1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 2.04 0.0 0.0 71.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.32 0.32 0.0
0.15 0.59 0.72 0.17 0.15 0.27 0.29 0.27 0.26 0.4 0.14 0.41 0.26 0.02 0.32 0.16 0.19 0.5 75.34 0.97 0.0 0.21 0.23 0.44 0.26 0.86 0.68 1.07 0.09 0.16 0.07 0.04
0.48 0.0 0.0 0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 1.76 152.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.16 0.03 0.14 0.02 0.32 0.2 0.13 0.07 0.14 0.04 0.12 0.04 0.17 0.22 0.08 0.14 0.17 52.09 0.0 1.53 0.0 0.02 0.14 0.07 0.1 0.52 0.08 0.1 0.23 0.13 0.21
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 199.82 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.25 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.78 1.29 1.16 1.38 2.75 2.14 2.62 2.62 2.63 3.27 2.73 2.95 2.19 3.29 6.2 3.16 1.97 2.38 1189.04 0.31 0.91 0.37 1.61 1.84 1.18 3.87 4.61 3.54 2.2 2.66 1.93 2.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 6.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.44 0.11 0.0 0.35 0.0 0.33 356.47 0.8 0.57 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 155.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.02 0.04 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.05 213.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1130.08 0.0 1.01 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.07 0.05 0.09 0.19 12.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.2 0.04 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.05 0.0 0.12 3.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 5.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.05 0.17 0.16 0.36 0.04 0.1 0.05 8.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03
0.15 0.03 0.09 0.11 0.0 0.22 0.29 0.11 0.14 0.05 0.15 0.21 0.03 0.1 0.07 0.0 0.12 0.3 28.97 0.0 0.14 0.0 0.12 0.03 0.2 0.06 0.15 0.13 0.17 0.15 0.17 0.11
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 1.47 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0
0.78 1.29 0.57 0.77 0.46 0.29 1.09 0.78 0.0 0.72 0.13 0.7 0.78 0.59 0.93 0.85 0.53 1.89 713.39 4.44 1.1 0.0 0.46 0.92 0.62 0.0 0.74 0.7 1.13 1.37 0.12 0.24
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 1.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 75.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.04 4.44 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.02 0.1 0.09 0.13 0.15 0.1 0.0 0.08 0.13 0.26 0.05 0.03 0.0 0.19 0.0 0.05 0.04 57.75 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.44 0.13 0.25 0.05 0.05 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 4562.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 3.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
1.4 0.99 1.41 1.71 1.3 1.47 1.15 1.68 1.26 1.85 1.37 1.43 2.98 0.15 2.44 4.3 0.91 2.08 140.08 0.0 0.0 0.0 0.45 0.55 0.2 2.45 1.52 1.2 0.91 0.98 0.82 0.86
0.01 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.11 0.05 0.36 0.0 0.0 0.03 0.11 0.28 72.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 7.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.72 0.0 0.0 26.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.03 0.08 0.04 0.08 0.12 0.01 0.3 50.42 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.06 0.14 0.09
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.05 0.0 0.0 0.24 49.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 54.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 18.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)