Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.08 -0.53 -0.44 -0.27 -0.05 0.79 1.08 1.03 0.94 0.67 0.53 0.21 -1.31 -2.33 -0.76 -0.77 -0.09 -0.68 -0.07 - -5.24 - -0.08 -0.17 - 0.49 0.61 0.25 0.38 0.37 0.64 0.37
-0.72 -0.28 0.13 0.23 0.23 0.77 1.13 0.86 0.96 1.08 0.58 0.25 -1.36 -0.37 -0.21 -0.95 -0.32 -0.49 -0.6 - -7.48 -2.13 -0.8 -1.24 -3.52 -2.02 -0.38 -0.43 0.26 0.28 1.4 0.88
-0.87 -0.51 -0.19 0.02 0.1 0.43 0.87 0.81 0.84 0.85 0.29 -0.08 -1.34 -0.44 -0.15 -0.9 -0.14 -0.49 -0.37 -4.4 -1.78 -3.23 -0.64 -1.46 -0.51 -2.36 -0.27 -0.61 0.48 0.41 1.75 1.15
-0.74 -0.41 -0.2 0.11 0.24 0.33 0.89 0.71 0.77 0.66 0.19 -0.04 -1.02 -0.27 -0.23 -0.69 -0.13 -0.05 -0.3 -4.75 -2.77 -0.77 -0.6 -1.09 -2.26 -2.15 -1.24 -1.15 0.68 0.54 1.72 1.21
0.01 -0.01 0.11 0.42 0.31 0.36 0.59 0.51 0.73 0.59 0.53 0.33 -0.62 -0.77 -1.06 -0.37 0.4 -0.36 -0.27 -6.05 -4.52 -8.58 0.26 0.11 -2.89 0.56 -0.08 -0.04 0.14 0.1 0.42 0.54
-0.14 -0.9 -0.74 -0.41 0.15 0.36 1.06 1.31 1.47 1.35 1.38 0.97 -1.86 -2.03 -0.55 -1.46 -0.68 -0.78 -0.39 -1.84 -5.21 -3.59 -0.77 -0.42 -3.86 0.51 0.13 -0.09 -0.16 -0.09 -0.11 -0.3
0.05 0.19 0.11 0.45 0.7 0.83 0.99 1.09 1.03 0.89 0.57 0.36 -0.5 -0.85 -0.02 -0.44 -0.67 -1.1 -0.48 -3.02 -2.81 -3.12 -0.43 -0.37 -2.79 -0.75 0.42 0.11 -0.24 -0.21 -0.3 -0.26
-0.27 -0.79 -2.31 -0.17 0.31 0.84 1.19 1.24 0.98 0.92 -0.1 0.35 -1.54 -2.81 -0.25 -1.07 -0.46 -0.11 -0.14 - -3.69 - -0.12 -0.61 -3.93 -0.63 0.32 0.89 0.5 0.63 0.63 0.5
0.09 -0.21 -0.15 -0.1 0.23 0.58 0.74 0.78 0.99 1.11 0.65 0.64 -0.47 -0.98 0.13 -0.4 -0.37 -0.28 -0.18 - - - -0.37 -0.46 - -0.08 0.21 0.39 0.01 -0.01 0.32 0.26
0.11 0.02 0.08 0.06 0.37 0.66 0.69 0.87 0.82 0.86 0.42 0.43 -0.21 -1.17 0.6 -0.16 -0.27 -0.08 -0.36 -7.74 -6.29 -4.75 -0.16 -0.14 -5.8 -0.5 -0.11 -0.09 -0.01 0.03 0.37 0.28
-0.24 -0.22 -1.29 -0.45 0.68 1.07 1.19 1.16 0.64 0.93 0.23 -0.16 -2.03 -2.08 0.75 -0.87 0.11 0.05 0.15 - -3.32 -0.13 -0.33 -0.41 -1.43 -0.43 0.51 0.13 0.39 0.36 -1.19 -1.98
-0.65 -2.14 -0.92 -0.4 0.05 0.14 0.87 1.22 0.52 1.34 0.11 0.37 -1.87 -2.07 0.0 -1.3 -0.08 0.37 -0.8 - - -0.26 -1.12 -1.15 - -0.76 0.13 1.05 0.61 0.55 1.16 0.8
0.06 0.08 0.21 0.3 0.68 0.5 0.59 0.72 0.78 0.72 0.38 0.39 -0.34 -0.61 -0.43 -0.7 0.06 -0.35 0.12 -7.89 -5.31 -4.27 0.15 -0.12 -3.84 -0.6 0.2 -0.08 0.43 0.46 -0.01 -0.01
0.05 0.04 0.21 0.33 0.12 -0.47 0.42 0.56 0.48 0.58 0.65 0.64 0.2 -0.01 -1.31 0.22 -0.41 -0.85 -1.18 - - - 0.09 -0.37 -5.14 -0.76 -0.34 -0.5 0.1 -0.08 1.72 1.11
-0.62 -0.68 -0.76 -0.57 0.19 0.86 1.27 0.82 0.76 0.78 0.18 -0.23 -1.57 -1.84 0.09 -1.33 0.12 -0.55 0.01 - -2.86 -1.08 0.11 -0.31 -2.67 -0.71 0.62 0.36 0.33 0.58 0.74 0.66
0.25 0.18 -0.1 0.22 0.71 0.67 1.0 0.97 1.18 1.03 0.67 0.33 -1.79 -1.91 -0.27 -1.02 -0.22 -0.13 -0.53 -2.83 -4.46 -2.68 -0.74 -0.82 - 0.26 0.17 0.25 -0.3 -0.06 0.13 0.02
0.14 -0.21 0.06 -0.38 0.76 1.0 1.18 1.38 1.3 1.24 0.8 0.39 -3.27 -4.1 -0.52 -2.18 -0.47 -1.88 -1.47 -2.46 -0.33 -7.81 -0.87 -0.97 -2.13 -0.88 0.06 0.02 0.47 0.24 -0.02 -0.09
0.11 -0.06 -0.46 -0.18 0.27 0.41 0.81 0.86 0.85 0.95 0.49 0.69 -0.37 -1.63 -0.68 -0.12 -0.14 -0.19 -0.07 - -4.95 - -0.09 -0.17 - -0.13 -0.27 -0.09 0.35 0.33 0.69 0.54
0.21 -0.87 -0.93 -0.4 0.16 0.99 0.84 1.17 1.01 0.78 0.6 -0.03 -0.58 -2.01 0.09 0.04 0.05 -0.07 0.21 -4.07 - - 0.12 -0.26 -2.79 -1.43 -0.01 0.24 0.43 0.75 -0.22 -0.1
0.26 -0.12 0.08 -0.05 0.23 0.55 0.83 0.65 0.87 0.91 0.72 0.68 -1.19 -1.87 -0.64 -0.8 -0.17 -0.45 -0.28 -4.06 -1.65 -0.83 -0.4 -0.32 -2.33 0.02 0.03 -0.02 0.15 0.11 0.48 0.33
0.09 -0.15 -0.55 0.19 0.02 0.84 0.83 1.01 1.16 1.1 0.99 0.64 -0.53 -1.75 -0.68 -0.47 -1.06 -1.55 -0.89 -0.88 -1.5 -0.77 -0.67 -0.23 -1.98 0.39 0.21 0.19 -0.82 -0.4 -0.12 -0.08
-0.43 -0.35 -0.59 -0.66 0.04 0.87 1.28 1.47 0.72 0.63 0.03 -0.39 -1.35 -2.95 -0.02 -1.29 0.06 0.58 -0.07 - - - 0.29 -0.51 -3.89 -0.31 -0.05 -0.01 0.73 1.02 0.37 -0.01
0.08 -0.59 -0.75 0.05 0.23 0.73 1.44 1.28 1.2 1.01 0.81 0.03 -1.25 -0.73 -0.4 -0.83 -0.8 -0.52 0.14 -2.59 - - -0.47 -1.04 -1.65 -0.29 0.25 -0.36 0.36 0.14 -0.06 0.06
-0.26 -0.87 -1.37 -0.25 -0.25 0.51 0.52 0.79 1.1 0.82 0.42 0.31 -1.9 -2.81 -0.17 -1.19 0.1 0.04 -0.05 -3.31 - -4.81 -0.02 -0.21 -2.17 -0.78 0.47 0.12 0.42 0.54 1.37 1.03
-0.21 -0.98 -0.19 -0.45 0.03 -0.26 1.03 0.94 1.05 1.01 0.31 0.28 -2.31 -2.24 -1.15 -1.93 0.36 -0.53 -0.49 -6.02 -0.63 - -0.6 -0.91 -3.59 -0.27 0.33 0.62 0.53 0.27 1.39 1.02
-0.54 -0.98 -0.62 -0.13 0.12 0.56 1.12 1.13 1.3 1.06 0.5 0.2 -0.75 -1.73 -0.05 -1.22 -0.11 -0.24 -1.01 - -1.0 -0.64 -0.07 0.03 0.14 -0.47 -0.04 -0.14 -0.25 -0.12 0.18 -0.12
-0.18 -0.64 -0.58 -0.38 -0.05 0.51 0.84 1.07 0.76 0.91 0.39 0.14 -1.75 -1.55 0.13 -1.2 -0.7 -0.39 -0.14 -1.16 -1.01 0.22 -0.82 -0.73 -0.68 -0.16 0.87 0.79 -0.06 -0.27 0.04 0.2
-0.01 0.1 0.03 -0.06 0.56 0.81 1.05 0.97 0.81 1.02 0.47 0.06 -1.33 -2.56 -0.74 -0.96 -0.5 -0.14 0.66 - -4.68 - 0.07 -0.66 - -0.2 0.46 -0.03 0.1 0.03 0.49 0.24
-0.01 -0.14 -1.03 -0.36 0.02 0.56 1.1 0.84 1.05 0.96 0.29 0.46 -2.68 -2.75 -0.67 -1.43 0.37 0.01 -0.04 - - - -0.06 -0.45 -3.24 -0.82 0.45 0.52 0.55 0.47 0.78 0.61
0.19 -0.21 0.23 0.27 -0.15 1.07 1.45 1.5 1.24 1.06 0.52 0.4 -1.84 -2.51 -1.05 -1.48 -0.6 -0.97 -1.25 - -4.3 -2.64 -1.28 -0.94 - -0.2 0.94 1.08 -0.44 -0.45 -0.34 -0.6
-0.5 -1.82 -1.71 -0.29 0.22 0.84 1.03 1.13 1.52 1.2 0.08 0.31 -1.84 -2.63 -0.14 -1.83 -0.36 0.02 -0.25 - - - -0.13 -0.91 -1.81 -0.62 0.86 0.53 0.28 0.23 0.82 0.25
0.09 -0.15 0.16 -0.07 0.72 0.51 0.86 1.25 1.11 1.16 0.94 0.56 -0.67 -2.29 -0.72 -0.7 -0.69 -0.76 -0.64 - - - -0.44 -0.68 - 0.03 0.21 0.26 0.01 -0.07 0.24 0.19
-0.28 -1.01 -1.11 -0.56 -0.13 0.84 1.51 1.03 1.44 1.09 0.59 0.23 -2.43 -2.36 -0.3 -0.99 -0.09 -0.55 0.51 - - - -0.56 -0.65 -2.91 -0.98 -0.84 -0.49 0.57 0.63 1.14 0.29
-0.38 -1.31 -1.37 -0.58 0.45 0.94 1.02 1.51 1.37 1.14 0.25 -0.16 -2.87 -2.41 0.29 -1.99 -0.77 -3.0 -1.05 0.34 -1.02 -0.23 -0.88 -1.4 -0.81 -0.57 1.01 0.7 -0.27 -0.38 0.07 -0.56
0.87 0.05 -0.75 -0.32 0.08 0.45 0.88 0.87 0.89 1.08 1.02 1.1 -2.45 -2.04 -0.99 -2.08 -0.07 0.54 -0.9 -4.66 -2.52 -0.87 -0.52 -0.94 -0.36 -2.67 -0.04 0.09 0.37 0.55 0.05 -0.57
0.2 -0.82 -0.68 -0.59 0.13 0.25 0.96 0.96 0.68 1.09 0.61 0.34 -1.58 -2.7 -0.7 -0.75 -0.18 0.25 -0.2 -3.38 0.13 -2.0 -0.6 -0.44 -2.65 -1.13 -1.1 -1.55 0.44 0.41 1.31 1.17
-0.05 0.27 0.71 0.28 0.2 0.32 0.48 0.72 0.52 0.57 0.64 0.44 -0.7 -0.25 -0.05 -0.46 -0.27 -0.59 -0.32 -3.2 -2.59 -3.67 -0.17 -0.22 -1.22 0.3 0.55 0.62 -0.28 -0.37 -0.13 -0.05
-0.31 -1.3 -1.83 -0.67 0.34 1.24 1.42 1.62 0.97 0.95 -0.03 -0.69 -2.19 -1.71 -1.06 -1.26 0.08 0.14 -0.87 -5.98 -1.26 -0.99 -0.54 -0.71 -4.12 -1.99 0.36 0.76 0.38 0.1 0.75 0.41
0.02 -0.16 0.08 0.29 0.38 0.27 0.57 0.83 1.16 1.04 0.85 0.9 -1.05 -1.2 -2.22 -0.6 0.34 -1.1 -0.56 -3.67 -5.4 -5.97 0.2 0.1 -1.33 -0.23 -0.14 -0.06 0.61 0.61 -0.37 -0.75
0.82 0.02 -0.69 -0.35 0.17 0.63 0.7 1.13 1.27 1.16 1.38 1.0 -1.76 -3.02 -1.3 -1.22 -1.07 -0.3 -0.84 -2.16 -3.18 -0.6 -0.96 -0.46 -2.59 -0.41 -0.33 -0.0 -0.23 -0.08 0.0 0.27
-0.0 -0.25 -1.09 -0.33 0.52 0.29 0.94 0.91 1.06 0.97 0.75 0.23 -0.82 -1.49 0.35 -0.25 -0.48 -0.79 0.07 - -5.49 -3.23 -0.49 -0.89 -3.04 0.36 0.72 0.39 0.1 0.29 0.14 0.02
-0.03 -0.36 -0.36 -0.1 0.7 1.22 1.24 1.24 1.22 1.13 1.05 0.58 -1.47 -1.93 -0.0 -0.87 -0.98 -0.88 -0.79 - -4.47 -13.23 -0.49 -0.68 -3.71 -0.16 0.23 0.29 -0.27 -0.17 -0.31 -0.56
-0.1 -0.5 -0.36 -0.28 -0.09 0.54 1.08 1.11 1.06 0.93 0.48 0.31 -1.44 -2.46 -0.11 -0.84 0.03 -0.78 -0.46 -4.23 -5.99 -1.4 -0.57 -0.56 -2.48 0.59 0.55 0.63 0.19 0.24 0.26 0.12
0.02 -0.16 -0.13 -0.09 0.62 0.59 0.3 0.42 0.99 0.94 0.72 0.43 -0.62 -1.43 -1.0 -0.47 0.8 0.49 -0.01 -7.23 - - -0.17 -1.28 0.05 -0.45 -0.64 -0.25 0.38 0.52 0.31 -0.33
0.27 -0.0 0.38 0.06 0.1 -0.07 0.59 0.49 0.86 1.03 0.45 0.52 -0.39 -1.88 -0.41 0.24 -0.64 0.14 0.57 - - - -0.78 -0.82 -6.08 0.38 0.26 0.28 -0.02 0.28 0.25 0.46
-0.02 0.11 0.27 0.31 0.3 0.42 0.53 0.47 0.59 0.67 0.41 0.38 -0.82 -1.12 -0.7 -0.79 0.27 -0.32 -0.4 -4.56 -1.34 -3.46 -0.28 -0.31 -1.65 0.1 -0.21 -0.12 0.17 0.27 0.7 1.06
-0.79 -1.12 -0.44 -0.46 0.16 0.22 1.59 1.58 1.44 1.16 0.89 0.21 -1.99 -1.98 0.73 -1.59 -1.31 -1.84 -0.77 -7.34 -2.03 - -1.4 -1.24 -4.35 0.35 0.51 0.14 -0.02 -0.13 0.37 0.5
-0.06 -0.3 0.26 0.09 0.73 0.64 0.7 1.16 1.16 1.18 1.18 0.8 -0.76 -2.03 -0.25 -0.69 -1.03 -1.18 -0.78 -4.41 -0.62 -3.94 -0.51 -0.39 -3.21 -0.01 -0.3 -0.45 -0.19 -0.49 0.13 0.03
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0.01 -0.03 0.14 0.28 0.48 -0.01 0.48 1.08 0.7 0.81 0.53 0.34 -0.17 -0.23 0.1 0.04 -0.55 -1.46 0.24 -2.59 -5.31 - -0.24 -0.31 -4.13 0.13 -0.04 -0.51 0.06 0.08 0.46 0.58
0.06 -0.11 0.18 0.27 0.21 0.12 0.47 1.15 0.74 0.73 0.64 0.45 -0.27 -0.46 -0.36 -0.23 -0.76 -1.01 -0.04 -4.23 -1.84 -3.18 -0.32 -0.21 -2.43 0.71 0.47 0.16 -0.29 -0.18 0.14 0.14
-0.71 -0.75 -1.3 -0.14 0.62 0.32 0.83 1.17 0.75 1.49 0.46 0.44 -2.02 - -2.1 -1.74 -0.49 0.39 -0.1 -2.65 -1.37 0.43 -0.79 -1.16 -0.89 -2.12 -0.17 -2.48 0.37 0.27 1.38 0.88
-0.27 -0.99 -0.89 0.06 1.09 1.27 0.97 0.92 0.87 1.0 0.84 -0.1 -1.42 -3.29 -0.63 -1.43 0.1 -0.63 -0.1 -4.81 - - 0.12 -0.81 - -2.06 0.53 -0.27 0.21 0.54 0.86 0.45
0.22 -0.42 -1.19 -0.05 0.28 0.74 0.81 0.8 1.47 1.1 0.79 0.27 -1.63 -1.77 0.14 -1.21 -0.59 -1.31 -0.87 -2.09 - -2.0 -0.7 -0.97 -1.17 -0.35 0.68 -0.05 -0.19 -0.12 0.42 1.09
0.04 0.25 0.38 0.55 -0.18 0.26 0.92 0.42 0.93 0.82 0.66 0.55 -0.37 -0.81 -0.47 -0.79 -0.04 -0.66 -0.21 - -3.55 - 0.22 -0.09 -1.19 -0.18 -0.36 -0.07 -0.12 -0.04 0.63 0.27
-0.23 -0.16 -0.37 -0.28 0.03 0.34 0.88 1.33 1.38 1.67 1.41 1.11 -2.07 -3.75 -1.13 -1.21 -0.95 -0.55 -0.46 -1.42 - - -0.58 -0.11 -6.59 -0.09 -0.73 -0.46 0.12 -0.01 0.17 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.