Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.67 0.8 0.75 0.84 0.83 0.88 0.89 1.0 0.75 0.71 0.62 0.62 0.63 0.52 0.93 0.58 0.64 0.53 0.92 0.07 0.52 0.04 0.85 0.91 0.97 0.38 0.76 0.75 0.7 0.77 0.52 0.65
0.33 0.39 0.49 0.45 0.5 0.43 0.42 0.51 0.63 0.56 0.5 0.46 0.3 0.19 0.21 0.3 0.27 0.23 0.4 0.14 0.46 0.58 0.37 0.39 1.0 0.27 0.3 0.26 0.46 0.42 0.35 0.41
0.31 0.46 0.49 0.58 0.59 0.59 0.51 0.45 0.36 0.43 0.4 0.31 0.44 0.21 0.11 0.69 0.55 0.71 0.86 0.12 0.57 0.03 0.65 0.56 1.0 0.3 0.3 0.29 0.57 0.56 0.42 0.47
0.75 0.71 0.74 0.72 0.73 0.59 0.54 0.65 0.69 0.86 0.78 0.84 1.0 0.54 0.39 0.92 0.76 0.59 0.85 0.01 0.2 0.0 0.9 0.84 0.78 0.79 0.73 0.66 0.86 0.96 0.81 0.72
0.39 0.42 0.37 0.45 0.54 0.46 0.56 0.58 0.44 0.47 0.38 0.41 1.0 0.14 0.27 0.54 0.43 0.25 0.75 0.01 0.14 0.0 0.34 0.36 0.27 0.31 0.55 0.62 0.43 0.38 0.36 0.37
0.63 0.69 0.69 0.84 0.83 1.0 0.74 0.66 0.7 0.73 0.69 0.68 0.39 0.5 0.51 0.61 0.61 0.32 0.51 0.1 0.3 0.05 0.58 0.59 0.61 0.66 0.65 0.87 0.54 0.59 0.37 0.37
0.71 0.64 0.62 0.62 0.58 0.65 0.59 0.68 0.72 0.74 0.72 0.68 0.72 0.36 0.22 1.0 0.62 0.41 0.56 0.23 0.7 0.55 0.57 0.6 0.88 0.63 0.56 0.6 0.68 0.69 0.39 0.39
0.53 0.73 0.57 0.68 0.66 0.55 0.49 0.43 0.46 0.45 0.45 0.5 0.25 0.52 0.27 0.32 0.33 0.15 0.44 0.01 0.12 0.0 0.35 0.3 1.0 0.39 0.19 0.23 0.36 0.33 0.21 0.12
0.72 0.59 0.56 0.67 0.67 0.63 0.67 0.72 0.86 0.8 0.79 0.78 0.45 0.59 0.47 0.88 0.61 0.5 0.89 0.09 0.18 0.06 0.92 1.0 0.41 0.91 0.71 0.77 0.67 0.83 0.76 0.76
0.47 0.55 0.65 0.67 0.66 0.78 0.62 0.57 0.58 0.51 0.45 0.34 0.35 0.62 0.73 0.49 0.69 0.69 1.0 0.12 0.59 0.27 0.66 0.63 0.86 0.52 0.53 0.5 0.53 0.58 0.31 0.31
0.63 0.55 0.47 0.59 0.66 0.61 0.49 0.56 0.56 0.6 0.55 0.6 1.0 0.27 0.17 0.93 0.46 0.36 0.8 0.0 0.02 0.01 0.68 0.68 0.64 0.8 0.34 0.32 0.62 0.6 0.66 0.66
0.74 0.74 0.72 0.71 0.64 0.64 0.66 0.73 0.73 0.73 0.74 0.76 0.63 0.78 0.87 0.9 0.54 0.42 1.0 0.06 0.17 0.08 0.64 0.7 0.84 0.91 0.44 0.47 0.71 0.72 0.46 0.39
0.19 0.48 0.5 0.48 0.66 0.6 0.41 0.32 0.25 0.21 0.18 0.18 0.33 0.53 0.27 1.0 0.4 0.13 0.71 0.11 0.17 0.06 0.48 0.42 0.2 0.45 0.62 0.47 0.37 0.3 0.26 0.25
0.66 0.62 0.52 0.58 0.54 0.49 0.51 0.53 0.56 0.55 0.55 0.59 0.37 0.68 0.53 0.42 0.48 0.37 0.47 0.04 0.36 0.07 0.48 0.51 1.0 0.44 0.6 0.52 0.42 0.45 0.43 0.37
0.48 0.48 0.42 0.54 0.52 0.53 0.47 0.5 0.49 0.48 0.42 0.42 0.62 0.47 0.28 1.0 0.53 0.3 0.58 0.08 0.27 0.13 0.43 0.39 0.86 0.49 0.59 0.7 0.47 0.46 0.31 0.25
0.59 0.61 0.69 0.82 0.8 0.78 0.83 0.86 0.79 0.8 0.74 0.66 0.53 0.35 0.49 0.98 0.42 0.34 0.98 0.11 0.51 0.09 0.65 0.52 0.69 1.0 0.77 0.9 0.64 0.58 0.41 0.57
0.29 0.15 0.12 0.22 0.28 0.21 0.34 0.33 0.36 0.33 0.44 0.3 0.11 0.04 0.0 0.09 0.18 0.05 0.17 0.0 0.08 0.0 0.25 0.19 1.0 0.18 0.19 0.37 0.47 0.38 0.27 0.14
0.51 0.59 0.57 0.62 0.69 0.63 0.57 0.56 0.6 0.57 0.57 0.5 1.0 0.65 0.19 0.94 0.52 0.35 0.76 0.21 0.25 0.05 0.63 0.6 0.72 0.89 0.74 0.71 0.53 0.57 0.65 0.79
0.83 0.83 0.89 0.9 0.98 0.89 0.91 0.91 0.92 0.86 0.76 0.75 0.83 0.62 0.86 0.9 0.66 0.51 0.97 0.22 0.56 0.12 0.76 0.75 0.93 0.79 0.86 1.0 0.81 0.85 0.45 0.51
0.65 0.59 0.71 0.55 0.68 0.58 0.57 0.49 0.73 0.55 0.57 0.49 0.6 0.44 0.75 0.78 1.0 0.85 0.66 0.15 0.14 0.11 0.71 0.7 0.3 0.44 0.43 0.44 0.73 0.77 0.71 0.75
0.04 0.07 0.36 0.5 0.36 0.46 0.7 0.85 1.0 0.71 0.24 0.17 0.04 0.01 0.0 0.04 0.15 0.16 0.14 0.0 0.0 0.0 0.87 0.54 0.13 0.34 0.51 0.38 0.31 0.27 0.2 0.17
0.78 0.61 0.49 0.57 0.57 0.55 0.62 0.75 0.8 0.83 0.79 0.88 0.79 0.88 0.51 0.77 0.52 0.49 0.72 0.16 0.4 0.04 0.52 0.59 1.0 0.87 0.83 0.77 0.64 0.68 0.67 0.78
0.8 0.27 0.18 0.38 0.63 0.49 0.33 0.56 0.64 0.55 0.48 0.35 0.02 0.06 0.06 0.05 0.47 0.38 0.24 0.0 0.52 0.0 0.31 0.2 1.0 0.48 0.68 0.89 0.64 0.54 0.21 0.34
0.16 0.18 0.2 0.39 0.61 0.72 0.53 0.51 0.3 0.26 0.22 0.15 0.41 0.15 0.09 0.52 0.55 0.46 0.57 0.11 0.55 0.1 0.53 0.46 1.0 0.1 0.27 0.3 0.36 0.37 0.22 0.25
0.62 0.59 0.49 0.69 0.82 0.67 0.63 0.64 0.66 0.68 0.55 0.56 0.78 0.44 0.7 1.0 0.66 0.47 0.78 0.06 0.14 0.16 0.7 0.76 0.83 0.42 0.41 0.39 0.75 0.69 0.54 0.51
0.79 0.71 0.6 0.68 0.69 0.63 0.54 0.63 0.68 0.67 0.73 0.76 0.64 0.77 0.95 0.87 0.55 0.22 0.81 0.04 0.23 0.07 0.52 0.52 1.0 0.79 0.64 0.73 0.71 0.78 0.34 0.37
0.32 0.33 0.31 0.28 0.27 0.24 0.21 0.22 0.18 0.19 0.2 0.23 0.47 0.5 0.15 1.0 0.18 0.24 0.25 0.04 0.02 0.02 0.17 0.21 0.31 0.36 0.67 0.98 0.22 0.28 0.15 0.07
0.56 0.45 0.51 0.58 0.76 0.72 0.8 1.0 0.89 0.82 0.8 0.64 0.48 0.47 0.34 0.6 0.43 0.6 0.77 0.05 0.49 0.09 0.53 0.47 0.95 0.97 0.82 0.86 0.52 0.54 0.6 0.62
0.89 0.9 0.64 0.61 0.29 0.34 0.63 0.56 0.82 0.4 0.54 0.51 0.42 0.13 0.1 0.67 0.52 0.52 0.99 0.0 0.1 0.0 0.58 0.72 0.04 0.24 0.65 0.64 1.0 0.96 0.52 0.46
0.11 0.18 0.29 0.27 0.32 0.23 0.23 0.21 0.13 0.09 0.16 0.11 0.52 0.48 0.51 1.0 0.07 0.07 0.11 0.0 0.07 0.0 0.13 0.33 0.45 0.22 0.21 0.29 0.06 0.07 0.03 0.06
0.23 0.29 0.23 0.45 0.35 0.36 0.38 0.64 0.61 0.27 0.27 0.29 0.19 0.12 0.21 0.19 0.39 0.01 0.51 0.0 0.06 0.0 0.79 0.74 0.06 0.26 1.0 0.6 0.61 0.55 0.35 0.26
0.03 0.09 0.27 0.37 0.45 0.39 0.57 0.67 0.79 0.49 0.25 0.14 0.02 0.01 0.01 0.05 0.18 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 1.0 0.69 0.27 0.27 0.47 0.42 0.36 0.33 0.29 0.18
0.63 0.86 0.58 0.7 0.65 0.58 0.61 0.65 0.69 0.66 0.75 0.59 0.57 0.32 0.37 1.0 0.54 0.47 0.9 0.0 0.29 0.0 0.64 0.69 0.74 0.98 0.66 0.5 0.75 0.81 0.83 0.89
0.55 0.63 0.5 0.47 0.46 0.46 0.4 0.39 0.46 0.42 0.42 0.4 1.0 0.32 0.04 0.75 0.33 0.31 0.57 0.01 0.05 0.0 0.54 0.49 0.31 0.6 0.37 0.37 0.45 0.46 0.33 0.35
0.64 0.7 0.78 0.75 0.79 0.81 0.79 0.96 0.92 0.8 0.79 0.74 0.68 0.63 0.68 0.74 0.73 0.31 0.88 0.17 0.14 0.22 0.71 0.71 1.0 0.59 0.75 0.74 0.69 0.69 0.72 0.71
0.65 0.79 0.72 0.84 0.88 0.87 0.88 0.88 0.82 0.89 0.84 0.76 0.77 0.75 0.98 1.0 0.69 0.49 0.91 0.36 0.69 0.33 0.73 0.74 0.85 0.77 0.62 0.67 0.68 0.73 0.49 0.48
0.78 0.93 0.82 0.92 0.84 0.88 0.8 0.78 0.82 0.71 0.7 0.7 0.53 0.99 1.0 0.91 0.7 0.53 0.98 0.13 0.6 0.18 0.87 0.75 0.77 0.65 0.57 0.61 0.61 0.69 0.58 0.49
0.56 0.45 0.54 0.63 0.84 0.64 0.53 0.59 0.74 0.61 0.66 0.47 0.93 0.59 0.85 1.0 0.34 0.06 0.63 0.22 0.41 0.07 0.74 0.73 0.6 0.56 0.3 0.48 0.4 0.56 0.15 0.14
0.49 0.53 0.51 0.52 0.43 0.45 0.38 0.43 0.49 0.43 0.53 0.5 0.67 0.68 0.55 0.7 0.52 0.62 0.59 0.08 0.2 0.07 0.81 1.0 0.64 0.47 0.32 0.29 0.46 0.53 0.57 0.64
0.39 0.47 0.47 0.46 0.48 0.52 0.49 0.6 0.5 0.47 0.56 0.42 0.42 0.21 0.23 0.47 0.51 0.44 0.6 0.19 0.37 0.24 0.49 0.46 1.0 0.23 0.31 0.29 0.5 0.5 0.51 0.51
0.45 0.47 0.46 0.46 0.48 0.54 0.57 0.56 0.55 0.57 0.46 0.51 0.7 0.31 0.37 0.66 0.55 0.48 0.89 0.38 0.6 0.08 0.7 0.74 1.0 0.4 0.33 0.34 0.63 0.58 0.79 0.94
0.72 0.77 0.75 0.93 1.0 0.89 0.95 0.85 0.87 0.72 0.69 0.61 0.32 0.37 0.47 0.58 0.63 0.25 0.71 0.05 0.28 0.0 0.79 0.86 0.36 0.74 0.92 0.99 0.73 0.71 0.49 0.39
0.4 0.49 0.39 0.33 0.27 0.33 0.4 0.43 0.54 0.47 0.38 0.39 1.0 0.3 0.46 0.75 0.76 0.33 0.38 0.06 0.05 0.06 0.76 0.94 0.68 0.12 0.17 0.1 0.38 0.39 0.61 0.72
0.5 0.45 0.47 0.5 0.51 0.56 0.47 0.45 0.46 0.44 0.4 0.44 0.44 0.7 0.66 0.39 0.38 0.35 0.48 0.17 0.5 0.09 0.4 0.47 0.41 0.67 1.0 0.87 0.32 0.35 0.32 0.45
0.32 0.37 0.39 0.46 0.56 0.62 0.43 0.39 0.41 0.35 0.35 0.31 0.42 0.53 0.08 1.0 0.41 0.36 0.67 0.1 0.41 0.04 0.5 0.38 0.5 0.37 0.49 0.66 0.44 0.47 0.3 0.2
0.57 0.69 0.73 0.88 0.86 0.8 0.79 0.85 0.69 0.58 0.61 0.59 0.27 0.3 0.34 0.43 0.61 0.38 0.7 0.22 0.3 0.02 0.83 0.81 0.74 0.64 1.0 1.0 0.7 0.7 0.56 0.46
0.39 0.34 0.57 0.57 0.71 0.68 0.72 0.87 0.54 0.61 0.47 0.45 0.18 0.17 0.3 0.16 0.42 0.0 0.39 0.05 0.09 0.05 0.82 0.81 1.0 0.29 0.74 0.48 0.5 0.44 0.34 0.23
1.0 0.9 0.8 0.88 0.87 0.87 0.67 0.84 0.93 0.8 0.84 0.8 0.72 0.98 0.89 0.76 0.84 0.51 0.81 0.17 0.35 0.09 0.95 0.89 0.93 0.85 1.0 0.93 0.68 0.68 0.49 0.48
0.08 0.13 0.26 0.29 0.34 0.27 0.14 0.15 0.11 0.13 0.12 0.09 0.43 0.48 0.39 1.0 0.08 0.03 0.14 0.03 0.05 0.0 0.1 0.21 0.31 0.24 0.27 0.42 0.05 0.08 0.04 0.08
0.71 0.62 0.56 0.61 0.62 0.66 0.6 0.7 0.72 0.76 0.66 0.72 0.89 0.76 0.67 0.91 0.64 0.48 0.82 0.14 0.3 0.08 0.76 0.79 1.0 0.7 0.76 0.72 0.69 0.73 0.8 0.93
0.88 0.9 0.75 1.0 0.8 0.95 0.83 1.0 0.86 0.83 0.91 0.88 0.76 0.53 0.84 0.81 0.54 0.31 0.88 0.02 0.37 0.01 0.72 0.8 0.86 0.89 0.95 0.82 0.69 0.77 0.44 0.43
0.7 0.64 0.59 0.65 0.69 0.66 0.62 0.6 0.68 0.73 0.58 0.7 0.74 0.81 0.63 0.9 0.64 0.49 1.0 0.12 0.29 0.04 0.7 0.69 0.96 1.0 0.75 0.74 0.71 0.72 0.69 0.7
1.0 0.59 0.3 0.46 0.78 0.9 0.55 0.5 0.44 0.37 0.39 0.39 0.1 0.21 0.09 0.19 0.52 0.39 0.4 0.03 0.3 0.05 0.61 0.44 0.91 0.21 0.56 0.61 0.53 0.55 0.26 0.31
0.74 0.52 0.36 0.34 0.33 0.31 0.28 0.39 0.45 0.43 0.43 0.58 0.14 0.17 0.15 0.19 0.47 0.42 0.53 0.02 0.15 0.01 0.4 0.19 1.0 0.1 0.18 0.18 0.35 0.35 0.18 0.15
0.5 0.59 0.55 0.58 0.54 0.53 0.43 0.52 0.54 0.5 0.5 0.43 0.61 0.55 0.46 0.82 0.43 0.39 0.67 0.11 0.08 0.01 0.82 0.81 1.0 0.44 0.46 0.45 0.51 0.55 0.39 0.41
0.79 0.71 0.54 0.64 0.62 0.52 0.61 0.71 0.82 0.68 0.63 0.68 0.68 0.29 0.48 0.91 0.54 0.18 0.96 0.16 0.2 0.07 0.74 0.79 0.59 0.53 0.52 0.37 0.88 0.86 0.95 1.0
0.49 0.48 0.45 0.5 0.42 0.52 0.51 0.53 0.58 0.49 0.47 0.49 0.56 0.69 0.56 0.63 0.53 0.55 0.53 0.06 0.21 0.07 0.51 0.6 1.0 0.56 0.77 0.85 0.59 0.59 0.48 0.46
0.59 0.61 0.54 0.68 0.71 0.67 0.52 0.57 0.68 0.57 0.62 0.58 0.62 0.71 0.67 0.7 0.49 0.39 0.77 0.02 0.63 0.14 0.64 0.62 1.0 0.55 0.61 0.64 0.59 0.63 0.49 0.51
0.54 0.62 0.65 0.64 0.71 0.77 0.56 0.6 0.64 0.55 0.63 0.54 0.69 0.51 0.48 0.78 0.68 0.57 0.88 0.01 0.28 0.04 0.77 0.75 1.0 0.5 0.62 0.54 0.73 0.74 0.47 0.52
0.53 0.54 0.52 0.52 0.49 0.44 0.46 0.47 0.43 0.47 0.47 0.49 0.07 0.6 0.32 0.26 0.46 0.17 0.21 0.06 0.17 0.05 0.35 0.29 1.0 0.5 0.37 0.39 0.36 0.39 0.34 0.18
0.43 0.51 0.44 0.57 0.75 0.58 0.47 0.62 0.58 0.59 0.51 0.5 0.71 0.32 0.4 0.65 0.4 0.42 1.0 0.08 0.04 0.02 0.52 0.64 0.67 0.55 0.68 0.63 0.45 0.45 0.31 0.36
0.69 0.64 0.69 0.66 0.73 0.71 0.54 0.61 0.66 0.65 0.57 0.66 0.57 0.57 0.57 0.6 0.53 0.23 0.83 0.02 0.37 0.13 0.54 0.5 1.0 0.71 0.62 0.58 0.52 0.52 0.36 0.31
0.73 0.63 0.55 0.68 0.73 0.64 0.57 0.73 0.81 0.67 0.79 0.83 0.5 0.53 0.53 0.67 0.57 0.39 0.83 0.05 0.11 0.02 0.65 0.75 0.69 0.63 0.65 0.68 0.7 0.7 0.83 1.0
0.6 0.69 0.62 0.64 0.61 0.6 0.62 0.64 0.68 0.7 0.6 0.56 0.91 0.65 0.2 0.89 0.52 0.35 1.0 0.13 0.42 0.06 0.75 0.75 0.66 0.77 0.65 0.75 0.58 0.59 0.32 0.35
0.69 0.66 0.68 0.67 0.71 0.77 0.66 0.7 0.71 0.7 0.62 0.63 0.83 0.59 0.62 0.98 0.7 0.38 1.0 0.19 0.3 0.2 0.69 0.73 0.92 0.74 0.79 0.77 0.77 0.76 0.66 0.75
0.84 0.65 0.62 0.54 0.53 0.62 0.55 0.55 0.61 0.6 0.58 0.61 0.71 0.81 0.36 0.91 0.5 0.46 0.8 0.04 0.41 0.08 0.67 0.73 0.64 0.82 1.0 0.83 0.64 0.63 0.89 0.81
0.67 0.65 0.69 0.75 0.79 0.87 0.69 0.66 0.71 0.6 0.62 0.54 0.5 0.99 1.0 0.68 0.63 0.48 0.8 0.36 0.55 0.2 0.62 0.65 0.69 0.73 0.99 0.98 0.55 0.57 0.35 0.34
0.66 0.66 0.67 0.59 0.61 0.7 0.74 0.89 0.85 0.93 0.75 0.76 1.0 0.55 0.38 0.87 0.62 0.24 0.71 0.03 0.03 0.04 0.64 0.63 0.62 0.63 0.89 0.75 0.63 0.63 0.55 0.73
0.61 0.48 0.58 0.57 0.56 0.54 0.57 0.59 0.84 0.72 0.74 0.59 0.39 0.29 0.57 0.83 0.72 0.48 0.62 0.02 0.19 0.06 0.57 0.6 0.63 0.48 0.5 0.4 0.81 0.83 0.94 1.0
0.56 0.53 0.68 0.47 0.49 0.72 0.56 0.5 0.55 0.38 0.48 0.4 0.66 0.55 0.72 0.71 0.35 0.44 0.74 0.17 0.19 0.05 0.46 0.51 1.0 0.3 0.51 0.46 0.4 0.43 0.21 0.27
0.67 0.63 0.7 0.65 0.62 0.6 0.58 0.69 0.71 0.76 0.69 0.7 0.6 0.57 0.49 0.72 0.45 0.3 0.64 0.16 0.29 0.05 0.55 0.65 1.0 0.7 0.63 0.49 0.54 0.51 0.36 0.45
0.64 0.58 0.81 0.68 0.69 0.75 0.51 0.8 0.78 0.9 0.69 0.61 0.77 0.52 0.27 1.0 0.41 0.39 0.81 0.0 0.02 0.01 0.72 0.92 0.71 0.94 0.81 0.59 0.45 0.54 0.35 0.51
0.37 0.38 0.34 0.44 0.47 0.49 0.42 0.42 0.59 0.31 0.33 0.28 0.36 0.1 0.14 0.46 0.5 0.73 0.63 0.22 0.27 0.19 0.44 0.46 1.0 0.3 0.41 0.25 0.5 0.52 0.27 0.27
0.72 0.76 0.81 0.73 1.0 0.75 0.87 0.75 0.88 0.77 0.79 0.8 0.03 0.17 0.1 0.04 0.83 0.2 0.63 0.23 0.07 0.0 0.73 0.56 0.41 0.65 0.78 0.82 0.67 0.75 0.37 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)