Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo103305	-	-	-	1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.6	0.96	1.27	1.97	-	-	-	-	-	3.11	0.9	-	-	-	-	-	1.98	-	-
Smo108762	-	-	2.87	-	2.14	-	-	2.85	3.17	-	-	-	-	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo111477	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo111492	-1.27	-	-	-	-	-	-	-	1.92	1.66	-	0.16	1.01	1.62	1.74	0.54	-	-0.67	1.48	-	-	-	1.51	-0.36	1.25	-	1.58	-	-0.8	-0.58	-	-
Smo112714	-	1.48	-	-	1.7	1.91	-	1.29	3.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-
Smo114488	2.43	-0.08	2.0	0.56	-0.99	0.07	0.38	-0.4	2.75	2.4	-4.91	0.62	-	-2.93	-4.32	-	-	-	-	-1.42	-	-	-	-	-	1.29	-	-	-	-	-	-
Smo127476	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.31	2.99	0.38	-0.43	-	-	-	0.71	0.47	-	-	-	-	3.08	2.28	1.74	0.66
Smo132063	-	-	-	-	-	-	3.41	-	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.6	-	-
Smo133344	-	-	-	-	-	-	1.45	-	2.99	2.15	1.36	2.49	-	2.75	-	-	-	-	-	-	-	-	1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo138647	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo28097	2.11	-	1.39	-	-	-	0.43	-	-	1.93	2.13	-	-	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	0.48	-	-	-
Smo29401	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo30995	1.5	1.89	-	-	-	1.84	-	-	2.64	1.42	-	-	1.77	-	-	-	-	-	2.65	-	-	-	-	1.72	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo34337	3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.92
Smo39915	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.38	-	2.07	2.74	-	1.9	-	-	-	2.33	0.34	-	-	-	-	2.32	0.05	1.3	-
Smo402330	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo402334	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo402495	1.68	-	-	-	-	-	1.49	1.33	-	-	-	-	-	-	-	1.65	1.49	-	2.48	-	-	-	1.64	-	-	-	-	-	3.14	-	-	-
Smo402703	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.5	-	-	-	-	-	3.37	3.37	-	-
Smo402903	0.21	-0.22	0.5	-0.92	-0.5	-0.41	-0.93	-1.17	-0.66	-0.7	-0.33	-0.75	0.7	-3.43	-6.19	1.57	0.34	-0.66	0.92	-1.01	-3.63	-	0.73	1.97	-1.3	-1.33	-2.22	-0.92	2.23	0.1	-0.9	-1.1
Smo404585	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.23	-	-	-	1.77	2.15	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57	-	3.69	-0.56	-	-	-
Smo404708	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo404835	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	4.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo405894	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo407719	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.05	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.94	-	0.91	0.85
Smo407853	3.59	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo409118	-	-	-	-	-	-	-	3.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo410642	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	-	-	-	-	2.3	3.03	2.3	-	-	-	-	2.34	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo410672	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411055	-	-	-	-	-	-	-	-	3.47	3.3	-	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411496	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo412040	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo413889	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo413960	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo415419	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.2	-	-	0.93	2.3	-	2.12	-	-	-	2.46	1.78	-	-	-	-	-0.47	1.25	2.11	1.85
Smo416338	-	1.04	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	0.96	1.35	-	-	2.35	2.9	-	2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.17	-
Smo416646	1.89	-	2.5	1.8	-	0.36	0.79	-0.15	2.07	-11.36	-19.19	-	-	-	-0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.75	-	3.15	-	-	-	-0.44	-	-
Smo417597	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo419986	-	1.0	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	0.99	-	-	2.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.43	-	1.26	2.26	1.22	2.16
Smo420154	2.4	-	-	-	-	-	-	-	1.49	-	-	1.5	-	-	-	-	1.7	-	3.56	-	-	-	1.52	1.64	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo421106	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo421706	-	-	-	-	-	-	-	3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.18	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo422091	0.76	-1.36	0.44	0.46	-	-0.09	0.69	-1.56	1.88	1.28	1.41	1.29	-	-0.37	1.32	-	-1.16	-	-1.16	-	-	1.99	-	-	-	-0.14	1.17	-	0.44	-1.15	-	-
Smo422535	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo423303	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	2.74	-	-	-	-	-	2.65	3.63	-	-
Smo424330	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo426260	-	-	-	-	-	-	-0.7	-	1.24	-	-	-	-	-	-	-	4.83	-	-0.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo426261	-0.08	-	-	2.0	-	-	2.74	-	3.27	-	-	-	-	-	0.95	-	-	-	1.07	2.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.17	-	-
Smo426851	-	0.97	-	-	-	-	-	-	2.1	-	-	1.06	-	2.21	1.55	-	-	-	-	-	-	-	3.26	1.15	-	-	-	-	1.08	-	-	1.13
Smo428092	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.78	-	-	-	-	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo428497	-	-	-	2.22	-	-	-	2.33	4.04	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo428911	-	-	-	-	-	3.08	-	-	2.94	-	2.86	-	-	-	-	-	-	-	3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo429353	-	-	-	-	-	-	-	-	2.36	-	-	-	1.04	-	0.14	1.19	1.95	-	-	-	-	-	1.02	-	-	-	-	3.09	-	-	1.85	1.8
Smo429415	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo430240	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo430436	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.0	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo430471	1.92	1.17	0.25	0.14	-	-	-0.62	-	-	0.36	-	0.77	-	-1.32	-	-1.14	0.02	0.49	2.17	-	-	-	0.21	-1.05	0.73	-	1.39	1.29	1.12	0.11	-1.64	-1.64
Smo430727	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo431927	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo432297	3.7	-	-	-	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo432320	1.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	-	2.28	-	-	-	-	-	-	-	-	2.97	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo4666	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo6804	2.02	0.91	1.63	-	-	-	0.91	2.65	2.56	0.66	-	-	-	-	-	1.22	-	-	-0.02	-	-	-	1.03	-0.04	-	-	-	-	-	-	-	0.02
Smo7944	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo86083	3.85	4.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo90622	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.64	3.57	-	2.51	-	-	-	2.05	1.98	-	-	-	-	0.72	0.66	-	0.59
Smo91761	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo95660	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.