Heatmap: Cluster_210 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100621	0.93	0.89	0.94	0.89	0.89	0.9	0.79	0.99	0.92	1.0	0.95	0.92	0.61	0.41	0.6	0.64	0.55	0.51	0.71	0.05	0.56	0.01	0.6	0.59	0.23	0.79	0.76	0.8	0.73	0.72	0.55	0.49
Smo102245	0.88	1.0	0.98	0.92	0.87	0.83	0.6	0.58	0.6	0.7	0.65	0.65	0.47	0.72	0.42	0.47	0.45	0.44	0.51	0.08	0.53	0.14	0.65	0.65	0.32	0.3	0.45	0.46	0.47	0.61	0.51	0.54
Smo111363	0.8	1.0	0.88	0.85	0.77	0.9	0.7	0.69	0.75	0.68	0.66	0.67	0.61	0.63	0.49	0.69	0.37	0.26	0.53	0.06	0.17	0.27	0.52	0.47	0.09	0.37	0.45	0.53	0.38	0.43	0.36	0.39
Smo112120	0.95	0.86	0.77	0.81	0.77	0.72	0.7	0.86	0.91	1.0	0.92	0.96	0.45	0.45	0.48	0.53	0.4	0.26	0.55	0.02	0.01	0.0	0.59	0.61	0.03	0.57	0.57	0.63	0.55	0.58	0.41	0.42
Smo13258	0.9	0.86	0.88	0.81	0.79	0.71	0.79	0.85	0.93	0.98	1.0	0.9	0.42	0.42	0.75	0.47	0.56	0.41	0.46	0.01	0.12	0.03	0.5	0.53	0.24	0.79	0.52	0.7	0.51	0.57	0.45	0.48
Smo143427	1.0	0.84	0.84	0.8	0.79	0.76	0.75	0.86	0.9	0.95	0.92	0.97	0.56	0.44	0.49	0.6	0.46	0.35	0.79	0.1	0.24	0.2	0.49	0.52	0.3	0.81	0.81	0.8	0.59	0.59	0.58	0.61
Smo145899	0.91	0.86	0.88	0.86	1.0	0.92	0.81	0.7	0.72	0.67	0.67	0.55	0.48	0.26	0.31	0.52	0.59	0.47	0.78	0.1	0.03	0.01	0.55	0.45	0.05	0.54	0.59	0.71	0.58	0.64	0.44	0.4
Smo163891	1.0	0.85	0.74	0.7	0.68	0.63	0.68	0.76	0.7	0.66	0.69	0.66	0.48	0.35	0.48	0.45	0.29	0.23	0.39	0.0	0.03	0.02	0.47	0.53	0.09	0.56	0.87	0.94	0.38	0.4	0.41	0.4
Smo164567	0.97	0.93	1.0	0.86	0.92	0.86	0.7	0.66	0.78	0.79	0.77	0.68	0.61	0.71	0.33	0.53	0.55	0.48	0.63	0.25	0.24	0.15	0.8	0.79	0.35	0.69	0.58	0.73	0.49	0.55	0.31	0.29
Smo172284	1.0	0.84	0.8	0.66	0.79	0.78	0.49	0.57	0.66	0.74	0.67	0.64	0.36	0.57	0.32	0.53	0.26	0.28	0.44	0.0	0.01	0.0	0.44	0.43	0.01	0.15	0.39	0.48	0.25	0.31	0.3	0.31
Smo173584	1.0	0.67	0.64	0.61	0.64	0.5	0.41	0.59	0.51	0.52	0.56	0.55	0.27	0.31	0.28	0.35	0.27	0.28	0.37	0.04	0.1	0.04	0.51	0.55	0.19	0.58	0.52	0.61	0.42	0.31	0.23	0.21
Smo177195	0.9	0.88	0.85	0.78	0.79	0.74	0.96	0.96	0.95	0.98	1.0	0.92	0.48	0.4	0.46	0.55	0.5	0.42	0.53	0.13	0.24	0.16	0.58	0.57	0.51	0.77	0.78	0.79	0.6	0.59	0.59	0.65
Smo178562	1.0	0.77	0.72	0.76	0.86	0.68	0.72	0.71	0.84	0.93	1.0	0.96	0.69	0.41	0.38	0.78	0.47	0.45	0.62	0.04	0.02	0.03	0.5	0.45	0.02	0.94	0.41	0.46	0.45	0.45	0.44	0.46
Smo183083	0.98	0.86	0.86	0.78	0.79	0.83	0.76	0.85	0.88	1.0	0.89	0.86	0.78	0.71	0.6	0.73	0.49	0.43	0.7	0.31	0.34	0.3	0.6	0.7	0.39	0.72	0.5	0.56	0.54	0.53	0.53	0.53
Smo229886	0.49	0.76	0.54	0.39	0.4	0.43	0.65	0.49	0.82	1.0	0.79	0.49	0.16	0.24	0.04	0.1	0.06	0.14	0.06	0.12	0.04	0.05	0.16	0.16	0.03	0.14	0.15	0.07	0.06	0.06	0.57	0.4
Smo28918	0.97	1.0	0.84	0.69	0.76	0.61	0.42	0.58	0.66	0.8	0.89	0.81	0.42	0.22	0.15	0.34	0.35	0.5	0.37	0.0	0.04	0.0	0.34	0.36	0.0	0.31	0.19	0.23	0.32	0.25	0.4	0.45
Smo30228	0.92	0.92	1.0	0.84	0.52	0.48	0.56	0.61	0.6	0.73	0.66	0.71	0.48	0.32	0.26	0.61	0.31	0.26	0.36	0.06	0.29	0.06	0.42	0.53	0.39	0.96	0.38	0.46	0.34	0.28	0.51	0.46
Smo33558	0.81	0.88	0.68	0.7	0.72	0.69	0.83	0.76	0.84	1.0	0.82	0.93	0.46	0.38	0.32	0.54	0.31	0.33	0.58	0.0	0.07	0.0	0.38	0.36	0.06	0.75	0.77	0.74	0.41	0.43	0.49	0.52
Smo402451	0.61	1.0	0.68	0.53	0.77	0.66	0.59	0.42	0.72	0.85	0.64	0.44	0.16	0.2	0.06	0.19	0.07	0.12	0.1	0.01	0.0	0.01	0.23	0.39	0.01	0.12	0.28	0.19	0.05	0.05	0.24	0.18
Smo404061	0.95	1.0	0.9	0.71	0.72	0.43	0.57	0.61	0.51	0.71	0.63	0.64	0.69	0.97	0.23	0.69	0.37	0.24	0.17	0.0	0.01	0.0	0.59	0.44	0.02	0.46	0.43	0.27	0.5	0.44	0.33	0.36
Smo405036	0.91	0.97	1.0	0.96	0.98	0.75	0.6	0.58	0.65	0.78	0.58	0.69	0.71	0.88	0.51	0.7	0.62	0.59	0.73	0.05	0.01	0.0	0.85	0.83	0.07	0.54	0.61	0.68	0.74	0.89	0.81	0.85
Smo408718	1.0	0.81	0.83	0.71	0.64	0.54	0.4	0.4	0.48	0.58	0.75	0.71	0.43	0.23	0.32	0.55	0.26	0.21	0.4	0.01	0.12	0.03	0.33	0.34	0.06	0.67	0.29	0.36	0.25	0.26	0.19	0.23
Smo408814	0.79	1.0	0.89	0.83	0.73	0.45	0.37	0.52	0.51	0.71	0.63	0.83	0.58	0.01	0.0	0.22	0.11	0.0	0.12	0.04	0.01	0.0	0.16	0.08	0.11	0.54	0.35	0.3	0.13	0.09	0.16	0.07
Smo409501	0.83	0.76	0.76	0.77	0.73	0.91	0.92	0.83	0.86	0.97	0.95	0.84	0.62	0.62	0.48	0.66	0.41	0.63	0.66	0.15	0.23	0.2	0.61	0.61	0.33	1.0	0.88	0.84	0.44	0.47	0.5	0.67
Smo409852	0.49	1.0	0.85	0.68	0.43	0.54	0.37	0.34	0.31	0.55	0.48	0.54	0.39	0.29	0.5	0.39	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.11	0.06	0.22	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01
Smo412985	1.0	0.87	0.85	0.8	0.83	0.79	0.63	0.7	0.84	0.79	0.81	0.77	0.44	0.46	0.49	0.54	0.57	0.41	0.56	0.07	0.17	0.25	0.61	0.68	0.45	0.42	0.6	0.67	0.58	0.69	0.35	0.43
Smo414574	0.62	1.0	0.86	0.73	0.46	0.52	0.33	0.3	0.47	0.5	0.5	0.61	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.0	0.17	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.03	0.24	0.16	0.06	0.06	0.04	0.05
Smo419975	1.0	0.9	0.88	0.83	0.81	0.76	0.69	0.77	0.8	0.86	0.89	0.8	0.43	0.42	0.3	0.64	0.51	0.51	0.58	0.13	0.15	0.07	0.59	0.58	0.4	0.94	0.66	0.77	0.56	0.62	0.61	0.58
Smo422192	0.87	0.78	0.64	0.74	0.82	0.66	0.67	0.75	0.98	0.88	0.96	0.8	0.86	0.43	0.31	0.82	0.33	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.59	0.07	0.6	0.39	0.3	0.49	0.49	0.35	0.38
Smo438214	0.97	1.0	0.8	0.87	0.97	0.75	0.57	0.6	0.7	0.63	0.74	0.55	0.58	0.66	0.17	0.72	0.41	0.4	0.17	0.0	0.03	0.0	0.62	0.6	0.02	0.34	0.41	0.55	0.53	0.5	0.33	0.27
Smo439915	0.97	0.86	0.75	0.71	0.76	0.65	0.69	0.76	0.68	0.65	0.67	0.63	0.45	0.37	0.45	0.44	0.33	0.21	0.4	0.01	0.05	0.01	0.54	0.61	0.21	0.68	0.96	1.0	0.39	0.42	0.44	0.38
Smo440323	0.68	0.63	0.73	0.62	0.39	0.33	0.33	0.63	0.6	0.56	0.55	0.5	0.31	0.22	0.34	0.27	0.18	0.18	0.35	0.11	0.2	0.01	0.25	0.29	0.1	1.0	0.29	0.28	0.45	0.54	0.23	0.33
Smo440870	1.0	0.83	0.86	0.73	0.65	0.6	0.78	0.74	0.78	0.85	0.82	0.83	0.49	0.43	0.31	0.56	0.34	0.28	0.49	0.07	0.1	0.06	0.41	0.41	0.05	0.65	0.49	0.54	0.47	0.51	0.44	0.4
Smo441325	1.0	0.89	0.9	0.81	0.84	0.86	0.86	0.89	0.86	0.91	0.89	0.84	0.67	0.54	0.59	0.71	0.51	0.42	0.65	0.07	0.29	0.1	0.62	0.63	0.3	0.82	0.79	0.8	0.61	0.65	0.62	0.56
Smo441628	0.82	0.76	0.65	0.64	0.7	0.61	0.61	0.57	0.62	0.66	0.66	0.63	0.37	0.38	0.38	0.49	0.47	0.31	0.56	0.05	0.26	0.27	0.44	0.55	0.26	0.68	0.83	1.0	0.52	0.58	0.31	0.32
Smo442632	0.69	1.0	0.99	0.94	0.78	0.62	0.63	0.64	0.65	0.62	0.61	0.56	0.35	0.36	0.19	0.65	0.35	0.25	0.37	0.06	0.08	0.01	0.32	0.31	0.32	0.54	0.63	0.67	0.36	0.37	0.19	0.21
Smo443944	0.96	1.0	0.87	0.81	0.77	0.8	0.72	0.82	0.83	0.84	0.84	0.82	0.5	0.53	0.58	0.63	0.52	0.47	0.62	0.25	0.22	0.3	0.56	0.54	0.2	0.59	0.69	0.72	0.54	0.59	0.5	0.47
Smo446491	1.0	0.84	0.84	0.72	0.68	0.67	0.51	0.67	0.69	0.78	0.87	0.79	0.4	0.29	0.06	0.49	0.24	0.37	0.59	0.0	0.02	0.01	0.36	0.27	0.01	0.67	0.39	0.33	0.38	0.34	0.39	0.5
Smo447811	0.84	0.81	0.91	0.73	0.64	0.57	0.6	0.7	0.83	0.93	1.0	0.86	0.64	0.6	0.17	0.78	0.34	0.24	0.26	0.01	0.04	0.0	0.7	0.64	0.07	0.78	0.32	0.38	0.45	0.45	0.35	0.38
Smo61162	0.72	0.72	0.71	0.72	0.88	0.98	0.86	0.93	0.81	0.77	0.62	0.61	0.38	0.44	0.35	0.41	0.49	0.56	0.72	0.08	0.05	0.01	0.51	0.52	0.09	0.55	0.83	1.0	0.55	0.58	0.4	0.52
Smo73417	0.8	0.93	1.0	0.81	0.97	0.89	0.64	0.68	0.64	0.66	0.7	0.63	0.43	0.52	0.41	0.47	0.35	0.46	0.49	0.07	0.24	0.03	0.57	0.54	0.13	0.33	0.4	0.41	0.36	0.37	0.41	0.43
Smo74587	0.96	1.0	0.94	1.0	0.89	0.7	0.68	0.72	0.63	0.82	0.69	0.74	0.27	0.24	0.24	0.43	0.61	0.32	0.61	0.01	0.01	0.01	0.62	0.59	0.01	0.8	0.55	0.52	0.6	0.63	0.55	0.51
Smo79692	0.96	1.0	0.77	0.74	0.84	0.79	0.75	0.71	0.74	0.93	0.79	0.87	0.63	0.57	0.55	0.72	0.43	0.45	0.69	0.1	0.16	0.01	0.51	0.5	0.06	0.88	0.83	0.82	0.52	0.52	0.64	0.7
Smo82283	0.8	0.98	0.98	0.85	0.84	0.94	1.0	0.71	0.7	0.81	0.68	0.75	0.6	0.78	0.75	0.72	0.6	0.47	0.54	0.1	0.18	0.3	0.52	0.57	0.14	0.53	0.68	0.73	0.51	0.58	0.47	0.46
Smo83164	0.69	0.82	0.77	0.74	0.62	0.4	0.44	0.46	0.48	0.54	0.53	0.55	0.23	0.18	0.09	0.37	0.23	0.19	0.33	0.03	0.17	0.01	0.41	0.46	0.16	1.0	0.5	0.54	0.33	0.36	0.35	0.42
Smo85691	1.0	0.87	0.8	0.86	0.86	0.89	0.72	0.86	0.91	0.97	0.86	0.85	0.73	0.87	0.61	0.68	0.6	0.42	0.65	0.13	0.1	0.03	0.64	0.59	0.27	0.48	0.58	0.5	0.58	0.62	0.58	0.56
Smo94334	0.99	0.95	0.99	0.92	0.88	0.91	0.77	0.78	0.9	1.0	0.93	0.89	0.71	0.74	0.64	0.72	0.52	0.43	0.75	0.27	0.45	0.3	0.62	0.58	0.43	0.65	0.54	0.52	0.59	0.57	0.54	0.71
Smo98006	0.99	0.92	0.83	0.84	0.91	0.91	0.83	0.9	0.88	0.93	0.88	0.87	0.63	0.72	0.74	0.66	0.52	0.56	0.73	0.05	0.09	0.0	0.65	0.61	0.21	0.88	0.93	1.0	0.62	0.6	0.77	0.82

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)