1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_155 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.07 0.16 0.18 0.21 0.19 0.14 0.18 0.16 0.17 0.13 0.12 0.11 1.0 0.38 0.08 0.82 0.13 0.36 0.41 0.06 0.06 0.01 0.86 0.91 0.18 0.31 0.27 0.26 0.16 0.17 0.15 0.22
0.52 0.59 0.54 0.47 0.42 0.43 0.37 0.4 0.43 0.46 0.47 0.45 0.88 0.77 0.28 1.0 0.45 0.49 0.57 0.06 0.4 0.06 0.85 0.87 0.61 0.44 0.35 0.32 0.48 0.48 0.57 0.59
0.27 0.33 0.29 0.29 0.32 0.31 0.25 0.23 0.25 0.25 0.24 0.21 0.95 0.54 0.6 1.0 0.17 0.18 0.26 0.25 0.08 0.26 0.45 0.45 0.54 0.3 0.28 0.33 0.22 0.26 0.1 0.12
0.33 0.38 0.41 0.39 0.42 0.41 0.39 0.36 0.32 0.3 0.33 0.27 0.81 0.97 0.89 1.0 0.36 0.44 0.6 0.16 0.11 0.15 0.46 0.56 0.29 0.34 0.41 0.35 0.4 0.42 0.31 0.32
0.07 0.1 0.13 0.11 0.17 0.29 0.09 0.28 0.34 0.22 0.07 0.09 1.0 0.15 0.15 0.81 0.07 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.36 0.95 0.05 0.2 0.07 0.25 0.18 0.27 0.09 0.03
0.65 0.61 0.49 0.53 0.57 0.45 0.38 0.44 0.64 0.51 0.59 0.55 0.94 0.68 0.39 1.0 0.4 0.43 0.73 0.1 0.19 0.2 0.67 0.83 0.59 0.91 0.6 0.5 0.48 0.52 0.71 0.72
0.54 0.69 0.48 0.44 0.41 0.34 0.29 0.2 0.2 0.19 0.24 0.32 0.76 0.67 0.56 1.0 0.52 0.41 0.57 0.04 0.1 0.04 0.56 0.67 0.27 0.16 0.42 0.56 0.34 0.41 0.53 0.52
0.29 0.32 0.3 0.34 0.38 0.42 0.27 0.28 0.3 0.27 0.26 0.22 0.7 1.0 0.91 0.81 0.3 0.27 0.77 0.14 0.14 0.02 0.48 0.43 0.58 0.25 0.31 0.33 0.43 0.46 0.19 0.2
0.22 0.22 0.2 0.18 0.22 0.17 0.17 0.16 0.2 0.19 0.18 0.19 1.0 0.75 0.21 1.0 0.29 0.39 0.75 0.24 0.18 0.15 0.35 0.41 0.35 0.35 0.22 0.21 0.34 0.35 0.29 0.27
0.39 0.44 0.45 0.48 0.5 0.48 0.45 0.5 0.48 0.45 0.48 0.42 0.91 0.66 1.0 0.85 0.46 0.43 0.65 0.3 0.39 0.35 0.7 0.74 0.48 0.68 0.56 0.55 0.53 0.56 0.55 0.52
0.17 0.17 0.18 0.18 0.22 0.19 0.17 0.17 0.21 0.2 0.2 0.17 0.7 0.61 0.47 0.78 0.24 0.23 0.56 0.1 0.11 0.09 0.6 1.0 0.38 0.43 0.29 0.28 0.3 0.32 0.24 0.35
0.66 0.55 0.55 0.6 0.65 0.73 0.62 0.59 0.61 0.65 0.57 0.52 0.84 0.91 0.52 1.0 0.41 0.35 0.76 0.4 0.19 0.54 0.76 0.84 0.15 0.59 0.65 0.72 0.48 0.49 0.48 0.47
0.36 0.38 0.43 0.4 0.45 0.41 0.25 0.27 0.32 0.35 0.37 0.31 1.0 0.67 0.39 0.87 0.26 0.31 0.44 0.02 0.15 0.18 0.53 0.71 0.41 0.24 0.19 0.18 0.29 0.32 0.34 0.43
0.39 0.5 0.57 0.5 0.58 0.68 0.56 0.56 0.42 0.44 0.42 0.34 0.84 0.87 0.72 0.95 0.58 0.61 1.0 0.31 0.37 0.43 0.79 0.87 0.32 0.38 0.51 0.55 0.51 0.53 0.38 0.43
0.19 0.26 0.33 0.35 0.42 0.42 0.34 0.23 0.26 0.23 0.23 0.14 0.75 0.86 0.01 1.0 0.4 0.29 0.47 0.05 0.28 0.01 0.55 0.54 0.18 0.34 0.42 0.56 0.29 0.34 0.18 0.26
0.3 0.39 0.33 0.3 0.31 0.29 0.29 0.2 0.25 0.24 0.24 0.19 0.53 0.69 0.59 1.0 0.25 0.41 0.84 0.11 0.14 0.11 0.73 0.76 0.12 0.3 0.23 0.29 0.28 0.32 0.14 0.18
0.22 0.19 0.2 0.21 0.23 0.21 0.17 0.24 0.24 0.25 0.24 0.23 1.0 0.6 0.18 0.63 0.13 0.15 0.26 0.12 0.18 0.46 0.35 0.58 0.34 0.34 0.23 0.23 0.19 0.2 0.21 0.19
0.45 0.46 0.5 0.5 0.59 0.51 0.43 0.47 0.43 0.4 0.42 0.36 0.84 0.79 0.82 1.0 0.47 0.48 0.67 0.15 0.29 0.46 0.67 0.76 0.61 0.58 0.61 0.56 0.46 0.49 0.47 0.53
0.29 0.42 0.33 0.37 0.41 0.35 0.28 0.28 0.22 0.21 0.22 0.21 0.9 1.0 0.82 0.79 0.28 0.33 0.52 0.1 0.06 0.09 0.44 0.48 0.16 0.16 0.21 0.11 0.27 0.28 0.19 0.21
0.31 0.33 0.4 0.43 0.42 0.42 0.4 0.37 0.37 0.37 0.34 0.3 1.0 0.97 0.88 0.91 0.28 0.16 0.37 0.04 0.23 0.02 0.4 0.37 0.49 0.51 0.4 0.37 0.27 0.3 0.14 0.15
0.44 0.46 0.43 0.48 0.5 0.49 0.36 0.4 0.37 0.39 0.36 0.36 0.89 1.0 0.9 0.9 0.36 0.34 0.74 0.19 0.2 0.11 0.56 0.54 0.71 0.49 0.53 0.53 0.43 0.43 0.39 0.45
0.4 0.53 0.45 0.42 0.4 0.45 0.27 0.22 0.29 0.29 0.35 0.25 1.0 0.77 0.65 0.92 0.31 0.27 0.53 0.13 0.05 0.04 0.43 0.47 0.11 0.19 0.25 0.21 0.31 0.38 0.23 0.23
0.39 0.44 0.44 0.51 0.48 0.5 0.47 0.41 0.49 0.51 0.43 0.45 0.86 1.0 0.76 0.82 0.45 0.42 0.53 0.32 0.32 0.28 0.67 0.77 0.52 0.35 0.21 0.26 0.47 0.52 0.3 0.25
0.27 0.22 0.23 0.25 0.29 0.28 0.27 0.27 0.29 0.28 0.28 0.23 0.78 0.82 0.29 1.0 0.28 0.29 0.59 0.19 0.23 0.12 0.45 0.54 0.3 0.47 0.24 0.33 0.35 0.43 0.21 0.18
0.55 0.56 0.56 0.53 0.41 0.52 0.47 0.54 0.6 0.61 0.62 0.57 0.94 0.91 0.79 0.91 0.42 0.8 0.84 0.5 0.39 0.42 0.99 1.0 0.19 0.34 0.28 0.26 0.55 0.54 0.48 0.54
0.15 0.22 0.24 0.23 0.27 0.26 0.24 0.21 0.21 0.19 0.19 0.16 0.42 0.62 0.6 1.0 0.17 0.26 0.57 0.05 0.06 0.3 0.43 0.77 0.28 0.32 0.36 0.47 0.19 0.28 0.17 0.24
0.16 0.22 0.18 0.19 0.19 0.18 0.14 0.15 0.15 0.2 0.16 0.16 1.0 0.69 0.06 0.8 0.26 0.25 0.16 0.0 0.05 0.01 0.67 0.83 0.4 0.25 0.16 0.2 0.3 0.28 0.3 0.27
0.16 0.14 0.17 0.12 0.25 0.16 0.1 0.06 0.1 0.11 0.13 0.11 1.0 0.31 0.11 0.73 0.06 0.09 0.1 0.01 0.02 0.0 0.29 0.57 0.29 0.16 0.2 0.14 0.11 0.11 0.1 0.1
0.06 0.09 0.1 0.09 0.08 0.06 0.04 0.07 0.04 0.05 0.08 0.07 1.0 0.26 0.04 0.76 0.04 0.3 0.58 0.0 0.1 0.0 0.18 0.31 0.18 0.14 0.12 0.15 0.09 0.14 0.07 0.06
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.4 0.16
0.21 0.28 0.25 0.25 0.29 0.24 0.25 0.23 0.26 0.22 0.21 0.2 0.65 0.94 0.73 1.0 0.26 0.05 0.81 0.0 0.0 0.0 0.54 0.58 0.2 0.2 0.22 0.35 0.24 0.27 0.2 0.23
0.09 0.03 0.07 0.15 0.07 0.23 0.17 0.18 0.2 0.17 0.1 0.11 1.0 0.36 0.31 0.81 0.06 0.12 0.09 0.0 0.01 0.02 0.34 0.94 0.08 0.1 0.22 0.1 0.15 0.22 0.09 0.08
0.74 0.78 0.64 0.51 0.47 0.43 0.37 0.29 0.32 0.29 0.36 0.37 0.78 0.91 0.87 1.0 0.64 0.85 0.4 0.17 0.25 0.04 0.69 0.61 0.11 0.18 0.27 0.24 0.5 0.53 0.65 0.49
0.26 0.3 0.23 0.24 0.36 0.26 0.21 0.22 0.32 0.2 0.25 0.22 0.44 1.0 0.71 0.57 0.27 0.31 0.77 0.15 0.27 0.16 0.42 0.71 0.2 0.41 0.56 0.6 0.28 0.34 0.27 0.39
0.38 0.39 0.46 0.5 0.58 0.61 0.52 0.53 0.53 0.55 0.47 0.41 0.87 0.61 0.42 1.0 0.33 0.29 0.54 0.26 0.13 0.5 0.62 0.91 0.34 0.31 0.34 0.37 0.57 0.56 0.25 0.27
0.1 0.1 0.1 0.1 0.09 0.11 0.1 0.1 0.13 0.12 0.1 0.1 0.35 0.53 0.3 0.83 0.16 0.23 0.86 0.29 0.2 0.23 0.54 1.0 0.11 0.51 0.43 0.33 0.24 0.28 0.23 0.26
0.39 0.44 0.43 0.4 0.39 0.38 0.33 0.37 0.41 0.41 0.37 0.37 0.92 0.9 0.75 1.0 0.3 0.32 0.47 0.04 0.1 0.0 0.46 0.47 0.58 0.36 0.4 0.45 0.35 0.41 0.23 0.28
0.09 0.05 0.01 0.06 0.08 0.08 0.07 0.09 0.06 0.06 0.09 0.11 0.88 0.11 0.11 1.0 0.05 0.16 0.31 0.01 0.0 0.4 0.27 0.36 0.15 0.29 0.19 0.25 0.1 0.1 0.09 0.06
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.2 0.12 0.29 0.0 0.27 0.12 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.22 0.29 0.0 0.21 0.11 0.11 0.1
0.04 0.0 0.14 0.08 0.0 0.04 0.08 0.29 0.0 0.0 0.05 0.04 0.42 0.3 0.0 0.67 0.05 0.12 1.0 0.0 0.46 0.0 0.52 0.64 0.0 0.3 0.48 0.44 0.0 0.05 0.53 0.05
0.19 0.25 0.21 0.22 0.31 0.28 0.25 0.21 0.29 0.27 0.26 0.22 0.95 0.8 0.84 1.0 0.14 0.15 0.61 0.05 0.14 0.12 0.58 0.82 0.42 0.2 0.21 0.17 0.21 0.27 0.18 0.2
0.33 0.44 0.49 0.48 0.47 0.7 0.39 0.32 0.18 0.3 0.3 0.17 0.96 0.99 0.34 0.67 0.4 0.44 0.81 0.05 0.38 0.07 1.0 0.95 0.29 0.16 0.27 0.29 0.24 0.29 0.26 0.41
0.28 0.26 0.3 0.33 0.44 0.48 0.51 0.41 0.23 0.24 0.2 0.2 0.59 0.95 0.57 1.0 0.43 0.21 0.42 0.05 0.09 0.12 0.49 0.61 0.22 0.24 0.33 0.34 0.36 0.39 0.38 0.25
0.42 0.44 0.31 0.4 0.33 0.35 0.28 0.3 0.27 0.34 0.33 0.33 1.0 0.7 0.16 0.88 0.1 0.12 0.24 0.0 0.12 0.0 0.4 0.57 0.36 0.26 0.25 0.22 0.12 0.13 0.54 0.39
0.03 0.04 0.06 0.05 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.08 0.01 0.02 0.36 0.74 0.41 1.0 0.05 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.37 0.66 0.02 0.02 0.07 0.1 0.15 0.28 0.08 0.1
0.27 0.31 0.34 0.3 0.28 0.31 0.27 0.24 0.29 0.27 0.3 0.27 0.91 0.68 0.78 1.0 0.36 0.29 0.83 0.21 0.12 0.21 0.66 0.81 0.24 0.38 0.25 0.29 0.35 0.4 0.24 0.24
0.1 0.16 0.18 0.23 0.28 0.28 0.31 0.21 0.16 0.15 0.11 0.09 1.0 1.0 0.08 0.93 0.26 0.23 0.45 0.02 0.23 0.02 0.66 0.55 0.39 0.22 0.25 0.3 0.19 0.19 0.1 0.14
0.37 0.35 0.32 0.32 0.4 0.38 0.18 0.15 0.14 0.11 0.11 0.11 0.15 0.91 0.29 0.34 0.46 0.29 0.73 0.12 0.27 0.01 0.58 1.0 0.25 0.17 0.6 0.49 0.23 0.37 0.46 0.27
0.09 0.16 0.2 0.45 0.4 0.56 0.2 0.34 0.13 0.21 0.13 0.1 0.59 0.15 0.32 1.0 0.09 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.68 0.98 0.04 0.07 0.08 0.03 0.37 0.14 0.19 0.16
0.1 0.1 0.12 0.12 0.14 0.12 0.07 0.1 0.08 0.11 0.11 0.08 1.0 0.57 0.55 0.86 0.02 0.04 0.04 0.01 0.11 0.04 0.28 0.75 0.14 0.19 0.12 0.18 0.06 0.11 0.03 0.04
0.3 0.33 0.26 0.27 0.29 0.27 0.23 0.17 0.23 0.2 0.18 0.16 0.68 0.82 0.39 1.0 0.32 0.24 0.57 0.02 0.04 0.06 0.64 0.79 0.13 0.14 0.3 0.25 0.3 0.33 0.36 0.26
0.11 0.06 0.08 0.09 0.09 0.12 0.06 0.07 0.13 0.15 0.15 0.08 0.7 1.0 0.74 0.73 0.08 0.18 0.48 0.0 0.0 0.0 0.18 0.29 0.02 0.17 0.13 0.12 0.13 0.12 0.11 0.15
0.17 0.18 0.19 0.25 0.24 0.34 0.35 0.34 0.28 0.28 0.2 0.2 1.0 0.34 0.79 0.59 0.24 0.39 0.43 0.14 0.08 0.05 0.43 0.58 0.48 0.33 0.46 0.59 0.32 0.37 0.15 0.15
0.09 0.06 0.06 0.08 0.07 0.14 0.12 0.11 0.16 0.17 0.1 0.1 1.0 0.48 0.45 0.88 0.05 0.1 0.07 0.0 0.0 0.32 0.31 0.93 0.14 0.13 0.22 0.23 0.13 0.17 0.09 0.08
0.12 0.16 0.2 0.22 0.28 0.29 0.25 0.23 0.2 0.2 0.17 0.15 1.0 0.49 0.61 1.0 0.23 0.29 0.51 0.18 0.09 0.33 0.54 0.79 0.48 0.38 0.57 0.58 0.24 0.31 0.18 0.22
0.18 0.21 0.2 0.3 0.3 0.38 0.47 0.48 0.36 0.31 0.28 0.22 0.53 0.86 1.0 0.51 0.3 0.26 0.73 0.24 0.13 0.05 0.43 0.53 0.73 0.38 0.58 0.48 0.42 0.54 0.27 0.23
0.08 0.14 0.04 0.06 0.0 0.17 0.16 0.16 0.02 0.12 0.08 0.13 0.6 0.55 0.88 1.0 0.4 0.08 0.44 0.0 0.05 0.0 0.42 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.29 0.16 0.12
0.3 0.28 0.31 0.36 0.36 0.39 0.42 0.39 0.48 0.44 0.37 0.37 0.66 1.0 0.82 0.7 0.39 0.25 0.59 0.22 0.09 0.1 0.38 0.43 0.48 0.41 0.25 0.45 0.44 0.54 0.18 0.07
0.23 0.23 0.25 0.24 0.22 0.25 0.23 0.25 0.25 0.23 0.24 0.21 0.63 1.0 0.54 0.72 0.22 0.14 0.65 0.44 0.18 0.47 0.51 0.92 0.18 0.43 0.47 0.46 0.23 0.27 0.2 0.26
0.04 0.07 0.08 0.28 0.0 0.11 0.57 0.22 0.3 0.06 0.08 0.12 0.04 0.0 0.02 0.91 0.08 0.14 0.35 0.0 0.0 0.0 0.75 1.0 0.0 0.16 0.06 0.0 0.25 0.25 0.13 0.05
0.1 0.14 0.16 0.18 0.27 0.13 0.11 0.13 0.1 0.1 0.16 0.06 0.63 1.0 0.88 0.86 0.16 0.06 0.54 0.0 0.0 0.0 0.17 0.14 0.34 0.25 0.3 0.3 0.24 0.31 0.26 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)