Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
1.32 0.63 -0.08 -0.46 -0.29 -0.58 -0.8 -0.47 -0.34 -0.22 0.18 0.38 0.48 0.5 -1.09 0.6 -0.53 -0.26 0.24 -0.2 -0.28 -1.18 -0.38 -0.22 0.56 0.13 -0.25 -0.29 -0.18 -0.21 0.44 -0.27
0.27 -0.3 0.14 -0.21 -0.77 -0.53 -0.35 0.05 0.31 0.44 0.82 0.68 0.39 0.07 -0.82 0.7 -0.46 -0.01 0.39 -4.84 -0.27 -0.13 -0.22 0.09 -1.13 0.57 -0.54 -0.74 -0.22 -0.38 0.46 0.54
0.79 0.64 -0.57 0.21 0.5 0.52 0.61 0.45 0.98 1.11 0.97 0.86 0.9 -2.21 -3.73 -0.02 -2.55 -2.44 -1.59 -1.11 0.31 -0.98 -1.44 -0.68 1.48 0.29 -1.88 -2.7 -1.67 -1.57 -0.87 -0.84
-0.6 0.23 0.07 -0.13 -1.21 -1.19 0.13 0.8 0.98 1.62 1.51 1.99 -0.08 1.33 0.38 1.07 -3.31 -1.63 -1.57 - - - -3.19 -2.43 -2.7 1.13 -1.25 -0.63 -1.31 -1.52 -1.86 -2.01
0.22 -0.25 -0.58 -0.3 -0.81 -1.01 -0.01 0.52 -0.1 0.81 1.13 1.47 -1.05 -1.94 -0.93 -0.11 -0.49 -0.42 0.71 0.59 -3.57 -3.7 -0.38 -0.29 -0.86 1.82 0.26 -0.0 -0.29 -0.4 -1.44 -0.7
-0.11 0.05 -0.23 -0.17 -0.81 -1.01 0.06 0.66 0.81 1.42 1.77 2.24 -0.33 0.11 -1.52 0.93 -1.98 -3.53 -1.81 -8.42 -3.01 - -2.16 -1.55 -1.83 1.22 -1.33 -1.42 0.06 -0.38 -0.41 -0.63
-0.05 0.01 0.07 -0.3 -1.12 -1.29 -0.09 0.38 0.36 1.33 1.31 1.66 0.17 0.61 -0.88 1.88 -2.07 -2.49 -0.5 -6.18 -2.67 -2.96 -2.08 -0.9 -0.19 0.8 -0.61 -0.4 -0.62 -0.82 -0.41 -0.89
1.23 0.46 0.28 0.07 0.36 0.02 0.08 0.61 0.93 1.04 1.14 1.41 -0.6 -0.87 -0.33 -0.66 -0.56 -2.84 -0.48 -6.32 -1.98 -6.83 -0.4 -0.34 -1.54 0.82 -0.21 -0.65 -0.18 -0.22 -1.21 -0.89
0.97 0.42 0.09 0.11 0.07 -0.27 0.32 0.54 0.74 1.14 1.0 1.43 -0.68 -0.69 -0.72 -0.81 -0.83 -1.01 -0.43 -3.47 -0.99 -5.82 -0.96 -0.83 -3.05 0.06 -1.44 -1.67 -0.09 0.04 0.81 0.94
0.66 0.6 0.41 0.19 -0.06 -0.35 -0.0 0.4 0.47 0.67 0.93 1.13 -0.62 -1.34 -1.98 -0.66 -0.39 -0.79 -0.19 -3.0 -0.64 -2.64 -0.51 -0.66 0.91 0.74 0.05 0.18 0.04 0.04 -0.79 -0.89
0.64 0.13 0.07 -0.06 -0.08 0.11 0.09 0.4 0.74 0.74 0.8 0.77 -0.6 -1.03 -1.58 -0.38 -0.55 -0.15 -0.27 -2.04 -0.48 -0.7 -0.33 -0.08 0.19 0.46 -0.3 -0.27 0.03 0.06 -0.07 -0.03
0.85 0.48 0.2 0.04 -0.01 -0.09 -0.12 0.6 0.68 0.75 0.84 0.94 0.0 -0.95 -2.27 -0.14 -0.6 -1.19 -0.07 -2.47 -1.88 -4.21 0.05 0.23 0.01 0.95 -0.09 -0.08 -0.21 -0.21 -0.51 -0.7
0.9 0.48 0.11 -0.09 -0.43 -0.68 -0.39 -0.04 0.58 0.77 1.18 1.5 0.31 -0.45 -1.11 0.13 -0.86 -1.22 -0.32 -1.86 -0.14 -3.09 -0.78 -0.39 1.31 0.09 -1.09 -1.14 -0.35 -0.32 -0.62 -0.61
0.3 0.41 0.16 0.15 0.06 0.14 0.12 0.41 0.44 0.47 0.58 0.47 -1.17 -0.83 -0.45 0.18 -0.11 -0.36 -0.02 -1.63 -0.14 -2.41 -0.02 -0.27 0.89 -0.03 0.08 0.25 0.11 0.14 -0.9 -1.14
0.85 0.82 0.63 0.1 -0.49 -0.83 0.04 0.43 0.85 1.45 1.67 1.9 -2.77 -2.47 -2.74 -2.11 -0.31 -0.7 -1.55 -1.17 -2.71 -6.51 -1.43 -1.81 -3.35 -0.3 -1.48 -1.14 0.64 0.45 0.19 0.25
0.86 0.05 -0.05 -0.04 -0.29 -0.63 0.19 0.92 0.9 1.06 1.12 1.27 -1.15 -1.35 -2.52 -0.9 -1.2 -1.71 -1.05 -4.63 -0.59 -4.25 -0.65 -0.0 -0.22 1.24 0.0 -0.54 -0.56 -0.53 0.46 0.44
0.3 0.21 0.08 0.09 0.1 0.05 0.09 0.27 0.51 0.64 0.69 0.59 -0.09 -0.54 -0.7 0.1 -0.61 -1.32 -0.24 -0.03 -0.05 -1.23 0.08 0.23 0.24 0.65 -0.41 -0.41 -0.41 -0.37 -0.54 -0.47
0.64 0.15 0.19 0.02 -0.04 -0.31 0.03 0.37 0.67 0.92 1.05 1.15 -0.69 -0.17 -1.41 -0.49 -0.44 -0.86 -0.69 -1.68 -0.26 -1.65 -0.02 -0.11 -0.09 0.7 -0.61 -0.82 -0.18 -0.18 -0.08 -0.07
0.88 0.32 0.31 0.16 0.08 0.16 0.14 0.28 0.64 0.94 1.02 1.14 -1.07 -1.09 -1.0 -1.14 -0.09 -0.07 -0.69 -0.64 -0.53 -1.97 -0.52 -0.75 -1.46 -0.37 -1.56 -1.41 0.04 0.22 0.56 0.6
0.44 0.08 -0.0 -0.03 -0.07 -0.06 -0.06 0.13 0.43 0.62 0.6 0.62 0.26 0.57 -0.54 0.26 -0.13 -0.9 -0.53 -0.14 -0.04 -0.6 -0.56 -0.44 0.52 0.13 -0.72 -0.68 0.01 0.07 -0.58 -0.8
0.68 1.01 0.79 0.49 0.07 -0.29 0.12 0.44 0.75 1.2 1.41 1.62 -0.45 -1.08 -1.5 -0.5 -1.12 -1.14 -0.66 -6.64 -3.57 -3.19 -1.05 -1.01 -2.78 0.11 -1.09 -0.91 -0.03 -0.13 0.2 -0.06
0.61 -0.62 -0.26 0.16 -0.05 -0.22 -0.21 1.05 1.09 1.6 1.5 1.05 -0.8 -2.02 -2.11 0.22 -1.92 -3.73 1.67 -3.66 -0.94 -1.3 -1.67 -1.13 -1.03 1.47 -1.03 -1.2 -1.65 -1.75 -1.67 -1.24
0.63 -0.9 -1.16 -1.23 -1.23 -1.68 -1.05 0.26 0.53 1.56 1.71 1.68 -0.06 -1.11 -3.1 0.34 -1.28 0.4 1.25 -3.83 -1.74 -9.16 -0.84 -0.5 -0.62 1.27 -0.43 -1.29 -0.14 -0.45 -1.12 -0.16
0.39 0.08 -0.23 -0.0 0.12 0.16 0.04 0.24 0.48 0.63 0.6 0.61 0.06 -0.23 -0.81 -0.1 -0.73 -1.2 0.17 -2.43 -2.19 -3.23 0.23 0.44 1.05 0.7 -0.33 -0.06 -0.15 -0.13 -0.46 -0.35
1.38 0.51 -0.42 -0.7 -0.94 -0.88 -0.66 -0.25 0.02 0.19 0.49 1.15 -0.78 0.14 -0.61 -0.28 -0.99 -0.28 0.3 -0.99 0.46 -3.05 -0.9 -0.45 0.3 0.1 -0.27 -0.39 -0.06 0.08 0.82 0.71
0.57 0.12 0.04 0.06 0.1 -0.07 -0.04 0.47 0.6 0.76 0.66 0.77 0.12 0.18 -0.85 -0.01 -1.1 -0.73 -0.25 -0.32 0.5 -1.3 -0.42 -0.17 0.72 -0.23 -1.24 -1.49 -0.46 -0.61 -0.18 0.0
1.49 0.61 -0.45 -0.69 -0.77 -1.61 -1.65 -0.18 0.65 1.78 1.98 2.21 -0.87 -0.95 -1.11 -1.43 -1.07 -3.81 -0.91 -0.85 -0.99 -2.82 -1.68 -1.36 -0.48 0.8 -1.87 -2.35 0.13 -0.05 -1.34 -1.4
-0.6 -1.13 -1.0 -0.72 -1.17 -0.81 0.02 0.91 1.18 1.55 1.29 1.15 1.75 1.06 -2.36 1.12 -3.61 -4.99 0.38 - -5.66 - -1.44 -1.4 -0.21 1.72 -1.57 -3.14 -1.6 -2.19 -1.17 -1.3
0.83 0.63 -0.05 -0.29 -0.66 -0.96 0.26 0.47 0.71 1.12 1.28 1.39 -1.06 -1.0 -0.53 -1.18 -0.58 0.06 0.28 -0.49 -1.37 -1.46 -1.44 -2.13 -2.57 0.4 -0.6 -0.41 0.14 0.02 0.16 0.1
0.49 0.36 0.02 0.12 0.05 0.03 0.27 0.4 0.5 0.75 0.89 0.9 0.48 -0.22 -1.35 0.2 -0.52 -0.55 0.25 -1.9 -2.0 -2.27 0.1 0.1 0.37 0.2 -0.84 -0.99 0.0 -0.06 -0.79 -0.82
0.67 0.22 0.04 0.1 0.02 -0.13 0.02 0.44 0.58 0.83 0.88 0.92 0.31 -0.47 -1.02 0.31 -0.58 -2.53 -0.04 -9.98 -1.2 -8.58 -0.14 0.01 -0.06 0.6 -0.33 -0.47 -0.27 -0.3 0.16 0.31
0.51 -1.5 -0.95 -0.1 -0.44 -0.55 -0.27 1.36 1.24 1.73 1.45 0.89 -1.71 -2.55 -2.27 -0.37 -3.17 -2.79 1.29 -0.1 -0.24 -2.07 -3.25 -2.05 -0.18 2.09 -0.3 -0.91 -2.71 -2.96 -2.68 -1.91
1.46 0.32 -0.44 -0.56 -0.95 -1.1 -0.71 -0.33 -0.17 0.3 0.45 1.11 -0.0 1.08 -0.4 0.27 -1.23 -0.54 -0.14 -3.15 -0.85 -8.21 -0.61 -0.14 0.49 0.25 0.13 -0.92 0.01 -0.1 0.79 0.42
0.77 0.01 0.07 0.07 -0.33 -0.51 0.01 0.26 0.81 0.87 0.97 1.21 -0.51 -0.87 -2.65 -0.7 -1.03 -1.63 -0.28 -0.49 0.02 - -0.35 -0.17 0.5 0.54 -0.55 -0.8 -0.17 -0.42 0.26 0.69
1.32 1.45 0.6 -0.32 -0.97 -1.14 -0.67 -0.3 -0.09 0.66 1.23 2.52 -0.32 -1.83 -0.73 -0.91 -2.11 -1.37 -0.83 -1.53 -0.94 -5.55 -1.76 -1.0 -2.25 1.06 -2.33 -2.22 -0.38 -0.75 -0.08 0.41
0.91 0.14 -0.09 -0.23 -0.22 -0.37 0.22 0.74 0.8 1.12 1.1 1.36 -0.78 -1.12 -2.72 -0.36 -0.71 -0.86 -0.02 -6.33 -4.23 -7.97 -0.54 -0.41 -2.38 1.15 0.17 0.22 0.22 0.26 -0.46 -0.48
0.46 0.14 0.14 0.2 -0.07 0.15 0.24 0.56 0.65 0.56 0.5 0.46 0.03 -0.46 -0.66 0.07 -0.51 -2.6 -0.21 -0.71 0.02 0.03 -0.1 0.15 -0.11 0.81 -0.16 -0.43 -0.59 -0.5 -0.7 -0.79
0.15 -0.05 0.06 0.19 0.11 0.06 -0.18 0.54 0.68 0.66 0.59 0.54 0.41 -0.19 -0.96 0.33 -0.97 -1.59 -0.71 -3.0 -0.38 0.58 -0.19 0.01 0.58 1.08 -0.27 -0.26 -0.94 -0.84 -0.99 -0.72
1.05 0.14 0.03 0.12 0.02 -0.04 0.56 0.85 1.28 1.48 1.46 1.71 - -6.32 -8.48 -5.56 -0.81 -4.15 -3.27 - -0.58 - -3.09 -3.72 0.44 0.89 0.76 0.11 -0.35 -0.67 -0.23 -1.61
0.79 0.24 -0.34 -0.37 -0.66 -0.93 -0.61 0.07 0.23 0.55 0.61 1.14 0.06 0.26 -0.13 0.06 -0.68 -0.89 0.09 -1.04 -0.34 -2.46 -0.63 -0.5 0.38 0.53 -0.31 -0.52 0.05 0.03 0.59 0.32
-0.17 -0.88 -0.77 -0.79 -0.63 -0.89 -0.14 0.38 0.25 1.22 1.06 1.15 0.59 0.85 0.28 -0.17 -1.16 -0.35 1.18 -0.0 -8.25 -7.37 -0.14 0.13 -0.81 0.31 -0.88 -1.22 -0.1 0.11 -0.59 -0.28
0.57 0.44 0.22 0.16 -0.11 -0.18 0.27 0.65 0.75 1.06 1.09 1.33 -0.83 -0.49 -0.9 -0.82 -0.69 -0.85 -0.74 -4.05 -1.69 -3.94 -0.78 -0.9 -2.78 0.56 0.02 -0.24 0.02 -0.08 0.26 0.64
0.61 0.28 -0.01 0.03 0.14 0.18 0.18 0.26 0.43 0.65 0.63 0.67 -0.07 -0.91 -1.35 0.03 -0.56 -0.66 0.17 -0.78 -0.89 -1.76 -0.03 -0.05 0.61 -0.04 -0.66 -0.52 -0.18 -0.05 0.11 0.24
0.48 -0.1 -0.43 -0.51 -0.88 -0.98 -0.19 0.74 0.95 1.48 1.73 1.88 -0.45 -0.12 -0.4 0.2 -2.15 -2.08 -0.0 -0.81 -2.47 -2.45 -1.55 -1.05 -3.03 0.88 -1.31 -1.23 0.14 0.25 -0.78 -1.06
1.23 0.31 -0.06 0.26 -1.37 -2.06 -0.26 0.16 0.87 0.93 2.06 2.1 -3.77 - - -5.18 -1.72 -3.91 -0.76 - -5.06 0.67 -0.7 -1.64 -0.72 1.86 -3.56 -5.16 -1.0 -0.64 -0.24 0.6
0.9 0.45 -0.12 0.04 -0.46 -0.04 0.08 0.07 0.35 0.49 0.46 0.86 -0.0 -0.11 -0.9 1.32 -0.57 -0.43 0.53 -4.21 0.43 -2.59 -0.96 -1.07 0.82 -0.33 -0.9 -0.97 -0.24 -0.16 -0.55 -0.41
1.65 0.65 0.04 -0.54 -0.54 -1.17 -1.14 -0.97 -0.53 -0.66 0.15 1.1 -0.92 0.63 -1.23 0.04 -1.02 -0.19 0.81 -3.99 0.08 -1.27 -1.31 -0.49 -2.47 -0.05 -1.45 -1.75 0.43 0.72 1.51 0.99
0.05 0.29 -0.03 -0.08 -0.13 0.13 0.51 0.59 0.61 0.83 0.71 0.71 0.28 -1.03 -1.4 0.06 -0.15 -0.07 -0.53 -1.95 -1.06 -2.74 -0.19 0.02 0.71 -0.02 -0.4 -0.14 -0.09 -0.08 -0.16 -0.33
0.32 0.27 0.13 0.39 0.24 -0.41 0.34 0.38 0.73 0.78 1.13 0.84 -0.65 -0.61 -1.38 -0.43 -1.35 -2.44 1.14 -3.28 -1.3 -1.15 -0.55 -0.15 -1.42 1.37 0.03 -0.36 -1.36 -1.33 -0.18 0.16
0.76 0.05 -0.06 -0.14 -0.66 -0.68 0.13 0.75 0.59 1.34 1.47 1.72 -1.65 -2.06 -1.97 -1.55 -1.12 -0.69 -1.14 -3.27 -0.45 -1.66 -1.51 -1.64 0.83 1.14 -0.3 -0.24 -0.16 -0.25 -0.37 -0.74
1.24 0.67 0.26 0.16 -0.13 -0.28 0.28 0.66 0.94 1.35 1.39 1.5 -0.94 -1.15 -1.19 -0.61 -1.05 -0.89 -0.91 -4.19 -1.94 -4.43 -1.18 -1.14 -2.91 0.61 -0.85 -0.98 -0.38 -0.47 0.03 0.24
1.04 0.08 -0.64 -0.71 -0.79 -0.89 -0.62 -0.04 0.24 0.73 0.89 1.41 0.35 0.07 -1.96 0.64 -1.1 0.14 0.46 -2.0 -3.21 -2.73 -0.74 -0.4 -2.21 1.45 -0.57 -1.25 -0.11 -0.15 0.4 0.49
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0.1 -0.27 0.0 -0.02 -0.04 -0.16 0.26 0.34 0.62 0.89 0.89 0.78 -0.79 0.25 0.37 -0.88 -0.74 -1.32 -0.96 -3.63 0.6 0.22 -1.05 -0.78 0.81 0.9 -0.32 0.06 -0.53 -0.5 -0.86 -1.08
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0.37 0.13 0.05 0.21 0.23 0.02 0.02 0.39 0.42 0.7 0.78 0.62 0.64 -0.09 -0.73 0.42 -0.96 -1.21 -0.59 -1.07 -0.26 -1.29 -0.27 0.0 0.78 0.81 -0.65 -0.75 -0.87 -0.76 -0.84 -0.53
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-0.45 -0.85 -0.63 -0.5 -0.64 -0.98 0.29 0.82 1.05 1.12 1.38 1.4 1.12 0.37 -1.99 -0.3 -1.17 -1.04 -0.17 -8.18 -3.39 -5.25 -0.66 -0.8 -1.99 0.02 0.24 0.13 0.57 0.56 -0.63 -0.17
0.66 0.46 0.38 0.54 0.52 0.54 0.25 0.67 0.57 0.83 0.61 0.69 0.23 -1.23 -1.77 -0.14 -1.3 -2.79 -0.28 -3.01 0.1 -3.15 -0.36 -0.01 0.44 0.37 -0.63 -0.93 -0.53 -0.7 -0.17 -0.06
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0.66 0.62 0.16 0.57 0.48 0.54 0.41 0.41 0.83 1.08 1.08 1.17 -1.44 -2.09 -1.28 0.07 0.11 0.14 0.31 -2.71 -0.64 -4.73 -0.46 -0.45 -1.9 -1.25 -1.71 -1.27 -0.36 -0.42 -0.35 0.03
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0.31 0.06 -0.0 0.11 0.11 0.08 0.18 0.48 0.56 0.69 0.65 0.64 0.45 -0.57 -0.94 0.13 -0.78 -0.94 -0.12 -1.89 -0.09 -3.99 -0.23 -0.0 1.03 -0.02 -0.76 -0.7 -0.27 -0.29 -0.05 0.16
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0.82 0.23 0.0 -0.06 -0.25 -0.37 -0.2 -0.25 -0.08 0.14 0.17 0.87 0.35 -0.09 -0.92 0.66 -0.53 -0.33 0.59 -1.35 -1.27 -1.61 -0.47 -0.23 -0.0 0.42 -0.28 -0.21 -0.01 0.07 0.45 0.41
-0.07 -1.22 -0.48 -0.45 -0.46 -0.72 0.17 1.12 1.42 1.59 1.46 1.04 0.79 -0.1 -3.65 0.98 -2.08 -1.81 -0.25 -1.74 -1.73 -8.65 -0.16 0.07 -1.89 -0.28 -1.05 -2.21 -0.11 -0.39 -0.29 0.15
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0.56 0.3 -0.28 -0.08 -0.54 -0.29 0.12 0.6 0.57 0.79 1.17 1.3 -0.4 -1.17 -2.24 -0.33 -0.58 -0.59 1.01 -0.38 - -0.4 -0.24 -0.19 -0.92 0.98 -0.76 -0.25 -0.3 -0.25 -0.86 -0.85
1.4 0.7 0.28 -0.08 -0.05 -0.51 -1.29 -1.47 -0.81 -0.7 -0.46 0.04 0.74 0.32 -0.92 0.94 -0.49 -0.34 0.66 -0.5 0.42 -6.48 -0.36 -0.06 1.02 0.49 -0.04 -0.01 -0.58 -0.32 -1.04 -0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.