Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.3 -0.24 -0.16 -0.32 0.19 -0.26 -0.56 -0.06 -0.24 0.01 -0.11 -0.31 0.4 -0.1 -0.61 0.68 -0.2 -0.5 0.34 -2.56 0.71 0.58 0.14 0.19 0.94 -0.21 -0.1 -0.1 -0.0 0.14 -0.24 -0.09
-0.4 -1.06 -2.71 -2.18 -0.71 -2.09 -1.39 -1.56 -1.41 -2.2 -1.23 -1.99 0.58 0.82 -2.28 1.46 -2.33 -0.82 1.32 -4.27 2.37 -1.59 -1.55 -0.5 2.42 0.67 -0.67 -1.95 0.46 0.12 -0.37 -1.38
0.92 1.04 0.15 -0.58 -0.48 0.02 -1.2 -3.19 -2.61 -2.54 -2.65 -1.78 -3.63 0.18 0.79 1.66 -1.21 -1.01 1.14 -2.37 0.74 -1.7 -4.21 -4.04 0.26 1.01 1.29 2.18 -1.08 -0.45 -2.5 -3.12
0.0 0.06 -0.22 -0.01 0.04 -0.16 -0.27 -0.36 -0.18 -0.33 -0.21 -0.19 0.2 0.71 0.71 0.26 -0.27 -0.32 0.1 -0.76 0.97 -0.36 0.01 0.0 1.05 -0.1 -0.37 -0.16 -0.28 -0.26 -0.79 -0.75
-0.27 -0.31 -0.4 -0.24 -0.14 -0.04 -0.19 -0.03 0.04 0.02 -0.13 -0.17 0.16 0.58 0.55 0.16 -0.39 -1.33 -0.01 0.17 0.52 -1.85 0.05 0.23 1.69 -0.2 -0.11 -0.12 -0.32 -0.36 -0.62 -0.74
-0.23 -0.14 -0.41 -0.36 -0.07 -0.14 -0.13 -0.09 0.06 0.15 -0.1 -0.23 0.04 0.8 0.07 0.84 -0.95 -0.21 0.64 -1.62 0.52 0.72 -0.26 -0.13 0.47 -0.46 -0.29 -0.37 -0.22 -0.42 0.03 0.02
-0.2 -0.32 -0.55 -0.19 -0.25 -0.15 -0.06 0.26 0.11 0.27 0.05 -0.02 0.5 0.13 -0.43 0.66 -0.54 -0.52 0.4 -0.71 0.98 -0.98 -0.0 0.26 0.07 -0.0 -0.1 -0.43 -0.11 -0.13 0.09 0.18
-1.62 -1.96 -2.98 -3.12 -0.27 -0.36 -1.01 -0.86 -1.34 -0.98 -1.09 -1.49 1.03 0.92 -1.6 1.15 -1.09 -2.34 0.25 - 1.21 1.19 0.72 0.79 0.99 -0.72 -0.21 -0.46 0.97 1.14 -0.25 0.36
-0.09 -0.34 -0.59 -0.2 -0.36 -0.12 -0.21 -0.12 0.03 -0.02 -0.44 -0.23 0.35 0.33 0.98 0.51 -0.34 -0.31 0.64 -1.76 0.83 -0.05 -0.2 0.16 1.05 -0.51 -0.37 -0.81 -0.46 -0.37 -0.11 0.0
-0.07 0.01 0.04 -0.1 -0.1 -0.13 -0.08 -0.23 -0.0 -0.04 -0.3 -0.21 0.64 0.7 0.87 0.89 -0.1 -0.31 0.37 -2.89 -0.59 -0.93 0.12 0.33 0.88 -0.12 -0.39 -0.13 -0.25 -0.16 -0.74 -1.07
- - - - - - - - - - - - -1.6 - - 4.05 - - -1.75 0.29 3.44 - - - - - 1.11 - - -0.74 - -
-0.34 -0.16 -0.23 0.0 0.04 0.07 0.13 -0.02 -0.12 -0.19 -0.23 -0.38 0.24 0.28 0.45 0.4 -0.59 -0.69 -0.1 -0.68 0.44 -1.19 -0.08 -0.03 1.11 0.54 0.63 0.68 -0.6 -0.58 -0.79 -0.8
-1.4 -1.59 -2.86 -0.45 -2.95 -0.85 -0.93 -2.1 - -1.93 -1.83 -1.04 2.22 -0.68 - 3.01 -1.63 -3.02 -1.49 -2.23 1.26 2.25 -2.49 0.05 1.24 -3.96 -0.2 -0.07 -1.86 -1.18 -3.09 -2.76
-1.0 -0.26 0.01 -0.3 -0.24 -0.43 -0.48 -0.82 -1.13 -0.68 -0.97 -1.19 1.72 -0.33 -3.67 1.13 -0.22 -0.21 0.51 -1.52 1.93 -2.57 0.22 0.43 2.09 -1.74 -1.16 -0.9 -0.87 -0.83 -1.26 -0.96
0.29 -0.21 -0.49 -0.57 -0.36 -0.21 -0.37 -0.28 -0.23 -0.28 0.0 0.1 0.56 -0.82 -2.01 1.12 -0.2 -0.45 0.59 -0.88 -0.24 -0.86 0.09 0.19 0.93 1.08 -0.47 0.3 0.41 0.61 -0.81 -1.27
-0.16 -0.29 -0.36 -0.45 -0.44 -0.35 -0.19 0.06 0.37 -0.09 0.45 -0.06 0.61 0.74 -0.38 0.57 -0.32 -0.25 -0.21 -2.81 0.8 -2.02 1.02 1.0 -2.02 -1.54 -1.16 -1.9 0.51 0.45 0.27 0.45
-0.26 -0.55 -0.6 -0.35 -0.31 -0.49 -0.63 -0.29 -0.01 -0.08 -0.02 -0.11 0.47 1.27 0.68 0.19 -0.91 -0.63 0.1 0.11 0.94 -0.47 -0.05 0.05 1.39 -0.43 -0.49 -0.49 -0.51 -0.48 -0.54 -0.36
-0.31 -0.88 -0.39 -1.3 -1.09 -1.58 -1.15 -0.86 -0.75 -0.39 -0.08 0.27 0.49 0.24 -1.4 1.1 -0.55 0.71 1.14 -1.96 1.54 -1.92 -0.02 0.12 1.07 0.71 -0.86 -1.13 0.05 0.28 -0.07 0.14
-0.49 -0.42 -0.3 0.07 0.09 0.3 -0.0 -0.13 -0.11 0.02 -0.16 -0.27 1.08 1.06 -1.82 0.34 -0.83 -0.27 0.29 -1.77 0.46 -1.03 -0.35 -0.39 0.38 0.52 0.9 0.83 -0.56 -0.59 -1.06 -0.89
-0.4 -0.35 -0.3 -0.23 -0.59 -0.34 -0.35 0.0 -0.07 0.14 -0.04 -0.06 0.1 0.67 0.29 0.31 -0.63 0.11 0.2 -0.67 0.88 0.27 0.12 0.23 0.29 0.34 -0.22 -0.39 -0.21 -0.26 -0.28 0.02
0.42 0.41 -0.31 -0.59 -0.35 -0.22 -0.34 -1.18 -0.46 -0.31 -0.43 -0.03 -0.89 -0.83 -1.7 2.27 -0.5 -0.83 0.56 -3.39 1.12 -3.39 -1.64 -2.15 0.18 -0.22 0.96 1.37 -0.1 -0.02 -0.57 -0.42
-0.43 -1.01 -0.94 -1.01 -0.84 -0.71 -0.71 -0.36 -0.19 -0.06 -0.34 -0.66 -0.13 0.39 -0.59 0.96 -1.12 -0.56 0.73 -0.58 1.49 -1.12 -0.52 0.19 1.29 0.77 0.36 0.47 -0.14 0.06 -0.35 -0.04
-0.15 -0.26 -0.39 -0.16 -0.2 -0.43 -0.64 -0.6 -0.24 -0.31 -0.08 -0.47 -0.01 1.44 0.03 0.82 -0.21 -0.29 0.26 -4.16 1.21 -3.37 -0.05 -0.02 0.83 -0.33 -1.08 -1.18 0.34 0.33 0.37 0.37
-0.45 -0.42 -0.32 -0.33 -0.37 -0.31 -0.45 -0.25 -0.33 -0.38 -0.36 -0.48 1.45 -0.72 -0.35 0.84 -0.64 -0.79 0.19 -0.05 1.57 -0.49 -0.0 0.33 0.16 0.32 0.27 0.33 -0.61 -0.56 -0.67 -0.46
-0.34 -0.84 -0.77 -0.55 -0.46 -0.52 -0.25 -0.42 -0.4 -0.47 -0.39 -0.53 1.23 0.8 1.56 1.38 -0.94 -2.04 0.89 -0.74 0.56 -2.87 -1.34 -1.4 -0.51 -0.18 0.89 0.89 -1.12 -0.66 -0.7 0.24
0.1 0.01 -0.44 -0.34 -0.17 -0.18 -0.48 -0.1 -0.03 -0.02 -0.06 -0.1 0.46 -0.13 0.19 0.7 -0.46 -0.97 0.48 -0.08 0.46 -0.49 -0.05 0.13 0.75 0.58 -0.28 -0.08 -0.06 -0.11 -0.39 -0.43
-1.86 -0.66 -0.49 0.27 0.73 0.78 0.12 -0.27 -1.22 -1.7 -2.42 -2.81 0.34 -1.63 -4.32 2.0 -0.55 -1.57 0.64 -1.44 1.5 -5.38 -1.62 -1.4 1.55 0.51 1.02 0.77 -0.65 -0.78 -0.43 -0.71
-0.18 -0.27 -0.39 -0.37 -0.27 -0.23 -0.41 -0.45 -0.11 0.15 -0.07 0.08 1.64 0.84 0.38 0.46 -0.4 -0.76 -0.38 -3.36 1.59 -3.49 -0.17 -0.01 0.87 -0.83 -1.41 -1.53 -0.31 -0.39 -0.03 0.12
-0.36 -0.59 -0.76 -0.6 -0.58 -0.62 -0.49 -0.43 -0.33 -0.3 -0.37 -0.38 0.79 0.78 0.32 0.72 -0.48 -0.18 0.2 -0.04 0.75 -1.11 -0.14 0.25 1.36 0.19 -0.17 -0.36 -0.31 -0.15 -0.02 0.02
-0.41 -0.32 -0.32 -0.37 -0.38 -0.26 -0.43 -0.27 -0.19 -0.25 -0.33 -0.32 0.32 0.97 -0.51 0.65 -0.47 -0.64 0.34 -1.49 1.35 -1.13 0.06 0.25 1.2 0.68 0.07 -0.01 -0.32 -0.26 -0.87 -0.86
-0.4 -0.3 -0.4 -0.16 -0.19 -0.07 -0.05 -0.14 0.1 -0.09 -0.2 -0.21 0.53 0.73 0.74 0.76 -0.46 -0.59 0.31 -0.73 -1.44 -0.77 0.42 0.63 0.69 0.19 -0.02 0.02 -0.29 -0.15 -0.61 -0.63
-0.38 -0.39 -0.72 -0.59 -0.65 -0.48 -0.68 -0.49 -0.49 -0.46 -0.65 -0.55 0.61 0.71 -0.14 0.68 -0.29 0.11 0.88 -1.88 1.02 -2.05 0.03 0.13 1.5 -0.75 -1.03 -1.16 0.18 0.13 0.58 0.68
-0.48 -0.56 -0.73 -0.47 0.04 -0.16 -0.31 -0.13 -0.09 0.01 -0.37 -0.38 0.27 0.6 1.42 1.0 -0.2 -0.67 0.95 -4.25 0.5 -0.89 -0.28 -0.38 1.34 -0.3 -0.25 -0.02 -0.6 -0.59 -0.56 -0.89
-1.44 -1.71 -0.35 -0.9 -0.01 -0.31 -1.19 -1.45 0.11 -0.37 -0.47 -1.19 1.65 1.06 1.17 1.79 -0.08 0.09 -0.32 - 0.94 - 0.47 0.6 -1.12 -1.66 -1.57 -0.65 -0.01 0.1 0.19 -0.19
-0.6 -1.02 -1.08 -0.68 -1.64 -0.84 -0.54 -0.66 -1.16 -0.5 -1.41 -1.11 1.73 1.3 1.04 1.04 -3.4 -0.74 0.77 - 2.02 - -2.33 -1.4 0.69 1.1 1.01 1.23 -2.66 -2.57 -3.52 -3.24
-0.63 -0.29 0.07 0.14 0.29 0.27 0.13 0.22 0.1 0.05 0.12 -0.35 0.72 0.94 -0.0 0.64 -0.91 -0.75 -0.53 -1.01 -0.3 -0.64 0.11 0.35 0.48 -0.09 0.55 0.5 -0.89 -0.73 -1.08 -0.59
-0.8 -0.65 -1.92 -2.41 -2.44 -2.0 -1.73 -0.42 -1.46 -1.29 -0.78 -0.63 1.17 1.82 -3.7 1.32 -0.99 0.43 -0.07 - 2.14 -7.82 -1.63 -0.98 0.05 0.06 0.25 -1.34 0.52 0.74 1.07 0.67
-1.11 -1.76 -2.33 -2.71 -2.3 -2.32 -3.76 -1.84 -1.5 -1.95 -2.02 -1.4 1.16 -1.54 -3.85 1.95 -1.88 -1.86 1.49 0.23 1.2 1.42 -1.27 -0.99 2.14 1.57 0.07 -0.78 -0.6 -0.4 -0.55 -0.23
-0.21 -0.13 -0.02 0.09 0.06 -0.04 -0.05 0.05 -0.25 -0.31 -0.32 -0.28 0.51 0.43 0.99 0.79 -0.26 -0.7 0.22 -2.64 0.08 -0.5 0.09 0.2 0.49 0.09 -0.06 -0.15 -0.14 0.02 -0.65 -0.48
-0.83 -0.58 -0.21 -0.34 -0.69 -0.21 -0.28 -0.84 -0.63 -0.7 -0.59 -0.78 1.9 -0.02 0.48 0.56 -0.57 -0.43 -0.5 0.38 1.25 -0.19 -0.25 -0.38 1.67 -0.23 -0.02 -0.16 -0.96 -0.8 -1.27 -1.15
-1.09 -0.62 -1.31 -0.89 -0.34 -0.46 -0.8 0.06 -0.11 -0.8 -0.23 -0.17 0.91 -0.07 0.68 0.93 -1.2 0.5 0.39 -2.78 1.22 0.32 0.23 0.7 0.61 0.68 -0.41 -0.27 -0.16 -0.18 -0.88 -1.01
-0.65 -0.02 0.15 -0.27 -0.08 -0.03 -0.41 -0.02 -0.03 0.14 0.25 -0.18 0.86 0.77 -4.07 0.55 -0.43 -0.21 -1.36 - -0.32 - -0.04 -1.4 -1.48 0.87 1.72 1.79 -0.5 -0.69 -0.89 -0.72
0.15 -1.07 -1.55 -1.14 -0.57 -1.07 -0.79 -0.24 0.07 0.15 0.05 0.1 0.28 -1.03 -0.54 0.36 -1.03 -0.94 0.3 0.47 1.35 0.14 -0.29 -0.13 0.98 0.9 0.14 -0.07 -0.22 0.07 -0.27 0.55
0.51 0.67 0.06 0.31 0.04 0.02 -0.52 -0.42 -0.25 -0.18 -0.44 0.2 0.23 1.07 -0.34 0.43 -0.71 -0.75 -0.34 0.12 1.49 -1.13 0.15 0.26 0.93 -1.82 -1.12 -1.2 -0.7 -0.75 -0.84 -0.54
-0.55 -0.53 -0.36 -0.55 -0.33 -0.5 -0.55 -0.26 -0.13 -0.01 -0.05 -0.32 0.85 1.25 0.8 0.52 -1.11 -1.17 -0.39 -2.03 1.09 -1.74 -0.36 -0.09 1.4 0.87 0.14 0.22 -1.08 -1.02 -0.7 -0.46
-0.62 -0.2 -0.26 -0.71 -0.47 -0.8 -0.53 -0.83 -0.83 -1.1 -0.72 -0.67 0.71 0.73 1.26 0.99 0.28 0.61 0.51 - 1.03 -3.58 0.36 0.48 1.05 -1.08 -0.72 -0.47 -0.13 0.01 -0.3 -0.08
-1.19 -0.98 -1.41 -1.56 -1.45 -0.89 -1.5 -1.77 -1.1 0.07 -0.5 -0.7 2.65 1.55 -1.32 2.27 -2.48 -1.94 -0.8 0.31 1.88 -4.64 -2.23 -1.58 0.07 0.38 -0.95 -1.38 -0.77 -1.45 -1.19 -1.61
0.02 -0.78 -0.12 -0.75 -0.35 -0.21 -1.14 -0.18 -0.26 0.13 -0.1 -0.62 1.43 1.23 0.55 1.77 -0.9 -1.0 1.37 -0.99 0.75 -1.56 -0.43 -0.16 -1.58 -0.86 -1.88 -1.23 -0.42 -0.01 -0.44 -0.64
0.13 0.11 -0.75 -0.68 -1.0 -0.65 -1.26 -1.2 -1.48 -1.26 -0.98 -0.8 0.54 0.14 -1.26 1.89 -0.53 -0.36 1.05 0.86 1.14 -0.2 -0.52 -0.47 1.77 -0.4 0.18 -0.41 -0.8 -0.73 -0.94 -1.08
-2.57 -2.8 -4.48 -2.47 -2.21 -2.55 -3.05 -4.78 -1.54 -2.42 -3.31 -2.63 1.51 2.29 0.14 1.52 0.02 0.92 1.43 -1.99 2.44 - 0.45 0.41 -4.01 -4.95 -3.65 -2.25 -0.45 0.35 0.32 -0.35
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.