Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.83 0.57 0.06 0.07 -0.14 0.02 0.07 -0.52 0.07 -0.24 0.05 0.02 -0.3 -0.33 0.53 0.02 -0.32 -1.23 0.14 1.86 1.17 1.32 -4.17 -3.2 -1.04 -0.46 -0.56 -0.49 -1.07 -0.67 -2.16 -2.48
0.4 0.96 1.06 0.72 0.38 0.41 0.29 -0.17 -0.27 0.06 0.01 0.27 -2.25 -0.73 -0.49 -0.7 -0.87 -0.99 -1.53 1.72 1.17 -0.87 -0.59 0.07 -1.73 -0.46 -1.68 -1.75 -1.05 -0.78 0.53 -0.54
-0.81 -0.62 0.37 -0.04 -0.93 -0.18 -0.49 -0.67 -0.66 -0.41 0.29 -0.2 0.31 -0.06 -0.2 -0.09 -0.84 -2.01 0.08 2.0 -0.02 0.28 -0.42 0.47 -1.1 1.63 -0.43 -0.31 -0.59 0.09 -1.13 -0.34
-0.41 0.1 0.35 0.39 0.35 0.66 0.48 -0.23 0.01 -0.01 0.09 -0.26 -1.89 -0.72 -0.03 -1.5 0.62 1.33 -2.21 1.88 0.13 -0.06 0.2 -0.62 -2.57 -1.57 -1.51 -1.11 0.07 0.22 -0.64 -1.3
-1.38 -1.32 -0.93 -0.44 -0.26 -0.51 0.02 -0.02 -0.09 0.42 0.31 0.03 -0.6 -2.46 -2.26 -1.11 -0.76 -0.87 -1.07 1.37 0.25 0.53 -0.88 -1.23 1.13 2.33 0.65 0.51 -0.76 -1.08 -0.82 -0.41
0.27 0.15 -0.34 -0.44 -0.35 -0.16 0.0 0.33 0.13 0.25 0.18 0.38 -1.36 -0.82 -1.23 -1.31 -0.97 -2.9 -0.83 0.69 1.69 -3.92 -1.16 -1.33 0.73 0.94 1.35 1.15 -0.72 -0.57 -0.93 -0.7
0.14 0.16 0.11 0.13 0.36 0.31 0.14 0.1 0.31 0.2 0.21 -0.06 -0.12 -0.27 -0.03 0.44 -0.68 -0.72 -0.12 1.49 0.63 -0.05 -0.62 -0.37 -0.22 -0.3 -0.8 -0.52 -0.63 -0.64 -0.85 -0.71
-0.34 -0.61 -0.73 -0.49 -0.03 0.04 -0.1 -0.27 -0.15 -0.21 -0.49 -0.81 0.16 0.44 0.97 0.4 -0.54 -0.16 -0.39 1.18 -0.93 0.27 -0.15 0.17 0.12 0.32 0.78 0.78 -0.71 -0.47 -0.72 -0.77
-0.03 0.14 -0.0 0.11 0.16 0.21 0.18 0.14 0.04 0.09 -0.09 -0.11 0.05 -0.0 0.43 0.26 -0.5 -0.84 0.27 0.2 -0.55 -0.06 -0.12 -0.05 0.6 0.23 0.11 0.13 -0.42 -0.39 -0.64 -0.66
-0.29 -0.38 -0.39 -0.12 0.03 0.08 0.03 0.22 0.14 0.22 -0.11 -0.21 0.2 0.07 0.04 0.05 -1.04 -2.46 0.36 0.66 -0.12 0.85 -0.34 0.02 0.82 0.88 0.23 0.25 -0.83 -0.79 -1.27 -0.85
-0.1 -0.35 -1.08 -0.31 -0.59 -0.29 -0.49 -0.42 0.09 0.11 0.12 0.2 0.45 0.3 0.6 0.52 -0.93 -1.51 -0.07 0.57 0.37 1.0 -0.42 -0.08 0.17 1.28 0.04 -0.25 -0.7 -0.68 -0.68 -0.84
0.11 0.06 -0.08 0.17 0.2 0.15 -0.1 0.06 -0.02 -0.15 -0.15 -0.13 -0.2 0.4 0.73 -0.11 -0.86 -1.03 -0.21 0.44 0.34 0.17 -0.41 -0.46 1.11 0.27 0.33 0.16 -0.82 -0.85 -0.83 -0.93
-0.04 0.2 0.18 0.24 0.2 0.31 0.15 0.14 0.14 0.0 -0.1 -0.05 -0.21 0.39 0.74 0.1 -0.49 -0.65 0.19 0.35 -1.14 -0.78 -0.27 -0.29 0.78 -0.16 0.03 0.12 -0.65 -0.57 -0.39 -0.31
0.19 0.25 -0.0 0.09 0.15 0.13 0.09 0.09 0.19 0.03 0.09 0.03 -0.74 0.65 0.64 0.13 -0.4 -0.67 0.43 -0.38 -0.31 -0.97 -0.31 0.03 0.81 0.09 0.0 0.26 -0.33 -0.15 -1.26 -1.25
-0.21 -0.7 -0.89 -0.61 -0.48 -0.36 -0.42 0.1 -0.26 -0.12 -0.34 -0.28 -0.24 -0.53 0.04 -0.22 -0.6 - -0.08 1.44 -0.1 0.46 -0.35 -0.4 0.31 1.18 0.84 0.53 -0.57 -0.75 0.36 0.81
0.26 0.09 -0.7 -0.19 0.0 -0.21 -0.22 0.04 0.2 0.25 0.26 0.43 0.02 -0.44 -0.65 0.28 -0.62 -0.32 0.04 0.59 0.86 -1.17 -0.41 -0.26 0.36 0.65 0.19 0.08 -0.24 -0.22 -0.47 -0.54
-0.05 -0.16 0.07 0.13 0.32 0.53 0.35 0.31 0.12 -0.09 -0.07 -0.16 -0.9 -1.18 -0.46 -0.67 0.1 -0.09 -0.17 1.06 0.64 0.41 -0.16 -0.29 0.11 -0.57 -0.44 -0.32 -0.06 -0.12 -0.26 0.01
-0.47 -0.34 -0.33 -0.25 -0.25 -0.24 -0.07 0.14 0.2 0.36 0.39 0.15 0.46 0.17 0.42 0.4 -0.63 -0.95 0.13 0.98 0.2 -0.37 -0.17 0.05 -0.26 0.89 -0.69 -0.88 -0.35 -0.26 -0.38 -0.33
-0.2 -0.33 -0.4 -0.49 -0.02 -0.26 -0.14 0.04 0.11 0.1 0.09 -0.13 0.1 -0.09 0.23 -0.02 -0.85 -0.97 -0.22 1.12 -0.12 -0.11 -0.72 -0.4 0.02 1.28 0.8 0.62 -0.78 -0.89 -0.28 -0.25
0.55 0.26 -0.34 -0.17 0.56 -0.22 -0.62 -0.13 0.48 0.36 0.22 0.08 -0.04 -0.8 -0.74 -1.2 -0.78 -2.77 0.54 0.73 0.83 0.24 -0.97 -1.28 0.38 1.62 0.32 0.47 -0.98 -0.46 -2.12 -3.41
-0.16 -2.44 - -9.09 0.91 -16.55 - 0.68 - 0.52 0.27 -0.17 -0.45 -2.66 -2.12 0.13 -1.37 - 0.04 3.16 0.62 -0.6 -0.13 -0.46 2.11 -0.67 -2.0 -0.01 -0.75 -1.45 -2.75 -2.55
-0.55 -0.7 -0.96 -0.49 -0.01 -0.07 0.02 -0.05 -0.07 0.11 -0.11 -0.32 -0.68 0.44 0.91 -0.13 -1.24 -1.13 -0.77 1.35 0.54 -0.22 -1.31 -0.76 0.98 1.18 0.88 1.12 -1.5 -1.38 -1.72 -1.3
-0.26 0.43 0.34 0.27 0.47 0.22 0.27 0.31 0.36 0.36 0.15 0.11 -0.37 -0.59 -0.34 -0.6 -0.79 -1.85 0.19 -0.52 -0.16 1.18 -0.16 -0.39 1.22 -0.18 -0.32 -0.32 -0.84 -0.97 -0.85 -0.41
-1.2 -1.44 0.52 0.86 0.77 0.56 -0.59 0.58 -1.3 1.31 1.46 0.25 -2.65 -0.07 0.74 - - -2.91 1.39 2.2 - - - -1.19 - 0.75 -0.33 0.94 -2.82 -2.81 -1.86 -1.92
-0.79 -0.83 -1.02 -1.07 -1.45 -0.82 -0.98 -0.87 -0.86 -0.93 -1.05 -0.87 -0.42 -0.66 0.03 -0.47 -0.19 0.01 0.28 1.84 -0.59 0.35 -0.17 -0.41 -0.73 1.42 1.31 1.27 -0.32 -0.15 0.29 0.39
-0.47 0.03 1.29 1.2 0.78 0.79 1.0 0.02 1.03 0.11 1.03 -0.34 -6.68 -6.04 -3.62 -5.6 -2.02 -2.31 -1.11 2.7 0.78 -4.74 -2.09 -2.25 -1.78 -0.6 -1.02 -1.07 -1.13 -0.54 -2.25 -3.61
0.35 0.06 0.18 0.03 0.09 0.15 0.05 0.48 0.67 0.61 0.64 0.69 -0.88 -0.55 -1.06 -0.46 -0.97 -0.45 0.21 0.27 0.64 -0.89 -0.79 -0.99 0.8 0.68 -0.43 -0.15 -0.37 -0.45 -0.85 -1.35
0.35 0.15 -0.18 -0.37 0.84 -0.66 -0.94 0.22 0.69 0.31 0.65 0.17 -0.7 -1.33 -0.44 -0.64 -1.49 -2.71 -1.6 1.94 1.91 -3.48 -1.11 -1.52 0.98 -0.66 -0.65 0.06 -1.05 -1.2 -0.69 -0.41
-0.51 -0.48 -0.12 -0.33 0.03 0.08 0.06 0.25 0.62 0.98 0.63 0.3 -0.42 -3.15 1.02 -0.35 -1.35 -2.29 1.46 1.68 -1.29 0.85 -2.99 -2.66 -1.76 1.4 -0.78 -0.31 -1.56 -1.18 -2.06 -2.31
1.11 0.92 0.76 0.88 0.05 -0.84 1.16 0.87 1.04 1.57 1.4 1.69 -4.85 0.28 -3.23 -3.26 -5.07 -1.65 -2.24 0.94 -0.52 -5.84 -6.39 -5.04 - 0.77 -3.11 -1.24 -2.04 -3.11 -1.52 -2.42
0.15 -0.0 -0.31 -0.14 -0.56 -0.2 0.07 -0.06 0.32 0.58 0.04 0.08 0.33 0.41 0.06 0.29 -0.77 -1.53 -0.21 0.08 0.38 0.72 -0.49 -0.28 1.34 0.25 -0.61 -0.55 -0.79 -0.59 -0.66 -0.57
-0.69 -0.9 -0.71 0.61 -2.6 0.61 0.44 1.45 1.27 0.12 0.26 -0.77 - -2.69 0.17 -1.47 - -2.74 -1.51 0.11 0.67 2.14 -0.98 -0.87 1.31 0.08 0.79 0.17 -1.11 -0.96 - -
0.07 0.1 -0.17 -0.02 0.32 0.29 0.46 0.34 0.19 0.34 0.56 0.03 -0.24 0.06 0.37 -0.39 -1.16 -5.57 -0.36 0.1 -0.16 0.81 -0.74 -0.94 0.66 0.78 0.46 0.37 -1.17 -0.96 -1.05 -0.87
-0.09 -0.13 -0.18 -0.13 -0.32 0.03 -0.0 0.04 -0.26 -0.06 -0.23 -0.29 -0.27 -0.68 -0.17 -0.05 0.01 -0.13 0.44 0.6 0.98 0.68 0.05 -0.16 0.14 -0.21 -0.22 -0.38 0.2 0.22 -0.42 -0.34
-0.31 0.2 -1.45 -0.19 -0.04 -0.01 -0.04 1.38 1.11 0.33 1.84 0.29 - -3.73 -2.96 -4.23 -0.4 -1.34 -2.81 -3.98 - 1.79 -1.16 -1.82 1.43 -0.03 1.05 0.5 -0.87 -0.43 -1.18 -1.6
-1.66 -0.3 0.12 0.76 1.15 0.41 1.14 0.65 1.65 0.5 0.65 0.41 -0.33 -1.35 0.34 -2.17 -0.73 -4.14 -0.15 -2.16 -0.85 0.83 -1.17 -1.56 0.77 -0.13 -0.08 -0.11 -1.51 -1.27 -1.4 -3.31
-0.99 -1.53 -1.05 -0.87 -0.02 -0.76 -0.04 0.25 0.55 0.93 0.87 0.5 -0.23 -1.36 0.04 -0.51 -1.57 -3.03 -0.73 1.42 1.31 -2.73 -1.26 -1.21 1.07 1.27 0.17 -0.01 -0.8 -0.93 -0.13 -0.09
0.1 0.14 -0.36 -0.19 -0.53 -0.31 -0.22 -0.07 0.09 0.11 0.08 0.25 -1.06 0.11 -0.0 -0.95 -0.84 -2.81 -0.9 0.13 0.76 0.18 -0.51 -0.21 0.54 1.62 0.91 0.8 -0.76 -0.84 -0.64 -0.48
0.26 0.41 -0.21 0.61 0.18 0.31 0.62 1.01 0.92 0.0 0.51 0.41 -1.18 -1.5 0.76 -1.42 -0.72 -5.69 -1.11 0.06 -1.0 1.49 -0.57 -0.56 0.62 0.32 -0.42 -0.21 -1.39 -0.89 -1.78 -1.99
-0.15 -0.33 -0.11 0.16 0.25 -0.59 0.39 0.83 -0.02 0.36 0.1 -0.32 0.81 -0.84 0.39 0.5 -2.54 -2.8 0.25 0.39 0.75 -1.95 -1.86 -1.08 1.03 1.46 -0.2 0.74 -1.4 -1.32 -1.96 -1.91
-0.41 0.19 0.19 -0.14 -0.59 -0.35 -0.32 -0.66 -0.27 -0.24 0.21 -0.13 0.02 0.53 0.6 0.39 -1.09 -1.28 -0.99 1.52 1.45 -3.62 -0.4 -0.17 0.07 0.67 0.04 -0.12 -0.65 -0.48 -0.58 -0.28
0.29 0.38 0.17 0.3 0.21 0.41 0.41 0.06 0.44 0.47 -0.45 0.3 -0.37 -0.03 0.47 -1.04 -1.3 -1.47 0.01 2.1 -1.45 -2.36 -0.54 -0.02 1.1 -1.04 -0.85 -0.52 -1.41 -0.79 -1.61 -1.06
0.25 0.24 0.04 0.61 0.81 0.06 0.54 0.44 0.64 0.22 0.44 0.32 -4.67 -0.89 -0.31 - -3.04 -4.32 - 1.84 2.14 1.22 -5.25 -4.87 0.97 -0.23 -0.7 -0.75 -3.61 -4.59 -6.69 -3.67
0.46 0.45 0.48 0.84 0.77 0.39 0.36 0.8 0.23 0.43 0.29 0.9 -3.85 -0.35 -0.25 -3.46 -3.96 -2.51 -3.41 0.27 -2.55 0.98 -2.24 -3.22 2.24 0.16 -0.13 0.77 -3.99 -3.98 - -5.07
0.64 0.11 -0.57 0.4 0.0 0.22 -0.33 -0.02 0.41 0.04 0.37 0.88 -2.21 -2.1 -1.5 -2.1 -0.82 -2.53 -1.69 1.49 1.8 0.59 -1.23 -1.91 0.52 1.01 0.23 -0.22 -1.06 -1.04 -0.94 -1.38
-0.25 -1.06 -0.32 -0.3 0.35 -0.23 -0.29 0.36 0.16 0.28 0.08 0.15 0.65 -0.86 0.61 0.19 -1.8 -1.93 -0.07 1.35 1.07 -0.76 -1.91 -1.37 -0.15 1.79 0.44 0.13 -1.41 -1.43 -1.79 -1.66
0.53 0.45 0.64 0.14 0.99 0.33 0.52 0.53 0.41 0.52 0.72 0.22 -1.33 -0.63 -0.1 -1.42 -1.47 -2.26 -1.09 0.08 -1.93 0.16 -1.46 -1.25 0.54 1.24 0.42 0.87 -1.46 -1.51 -2.04 -1.77
-0.05 0.27 -0.28 0.07 0.11 0.41 0.34 0.27 0.56 0.45 0.07 0.0 -2.45 -1.9 -1.52 -2.05 -0.66 -1.64 -0.13 0.37 0.39 0.41 0.01 -0.34 1.19 0.38 0.76 0.58 -0.51 -0.58 -0.57 -0.44
0.05 -0.49 -0.34 -0.14 -0.0 -0.24 -0.05 0.38 0.31 0.29 0.4 0.06 -0.79 -1.4 -1.04 -0.83 -1.76 -1.73 -1.01 0.51 0.01 -0.78 -1.81 -1.41 0.55 2.25 1.49 0.98 -1.5 -1.35 -0.94 -0.8
0.13 1.05 0.62 1.06 - 0.34 1.39 0.99 -0.88 -0.24 -0.24 0.09 - - - - -0.95 -0.91 0.54 2.81 2.1 - -1.86 - 0.29 - - - -0.35 - - -
-0.27 -0.38 -0.07 -0.12 0.13 0.1 0.12 0.24 0.21 0.24 0.26 -0.06 0.27 0.18 -0.3 0.67 -0.81 -0.85 -0.18 1.36 0.15 -0.24 0.16 0.38 -0.23 -0.25 -0.38 -0.39 -0.68 -0.39 -0.57 -0.64
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0.18 -0.19 -0.29 -0.12 0.06 -0.18 0.03 0.28 0.34 0.2 0.13 0.33 -0.87 -0.8 -1.09 -0.45 -0.45 -1.04 -0.27 0.51 0.6 -0.16 -0.37 -0.44 0.98 1.11 0.28 0.5 -0.29 -0.27 -0.61 -0.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.