Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.76 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.59 0.55 0.6 0.73 0.8 0.74 0.84 0.92 0.84 0.9 0.8 0.74 0.84 0.6 0.84 0.72 0.43 0.36 0.7 0.28 0.58 1.0 0.62 0.73 0.7 0.83 0.53 0.51 0.53 0.51 0.34 0.34
0.51 0.59 0.44 0.38 0.44 0.52 0.46 0.47 0.6 0.57 0.46 0.52 0.53 0.28 0.35 0.81 0.3 0.26 0.49 0.01 0.0 1.0 0.61 0.69 0.01 0.34 0.33 0.22 0.44 0.45 0.47 0.4
0.22 0.26 0.18 0.23 0.15 0.22 0.2 0.21 0.2 0.21 0.22 0.23 0.5 1.0 0.29 0.74 0.11 0.19 0.1 0.0 0.11 0.83 0.28 0.43 0.46 0.09 0.16 0.18 0.13 0.16 0.21 0.25
0.45 0.41 0.25 0.48 0.64 0.46 0.42 0.41 0.46 0.45 0.61 0.43 0.86 0.61 0.87 0.94 0.61 0.53 0.93 0.76 0.49 1.0 0.41 0.46 0.74 0.6 0.62 0.48 0.72 0.59 0.53 0.55
0.37 0.48 0.36 0.57 0.45 0.61 0.49 0.43 0.4 0.39 0.38 0.31 0.43 0.24 0.61 0.7 0.35 0.58 0.52 0.05 0.41 1.0 0.6 0.44 0.32 0.34 0.56 0.53 0.4 0.44 0.25 0.18
0.53 0.5 0.47 0.47 0.47 0.48 0.46 0.52 0.52 0.56 0.57 0.56 1.0 0.52 0.47 0.91 0.33 0.35 0.53 0.28 0.31 0.77 0.55 0.58 0.45 0.42 0.3 0.26 0.41 0.41 0.4 0.56
0.38 0.32 0.16 0.27 0.32 0.27 0.31 0.32 0.36 0.31 0.37 0.29 1.0 0.6 0.28 0.86 0.17 0.14 0.33 0.04 0.64 0.65 0.22 0.28 0.57 0.35 0.25 0.27 0.18 0.2 0.31 0.25
0.63 0.44 0.44 0.44 0.3 0.48 0.25 0.6 0.47 0.58 0.35 0.62 0.27 0.52 0.69 0.32 0.33 1.0 0.45 0.02 0.87 0.47 0.22 0.31 0.48 0.61 0.61 0.83 0.35 0.4 0.21 0.12
0.07 0.11 0.23 0.28 0.4 0.21 0.1 0.16 0.1 0.08 0.07 0.05 0.77 0.26 0.04 0.34 0.01 0.02 0.25 0.03 0.04 0.02 0.11 0.35 0.46 1.0 0.11 0.07 0.02 0.03 0.03 0.03
0.13 0.0 0.05 0.01 0.0 0.06 0.15 0.08 0.0 0.09 0.15 0.18 0.48 1.0 0.07 0.81 0.0 0.02 0.04 0.0 0.3 0.55 0.0 0.0 0.14 0.21 0.05 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02
0.35 0.52 0.41 0.44 0.52 0.66 0.59 0.47 0.7 0.6 0.64 0.33 0.67 0.56 0.98 0.75 0.5 0.47 0.85 0.0 0.11 1.0 0.46 0.49 0.2 0.5 0.61 0.58 0.62 0.62 0.19 0.25
0.3 0.27 0.26 0.3 0.42 0.35 0.35 0.5 0.49 0.47 0.37 0.32 1.0 0.21 0.41 0.46 0.25 0.2 0.49 0.2 0.34 0.11 0.37 0.51 0.55 0.92 0.42 0.42 0.3 0.35 0.25 0.23
0.23 0.15 0.21 0.21 0.1 0.26 0.29 0.37 0.4 0.27 0.31 0.24 1.0 0.06 0.06 0.25 0.07 0.09 0.38 0.0 0.16 0.0 0.16 0.22 0.58 0.8 0.16 0.24 0.06 0.09 0.08 0.07
0.68 0.76 0.76 0.77 0.72 0.69 0.67 0.68 0.61 0.79 0.73 0.65 0.52 0.56 0.94 0.61 0.56 0.76 0.94 0.09 0.88 0.75 0.65 0.58 0.78 1.0 0.79 0.88 0.54 0.55 0.42 0.44
0.46 0.48 0.51 0.52 0.55 0.59 0.78 0.71 0.64 0.73 0.67 0.55 0.68 0.6 1.0 0.91 0.42 0.31 0.63 0.24 0.61 0.75 0.55 0.61 0.25 0.39 0.38 0.42 0.4 0.41 0.47 0.32
0.2 0.33 0.62 0.4 0.17 0.33 0.49 0.19 0.19 0.19 0.28 0.19 0.01 0.05 0.36 0.06 0.45 0.85 0.9 0.01 0.0 1.0 0.16 0.1 0.03 0.18 0.31 0.33 0.28 0.2 0.18 0.17
0.12 0.19 0.23 0.18 0.21 0.17 0.26 0.3 0.19 0.33 0.4 0.21 0.3 0.31 1.0 0.54 0.14 0.48 0.28 0.0 0.08 0.67 0.17 0.22 0.12 0.22 0.28 0.24 0.09 0.13 0.17 0.3
0.57 0.57 0.67 0.63 0.65 0.59 0.71 0.87 0.85 1.0 0.86 0.76 0.73 0.42 0.39 0.6 0.31 0.23 0.35 0.62 0.33 0.21 0.45 0.46 0.23 0.99 0.44 0.43 0.36 0.36 0.35 0.33
0.37 0.37 0.44 0.48 0.45 0.51 0.63 0.57 0.4 0.56 0.43 0.49 0.71 0.42 0.83 0.55 0.2 0.89 0.78 0.01 0.0 1.0 0.46 0.6 0.4 0.61 0.49 0.48 0.33 0.33 0.2 0.22
0.43 0.31 0.33 0.32 0.35 0.52 0.48 0.62 0.57 0.58 0.53 0.44 0.54 0.29 1.0 0.62 0.35 0.36 0.5 0.3 0.65 0.96 0.39 0.44 0.26 0.66 0.77 0.63 0.44 0.38 0.51 0.56
0.6 0.6 0.61 0.69 0.7 0.69 0.71 0.75 0.8 0.77 0.76 0.65 0.94 0.73 0.75 1.0 0.35 0.2 0.49 0.52 0.58 0.68 0.56 0.67 0.72 0.82 0.59 0.63 0.35 0.44 0.31 0.28
0.15 0.14 0.13 0.21 0.16 0.18 0.17 0.19 0.19 0.19 0.2 0.21 1.0 0.68 0.16 0.61 0.12 0.06 0.1 0.03 0.09 0.47 0.09 0.11 0.12 0.22 0.2 0.23 0.11 0.12 0.1 0.09
0.21 0.17 0.24 0.19 0.16 0.17 0.2 0.22 0.19 0.2 0.24 0.21 1.0 0.39 0.23 0.58 0.05 0.04 0.23 0.01 0.01 0.35 0.12 0.21 0.49 0.66 0.3 0.29 0.08 0.09 0.05 0.09
0.75 0.65 0.66 0.7 0.62 0.69 0.68 0.89 0.99 0.97 1.0 0.85 0.89 0.52 0.43 0.49 0.26 0.17 0.37 0.4 0.36 0.84 0.42 0.57 0.21 0.7 0.36 0.4 0.36 0.38 0.31 0.35
0.42 0.37 0.32 0.39 0.48 0.39 0.38 0.44 0.38 0.46 0.44 0.43 1.0 0.96 0.47 0.53 0.24 0.11 0.35 0.1 0.65 0.48 0.28 0.29 0.49 0.4 0.36 0.29 0.24 0.27 0.3 0.39
0.24 0.48 0.33 0.35 0.16 0.44 0.41 0.21 0.33 0.56 0.45 0.31 1.0 0.62 1.0 0.79 0.49 0.7 0.95 0.05 0.34 0.79 0.68 0.69 0.28 0.62 0.36 0.18 0.57 0.73 0.66 0.8
0.28 0.24 0.33 0.26 0.31 0.35 0.28 0.28 0.34 0.37 0.4 0.29 1.0 0.66 0.55 0.47 0.32 0.27 0.11 0.32 0.43 0.89 0.35 0.31 0.15 0.16 0.21 0.31 0.19 0.21 0.12 0.21
0.21 0.29 0.11 0.24 0.17 0.16 0.13 0.14 0.12 0.3 0.43 0.13 1.0 0.24 0.79 0.8 0.16 0.02 0.57 0.11 0.4 0.94 0.26 0.38 0.74 0.62 0.51 0.6 0.19 0.22 0.06 0.14
0.43 0.49 0.54 0.56 0.56 0.56 0.66 0.66 0.79 0.84 0.82 0.67 0.93 0.75 1.0 1.0 0.43 0.3 0.52 0.4 0.27 0.77 0.64 0.73 0.74 0.6 0.3 0.38 0.47 0.58 0.31 0.3
0.1 0.17 0.07 0.15 0.13 0.18 0.19 0.29 0.18 0.45 0.37 0.1 1.0 0.2 0.45 0.25 0.14 0.1 0.29 0.06 0.0 0.87 0.16 0.11 0.41 0.37 0.12 0.0 0.11 0.17 0.03 0.07
0.07 0.21 0.12 0.15 0.2 0.1 0.17 0.08 0.17 0.09 0.14 0.1 1.0 0.48 0.23 0.52 0.13 0.13 0.23 0.05 0.0 0.88 0.3 0.45 0.05 0.25 0.14 0.23 0.12 0.13 0.09 0.08
0.41 0.48 0.48 0.44 0.45 0.47 0.45 0.59 0.47 0.5 0.51 0.39 1.0 0.5 0.23 0.77 0.38 0.33 0.53 0.23 0.33 0.14 0.35 0.4 0.94 0.73 0.69 0.56 0.41 0.4 0.39 0.48
0.38 0.25 0.41 0.43 0.22 0.4 0.31 0.38 0.58 0.47 0.38 0.48 0.87 0.82 1.0 0.91 0.11 0.15 0.27 0.02 0.17 0.93 0.15 0.17 0.11 0.6 0.37 0.45 0.12 0.11 0.06 0.08
0.61 0.67 0.66 0.66 0.79 0.79 0.58 0.66 0.71 0.66 0.74 0.7 1.0 0.88 0.68 0.9 0.45 0.41 0.76 0.62 0.77 0.95 0.73 0.82 0.62 0.43 0.38 0.4 0.53 0.51 0.33 0.41
0.52 0.46 0.48 0.49 0.37 0.64 0.41 0.31 0.52 0.51 0.47 0.45 0.37 0.25 0.75 0.44 0.43 0.29 0.55 0.02 0.17 1.0 0.46 0.4 0.24 0.33 0.32 0.47 0.29 0.33 0.37 0.46
0.27 0.32 0.28 0.27 0.36 0.27 0.34 0.36 0.48 0.52 0.5 0.49 0.21 0.25 0.41 0.23 0.13 0.03 0.49 0.03 0.16 0.68 0.16 0.23 0.23 1.0 0.29 0.2 0.15 0.17 0.17 0.17
0.08 0.08 0.05 0.11 0.02 0.11 0.15 0.11 0.08 0.04 0.05 0.15 1.0 0.09 0.0 0.46 0.12 0.28 0.42 0.0 0.16 0.0 0.14 0.11 0.18 0.68 0.2 0.19 0.12 0.09 0.01 0.05
0.82 0.86 0.73 0.68 0.67 0.6 0.77 0.71 0.77 0.83 0.64 1.0 0.65 0.75 0.83 0.86 0.38 0.38 0.68 0.08 0.14 0.86 0.65 0.77 0.21 0.62 0.56 0.48 0.43 0.52 0.76 0.84
0.45 0.49 0.55 0.39 0.44 0.39 0.34 0.31 0.32 0.39 0.43 0.39 0.29 0.12 0.44 0.36 0.42 0.31 0.8 0.35 0.12 1.0 0.19 0.14 0.01 0.23 0.3 0.39 0.25 0.32 0.24 0.21
0.5 0.45 0.4 0.53 0.56 0.49 0.49 0.62 0.6 0.54 0.51 0.53 1.0 0.12 0.25 0.45 0.35 0.03 0.5 0.32 0.35 0.27 0.37 0.4 0.61 0.6 0.51 0.54 0.35 0.38 0.41 0.42
0.39 0.12 0.12 0.1 0.14 0.05 0.07 0.13 0.12 0.26 0.38 0.44 1.0 0.3 0.1 0.36 0.01 0.0 0.29 0.03 0.14 0.55 0.03 0.1 0.55 0.93 0.12 0.05 0.06 0.07 0.13 0.09
0.4 0.54 0.47 0.47 0.45 0.35 0.43 0.25 0.34 0.4 0.41 0.29 0.56 0.55 0.35 0.74 0.38 0.25 0.34 0.08 0.02 0.5 1.0 0.71 0.03 0.09 0.17 0.21 0.4 0.47 0.29 0.25
0.11 0.16 0.09 0.16 0.16 0.16 0.13 0.15 0.17 0.19 0.11 0.14 0.99 0.37 0.43 0.72 0.13 0.05 0.27 0.04 0.24 1.0 0.2 0.26 0.15 0.19 0.08 0.15 0.12 0.12 0.06 0.08
0.4 0.39 0.4 0.33 0.42 0.4 0.31 0.36 0.39 0.37 0.36 0.4 1.0 0.76 0.38 0.95 0.11 0.08 0.22 0.13 0.48 0.81 0.2 0.23 0.31 0.63 0.31 0.26 0.12 0.15 0.08 0.09
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.0 0.03 1.0 0.37 0.01 0.74 0.02 0.05 0.09 0.01 0.0 0.47 0.02 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0
0.18 0.23 0.2 0.2 0.19 0.28 0.29 0.14 0.29 0.19 0.23 0.2 0.51 0.56 0.08 0.45 0.22 0.39 0.06 0.0 0.0 0.62 1.0 0.72 0.07 0.08 0.06 0.05 0.19 0.24 0.25 0.23
0.68 0.41 0.44 0.58 0.57 0.41 0.6 0.91 0.9 0.91 1.0 0.9 0.6 0.28 0.32 0.38 0.09 0.05 0.17 0.34 0.15 0.18 0.19 0.25 0.23 0.94 0.24 0.22 0.15 0.15 0.16 0.17
0.47 0.29 0.37 0.48 0.44 0.39 0.49 0.81 0.73 0.76 0.8 0.63 0.84 0.33 0.38 0.49 0.11 0.03 0.24 0.37 0.18 0.57 0.22 0.32 0.29 1.0 0.23 0.19 0.18 0.16 0.2 0.22
0.71 0.54 0.49 0.52 0.69 0.62 0.55 0.61 0.7 0.74 0.66 0.52 0.75 0.61 0.8 0.92 0.31 0.28 0.95 0.42 0.58 0.76 0.43 0.48 0.72 1.0 0.93 0.66 0.48 0.52 0.45 0.52
0.73 0.61 0.7 0.61 0.38 0.67 0.62 0.96 0.95 0.82 1.0 0.87 0.48 0.65 0.48 0.46 0.27 0.06 0.47 0.05 0.21 0.88 0.38 0.45 0.32 0.47 0.54 0.43 0.4 0.41 0.9 0.73
0.06 0.1 0.23 0.35 0.38 0.32 0.36 0.56 0.36 0.31 0.21 0.13 0.48 0.08 0.01 0.5 0.07 0.06 0.29 0.06 0.3 0.01 0.28 0.35 0.17 1.0 0.31 0.25 0.2 0.18 0.21 0.28
0.5 0.35 0.39 0.4 0.5 0.4 0.33 0.47 0.52 0.6 0.75 0.57 1.0 0.57 0.6 0.58 0.17 0.07 0.36 0.15 0.19 0.61 0.2 0.31 0.35 0.66 0.36 0.38 0.2 0.21 0.35 0.44
0.21 0.14 0.13 0.18 0.2 0.17 0.2 0.29 0.25 0.3 0.25 0.21 0.71 0.14 0.7 0.89 0.15 0.18 1.0 0.27 0.46 0.83 0.18 0.25 0.15 0.13 0.07 0.11 0.25 0.26 0.29 0.38
0.73 0.7 0.67 0.91 0.78 1.0 0.72 0.85 0.84 0.81 0.76 0.8 0.78 0.79 0.9 0.85 0.38 0.32 0.58 0.59 0.44 0.87 0.62 0.64 0.84 0.9 0.71 0.78 0.46 0.44 0.34 0.35
0.48 0.48 0.37 0.47 0.49 0.52 0.43 0.46 0.47 0.45 0.44 0.45 0.47 0.42 0.57 0.56 0.34 0.33 0.53 0.21 0.27 1.0 0.46 0.44 0.43 0.38 0.39 0.38 0.34 0.41 0.4 0.35
0.5 0.49 0.49 0.48 0.49 0.48 0.49 0.58 0.59 0.71 0.68 0.61 0.64 0.86 0.55 0.58 0.37 0.55 0.45 0.28 0.58 0.84 0.5 0.55 0.26 1.0 0.57 0.6 0.38 0.34 0.39 0.39
0.42 0.36 0.28 0.43 0.39 0.38 0.45 0.38 0.47 0.56 0.74 0.5 1.0 0.46 0.7 0.35 0.11 0.07 0.26 0.18 0.08 0.52 0.15 0.28 0.42 0.86 0.47 0.26 0.11 0.18 0.25 0.28
0.17 0.14 0.28 0.23 0.23 0.26 0.2 0.25 0.2 0.15 0.21 0.18 0.74 0.21 0.32 0.81 0.28 0.15 0.39 0.32 0.19 1.0 0.32 0.38 0.29 0.27 0.44 0.32 0.28 0.31 0.17 0.18
0.13 0.19 0.24 0.32 0.34 0.35 0.43 0.46 0.29 0.25 0.23 0.2 1.0 0.1 0.08 0.56 0.18 0.18 0.54 0.06 0.35 0.64 0.19 0.2 0.74 0.25 0.17 0.17 0.25 0.22 0.15 0.22
0.22 0.15 0.26 0.36 0.3 0.26 0.35 0.45 0.47 0.39 0.48 0.33 1.0 0.4 0.26 0.61 0.15 0.16 0.3 0.06 0.37 0.95 0.54 0.75 0.19 0.81 0.28 0.32 0.32 0.3 0.23 0.44
0.3 0.33 0.35 0.44 0.53 0.47 0.37 0.39 0.38 0.43 0.38 0.33 0.6 0.4 0.44 0.58 0.37 0.28 0.44 0.19 0.39 1.0 0.51 0.58 0.3 0.27 0.36 0.37 0.34 0.35 0.36 0.36
0.03 0.06 0.14 0.16 0.16 0.18 0.15 0.08 0.05 0.04 0.03 0.02 0.34 0.48 0.25 0.37 0.19 0.11 0.06 0.09 0.07 1.0 0.48 0.43 0.07 0.02 0.07 0.06 0.12 0.12 0.05 0.04
0.52 0.58 0.59 0.55 0.59 0.44 0.37 0.49 0.52 0.52 0.45 0.39 0.84 0.42 0.4 0.87 0.36 0.41 0.64 0.19 0.14 1.0 0.55 0.61 0.24 0.58 0.41 0.51 0.45 0.49 0.46 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)