0.6 0.48 0.45 0.1 0.1 0.41 0.13 0.12 0.39 0.4 0.34 0.27 0.14 0.21 0.28 1.0 0.64 0.54 0.2 0.21 0.2 0.21
0.71 0.61 0.57 0.59 0.55 0.55 0.6 0.66 0.71 0.66 0.7 0.71 0.44 0.43 0.65 0.51 0.4 0.36 0.57 0.22 0.46 0.35 0.46 0.46 0.79 1.0 0.93 0.82 0.49 0.45 0.6 0.76
0.46 0.48 0.21 0.13 0.11 0.07 0.11 0.08 0.07 0.05 0.11 0.2 0.05 0.22 0.0 0.05 0.24 0.28 0.4 0.04 0.23 0.0 0.1 0.06 0.37 0.06 0.21 0.11 0.24 0.27 1.0 0.78
0.04 0.02 0.08 0.05 0.07 0.16 0.3 0.3 0.29 0.21 0.12 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.1 0.35 0.3 0.03 0.41 0.05 0.06 0.07 0.6 0.45 0.85 0.59 0.22 0.22 1.0 0.66
0.21 0.22 0.23 0.21 0.24 0.22 0.32 0.24 0.25 0.23 0.23 0.21 0.17 0.28 0.3 0.2 0.14 0.16 0.3 0.12 0.18 0.09 0.14 0.16 0.11 0.21 0.26 0.2 0.19 0.21 1.0 0.77
0.02 0.04 0.06 0.05 0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.0 0.08 0.01 0.04 0.04 0.06 0.08 0.06 0.05 0.4 0.0 0.0 0.03 0.06 0.04 0.05 0.05 0.11 0.1 0.01 0.06 1.0 0.54
0.1 0.07 0.07 0.07 0.12 0.07 0.15 0.14 0.18 0.18 0.17 0.16 0.12 0.07 0.07 0.18 0.07 0.23 0.11 0.01 0.18 0.0 0.09 0.11 0.05 0.28 0.31 0.21 0.14 0.12 0.75 1.0
0.43 0.5 0.46 0.53 0.57 0.5 0.54 0.61 0.53 0.63 0.63 0.53 0.45 0.51 0.47 0.46 0.33 0.19 0.49 0.19 0.17 0.46 0.41 0.43 0.67 1.0 0.76 0.65 0.36 0.38 0.48 0.69
0.44 0.47 0.51 0.52 0.51 0.5 0.39 0.48 0.5 0.51 0.49 0.44 0.46 0.32 0.28 0.38 0.28 0.33 0.34 0.02 0.14 0.12 0.42 0.42 0.39 1.0 0.85 0.62 0.29 0.31 0.5 0.58
0.15 0.12 0.08 0.11 0.09 0.09 0.1 0.09 0.07 0.09 0.08 0.08 0.04 0.07 0.1 0.06 0.07 0.1 0.1 0.05 0.05 0.07 0.08 0.09 0.09 0.08 0.13 0.1 0.06 0.06 1.0 0.54
0.32 0.3 0.29 0.26 0.26 0.26 0.29 0.32 0.27 0.27 0.26 0.3 0.02 0.06 0.02 0.02 0.25 0.35 0.09 0.03 0.16 0.0 0.12 0.08 0.32 0.12 0.47 0.47 0.22 0.22 1.0 0.98
0.07 0.07 0.08 0.1 0.11 0.08 0.1 0.12 0.07 0.07 0.09 0.05 0.12 0.06 0.06 0.13 0.12 0.15 0.17 0.01 0.01 0.02 0.17 0.19 0.08 0.48 0.42 0.32 0.1 0.1 0.86 1.0
0.2 0.14 0.14 0.15 0.18 0.2 0.23 0.28 0.27 0.27 0.27 0.24 0.11 0.21 0.26 0.1 0.14 0.14 0.15 0.0 0.09 0.11 0.1 0.13 0.08 0.17 0.32 0.22 0.14 0.15 0.64 1.0
0.38 0.51 0.55 0.47 0.44 0.5 0.4 0.33 0.3 0.25 0.26 0.25 0.13 0.14 0.17 0.11 0.4 0.4 0.2 0.02 0.09 0.02 0.26 0.24 0.45 0.2 1.0 0.91 0.25 0.24 0.7 0.61
0.26 0.27 0.29 0.29 0.48 0.34 0.36 0.42 0.4 0.4 0.41 0.29 0.39 0.27 0.54 0.45 0.21 0.2 0.39 0.31 0.4 0.28 0.25 0.35 0.27 1.0 0.58 0.55 0.24 0.26 0.18 0.19
0.19 0.13 0.2 0.18 0.25 0.15 0.14 0.15 0.23 0.32 0.25 0.23 0.03 0.02 0.06 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.22 0.01 0.02 0.11 1.0 0.52 0.78 0.01 0.01 0.0 0.0
0.25 0.33 0.47 0.66 0.8 1.0 0.76 0.51 0.5 0.45 0.32 0.25 0.22 0.19 0.4 0.29 0.33 0.19 0.25 0.03 0.03 0.07 0.44 0.44 0.08 0.42 0.72 0.63 0.2 0.23 0.96 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 0.08 0.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 1.0 0.84
0.39 0.68 0.61 0.45 0.42 0.49 0.32 0.37 0.35 0.29 0.4 0.28 0.04 0.14 0.02 0.07 0.31 0.21 0.19 0.0 0.07 0.0 0.25 0.12 0.16 0.28 1.0 0.78 0.33 0.33 0.72 0.61
0.24 0.17 0.19 0.22 0.22 0.2 0.37 0.56 0.36 0.55 0.38 0.62 0.07 0.09 0.01 0.07 0.05 0.03 0.18 0.0 0.02 0.0 0.1 0.13 0.49 0.99 1.0 0.47 0.12 0.1 0.18 0.23
0.33 0.29 0.3 0.31 0.3 0.31 0.37 0.4 0.47 0.52 0.52 0.45 0.27 0.19 0.24 0.29 0.18 0.17 0.27 0.38 0.24 0.44 0.23 0.24 0.36 1.0 0.74 0.56 0.2 0.21 0.32 0.42
0.33 0.4 0.42 0.49 0.51 0.51 0.55 0.42 0.4 0.34 0.32 0.31 0.2 0.35 0.42 0.41 0.35 0.33 0.52 0.09 0.1 0.03 0.32 0.38 0.46 0.36 1.0 0.92 0.34 0.39 0.96 0.89
0.38 0.44 0.5 0.56 0.68 0.72 0.69 0.57 0.44 0.32 0.32 0.29 0.17 0.37 0.58 0.21 0.52 0.37 0.35 0.13 0.16 0.17 0.34 0.32 0.51 0.3 1.0 0.92 0.34 0.34 0.78 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)