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Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.88 -0.08 0.59 0.67 0.64 0.6 0.47 -0.03 -0.11 -0.11 -0.09 -0.37 -1.02 -0.41 1.3 -0.67 0.08 -0.6 -0.18 -0.75 -1.31 1.39 -0.04 -0.35 0.85 -1.71 -0.65 -0.79 -0.48 0.15 -0.85 -1.36
-0.55 -0.34 -0.63 -0.43 0.41 0.19 0.23 0.6 0.47 -0.17 -0.01 -0.37 0.25 -0.47 1.19 0.04 -1.27 -2.55 -0.35 0.72 -0.32 0.12 -1.02 -0.67 1.0 1.06 0.75 0.36 -1.03 -0.72 -1.78 -1.97
-0.1 -0.14 -0.25 -0.16 0.06 -0.08 -0.26 0.11 0.23 0.21 0.22 0.17 -0.13 0.25 0.87 -0.12 -0.57 -2.0 0.22 0.74 -0.91 -0.74 -0.38 -0.33 1.64 0.33 -0.28 -0.29 -0.57 -0.51 -0.82 -0.63
-0.48 -0.17 -0.18 0.02 0.3 0.35 0.3 0.14 0.22 -0.3 -0.29 -0.26 -1.32 -0.17 1.14 -0.72 0.23 -0.27 0.04 -0.52 -0.35 0.63 -0.83 -1.16 1.31 -0.49 0.24 0.4 0.09 -0.04 -0.64 -0.98
-0.58 -0.9 -0.51 -0.28 -0.28 -0.24 -0.04 0.34 0.38 0.32 0.15 0.07 -0.44 -0.57 -0.27 -0.48 -0.68 -0.78 -0.23 1.46 0.56 0.66 -0.59 -0.37 0.56 0.73 0.34 0.07 -0.45 -0.49 -0.43 -0.38
-0.71 -0.56 -0.54 -0.24 -0.13 0.28 0.17 0.52 0.14 0.01 -0.41 -0.4 0.02 -0.53 1.2 -0.04 -0.53 -0.62 0.27 0.37 -0.25 -0.34 0.19 0.41 -0.06 0.48 0.41 0.77 -0.46 -0.49 -0.98 -0.67
-1.25 -0.31 -0.17 -0.98 -0.41 0.59 -1.53 -1.13 -1.81 -1.68 -0.37 -0.94 0.83 1.51 1.53 1.33 -0.66 0.79 -1.62 1.56 0.7 0.22 0.78 -0.09 -0.47 -0.72 -2.3 -0.8 -0.84 -1.48 -3.17 -2.42
-0.35 -0.3 -0.27 0.06 0.01 0.03 0.22 0.06 -0.15 -0.17 -0.42 -0.49 -0.3 -0.46 1.11 0.17 -1.19 -1.78 -0.43 0.44 0.56 0.63 -0.51 -0.1 1.07 0.42 0.81 1.01 -1.25 -1.09 -1.48 -1.79
-0.03 -0.27 -0.27 0.05 0.13 -0.15 -0.13 0.1 0.22 0.27 -0.06 -0.07 -0.15 -0.6 -0.11 0.07 -0.25 -0.6 0.27 -0.44 -0.72 -2.59 -0.08 0.23 1.62 0.82 0.03 0.3 -0.41 -0.14 -0.5 -0.43
-0.21 -0.19 -0.28 -0.12 -0.06 0.05 -0.1 0.14 0.13 -0.13 -0.24 -0.22 0.67 0.65 0.95 0.65 -0.73 -1.07 -0.28 1.03 -0.83 -1.54 -0.19 0.05 0.67 0.35 0.1 0.08 -0.53 -0.48 -1.12 -1.05
-0.69 -0.36 -0.29 0.16 0.31 0.86 0.89 0.79 0.14 0.07 -0.5 -0.59 -0.85 -2.16 1.28 -0.94 -0.45 -0.3 -0.36 -0.01 -1.15 0.09 -0.81 -0.86 0.58 -0.94 1.12 0.94 -0.54 -0.38 -0.86 -0.49
-0.65 -0.55 -0.47 -0.42 -0.13 -0.09 -0.11 -0.06 -0.02 -0.3 -0.39 -0.74 0.26 -0.09 1.36 0.38 -0.46 -0.74 0.46 -0.4 -0.57 0.9 -0.0 0.21 0.84 0.3 0.2 0.19 -0.45 -0.3 -0.67 -0.54
-0.18 -0.55 -0.42 -0.26 -0.35 -0.31 -0.5 -0.41 -0.36 -0.26 -0.18 -0.21 0.48 0.97 1.17 0.75 -0.54 -1.25 0.18 0.95 0.02 0.27 -0.22 -0.01 1.01 0.06 -0.59 -0.81 -0.42 -0.26 -0.9 -0.98
-0.16 -0.14 -0.22 -0.09 0.08 0.0 -0.01 0.22 0.04 0.13 0.05 -0.15 0.1 -0.58 0.08 0.22 -0.39 -0.87 0.29 0.41 -0.6 -0.83 -0.26 -0.17 1.05 0.81 0.23 0.18 -0.21 -0.1 -0.46 -0.48
-0.35 -0.42 -0.43 -0.29 -0.06 0.24 -0.15 0.35 0.65 0.35 0.4 0.12 -1.0 -0.83 -0.32 -0.5 -0.16 -0.45 -0.61 1.33 0.85 0.74 -0.56 -0.3 0.96 -0.28 -0.73 -0.73 -0.07 -0.12 -0.9 -0.71
-0.51 -0.3 -0.29 -0.12 0.39 0.48 0.32 0.3 0.18 -0.0 0.01 -0.47 -0.04 -0.29 0.66 0.18 -0.54 -0.44 0.2 0.74 0.02 -0.19 -0.26 -0.24 -0.31 0.03 0.44 0.32 -0.55 -0.48 -0.48 -0.29
-0.17 -0.2 -0.12 -0.04 0.07 0.29 0.18 0.25 0.17 0.24 0.08 -0.05 -0.37 -0.85 0.76 -0.54 -0.6 -1.03 0.17 0.25 -0.1 0.04 -0.58 -0.33 1.03 0.27 0.33 0.51 -0.5 -0.38 -0.58 -0.45
-0.84 -0.87 -0.74 -0.39 -0.32 -0.13 -0.13 -0.2 -0.05 -0.44 -0.69 -0.71 0.16 0.07 1.6 0.41 -0.05 -0.28 0.52 -0.19 -0.49 0.97 -0.04 0.46 0.26 0.12 0.08 0.1 -0.17 0.12 -1.01 -0.81
-0.09 -0.06 -0.08 -0.03 0.0 0.06 0.04 0.05 -0.06 -0.11 -0.14 -0.17 -0.38 -0.24 1.14 -0.13 -0.63 -0.89 -0.18 -0.39 -0.1 0.43 -0.69 -0.49 1.31 0.42 0.4 0.29 -0.62 -0.62 -0.36 -0.38
-0.15 -0.2 -0.28 -0.05 0.22 0.23 0.12 0.32 0.11 -0.12 0.01 -0.18 -0.68 -0.6 0.37 -0.47 -0.23 -0.4 -0.06 0.12 0.22 -0.79 -0.34 -0.42 1.34 0.35 0.46 0.38 -0.24 -0.15 -0.63 -0.39
-0.33 -0.2 0.26 0.41 0.47 0.5 0.59 0.06 0.33 0.1 0.02 -0.18 -1.99 -0.91 1.45 -1.69 0.65 -0.25 -0.58 -1.87 -2.57 0.74 -0.26 -0.67 0.76 -0.3 -0.38 -0.12 0.24 0.57 -0.62 -2.0
-0.06 0.28 0.42 0.32 0.51 0.55 0.29 -0.14 -0.12 -0.31 -0.37 -0.43 -0.19 0.08 1.15 0.21 -0.42 -0.34 -0.09 -0.13 -0.68 0.46 -0.8 -0.68 -0.31 -0.41 0.74 0.67 -0.87 -0.78 -0.94 -0.66
-0.46 -0.3 -0.5 -0.23 0.11 0.29 -0.17 -0.53 -0.57 -0.41 -0.59 -0.84 0.33 0.1 1.44 0.38 -0.55 -0.33 0.36 0.54 1.09 0.73 -0.69 -0.5 0.55 -0.44 -0.01 0.02 -0.63 -0.45 -1.01 -0.74
-0.55 -0.6 -0.68 -0.62 -0.01 -0.1 0.28 0.44 0.35 0.09 -0.2 -0.15 -0.12 -0.82 0.87 -0.54 -1.08 -1.36 -0.31 -0.27 -0.45 1.09 -0.6 -0.14 1.29 0.2 0.93 0.45 -0.79 -0.52 -0.66 0.1
-1.05 -0.67 -0.43 -0.12 0.09 0.39 0.4 0.3 -0.06 -0.18 -0.37 -0.77 -0.32 -0.3 1.14 -0.35 -0.44 -0.51 -0.3 -0.07 0.41 -0.31 -0.38 -0.12 1.16 -0.1 0.97 0.82 -0.47 -0.31 -0.98 -0.91
-0.22 -0.2 -0.14 -0.08 -0.26 -0.17 -0.21 0.22 -0.03 0.12 0.08 -0.09 0.06 -0.25 -2.04 0.18 -0.37 -0.33 0.11 -0.08 -0.19 -2.42 -0.16 -0.13 1.22 0.65 0.45 0.36 -0.04 -0.04 0.32 0.17
-0.24 -0.22 -0.0 0.09 0.19 0.26 0.39 0.29 0.19 -0.02 -0.07 -0.28 -0.44 -0.14 1.19 -0.89 -0.63 -0.68 -0.17 -0.32 -0.06 0.39 -0.34 -0.49 0.89 -0.36 0.58 0.38 -0.69 -0.52 -0.47 -0.37
-0.21 -0.59 -0.52 -0.6 -0.37 0.05 0.13 0.04 0.1 -0.4 -0.26 -0.39 -0.57 -0.24 1.04 -0.11 -0.63 -0.65 -0.18 1.29 -0.44 0.18 -0.57 -0.49 1.23 -0.34 0.62 0.74 -0.45 -0.12 -0.33 -0.78
-1.61 -1.03 -0.34 0.03 0.25 0.57 0.57 0.51 -0.16 -0.36 -0.71 -1.33 -0.87 0.21 0.34 0.17 -0.39 -0.74 0.32 0.24 0.27 -1.64 -0.18 0.1 1.44 -0.34 0.9 1.0 -0.39 -0.23 -1.43 -1.33
-0.73 -0.55 -0.3 -0.28 0.17 0.08 0.13 0.2 -0.17 0.12 -0.37 -0.55 0.11 -0.11 1.51 0.36 -0.7 -1.41 0.05 -0.5 0.39 1.2 -0.58 -0.34 1.07 0.33 -0.26 0.03 -0.52 -0.56 -1.31 -1.69
-0.07 -0.09 0.01 0.03 -0.06 0.09 0.11 -0.63 -0.37 -0.41 -0.36 -0.55 0.12 0.75 1.05 0.54 -0.04 -0.42 0.39 0.72 -0.26 -0.91 0.19 0.22 0.24 -0.7 -0.34 0.04 -0.34 0.02 -0.8 -0.53
-0.65 -1.17 -0.95 -0.63 -0.15 -0.12 0.23 0.34 0.33 0.28 -0.01 -0.36 -0.1 -1.02 -0.99 -0.69 -0.54 -0.49 -0.53 1.15 0.02 0.93 -0.78 -0.78 1.35 0.95 0.68 0.66 -0.3 -0.3 -0.88 -1.06
-0.89 -0.66 -0.43 -0.42 -0.16 -0.02 0.42 0.08 0.36 0.29 0.1 -0.28 -0.38 -0.52 -0.21 -0.42 -1.01 -1.42 -0.0 1.57 0.22 0.04 -0.45 -0.13 0.74 0.12 0.55 0.5 -0.37 -0.49 -0.29 -0.02
-0.3 -0.23 -0.2 -0.06 0.16 0.08 -0.16 -0.11 -0.22 -0.45 -0.39 -0.44 0.1 0.63 0.68 0.31 -0.54 -0.56 -0.22 0.24 0.46 0.04 -0.27 -0.21 0.39 0.24 0.84 0.71 -0.44 -0.37 -1.0 -0.88
0.89 -0.04 0.55 -0.19 -1.76 -0.87 -0.19 -0.97 -0.07 -1.06 0.47 0.69 0.23 -0.04 2.97 -1.12 -5.53 - -1.84 - -5.1 - -3.35 -0.8 2.88 -1.11 - -0.89 - -4.73 -2.27 -3.2
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-0.31 -0.29 -0.59 -0.36 -0.51 -0.25 -0.51 -0.4 -0.5 -0.62 -0.66 -0.73 -0.34 0.26 1.32 -0.19 -0.64 -0.95 -0.28 0.95 0.93 0.7 -0.72 -0.61 0.55 0.44 1.04 1.05 -0.87 -0.73 -0.76 -0.81
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-0.61 -0.33 -0.69 -0.51 -0.66 -0.15 -0.69 -0.52 -0.67 -0.54 -0.69 -0.51 0.65 0.4 0.79 0.41 -0.34 -0.72 0.26 1.24 0.57 0.97 -0.49 -0.61 0.88 0.25 0.44 0.23 -0.67 -0.77 -0.75 -0.66
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-0.93 -0.7 -0.77 -0.36 0.14 0.09 -0.02 0.03 -0.25 -0.6 -0.64 -0.97 0.15 0.22 0.23 0.46 -0.51 -0.11 0.77 -4.25 -1.44 -0.23 -0.04 -0.06 1.93 0.2 0.76 0.68 -0.4 -0.27 -0.84 -0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.