1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
5.44 6.69 5.95 6.93 6.13 6.28 4.61 4.81 4.19 4.78 4.33 4.07 5.33 3.92 11.07 7.02 5.07 3.62 12.39 6.06 12.46 4.06 4.02 3.1 9.59 5.19 10.0 10.34 3.92 4.85 2.67 2.56
0.14 0.16 0.17 0.17 0.13 0.12 0.19 0.15 0.19 0.12 0.18 0.17 0.14 0.03 0.63 0.26 0.44 0.14 1.22 0.18 0.85 0.02 0.14 0.13 0.08 0.62 0.57 0.66 0.45 0.35 0.45 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.7 0.92 1.35 1.48 2.28 2.94 3.37 3.61 3.53 2.88 2.01 1.89 0.29 0.24 0.95 0.43 1.42 1.54 12.42 0.32 7.97 1.44 0.91 1.02 0.92 3.18 4.54 4.38 1.73 1.76 1.73 1.2
79.3 81.96 83.97 69.93 63.01 83.83 101.97 91.27 62.56 91.55 63.96 58.43 119.0 65.47 35.22 138.55 86.68 125.41 373.97 47.01 289.7 77.61 147.61 167.08 163.24 142.06 132.68 154.45 132.54 115.42 78.29 54.65
0.08 0.14 0.14 0.16 0.2 0.19 0.15 0.11 0.06 0.13 0.16 0.05 0.18 0.18 0.79 0.14 0.13 0.07 4.78 0.16 1.35 0.0 0.27 0.18 0.08 0.08 0.09 0.11 0.08 0.09 0.06 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.14 0.88 0.02 0.33 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.04 0.05 0.04 0.06 0.03 0.03 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.51 0.0 1.24 0.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.07 0.0 0.18 0.03 0.07 0.0
0.12 0.2 0.16 0.23 0.11 0.19 0.29 0.11 0.07 0.06 0.13 0.13 0.38 0.17 1.45 0.14 0.21 0.32 1.2 0.1 1.3 0.0 0.1 0.07 0.0 0.12 0.11 0.51 0.12 0.14 0.07 0.02
0.23 0.26 0.25 0.36 0.15 0.36 0.32 0.12 0.16 0.09 0.22 0.26 0.33 0.2 0.32 0.57 0.19 0.16 2.1 0.06 4.44 0.34 0.37 0.47 0.54 0.95 0.44 0.69 0.25 0.35 0.12 0.19
0.24 0.24 0.08 0.09 0.02 0.09 0.09 0.09 0.06 0.13 0.19 0.04 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.05 0.76 0.0 1.25 0.0 0.03 0.08 0.08 0.3 0.0 0.59 0.07 0.04 0.05 0.02
0.28 0.12 0.25 0.05 0.14 0.25 0.23 0.22 0.3 0.28 0.21 0.18 0.02 0.22 0.24 0.03 0.06 0.85 2.57 0.0 1.75 0.0 0.02 0.02 0.06 0.87 0.79 0.65 0.04 0.01 0.0 0.01
0.53 0.72 1.06 1.34 0.56 2.06 2.25 1.59 2.57 1.44 1.08 0.81 0.49 0.36 3.97 0.75 1.02 0.0 1.37 1.64 3.51 0.0 1.08 0.8 1.42 0.74 1.42 1.07 0.84 1.65 0.7 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 3.9 0.0 8.55 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.4 1.86 1.74 1.64 1.33 2.41 3.42 2.38 1.97 3.22 2.57 2.53 0.49 0.53 0.11 0.26 1.28 1.44 6.11 0.0 12.22 0.46 1.14 0.96 4.77 2.45 3.69 3.96 1.07 1.18 1.25 1.71
0.53 0.66 0.99 0.54 0.49 0.73 0.79 0.39 0.25 0.2 0.37 0.32 0.62 0.76 1.7 1.55 0.68 0.32 2.71 0.16 3.54 0.08 0.79 0.79 0.51 1.0 0.63 1.58 0.58 0.88 0.25 0.29
2.74 2.68 1.27 2.91 1.08 2.91 3.22 2.5 3.16 3.19 3.26 2.93 1.49 1.7 3.39 1.62 1.72 0.11 6.02 0.07 10.78 0.3 2.49 2.01 6.05 3.25 2.35 1.72 1.84 1.31 2.39 2.93
0.02 0.04 0.08 0.05 0.05 0.16 0.04 0.02 0.02 0.07 0.17 0.09 0.05 0.03 0.39 0.16 0.02 0.04 8.94 0.0 4.22 0.0 0.03 0.05 0.13 0.03 0.2 0.07 0.08 0.05 0.06 0.06
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.14 0.07 0.16 0.38 0.71 1.81 3.77 0.0 6.64 0.63 0.43 0.45 0.8 0.0 0.54 0.0 0.65 0.48 0.67 1.15
0.74 0.03 0.09 0.22 0.57 0.37 0.07 0.09 0.71 0.09 0.0 0.17 0.61 0.44 0.25 0.89 0.11 0.76 2.44 0.0 3.85 0.0 0.56 1.53 1.2 0.23 0.86 1.05 0.18 0.15 0.04 0.07
0.23 0.21 0.05 0.06 0.42 0.06 0.17 0.3 0.08 0.13 0.12 0.12 0.05 0.1 0.04 0.03 0.14 0.26 4.82 0.0 2.65 0.0 0.15 0.36 1.34 1.69 0.51 0.99 0.31 0.3 0.36 0.05
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.02 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.84 0.0 2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.86 0.1 0.28 0.31 0.61 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.48 0.18 0.27 0.09 0.17
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.03 0.0 0.06 0.08 0.27 0.51 0.55 0.44 0.61 0.21 0.22 0.14 0.01 0.07 0.05 0.1 0.17 3.37 0.0 0.64 0.0 0.06 0.03 0.27 1.06 0.43 1.18 0.24 0.21 0.04 0.03
0.27 0.13 0.1 0.2 0.44 0.37 0.38 0.42 0.45 0.56 0.44 0.48 0.07 0.09 0.18 0.06 0.37 0.22 3.83 0.0 1.75 0.22 0.15 0.13 0.14 0.41 0.74 1.03 0.35 0.33 0.31 0.19
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.28 0.69 0.0 1.79 0.0 0.12 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 1.06 8.83 0.0 13.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.16 0.12 0.31 0.42 0.34 0.47 0.27 0.41 0.25 0.36 0.24 0.12 0.11 0.11 0.08 0.17 0.34 1.65 0.0 1.86 0.0 0.25 0.18 0.79 0.55 0.57 0.44 0.18 0.21 0.08 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.07 0.25 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0
0.32 0.63 0.22 0.69 0.29 0.51 0.81 0.87 0.45 0.6 0.52 0.4 0.0 0.02 0.02 0.02 0.12 0.25 2.41 0.0 3.69 0.0 0.02 0.04 1.18 0.38 0.65 0.77 0.29 0.26 0.17 0.19
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.56 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
0.1 0.18 0.02 0.26 0.1 0.09 0.32 0.08 0.16 0.25 0.15 0.07 0.0 0.0 0.09 0.05 0.07 0.14 2.5 0.0 1.84 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.15 0.12 0.08
0.51 0.0 0.26 0.22 0.0 0.15 0.24 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 2.12 4.52 0.0 1.51 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.99 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13 0.81 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.06 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.01 0.11 0.08 0.18 0.64 0.13 0.22 0.0 0.08 0.02 0.07 0.0 0.08 0.1 0.0 0.02 0.11 0.09
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.2 0.74 0.0 1.31 0.0 0.03 0.02 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.53 1.14 0.28 0.63 0.53 0.42 0.98 0.42 0.6 0.51 0.86 0.91 0.07 0.14 0.2 0.07 0.31 0.68 2.0 0.15 3.72 0.23 0.26 0.15 1.86 0.55 0.73 0.25 0.44 0.38 0.69 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.47 0.0 0.95 0.0 0.05 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.77 6.99 4.89 4.87 8.54 5.46 8.57 8.44 8.34 10.79 10.73 5.31 13.5 18.22 0.78 6.41 2.97 2.52 103.33 0.03 119.56 0.01 3.23 9.89 33.92 14.59 5.62 8.08 11.22 14.17 5.89 9.97
0.92 0.67 0.63 0.87 0.93 0.72 0.79 0.88 0.88 0.75 0.92 0.99 1.96 0.71 6.86 1.72 0.3 0.15 3.56 2.49 3.51 0.11 0.5 0.61 0.18 0.6 0.93 0.95 0.41 0.45 1.87 1.47
2.78 1.16 0.72 1.91 6.52 3.35 3.26 2.84 1.3 4.41 4.3 1.18 8.61 0.28 6.08 22.9 5.89 10.73 28.07 1.86 24.53 3.78 4.63 5.6 0.0 8.15 4.92 6.04 9.17 10.75 4.51 4.69
0.1 0.18 0.12 0.09 0.09 0.06 0.02 0.12 0.09 0.29 0.89 0.32 0.0 0.0 0.03 0.03 0.12 0.06 3.98 0.0 1.21 0.0 0.45 0.33 0.0 0.02 0.09 0.12 0.2 0.1 0.2 0.31
0.06 0.03 0.07 0.13 0.27 0.21 0.27 0.03 0.18 0.05 0.13 0.06 0.83 0.12 0.25 1.84 0.21 1.02 3.99 0.07 7.95 1.51 0.04 0.33 0.25 0.36 0.24 0.28 0.56 0.63 0.38 0.93
2.75 2.41 2.98 3.02 3.15 3.55 4.33 3.8 3.74 3.64 3.01 2.67 2.11 0.77 2.05 10.52 2.87 6.4 8.97 1.95 14.96 3.85 4.71 6.68 8.28 6.22 5.82 6.31 5.26 4.23 2.48 1.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 1.11 5.19 21.69 0.0 4.67 0.0 0.83 1.97 0.0 0.0 0.0 0.0 2.71 2.01 5.63 5.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 1.11 5.19 21.69 0.0 4.67 0.0 0.83 1.97 0.0 0.0 0.0 0.0 2.71 2.01 5.63 5.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.44 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
1.37 1.96 1.63 1.29 3.81 2.98 2.14 2.48 1.73 1.55 2.83 2.64 0.83 0.54 0.37 1.05 3.78 3.5 26.98 0.0 11.4 0.0 7.43 6.8 0.94 0.9 1.83 3.15 5.98 7.39 4.01 6.96

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)