1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.09 0.11 0.12 0.12 0.13 0.11 0.07 0.09 0.06 0.09 0.09 0.07 1.0 0.24 0.06 0.52 0.01 0.01 0.09 0.0 0.01 0.0 0.04 0.06 0.11 0.23 0.21 0.21 0.03 0.04 0.03 0.03
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.73 0.03 0.01 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.01 0.8 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.74 0.14 0.19 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.92 0.13 0.19 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0
0.09 0.09 0.08 0.1 0.09 0.09 0.06 0.06 0.07 0.07 0.08 0.07 0.87 0.26 0.05 1.0 0.04 0.01 0.12 0.0 0.01 0.0 0.06 0.13 0.04 0.14 0.15 0.25 0.04 0.06 0.02 0.03
0.06 0.03 0.13 0.13 0.09 0.07 0.09 0.06 0.05 0.07 0.06 0.06 1.0 0.25 0.31 0.64 0.16 0.08 0.15 0.03 0.08 0.15 0.11 0.17 0.01 0.12 0.08 0.09 0.11 0.11 0.06 0.06
0.17 0.14 0.07 0.09 0.13 0.14 0.12 0.16 0.15 0.13 0.18 0.16 1.0 0.2 0.07 0.76 0.03 0.02 0.05 0.11 0.0 0.15 0.09 0.13 0.08 0.32 0.21 0.19 0.05 0.06 0.06 0.08
0.1 0.13 0.08 0.09 0.12 0.13 0.06 0.09 0.07 0.18 0.09 0.07 1.0 0.31 0.03 0.81 0.12 0.09 0.29 0.0 0.03 0.0 0.33 0.21 0.08 0.07 0.11 0.13 0.1 0.14 0.03 0.07
0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.18 0.02 0.75 0.06 0.05 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.12 0.03 0.03
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.06 0.31 0.74 0.02 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.27 0.02 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01
0.11 0.16 0.14 0.15 0.18 0.13 0.13 0.14 0.13 0.11 0.1 0.09 1.0 0.22 0.02 0.59 0.21 0.33 0.43 0.01 0.14 0.01 0.31 0.3 0.15 0.16 0.16 0.19 0.16 0.18 0.11 0.15
0.07 0.04 0.05 0.07 0.06 0.07 0.06 0.08 0.07 0.08 0.04 0.05 1.0 0.28 0.11 0.58 0.08 0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.07 0.04 0.02 0.06 0.08 0.07 0.07 0.07 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 1.0 0.06 0.1 0.17 0.03 0.11 0.01 0.09 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.12 0.11
0.15 0.15 0.15 0.17 0.17 0.17 0.16 0.16 0.18 0.18 0.2 0.15 1.0 0.18 0.22 0.39 0.14 0.07 0.14 0.06 0.02 0.04 0.07 0.04 0.06 0.18 0.16 0.2 0.09 0.12 0.05 0.05
0.12 0.15 0.2 0.23 0.23 0.2 0.2 0.21 0.2 0.22 0.19 0.14 0.96 0.37 0.07 1.0 0.13 0.07 0.24 0.03 0.04 0.02 0.31 0.42 0.06 0.22 0.19 0.21 0.16 0.16 0.08 0.07
0.08 0.09 0.12 0.13 0.14 0.14 0.15 0.18 0.17 0.18 0.16 0.12 1.0 0.27 0.06 0.41 0.04 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.19 0.17 0.01 0.08 0.06 0.08 0.06 0.08 0.02 0.03
0.06 0.05 0.06 0.07 0.09 0.08 0.08 0.09 0.08 0.07 0.07 0.05 1.0 0.2 0.04 0.42 0.05 0.04 0.12 0.05 0.04 0.01 0.19 0.43 0.07 0.18 0.07 0.09 0.06 0.1 0.03 0.02
0.12 0.08 0.06 0.07 0.08 0.1 0.03 0.09 0.08 0.08 0.1 0.07 0.78 0.16 0.02 1.0 0.02 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.07 0.2 0.31 0.27 0.05 0.05 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.01 1.0 0.15 0.09 0.9 0.0 0.0 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.05 0.01 0.0 0.03 0.03 0.0 0.01
0.12 0.09 0.1 0.11 0.2 0.17 0.21 0.24 0.2 0.2 0.14 0.15 1.0 0.09 0.18 0.84 0.05 0.05 0.1 0.0 0.01 0.02 0.05 0.05 0.02 0.12 0.16 0.15 0.08 0.08 0.09 0.1
0.07 0.08 0.08 0.07 0.08 0.09 0.06 0.05 0.07 0.09 0.06 0.06 1.0 0.26 0.01 0.71 0.09 0.08 0.14 0.06 0.09 0.01 0.35 0.23 0.06 0.02 0.02 0.04 0.13 0.12 0.07 0.07
0.04 0.05 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 1.0 0.28 0.01 0.77 0.01 0.01 0.19 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.05 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02
0.08 0.05 0.1 0.07 0.03 0.13 0.06 0.12 0.1 0.12 0.12 0.08 1.0 0.05 0.04 0.7 0.06 0.14 0.07 0.01 0.03 0.04 0.19 0.34 0.05 0.03 0.08 0.05 0.09 0.1 0.13 0.11
0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.22 0.43 0.02 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.0 0.03 0.08 0.0 0.02 0.08 0.11 0.18
0.03 0.03 0.04 0.01 0.16 0.03 0.01 0.09 0.01 0.0 0.03 0.03 1.0 0.11 0.12 0.41 0.03 0.08 0.37 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.02 0.03
0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.13 0.02 0.88 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.03 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0
0.03 0.06 0.08 0.07 0.07 0.07 0.1 0.09 0.1 0.1 0.08 0.05 1.0 0.37 0.01 0.47 0.04 0.04 0.04 0.01 0.03 0.0 0.25 0.24 0.03 0.02 0.03 0.03 0.06 0.06 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.37 0.16 0.11 0.25 0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.01 0.08 0.12 0.03 0.14 0.11 0.11 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.01 0.0 1.0 0.01 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.11 0.22 0.13 0.08 0.04 0.05 0.03 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.15 0.0 0.94 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.12 0.12 0.08 0.18 0.17 0.12 0.14 0.14 0.17 0.14 0.1 0.15 1.0 0.31 0.29 0.77 0.2 0.37 0.41 0.0 0.0 0.0 0.25 0.27 0.14 0.19 0.2 0.32 0.14 0.23 0.07 0.13
0.06 0.07 0.07 0.07 0.08 0.06 0.06 0.06 0.07 0.07 0.07 0.06 1.0 0.3 0.04 0.58 0.2 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.01 0.1 0.07 0.07 0.15 0.16 0.14 0.21
0.07 0.02 0.02 0.05 0.04 0.06 0.04 0.06 0.04 0.09 0.06 0.05 1.0 0.08 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01
0.15 0.17 0.11 0.17 0.19 0.16 0.15 0.17 0.13 0.09 0.16 0.1 1.0 0.21 0.43 0.72 0.16 0.1 0.2 0.04 0.01 0.17 0.2 0.19 0.1 0.07 0.12 0.15 0.14 0.1 0.1 0.09
0.05 0.04 0.05 0.03 0.04 0.01 0.03 0.04 0.01 0.06 0.02 0.03 1.0 0.04 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.38 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03
0.1 0.16 0.15 0.17 0.16 0.18 0.15 0.15 0.14 0.16 0.14 0.11 1.0 0.23 0.07 0.61 0.15 0.13 0.09 0.02 0.11 0.07 0.19 0.2 0.17 0.19 0.3 0.31 0.16 0.16 0.08 0.07
0.16 0.14 0.14 0.1 0.14 0.11 0.07 0.09 0.09 0.11 0.11 0.08 0.99 0.23 0.01 1.0 0.02 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.36 0.67 0.0 0.04 0.04 0.06 0.09 0.11 0.05 0.07
0.1 0.1 0.11 0.11 0.12 0.11 0.1 0.12 0.1 0.14 0.12 0.12 1.0 0.11 0.0 0.7 0.11 0.09 0.17 0.0 0.09 0.0 0.31 0.09 0.07 0.07 0.05 0.07 0.13 0.13 0.09 0.14
0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 1.0 0.23 0.24 0.72 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01
0.04 0.07 0.08 0.06 0.1 0.07 0.09 0.06 0.05 0.04 0.04 0.04 1.0 0.29 0.14 0.68 0.07 0.17 0.09 0.0 0.01 0.0 0.18 0.25 0.01 0.04 0.06 0.03 0.06 0.06 0.04 0.06
0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.03 0.03 1.0 0.22 0.1 0.65 0.01 0.02 0.09 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02
0.08 0.05 0.04 0.04 0.03 0.04 0.04 0.05 0.05 0.09 0.08 0.07 0.69 0.23 0.22 1.0 0.02 0.01 0.1 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.21 0.04 0.06 0.03 0.04 0.01 0.01
0.06 0.05 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05 0.05 0.86 0.22 0.04 1.0 0.05 0.03 0.16 0.07 0.03 0.0 0.15 0.23 0.18 0.13 0.04 0.05 0.08 0.11 0.04 0.04
0.08 0.11 0.15 0.14 0.18 0.17 0.17 0.13 0.11 0.11 0.11 0.07 1.0 0.36 0.19 0.73 0.08 0.13 0.07 0.24 0.13 0.12 0.06 0.07 0.08 0.1 0.17 0.19 0.06 0.08 0.05 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.34 0.06 0.04 0.32 0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 0.22 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05 0.11 0.08
0.17 0.14 0.17 0.15 0.15 0.13 0.11 0.18 0.19 0.26 0.24 0.18 1.0 0.21 0.12 0.66 0.04 0.05 0.37 0.08 0.05 0.1 0.28 0.49 0.1 0.27 0.09 0.1 0.06 0.09 0.07 0.06
0.12 0.13 0.15 0.15 0.16 0.14 0.12 0.16 0.19 0.2 0.2 0.15 1.0 0.27 0.1 0.49 0.06 0.05 0.14 0.07 0.01 0.0 0.26 0.32 0.15 0.11 0.11 0.08 0.1 0.1 0.11 0.12
0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.14 0.0 0.77 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.15 0.02 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01
0.14 0.2 0.19 0.18 0.21 0.19 0.17 0.17 0.21 0.18 0.21 0.17 0.97 0.43 0.12 1.0 0.17 0.09 0.26 0.06 0.04 0.01 0.26 0.34 0.13 0.17 0.1 0.13 0.15 0.16 0.12 0.1
0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.05 0.03 0.02 1.0 0.12 0.0 0.96 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.15 0.02 0.01 0.02 0.02 0.05 0.01
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 1.0 0.02 0.05 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)