Heatmap: Cluster_144 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.34 -0.0 0.34 0.37 0.39 0.43 0.41 0.07 0.06 -0.17 -0.07 -0.5 0.27 1.35 1.55 0.55 0.34 -0.17 -0.92 -5.27 -5.03 -2.7 0.27 0.42 -3.55 -0.48 -0.55 -0.04 -0.31 -0.08 -0.44 -1.06
-0.53 0.44 0.31 0.38 0.22 0.09 0.11 -0.51 -0.33 -0.45 -0.55 -0.49 -0.64 1.06 2.37 -0.63 0.38 -1.19 -0.18 -0.06 -0.09 0.88 -0.76 -0.76 -0.5 -1.25 -0.99 -0.45 -0.58 -0.43 -1.33 -2.07
-0.2 -0.26 -0.23 -0.02 -0.01 -0.02 0.08 0.13 -0.08 -0.13 -0.13 -0.34 0.47 0.4 1.63 0.75 -0.49 -0.87 0.53 -0.71 -1.17 -0.94 -0.34 -0.17 -1.44 0.71 0.38 0.27 -0.56 -0.48 -0.55 -0.47
0.44 -0.1 -0.38 -0.42 -0.02 -0.09 -1.44 -0.5 0.05 0.33 0.44 0.27 0.36 2.43 2.26 1.27 -0.32 -0.56 -3.64 - - - -0.14 -0.74 -7.16 -2.69 -0.84 -0.64 -1.17 -0.62 -0.92 -1.3
-0.36 -0.37 -0.42 -0.22 -0.21 -0.21 -0.36 -0.36 -0.28 -0.31 -0.29 -0.59 0.72 1.16 1.56 0.74 -0.32 -0.41 0.05 0.32 0.03 -0.4 -0.23 -0.1 0.56 -0.41 -0.48 -0.28 -0.53 -0.35 -0.64 -0.6
-0.11 -0.21 0.0 0.19 0.11 0.19 0.01 0.01 -0.07 -0.13 -0.28 -0.47 0.34 0.85 1.37 0.53 -0.02 -0.3 0.14 -2.02 -1.41 -3.78 0.43 0.53 -0.05 -0.43 -0.07 0.11 -0.41 -0.36 -0.37 -0.17
-0.22 -0.2 0.22 0.38 0.05 -0.11 0.2 -0.11 -0.34 -0.59 -0.21 -0.53 0.91 1.3 2.52 0.62 -0.48 -1.17 -0.96 -1.43 - - 1.01 -0.55 -4.05 -1.37 -1.08 -0.04 -0.76 -0.56 -0.64 -0.75
0.01 0.12 0.18 0.17 0.24 0.28 0.11 0.13 -0.0 0.05 -0.04 -0.16 0.42 0.51 1.35 0.47 -0.42 -0.5 0.14 -1.25 -1.4 -2.26 -0.07 0.05 -0.12 -0.16 -0.1 -0.06 -0.42 -0.29 -0.3 -0.28
-0.14 0.16 0.03 0.28 0.27 0.17 0.08 -0.26 -0.29 -0.48 -0.36 -0.55 -0.25 0.61 1.65 0.08 0.15 0.07 0.19 -0.66 -1.99 -1.36 0.05 0.16 0.06 -1.18 0.48 0.41 -0.25 -0.11 -0.66 -0.66
-0.16 -0.02 0.1 0.15 0.17 0.16 0.16 0.19 -0.04 -0.03 -0.04 -0.13 0.5 0.99 1.44 0.48 -0.15 -0.55 0.29 -6.01 -5.0 -10.62 -0.01 0.01 -1.19 0.1 0.35 0.13 -0.26 -0.21 -0.24 -0.31
-0.54 -0.37 -0.22 0.16 -0.14 0.17 -0.09 -0.13 -0.33 -0.17 -0.4 -0.42 0.72 1.28 1.16 0.46 -0.23 -0.11 -0.13 0.09 -1.54 0.26 -0.08 -0.05 -0.58 0.28 0.14 0.04 -0.45 -0.33 -1.01 -0.85
-0.54 0.27 0.18 0.04 0.19 0.44 0.3 0.19 0.22 -0.18 -0.09 -0.38 0.94 1.08 1.96 0.89 -0.47 -2.22 -0.04 - -7.61 -5.76 -0.36 -0.42 -2.23 0.35 0.11 0.51 -0.57 -0.21 -1.86 -1.69
0.47 0.59 0.26 0.12 -0.05 -0.05 -0.25 -0.15 -0.06 -0.03 -0.01 -0.01 -0.03 0.87 0.89 0.39 -0.28 -0.45 0.17 -2.84 -1.82 -2.18 0.01 0.41 0.23 0.17 0.29 0.44 -0.55 -0.36 -0.7 -0.59
-0.26 -0.18 -0.11 -0.03 0.05 -0.15 -0.13 -0.01 -0.12 -0.11 -0.06 -0.22 0.48 0.94 1.84 0.57 -0.45 -1.06 0.13 -1.28 -2.53 -2.65 -0.07 0.15 0.06 0.36 0.12 0.0 -0.57 -0.43 -0.39 -0.37
0.04 0.01 0.07 0.1 0.03 0.36 0.11 -0.11 0.07 -0.03 0.04 0.09 -0.13 0.88 1.84 0.44 -0.31 -0.61 0.27 -1.81 0.0 -2.69 -0.28 -0.09 -0.59 -1.08 -0.4 -0.46 -0.16 -0.04 -0.55 -0.6
-0.31 -0.01 -0.27 0.08 0.0 -0.2 0.0 -0.3 -0.29 -0.24 -0.4 -0.21 0.81 1.63 1.52 0.55 -0.37 -0.78 0.21 -0.07 -0.78 -1.34 0.05 0.22 -0.79 -0.09 -0.4 -0.25 -0.49 -0.4 -1.02 -1.14
-0.16 -0.18 -0.19 0.03 -0.01 0.19 -0.04 0.13 0.11 -0.14 -0.13 -0.42 0.45 0.62 1.55 0.92 -0.25 -0.14 0.19 -1.85 -2.43 -2.73 -0.18 0.02 -0.31 0.24 0.37 0.28 -0.16 0.04 -1.05 -1.19
-0.6 -0.35 -0.85 0.32 -0.0 0.06 -0.36 -0.35 -0.02 -0.31 0.01 -0.39 0.68 1.24 2.36 0.72 -0.23 -1.77 -0.71 -4.19 - - 1.36 -0.27 -3.3 -0.59 -0.18 0.32 -0.63 -0.26 -0.6 -0.7
-0.42 -0.34 -0.14 0.11 0.19 0.11 -0.1 -0.24 -0.04 -0.21 -0.42 -0.42 0.46 1.34 1.33 0.47 -0.35 -0.87 0.2 -0.12 -0.62 -0.34 -0.17 -0.11 -0.29 0.13 0.1 0.34 -0.52 -0.3 -0.97 -1.23
-0.08 -0.02 0.08 0.16 0.19 0.03 -0.04 -0.19 -0.08 -0.07 -0.19 -0.31 0.15 1.27 1.24 0.49 -0.31 0.04 -0.04 -2.07 -0.07 -0.0 0.44 0.45 -1.47 -0.57 -0.85 -0.78 -0.34 -0.35 -0.42 -0.35
0.26 0.08 0.11 0.13 0.23 0.44 -0.13 -0.15 0.01 -0.05 -0.19 -0.23 0.06 1.47 1.74 0.67 -0.03 -0.16 -0.55 -5.4 -7.54 -6.69 0.38 0.26 -3.11 -0.85 -0.28 0.0 -0.34 -0.01 -0.54 -0.49
0.57 0.36 0.06 0.2 -0.06 -0.01 -1.32 -0.56 -0.17 0.2 0.14 0.28 1.64 2.26 2.67 0.94 -3.3 -2.82 -4.1 - - -5.35 -3.18 -2.12 -2.82 -0.8 -0.63 -0.32 -2.99 -1.86 -2.97 -3.07
-0.08 -0.2 -0.24 -0.22 -0.09 0.05 -0.19 -0.36 -0.43 -0.7 -0.54 -0.76 0.38 1.25 1.99 0.1 -0.27 -0.29 -0.07 -0.05 -0.38 -0.41 -0.4 -0.2 0.67 -0.85 -0.08 -0.3 -0.56 -0.44 -0.55 -0.37
-0.0 0.22 0.26 0.21 0.05 0.2 0.01 -0.43 -0.44 -0.4 -0.38 -0.43 -0.14 1.27 2.28 0.98 0.02 -0.21 -1.08 -1.34 -1.25 -0.73 0.06 0.17 -1.41 -1.34 -1.38 -1.04 -0.34 -0.2 -0.6 -0.91
-0.17 -0.13 0.07 0.12 0.2 0.26 0.36 0.29 0.28 0.11 0.16 -0.17 0.32 1.28 1.54 -0.11 0.06 -0.33 -0.29 -2.04 -2.78 -2.32 -0.3 -0.36 -0.89 -0.48 -0.2 -0.12 -0.33 -0.18 -0.17 -0.09
-0.64 -0.6 -0.53 -0.37 -0.09 -0.34 -0.33 -0.52 -0.36 -0.47 -0.58 -0.61 0.75 1.35 1.91 0.68 -0.14 -0.09 -0.24 -0.76 0.33 0.12 -0.16 0.04 0.68 -0.51 -0.63 -0.26 -0.44 -0.44 -1.22 -1.51
-0.19 -0.23 -0.13 -0.02 -0.06 0.0 0.12 -0.02 0.09 0.0 0.03 -0.19 0.61 1.44 1.37 0.19 0.29 0.0 0.09 -2.38 -3.03 -1.27 -0.07 -0.03 -1.06 -0.55 -0.47 -0.37 0.03 0.14 -0.21 -0.31
-0.87 -0.34 0.24 0.47 0.41 0.14 0.66 0.36 0.13 0.02 -0.22 -0.72 1.6 1.83 2.01 1.2 -1.49 -1.89 -1.58 -3.76 -2.64 -3.05 -2.43 -1.95 -3.14 0.42 -0.11 -0.03 -1.9 -1.45 -2.01 -1.67
-0.3 -0.29 -0.33 -0.2 -0.22 -0.17 -0.35 -0.26 -0.2 -0.23 -0.23 -0.32 0.65 0.84 1.17 0.78 0.02 0.12 0.6 -1.13 -0.84 -0.65 0.49 0.62 -1.2 -0.33 -0.9 -0.97 -0.02 0.03 -0.01 0.2
-0.38 -0.06 -0.1 -0.02 -0.2 -0.24 -0.25 -0.59 -0.65 -0.75 -0.56 -0.83 0.14 1.87 2.55 -0.04 -0.3 -0.8 -0.0 -3.56 -3.82 -3.85 -0.73 -0.86 -1.15 -0.75 0.72 0.54 -1.0 -0.95 0.49 -0.42
-0.1 0.2 0.11 0.11 -0.05 -0.12 -0.05 -0.21 -0.05 -0.05 0.04 -0.02 0.02 1.05 1.36 0.18 -0.17 -0.09 0.29 -1.86 -0.3 -1.84 -0.02 0.06 -0.3 0.32 -0.14 0.05 -0.38 -0.21 -0.7 -0.74
-0.25 -0.28 -0.27 -0.12 -0.13 -0.02 0.05 -0.05 -0.03 -0.17 -0.19 -0.35 0.46 1.21 1.77 0.41 -0.36 -0.87 0.24 -1.06 -0.83 -0.42 -0.23 -0.07 -0.37 0.07 -0.03 0.11 -0.37 -0.23 -0.81 -0.88
0.17 0.16 0.29 0.22 0.26 0.21 0.23 0.17 0.17 0.16 0.15 0.08 0.25 1.11 1.33 0.21 -0.22 -0.39 -0.03 -2.97 -2.22 -3.17 -0.16 -0.11 -0.47 -0.29 -0.13 -0.15 -0.54 -0.48 -0.36 -0.2
-0.12 0.3 0.26 0.08 0.06 0.08 0.09 -0.06 -0.06 0.01 0.18 -0.03 0.44 0.95 1.24 0.64 0.01 0.04 -0.11 -2.0 -1.39 -0.5 0.5 0.52 -1.72 -0.84 -1.45 -1.01 -0.19 -0.0 -0.51 -0.43
-0.27 -0.0 0.02 0.15 0.06 0.2 -0.07 -0.21 -0.21 -0.21 -0.27 -0.48 0.56 1.14 1.5 0.86 -0.4 -0.62 -0.02 -0.12 -2.1 -2.91 0.2 0.21 0.04 -0.06 0.05 0.21 -0.66 -0.38 -1.21 -1.09
0.0 0.06 -0.04 0.02 0.16 0.03 0.07 -0.13 -0.13 -0.32 -0.3 -0.39 -0.04 0.63 1.1 0.14 -0.05 -0.32 0.44 -2.16 -1.47 -1.81 0.06 0.56 0.11 -0.15 0.5 0.65 -0.3 -0.13 -0.42 -0.2
0.05 -0.06 -0.05 0.13 0.14 0.35 0.28 0.02 -0.01 0.04 -0.01 -0.23 0.38 1.16 0.9 0.23 0.17 0.29 0.07 -1.27 -1.97 -1.33 0.18 0.28 -1.08 -0.84 -0.43 -0.15 -0.1 0.17 -0.58 -0.55
0.19 0.23 0.16 0.11 0.18 0.19 0.14 -0.12 -0.22 -0.22 -0.26 -0.4 0.04 0.41 1.1 0.66 -0.21 -0.38 0.58 -2.67 -1.35 -2.39 0.06 0.2 -0.53 0.0 0.4 0.37 -0.24 -0.14 -0.18 -0.34
-0.64 -0.32 -0.0 0.15 0.14 0.16 0.05 -0.07 0.11 0.13 -0.0 -0.4 0.18 1.96 2.22 1.19 -0.43 -0.53 -0.6 -5.29 -3.31 -4.42 -0.16 -0.0 -3.08 -0.77 -0.96 -0.86 -0.5 -0.38 -1.31 -0.99
-0.22 -0.4 -0.31 0.01 -0.14 -0.1 -0.08 0.09 0.03 0.02 -0.07 -0.04 0.59 0.97 1.16 -0.15 -0.18 -0.6 -0.32 -1.3 -0.25 -1.84 0.12 0.27 0.9 0.04 -0.09 -0.09 -0.3 -0.22 -0.38 -0.34
-0.13 -0.06 -0.04 0.05 -0.02 0.01 0.05 0.12 0.1 0.12 0.14 -0.03 0.46 1.35 1.42 0.55 -0.49 -0.74 -0.19 -1.37 -1.26 -2.03 -0.22 -0.02 0.29 -0.16 -0.42 -0.44 -0.65 -0.51 -0.29 -0.23
-0.21 -0.09 0.02 0.07 0.07 -0.0 0.07 -0.08 -0.13 0.04 -0.11 -0.27 0.1 1.02 1.2 0.25 -0.48 0.17 0.18 -1.01 -0.88 -2.98 -0.18 -0.15 0.11 -0.06 0.27 0.43 -0.52 -0.32 -0.15 -0.18
-0.0 0.22 0.26 0.21 0.05 0.2 0.01 -0.43 -0.44 -0.4 -0.38 -0.43 -0.14 1.27 2.28 0.98 0.02 -0.21 -1.08 -1.34 -1.25 -0.73 0.06 0.17 -1.41 -1.34 -1.38 -1.04 -0.34 -0.2 -0.6 -0.91
-0.41 -0.46 -0.69 -0.57 -0.78 -0.55 -0.37 -0.49 -0.19 -0.2 -0.13 -0.26 0.67 1.67 1.71 0.93 -0.64 -0.25 0.76 -6.82 -3.2 - -0.5 0.04 -1.64 -0.02 -0.46 -0.85 -0.05 0.23 0.38 0.98
-0.12 0.16 0.14 0.29 0.23 0.24 0.27 0.11 0.12 0.2 0.09 -0.04 0.12 0.85 1.57 0.17 -0.3 -0.76 -0.16 -3.42 -0.86 -1.84 0.04 0.3 -0.18 -0.33 -0.2 -0.01 -0.62 -0.44 -0.46 -0.69
0.28 0.19 -0.05 0.11 0.06 0.15 0.16 0.07 0.03 -0.03 -0.08 -0.11 0.34 1.42 1.9 0.21 -0.26 -0.41 -0.09 -1.49 -2.48 -2.08 -0.38 -0.28 -1.43 -0.52 -0.24 -0.28 -0.42 -0.28 -0.53 -0.5
-0.16 0.07 0.13 0.2 0.05 0.04 0.02 0.05 0.01 -0.04 -0.09 -0.07 0.49 1.73 1.11 0.43 -0.21 -0.28 -0.05 -2.06 -2.12 -3.1 -0.08 -0.08 -0.33 -0.47 -0.05 -0.03 -0.31 -0.18 -0.6 -0.59
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0.06 0.04 0.23 0.32 0.31 0.48 0.24 0.32 0.32 0.33 0.23 0.12 0.18 1.1 1.32 0.42 -0.37 -0.89 0.15 -3.5 -1.37 -2.98 -0.44 -0.38 0.16 0.13 -0.57 -0.51 -0.37 -0.25 -1.26 -1.29
-0.23 -0.16 -0.3 -0.03 -0.05 0.07 0.01 -0.18 -0.17 -0.0 -0.19 -0.29 0.67 1.02 1.04 0.56 -0.32 -0.16 0.15 -1.53 -0.08 -2.4 0.02 -0.11 0.46 -0.19 0.07 -0.28 -0.35 -0.25 -0.27 0.03
-0.33 0.04 0.19 0.35 0.12 -0.04 -0.09 -0.45 -0.19 -0.39 -0.28 -0.43 -0.29 1.35 2.23 -0.23 0.08 -0.47 -0.52 -0.54 -1.97 -0.54 0.46 0.75 -1.9 -0.61 -0.86 -0.38 -0.71 -0.46 -0.64 -0.92
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0.11 0.4 0.21 0.13 0.18 0.36 0.0 -0.7 -0.56 -0.63 -0.5 -0.69 0.03 1.31 1.51 1.03 0.16 0.63 0.16 -1.74 -3.6 -3.04 0.46 0.38 -4.55 -1.28 -0.44 -0.33 -0.08 0.29 -0.77 -0.88
-0.25 -0.29 0.06 -0.01 0.04 0.07 -0.02 -0.23 0.07 -0.07 -0.12 -0.35 0.14 0.89 1.31 0.37 -0.06 -0.2 0.49 -1.94 -2.76 -5.73 -0.2 -0.25 0.12 0.02 0.48 0.54 -0.22 -0.05 -0.33 0.02
-0.03 -0.13 -0.15 -0.04 0.0 0.18 -0.04 -0.14 -0.14 -0.18 -0.34 -0.28 0.5 1.11 1.86 0.47 -0.11 -0.28 -0.01 -0.94 -1.76 -1.59 -0.31 -0.1 0.4 -0.69 -0.33 -0.52 -0.29 -0.19 -0.51 -0.36
-0.16 -0.23 -0.06 -0.1 -0.24 0.31 -0.13 0.16 0.22 0.25 0.06 0.05 0.29 0.55 1.61 0.33 -0.58 -0.35 0.15 -2.18 -5.89 -0.1 -0.43 -0.2 -0.65 0.14 0.38 0.07 -0.5 -0.24 -0.16 -0.1
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-0.69 -0.28 -0.38 -0.03 -0.19 -0.18 -0.32 -0.94 -0.49 -0.72 -0.43 -0.37 0.62 2.14 2.13 0.55 -0.85 -1.05 0.43 -1.79 -4.02 -0.29 -0.36 0.34 -2.33 -0.11 -0.89 -0.92 -0.78 -0.36 -0.13 0.02
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-0.14 0.23 0.31 0.24 0.27 0.11 0.23 -0.3 -0.06 -0.11 -0.1 -0.21 0.83 1.68 2.11 1.07 -0.28 -1.28 -1.27 -2.05 -2.41 -2.65 -0.38 -0.43 -0.96 -1.07 -1.05 -0.54 -0.7 -0.3 -1.35 -1.24
0.05 0.23 0.23 -0.05 -0.02 0.1 0.11 -0.04 0.25 0.22 0.28 -0.01 1.14 1.37 2.23 0.94 -0.41 -1.02 -0.42 -1.55 -1.15 -5.93 -2.35 -1.52 -1.33 -0.19 -0.76 -0.47 -1.23 -0.74 -1.55 -1.78
-0.11 -0.13 -0.12 0.02 -0.07 0.0 -0.12 0.06 0.05 0.03 -0.1 -0.14 0.79 1.12 1.46 0.65 -0.77 -0.97 -0.1 -1.79 -1.52 -2.87 -0.19 0.07 0.27 0.45 0.18 0.14 -0.5 -0.47 -0.79 -0.66
-0.46 -0.13 -0.08 0.05 0.12 -0.02 -0.09 -0.22 -0.05 -0.36 -0.23 -0.43 0.63 1.43 1.66 0.61 0.05 -0.63 0.35 -4.33 -1.71 -3.14 0.29 0.35 0.14 -0.78 -0.27 -0.26 -0.12 0.01 -0.64 -1.33
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-0.22 -0.12 -0.17 -0.13 -0.16 -0.14 -0.26 -0.4 -0.4 -0.21 -0.28 -0.48 0.83 1.92 1.89 1.3 -0.01 -0.39 0.27 -3.25 -5.11 -4.51 -0.0 -0.01 -2.09 -0.42 -1.12 -0.82 -0.27 -0.11 -0.62 -0.73
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.