Heatmap: Cluster_148 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100512	-0.05	-0.1	-0.35	-0.11	-0.07	-0.08	-0.15	-0.14	-0.17	-0.22	-0.22	-0.28	0.09	0.4	1.46	0.4	-0.1	-0.65	0.27	-0.73	-0.57	1.06	-0.11	0.0	-0.21	-0.31	-0.27	-0.38	-0.08	-0.1	-0.28	-0.38
Smo103994	-0.65	-0.52	-0.41	-0.29	-0.16	-0.05	0.06	-0.01	-0.31	-0.6	-0.64	-0.81	-0.38	0.16	1.91	-0.35	-0.52	-0.48	-0.28	0.79	0.24	1.0	-0.79	-0.54	0.78	0.09	0.49	0.22	-0.81	-0.81	-0.74	-0.78
Smo105942	-1.06	-0.81	-0.49	-0.28	-0.16	0.32	0.19	0.28	-0.14	-0.64	-0.69	-0.89	0.12	-0.68	1.77	0.17	-0.75	-1.2	0.08	0.93	-0.65	1.28	-0.81	-0.58	0.94	0.02	0.65	0.29	-0.73	-0.59	-1.69	-1.45
Smo113356	-1.09	-1.13	-0.79	-0.67	-0.41	0.1	0.09	-0.18	-0.34	-0.69	-0.65	-1.04	-0.22	-0.92	2.11	-0.09	-0.23	-0.06	0.45	1.16	-0.11	1.17	-0.49	-0.1	0.32	-0.58	-0.06	-0.28	-0.24	-0.24	-0.7	-0.58
Smo119017	-0.7	-0.6	-0.58	-0.28	-0.37	0.18	-0.24	-0.03	-0.45	-0.74	-0.61	-0.72	-0.19	1.29	2.26	-0.32	-0.61	-0.48	-0.63	0.92	-0.73	1.46	-0.45	-0.37	-1.03	-0.94	-0.08	-0.25	-1.08	-0.53	-0.93	-0.46
Smo135283	-0.23	0.04	0.16	0.3	0.29	0.35	0.27	0.13	0.18	0.02	-0.12	-0.5	-0.59	0.57	1.47	0.34	-0.1	-1.19	-0.09	-0.14	-1.66	0.29	-0.21	0.08	-0.18	-0.64	0.01	0.21	-0.45	-0.38	-0.69	-0.95
Smo139554	-0.2	-0.05	0.11	0.08	0.12	0.52	0.07	-0.11	-0.41	-0.5	-0.52	-0.77	0.01	0.72	1.82	0.02	-0.5	-0.56	-0.16	0.78	-0.01	0.96	-0.42	-0.25	-0.6	-1.01	-0.24	-0.16	-0.82	-0.64	-1.13	-0.98
Smo145395	-0.34	-0.37	-0.1	-0.12	-0.03	-0.02	0.03	-0.26	-0.24	-0.53	-0.32	-0.6	0.31	0.38	1.79	0.29	-0.35	-0.84	-0.05	0.16	-0.03	1.37	-0.32	0.06	0.5	-1.01	-0.62	-0.6	-0.58	-0.31	-1.15	-0.87
Smo146841	-1.02	-0.52	-0.34	-0.23	-0.12	0.22	0.3	0.07	-0.37	-0.53	-0.9	-1.04	-0.58	-1.06	2.12	-0.11	-0.77	-1.45	-0.08	1.02	-1.4	1.2	-1.0	-0.57	0.47	0.57	0.87	0.86	-0.99	-0.74	-1.82	-2.15
Smo148446	-0.37	-0.25	-0.15	-0.11	0.12	0.16	0.18	0.24	0.05	-0.08	-0.14	-0.29	0.07	0.14	1.72	0.07	-0.46	-0.53	-0.19	0.36	-0.47	1.02	-0.56	-0.18	-0.96	-0.05	-0.08	-0.38	-0.65	-0.64	-0.46	-0.44
Smo154794	-0.45	-0.29	-0.27	-0.05	-0.01	-0.15	-0.01	0.02	-0.1	-0.2	-0.24	-0.25	-0.08	0.83	1.64	0.04	-0.43	-0.61	-0.25	0.74	0.06	0.32	-0.6	-0.33	0.11	-0.08	-0.0	-0.04	-0.47	-0.37	-0.62	-0.76
Smo157263	-0.34	-0.02	0.03	0.21	0.32	0.47	0.35	0.1	-0.16	-0.51	-0.57	-0.7	-0.55	0.0	1.75	-0.3	-0.44	-0.47	-0.2	0.97	-0.55	0.9	-0.63	-0.47	-0.8	-0.46	0.52	0.22	-0.82	-0.86	-0.84	-0.91
Smo157954	-0.12	-0.08	-0.06	-0.05	-0.03	-0.03	-0.18	0.13	0.07	0.05	0.02	-0.15	0.21	0.64	0.62	0.4	-0.5	-0.77	0.03	0.62	-0.43	0.7	-0.01	0.05	0.32	-0.05	-0.78	-0.47	-0.4	-0.33	-0.54	-0.52
Smo160008	-0.53	-0.36	-0.29	-0.09	-0.03	0.09	0.08	0.06	-0.29	-0.5	-0.57	-0.67	-0.24	0.36	2.03	-0.11	-0.42	-1.0	-0.1	1.2	-0.42	0.3	-0.44	-0.31	0.47	-0.45	0.1	-0.05	-0.6	-0.62	-0.67	-0.81
Smo164004	-0.24	-0.11	-0.23	0.19	0.22	0.44	0.08	0.05	-0.32	-0.58	-0.71	-0.77	-0.11	0.3	1.72	0.1	-0.12	-0.45	0.01	1.0	-0.49	-0.17	-0.12	-0.13	0.12	-0.82	0.15	-0.0	-0.44	-0.53	-0.76	-0.84
Smo170422	-0.3	-0.07	0.03	-0.03	0.03	0.18	0.21	0.17	0.14	0.01	0.04	-0.2	0.13	0.9	1.13	0.31	-0.3	-0.35	-0.48	-0.48	0.03	0.33	-0.02	-0.03	0.01	-0.7	-0.44	-0.1	-0.39	-0.21	-0.78	-0.65
Smo171093	-0.36	-0.31	-0.08	-0.08	0.08	0.17	0.02	-0.07	-0.23	-0.49	-0.48	-0.57	-0.36	0.24	1.97	-0.17	-0.46	-0.9	-0.04	1.04	-0.7	0.37	-0.71	-0.53	0.47	-0.19	0.25	0.41	-0.6	-0.51	-0.95	-1.04
Smo171605	-0.12	-0.09	-0.1	-0.09	0.08	-0.05	-0.13	-0.16	-0.15	-0.19	-0.1	-0.24	-0.21	0.75	1.31	0.1	-0.42	0.1	0.03	0.92	0.05	0.54	-0.31	-0.35	-1.19	-0.54	-0.14	-0.43	-0.33	-0.56	-0.25	-0.17
Smo177107	-0.28	-0.12	-0.0	0.02	-0.19	0.11	0.07	0.05	-0.4	-0.25	-0.35	-0.45	0.05	-0.33	0.7	0.3	-0.35	-1.49	0.23	-0.71	0.12	2.12	-0.45	-0.5	0.42	-0.27	-0.09	0.14	-0.36	-0.32	-1.49	-1.11
Smo182543	-0.56	-0.12	-0.05	0.1	0.28	0.46	0.26	0.09	-0.15	-0.34	-0.53	-0.61	0.21	0.27	1.66	0.26	-0.27	-0.67	-0.26	0.17	-0.4	0.74	-0.41	-0.14	0.51	-0.92	-0.05	0.28	-0.54	-0.36	-1.44	-1.81
Smo227897	-0.31	-0.26	-0.24	-0.1	-0.23	-0.11	-0.07	-0.01	-0.18	-0.15	-0.26	-0.23	0.14	1.13	1.4	0.2	-0.44	-0.53	-0.11	0.33	0.19	0.74	-0.41	-0.23	0.09	-0.26	-0.28	-0.38	-0.62	-0.47	-0.45	-0.51
Smo229708	-1.72	-1.79	-1.23	-0.51	0.19	0.49	0.31	0.16	-0.11	-0.29	-0.56	-1.03	-0.37	1.01	1.49	-0.46	-0.27	0.34	-0.7	1.13	0.08	1.54	-0.22	-0.54	-1.66	-1.26	0.04	-0.14	-0.43	-0.28	-0.64	-0.26
Smo231600	-0.43	-0.2	-0.13	0.04	-0.02	0.24	0.07	-0.14	-0.26	-0.3	-0.41	-0.64	-0.44	1.37	1.96	-0.04	-0.36	-0.91	-0.48	0.63	-0.22	0.6	-0.57	-0.63	0.73	-1.48	-0.13	-0.25	-0.89	-0.74	-1.16	-1.07
Smo235312	-0.76	-0.74	-0.62	-0.31	-0.1	0.06	0.17	0.02	0.03	-0.24	-0.37	-0.58	0.26	0.76	1.83	-0.14	-0.72	-0.6	-0.47	0.99	-0.36	0.94	-0.45	-0.03	1.32	-1.27	-0.6	-0.71	-0.92	-0.82	-1.06	-1.19
Smo269009	-0.66	-0.39	-0.28	-0.22	-0.04	0.17	0.13	-0.1	-0.42	-0.67	-0.71	-0.96	-0.3	0.13	1.85	-0.18	-0.25	-0.5	-0.19	1.09	0.43	1.1	-0.6	-0.36	0.22	-0.56	0.27	0.17	-0.69	-0.69	-0.9	-1.1
Smo269010	-0.36	-0.41	-0.23	-0.23	-0.09	-0.11	-0.36	-0.05	-0.11	0.07	0.04	-0.27	0.68	0.8	0.75	0.49	-0.55	-0.76	-0.4	0.8	-0.27	0.83	0.17	0.31	-0.62	0.14	-0.17	-0.03	-0.63	-0.6	-0.8	-0.61
Smo271069	-0.65	-0.41	-0.64	-0.42	-0.13	-0.05	-0.02	-0.07	-0.08	0.09	-0.05	-0.27	0.54	0.68	1.09	0.29	-0.8	-0.66	-0.01	0.73	0.43	0.6	-0.6	-0.3	0.15	-0.26	-0.22	-0.28	-0.9	-0.88	0.22	0.18
Smo271906	-0.61	-0.55	-0.43	-0.24	-0.18	0.01	-0.02	-0.09	-0.3	-0.67	-0.7	-0.73	-0.3	0.45	2.4	-0.13	-0.56	-2.93	-0.26	1.63	-0.68	0.81	-0.82	-0.61	0.62	-0.9	-0.32	-0.45	-0.89	-0.81	-0.73	-0.82
Smo271907	-0.34	-0.16	-0.19	0.03	0.16	0.27	0.15	0.1	-0.19	-0.56	-0.43	-0.63	-0.47	0.13	1.93	-0.18	-0.3	-1.12	-0.06	1.26	-0.31	0.16	-0.42	-0.15	0.75	-0.76	-0.22	-0.52	-0.63	-0.68	-0.67	-0.87
Smo402189	-0.23	-0.37	-0.35	-0.17	0.12	0.08	0.02	0.08	-0.18	-0.18	-0.43	-0.54	-0.01	0.31	1.54	0.04	-0.63	-0.62	-0.2	0.32	-0.6	0.69	-0.64	-0.45	0.38	0.35	0.65	0.35	-0.84	-0.62	-0.51	-0.41
Smo402529	-0.54	-0.54	-0.67	-0.38	-0.3	-0.25	-0.27	-0.19	-0.11	-0.17	-0.32	-0.37	0.25	1.31	1.7	0.27	-0.69	-0.81	0.15	0.03	0.37	1.45	-0.31	-0.1	0.07	-0.82	-0.99	-1.25	-0.51	-0.44	-0.61	-0.69
Smo405730	-0.28	-0.44	-0.22	-0.24	0.24	0.22	0.12	0.08	-0.01	-0.07	-0.07	-0.43	0.39	0.32	1.42	0.24	-0.78	-0.78	-0.05	-0.16	0.25	0.47	-0.19	0.23	-0.38	0.24	-0.13	-0.07	-0.55	-0.51	-0.75	-0.41
Smo407242	-0.3	-0.5	-0.44	-0.47	-1.18	-0.43	-0.17	-0.38	-0.31	-0.23	-0.17	-0.76	0.42	1.42	2.16	0.93	-0.48	-0.21	0.21	-1.24	-0.47	1.65	-1.46	-1.29	-1.85	0.59	-1.23	-0.96	-0.95	-0.98	-0.81	-0.88
Smo409667	-1.31	-1.86	-1.42	-1.19	-1.1	-0.97	-0.86	-1.04	-1.07	-0.69	-1.03	-1.23	0.17	2.14	2.88	0.56	-1.99	-2.76	-2.1	1.97	-0.37	2.46	-3.59	-3.23	-4.36	-1.91	-3.13	-1.82	-3.0	-2.65	-4.21	-3.71
Smo413325	-1.96	-2.15	-1.93	-1.83	-2.33	-1.63	-1.84	-1.78	-1.75	-1.61	-1.5	-1.72	2.17	1.86	2.26	1.37	-2.41	-2.89	1.16	2.14	0.04	1.57	-3.7	-3.05	-0.33	-3.67	-3.42	-2.75	-1.88	-1.86	-2.7	-2.98
Smo413340	-0.93	-0.8	-1.4	-0.81	-0.44	-0.75	-0.86	-1.43	-1.37	0.29	-0.94	-1.31	0.62	2.05	2.63	1.03	-0.28	-0.94	-0.81	0.02	-4.01	0.96	0.11	-0.05	-3.25	-1.16	-0.23	-1.15	-0.35	-0.31	-1.24	-1.19
Smo416654	-0.34	-0.6	-0.31	-0.49	-0.03	-0.19	-0.89	-0.04	-0.16	-1.38	-0.59	-1.14	-1.29	0.55	2.66	-1.1	-1.64	-2.16	-1.15	1.16	0.61	1.21	-2.12	-2.08	-0.41	0.39	1.35	0.67	-2.05	-2.49	-2.6	-1.84
Smo419389	-0.05	-0.08	-0.37	-0.04	-0.16	-0.14	-0.08	-0.06	0.06	-0.04	-0.17	-0.01	0.12	0.82	1.24	0.23	-0.73	-1.45	-0.07	0.5	0.11	1.1	-0.6	-0.41	0.75	-0.24	-0.36	-0.51	-0.55	-0.49	-1.25	-0.87
Smo419858	-0.38	-0.53	-0.4	-0.38	-0.53	-0.04	0.04	0.15	-0.19	-0.17	-0.08	-0.46	-0.7	0.84	2.2	-0.71	-0.69	-2.69	-0.74	0.59	-0.26	1.77	-1.18	-1.32	-2.18	-0.07	0.4	0.06	-0.63	-0.78	-0.55	-0.44
Smo421604	0.06	-0.53	0.05	-0.01	-0.33	0.08	-0.22	-0.04	-0.2	-0.27	-0.0	-0.31	-1.36	-0.03	1.85	-0.73	-0.49	-1.87	0.4	-0.01	0.69	0.67	-1.22	-1.64	0.25	-0.4	0.88	0.48	-0.55	-0.81	-0.45	0.08
Smo424460	-1.33	-1.08	-1.23	-0.81	-0.77	-1.22	-1.06	-1.36	-0.82	-0.74	-1.15	-1.11	1.56	2.1	2.51	0.92	-1.57	-2.26	-1.91	1.4	1.09	0.82	-1.85	-1.63	-1.53	-1.19	-0.48	-1.43	-2.1	-1.65	-1.08	-0.95
Smo425478	-1.22	-1.81	-0.87	-0.67	-0.72	-0.78	-0.62	-2.39	-1.97	-2.39	-2.37	-1.56	1.6	1.9	2.09	0.44	-0.55	-1.43	1.16	0.38	0.05	0.08	-0.86	-0.97	-0.1	-1.72	1.01	0.96	-1.8	-0.52	-1.53	-1.19
Smo428242	-0.51	-0.42	-0.55	-0.3	-0.13	-0.0	-0.21	-0.41	-0.49	-0.53	-0.93	-0.67	-0.1	-0.67	1.84	0.15	-0.19	-0.19	0.36	0.39	-0.35	0.62	-0.24	0.0	-0.19	-0.42	0.39	0.07	-0.36	-0.26	0.11	0.6
Smo437414	-0.06	-0.31	-0.5	-0.52	-0.5	-0.64	-0.78	-0.29	-0.12	0.23	0.26	0.49	0.24	0.65	0.71	0.69	-0.94	-0.26	-0.01	0.8	-0.26	0.16	-0.45	-0.35	0.24	0.24	0.0	-0.49	-0.09	-0.16	-0.04	-0.09
Smo440387	-0.12	-0.36	-0.38	-0.12	0.07	-0.1	0.05	0.11	0.04	-0.01	-0.02	-0.08	0.51	0.9	1.51	0.15	-0.92	-0.61	-0.25	-0.65	-0.22	0.9	-0.67	-0.34	-1.19	0.37	0.17	-0.24	-0.62	-0.8	-0.51	-0.18
Smo446561	-0.0	0.08	0.15	0.21	0.18	0.32	0.2	0.08	0.31	-0.01	-0.08	-0.02	-0.16	1.08	1.41	-0.07	-0.75	-2.06	-0.29	0.16	0.13	-0.13	-0.14	-0.04	-0.37	-0.1	-0.12	-0.21	-0.78	-0.51	-1.2	-1.19
Smo73518	-0.36	-0.67	-0.42	-0.39	-0.14	-0.19	-0.14	-0.0	-0.15	-0.16	-0.17	-0.42	-0.24	-0.17	0.91	0.01	-0.61	-0.83	0.12	-0.74	-0.3	1.62	-0.51	-0.29	0.48	0.5	0.34	0.16	-0.28	-0.11	-0.05	0.17
Smo73953	-0.29	-0.06	-0.23	-0.13	-0.11	-0.2	-0.06	-0.17	0.04	-0.03	-0.05	-0.13	0.41	0.99	1.22	0.49	-0.51	-0.54	-0.04	0.64	-0.2	0.51	-0.22	0.01	0.55	-0.35	-0.97	-1.03	-0.64	-0.46	-0.78	-0.71
Smo74372	-0.08	-0.08	-0.11	-0.19	-0.33	-0.24	-0.04	-0.02	0.04	0.09	0.0	-0.02	0.16	0.61	0.86	0.28	-0.58	-0.78	0.09	0.6	0.03	0.76	-0.23	0.02	-0.35	-0.12	-0.22	-0.51	-0.43	-0.38	-0.24	-0.11
Smo79311	-0.4	-0.29	-0.54	-0.1	-0.17	0.12	-0.12	0.05	-0.02	-0.01	-0.26	-0.17	0.02	0.67	1.31	0.03	-0.49	-1.04	-0.01	-0.73	-0.29	1.33	-0.32	-0.13	0.32	-0.24	0.11	-0.18	-0.57	-0.65	-0.29	0.04
Smo79314	-0.2	-0.09	-0.13	0.11	-0.09	0.18	-0.18	-0.47	-0.34	-0.37	-0.57	-0.67	0.54	0.78	1.36	0.71	-0.23	-0.73	0.35	-1.73	-0.69	0.68	0.18	0.31	0.69	-0.6	-0.31	-0.11	-0.39	-0.32	-0.85	-0.96
Smo79764	-0.16	-0.41	-0.17	-0.22	-0.1	0.01	-0.09	0.09	0.12	0.06	-0.05	-0.2	-0.0	0.29	1.55	0.02	-0.33	-0.61	0.14	0.56	-0.73	0.31	-0.47	-0.16	-0.65	0.61	-0.09	-0.1	-0.36	-0.26	-0.57	-0.48
Smo80845	-0.25	-0.64	-0.78	-0.32	-0.3	-0.21	-0.31	-0.61	-0.09	-0.27	-0.49	-0.49	0.05	0.46	1.17	0.26	-0.41	-0.18	-0.2	-0.08	0.51	1.33	-0.01	0.11	0.41	-0.69	0.31	0.06	-0.42	-0.26	-0.33	-0.19
Smo84870	-0.53	-0.75	-0.74	-0.62	-0.77	-0.73	-0.84	-1.06	-0.95	-0.69	-1.09	-1.03	0.84	1.77	1.94	0.25	-0.23	-0.06	0.19	0.58	0.34	1.09	-0.3	-0.17	0.05	-1.42	-1.22	-1.54	-0.53	-0.39	-0.43	-0.03
Smo86023	-0.24	-0.49	-0.7	-0.33	-0.31	-0.05	-0.21	-0.16	-0.01	-0.24	-0.32	-0.43	0.51	0.94	1.45	0.57	-0.34	-0.22	0.1	-0.14	-0.04	0.63	0.19	0.47	-0.61	-0.48	-0.54	-0.81	-0.29	-0.22	-0.37	-0.33
Smo89106	-0.16	-0.23	-0.3	0.01	0.01	-0.0	0.05	0.0	0.12	-0.01	0.03	-0.07	-0.21	0.9	1.29	-0.33	-0.06	-0.73	-0.5	0.94	-0.81	1.25	-0.37	-0.5	-0.13	-0.75	-0.51	-0.54	-0.45	-0.37	-0.6	-0.56
Smo94273	-0.35	-0.13	-0.23	0.03	-0.06	-0.01	-0.0	-0.2	-0.27	-0.45	-0.39	-0.44	-0.04	1.1	1.53	-0.01	-0.48	-0.92	-0.08	0.41	-0.27	1.18	-0.56	-0.3	-0.02	-0.23	0.15	0.01	-0.74	-0.59	-0.76	-0.73
Smo98666	-0.51	0.14	-0.22	-0.12	0.09	0.24	0.02	-0.83	-0.57	-0.38	-0.56	-0.48	1.11	0.5	1.79	0.72	-0.37	-0.58	0.22	-1.45	-3.78	-0.96	0.67	0.93	0.81	-0.84	-0.41	-0.8	-0.52	-0.33	-1.35	-1.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.