Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.42 -0.12 -0.09 -0.25 -0.36 -0.47 0.49 0.62 0.91 1.06 1.15 1.09 0.24 -0.9 -2.09 0.43 -1.29 -0.65 -0.06 -9.49 - - -0.13 0.07 -4.89 1.38 0.1 0.1 -0.15 -0.29 -0.63 -0.34
-0.12 -0.01 -0.02 0.13 0.31 0.13 0.18 0.57 0.47 0.5 0.18 0.22 0.55 -0.06 0.29 0.71 -0.82 -0.78 0.44 -3.28 -2.39 -2.99 -0.21 0.06 -0.57 0.78 0.21 0.09 -0.13 -0.13 -0.66 -0.38
-0.19 -0.42 -0.25 -0.22 -0.19 -0.28 0.14 0.62 0.72 0.84 0.96 0.72 0.18 0.43 0.19 0.09 -0.69 -0.67 -0.24 -2.28 -2.0 -1.08 -0.31 0.02 -1.42 0.87 -0.32 -0.38 -0.27 -0.21 0.11 0.3
-0.29 -0.18 -0.01 0.16 0.0 -0.12 0.33 1.07 0.65 0.83 0.49 0.27 -0.1 0.08 0.36 0.22 -0.63 -1.43 0.02 -3.39 -5.4 -3.62 -0.43 -0.32 -1.49 1.61 0.33 0.32 -0.28 -0.35 -0.73 -0.71
-0.08 -0.35 -0.33 -0.11 0.04 0.01 0.16 0.53 0.5 0.46 0.48 0.2 0.27 -0.82 0.05 0.41 -0.42 -0.79 0.22 -5.33 -2.16 -4.82 -0.03 0.25 -0.82 1.4 0.33 0.18 -0.03 -0.07 -0.04 0.04
-0.61 -1.54 -1.05 -0.88 -1.13 -1.46 0.13 0.7 0.82 1.02 0.98 0.68 0.3 -0.03 0.87 -0.38 -2.14 -2.4 -0.55 -4.84 -4.16 -3.39 -1.18 -1.32 -3.39 2.37 -0.09 -1.11 -0.66 -1.14 0.98 1.28
-0.03 -0.88 -0.65 -0.48 -0.41 -0.68 -0.16 0.67 0.91 1.29 1.17 0.98 1.9 -0.33 -1.12 0.7 -1.3 -1.7 0.13 -4.27 -3.59 -11.31 0.17 -0.3 -1.07 1.62 -2.11 -2.13 -0.86 -0.84 -0.7 -0.99
0.16 0.13 0.11 0.19 0.05 0.17 0.57 0.71 0.86 0.91 0.79 0.51 -0.22 0.7 -0.14 -0.07 -0.99 -1.15 -1.05 -2.21 -1.19 -2.55 -1.15 -1.2 -1.52 1.26 0.26 0.02 -0.64 -0.66 -0.07 -0.43
0.11 -0.12 -0.07 -0.21 0.05 -0.13 0.17 0.64 0.79 0.87 1.05 0.68 -0.02 -1.32 -1.67 0.03 -1.03 -0.77 -0.02 -2.23 -1.25 -1.27 -0.42 -0.12 -2.21 1.41 -0.16 -0.28 -0.13 -0.23 0.17 0.42
-0.43 -0.33 -0.05 -0.2 -0.15 -0.16 0.14 0.4 0.41 0.54 0.48 0.18 0.4 -0.68 -0.74 0.43 -0.28 -0.61 0.44 -2.22 -1.55 -3.77 -0.08 0.17 -0.73 1.32 -0.15 0.06 0.38 0.45 0.01 -0.05
-0.18 -0.0 -0.14 0.2 0.19 0.13 0.28 0.64 0.58 0.51 0.39 0.43 0.31 -0.17 -0.02 0.42 -0.42 -0.73 0.24 -1.39 -2.29 -2.02 -0.02 0.2 -1.49 1.04 0.0 -0.16 -0.11 -0.17 -0.28 -0.78
-0.37 -0.32 -0.11 -0.06 -0.27 -0.21 0.0 0.48 0.48 0.67 0.65 0.29 0.46 -0.18 0.23 0.38 -0.71 -0.57 0.06 -1.06 -0.45 -1.82 -0.0 0.33 -1.04 0.93 -0.34 -0.24 -0.18 -0.12 -0.12 0.15
-0.61 -0.43 -0.32 -0.36 -0.3 -0.33 -0.05 0.42 0.76 0.83 0.91 0.56 0.66 -0.32 -1.0 0.8 -1.43 -1.27 0.31 -4.02 -1.47 -2.9 -0.07 0.3 -1.38 1.03 0.44 0.49 -0.09 0.05 -0.31 -0.14
0.07 -0.08 0.15 0.39 0.63 -0.09 0.1 0.52 0.58 1.48 1.09 0.9 1.09 -0.38 -1.75 0.21 -1.51 -2.57 -0.31 - -2.39 -2.22 -0.65 -0.16 -5.14 1.64 -1.15 -1.29 -0.93 -0.85 -0.25 -0.35
-0.15 0.08 0.14 0.33 0.02 0.2 0.53 0.54 0.6 0.81 0.47 0.39 0.18 0.69 -1.26 0.84 -0.6 -1.91 0.18 - -1.05 - -0.73 -0.32 -1.16 1.47 -0.25 -0.06 -0.32 -0.36 -0.75 -0.79
-0.25 -0.51 -0.21 0.03 0.01 -0.4 0.15 0.88 0.88 1.08 0.98 0.56 0.29 -1.37 -1.77 0.44 -0.38 -2.06 -0.21 -6.27 - - 0.01 0.31 -4.34 1.31 -0.15 -0.09 0.3 0.22 -0.01 0.4
0.04 -0.34 -0.35 -0.15 -0.13 -0.06 0.19 0.5 0.66 0.68 0.57 0.4 0.38 0.97 0.65 0.08 -0.93 -0.99 0.04 -2.1 -2.29 -3.47 -0.18 0.06 -0.61 1.05 0.01 -0.04 -0.3 -0.16 -0.75 -0.59
-0.19 -0.25 -0.32 -0.17 -0.07 -0.25 -0.11 0.3 0.48 0.61 0.43 0.46 0.17 0.23 0.47 0.03 -0.9 -0.32 -0.06 -0.8 -0.37 -1.28 -0.37 -0.12 0.23 1.28 0.04 0.1 -0.5 -0.49 -0.46 -0.51
0.27 -0.34 -0.6 -0.24 -0.39 -0.5 -0.08 0.41 0.53 0.75 0.7 1.03 0.26 0.3 -0.53 0.24 -0.99 -1.31 -0.18 -2.08 -1.94 -3.82 -0.88 -0.78 -0.77 1.3 0.19 0.07 -0.29 -0.38 0.77 0.73
0.02 -0.13 -0.15 0.02 -0.02 -0.09 0.06 0.43 0.49 0.68 0.62 0.56 0.33 0.45 0.17 0.18 -0.57 -0.9 -0.25 -1.08 -1.31 -2.28 -0.36 -0.12 -0.25 1.16 -0.26 -0.2 -0.36 -0.4 -0.13 -0.14
-0.16 -0.23 -0.01 0.14 0.13 0.1 0.39 0.77 0.67 0.72 0.51 0.44 0.33 -0.86 -1.31 0.09 -0.42 -0.71 -0.32 -2.89 -1.92 -2.61 -0.23 -0.3 -1.02 1.14 -0.13 -0.16 -0.07 -0.02 0.43 0.57
-0.21 0.07 0.25 0.31 -0.04 -0.24 -0.15 0.34 0.62 0.88 0.77 0.62 0.24 -0.76 -0.44 0.04 -0.21 -0.86 -0.23 -1.64 -3.17 -5.82 -0.1 -0.2 -1.6 1.54 -0.57 -0.56 0.0 -0.01 0.03 0.48
-0.74 -0.89 -0.19 0.0 0.02 -0.15 0.62 0.93 0.88 0.99 0.75 0.34 0.67 -0.47 -1.53 0.03 -0.89 -1.65 -0.11 -4.43 -3.51 -9.13 -0.05 -0.09 -1.82 1.4 0.2 0.14 0.13 0.02 -0.23 0.25
-0.63 -1.03 -0.75 -0.53 -0.42 -0.44 -0.05 0.5 0.84 1.01 0.91 0.7 0.55 -0.22 0.73 0.31 -0.84 -1.14 -0.25 -1.38 -0.75 -1.7 -0.71 -0.3 -0.91 1.48 0.02 -0.02 -0.49 -0.48 -0.35 0.11
-0.08 -0.19 0.12 0.22 0.05 -0.0 -0.03 0.4 0.52 0.59 0.52 0.32 0.7 -0.02 -1.3 1.03 -0.78 -1.89 0.24 -1.63 -1.64 -2.3 -0.93 -0.35 -0.31 1.27 0.37 0.41 -0.46 -0.4 -0.5 -0.52
-0.4 -0.05 0.26 0.28 0.21 0.16 0.39 0.52 0.53 0.63 0.46 0.2 0.5 -0.28 -0.59 0.41 -0.42 -1.12 0.27 -3.21 -2.3 -1.84 0.03 0.15 -2.22 0.74 -0.36 -0.26 -0.07 0.01 0.28 0.4
0.12 0.12 0.0 -0.04 0.05 0.07 0.08 0.49 0.59 0.88 0.87 0.75 0.15 -0.17 -0.37 0.09 -0.89 -1.0 -0.08 -2.9 -0.96 -3.41 -0.36 -0.26 -1.78 1.28 -0.14 -0.19 -0.38 -0.34 0.1 0.22
-0.37 -0.12 -0.13 0.07 -0.01 -0.02 0.27 0.58 0.67 0.74 0.63 0.31 0.53 -0.27 -0.52 0.38 -0.57 -0.54 -0.28 -3.01 -1.83 -2.74 -0.22 -0.16 -0.58 1.3 0.4 0.29 -0.17 -0.22 -0.51 -0.41
-0.44 -0.99 -0.86 -0.46 -0.6 -0.55 -0.15 0.59 0.85 1.14 1.06 0.88 0.65 0.13 -1.76 0.81 -1.05 -0.82 -0.09 -3.38 -2.95 -6.04 -0.04 0.47 -1.56 1.24 -0.43 -0.46 -0.04 -0.07 0.13 0.39
-0.42 -0.9 -0.52 -0.39 -0.39 -0.2 -0.08 0.39 0.42 0.64 0.45 0.34 0.13 -0.98 -1.16 0.32 -0.56 -0.52 0.45 -0.88 -0.94 -0.45 0.1 0.47 -0.8 1.48 -0.16 -0.02 -0.0 -0.05 0.15 0.27
-0.26 -0.48 -0.37 -0.28 -0.31 -0.31 -0.21 0.48 0.48 0.6 0.58 0.39 0.45 0.09 -0.85 0.39 -0.98 -1.24 -0.25 -2.16 -1.75 -2.47 -0.03 0.29 -1.53 1.62 0.65 0.51 -0.27 -0.3 0.02 0.29
-0.39 -0.53 -0.47 -0.35 -0.18 -0.31 -0.0 0.49 0.53 0.59 0.49 0.42 0.64 0.01 0.74 0.5 -1.18 -1.59 -0.17 -2.04 -1.02 -2.48 -0.15 0.39 -0.45 1.5 0.28 0.16 -0.69 -0.57 -0.43 -0.16
-0.05 -0.49 -0.39 -0.4 -0.21 -0.35 0.07 0.39 0.53 0.68 0.65 0.47 -0.2 -0.17 -0.93 -0.4 -0.87 -0.43 -0.24 -1.11 -1.1 -1.39 -0.46 -0.31 -1.36 1.5 0.58 0.44 -0.04 -0.06 0.21 0.68
-0.44 -0.64 -0.5 -0.4 -0.4 -0.36 -0.08 0.64 0.65 0.79 0.71 0.51 0.43 0.29 -0.49 0.39 -1.15 -0.78 -0.01 -2.71 -1.64 -3.47 -0.27 0.05 -1.3 1.21 0.5 0.09 -0.22 -0.27 0.5 0.5
-0.55 -0.23 0.1 -0.12 -0.08 -0.22 0.29 0.65 0.78 0.73 0.77 0.25 -0.19 0.28 -1.01 -0.23 -0.7 -0.27 -0.77 -1.66 -1.11 -1.55 -0.2 -0.15 -1.86 1.25 0.56 0.5 -0.3 -0.32 -0.08 0.18
0.05 -0.46 -0.13 -0.09 -0.27 -0.4 0.03 0.64 0.66 0.81 0.74 0.62 0.81 -0.08 -1.99 0.35 -1.07 -1.34 0.05 -2.58 -1.88 -2.95 -0.37 -0.06 -0.73 1.63 -0.07 -0.38 -0.27 -0.41 0.05 0.25
-1.04 -1.57 -1.22 -0.22 0.04 0.21 0.59 1.47 0.94 1.72 0.88 0.08 -1.34 -2.9 -2.4 -1.65 -1.55 -3.15 -1.64 -10.71 -4.86 -6.72 -1.49 -1.31 -2.25 3.27 -0.22 0.05 -1.76 -1.91 -2.02 -2.39
-0.23 -0.06 0.19 0.15 -0.21 -0.16 0.09 0.65 0.49 0.79 0.44 0.24 0.15 -0.27 -0.51 0.37 -0.53 -0.75 -0.33 -1.58 -0.96 -2.48 0.28 0.42 -0.47 1.48 -0.2 -0.24 -0.2 -0.25 -0.53 -0.6
-0.23 -0.25 -0.15 -0.17 -0.12 -0.31 0.0 0.33 0.51 0.88 0.83 0.75 0.52 -0.18 0.0 0.52 -0.99 -1.31 0.06 -1.69 -0.36 -3.71 -0.26 0.09 -1.69 1.63 -0.45 -0.59 -0.34 -0.33 -0.28 -0.27
-0.2 -0.07 -0.72 -0.11 -0.44 0.05 0.59 0.84 0.84 0.98 0.7 0.68 0.11 0.0 -0.45 -0.26 -1.59 -2.6 -0.18 - -1.73 -4.56 -1.1 -1.07 0.06 0.84 0.63 -0.03 -0.57 -0.59 0.72 0.95
-0.01 0.11 0.08 0.05 -0.25 -0.26 0.22 0.64 0.84 1.08 0.99 0.91 0.07 -0.04 0.23 0.59 -1.36 -1.89 -0.19 -2.19 -2.13 -2.54 -0.15 -0.08 -2.29 0.93 -1.04 -0.95 -0.28 -0.13 0.1 0.09
0.12 0.03 0.14 0.06 0.25 0.01 -0.02 0.5 0.64 0.73 0.77 0.41 0.47 -0.16 -0.88 0.51 -1.09 -1.09 0.24 -2.81 -1.0 -4.26 -0.14 -0.0 -1.16 1.26 0.29 0.26 -0.37 -0.39 -0.9 -0.8
-0.17 0.22 0.23 0.26 0.07 0.15 0.33 0.5 0.26 0.43 0.27 -0.05 0.06 0.46 0.32 0.42 -0.57 -0.48 -0.08 -2.84 -1.17 -4.01 -0.48 -0.43 -2.64 1.45 0.07 0.07 -0.08 -0.04 -0.44 -0.13
-0.75 -0.36 0.23 0.24 0.07 -0.13 0.55 0.9 0.91 0.97 0.74 0.34 1.06 0.15 -1.08 0.35 -1.05 -1.64 -0.44 -6.74 -4.5 -9.37 -0.48 -0.77 -2.97 1.42 -0.09 -0.23 -0.22 -0.28 -0.09 0.21
-0.05 -0.23 -0.07 -0.04 -0.11 0.07 0.15 0.41 0.36 0.43 0.51 0.33 0.06 0.51 0.69 0.16 -0.72 -2.05 -0.02 -1.02 -1.46 -2.16 -0.35 -0.15 -0.37 1.28 0.38 0.38 -0.43 -0.37 -0.39 -0.6
0.08 0.02 -0.07 -0.06 -0.1 -0.13 0.09 0.58 0.35 0.65 0.44 0.38 0.03 -0.52 -0.95 0.17 -0.68 -1.07 -0.05 -4.98 -1.27 -1.83 -0.1 0.1 -1.84 1.52 0.44 0.47 -0.03 -0.11 0.1 0.11
-0.16 -0.48 -0.11 -0.21 0.01 -0.06 0.15 0.46 0.28 0.38 0.28 0.1 0.79 -0.33 0.07 0.5 -0.58 -0.67 0.32 -2.04 -1.92 -2.2 -0.02 0.17 -0.22 0.9 0.7 0.67 -0.15 -0.17 -0.84 -0.52
-0.58 -0.54 -0.22 -0.21 -0.27 -0.41 0.39 0.78 0.88 1.06 0.98 0.71 -0.12 -0.29 -1.55 -0.15 -1.32 -1.22 -0.01 -4.16 -2.21 -5.96 -0.9 -0.67 -1.95 1.81 -0.0 -0.37 -0.45 -0.45 0.67 0.94
-0.41 -0.21 -0.19 -0.01 0.07 -0.16 -0.03 0.4 0.26 0.27 0.44 0.12 0.75 -0.76 -0.49 0.76 -0.38 -0.87 0.18 -3.56 -2.96 -2.54 0.12 0.35 -0.25 1.42 0.49 0.59 -0.07 -0.06 -0.54 -0.96
0.9 -0.63 -0.64 -0.89 -0.64 -0.88 -0.62 0.31 0.5 1.13 0.91 1.07 1.33 0.33 -1.69 0.19 -0.75 -1.98 -0.04 - -2.53 -2.52 -0.78 -0.77 -2.29 1.47 -0.84 -0.73 -0.11 0.19 0.69 0.36
-0.46 -0.24 -0.18 -0.15 -0.31 -0.34 0.06 0.51 0.66 0.92 1.03 0.88 0.21 -0.08 -0.68 0.06 -0.47 -0.64 -0.32 -1.92 -1.3 -4.3 -0.18 -0.16 -0.22 1.12 -0.57 -0.68 -0.17 -0.3 0.34 0.58
-0.58 -0.44 -0.05 0.2 0.07 0.18 0.22 0.84 0.74 0.93 0.55 0.22 0.38 -0.71 -0.26 0.6 -0.45 -0.82 0.66 -7.56 -5.83 -5.57 -0.09 0.21 -4.7 1.09 0.18 0.11 0.17 0.34 -0.96 -0.8
-0.46 -0.18 0.52 0.52 0.56 0.28 0.06 0.42 0.42 0.53 0.29 -0.22 0.9 0.12 -0.76 0.07 0.11 -0.69 -0.12 -5.44 -3.89 -5.54 -0.18 -0.41 -1.77 1.03 0.27 0.3 -0.02 -0.16 -0.26 0.18
-0.15 -0.49 -0.2 0.1 -0.01 -0.19 0.08 0.65 0.82 0.87 0.7 0.46 0.62 0.84 -0.04 0.37 -1.09 -1.29 -0.48 -4.2 -1.98 -5.23 -0.23 -0.02 -0.83 1.52 0.13 0.07 -0.78 -0.73 -0.9 -0.58
-0.02 -0.4 -0.4 -0.51 -0.47 -0.36 -0.35 0.19 0.39 0.64 0.78 0.68 0.53 0.11 0.04 0.7 -1.02 -0.84 0.06 -1.24 -1.28 -0.46 -0.22 0.19 -1.04 1.28 -0.5 -0.66 -0.38 -0.34 0.1 0.55
0.22 -0.31 -0.49 -0.41 -0.51 -0.68 -0.23 0.31 0.49 0.71 0.71 0.85 0.13 0.24 -0.45 0.53 -1.36 -1.66 0.37 -4.8 -3.12 -6.46 -0.85 -0.3 -1.77 1.77 0.32 0.04 -0.19 -0.34 0.68 0.5
-0.12 -0.69 -0.29 0.03 -0.02 -0.29 -0.25 0.47 0.67 0.77 0.49 0.41 0.34 -0.4 -0.09 0.09 -1.34 -2.24 -0.23 -0.76 -1.24 -2.59 0.18 1.1 -0.37 1.71 0.21 0.01 -0.78 -0.72 -0.71 -0.73
-0.67 -0.47 -0.3 -0.16 -0.22 -0.27 0.77 0.66 0.69 0.8 0.51 0.33 0.03 0.56 -1.14 0.55 -1.22 -1.44 0.38 -5.09 -2.46 -3.16 -1.25 -0.78 -1.74 1.52 0.44 0.35 -0.27 -0.22 0.46 0.34
0.33 -0.45 -0.5 -0.37 -0.2 -0.1 0.07 0.62 0.76 0.88 0.72 0.75 -0.48 -0.09 -0.98 -0.47 -1.23 -0.79 -0.22 -2.1 -0.39 -4.54 -0.82 -0.67 -0.03 0.91 0.51 -0.02 -0.43 -0.45 0.73 0.93
-0.04 -0.5 -0.37 0.02 -0.0 -0.23 -0.11 0.62 0.63 0.78 0.43 0.38 0.65 0.22 0.11 -0.08 -0.71 -0.94 0.27 -1.8 -0.23 -2.36 -0.25 -0.11 -0.22 1.15 -0.56 -0.64 -0.52 -0.55 0.38 0.05
-0.62 -0.29 -0.31 0.03 -0.19 0.0 0.35 0.38 0.68 0.55 0.48 0.45 0.34 -0.23 0.36 0.54 -0.21 -0.53 0.13 -3.03 -2.34 -2.17 0.27 0.51 -0.5 1.22 -0.32 0.02 -0.05 0.07 -0.98 -1.37
-0.43 -0.3 0.1 0.21 0.2 -0.0 0.21 0.5 0.45 0.49 0.44 0.09 0.76 -0.56 -0.07 0.37 -0.29 -1.0 0.07 -3.5 -1.39 -2.43 -0.14 -0.22 -0.79 0.93 0.32 0.23 0.01 -0.11 -0.07 0.12
-0.7 -0.13 0.67 0.48 -0.36 -0.7 1.14 1.04 0.82 0.94 0.64 0.31 -1.15 -0.79 -0.8 -0.62 -1.02 -1.34 -0.83 -2.03 -1.42 -4.01 -0.95 -0.7 -0.75 2.63 -0.85 -0.87 -0.91 -0.96 -1.37 -0.97
-0.34 -0.12 0.09 0.07 0.04 -0.04 0.22 0.65 0.67 0.8 0.69 0.43 0.14 -0.58 -0.29 -0.05 -0.74 -1.19 -0.12 -1.66 -1.58 -3.3 0.05 0.32 -0.95 1.33 0.04 -0.0 -0.24 -0.25 -0.22 -0.02
-0.36 -0.3 -0.09 -0.0 0.19 0.01 0.37 0.66 0.61 0.63 0.45 0.18 0.42 -0.51 0.55 0.31 -0.74 -1.06 0.22 -2.63 -3.98 -2.49 -0.27 -0.01 -1.09 1.37 0.28 0.4 -0.28 -0.23 -0.66 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.