Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.35 0.38 0.46 0.52 0.56 0.5 0.64 0.75 0.8 0.74 0.61 0.51 0.76 0.62 0.69 0.61 0.34 0.36 0.56 0.82 0.5 0.28 0.46 0.6 0.68 1.0 0.36 0.35 0.39 0.42 0.33 0.39
0.52 0.41 0.34 0.55 0.47 0.42 0.62 0.71 0.72 1.0 0.83 0.64 0.26 0.85 0.36 0.25 0.18 0.4 0.32 0.09 0.54 0.06 0.25 0.25 0.81 0.94 0.58 0.66 0.22 0.21 0.23 0.22
0.52 0.56 0.43 0.61 0.74 0.62 0.53 0.64 0.6 0.73 0.62 0.6 0.42 0.55 1.0 0.49 0.38 0.16 0.46 0.25 0.36 0.71 0.48 0.51 0.89 0.65 0.65 0.58 0.32 0.33 0.31 0.29
0.33 0.34 0.42 0.52 0.41 0.37 0.46 0.71 0.78 0.96 0.69 0.66 0.43 0.46 0.18 0.5 0.15 0.14 0.51 0.73 0.48 0.21 0.23 0.33 0.42 1.0 0.29 0.23 0.28 0.25 0.5 0.41
0.51 0.45 0.37 0.46 0.46 0.47 0.55 0.64 0.68 0.72 0.61 0.67 1.0 0.89 0.97 0.96 0.34 0.31 0.6 0.26 0.53 0.43 0.57 0.73 0.88 0.88 0.31 0.26 0.44 0.47 0.42 0.44
0.39 0.41 0.35 0.39 0.41 0.4 0.38 0.39 0.47 0.4 0.41 0.41 0.81 1.0 0.69 0.87 0.29 0.27 0.46 0.29 0.31 0.21 0.38 0.42 0.66 0.51 0.34 0.37 0.3 0.31 0.27 0.21
0.47 0.49 0.5 0.57 0.58 0.54 0.56 0.68 0.62 0.59 0.57 0.52 0.8 0.81 0.85 0.85 0.3 0.25 0.43 0.28 0.11 0.2 0.43 0.52 0.41 1.0 0.73 0.7 0.35 0.36 0.28 0.31
0.42 0.36 0.41 0.38 0.48 0.48 0.4 0.39 0.45 0.46 0.49 0.42 0.83 1.0 0.48 0.89 0.34 0.44 0.53 0.32 0.51 0.46 0.41 0.54 0.42 0.82 0.43 0.54 0.4 0.47 0.36 0.28
0.56 0.44 0.46 0.47 0.47 0.58 0.58 0.59 0.67 0.58 0.65 0.67 0.37 0.41 0.61 0.56 0.32 0.1 0.52 0.25 0.32 0.15 0.31 0.4 0.77 1.0 0.82 0.61 0.38 0.46 0.27 0.24
0.49 0.48 0.5 0.54 0.53 0.5 0.61 0.68 0.7 0.75 0.74 0.67 0.89 0.88 1.0 0.82 0.35 0.27 0.57 0.26 0.33 0.44 0.48 0.58 0.66 0.92 0.49 0.44 0.42 0.41 0.68 0.6
0.44 0.35 0.29 0.29 0.25 0.26 0.27 0.31 0.38 0.47 0.47 0.54 1.0 0.81 0.49 0.85 0.27 0.23 0.45 0.18 0.41 0.24 0.49 0.54 0.5 0.28 0.11 0.08 0.37 0.36 0.32 0.4
0.47 0.52 0.59 0.6 0.59 0.58 0.66 0.74 0.63 0.65 0.66 0.52 0.87 0.86 0.92 0.75 0.36 0.22 0.41 0.61 0.34 0.45 0.42 0.48 0.59 1.0 0.77 0.75 0.36 0.36 0.43 0.42
0.5 0.41 0.44 0.43 0.44 0.43 0.42 0.57 0.78 0.88 0.86 0.79 0.64 0.43 0.6 0.58 0.23 0.2 0.44 0.69 1.0 0.37 0.39 0.48 0.76 0.82 0.25 0.22 0.42 0.39 0.43 0.5
0.48 0.44 0.4 0.39 0.42 0.32 0.35 0.42 0.53 0.61 0.7 0.61 0.47 0.45 0.31 0.55 0.3 0.25 0.45 1.0 0.85 0.53 0.38 0.42 0.98 0.7 0.32 0.27 0.35 0.35 0.43 0.5
0.43 0.39 0.39 0.46 0.5 0.45 0.49 0.66 0.65 0.7 0.65 0.61 0.52 0.55 0.68 0.58 0.31 0.26 0.51 0.79 0.88 0.44 0.44 0.49 0.67 1.0 0.52 0.47 0.38 0.4 0.39 0.35
0.26 0.27 0.33 0.4 0.44 0.45 0.53 0.56 0.45 0.43 0.32 0.29 0.35 0.44 1.0 0.36 0.29 0.29 0.45 0.3 0.49 0.39 0.32 0.34 0.84 0.38 0.28 0.32 0.33 0.31 0.3 0.21
0.48 0.38 0.51 0.57 0.55 0.42 0.49 0.64 0.75 0.86 0.74 0.64 0.97 0.56 0.53 0.59 0.16 0.08 0.26 0.19 0.33 0.18 0.13 0.13 0.95 1.0 0.52 0.5 0.25 0.2 0.2 0.24
0.37 0.3 0.33 0.38 0.43 0.4 0.47 0.55 0.55 0.53 0.53 0.47 0.5 0.67 1.0 0.47 0.3 0.24 0.35 0.23 0.22 0.34 0.38 0.47 0.48 0.63 0.47 0.41 0.29 0.31 0.43 0.51
0.48 0.44 0.41 0.41 0.42 0.34 0.38 0.42 0.48 0.45 0.45 0.42 1.0 0.87 0.65 0.96 0.38 0.27 0.45 0.04 0.41 0.27 0.45 0.55 0.75 0.47 0.4 0.43 0.37 0.39 0.33 0.21
0.58 0.34 0.38 0.49 0.6 0.51 0.47 0.6 0.54 0.57 0.56 0.62 0.41 0.43 0.62 0.46 0.27 0.05 0.47 0.3 0.2 0.33 0.32 0.35 1.0 0.96 0.84 0.56 0.28 0.32 0.4 0.48
0.49 0.42 0.43 0.5 0.5 0.52 0.52 0.65 0.66 0.74 0.63 0.67 0.7 0.86 0.86 0.62 0.32 0.25 0.57 0.5 0.57 0.6 0.47 0.58 0.48 1.0 0.39 0.34 0.35 0.37 0.39 0.44
0.45 0.45 0.35 0.37 0.38 0.37 0.38 0.44 0.43 0.49 0.48 0.51 1.0 0.77 0.56 0.75 0.38 0.3 0.71 0.23 0.52 0.04 0.57 0.65 0.58 0.46 0.27 0.25 0.53 0.57 0.3 0.31
0.36 0.27 0.29 0.31 0.34 0.3 0.34 0.52 0.52 0.54 0.52 0.44 0.52 0.6 0.51 0.49 0.16 0.13 0.3 0.31 0.4 0.13 0.26 0.32 0.76 1.0 0.53 0.46 0.22 0.22 0.28 0.36
0.36 0.36 0.2 0.3 0.17 0.51 0.29 0.3 0.21 0.5 0.44 0.18 0.0 0.38 0.44 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 1.0 0.77 0.27 0.0 0.02 0.0 0.0
0.42 0.4 0.44 0.41 0.39 0.43 0.44 0.46 0.46 0.48 0.51 0.43 0.93 0.87 0.33 1.0 0.28 0.3 0.57 0.09 0.41 0.31 0.37 0.43 0.99 0.49 0.42 0.41 0.36 0.37 0.45 0.35
0.42 0.45 0.35 0.35 0.33 0.34 0.37 0.38 0.4 0.4 0.52 0.44 0.31 0.33 0.24 0.29 0.14 0.04 0.25 0.45 1.0 0.1 0.18 0.19 0.79 0.89 0.9 0.86 0.18 0.2 0.2 0.18
0.22 0.3 0.26 0.32 0.23 0.33 0.35 0.35 0.33 0.38 0.33 0.29 0.24 0.15 0.34 0.19 0.12 0.05 0.25 0.63 0.52 0.25 0.19 0.2 0.51 1.0 0.69 0.64 0.16 0.2 0.11 0.12
0.39 0.24 0.2 0.28 0.33 0.23 0.28 0.35 0.46 0.47 0.47 0.44 0.09 0.27 0.09 0.17 0.25 0.27 0.35 0.49 0.77 0.2 0.29 0.28 0.65 1.0 0.38 0.43 0.29 0.3 0.21 0.22
0.46 0.42 0.31 0.35 0.23 0.41 0.43 0.5 0.48 0.53 0.48 0.43 0.05 0.38 0.46 0.1 0.15 0.02 0.12 0.03 0.35 0.1 0.07 0.05 0.71 1.0 0.73 0.53 0.11 0.11 0.04 0.05
0.29 0.32 0.54 0.54 0.75 0.49 0.82 0.85 0.96 0.94 0.73 0.69 0.05 0.15 0.01 0.1 0.19 0.39 0.15 0.78 0.72 0.02 0.1 0.07 0.15 1.0 0.29 0.28 0.28 0.24 0.22 0.14
0.59 0.71 0.64 0.71 0.68 0.68 0.62 0.77 0.68 0.77 0.74 0.64 0.41 0.51 0.77 0.41 0.25 0.11 0.4 0.37 0.43 0.51 0.42 0.51 1.0 0.68 0.83 0.7 0.26 0.33 0.4 0.38
0.58 0.73 0.68 0.73 0.8 0.69 0.65 0.67 0.75 0.72 0.72 0.63 0.81 0.82 0.86 0.85 0.43 0.14 0.58 0.38 0.38 0.47 0.48 0.56 0.55 0.95 0.93 1.0 0.43 0.44 0.4 0.43
0.43 0.37 0.41 0.42 0.49 0.48 0.59 0.74 0.72 0.77 0.73 0.61 0.62 0.42 0.61 0.63 0.31 0.27 0.55 0.38 0.55 0.23 0.4 0.49 0.68 1.0 0.38 0.4 0.43 0.45 0.52 0.5
0.21 0.11 0.09 0.08 0.06 0.07 0.1 0.2 0.26 0.38 0.61 0.52 0.15 0.09 0.09 0.27 0.16 0.34 0.42 0.19 0.43 0.0 0.2 0.13 0.45 1.0 0.1 0.08 0.29 0.35 0.3 0.39
0.35 0.31 0.28 0.31 0.33 0.37 0.38 0.5 0.54 0.49 0.49 0.4 0.44 0.24 0.14 0.46 0.25 0.21 0.4 0.68 0.82 0.38 0.33 0.38 1.0 0.57 0.41 0.48 0.39 0.34 0.4 0.43
0.15 0.19 0.31 0.39 0.14 0.21 0.67 0.55 0.56 0.71 0.61 0.5 0.4 0.26 0.43 0.14 0.11 0.05 0.04 0.1 0.1 0.83 0.07 0.26 0.12 1.0 0.08 0.13 0.04 0.05 0.06 0.03
0.43 0.44 0.45 0.43 0.42 0.39 0.49 0.53 0.58 0.68 0.64 0.61 0.54 0.43 0.43 0.45 0.24 0.26 0.46 0.32 0.35 0.05 0.34 0.4 0.86 1.0 0.65 0.52 0.31 0.31 0.48 0.57
0.36 0.36 0.35 0.4 0.51 0.54 0.55 0.61 0.58 0.64 0.54 0.45 0.44 0.45 1.0 0.45 0.21 0.2 0.52 0.26 0.43 0.49 0.3 0.39 0.87 0.55 0.43 0.4 0.29 0.31 0.25 0.29
0.52 0.5 0.57 0.56 0.53 0.56 0.58 0.8 0.74 0.73 0.77 0.63 0.71 0.9 1.0 0.76 0.33 0.3 0.5 0.46 0.37 0.68 0.51 0.6 0.36 0.96 0.62 0.58 0.37 0.4 0.4 0.45
0.2 0.18 0.17 0.23 0.24 0.2 0.22 0.23 0.23 0.25 0.24 0.22 0.25 1.0 0.52 0.76 0.12 0.08 0.17 0.22 0.18 0.08 0.16 0.15 0.75 0.34 0.16 0.19 0.16 0.17 0.05 0.05
0.48 0.39 0.38 0.39 0.41 0.37 0.39 0.43 0.51 0.56 0.53 0.5 0.89 1.0 0.67 0.83 0.28 0.26 0.59 0.25 0.38 0.37 0.43 0.52 0.6 0.81 0.35 0.37 0.32 0.33 0.35 0.38
0.19 0.25 0.11 0.19 0.13 0.17 0.24 0.23 0.31 0.46 0.41 0.36 0.14 0.36 0.17 0.25 0.04 0.3 0.12 0.0 0.41 0.0 0.07 0.12 1.0 0.8 0.19 0.36 0.12 0.12 0.1 0.06
0.27 0.14 0.14 0.24 0.09 0.2 0.23 0.16 0.28 0.36 0.41 0.29 0.0 0.18 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.61 0.0 0.05 0.04 1.0 0.9 0.21 0.0 0.1 0.03 0.13 0.03
0.58 0.61 0.57 0.56 0.52 0.5 0.47 0.58 0.66 0.7 0.69 0.57 1.0 0.87 0.76 1.0 0.38 0.43 0.55 0.31 0.33 0.06 0.69 0.7 0.66 0.59 0.27 0.36 0.4 0.39 0.35 0.41
0.39 0.41 0.34 0.45 0.37 0.35 0.4 0.57 0.6 0.61 0.51 0.5 0.51 0.34 0.38 0.58 0.37 0.35 0.44 0.0 0.33 0.25 0.42 0.44 0.52 1.0 0.53 0.66 0.52 0.46 0.4 0.44
0.38 0.34 0.32 0.33 0.31 0.3 0.25 0.33 0.41 0.39 0.42 0.37 1.0 0.71 0.68 0.83 0.31 0.23 0.7 0.2 0.27 0.15 0.45 0.6 0.6 0.52 0.2 0.2 0.4 0.39 0.23 0.26
0.48 0.43 0.35 0.4 0.43 0.45 0.34 0.46 0.49 0.6 0.49 0.51 0.59 0.48 0.49 0.62 0.37 0.3 0.41 0.03 0.34 0.26 0.37 0.43 0.93 1.0 0.5 0.6 0.42 0.43 0.42 0.42
0.44 0.41 0.31 0.37 0.31 0.41 0.29 0.42 0.39 0.45 0.36 0.42 0.25 0.37 0.34 0.31 0.22 0.09 0.33 0.44 0.75 0.38 0.26 0.22 1.0 0.92 0.75 0.69 0.21 0.2 0.2 0.15
0.41 0.4 0.4 0.41 0.37 0.38 0.42 0.58 0.52 0.64 0.56 0.59 0.41 0.57 0.62 0.34 0.13 0.07 0.2 0.06 0.26 0.6 0.27 0.3 0.84 1.0 0.41 0.38 0.28 0.25 0.21 0.19
0.41 0.31 0.48 0.49 0.49 0.49 0.73 0.89 0.93 1.0 0.85 0.77 0.56 0.21 0.21 0.24 0.27 0.26 0.24 0.68 0.37 0.14 0.38 0.39 0.42 0.96 0.48 0.48 0.4 0.38 0.59 0.73
0.55 0.5 0.43 0.53 0.51 0.56 0.47 0.6 0.6 0.64 0.55 0.56 0.74 0.73 1.0 0.95 0.39 0.27 0.7 0.12 0.23 0.35 0.5 0.57 0.44 0.89 0.51 0.38 0.39 0.4 0.54 0.47
0.54 0.49 0.55 0.56 0.53 0.51 0.61 0.73 0.7 0.84 0.81 0.75 0.38 0.51 0.52 0.48 0.36 0.31 0.41 1.0 0.91 0.33 0.45 0.44 0.68 0.65 0.4 0.41 0.41 0.4 0.44 0.42
0.71 0.62 0.63 0.58 0.55 0.59 0.62 0.7 0.77 0.83 0.83 0.76 0.88 1.0 0.96 0.87 0.4 0.39 0.72 0.47 0.41 0.23 0.54 0.61 0.72 0.75 0.5 0.47 0.41 0.44 0.6 0.67
0.42 0.45 0.41 0.52 0.52 0.54 0.48 0.55 0.64 0.6 0.59 0.56 0.71 0.56 0.87 0.82 0.27 0.23 0.34 0.29 0.21 0.33 0.44 0.5 0.83 1.0 0.61 0.57 0.34 0.34 0.58 0.57
0.34 0.33 0.36 0.36 0.38 0.32 0.38 0.44 0.59 0.62 0.66 0.61 0.6 0.26 0.18 0.5 0.3 0.29 0.45 0.47 0.77 0.33 0.45 0.52 0.74 1.0 0.36 0.37 0.42 0.38 0.39 0.44
0.5 0.48 0.44 0.54 0.6 0.54 0.62 0.67 0.67 0.77 0.72 0.71 0.4 0.58 1.0 0.45 0.33 0.24 0.42 0.24 0.45 0.43 0.35 0.38 0.54 0.68 0.43 0.42 0.37 0.38 0.3 0.33
0.51 0.49 0.58 0.63 0.63 0.6 0.67 0.78 0.84 0.89 0.81 0.79 0.64 0.78 0.95 0.56 0.34 0.29 0.53 0.51 0.28 0.87 0.38 0.46 0.99 1.0 0.66 0.57 0.38 0.38 0.44 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)