Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00246240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.295)	0.92	0.66	0.37	0.18	1.0	0.02	0.0	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.15	0.19	0.5	0.13	0.06	0.07	0.06	0.21	0.04	0.1
AMTR_s00001p00248330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.307)	0.93	0.69	0.4	0.01	1.0	0.07	0.12	0.08	0.18	0.16	0.32	0.26	0.28	0.3	0.32	0.27	0.48	0.3	0.34	0.31	0.26	0.35
AMTR_s00002p00186590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.163)	0.69	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.16	0.06	0.41	0.28	0.37	0.51	0.04	0.05	0.33	0.12	0.39	0.21	0.13	0.05	0.33	0.07
AMTR_s00002p00270370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.580)	0.8	0.45	0.34	0.13	1.0	0.38	0.39	0.17	0.32	0.34	0.44	0.51	0.45	0.6	0.58	0.29	0.39	0.34	0.28	0.32	0.14	0.42
AMTR_s00003p00135920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.102)	1.0	0.55	0.27	0.05	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.03	0.15	0.1	0.03	0.04	0.01	0.01	0.25	0.01	0.05
AMTR_s00003p00269410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.406)	0.97	0.98	0.47	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
AMTR_s00004p00172570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.197)	1.0	0.73	0.51	0.05	0.7	0.01	0.05	0.06	0.08	0.1	0.28	0.31	0.25	0.21	0.47	0.26	0.56	0.44	0.27	0.26	0.23	0.3
AMTR_s00004p00263050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.262)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.17	0.19	0.07	0.15	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00007p00098520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.59)	0.6	1.0	0.25	0.12	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.08	0.09	0.01	0.22	0.0	0.11	0.02	0.02	0.05	0.02	0.11
AMTR_s00007p00190700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.161)	1.0	0.67	0.72	0.18	0.76	0.08	0.05	0.12	0.11	0.1	0.13	0.15	0.25	0.18	0.45	0.11	0.07	0.09	0.08	0.12	0.05	0.2
AMTR_s00007p00255440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.298)	0.32	0.23	0.44	0.06	1.0	0.01	0.07	0.03	0.11	0.09	0.2	0.23	0.22	0.17	0.38	0.17	0.21	0.18	0.17	0.12	0.14	0.32
AMTR_s00008p00124620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.55)	0.6	1.0	0.72	0.16	0.9	0.24	0.13	0.11	0.12	0.15	0.25	0.3	0.26	0.24	0.67	0.57	0.12	0.39	0.25	0.25	0.26	0.34
AMTR_s00009p00263240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.357)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.15	0.11	0.46	0.46	0.2	0.09	0.48	0.08	0.68	0.02	0.09	0.06	0.04	0.08
AMTR_s00009p00264800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.376)	1.0	0.71	0.1	0.0	0.77	0.31	0.02	0.0	0.1	0.06	0.05	0.07	0.19	0.64	0.76	0.1	0.0	0.03	0.03	0.01	0.02	0.32
AMTR_s00010p00152350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.112)	0.86	0.57	0.69	0.24	1.0	0.02	0.03	0.07	0.06	0.05	0.22	0.25	0.2	0.54	0.13	0.18	0.16	0.19	0.28	0.36	0.08	0.14
AMTR_s00010p00264140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.497)	0.25	0.24	0.53	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.04	0.21	0.16	0.32	0.03	0.14	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06
AMTR_s00012p00151310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.87)	1.0	0.77	0.53	0.18	0.54	0.17	0.03	0.04	0.1	0.07	0.25	0.24	0.23	0.21	0.25	0.24	0.24	0.15	0.2	0.33	0.1	0.23
AMTR_s00013p00262410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.281)	1.0	0.89	0.0	0.19	0.63	0.0	0.07	0.14	0.08	0.09	0.39	0.39	0.4	0.3	0.45	0.23	0.38	0.39	0.39	0.39	0.8	0.34
AMTR_s00016p00116320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.77)	0.92	1.0	0.81	0.07	0.97	0.12	0.06	0.17	0.19	0.16	0.2	0.26	0.35	0.35	0.46	0.22	0.09	0.18	0.18	0.21	0.11	0.56
AMTR_s00016p00130370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.90)	0.95	0.71	0.31	0.07	1.0	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.16	0.51	0.84	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
AMTR_s00016p00259850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.370)	0.41	0.39	0.5	0.0	1.0	0.05	0.1	0.16	0.13	0.15	0.16	0.3	0.21	0.21	0.31	0.26	0.12	0.13	0.11	0.12	0.13	0.13
AMTR_s00020p00161780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.57)	1.0	0.27	0.76	0.03	0.46	0.0	0.01	0.02	0.06	0.22	0.08	0.16	0.04	0.17	0.24	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04
AMTR_s00022p00032270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.16)	0.94	0.22	0.29	0.0	1.0	0.02	0.13	0.09	0.14	0.11	0.4	0.28	0.08	0.12	0.22	0.07	0.19	0.17	0.12	0.09	0.11	0.11
AMTR_s00022p00230580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.309)	0.32	0.47	0.43	0.03	1.0	0.19	0.04	0.0	0.05	0.06	0.19	0.15	0.23	0.25	0.23	0.16	0.1	0.09	0.16	0.13	0.06	0.15
AMTR_s00024p00234280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.257)	1.0	0.58	0.28	0.08	0.82	0.0	0.07	0.03	0.16	0.14	0.11	0.08	0.09	0.22	0.54	0.02	0.06	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05
AMTR_s00025p00116370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.106)	0.04	0.08	0.0	0.01	1.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.42	0.65	0.42	0.56	0.61	0.02	0.6	0.23	0.13	0.1	0.4	0.43
AMTR_s00025p00133870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.136)	0.83	1.0	0.54	0.26	0.88	0.16	0.22	0.4	0.39	0.48	0.27	0.29	0.43	0.58	0.88	0.28	0.27	0.2	0.16	0.59	0.15	0.44
AMTR_s00028p00071100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.14)	0.65	0.26	0.47	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.1	0.16	0.18	0.45	0.28	0.13	0.07	0.05	0.19	0.06	0.12
AMTR_s00029p00047020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.34)	0.75	0.35	0.06	0.02	1.0	0.2	0.02	0.03	0.09	0.05	0.0	0.07	0.01	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
AMTR_s00029p00098130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.92)	0.99	0.87	0.24	0.05	1.0	0.13	0.12	0.04	0.14	0.14	0.3	0.29	0.27	0.46	0.58	0.26	0.13	0.16	0.14	0.23	0.08	0.2
AMTR_s00032p00231660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.256)	1.0	0.49	0.56	0.18	0.57	0.17	0.07	0.09	0.08	0.09	0.24	0.27	0.25	0.22	0.23	0.21	0.25	0.18	0.2	0.23	0.12	0.26
AMTR_s00036p00206680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.124)	1.0	0.89	0.44	0.34	0.67	0.19	0.14	0.17	0.18	0.16	0.24	0.33	0.41	0.4	0.63	0.28	0.14	0.17	0.22	0.3	0.18	0.39
AMTR_s00036p00209710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.129)	1.0	0.46	0.18	0.03	0.61	0.42	0.14	0.03	0.11	0.12	0.03	0.03	0.11	0.3	0.46	0.05	0.02	0.03	0.02	0.15	0.03	0.08
AMTR_s00038p00081060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.37)	0.14	0.04	0.14	0.1	0.97	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.17	0.87	1.0	0.04	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07
AMTR_s00040p00042140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.19)	0.64	0.31	0.38	0.06	1.0	0.57	0.24	0.08	0.12	0.14	0.18	0.25	0.18	0.23	0.46	0.14	0.15	0.12	0.11	0.14	0.03	0.2
AMTR_s00040p00104050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.71)	0.99	0.61	0.44	0.14	1.0	0.1	0.07	0.09	0.1	0.07	0.23	0.31	0.41	0.55	0.56	0.25	0.26	0.18	0.18	0.2	0.07	0.49
AMTR_s00040p00173680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.160)	0.46	0.91	0.73	0.22	1.0	0.19	0.14	0.21	0.12	0.13	0.35	0.4	0.37	0.55	0.2	0.3	0.22	0.26	0.29	0.35	0.1	0.5
AMTR_s00045p00206880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.274)	0.63	0.76	0.41	0.1	1.0	0.1	0.07	0.41	0.36	0.41	0.07	0.08	0.22	0.39	0.74	0.25	0.04	0.12	0.13	0.35	0.13	0.27
AMTR_s00048p00081140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.38)	1.0	0.99	0.5	0.01	0.97	0.03	0.2	0.21	0.19	0.26	0.42	0.53	0.49	0.33	0.56	0.39	0.86	0.36	0.39	0.53	0.24	0.56
AMTR_s00048p00185950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.139)	0.39	0.69	0.0	0.08	1.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.07	0.33	0.35	0.21	0.09	0.06	0.18	0.29	0.16	0.25	0.08	0.08	0.06
AMTR_s00049p00015390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.5)	1.0	0.93	0.04	0.0	0.86	0.0	0.03	0.0	0.04	0.03	0.22	0.37	0.29	0.2	0.34	0.17	0.33	0.14	0.12	0.22	0.09	0.29
AMTR_s00049p00194790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.206)	0.62	0.69	0.38	0.12	1.0	0.1	0.03	0.01	0.02	0.02	0.16	0.19	0.43	0.46	0.58	0.26	0.09	0.1	0.13	0.14	0.15	0.25
AMTR_s00050p00228770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.104)	1.0	0.77	0.31	0.25	0.71	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.07	0.11	0.04	0.1	0.49	0.0	0.02	0.01	0.01	0.18	0.01	0.06
AMTR_s00053p00195030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.146)	1.0	0.76	0.38	0.01	0.61	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.08	0.14	0.35	0.31	0.05	0.04	0.03	0.03	0.14	0.03	0.1
AMTR_s00054p00177020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00054.65)	0.69	1.0	0.35	0.14	0.45	0.01	0.06	0.0	0.09	0.08	0.14	0.17	0.11	0.29	0.35	0.02	0.13	0.04	0.08	0.05	0.11	0.09
AMTR_s00058p00198960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.201)	0.8	0.73	0.55	0.06	1.0	0.14	0.31	0.06	0.3	0.37	0.06	0.06	0.17	0.22	0.49	0.14	0.06	0.03	0.07	0.18	0.03	0.08
AMTR_s00062p00098880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.72)	0.65	1.0	0.43	0.06	0.47	0.09	0.01	0.0	0.02	0.02	0.13	0.13	0.08	0.09	0.09	0.04	0.19	0.13	0.13	0.05	0.34	0.05
AMTR_s00062p00178830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.173)	0.21	0.25	0.33	0.23	0.96	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.21	0.6	1.0	0.35	0.04	0.08	0.04	0.13	0.03	0.09
AMTR_s00065p00019420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.5)	1.0	0.45	0.2	0.0	0.49	0.02	0.04	0.0	0.08	0.03	0.03	0.16	0.01	0.01	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00065p00204650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.192)	0.56	0.64	0.73	0.04	1.0	0.01	0.2	0.03	0.35	0.2	0.05	0.08	0.1	0.36	0.28	0.08	0.04	0.04	0.07	0.16	0.11	0.21
AMTR_s00066p00158540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.165)	1.0	0.49	0.44	0.0	0.75	0.0	0.02	0.02	0.05	0.04	0.09	0.11	0.13	0.03	0.19	0.03	0.25	0.03	0.06	0.06	0.02	0.16
AMTR_s00068p00056320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.23)	1.0	0.61	0.38	0.01	0.53	0.0	0.06	0.13	0.13	0.11	0.14	0.23	0.32	0.25	0.2	0.07	0.08	0.22	0.13	0.16	0.09	0.41
AMTR_s00069p00138950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.103)	0.92	0.89	0.05	0.01	1.0	0.01	0.12	0.13	0.08	0.09	0.49	0.47	0.31	0.2	0.22	0.23	0.52	0.39	0.43	0.23	0.3	0.26
AMTR_s00069p00197220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.211)	1.0	0.8	0.31	0.1	0.5	0.12	0.13	0.16	0.12	0.11	0.57	0.35	0.49	0.29	0.3	0.31	0.39	0.32	0.42	0.29	0.29	0.33
AMTR_s00072p00184150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.133)	0.8	0.49	0.53	0.15	0.71	0.12	0.01	0.04	0.01	0.01	0.24	0.17	0.26	0.77	1.0	0.19	0.14	0.16	0.19	0.39	0.07	0.31
AMTR_s00082p00169880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00082.41)	1.0	0.9	0.54	0.06	0.65	0.13	0.09	0.13	0.17	0.17	0.13	0.16	0.14	0.25	0.18	0.15	0.1	0.09	0.1	0.15	0.08	0.14
AMTR_s00085p00035990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.11)	0.53	0.78	0.0	0.0	1.0	0.0	0.21	0.3	0.43	0.25	0.02	0.09	0.12	0.4	0.44	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.2
AMTR_s00087p00084520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.26)	1.0	0.93	0.51	0.12	0.76	0.0	0.13	0.3	0.15	0.17	0.49	0.58	0.33	0.21	0.22	0.23	0.11	0.27	0.24	0.19	0.02	0.22
AMTR_s00088p00095460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.57)	0.48	0.73	0.56	0.13	1.0	0.57	0.16	0.04	0.39	0.36	0.13	0.21	0.36	0.31	0.43	0.16	0.07	0.15	0.18	0.29	0.11	0.36
AMTR_s00096p00172010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.119)	0.93	1.0	0.06	0.11	0.4	0.01	0.16	0.0	0.14	0.1	0.37	0.38	0.25	0.25	0.34	0.21	0.3	0.27	0.31	0.25	0.29	0.24
AMTR_s00098p00078240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.15)	0.73	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.23	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00099p00096450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.75)	1.0	0.79	0.41	0.13	0.69	0.02	0.1	0.05	0.16	0.15	0.43	0.32	0.44	0.26	0.37	0.18	0.23	0.31	0.24	0.22	0.24	0.3
AMTR_s00104p00016370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.1)	1.0	0.49	0.0	0.12	0.33	0.0	0.03	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.09	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00109p00138160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.147)	0.83	1.0	0.09	0.05	0.69	0.02	0.1	0.02	0.08	0.08	0.58	0.65	0.47	0.21	0.28	0.32	0.47	0.4	0.44	0.35	0.18	0.34
AMTR_s00129p00124600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.100)	0.83	0.69	0.44	0.29	1.0	0.0	0.1	0.1	0.11	0.13	0.32	0.15	0.31	0.18	0.23	0.23	0.47	0.21	0.11	0.11	0.1	0.15
AMTR_s00140p00045380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.17)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.17	0.01	0.47	0.28	0.26	0.43	0.15	0.04	0.11	0.07	0.8	0.19	0.26	0.06	0.13	0.14
AMTR_s00142p00098900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00142.65)	0.65	0.06	0.42	0.12	1.0	0.35	0.2	0.1	0.15	0.16	0.08	0.11	0.13	0.11	0.2	0.13	0.07	0.09	0.06	0.1	0.04	0.11
AMTR_s00144p00007850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.1)	1.0	0.66	0.09	0.03	0.58	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.14	0.12	0.23	0.12	0.11	0.14	0.11	0.07	0.06	0.02	0.02	0.09
AMTR_s00162p00048220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00162.23)	0.7	0.74	0.19	0.14	1.0	0.0	0.01	0.06	0.06	0.09	0.28	0.25	0.29	0.35	0.55	0.22	0.21	0.25	0.22	0.26	0.25	0.27
AMTR_s00164p00013910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.1)	0.88	0.72	0.16	0.01	1.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.33	0.52	0.21	0.19	0.3	0.16	0.35	0.57	0.45	0.29	0.31	0.2
AMTR_s00168p00035700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00168.9)	0.64	0.91	0.59	0.11	1.0	0.06	0.33	0.32	0.31	0.34	0.21	0.37	0.26	0.22	0.26	0.08	0.26	0.1	0.1	0.11	0.06	0.22
AMTR_s00202p00030010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00202.9)	0.9	1.0	0.81	0.14	0.85	0.01	0.04	0.09	0.05	0.04	0.35	0.31	0.23	0.24	0.17	0.18	0.08	0.33	0.22	0.09	0.26	0.07
AMTR_s00366p00014600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00366.2)	0.0	0.0	0.52	0.0	1.0	0.0	0.06	0.0	0.04	0.06	0.0	0.2	0.05	0.03	0.32	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
AMTR_s01385p00008180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01385.1)	0.72	0.48	0.56	0.0	1.0	0.19	0.1	0.06	0.18	0.15	0.11	0.17	0.19	0.22	0.25	0.14	0.12	0.1	0.12	0.09	0.07	0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)