1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.26 0.26 0.3 0.29 0.31 0.34 0.44 0.25 0.28 0.28 0.28 0.25 0.37 0.41 1.0 0.42 0.3 0.3 0.36 0.05 0.01 0.04 0.25 0.24 0.04 0.13 0.16 0.16 0.41 0.45 0.33 0.27
0.19 0.27 0.22 0.29 0.24 0.29 0.28 0.25 0.25 0.22 0.21 0.21 0.36 0.54 1.0 0.38 0.28 0.26 0.33 0.19 0.27 0.11 0.35 0.38 0.35 0.27 0.35 0.32 0.27 0.26 0.2 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.38 1.0 0.21 0.19 0.12 0.25 0.04 0.03 0.09 0.18 0.2 0.02 0.08 0.12 0.13 0.15 0.16 0.14 0.13
0.27 0.37 0.43 0.35 0.37 0.4 0.24 0.21 0.21 0.18 0.22 0.2 0.28 0.32 1.0 0.28 0.26 0.21 0.08 0.0 0.05 0.11 0.37 0.35 0.05 0.19 0.29 0.36 0.12 0.16 0.12 0.13
0.38 0.4 0.4 0.51 0.46 0.47 0.41 0.41 0.52 0.39 0.4 0.36 0.67 0.79 1.0 0.78 0.54 0.49 0.74 0.1 0.16 0.29 0.63 0.66 0.35 0.4 0.5 0.45 0.54 0.47 0.41 0.45
0.18 0.21 0.26 0.23 0.32 0.32 0.35 0.32 0.32 0.25 0.21 0.2 0.42 0.4 1.0 0.57 0.25 0.26 0.71 0.2 0.05 0.05 0.31 0.44 0.11 0.4 0.39 0.37 0.27 0.38 0.21 0.17
0.27 0.31 0.31 0.33 0.32 0.32 0.41 0.33 0.44 0.41 0.39 0.33 0.63 0.42 1.0 0.54 0.34 0.23 0.27 0.07 0.19 0.2 0.52 0.55 0.05 0.25 0.25 0.3 0.3 0.35 0.25 0.24
0.21 0.28 0.35 0.31 0.37 0.48 0.33 0.25 0.24 0.2 0.15 0.15 0.2 0.29 1.0 0.33 0.25 0.19 0.18 0.0 0.0 0.03 0.2 0.12 0.03 0.16 0.34 0.51 0.18 0.21 0.04 0.04
0.27 0.34 0.33 0.32 0.26 0.24 0.3 0.23 0.29 0.33 0.34 0.26 0.27 0.27 1.0 0.28 0.53 0.34 0.37 0.0 0.0 0.01 0.53 0.35 0.0 0.13 0.17 0.24 0.38 0.41 0.53 0.55
0.29 0.35 0.35 0.4 0.56 0.42 0.45 0.37 0.37 0.3 0.29 0.26 0.32 0.58 1.0 0.46 0.39 0.36 0.36 0.26 0.18 0.25 0.47 0.47 0.28 0.33 0.45 0.53 0.35 0.33 0.25 0.19
0.24 0.29 0.28 0.3 0.32 0.32 0.33 0.24 0.25 0.24 0.23 0.22 0.42 0.56 1.0 0.39 0.36 0.3 0.53 0.31 0.17 0.37 0.25 0.26 0.19 0.12 0.21 0.2 0.29 0.33 0.23 0.23
0.32 0.41 0.44 0.41 0.37 0.47 0.38 0.34 0.34 0.35 0.42 0.31 0.47 0.53 1.0 0.53 0.34 0.3 0.46 0.13 0.04 0.28 0.47 0.45 0.24 0.17 0.24 0.26 0.4 0.46 0.29 0.41
0.27 0.33 0.35 0.35 0.41 0.43 0.42 0.39 0.32 0.28 0.26 0.22 0.26 0.32 1.0 0.32 0.25 0.24 0.32 0.17 0.08 0.25 0.21 0.24 0.06 0.25 0.37 0.32 0.2 0.22 0.17 0.15
0.34 0.31 0.35 0.37 0.43 0.39 0.39 0.39 0.39 0.35 0.34 0.31 0.44 0.44 1.0 0.68 0.38 0.32 0.54 0.07 0.02 0.09 0.49 0.65 0.17 0.39 0.33 0.34 0.38 0.4 0.28 0.23
0.21 0.26 0.26 0.25 0.31 0.32 0.29 0.23 0.2 0.17 0.16 0.14 0.37 0.46 1.0 0.38 0.32 0.22 0.43 0.19 0.1 0.16 0.33 0.35 0.19 0.17 0.34 0.31 0.27 0.28 0.26 0.24
0.09 0.03 0.06 0.07 0.07 0.09 0.19 0.16 0.04 0.15 0.14 0.13 0.3 0.13 1.0 0.12 0.04 0.08 0.01 0.0 0.0 0.02 0.47 0.2 0.04 0.04 0.04 0.0 0.04 0.05 0.05 0.05
0.2 0.21 0.21 0.23 0.29 0.35 0.27 0.16 0.18 0.15 0.12 0.12 0.44 0.2 1.0 0.58 0.36 0.32 0.36 0.27 0.04 0.16 0.21 0.24 0.03 0.04 0.1 0.11 0.26 0.28 0.16 0.09
0.27 0.3 0.36 0.39 0.43 0.54 0.49 0.44 0.45 0.43 0.34 0.32 0.46 0.48 1.0 0.57 0.4 0.34 0.58 0.13 0.1 0.11 0.45 0.49 0.08 0.36 0.27 0.28 0.47 0.44 0.39 0.34
0.21 0.2 0.21 0.24 0.27 0.26 0.27 0.26 0.25 0.26 0.21 0.2 0.31 0.5 1.0 0.32 0.26 0.21 0.3 0.22 0.31 0.1 0.27 0.27 0.26 0.32 0.26 0.22 0.26 0.27 0.27 0.27
0.33 0.35 0.35 0.35 0.35 0.39 0.32 0.36 0.42 0.36 0.37 0.31 0.47 0.37 1.0 0.39 0.33 0.27 0.32 0.15 0.14 0.27 0.52 0.6 0.15 0.26 0.24 0.24 0.27 0.29 0.26 0.35
0.37 0.39 0.34 0.39 0.24 0.41 0.37 0.33 0.4 0.41 0.29 0.3 0.61 0.72 1.0 0.65 0.36 0.38 0.52 0.01 0.03 0.08 0.41 0.46 0.33 0.24 0.31 0.21 0.46 0.4 0.28 0.28
0.25 0.35 0.34 0.54 0.49 0.49 0.51 0.42 0.4 0.3 0.29 0.25 0.7 0.87 0.81 1.0 0.59 0.54 0.97 0.02 0.06 0.0 0.48 0.52 0.49 0.43 0.68 0.6 0.51 0.56 0.31 0.35
0.23 0.27 0.31 0.28 0.35 0.35 0.33 0.31 0.24 0.2 0.2 0.17 0.26 0.27 1.0 0.3 0.28 0.28 0.31 0.02 0.01 0.01 0.23 0.26 0.01 0.12 0.22 0.2 0.22 0.23 0.23 0.22
0.1 0.16 0.22 0.18 0.16 0.18 0.22 0.22 0.17 0.15 0.13 0.12 0.34 0.24 1.0 0.4 0.25 0.28 0.41 0.09 0.11 0.01 0.22 0.24 0.07 0.14 0.29 0.25 0.25 0.28 0.17 0.21
0.31 0.33 0.37 0.38 0.41 0.37 0.48 0.44 0.42 0.44 0.34 0.31 0.37 0.44 1.0 0.4 0.4 0.39 0.4 0.18 0.21 0.01 0.41 0.37 0.28 0.28 0.45 0.41 0.36 0.35 0.31 0.39
0.49 0.52 0.56 0.48 0.44 0.55 0.37 0.41 0.39 0.42 0.4 0.38 0.46 0.52 1.0 0.55 0.33 0.24 0.45 0.05 0.17 0.14 0.39 0.45 0.18 0.32 0.39 0.49 0.32 0.34 0.18 0.19
0.15 0.18 0.2 0.26 0.22 0.28 0.29 0.21 0.27 0.21 0.15 0.19 0.06 0.14 1.0 0.09 0.25 0.12 0.27 0.19 0.31 0.21 0.08 0.08 0.14 0.15 0.32 0.26 0.16 0.17 0.09 0.07
0.13 0.04 0.13 0.17 0.04 0.11 0.07 0.09 0.04 0.05 0.07 0.05 0.37 0.15 1.0 0.47 0.02 0.02 0.52 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.2 0.09 0.05 0.06 0.01 0.03 0.01 0.02
0.16 0.16 0.19 0.24 0.28 0.22 0.2 0.19 0.13 0.18 0.15 0.11 0.31 0.34 1.0 0.42 0.28 0.09 0.39 0.0 0.01 0.0 0.05 0.05 0.0 0.04 0.04 0.04 0.18 0.27 0.12 0.09
0.22 0.27 0.68 0.48 0.36 0.45 0.41 0.22 0.26 0.28 0.14 0.19 0.31 0.43 1.0 0.45 0.26 0.12 0.24 0.0 0.0 0.0 0.21 0.1 0.0 0.07 0.23 0.17 0.18 0.26 0.09 0.11
0.35 0.4 0.41 0.48 0.48 0.48 0.54 0.43 0.59 0.54 0.5 0.44 0.28 0.36 1.0 0.46 0.43 0.38 0.47 0.06 0.25 0.12 0.54 0.56 0.13 0.32 0.23 0.21 0.37 0.46 0.45 0.49
0.04 0.11 0.1 0.1 0.11 0.09 0.07 0.06 0.08 0.1 0.05 0.04 0.35 0.08 1.0 0.46 0.06 0.02 0.61 0.02 0.03 0.0 0.02 0.04 0.07 0.07 0.12 0.21 0.04 0.06 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.2 0.05 1.0 0.72 0.15 0.12 0.69 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 0.0 0.0 0.11 0.0 0.08 0.08 0.04 0.0
0.12 0.1 0.12 0.13 0.16 0.17 0.17 0.16 0.18 0.15 0.08 0.11 0.44 0.33 1.0 0.31 0.11 0.11 0.65 0.02 0.04 0.04 0.1 0.08 0.12 0.49 0.44 0.61 0.09 0.1 0.06 0.07
0.2 0.21 0.2 0.29 0.26 0.24 0.21 0.27 0.3 0.32 0.3 0.23 0.5 0.18 1.0 0.42 0.09 0.08 0.26 0.0 0.01 0.0 0.44 0.45 0.05 0.35 0.22 0.22 0.14 0.15 0.14 0.15
0.1 0.18 0.06 0.08 0.08 0.2 0.23 0.06 0.07 0.04 0.1 0.12 0.07 0.14 1.0 0.2 0.16 0.2 0.47 0.0 0.1 0.13 0.01 0.0 0.15 0.05 0.03 0.25 0.09 0.06 0.06 0.02
0.45 0.49 0.49 0.46 0.49 0.53 0.54 0.5 0.42 0.45 0.4 0.39 0.39 0.4 1.0 0.49 0.38 0.36 0.52 0.39 0.39 0.3 0.35 0.36 0.29 0.54 0.51 0.53 0.4 0.44 0.3 0.3
0.27 0.34 0.31 0.36 0.27 0.31 0.3 0.3 0.3 0.28 0.31 0.22 0.39 0.54 1.0 0.5 0.28 0.2 0.57 0.01 0.0 0.03 0.3 0.3 0.05 0.27 0.38 0.46 0.3 0.36 0.16 0.16
0.39 0.39 0.41 0.41 0.36 0.45 0.37 0.35 0.33 0.4 0.29 0.31 0.47 0.68 1.0 0.62 0.43 0.48 0.57 0.0 0.05 0.0 0.41 0.42 0.15 0.21 0.24 0.3 0.47 0.47 0.3 0.31
0.05 0.04 0.07 0.11 0.13 0.1 0.12 0.11 0.1 0.13 0.09 0.07 0.23 0.58 1.0 0.4 0.17 0.17 0.14 0.06 0.02 0.21 0.08 0.07 0.02 0.14 0.06 0.07 0.13 0.16 0.05 0.04
0.08 0.08 0.13 0.11 0.16 0.14 0.12 0.1 0.1 0.11 0.1 0.09 0.17 0.26 1.0 0.23 0.18 0.15 0.16 0.01 0.0 0.02 0.34 0.48 0.02 0.07 0.12 0.15 0.13 0.16 0.08 0.12
0.13 0.15 0.11 0.16 0.15 0.16 0.19 0.1 0.13 0.13 0.11 0.12 0.11 0.04 1.0 0.17 0.4 0.25 0.36 0.04 0.12 0.0 0.06 0.05 0.07 0.03 0.1 0.09 0.21 0.22 0.31 0.31
0.11 0.18 0.28 0.18 0.07 0.14 0.14 0.17 0.23 0.14 0.11 0.14 0.2 0.12 1.0 0.19 0.15 0.31 0.56 0.01 0.02 0.07 0.1 0.17 0.22 0.11 0.18 0.27 0.17 0.25 0.05 0.05
0.11 0.18 0.28 0.18 0.07 0.14 0.14 0.17 0.23 0.14 0.11 0.14 0.2 0.12 1.0 0.19 0.15 0.31 0.56 0.01 0.02 0.07 0.1 0.17 0.22 0.11 0.18 0.27 0.17 0.25 0.05 0.05
0.37 0.34 0.43 0.43 0.45 0.57 0.54 0.48 0.6 0.47 0.41 0.33 0.29 0.82 1.0 0.65 0.52 0.49 0.54 0.02 0.0 0.01 0.55 0.53 0.06 0.24 0.4 0.39 0.48 0.47 0.36 0.41
0.22 0.31 0.18 0.35 0.28 0.36 0.25 0.2 0.22 0.13 0.18 0.23 0.15 0.21 1.0 0.18 0.29 0.32 0.25 0.01 0.05 0.07 0.17 0.19 0.29 0.13 0.29 0.41 0.23 0.26 0.07 0.07
0.33 0.37 0.33 0.4 0.42 0.45 0.38 0.43 0.37 0.29 0.31 0.29 0.33 0.49 1.0 0.42 0.28 0.24 0.55 0.11 0.08 0.18 0.3 0.31 0.27 0.39 0.42 0.32 0.28 0.26 0.37 0.31
0.24 0.34 0.34 0.32 0.37 0.31 0.22 0.18 0.23 0.21 0.21 0.16 0.23 0.34 1.0 0.27 0.23 0.22 0.07 0.02 0.03 0.27 0.36 0.36 0.05 0.11 0.16 0.17 0.11 0.14 0.11 0.11
0.28 0.29 0.29 0.3 0.33 0.31 0.31 0.27 0.3 0.27 0.31 0.24 0.28 0.52 1.0 0.47 0.35 0.25 0.46 0.13 0.19 0.11 0.43 0.4 0.12 0.23 0.36 0.4 0.33 0.35 0.19 0.15
0.09 0.15 0.16 0.13 0.27 0.23 0.12 0.07 0.19 0.18 0.13 0.1 0.36 0.09 1.0 0.28 0.27 0.18 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.01 0.05 0.19 0.18 0.23 0.26 0.28
0.18 0.22 0.25 0.31 0.26 0.28 0.28 0.27 0.2 0.16 0.2 0.14 0.03 0.12 1.0 0.07 0.15 0.2 0.16 0.03 0.14 0.31 0.07 0.05 0.14 0.12 0.35 0.32 0.11 0.11 0.07 0.05
0.24 0.23 0.2 0.28 0.28 0.37 0.31 0.38 0.32 0.29 0.24 0.2 0.24 0.37 1.0 0.46 0.26 0.23 0.62 0.1 0.05 0.07 0.24 0.26 0.22 0.37 0.43 0.3 0.3 0.25 0.38 0.35
0.17 0.22 0.26 0.28 0.46 0.48 0.41 0.27 0.27 0.25 0.2 0.16 0.17 0.09 1.0 0.19 0.22 0.2 0.2 0.12 0.06 0.05 0.14 0.15 0.02 0.12 0.38 0.33 0.2 0.26 0.08 0.1
0.2 0.38 0.37 0.33 0.41 0.41 0.34 0.31 0.31 0.27 0.27 0.21 0.25 0.45 1.0 0.3 0.28 0.19 0.26 0.07 0.25 0.18 0.34 0.33 0.16 0.19 0.21 0.28 0.26 0.27 0.12 0.06
0.16 0.19 0.25 0.21 0.26 0.25 0.25 0.18 0.21 0.19 0.23 0.13 0.25 0.35 1.0 0.3 0.4 0.44 0.33 0.09 0.11 0.01 0.33 0.31 0.16 0.09 0.21 0.2 0.27 0.33 0.34 0.35
0.19 0.21 0.22 0.23 0.27 0.28 0.27 0.26 0.23 0.22 0.19 0.19 0.38 0.43 1.0 0.38 0.28 0.2 0.37 0.31 0.24 0.26 0.32 0.37 0.22 0.2 0.2 0.16 0.24 0.24 0.24 0.25
0.24 0.21 0.29 0.23 0.25 0.18 0.24 0.23 0.3 0.33 0.3 0.25 0.18 0.28 1.0 0.49 0.24 0.17 0.14 0.02 0.0 0.05 0.25 0.34 0.02 0.12 0.16 0.12 0.26 0.31 0.21 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)