1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.06 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.03 0.06 0.38 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05
0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.06 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 1.1 0.26 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.58 0.09 0.0 0.0 0.03 0.04 0.11 0.14
0.75 0.52 0.71 0.46 0.15 0.59 0.53 0.54 1.4 0.67 0.08 0.45 0.1 0.15 0.65 0.05 0.05 1.68 0.0 0.0 0.87 0.14 0.05 0.1 0.0 0.81 0.11 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.17 0.51 0.07 0.0 0.1 1.04 0.95 0.25 0.07 0.08 0.25 0.28 0.0 0.7 0.4 0.36 4.13 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.33 0.78 0.61 0.43 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.98 2.44 0.0 3.61 0.0 5.55 5.91 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 2.28 0.0 0.0 0.71 0.67 1.73 2.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.23 0.03 0.11 0.0 0.16 0.27 0.2 0.04 0.17 0.09 0.12 0.47 0.12 0.48 0.54 0.07 1.63 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.62 0.09 0.29 0.41 0.02 0.04 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.09 0.0 0.16 0.43 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.66 0.08 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.56 0.36 0.35 0.59 0.71 0.36 0.3 0.62 0.46 0.28 0.51 0.39 1.54 1.05 1.78 0.91 0.35 4.63 0.63 2.73 0.98 1.07 0.7 1.03 0.99 0.77 0.59 0.96 0.36 0.49 0.2 0.38
0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.06 0.03 0.02 0.02 0.0 0.06 0.02 0.02 0.17 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.08 0.49 0.36 1.04 0.36 0.31 2.86 0.22 0.0 0.0 0.48 0.45 0.52 0.34 0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.22
2.01 0.42 0.73 1.85 1.6 1.5 1.67 1.15 1.93 2.38 1.58 2.65 0.34 78.3 0.88 0.0 8.31 10.51 0.87 0.1 2.34 0.0 0.09 0.0 0.64 0.0 0.0 2.94 3.82 4.04 2.38 1.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.45 0.06 0.0 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.1 0.17 0.08 0.11 0.32 0.16 0.17 0.11 0.0 0.0 0.05 0.39 0.42 0.49 0.38 0.06 0.16 1.24 0.0 0.72 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 56.35 0.47 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.14 0.26 0.26 0.09 0.07 0.2 0.22 0.19 0.32 0.34 0.26 0.28 0.07 0.1 0.05 0.14 0.28 19.45 4.47 0.0 1.31 0.0 0.16 0.39 0.67 0.47 0.22 0.0 0.39 0.4 0.36 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.13 0.23 0.32 0.3 0.15 0.22 0.4 0.17 0.59 0.53 0.22 18.29 2.26 1.4 8.54 0.03 1.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.98 0.06 0.07 0.09 0.08 0.38 0.01 0.61
1.36 1.43 1.33 1.86 1.74 1.18 0.99 1.04 0.88 1.1 1.6 0.92 29.44 8.3 3.35 6.54 0.13 1.61 0.58 0.0 0.03 0.0 1.54 5.83 1.22 0.32 2.12 1.57 0.49 1.93 0.08 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0 0.74 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.7 1.25 0.95 0.95 1.08 1.82 1.36 2.54 1.84 1.79 0.73 0.74 0.81 1.25 2.0 0.78 0.38 3.37 1.05 1.26 1.07 2.75 0.19 0.71 2.67 0.82 0.98 0.51 0.68 0.37 0.64 1.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.39 0.34 0.19 0.1 0.24 0.57 0.7 0.39 0.44 0.47 0.24 9.11 1.5 0.01 0.85 0.11 2.56 0.09 0.08 1.89 0.0 0.12 0.06 0.39 0.31 0.21 0.21 0.18 0.17 0.07 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.6 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.18 0.28 0.21 0.1 0.13 0.55 0.15 0.36 0.41 0.41 0.24 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 5.51 0.23 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.19 0.06 0.04 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.01
0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.05 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.31 0.08 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.21 0.27 0.09 0.19 0.09 0.31 0.38 0.33 0.11 0.33 0.15 1.68 1.44 1.27 1.89 0.26 6.78 2.16 0.0 1.22 0.0 0.53 0.55 3.47 3.26 0.49 0.27 0.98 1.1 1.61 1.85
0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.39 0.16 0.0 1.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.13 0.0 0.17 0.0 0.05 0.47 0.11 0.14 0.48 0.0 0.06 0.0 0.05 0.06 0.06 0.0 0.91 0.59 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.44 0.08 0.13 0.23 0.25 0.31 0.05 0.15
0.25 0.36 0.42 1.05 1.72 0.25 0.43 0.12 1.13 0.55 0.63 0.55 1.35 1.47 0.67 1.03 0.2 3.73 1.57 0.05 0.23 0.0 0.63 0.61 0.0 1.44 1.35 1.45 0.4 0.47 0.27 0.4
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.12 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.45 0.22 0.0 0.3 0.0 0.65 0.0 0.36 0.0 0.11
0.02 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.02 0.02 0.08 0.04 0.28 0.09 0.1 0.12 0.09 0.16 0.08 0.01 0.07 0.06 0.02 0.07 2.31 0.35 0.0 0.06 0.17 0.03 0.03 0.0 0.19 0.06 0.06 0.14 0.08 0.1 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 0.55 0.68 0.32 0.33 0.38 0.78 0.93 0.71 0.59 0.96 0.77 0.46 0.22 0.92 0.63 0.53 12.45 0.52 0.0 0.26 0.0 0.38 1.09 0.31 0.81 0.57 1.15 0.6 0.4 0.7 0.47
0.06 0.0 0.09 0.04 0.0 0.12 0.1 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.1 0.0 0.19 0.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.17 0.22 0.23 0.24 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.06 0.07 0.21 0.07 0.11 0.14 0.21 0.3 0.31 0.31 0.16 0.08 0.31 0.04 0.07 0.34 0.93 2.37 0.0 0.0 0.0 0.17 0.13 0.43 0.44 0.33 0.42 0.13 0.25 0.58 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.83 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.17 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
41.51 39.03 35.99 37.78 39.45 33.69 31.5 35.79 36.72 38.22 38.11 40.28 29.35 25.78 30.21 25.95 26.35 44.31 29.39 2.26 9.02 6.05 29.54 29.06 29.02 46.01 45.27 47.65 28.93 28.38 15.18 17.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)