1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.15 0.16 0.16 0.14 0.21 0.18 0.17 0.13 0.19 0.21 0.18 0.14 0.05 0.05 0.02 0.08 0.12 0.15 0.12 1.0 0.07 0.28 0.11 0.13 0.21 0.11 0.07 0.1 0.09 0.09 0.11 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.13 0.1 0.15 0.13 0.11 0.19 0.23 0.24 0.43 0.23 0.24 0.25 0.18 0.27 0.25 0.15 0.1 0.05 0.07 1.0 0.11 0.09 0.05 0.06 0.04 0.07 0.16 0.22 0.13 0.15 0.14 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.04 0.08 0.09 0.0 0.13 0.1 0.22 0.07 0.07 0.02 0.08 0.06 0.03 0.08 0.06 0.24 0.15 0.23 1.0 0.0 0.19 0.16 0.08 0.08 0.05 0.31 0.18 0.27 0.3 0.24 0.2
0.12 0.04 0.07 0.06 0.1 0.06 0.11 0.12 0.07 0.05 0.08 0.06 0.01 0.08 0.19 0.02 0.03 0.05 0.07 1.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.19 0.12 0.07 0.12 0.1 0.09 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.23 0.18 0.01 0.19 1.0 0.02 0.0 0.16 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.19 0.17
0.42 0.41 0.46 0.48 0.48 0.44 0.42 0.45 0.46 0.44 0.37 0.43 0.53 0.39 0.5 0.51 0.38 0.47 0.47 1.0 0.07 0.07 0.48 0.44 0.18 0.28 0.37 0.35 0.34 0.35 0.29 0.34
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.29 0.01 0.03 0.23 0.04 1.0 0.15 0.02 0.02 0.03 0.35 0.08 0.05 0.09 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.06 0.12 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.25 0.04 0.03 0.14 0.05 0.25 0.28 0.03 0.03 0.03 0.04
0.16 0.15 0.21 0.18 0.03 0.21 0.19 0.23 0.09 0.11 0.15 0.19 0.18 0.06 0.39 0.19 0.28 0.15 0.48 1.0 0.0 0.0 0.06 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.12 0.14 0.12 0.09
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.08 0.19 0.61 0.15 0.01 0.09 0.01 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.02
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.12 0.13 0.09 0.14 0.01 0.01 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.04 0.03 0.01 0.13 0.08 0.01 0.2 0.56 1.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.12 0.08 0.07 0.12 0.06 0.09 0.03 0.06 0.06 0.08 0.06 0.04 0.07 0.25 0.08 0.02 0.08 0.83 1.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 0.09 0.13 0.1 0.05 0.03 0.03 0.03
0.03 0.07 0.03 0.05 0.03 0.06 0.03 0.06 0.04 0.04 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 1.0 0.19 0.0 0.01 0.01 0.14 0.04 0.06 0.06 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04
0.01 0.04 0.02 0.02 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.06 0.05 0.09 0.01 0.01 0.09 1.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.02 0.05 0.04 0.05 0.03 0.06 0.04 0.03 0.03 0.02 0.05 0.02 0.09 0.04 0.02 0.03 0.01 1.0 0.04 0.12 0.04 0.06 0.13 0.03 0.05 0.06 0.01 0.02 0.02 0.01
0.19 0.17 0.12 0.11 0.17 0.19 0.24 0.23 0.13 0.21 0.14 0.12 0.13 0.05 0.17 0.17 0.21 0.24 0.3 1.0 0.31 0.0 0.16 0.21 0.58 0.17 0.37 0.19 0.2 0.21 0.22 0.21
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
0.04 0.05 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.05 0.04 0.13 0.05 0.03 0.11 0.01 0.02 0.21 0.04 0.02 0.35 1.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.64 0.11 0.04 0.08 0.09 0.07 0.06 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.21 0.0 0.05 0.02 0.03 0.01 0.02
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.04 0.52 1.0 0.0 0.24 0.02 0.02 0.06 0.0 0.08 0.04 0.06 0.09 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.35 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.0
0.07 0.06 0.15 0.05 0.0 0.07 0.12 0.08 0.05 0.12 0.04 0.08 0.1 0.02 0.11 0.18 0.05 0.05 0.19 1.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.11 0.08 0.08 0.06 0.06 0.06 0.05
0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 0.06 0.06 0.09 0.06 0.09 0.06 0.05 0.06 0.0 0.0 0.1 0.09 0.1 0.11 1.0 0.07 0.0 0.11 0.07 0.33 0.16 0.05 0.05 0.14 0.13 0.08 0.11
0.1 0.04 0.17 0.11 0.15 0.27 0.28 0.19 0.16 0.11 0.18 0.13 0.06 0.08 0.44 0.11 0.09 0.08 0.84 1.0 0.04 0.16 0.06 0.04 0.18 0.11 0.42 0.53 0.14 0.19 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.61 1.0 0.0 0.35 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.25 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.04 0.01 0.15 0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08 0.0 0.02
0.1 0.06 0.06 0.05 0.12 0.07 0.03 0.08 0.06 0.04 0.08 0.05 0.15 0.04 0.15 0.19 0.24 0.13 0.15 1.0 0.16 0.1 0.15 0.12 0.12 0.14 0.08 0.12 0.14 0.15 0.12 0.13
0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.04 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.14 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.1 0.04 0.09 0.16 0.11 0.07 0.04 0.02 0.04 0.04 0.09 0.08 0.26 0.28 0.18 0.06 0.04 0.14 1.0 0.29 0.1 0.05 0.1 0.07 0.09 0.08 0.03 0.06 0.05 0.07 0.04
0.18 0.16 0.1 0.14 0.09 0.26 0.27 0.19 0.32 0.24 0.18 0.3 0.21 0.22 0.23 0.16 0.1 0.16 0.27 1.0 0.2 0.0 0.11 0.06 0.42 0.16 0.14 0.08 0.07 0.12 0.17 0.23
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.33 0.03 0.0 0.01 0.12 0.05 0.33 1.0 0.0 0.03 0.04 0.07 0.49 0.09 0.02 0.0 0.1 0.11 0.06 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.08 0.04 0.04 0.07 1.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.31 0.25 0.0 0.18 0.0 0.07 0.07 0.03
0.02 0.01 0.07 0.04 0.0 0.01 0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.88 0.22 0.08 0.39 0.01 0.03 0.19 1.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.17 0.06 0.09 0.07 0.06 0.03 0.02 0.03
0.06 0.01 0.02 0.04 0.0 0.02 0.01 0.08 0.13 0.08 0.05 0.04 0.06 0.0 0.11 0.02 0.02 0.02 0.15 1.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.21 0.12 0.12 0.07 0.01 0.14 0.05 0.01
0.01 0.01 0.04 0.07 0.02 0.04 0.06 0.05 0.02 0.03 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04 0.02 0.03 0.06 0.04 1.0 0.0 0.06 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02
0.12 0.12 0.08 0.18 0.16 0.21 0.17 0.22 0.16 0.12 0.14 0.12 0.17 0.1 0.29 0.16 0.08 0.08 0.15 1.0 0.12 0.08 0.13 0.16 0.44 0.2 0.21 0.2 0.11 0.15 0.11 0.12
0.02 0.02 0.01 0.07 0.01 0.1 0.02 0.01 0.12 0.06 0.11 0.0 0.1 0.03 0.16 0.02 0.0 0.36 0.35 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.14 0.09 0.01 0.01 0.01 0.0
0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.02 0.04 0.02 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0
0.03 0.0 0.01 0.06 0.15 0.04 0.06 0.1 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.05 0.15 0.06 0.11 0.06 0.11 0.07 0.11 0.07 0.11 0.16 0.05 0.02 0.03 0.02 0.02 0.07 0.11 0.36 1.0 0.04 0.04 0.06 0.03 0.3 0.01 0.23 0.31 0.06 0.09 0.04 0.06
0.09 0.07 0.06 0.14 0.04 0.09 0.06 0.04 0.09 0.05 0.06 0.05 0.1 0.03 0.02 0.18 0.11 0.38 0.37 1.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.07 0.12 0.1 0.07 0.14 0.19 0.09 0.1
0.07 0.08 0.14 0.12 0.06 0.15 0.13 0.13 0.09 0.15 0.15 0.09 0.55 0.31 0.79 0.43 0.2 0.07 0.25 1.0 0.0 0.13 0.08 0.09 0.08 0.07 0.14 0.12 0.1 0.15 0.05 0.08
0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.05 0.04 0.02 0.07 0.03 0.06 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.06 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.19 0.02 0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.1 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.06
0.12 0.09 0.08 0.11 0.14 0.13 0.13 0.15 0.18 0.19 0.17 0.09 0.2 0.13 0.2 0.24 0.21 0.42 0.14 1.0 0.08 0.4 0.15 0.17 0.45 0.2 0.24 0.23 0.18 0.25 0.14 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 1.0 0.11 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.1 0.14 0.12 0.11 0.14 0.16 0.15 0.15 0.17 0.13 0.14 0.37 0.37 0.42 0.35 0.25 0.26 0.2 1.0 0.04 0.27 0.41 0.31 0.3 0.17 0.15 0.17 0.18 0.21 0.16 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)