Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100162	0.45	0.66	0.7	0.5	0.81	0.75	0.56	0.4	0.67	0.51	0.67	0.31	0.12	0.25	0.31	0.44	0.93	1.0	0.3	0.0	0.0	0.04	0.84	0.65	0.07	0.27	0.09	0.26	0.56	0.72	0.05	0.05
Smo106449	0.4	0.38	0.39	0.37	0.33	0.36	0.42	0.35	0.35	0.4	0.5	0.53	0.48	0.25	1.0	0.45	0.36	0.25	0.26	0.0	0.0	0.0	0.21	0.31	0.0	0.15	0.08	0.15	0.41	0.45	0.17	0.16
Smo107475	0.66	0.65	0.83	0.88	0.94	0.78	0.72	0.71	0.91	0.84	0.81	0.71	0.46	0.4	0.39	0.63	0.53	0.27	0.84	0.02	0.02	0.01	0.64	0.81	0.06	1.0	0.27	0.59	0.62	0.59	0.56	0.56
Smo111015	0.49	0.66	0.67	0.6	0.69	0.54	0.62	0.67	0.44	0.45	0.57	0.54	0.44	0.23	0.24	0.55	0.44	0.23	0.66	0.02	0.02	0.0	0.6	0.68	0.0	1.0	0.69	0.44	0.58	0.55	0.49	0.56
Smo124779	0.55	0.73	0.78	0.64	0.63	0.52	0.68	0.57	0.7	0.63	0.66	0.52	0.09	0.26	1.0	0.2	0.62	0.36	0.24	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.74	0.27	0.36	0.34	0.44	0.37	0.33
Smo126979	0.14	0.26	0.31	0.33	0.37	0.4	1.0	0.27	0.36	0.24	0.26	0.2	0.07	0.06	0.44	0.09	0.82	0.74	0.16	0.1	0.01	0.04	0.33	0.6	0.01	0.06	0.05	0.09	0.16	0.17	0.2	0.11
Smo131886	0.57	0.48	0.58	0.63	0.64	0.6	0.68	0.79	0.87	0.8	0.85	0.65	0.12	0.5	0.36	0.24	0.48	0.08	0.84	0.01	0.02	0.05	0.35	0.33	0.04	1.0	0.5	0.62	0.53	0.58	0.37	0.29
Smo140273	0.5	0.62	0.53	0.47	0.37	0.35	0.81	0.86	0.94	1.0	0.89	0.74	0.14	0.42	0.43	0.12	0.55	0.33	0.12	0.01	0.0	0.0	0.56	0.43	0.0	0.48	0.05	0.07	0.34	0.35	0.43	0.29
Smo149322	0.64	0.47	0.54	0.61	0.64	0.66	0.76	0.88	0.97	0.99	0.93	0.85	0.32	0.67	1.0	0.37	0.68	0.55	0.6	0.34	0.18	0.2	0.56	0.52	0.69	0.79	0.49	0.56	0.71	0.71	0.49	0.37
Smo161006	0.63	0.53	0.5	0.82	0.69	0.6	0.57	0.74	0.87	1.0	0.72	0.96	0.1	0.56	0.39	0.19	0.47	0.09	0.71	0.01	0.01	0.07	0.32	0.24	0.01	0.66	0.31	0.23	0.55	0.53	0.34	0.31
Smo161430	0.58	0.74	0.81	0.77	0.77	0.72	0.89	0.89	0.95	1.0	0.91	0.86	0.67	0.5	0.96	0.53	0.44	0.3	0.42	0.39	0.48	0.23	0.53	0.51	0.38	0.91	0.38	0.42	0.54	0.58	0.45	0.46
Smo171238	0.86	0.98	1.0	0.96	0.81	0.81	0.78	0.59	0.78	0.8	0.83	0.8	0.33	0.56	0.92	0.4	0.92	0.72	0.8	0.08	0.34	0.14	0.5	0.56	0.62	0.52	0.44	0.44	0.71	0.73	0.49	0.51
Smo179365	0.53	0.34	0.38	0.35	0.36	0.32	0.47	0.56	0.79	0.94	1.0	0.98	0.14	0.39	0.68	0.17	0.41	0.25	0.27	0.11	0.11	0.13	0.32	0.32	0.07	0.34	0.39	0.5	0.49	0.44	0.36	0.4
Smo230641	0.28	0.53	0.54	0.41	0.28	0.29	0.62	0.25	0.28	0.29	0.26	0.3	0.23	0.38	0.28	0.27	0.93	0.7	0.32	0.12	0.01	0.01	0.55	1.0	0.01	0.17	0.03	0.05	0.62	0.87	0.18	0.12
Smo231554	0.57	0.7	0.67	0.8	0.82	0.79	0.94	0.98	0.91	0.85	0.79	0.67	0.51	1.0	0.72	0.69	0.8	0.6	0.97	0.08	0.09	0.04	0.69	0.54	0.33	0.59	0.49	0.51	0.6	0.61	0.44	0.31
Smo231555	0.5	0.65	0.57	0.74	0.71	0.65	0.78	1.0	0.99	0.91	0.85	0.68	0.08	0.5	0.32	0.15	0.72	0.49	0.78	0.0	0.0	0.0	0.5	0.3	0.01	0.5	0.24	0.24	0.57	0.59	0.51	0.28
Smo232921	0.54	0.5	0.48	0.48	0.42	0.52	0.54	0.42	0.46	0.53	0.63	0.76	0.49	0.26	1.0	0.44	0.38	0.33	0.26	0.06	0.16	0.08	0.21	0.33	0.15	0.13	0.07	0.12	0.41	0.43	0.16	0.16
Smo234301	0.38	0.5	0.37	0.67	0.65	0.55	0.82	0.7	0.49	0.43	0.7	0.44	0.23	0.21	0.59	0.39	0.94	1.0	0.42	0.18	0.0	0.04	0.73	0.86	0.07	0.2	0.1	0.17	0.62	0.83	0.07	0.03
Smo24657	0.71	0.76	0.83	0.85	0.64	0.76	1.0	0.89	0.89	0.91	0.8	0.76	0.83	0.81	0.28	0.91	0.43	0.54	0.64	0.04	0.13	0.06	0.53	0.54	0.09	0.67	0.34	0.32	0.49	0.5	0.73	0.55
Smo25174	0.67	1.0	0.97	0.78	0.61	0.79	0.89	0.7	0.79	0.77	0.83	0.72	0.36	0.89	0.91	0.58	0.73	0.52	0.54	0.16	0.01	0.22	0.28	0.26	0.06	0.35	0.25	0.21	0.48	0.53	0.58	0.43
Smo270954	0.53	0.68	0.63	0.67	0.65	0.65	0.74	0.78	1.0	0.99	0.9	0.86	0.19	0.11	0.49	0.23	0.33	0.2	0.19	0.18	0.15	0.25	0.32	0.35	0.06	0.68	0.25	0.27	0.23	0.31	0.31	0.27
Smo2945	0.43	0.62	0.76	0.87	0.87	0.66	0.96	0.9	1.0	0.96	0.78	0.76	0.2	0.43	0.96	0.41	0.6	0.53	0.42	0.0	0.0	0.0	0.58	0.45	0.01	0.63	0.19	0.22	0.57	0.57	0.67	0.71
Smo31776	0.73	0.89	0.91	0.99	0.81	1.0	0.91	0.86	0.78	0.89	0.76	0.63	0.45	0.78	0.73	0.54	0.68	0.52	0.31	0.06	0.07	0.01	0.37	0.27	0.1	0.59	0.42	0.47	0.54	0.63	0.45	0.33
Smo402112	0.74	0.83	0.74	0.97	0.85	0.72	0.82	0.65	0.89	1.0	0.95	0.87	0.12	0.42	0.71	0.18	0.74	0.16	0.26	0.04	0.04	0.05	0.41	0.25	0.01	0.26	0.43	0.51	0.51	0.6	0.4	0.26
Smo402116	0.69	0.77	0.85	0.77	0.79	0.76	0.93	0.72	1.0	0.73	0.96	0.75	0.11	0.37	0.63	0.16	0.66	0.04	0.22	0.01	0.03	0.09	0.38	0.22	0.04	0.33	0.42	0.56	0.39	0.45	0.31	0.19
Smo403655	0.47	0.41	0.42	0.49	0.51	0.49	0.59	0.72	0.76	0.79	0.74	0.59	0.24	1.0	0.7	0.49	0.47	0.56	0.45	0.02	0.13	0.09	0.54	0.52	0.66	0.31	0.65	0.75	0.59	0.61	0.51	0.57
Smo406756	0.57	0.65	0.68	0.56	0.58	0.62	0.69	0.47	0.63	0.62	0.73	0.61	0.2	0.38	1.0	0.53	0.54	0.59	0.39	0.07	0.06	0.48	0.17	0.19	0.05	0.2	0.26	0.24	0.46	0.55	0.27	0.23
Smo406940	0.26	0.36	0.77	0.32	0.07	0.49	0.47	1.0	0.53	0.59	0.54	0.44	0.23	0.38	0.4	0.06	0.01	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.13	0.15	0.08	0.84	0.52	0.14	0.02	0.04	0.11	0.14
Smo413732	0.75	0.76	0.59	0.8	0.63	0.94	0.85	0.88	0.83	0.85	0.93	0.69	0.36	0.46	1.0	0.29	0.61	0.24	0.39	0.0	0.0	0.12	0.42	0.3	0.11	0.26	0.21	0.27	0.45	0.42	0.75	0.66
Smo415166	0.44	0.59	0.78	0.77	0.82	0.82	0.75	0.68	0.82	0.7	0.73	0.51	0.7	0.49	1.0	0.26	0.8	0.3	0.13	0.03	0.04	0.11	0.17	0.16	0.02	0.26	0.25	0.3	0.44	0.54	0.38	0.33
Smo417047	0.57	0.7	0.9	0.81	0.84	0.84	1.0	0.75	0.92	0.89	0.81	0.73	0.18	0.18	0.87	0.31	0.41	0.4	0.16	0.14	0.13	0.77	0.16	0.28	0.02	0.47	0.18	0.34	0.36	0.45	0.24	0.19
Smo419187	0.78	0.84	0.75	0.72	0.66	0.78	0.89	0.54	0.89	0.8	0.74	0.82	0.34	0.44	0.78	0.31	1.0	0.75	0.24	0.23	0.27	0.49	0.38	0.23	0.08	0.08	0.13	0.19	0.72	0.74	0.52	0.46
Smo419447	0.4	0.69	1.0	0.93	0.95	0.86	0.91	0.84	0.85	0.98	0.78	0.57	0.23	0.22	0.72	0.19	0.49	0.37	0.88	0.0	0.0	0.0	0.45	0.24	0.0	0.2	0.25	0.38	0.18	0.31	0.27	0.2
Smo423800	0.34	0.52	0.65	0.58	0.41	0.49	0.58	0.59	0.52	0.44	0.55	0.54	0.02	0.05	0.19	0.02	1.0	0.01	0.48	0.0	0.0	0.0	0.44	0.2	0.05	0.29	0.37	0.44	0.6	0.66	0.25	0.15
Smo431857	0.5	0.78	0.24	0.68	0.33	0.65	0.73	0.85	1.0	0.89	0.82	0.8	0.01	0.28	0.56	0.03	0.01	0.14	0.0	0.0	0.0	0.17	0.04	0.07	0.0	0.79	0.27	0.2	0.01	0.0	0.01	0.02
Smo432583	0.3	0.31	0.43	0.32	0.57	0.36	0.25	0.36	0.42	0.32	0.39	0.28	0.3	0.34	0.58	0.4	0.76	1.0	0.56	0.06	0.04	0.0	0.47	0.95	0.07	0.25	0.3	0.05	0.55	0.49	0.3	0.28
Smo438593	0.76	0.84	0.75	0.83	0.71	0.64	0.77	0.74	0.8	0.81	0.81	0.78	0.71	0.61	0.62	0.9	0.61	0.33	1.0	0.23	0.19	0.23	0.64	0.73	0.58	0.84	0.64	0.67	0.55	0.62	0.62	0.43
Smo44115	0.63	0.6	0.49	0.43	0.34	0.39	0.58	0.61	0.81	0.75	0.8	0.71	0.24	0.18	1.0	0.36	0.38	0.29	0.39	0.03	0.02	0.05	0.31	0.36	0.0	0.39	0.16	0.15	0.43	0.48	0.43	0.47
Smo446098	0.6	0.59	0.58	0.58	0.58	0.54	0.62	0.59	0.73	0.74	0.79	0.72	0.44	0.49	0.32	1.0	0.46	0.26	0.36	0.19	0.22	0.16	0.46	0.45	0.28	0.43	0.38	0.41	0.45	0.49	0.4	0.35
Smo5415	0.69	0.6	0.47	0.5	0.33	0.61	0.78	0.92	0.9	0.76	1.0	0.81	0.3	0.85	0.63	0.34	0.23	0.21	0.25	0.0	0.07	0.0	0.14	0.16	0.04	0.6	0.21	0.07	0.17	0.14	0.1	0.05
Smo61948	0.75	0.86	0.79	0.72	0.66	0.7	0.83	0.8	0.77	0.86	0.93	0.8	0.93	0.46	0.22	1.0	0.65	0.35	0.43	0.05	0.1	0.08	0.84	0.79	0.08	0.52	0.36	0.38	0.58	0.6	0.76	0.48
Smo64465	0.71	0.86	0.59	0.68	0.64	0.77	0.82	0.77	0.74	0.8	0.71	0.51	0.23	0.32	1.0	0.37	0.61	0.3	0.51	0.13	0.0	0.09	0.35	0.28	0.09	0.39	0.79	0.66	0.51	0.42	0.41	0.53
Smo6527	0.66	0.94	1.0	0.81	0.69	0.69	0.88	0.62	0.85	0.72	0.84	0.64	0.09	0.26	0.81	0.19	0.53	0.7	0.19	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.0	0.91	0.43	0.48	0.25	0.34	0.31	0.22
Smo74030	0.64	0.72	0.87	0.84	0.76	0.73	0.82	0.59	0.85	0.77	0.71	0.62	0.16	0.37	1.0	0.34	0.89	0.24	0.13	0.02	0.0	0.0	0.27	0.2	0.01	0.15	0.16	0.24	0.6	0.66	0.46	0.24
Smo74260	0.46	0.59	0.62	0.8	0.72	0.69	0.68	0.62	0.7	0.64	0.74	0.57	0.43	0.16	0.31	0.31	1.0	0.53	0.45	0.14	0.19	0.36	0.9	0.34	0.13	0.49	0.31	0.43	0.65	0.7	0.49	0.46
Smo74281	0.46	0.47	1.0	0.61	0.44	0.68	0.59	0.59	0.73	0.65	0.72	0.53	0.35	0.62	0.96	0.4	0.76	0.44	0.38	0.15	0.14	0.33	0.61	0.49	0.09	0.32	0.37	0.45	0.44	0.56	0.4	0.37
Smo74510	0.4	0.41	0.29	0.39	0.41	0.35	0.75	0.75	0.9	1.0	0.8	0.66	0.46	0.77	0.7	0.39	0.36	0.27	0.47	0.02	0.05	0.03	0.24	0.21	0.34	0.58	0.57	0.56	0.64	0.76	0.74	0.6
Smo74552	0.69	0.82	0.7	0.86	0.8	0.75	0.78	0.75	0.98	0.92	0.94	0.79	0.17	0.46	0.72	0.25	1.0	0.26	0.38	0.17	0.08	0.44	0.64	0.36	0.09	0.34	0.43	0.47	0.7	0.77	0.62	0.41
Smo74798	0.83	0.73	0.74	0.69	0.64	0.64	0.8	0.61	0.77	0.72	0.75	0.7	0.2	0.36	0.79	0.38	1.0	0.62	0.58	0.02	0.04	0.28	0.35	0.39	0.11	0.75	0.53	0.66	0.84	0.96	0.47	0.41
Smo81310	0.5	0.48	0.56	0.52	0.54	0.46	0.77	0.88	0.96	1.0	0.92	0.68	0.31	0.61	0.85	0.45	0.44	0.26	0.79	0.2	0.0	0.0	0.28	0.12	0.09	0.38	0.36	0.41	0.72	0.77	0.49	0.44
Smo81473	0.72	0.72	0.74	0.66	0.66	0.68	0.78	0.7	0.99	0.9	0.94	0.83	0.31	0.47	1.0	0.45	0.9	0.45	0.23	0.09	0.14	0.11	0.25	0.16	0.05	0.18	0.17	0.21	0.69	0.78	0.33	0.27
Smo85374	0.62	0.38	0.37	0.36	0.34	0.33	0.54	0.6	0.72	0.95	1.0	0.87	0.17	0.5	0.86	0.2	0.48	0.5	0.29	0.12	0.23	0.14	0.31	0.33	0.17	0.51	0.48	0.62	0.51	0.52	0.48	0.54
Smo85451	0.6	0.72	0.81	0.82	0.79	0.76	0.81	0.68	0.79	0.71	0.68	0.63	0.31	0.6	0.98	0.35	1.0	0.71	0.39	0.38	0.13	0.46	0.54	0.39	0.06	0.4	0.48	0.67	0.77	0.91	0.57	0.46
Smo86596	0.76	0.85	0.98	0.99	0.9	0.89	1.0	0.71	0.86	0.82	0.84	0.73	0.12	0.33	0.78	0.25	0.77	0.25	0.12	0.2	0.05	0.48	0.24	0.19	0.06	0.2	0.23	0.31	0.46	0.52	0.3	0.2
Smo87880	0.8	0.67	1.0	0.83	0.83	0.96	0.74	0.71	0.71	0.73	0.67	0.62	0.28	0.38	0.68	0.33	0.37	0.45	0.41	0.02	0.03	0.49	0.28	0.25	0.07	0.43	0.33	0.37	0.32	0.33	0.24	0.21
Smo89194	0.52	0.68	0.77	0.7	0.62	0.65	0.76	0.67	0.85	0.91	0.88	0.8	0.27	0.27	1.0	0.34	0.52	0.37	0.64	0.07	0.0	0.0	0.26	0.34	0.03	0.34	0.23	0.2	0.42	0.45	0.47	0.4
Smo90847	0.49	0.72	0.83	0.71	0.61	0.65	0.61	0.55	0.61	0.57	0.56	0.48	0.16	0.34	0.89	0.21	1.0	0.17	0.46	0.03	0.04	0.26	0.52	0.47	0.09	0.32	0.35	0.43	0.51	0.67	0.28	0.26
Smo99871	0.71	1.0	0.72	0.89	0.55	0.85	0.77	0.83	0.94	0.99	0.94	0.74	0.47	0.66	0.82	0.54	0.49	0.31	0.45	0.26	0.07	0.09	0.69	0.61	0.08	0.8	0.5	0.51	0.41	0.45	0.34	0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)