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Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.07 0.2 -0.04 -0.1 0.19 0.16 -0.06 0.05 0.21 0.24 0.23 -0.12 0.39 -0.55 -0.31 0.6 -0.12 0.39 0.05 -0.21 -1.46 -3.14 0.11 -0.14 0.04 -0.22 -0.0 -0.26 -0.16 0.01 0.53 0.32
-1.01 -0.72 -0.81 0.12 -0.7 -0.85 -0.62 -0.32 -0.32 0.87 0.69 0.34 1.87 -1.73 -2.53 1.24 0.09 -0.29 1.91 -2.29 - - -0.98 0.72 0.68 -0.72 -0.41 0.47 0.08 -0.72 -1.34 -2.41
0.33 0.22 0.08 0.18 0.11 0.26 0.09 0.2 0.3 0.32 0.23 0.28 0.24 -0.16 0.09 0.21 -0.63 -0.78 -0.04 0.6 -0.88 -1.32 -0.46 -0.52 -0.07 0.13 -0.19 -0.08 -0.25 -0.09 0.08 -0.13
0.11 0.17 0.2 0.36 0.76 0.38 -0.15 -0.13 -0.13 0.12 0.2 0.11 0.55 0.16 -0.12 0.72 -0.08 -0.95 0.61 -0.27 -0.85 -0.79 -0.04 0.3 -1.05 0.13 -0.26 -0.43 -0.47 -0.29 -0.75 -0.43
-0.04 0.05 -0.06 0.15 0.09 0.02 0.33 0.34 0.45 0.48 0.27 0.26 -0.05 -0.21 0.78 -0.01 0.08 -0.25 0.13 -0.23 - - -0.05 -0.05 -3.89 -0.6 0.11 -0.17 0.32 0.47 0.39 0.27
-0.32 0.04 0.11 0.28 0.41 0.85 0.9 0.37 0.12 -0.04 -0.53 -0.51 -0.53 -0.65 1.12 -0.34 -0.26 0.1 0.07 -0.07 -3.08 -1.58 -0.02 0.09 -0.43 -0.52 0.74 0.7 -0.34 -0.15 -0.92 -1.11
0.15 -0.06 0.2 0.05 0.03 0.28 0.09 -0.06 0.27 0.09 0.06 -0.0 0.04 -0.1 0.62 0.1 -0.12 -0.27 0.58 0.7 -4.51 -3.38 -0.06 0.14 -0.56 -0.23 0.31 0.43 -0.08 -0.01 -0.65 -0.26
-0.37 -1.05 -0.86 -1.48 0.36 0.06 0.71 0.27 0.11 0.84 -1.1 -0.42 2.74 -0.89 -0.54 1.38 -0.72 -2.06 -0.77 0.86 - -4.75 -1.54 -0.99 -9.16 -0.4 0.78 0.39 -1.09 -0.39 -1.19 -1.03
0.21 0.21 0.07 0.03 0.2 0.39 0.13 0.15 0.1 0.24 0.15 0.1 0.11 0.1 -0.15 0.36 -0.27 -0.01 0.38 0.08 -0.82 -1.09 0.0 -0.03 -0.39 -0.08 -0.15 0.06 -0.27 -0.15 -0.31 -0.29
0.44 0.29 0.37 0.16 0.09 0.08 -0.19 -0.43 -0.13 -0.11 -0.29 -0.46 0.3 0.56 0.19 -0.17 0.55 0.38 0.72 -0.55 -1.09 -2.61 0.02 -0.6 0.39 -1.44 -0.19 -0.16 0.04 0.26 -0.08 0.17
0.15 -0.07 0.02 0.03 -0.25 -0.32 -0.3 0.14 0.23 0.46 0.36 0.25 0.64 -0.07 -1.72 0.6 -1.01 -0.16 0.75 -0.34 -0.95 -4.42 0.24 0.3 -1.93 0.54 -0.22 -0.64 0.06 -0.08 0.37 0.73
0.0 -0.08 0.0 -0.06 -0.08 -0.1 0.16 0.48 0.63 0.79 0.71 0.57 0.18 0.03 -0.19 0.28 -0.52 -0.48 -0.09 0.11 -1.37 -0.15 -0.18 -0.42 -1.97 0.28 -0.51 -0.49 -0.06 -0.02 -0.15 -0.01
0.14 -0.18 -0.31 -0.26 -0.29 -0.23 -0.08 -0.0 0.11 -0.05 0.03 -0.17 0.05 0.79 0.43 0.05 -0.04 0.43 0.86 -0.06 -2.81 -3.91 -0.18 -0.22 0.2 -0.52 -0.67 -0.67 0.14 0.37 0.63 0.64
0.19 0.18 0.2 0.23 0.49 0.14 0.25 0.33 0.38 0.55 0.34 0.33 0.33 0.03 0.13 0.29 -0.1 -0.85 -0.14 0.24 -1.57 -2.13 0.35 0.62 -1.03 -0.32 -1.01 -0.8 -0.01 0.03 -0.68 -0.68
0.16 0.15 0.15 0.14 0.2 0.21 0.23 0.36 0.4 0.42 0.35 0.26 -0.08 -0.32 0.07 0.08 -0.4 -0.69 0.13 0.46 -1.65 -3.25 0.06 0.14 -1.23 0.42 0.18 0.28 -0.31 -0.26 -0.39 -0.19
-0.47 -0.52 -0.26 -0.29 -0.08 -0.2 -0.16 0.02 0.09 -0.01 0.23 -0.16 0.31 0.3 -0.47 0.51 -0.25 -0.23 -0.13 0.32 -0.28 -1.12 0.43 0.39 -0.86 0.93 0.08 0.23 -0.16 -0.23 0.09 0.22
0.87 0.45 0.2 0.05 -0.03 -0.14 -0.21 -0.15 -0.14 -0.06 -0.03 0.28 0.29 0.35 0.38 0.36 -0.49 -0.31 -0.02 0.55 -0.53 -1.51 -0.09 -0.02 -0.07 -0.11 -0.34 -0.16 -0.21 -0.1 -0.36 -0.41
0.31 0.16 0.26 0.28 0.11 -0.16 0.24 0.41 0.46 0.79 0.79 0.53 0.89 -0.56 -4.94 -0.37 -0.03 0.43 -2.06 0.04 -0.9 -4.47 -0.18 -0.41 -0.67 0.57 0.33 -0.01 -0.35 -0.45 -0.48 -0.5
-0.43 -0.44 -0.53 -0.28 0.58 -0.03 -0.61 -0.57 -0.03 -0.35 -0.34 -0.81 -0.0 -0.62 -0.7 0.87 0.13 0.16 0.98 -0.38 -1.65 -6.39 0.95 0.76 -0.61 0.75 0.23 0.55 0.29 0.32 -0.2 -0.39
0.23 0.27 0.12 0.39 0.42 0.72 0.86 0.28 0.52 0.32 0.47 0.38 -0.75 -0.48 0.37 -0.08 -0.08 -0.3 0.13 -0.88 -1.03 -3.06 -0.35 -0.49 -0.31 -0.77 0.02 0.34 -0.62 -0.29 -0.27 -0.27
0.4 0.19 0.12 0.39 0.35 0.35 0.11 0.36 0.34 0.25 0.13 0.28 -0.1 -0.31 -0.79 -0.0 -0.16 -0.06 -0.39 -0.45 -1.08 -5.52 -0.02 0.06 -0.2 0.26 0.37 0.25 0.14 -0.06 -0.28 -0.22
0.08 -0.03 -0.08 -0.16 -0.15 0.25 0.5 0.52 0.78 0.8 0.75 0.56 -0.73 -0.9 -0.07 -0.55 -0.13 -0.13 -0.04 -0.45 -1.34 -3.37 0.04 -0.18 -2.32 0.13 0.3 0.43 -0.08 0.01 -0.12 0.18
-0.21 -0.1 -0.13 0.02 -0.27 -0.06 -0.16 -0.05 -0.16 0.02 0.05 -0.09 0.47 -0.35 -0.09 0.54 -0.1 -0.11 0.49 -0.74 -1.75 -2.66 0.21 0.24 -0.45 0.42 0.33 0.33 -0.02 0.05 0.47 0.62
-0.17 0.01 0.32 0.14 -0.0 0.46 0.23 0.4 0.53 0.52 0.41 0.19 0.54 0.75 -0.01 0.54 -0.71 -0.7 -0.95 -0.02 -1.56 -3.95 0.44 0.22 -0.07 -0.75 -0.36 -0.17 -0.34 -0.4 -0.57 -0.21
0.35 0.23 0.45 0.59 0.45 0.61 0.47 0.45 0.19 0.5 0.42 0.33 -0.27 -0.45 -0.12 0.13 -0.17 -0.5 0.24 -0.58 -1.93 -3.89 0.01 -0.17 -0.75 -0.63 -0.39 -0.26 0.17 0.11 -0.31 -0.33
-0.43 -0.04 0.63 0.73 0.53 0.26 0.76 0.49 0.76 0.26 0.24 -0.18 -0.4 -1.1 -2.26 -0.82 0.34 -0.28 0.89 -9.07 - 0.64 0.75 0.95 -7.21 -0.67 -0.91 -0.68 -0.08 0.05 -0.15 -0.77
-0.72 -1.21 -1.93 -1.38 -1.95 -0.88 -0.55 -1.23 -0.01 -0.68 -0.61 -0.72 1.71 -1.07 -2.49 1.35 -0.93 -0.85 2.2 0.92 1.05 - -2.08 -1.63 0.91 -1.13 0.35 -0.13 -0.54 -0.05 -0.55 0.99
-0.72 -0.34 0.34 0.45 0.09 0.48 0.4 0.52 0.72 0.19 0.16 -0.3 -0.41 -0.39 0.18 -0.23 0.3 -0.28 -0.22 -4.25 -3.45 0.75 1.07 0.91 -1.72 0.19 -0.13 -0.54 -0.21 -0.32 -0.7 -0.99
-0.52 -0.05 0.18 0.3 0.56 0.61 0.54 0.52 0.4 0.41 0.1 -0.31 -0.21 -1.32 0.95 -0.17 -0.37 -0.15 0.32 -0.23 -7.64 -0.83 0.35 0.42 -0.27 -0.42 0.17 0.32 -0.21 -0.04 -1.82 -1.14
-0.34 0.11 -0.49 -0.06 -0.14 -0.2 -0.03 -0.37 -0.08 -0.36 -0.69 -0.26 0.88 0.2 0.23 1.25 0.26 0.03 1.16 -0.26 - - 0.44 0.49 -3.8 0.24 0.12 0.27 0.25 0.33 -0.74 -0.86
-0.62 -0.81 -0.37 -0.71 -0.26 -0.54 -0.67 -0.23 0.01 -0.39 -0.02 -0.54 2.21 -0.14 -0.6 0.55 -0.18 0.34 -0.1 0.87 -0.49 0.29 -0.19 -0.46 -0.06 -0.02 -0.09 0.2 -0.26 -0.2 -0.89 -0.92
-1.19 -0.05 -0.2 -0.52 1.12 0.91 1.17 0.64 0.67 0.32 0.07 -1.1 -0.05 -2.68 1.37 -0.37 -0.04 0.42 0.39 -0.49 -2.97 -2.12 0.09 0.22 -0.2 -1.56 -0.1 -1.26 -0.01 0.09 -1.62 -1.14
0.4 0.25 0.35 0.33 0.43 0.51 0.32 -0.02 0.43 0.48 0.29 0.1 -0.08 -0.3 0.28 0.04 0.11 -0.28 0.33 0.44 -0.84 -1.38 0.07 -0.18 -1.98 -0.62 -0.48 -0.45 -0.25 -0.08 -0.54 -0.57
-0.42 -0.26 -0.09 -0.08 -0.18 0.11 0.37 0.5 0.59 0.65 0.34 0.16 0.65 0.86 -1.27 0.63 -0.11 -0.32 -0.83 -0.27 -0.16 -2.03 -0.51 -0.84 0.89 -0.79 0.34 0.17 -0.37 -0.61 -0.39 -0.98
-0.52 0.07 -0.53 -0.48 -0.01 -0.62 -0.49 -0.77 0.21 0.58 -0.04 0.09 0.96 -0.12 -4.19 1.96 -0.63 -0.71 1.18 0.68 -0.69 - 0.22 -0.1 -0.93 0.97 -0.3 -0.33 -0.38 -0.11 -1.22 -1.49
-0.15 -0.16 0.13 -0.03 -0.14 0.02 -0.37 -0.37 -0.16 -0.09 -0.26 -0.42 0.52 0.89 0.93 0.63 -0.61 -0.2 0.76 0.01 -2.25 -0.76 -0.27 -0.15 0.74 -0.15 -0.35 -0.96 -0.9 -0.65 0.25 0.6
0.12 -0.41 -0.28 -0.3 -0.21 -0.09 0.02 0.33 0.48 0.3 0.3 0.32 -0.02 -0.56 -0.22 0.06 -0.48 0.16 -0.12 -0.54 -0.77 -0.44 0.07 0.29 -2.02 0.85 0.22 -0.08 0.01 -0.14 0.28 0.52
0.47 -0.28 -0.21 -0.03 0.4 0.21 0.56 0.66 0.71 0.61 0.58 0.6 -0.78 -1.72 -0.39 -0.21 0.06 -0.38 0.26 -0.01 -5.48 - 0.06 0.09 -4.76 -0.92 -0.27 -0.78 0.24 0.31 0.8 0.53
-0.01 -0.32 -0.04 -0.27 -0.15 0.22 0.15 -0.01 0.18 0.37 0.36 0.13 1.06 -0.05 -1.86 0.82 -0.69 -0.6 0.91 -0.79 0.14 -2.66 0.49 0.26 0.1 0.16 -0.76 -0.22 -0.14 0.17 -0.96 -0.84
0.2 0.31 0.28 0.16 0.18 0.18 0.12 0.03 0.23 0.13 0.2 0.22 -0.04 0.38 0.42 -0.05 -0.62 -0.53 0.45 0.0 -2.09 -2.92 -0.25 -0.16 -0.33 -0.1 0.26 -0.0 -0.32 -0.27 0.11 0.39
0.11 -0.07 -0.12 -0.16 0.08 -0.01 0.09 0.33 0.26 0.43 0.28 0.02 0.16 -0.03 0.27 0.27 -0.55 -0.03 0.24 0.21 -0.59 -0.34 -0.13 0.02 -3.08 0.32 -0.06 -0.15 -0.3 -0.15 0.01 0.21
0.18 0.34 0.17 0.62 0.48 0.73 0.36 0.45 0.44 0.38 0.43 0.29 -1.1 -0.97 0.28 -0.79 -0.05 -0.29 -0.14 -1.45 -0.86 -2.79 0.47 0.11 0.03 -0.26 -0.13 -0.19 -0.32 -0.39 -0.19 -0.11
0.3 0.28 0.35 -0.1 0.6 0.07 0.06 0.26 0.6 0.7 0.58 0.48 -2.79 -1.78 0.66 -3.61 -0.99 0.08 1.82 0.94 -1.75 - -0.11 -0.83 -4.04 -0.01 0.01 0.42 -0.78 -0.76 -1.09 -0.76
-0.13 -0.32 0.03 -0.19 0.39 0.21 0.08 0.56 0.4 0.43 0.08 0.04 0.45 -1.38 -0.22 -0.09 -0.62 0.13 0.59 -0.06 0.33 - 0.06 0.37 -0.51 -0.32 -0.36 -1.34 0.11 0.02 0.32 0.33
-0.04 0.36 0.46 0.4 0.73 1.0 0.48 0.35 0.42 0.17 -0.06 -0.3 -0.17 -0.99 0.6 -0.21 -0.43 -0.24 -0.13 0.9 -1.56 -0.41 -0.18 -0.24 -1.44 -0.55 -0.09 0.3 -0.59 -0.52 -1.24 -0.96
0.26 -0.05 -0.01 0.13 0.01 -0.08 0.34 0.33 0.51 0.51 0.36 0.35 0.04 0.4 -1.11 0.42 -0.39 -1.07 0.42 -0.24 -1.93 -6.11 -0.27 -0.12 -1.12 0.67 -0.12 -0.2 -0.26 -0.27 0.73 0.15
0.54 -0.23 0.0 -0.04 0.21 0.11 -0.1 0.51 0.53 0.99 0.98 0.65 0.5 0.01 -0.01 0.2 -1.5 -0.75 0.27 0.07 -2.35 -3.29 -0.31 0.29 -3.32 0.57 -0.36 -0.98 -1.12 -1.04 0.04 0.27
-0.74 -1.45 -1.22 -2.36 -0.47 -0.13 -1.16 -1.12 -0.62 -1.52 -0.36 -0.5 2.81 0.02 -0.87 2.28 -1.38 0.28 0.66 1.87 -2.22 - -1.26 -0.99 -2.39 0.22 -0.86 -0.47 -1.67 -1.14 -1.42 -2.13
-0.66 -1.11 -0.14 -0.27 0.16 -0.42 -0.37 -0.06 -0.27 -0.27 0.05 -0.61 -0.92 0.41 -4.55 -0.19 -1.66 -1.97 -0.72 1.09 -0.19 -6.38 1.49 1.84 1.35 1.37 -0.13 0.37 -1.15 -1.07 -1.7 -1.78
-1.01 -0.72 -0.81 0.12 -0.7 -0.85 -0.62 -0.32 -0.32 0.87 0.69 0.34 1.87 -1.73 -2.53 1.24 0.09 -0.29 1.91 -2.29 - - -0.98 0.72 0.68 -0.72 -0.41 0.47 0.08 -0.72 -1.34 -2.41
-0.13 -0.35 -0.26 -0.35 -0.36 -0.12 -0.04 -0.05 0.11 0.11 0.23 0.04 0.24 -0.37 -0.68 0.3 -0.3 -0.37 0.31 -0.16 0.02 -0.38 -0.17 0.06 -0.29 0.69 -0.09 -0.15 -0.15 -0.03 0.7 0.74
0.03 -0.15 -0.08 -0.25 -0.19 -0.05 -0.03 -0.08 -0.11 0.05 -0.08 -0.21 0.75 0.97 0.28 0.71 -0.72 0.11 0.2 -0.17 -2.45 -5.17 0.67 0.67 0.46 -1.29 -0.62 -1.42 -0.46 -0.46 0.57 0.49
0.34 0.17 -0.09 -0.17 -0.11 -0.24 0.37 0.39 0.62 0.86 0.7 0.68 0.71 0.08 -0.62 0.43 -0.65 -1.37 -0.48 0.11 -1.37 -1.98 -0.24 -0.24 -1.99 0.61 0.06 -0.18 -0.32 -0.45 -0.28 -0.11
0.36 0.25 0.16 0.28 0.26 0.44 0.15 0.22 0.27 0.38 0.1 0.09 0.28 -0.39 -0.16 0.26 -0.23 -0.58 0.1 -0.48 -3.02 -6.05 0.21 0.23 -0.58 -0.55 -0.25 -0.15 -0.43 -0.21 0.6 0.73
-0.18 -0.31 -0.16 -0.7 -0.42 -0.62 -0.21 0.15 0.69 0.39 0.43 0.37 1.02 0.13 0.05 0.82 -0.43 -0.4 0.28 0.83 -1.83 0.43 -0.43 -0.16 -0.93 0.12 -1.19 -0.67 -0.29 -0.34 -0.22 0.03
0.3 -0.37 0.05 -0.27 -0.21 -0.11 0.13 0.47 0.42 0.47 0.58 0.4 -0.24 -0.17 -0.5 0.24 -0.43 0.13 0.06 -0.49 -2.32 -1.12 0.09 0.23 -3.67 0.52 -0.07 -0.4 -0.21 0.05 0.5 0.75
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-0.14 0.17 0.3 0.2 0.1 0.2 0.19 0.26 0.35 0.32 0.34 0.04 -0.13 -0.26 -0.31 0.38 -0.06 -0.78 0.15 -0.52 -1.13 0.33 0.39 0.39 -0.84 0.01 -0.4 -0.23 0.08 0.22 -0.79 -0.54
0.3 0.24 0.33 0.28 0.08 0.17 0.33 0.19 0.43 0.51 0.31 0.41 0.59 0.02 -0.35 0.4 -0.48 -0.53 -0.33 0.24 -1.55 -1.04 0.04 -0.04 -1.57 -0.3 -0.44 -0.47 -0.21 -0.22 -0.01 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.