Heatmap: Cluster_162 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.36 -0.02 0.33 0.54 0.56 0.32 0.52 0.5 0.26 0.16 0.03 0.01 -0.35 0.09 -0.65 0.18 -0.54 -1.23 0.12 -2.49 -1.42 -3.91 -0.24 -0.02 -0.04 0.58 0.71 0.71 -0.32 -0.3 0.09 -0.1
-0.59 -0.72 -0.98 -1.06 0.23 0.95 1.13 1.16 1.04 0.65 -0.77 -0.33 -3.31 -4.58 -0.53 -2.46 -0.67 -1.34 -1.12 -1.9 -0.04 -2.14 -1.09 -1.84 2.13 -0.89 1.12 1.24 -0.29 -0.4 -0.21 -0.75
-1.62 -2.0 -2.62 -1.72 0.44 1.44 1.92 1.26 1.28 0.24 -0.05 0.28 -5.04 -5.33 0.33 -3.17 -0.85 -1.01 -0.59 - -2.91 - -1.8 -1.39 0.39 -0.9 1.63 1.78 -0.46 -0.27 -0.54 -1.52
-1.28 -1.9 -1.05 -1.01 0.26 1.0 1.42 1.44 0.96 0.39 -0.65 -0.74 -2.81 -3.55 -0.86 -2.42 -0.63 -0.14 -1.73 0.83 -1.53 -0.86 -1.08 -1.23 0.9 -1.24 1.36 1.44 -0.21 0.03 -0.29 -0.71
0.03 -0.35 -0.49 -0.45 -0.11 0.03 0.56 0.5 0.8 0.74 0.52 0.28 0.12 -0.09 0.03 -0.16 -0.71 -1.11 -0.17 -2.41 -2.98 0.04 -0.67 -0.44 0.46 0.23 0.38 0.37 -0.48 -0.39 0.15 0.58
-0.3 -0.27 -0.1 0.12 0.21 0.77 0.99 0.69 0.67 0.61 0.25 0.12 0.04 -0.96 -0.61 -0.29 -0.04 -0.2 0.22 0.47 - -5.11 0.01 0.14 -2.13 -0.41 -0.16 0.05 0.45 0.52 -0.6 -0.86
-0.56 -0.73 -0.55 -0.6 0.46 1.07 1.27 0.91 1.07 0.5 0.15 -0.26 -2.83 -3.96 -0.83 -2.19 -0.52 0.07 -0.63 -1.85 -0.54 -3.3 -0.71 -1.07 1.41 -1.1 0.99 0.9 0.08 0.14 -0.2 -0.72
0.18 0.27 0.17 0.12 0.04 0.1 0.03 0.26 0.51 0.49 0.4 0.33 0.01 0.19 -0.11 -0.01 -0.44 -0.75 -0.18 -1.21 -1.07 -1.1 -0.1 0.04 -0.13 0.36 0.34 0.3 -0.48 -0.33 -0.13 -0.04
-0.32 0.01 0.24 0.28 0.34 0.24 0.6 0.31 0.46 0.47 0.24 0.1 -0.78 -0.31 0.48 -0.51 -0.0 -0.03 -0.54 -4.04 -1.16 -3.15 -0.13 0.04 0.52 0.49 0.47 0.85 -0.32 -0.17 -0.74 -0.83
-0.24 -0.01 0.19 0.2 0.09 0.32 0.66 0.5 0.6 0.36 0.33 0.09 -0.91 -0.49 0.45 -0.33 -0.06 -3.24 -0.6 -4.62 -0.51 -0.52 -0.2 -0.19 0.64 0.62 0.66 0.74 -0.37 -0.36 -0.76 -0.65
-1.16 -1.62 -1.07 -1.64 0.08 1.11 1.37 1.27 0.46 0.29 0.28 -0.96 -2.37 -2.87 -0.46 -2.19 -0.5 -0.35 -0.44 -0.84 -1.0 -1.56 -0.69 -1.15 1.3 -0.52 1.31 1.56 0.11 0.18 -0.48 -1.31
-0.39 -0.21 -0.27 0.17 0.64 0.56 0.77 0.67 0.82 0.15 0.39 0.1 -0.91 -0.9 0.39 -0.73 -0.54 -0.3 0.05 - -2.33 - -0.64 -0.53 1.32 -0.4 0.62 0.39 -0.36 -0.0 -0.16 0.03
-0.38 -0.54 -0.61 -0.34 0.48 0.72 1.22 1.06 0.89 0.92 -0.4 0.01 -3.11 -3.39 -0.74 -2.54 -0.54 -0.34 -0.83 -0.03 -2.15 - -0.81 -1.34 -0.2 -0.19 1.61 1.35 0.08 -0.25 -0.09 -0.41
-0.29 -0.33 -0.21 0.19 0.1 0.08 0.44 0.63 0.59 0.62 0.39 0.35 -1.45 0.18 0.37 -0.81 -0.37 -0.66 -0.12 -0.61 -1.59 0.23 -0.41 -0.42 0.06 0.45 0.43 0.37 -0.21 -0.12 -0.37 -0.35
-0.0 0.11 0.09 0.22 0.46 0.49 0.47 0.35 0.35 0.19 0.06 0.06 -0.96 -0.74 -0.46 -0.84 0.09 -0.25 -0.77 -0.5 -0.15 -0.05 -0.5 -0.43 0.68 -0.53 0.55 0.71 -0.12 -0.06 -0.28 -0.45
0.25 0.31 0.25 0.37 0.39 0.28 0.19 0.09 0.14 0.16 0.18 0.02 -0.19 -0.36 -0.06 0.19 -0.13 -0.49 0.27 -1.25 -0.66 -0.9 -0.14 -0.21 -0.13 0.15 0.16 0.47 -0.13 -0.04 -0.21 -0.34
-1.96 -1.66 -1.1 -0.26 0.68 1.22 1.42 1.1 0.22 -0.82 -1.63 -1.83 -2.97 -2.5 -0.19 -2.71 -0.62 -0.82 -0.89 0.61 0.79 0.61 -1.13 -1.59 1.32 -0.89 1.66 1.33 -1.13 -1.15 -1.45 -1.24
0.37 0.16 0.0 0.11 0.21 0.03 0.06 0.25 0.55 0.42 0.43 0.49 -0.86 -1.06 -0.33 -0.3 -0.33 -0.92 0.22 -3.16 -0.26 -1.13 0.12 0.17 0.34 0.18 0.3 0.46 0.05 0.27 -0.26 -0.48
-0.27 -1.03 -0.48 -0.45 -0.02 1.0 1.28 1.2 0.29 0.78 0.7 -0.24 -1.81 -3.8 -0.61 -1.26 0.1 0.4 -0.33 - -4.95 -2.41 -0.05 -0.46 0.94 -1.42 0.36 0.53 0.54 0.89 -0.64 -0.67
-0.27 -1.11 -1.35 -0.04 -1.23 0.76 1.72 1.24 1.19 1.06 0.47 0.58 -1.78 - 0.09 -1.45 -0.28 -0.71 -0.19 - - - -0.04 -0.37 1.21 -3.24 -2.96 0.02 1.09 0.27 -0.01 -0.6
-0.26 0.13 0.12 0.32 0.39 0.29 0.28 0.66 0.49 0.55 0.37 0.28 0.02 -0.12 -1.09 0.16 -0.53 -0.88 -0.23 -1.74 -0.25 -1.72 -0.07 0.17 0.91 0.42 -0.01 0.04 -0.11 -0.28 -0.8 -1.57
0.48 0.43 -0.04 0.33 0.11 0.27 -0.08 0.27 0.25 0.3 0.19 0.36 0.06 0.13 0.01 0.21 -0.5 -1.01 0.24 -0.99 0.13 -2.36 -0.09 0.02 0.37 -0.04 -0.4 0.0 -0.23 -0.21 -0.42 -0.3
0.49 0.32 0.16 0.35 0.26 0.14 -0.02 0.43 0.39 0.47 0.47 0.57 0.34 -0.32 -0.32 -0.16 -0.75 -1.88 -0.33 -1.92 -1.55 -4.0 -0.5 -0.07 0.62 0.37 0.93 0.48 -0.74 -0.67 -0.61 -0.0
0.13 -0.01 0.07 0.14 0.24 0.27 0.11 0.37 0.41 0.54 0.39 0.35 -0.56 -0.67 -0.72 -0.32 -0.2 -0.97 -0.2 -1.96 -0.01 -1.36 0.09 0.36 0.26 0.63 0.12 0.17 0.06 0.13 -0.18 -0.5
-0.28 -0.08 0.05 0.24 0.11 0.18 0.46 0.62 0.45 0.53 0.29 0.18 0.37 0.05 -0.27 0.58 -0.17 -0.42 0.34 -2.76 -2.07 -2.82 -0.05 0.08 0.18 0.43 -0.38 -0.37 0.11 0.06 -0.43 -0.43
0.15 0.07 0.08 0.36 0.41 0.57 0.26 0.37 0.57 0.51 0.33 0.2 -0.22 0.41 -0.95 -0.72 -0.89 -0.49 -0.91 -4.6 -2.15 -0.95 -0.69 -0.39 0.8 0.19 0.74 0.42 -1.37 -0.99 0.36 0.63
-0.03 -0.14 -0.35 -0.2 -0.27 0.13 0.18 0.32 0.47 0.04 0.03 0.14 -2.15 -1.62 -1.45 -2.3 0.43 -1.03 -0.2 -6.75 -0.46 0.25 0.16 -0.53 1.44 -0.56 0.44 0.37 0.51 0.43 0.8 0.58
0.2 0.15 0.25 0.32 0.34 0.3 0.3 0.3 0.42 0.44 0.34 0.32 -0.26 -0.18 -0.03 -0.28 -0.26 -0.95 -0.25 -1.6 -0.32 -2.47 -0.51 -0.44 0.76 -0.03 0.27 0.32 -0.45 -0.39 -0.04 0.12
-0.33 -0.22 0.17 0.28 0.15 -0.05 0.16 0.57 0.5 0.63 0.38 0.22 0.34 0.2 0.28 0.06 -0.35 -0.79 -0.05 -2.64 -1.2 -2.6 0.09 0.18 0.5 0.51 -0.03 -0.17 -0.13 -0.19 -0.69 -0.25
-0.04 0.16 0.19 0.2 0.25 0.12 0.34 0.51 0.46 0.65 0.58 0.43 0.07 -0.03 -0.19 0.36 -0.63 -0.88 0.38 -2.04 -0.87 -3.21 -0.21 -0.05 -0.05 0.07 -0.24 -0.46 -0.18 -0.11 -0.07 0.14
-0.04 0.01 0.06 0.41 0.34 0.21 0.36 0.66 0.73 0.65 0.61 0.43 -0.28 0.11 -0.85 0.15 -0.25 -0.46 0.21 -2.69 -1.3 -3.03 -0.49 -0.74 0.24 0.43 -0.02 -0.12 -0.01 -0.16 -0.41 -0.16
-2.25 -2.04 -1.87 -0.88 0.47 1.32 1.29 1.13 0.27 -0.26 -0.93 -1.74 -2.1 -0.03 -1.12 -0.51 -0.66 -0.33 0.05 -1.44 0.95 -3.24 -0.1 -1.05 -0.03 -0.43 1.63 1.6 -0.46 -0.4 -0.4 -0.69
0.12 0.19 0.22 0.23 0.19 0.43 0.39 0.1 0.21 0.14 -0.02 0.08 -0.75 -0.03 0.06 -0.51 0.36 -0.22 -0.02 0.06 -0.45 -1.76 -0.24 -0.37 -0.06 -0.07 0.46 0.59 0.14 0.14 -0.61 -1.02
-0.64 -0.92 -1.37 -0.68 0.14 0.84 0.71 0.78 0.47 0.37 -0.22 -0.54 -2.33 -2.47 0.39 -1.75 -0.45 -0.44 -0.5 -0.96 0.04 -1.76 -0.72 -0.94 1.47 -0.3 1.51 1.57 -0.31 -0.35 -0.69 -0.69
-0.04 0.14 0.37 0.41 0.37 0.3 0.32 0.44 0.44 0.28 0.38 -0.01 -0.02 0.49 -0.7 -0.11 -0.56 -0.62 -0.37 -2.51 -0.88 -2.27 0.16 0.01 0.06 0.33 0.64 0.55 -0.52 -0.36 -0.64 -0.35
-0.28 -0.48 -0.38 -0.19 0.09 0.16 0.27 0.43 0.37 0.21 0.01 -0.06 -0.81 -0.36 0.03 -0.92 -0.19 -0.56 -0.19 -0.68 -0.37 -0.36 -0.49 -0.39 1.2 0.08 0.94 0.89 -0.13 -0.03 -0.23 -0.3
-0.67 -0.19 -0.16 0.19 0.27 0.25 0.4 0.57 0.44 0.54 0.24 0.05 0.17 -0.03 -0.97 0.5 -0.49 -1.09 0.31 -3.21 -1.73 -2.97 0.31 0.47 0.5 0.61 0.08 0.08 -0.21 -0.22 -0.15 -0.11
-2.24 -3.0 -2.18 -0.35 0.66 1.22 1.16 0.88 0.78 0.25 -0.2 -1.23 -3.46 -0.25 -0.35 -2.1 -0.4 -2.08 -1.08 -1.18 0.79 -1.64 -0.34 -1.04 1.44 -0.53 1.24 1.2 -0.24 -0.11 -0.49 -0.46
-0.15 0.06 0.2 0.27 0.4 0.45 0.67 0.54 0.51 0.44 0.27 0.15 -0.99 -0.25 0.16 -0.98 -0.11 -0.59 -0.2 -1.25 -0.59 -2.61 -0.31 -0.35 0.67 -0.33 0.35 0.28 -0.12 -0.1 -0.0 -0.2
0.02 0.1 0.3 0.56 0.6 0.66 0.7 0.73 0.61 0.46 0.3 0.12 -1.41 -0.95 -0.85 -0.77 -0.07 -0.84 -0.56 -0.24 -0.76 -2.53 -0.56 -0.91 0.69 -0.02 0.36 0.4 -0.11 -0.2 -0.31 -0.42
-0.52 0.42 0.72 0.67 0.13 0.04 0.85 0.78 0.54 0.67 0.27 0.33 -0.63 -1.43 -2.25 -0.54 -0.94 -0.54 -0.19 -1.96 -0.49 -3.52 -0.33 -0.34 0.89 1.04 0.12 0.28 -0.15 -0.32 -1.07 -0.9
-1.59 -1.92 -2.0 -1.44 0.25 0.5 1.1 1.02 1.15 0.23 -0.25 -0.5 -3.87 -2.8 -0.27 -3.95 -0.47 -0.67 0.42 -5.01 -0.53 -0.06 -1.06 -1.71 1.27 0.24 1.57 1.7 -0.38 -0.57 -0.39 -0.32
-1.09 -1.3 -0.9 -0.01 0.76 1.04 1.12 0.94 0.62 0.35 0.03 -0.39 -0.72 0.18 -0.29 -0.1 -0.54 -1.05 0.39 -5.89 -3.12 -3.77 -0.73 -1.02 -1.09 -0.42 1.12 1.22 0.21 0.3 -0.23 -0.11
-5.78 -4.29 -3.81 -1.11 1.35 2.05 1.99 1.38 -0.15 -1.37 -3.23 -5.03 -6.48 -6.11 -7.71 -3.79 -0.35 -1.16 -0.77 -3.81 -0.15 -5.3 -0.16 -2.13 0.9 -1.03 2.11 2.26 -1.14 -0.97 -3.16 -3.27
-1.14 -1.44 -1.89 -0.83 -1.06 0.93 1.03 1.24 0.82 0.41 -0.28 -0.29 -3.16 -2.6 -0.25 -2.85 -0.96 -1.55 -0.71 -0.42 -5.01 -0.79 -1.36 -1.96 1.63 0.06 1.72 2.08 -0.44 -0.7 -0.75 -1.01
-0.23 -0.58 -0.99 -0.08 -0.03 0.44 0.6 1.12 0.98 1.07 1.09 0.68 -0.54 -0.82 0.02 -0.94 -1.56 -2.81 -0.89 -3.28 -1.54 0.7 -1.27 -1.69 0.9 -0.55 0.82 0.49 -0.65 -0.82 -0.22 -0.25
-0.38 0.02 0.0 0.31 -0.12 0.32 0.51 0.65 0.59 1.01 0.86 0.48 -0.38 -1.22 -2.32 -0.52 -0.76 -1.93 -0.44 -1.39 -0.57 -1.76 -0.32 -0.47 1.07 0.87 0.23 0.44 -0.37 -0.31 -0.57 -0.26
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-0.23 -0.29 -0.09 0.18 0.21 0.39 0.58 0.79 0.31 0.19 -0.22 -0.53 -0.76 -1.97 0.88 -1.0 -0.19 -0.84 -0.74 -1.91 -0.85 -2.11 -0.4 -0.69 0.98 -0.03 1.52 1.5 -0.07 -0.28 -1.5 -2.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.