Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo103199	0.69	0.76	0.64	0.62	0.75	0.74	0.63	0.68	0.76	0.78	0.77	0.61	0.87	0.45	0.53	1.0	0.61	0.87	0.68	0.57	0.24	0.08	0.71	0.6	0.68	0.56	0.66	0.55	0.59	0.66	0.95	0.82
Smo104684	0.13	0.16	0.15	0.29	0.16	0.15	0.17	0.21	0.21	0.48	0.43	0.33	0.97	0.08	0.05	0.63	0.28	0.22	1.0	0.05	0.0	0.0	0.13	0.44	0.43	0.16	0.2	0.37	0.28	0.16	0.1	0.05
Smo110560	0.83	0.77	0.69	0.75	0.71	0.79	0.7	0.75	0.81	0.82	0.77	0.8	0.78	0.59	0.7	0.76	0.43	0.38	0.64	1.0	0.36	0.26	0.48	0.46	0.63	0.72	0.58	0.62	0.55	0.62	0.7	0.6
Smo111112	0.64	0.66	0.68	0.76	1.0	0.77	0.53	0.54	0.54	0.64	0.68	0.64	0.87	0.66	0.55	0.97	0.56	0.31	0.9	0.49	0.33	0.34	0.57	0.73	0.29	0.65	0.49	0.44	0.43	0.48	0.35	0.44
Smo119202	0.57	0.6	0.56	0.65	0.62	0.59	0.74	0.74	0.8	0.81	0.71	0.7	0.56	0.51	1.0	0.58	0.62	0.49	0.64	0.5	0.0	0.0	0.56	0.56	0.04	0.39	0.63	0.52	0.73	0.81	0.77	0.71
Smo121399	0.37	0.47	0.5	0.56	0.61	0.83	0.86	0.6	0.5	0.45	0.32	0.32	0.32	0.29	1.0	0.36	0.39	0.5	0.48	0.44	0.05	0.15	0.45	0.49	0.34	0.32	0.77	0.75	0.36	0.41	0.24	0.21
Smo123901	0.68	0.59	0.71	0.64	0.63	0.75	0.65	0.59	0.74	0.65	0.64	0.61	0.63	0.57	0.95	0.66	0.57	0.51	0.92	1.0	0.03	0.06	0.59	0.68	0.42	0.52	0.76	0.83	0.58	0.61	0.39	0.51
Smo137632	0.12	0.07	0.08	0.05	0.19	0.16	0.24	0.18	0.16	0.27	0.07	0.11	1.0	0.08	0.1	0.39	0.09	0.04	0.09	0.27	0.0	0.01	0.05	0.08	0.0	0.11	0.26	0.2	0.07	0.11	0.07	0.07
Smo139450	0.88	0.88	0.8	0.78	0.88	1.0	0.84	0.84	0.82	0.9	0.85	0.81	0.82	0.81	0.69	0.97	0.63	0.75	0.99	0.8	0.43	0.36	0.76	0.75	0.58	0.72	0.68	0.79	0.63	0.69	0.61	0.62
Smo141980	0.82	0.74	0.78	0.67	0.64	0.64	0.53	0.45	0.55	0.56	0.49	0.44	0.74	0.89	0.69	0.54	0.89	0.79	1.0	0.41	0.28	0.1	0.61	0.4	0.8	0.22	0.53	0.54	0.62	0.73	0.57	0.68
Smo146775	0.66	0.56	0.6	0.6	0.5	0.47	0.48	0.65	0.69	0.81	0.76	0.71	0.92	0.56	0.18	0.9	0.29	0.53	1.0	0.47	0.31	0.03	0.7	0.73	0.16	0.86	0.51	0.38	0.62	0.56	0.77	0.98
Smo154366	0.58	0.55	0.58	0.56	0.55	0.54	0.65	0.81	0.9	1.0	0.95	0.86	0.65	0.59	0.51	0.71	0.4	0.42	0.54	0.62	0.22	0.52	0.51	0.43	0.15	0.7	0.41	0.41	0.56	0.57	0.52	0.58
Smo163585	0.61	0.49	0.45	0.46	0.45	0.47	0.52	0.55	0.59	0.53	0.56	0.49	0.57	0.95	0.74	0.57	0.54	0.74	1.0	0.53	0.08	0.04	0.49	0.47	0.63	0.38	0.35	0.35	0.61	0.71	0.85	0.86
Smo170187	0.74	0.74	0.74	0.76	0.91	0.71	0.77	0.81	0.84	0.95	0.82	0.82	0.81	0.66	0.71	0.8	0.6	0.36	0.59	0.76	0.22	0.15	0.82	1.0	0.32	0.52	0.32	0.37	0.64	0.66	0.41	0.4
Smo171255	0.81	0.81	0.81	0.8	0.84	0.84	0.86	0.94	0.96	0.97	0.93	0.87	0.69	0.58	0.76	0.77	0.55	0.45	0.8	1.0	0.23	0.08	0.76	0.8	0.31	0.97	0.82	0.89	0.59	0.61	0.56	0.64
Smo180035	0.38	0.37	0.44	0.43	0.5	0.46	0.47	0.53	0.56	0.52	0.62	0.47	0.65	0.65	0.38	0.75	0.44	0.45	0.48	0.65	0.43	0.24	0.71	0.69	0.29	1.0	0.56	0.62	0.47	0.45	0.56	0.61
Smo184770	1.0	0.75	0.63	0.56	0.53	0.49	0.47	0.49	0.5	0.52	0.53	0.66	0.67	0.69	0.71	0.7	0.39	0.44	0.54	0.8	0.38	0.19	0.51	0.54	0.52	0.5	0.43	0.49	0.47	0.51	0.42	0.41
Smo231517	0.67	0.6	0.65	0.65	0.58	0.48	0.64	0.72	0.74	0.93	0.93	0.78	1.0	0.37	0.02	0.42	0.53	0.73	0.13	0.55	0.29	0.02	0.47	0.4	0.34	0.8	0.68	0.54	0.42	0.4	0.39	0.38
Smo25564	0.38	0.37	0.35	0.42	0.76	0.5	0.33	0.34	0.5	0.4	0.4	0.29	0.51	0.33	0.31	0.92	0.55	0.57	1.0	0.39	0.16	0.01	0.98	0.86	0.33	0.85	0.59	0.74	0.62	0.63	0.44	0.39
Smo26993	0.65	0.66	0.6	0.72	0.74	0.9	1.0	0.67	0.79	0.69	0.76	0.72	0.33	0.39	0.71	0.52	0.52	0.45	0.6	0.3	0.27	0.07	0.43	0.39	0.44	0.32	0.56	0.7	0.36	0.45	0.46	0.45
Smo35012	1.0	0.86	0.82	0.99	0.96	0.96	0.82	0.97	0.96	0.9	0.83	0.92	0.71	0.61	0.44	0.76	0.68	0.73	0.58	0.56	0.36	0.02	0.75	0.79	0.66	0.91	0.98	0.9	0.83	0.73	0.62	0.65
Smo36171	0.61	0.56	0.54	0.51	0.52	0.68	0.81	0.82	0.98	1.0	0.96	0.84	0.35	0.31	0.55	0.39	0.53	0.52	0.56	0.42	0.23	0.06	0.59	0.51	0.11	0.63	0.71	0.77	0.54	0.58	0.53	0.65
Smo37389	0.56	0.61	0.6	0.66	0.54	0.63	0.58	0.63	0.58	0.66	0.67	0.61	0.9	0.51	0.61	0.94	0.61	0.6	0.91	0.39	0.19	0.1	0.75	0.77	0.48	0.87	0.82	0.82	0.64	0.67	0.9	1.0
Smo403078	0.53	0.6	0.74	0.65	0.59	0.82	0.7	0.78	0.86	0.85	0.79	0.68	0.86	1.0	0.59	0.86	0.36	0.36	0.31	0.59	0.2	0.04	0.8	0.69	0.57	0.35	0.46	0.53	0.47	0.45	0.4	0.51
Smo403279	0.83	0.77	0.89	0.99	0.89	1.0	0.9	0.9	0.75	0.92	0.88	0.82	0.54	0.48	0.6	0.72	0.58	0.46	0.77	0.44	0.17	0.04	0.66	0.58	0.39	0.42	0.5	0.55	0.74	0.71	0.53	0.52
Smo404210	0.38	0.5	0.8	0.86	0.75	0.62	0.87	0.73	0.87	0.62	0.61	0.46	0.39	0.24	0.11	0.29	0.66	0.43	0.96	0.0	0.0	0.81	0.87	1.0	0.0	0.32	0.27	0.32	0.49	0.53	0.47	0.3
Smo406669	0.13	0.09	0.06	0.08	0.06	0.12	0.15	0.09	0.22	0.14	0.14	0.13	0.71	0.1	0.04	0.56	0.11	0.12	1.0	0.41	0.45	0.0	0.05	0.07	0.41	0.1	0.28	0.2	0.15	0.21	0.15	0.43
Smo408692	0.29	0.38	0.6	0.65	0.51	0.66	0.63	0.68	0.79	0.54	0.54	0.39	0.36	0.37	0.54	0.41	0.59	0.39	0.41	0.03	0.04	0.8	1.0	0.9	0.15	0.55	0.44	0.33	0.41	0.38	0.29	0.24
Smo413402	0.36	0.5	0.59	0.64	0.76	0.79	0.75	0.74	0.68	0.69	0.55	0.42	0.45	0.21	1.0	0.46	0.4	0.47	0.65	0.44	0.0	0.29	0.66	0.69	0.43	0.39	0.58	0.65	0.45	0.5	0.15	0.23
Smo413728	0.33	0.45	0.3	0.4	0.38	0.37	0.41	0.33	0.4	0.33	0.26	0.35	0.77	0.48	0.49	1.0	0.5	0.43	0.94	0.35	0.0	0.0	0.57	0.59	0.03	0.5	0.46	0.51	0.5	0.53	0.25	0.23
Smo416325	0.14	0.12	0.17	0.13	0.18	0.15	0.14	0.18	0.22	0.16	0.21	0.15	1.0	0.2	0.14	0.32	0.19	0.27	0.2	0.4	0.15	0.26	0.19	0.16	0.21	0.21	0.2	0.25	0.18	0.19	0.12	0.11
Smo416406	0.17	0.37	0.34	0.27	0.84	0.73	0.87	0.6	0.62	0.48	0.41	0.18	0.37	0.06	1.0	0.3	0.37	0.52	0.51	0.28	0.05	0.09	0.41	0.45	0.34	0.13	0.36	0.16	0.39	0.41	0.13	0.18
Smo422213	0.92	0.84	0.89	0.88	0.94	1.0	0.87	0.69	0.94	0.98	0.86	0.75	0.66	0.57	0.85	0.72	0.76	0.58	0.88	0.95	0.39	0.27	0.74	0.62	0.18	0.46	0.5	0.51	0.59	0.66	0.48	0.47
Smo424766	0.4	0.45	0.51	0.51	0.47	0.58	0.7	0.76	0.81	0.85	0.68	0.6	0.84	0.98	0.22	0.84	0.5	0.43	0.3	0.45	0.48	0.13	0.38	0.3	1.0	0.31	0.68	0.61	0.42	0.35	0.41	0.27
Smo427272	0.18	0.27	0.18	0.18	0.25	0.17	0.18	0.15	0.3	0.38	0.25	0.27	0.5	0.24	0.01	1.0	0.17	0.16	0.58	0.41	0.16	0.0	0.3	0.24	0.13	0.5	0.21	0.2	0.2	0.24	0.11	0.09
Smo427439	0.47	0.47	0.57	0.52	0.48	0.53	0.41	0.41	0.47	0.49	0.44	0.39	0.75	0.98	1.0	0.81	0.34	0.46	0.89	0.53	0.11	0.31	0.44	0.47	0.87	0.47	0.41	0.27	0.28	0.33	0.62	0.8
Smo429621	0.6	0.42	0.46	0.45	0.48	0.52	0.56	0.7	0.77	0.69	0.68	0.69	0.55	0.38	0.48	0.58	0.4	0.62	0.51	0.38	0.33	0.41	0.58	0.68	0.14	1.0	0.65	0.52	0.56	0.51	0.67	0.8
Smo48533	0.8	0.47	0.5	0.56	0.76	0.67	0.84	0.91	0.94	0.87	0.86	0.87	0.34	0.17	0.44	0.5	0.6	0.44	0.69	0.57	0.01	0.0	0.6	0.61	0.02	0.3	0.48	0.33	0.68	0.71	1.0	0.83
Smo64442	0.48	0.38	0.46	0.4	0.43	0.56	0.53	0.47	0.54	0.62	0.61	0.52	1.0	0.46	0.13	0.84	0.3	0.32	0.9	0.28	0.53	0.08	0.67	0.57	0.51	0.54	0.28	0.41	0.43	0.54	0.25	0.27
Smo74004	0.84	0.91	0.89	0.82	0.83	0.83	0.8	0.75	0.86	0.8	0.84	0.85	0.71	0.96	0.98	0.71	0.48	0.51	1.0	0.74	0.17	0.1	0.62	0.66	0.58	0.68	0.88	0.73	0.59	0.61	0.79	0.96
Smo74712	0.8	0.7	0.68	0.66	0.78	0.73	0.79	0.93	0.89	1.0	0.9	0.75	0.83	0.73	0.89	0.89	0.5	0.72	0.87	0.86	0.49	0.58	0.67	0.75	0.09	0.93	0.71	0.67	0.6	0.67	0.75	0.85
Smo75149	0.68	0.76	0.68	0.93	0.84	1.0	0.77	0.82	0.82	0.78	0.81	0.74	0.28	0.31	0.73	0.35	0.58	0.49	0.55	0.22	0.33	0.09	0.83	0.65	0.61	0.5	0.55	0.53	0.48	0.46	0.53	0.55
Smo76631	0.35	0.34	0.36	0.27	0.43	0.3	0.3	0.34	0.43	0.46	0.43	0.4	0.04	0.08	0.45	0.02	0.14	0.3	1.0	0.54	0.08	0.0	0.26	0.16	0.02	0.28	0.29	0.38	0.17	0.17	0.13	0.17
Smo76818	0.6	0.53	0.67	0.58	0.87	0.76	0.7	0.98	0.88	0.89	0.7	0.68	0.91	0.25	0.57	0.62	0.43	0.72	1.0	0.63	0.84	0.0	0.69	0.86	0.47	0.53	0.52	0.26	0.71	0.67	0.82	0.83
Smo80491	0.48	0.64	0.69	0.66	0.83	1.0	0.69	0.64	0.67	0.56	0.48	0.41	0.44	0.25	0.75	0.43	0.37	0.42	0.46	0.93	0.17	0.38	0.44	0.42	0.18	0.34	0.47	0.61	0.33	0.35	0.21	0.26
Smo80744	0.72	0.58	0.6	0.66	0.61	0.57	0.76	0.76	0.86	0.86	0.78	0.77	0.62	0.79	0.28	0.81	0.46	0.29	0.81	0.51	0.16	0.01	0.5	0.55	0.28	0.96	0.55	0.52	0.51	0.5	1.0	0.67
Smo84321	0.73	0.43	0.5	0.49	0.58	0.54	0.47	0.72	0.73	1.0	0.99	0.79	0.71	0.5	0.5	0.58	0.18	0.3	0.61	0.53	0.1	0.05	0.41	0.61	0.05	0.74	0.39	0.25	0.23	0.24	0.52	0.6
Smo84991	0.09	0.05	0.06	0.03	0.1	0.13	0.06	0.07	0.09	0.05	0.11	0.1	1.0	0.15	0.08	0.7	0.05	0.17	0.23	0.52	0.03	0.0	0.06	0.07	0.03	0.17	0.08	0.1	0.04	0.06	0.05	0.03
Smo85976	0.18	0.13	0.25	0.23	0.31	0.21	0.22	0.27	0.23	0.23	0.29	0.18	0.15	0.37	0.01	0.24	0.09	0.07	0.17	0.59	0.24	0.0	0.78	1.0	0.71	0.72	0.25	0.36	0.13	0.13	0.09	0.08
Smo89240	0.13	0.16	0.15	0.29	0.16	0.15	0.17	0.21	0.21	0.48	0.43	0.33	0.97	0.08	0.05	0.63	0.28	0.22	1.0	0.05	0.0	0.0	0.13	0.44	0.43	0.16	0.2	0.37	0.28	0.16	0.1	0.05
Smo89423	0.55	0.47	0.5	0.47	0.47	0.55	0.58	0.58	0.65	0.65	0.7	0.62	0.71	0.46	0.37	0.74	0.49	0.46	0.74	0.54	0.61	0.46	0.53	0.63	0.49	0.96	0.56	0.54	0.54	0.59	0.97	1.0
Smo89585	0.52	0.46	0.48	0.43	0.45	0.49	0.5	0.48	0.47	0.53	0.48	0.44	0.86	1.0	0.62	0.84	0.31	0.55	0.59	0.45	0.09	0.01	0.81	0.81	0.7	0.21	0.33	0.19	0.37	0.37	0.76	0.72
Smo89901	0.7	0.62	0.51	0.49	0.51	0.47	0.71	0.72	0.84	1.0	0.89	0.88	0.9	0.58	0.36	0.74	0.35	0.21	0.39	0.59	0.21	0.14	0.47	0.46	0.14	0.84	0.57	0.49	0.44	0.4	0.45	0.51
Smo90172	0.77	0.72	0.68	0.73	0.73	0.82	0.67	0.71	0.73	0.79	0.65	0.64	0.73	0.46	0.54	0.73	0.51	0.4	0.65	0.43	0.07	0.01	0.7	0.71	0.4	0.41	0.51	0.54	0.45	0.52	0.92	1.0
Smo91230	0.44	0.4	0.44	0.3	0.37	0.32	0.43	0.55	0.79	0.64	0.66	0.64	1.0	0.54	0.51	0.87	0.36	0.37	0.6	0.88	0.14	0.66	0.36	0.44	0.26	0.53	0.21	0.31	0.4	0.39	0.42	0.5
Smo92328	0.73	0.46	0.62	0.49	0.52	0.55	0.65	0.83	0.8	0.83	0.89	0.79	0.5	0.53	0.42	0.7	0.44	0.65	0.62	0.43	0.12	0.27	0.63	0.7	0.05	0.85	0.57	0.45	0.51	0.62	0.84	1.0
Smo92951	0.65	0.55	0.59	0.52	0.5	0.59	0.52	0.53	0.55	0.61	0.62	0.56	1.0	0.9	0.86	0.8	0.39	0.55	0.62	0.83	0.34	0.27	0.79	0.99	0.44	0.54	0.34	0.31	0.44	0.4	0.42	0.53
Smo96490	0.71	0.73	0.74	0.73	0.7	0.73	0.72	0.83	0.83	0.95	1.0	0.94	0.69	0.55	0.4	0.9	0.56	0.65	0.95	0.57	0.21	0.2	0.75	0.8	0.06	0.53	0.39	0.36	0.69	0.67	0.72	0.85
Smo97927	0.69	0.86	0.94	0.88	0.82	0.88	0.87	0.92	0.97	0.96	0.97	0.79	0.7	0.64	0.61	1.0	0.73	0.45	0.85	0.53	0.35	0.96	1.0	1.0	0.43	0.77	0.58	0.65	0.81	0.89	0.44	0.53
Smo98911	0.82	0.78	0.84	0.81	0.7	0.75	0.84	0.76	0.9	0.95	0.83	0.88	1.0	0.68	0.52	0.88	0.48	0.46	0.53	0.79	0.23	0.32	0.68	0.65	0.22	0.54	0.49	0.48	0.57	0.57	0.66	0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)