1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_177 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.27 0.85 0.27
0.26 0.34 0.23 0.27 0.58 0.57 0.89 0.47 0.28 0.51 0.33 0.23 0.12 0.06 0.25 0.1 0.31 0.17 1.0 0.0 0.31 0.02 0.17 0.17 0.32 0.23 0.64 0.58 0.27 0.31 0.36 0.29
0.1 0.09 0.08 0.16 0.34 0.32 0.42 0.24 0.28 0.46 0.23 0.22 0.0 0.03 0.08 0.06 0.17 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.24 0.46 0.36 0.28 0.24 0.34 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.84 0.5 0.81 0.83 0.35 0.21 0.0 0.0 0.26 0.21 0.43 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.28 0.23
0.47 0.65 0.73 0.71 0.92 0.8 0.63 0.43 0.41 0.43 0.36 0.31 0.63 0.23 0.31 0.82 0.74 0.48 1.0 0.19 0.59 0.36 0.73 0.75 0.43 0.39 0.65 0.76 0.5 0.61 0.38 0.38
0.23 0.39 0.22 0.17 0.15 0.1 0.06 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.09 0.14 0.16 0.16 0.57 0.27 0.82 0.03 0.06 0.0 0.67 1.0 0.94 0.05 0.16 0.15 0.1 0.15 0.21 0.19
0.44 0.52 0.63 0.6 0.61 0.59 0.57 0.43 0.36 0.29 0.29 0.31 0.12 0.34 0.1 0.22 0.68 1.0 0.43 0.18 0.49 0.04 0.56 0.53 0.49 0.3 0.86 0.9 0.55 0.57 0.51 0.56
0.27 0.28 0.28 0.33 0.47 0.49 0.48 0.56 0.58 0.42 0.32 0.3 0.2 0.13 0.55 0.35 0.43 0.4 0.84 0.27 0.12 0.16 0.43 0.45 0.59 0.86 0.85 1.0 0.53 0.63 0.25 0.16
0.02 0.04 0.04 0.17 0.41 0.3 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.04 0.3 1.0 0.35 0.74 0.0 0.01 0.0 0.96 0.73 0.03 0.02 0.31 0.22 0.05 0.04 0.09 0.11
0.08 0.2 0.25 0.24 0.34 0.26 0.19 0.14 0.15 0.17 0.11 0.09 0.01 0.0 0.03 0.02 0.74 0.67 1.0 0.01 0.05 0.11 0.89 0.69 0.53 0.15 0.37 0.28 0.27 0.26 0.11 0.2
0.24 0.3 0.37 0.41 0.56 0.46 0.27 0.18 0.19 0.2 0.18 0.18 0.2 0.09 0.07 0.26 0.64 0.23 0.75 0.08 0.44 0.09 0.78 0.7 1.0 0.29 0.49 0.75 0.29 0.33 0.15 0.16
0.11 0.41 0.26 0.41 0.08 0.38 0.04 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.9 0.02 1.0 0.06 0.06 0.01 0.52 0.36 0.75 0.1 0.36 0.43 0.2 0.26 0.08 0.09
0.08 0.08 0.16 0.21 0.22 0.26 0.1 0.11 0.17 0.12 0.03 0.05 0.15 0.04 0.02 0.42 0.4 0.01 0.59 0.0 0.04 0.0 0.75 0.99 1.0 0.41 0.56 0.65 0.26 0.23 0.14 0.11
0.14 0.66 0.56 0.54 0.43 0.21 0.09 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.33 0.09 0.1 0.49 0.96 0.74 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.01 0.02 0.31 0.27 0.28 0.26 0.32 0.23
0.2 0.08 0.16 0.08 0.18 0.19 0.21 0.17 0.3 0.19 0.19 0.13 0.08 0.06 0.09 0.07 0.23 0.33 1.0 0.03 0.12 0.0 0.14 0.07 0.35 0.19 0.17 0.14 0.27 0.37 0.18 0.1
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.14 0.16 0.19 0.36 0.29 0.5 0.45 0.27 0.44 0.0 0.43 0.0 0.53 0.88 0.0 0.0 0.24 0.45 1.0 0.8 0.26 0.75
0.15 0.12 0.26 0.08 0.41 0.13 0.14 0.04 0.04 0.03 0.1 0.04 0.1 0.0 0.0 0.15 0.39 0.6 1.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.11 0.25 0.1 0.17 0.11 0.22 0.59 0.31 0.19
0.12 0.03 0.06 0.11 0.36 0.09 0.57 0.52 0.28 0.24 0.47 0.22 0.02 0.02 0.27 0.03 0.16 0.28 1.0 0.06 0.18 0.06 0.2 0.12 0.13 0.35 0.78 0.69 0.21 0.38 0.14 0.11
0.03 0.02 0.04 0.07 0.12 0.25 0.44 0.15 0.13 0.2 0.23 0.07 0.0 0.03 0.02 0.06 0.2 0.38 1.0 0.03 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.05 0.54 0.23 0.44 0.22 0.19 0.05
0.07 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.2 0.0 0.06 0.05 0.0 0.16 0.38 0.24 0.18 0.24 0.36 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.37 0.13 0.0 0.19 0.46 0.05 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.5 0.28 0.08 1.0 0.11 0.02 0.19 0.27 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.3 0.34 0.35
0.0 0.01 0.02 0.06 0.37 0.45 0.17 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.08 0.89 0.23 0.32 0.02 0.14 0.01 1.0 0.36 0.26 0.01 0.45 0.49 0.04 0.03 0.01 0.01
0.13 0.14 0.2 0.15 0.14 0.18 0.25 0.29 0.26 0.26 0.19 0.09 0.22 0.13 0.35 0.15 0.08 0.13 1.0 0.16 0.02 0.0 0.09 0.09 0.4 0.47 0.78 0.7 0.07 0.1 0.12 0.06
0.06 0.01 0.04 0.03 0.01 0.07 0.03 0.06 0.13 0.11 0.09 0.04 0.2 0.02 0.05 0.45 0.29 0.0 1.0 0.04 0.12 0.07 0.33 0.2 0.05 0.05 0.03 0.0 0.26 0.16 0.18 0.13
0.31 0.26 0.26 0.35 0.51 0.5 1.0 0.88 0.82 0.65 0.79 0.46 0.01 0.02 0.11 0.01 0.71 0.22 0.77 0.1 0.0 0.05 0.18 0.07 0.36 0.55 0.45 0.65 0.52 0.55 0.26 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.16 0.16 0.0 0.35 0.46 0.81 0.16 0.17 0.0 0.0
0.12 0.06 0.16 0.12 0.21 0.28 0.28 0.35 0.21 0.11 0.11 0.11 0.0 0.09 0.12 0.06 0.12 0.23 1.0 0.0 0.09 0.12 0.33 0.16 0.21 0.24 0.53 0.36 0.24 0.25 0.15 0.12
0.2 0.41 0.49 0.56 0.54 0.54 0.33 0.27 0.15 0.1 0.09 0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.77 0.52 0.27 0.04 0.34 0.02 0.48 0.28 0.44 0.28 0.81 1.0 0.38 0.38 0.28 0.2
0.06 0.18 0.19 0.35 0.52 0.65 0.57 0.33 0.26 0.23 0.2 0.14 0.11 0.13 0.37 0.18 1.0 0.48 0.28 0.43 0.01 0.03 0.67 0.32 0.09 0.1 0.89 0.81 0.38 0.38 0.22 0.24
0.08 0.07 0.0 0.05 0.0 0.31 0.0 0.13 0.17 0.06 0.0 0.08 0.19 0.0 0.0 0.26 0.5 0.42 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.61 0.0 0.42 0.17 0.28 0.62 0.2 0.29 0.35
0.29 0.11 0.37 0.34 0.47 0.22 0.13 0.24 0.42 0.16 0.18 0.25 0.06 0.1 0.18 0.36 0.71 0.77 1.0 0.0 0.0 0.16 0.33 0.25 0.42 0.18 0.18 0.16 0.57 0.59 0.37 0.59
0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.16 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.19 0.0 0.37 0.0 0.0 0.36 0.56 0.24 0.11
0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.42 0.38 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.1 0.0 0.0 0.24 0.0 0.7 0.47 0.1 0.38
0.12 0.28 0.1 0.13 0.15 0.35 0.3 0.31 0.29 0.27 0.24 0.23 0.05 0.19 0.5 0.06 0.5 0.5 1.0 0.04 0.08 0.0 0.42 0.55 0.16 0.24 0.5 0.39 0.46 0.54 0.2 0.2
0.23 0.34 0.87 0.35 0.3 0.52 0.41 0.32 0.25 0.06 0.21 0.1 0.01 0.02 0.05 0.0 0.7 0.74 0.03 0.07 0.14 0.0 0.11 0.04 0.0 0.04 0.32 0.35 0.42 0.77 0.29 1.0
0.01 0.05 0.08 0.0 0.02 0.02 0.09 0.0 0.19 0.03 0.0 0.06 0.3 0.16 0.11 0.32 0.33 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.43 0.0 0.04 0.05 0.09 0.33 0.33 0.36 0.25
0.12 0.03 0.02 0.11 0.0 0.09 0.03 0.07 0.04 0.03 0.04 0.02 0.0 0.03 0.01 0.03 0.78 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.24 0.13 0.0 0.14 0.14 0.25 0.71 1.0 0.19 0.2
0.14 0.15 0.14 0.15 0.19 0.42 0.38 0.21 0.3 0.23 0.18 0.12 0.04 0.02 0.11 0.06 0.21 0.12 1.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.12 0.29 0.07 0.36 0.47 0.25 0.37 0.17 0.14
0.28 0.54 0.52 0.42 0.53 0.34 0.15 0.1 0.07 0.06 0.03 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.46 0.25 1.0 0.42 0.14 0.0 0.74 0.27 0.51 0.21 0.37 0.45 0.11 0.1 0.03 0.03
0.19 0.39 0.43 0.37 0.47 0.48 0.4 0.24 0.33 0.22 0.22 0.22 0.01 0.05 0.09 0.17 0.8 0.6 1.0 0.0 0.03 0.01 0.54 0.42 0.39 0.15 0.56 0.81 0.6 0.76 0.42 0.36
0.22 0.52 0.59 0.58 0.5 0.49 0.46 0.14 0.16 0.08 0.09 0.08 0.01 0.03 0.0 0.01 0.74 1.0 0.28 0.04 0.16 0.0 0.37 0.14 0.36 0.01 0.47 0.51 0.35 0.39 0.54 0.7
0.25 0.3 0.46 0.46 0.55 0.49 0.47 0.31 0.23 0.19 0.18 0.12 0.21 0.22 0.09 0.43 0.71 0.47 0.58 0.12 0.43 0.06 1.0 0.75 0.42 0.27 0.3 0.37 0.44 0.43 0.4 0.32
0.01 0.28 0.05 0.2 0.3 1.0 0.36 0.24 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.04 0.63 0.0 0.36 0.0 0.59 0.22 0.55 0.15 0.97 0.79 0.07 0.0 0.07 0.0
0.46 0.44 0.43 0.48 0.65 0.62 0.76 0.82 0.85 0.7 0.72 0.61 0.2 0.23 0.43 0.28 0.56 0.42 1.0 0.48 0.28 0.21 0.52 0.52 0.93 0.66 0.66 0.71 0.62 0.67 0.44 0.45
0.63 0.78 0.72 0.74 0.78 0.75 0.69 0.66 0.5 0.5 0.53 0.56 0.06 0.08 0.09 0.19 0.78 1.0 0.7 0.23 0.62 0.18 0.56 0.47 0.83 0.74 0.98 0.9 0.8 0.74 0.71 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.43 0.29 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.44 0.67 0.64
0.49 0.61 0.58 0.67 0.59 0.88 1.0 0.89 0.96 0.67 0.71 0.57 0.52 0.42 0.74 0.58 0.87 0.78 0.74 0.95 0.11 0.41 0.74 0.68 0.48 0.27 0.96 0.7 0.73 0.78 0.63 0.76
0.18 0.26 0.34 0.51 0.2 0.3 0.26 0.23 0.36 0.29 0.27 0.24 0.08 0.03 0.04 0.19 0.52 0.26 1.0 0.0 0.0 0.25 0.32 0.35 0.08 0.15 0.32 0.61 0.28 0.3 0.18 0.16
0.28 0.35 0.27 0.35 0.86 0.85 0.63 0.28 0.14 0.34 0.23 0.13 0.55 0.18 0.0 0.86 0.63 0.27 0.54 0.0 0.11 0.0 0.7 0.29 0.51 0.33 0.71 1.0 0.38 0.14 0.36 0.08
0.45 0.48 0.65 0.59 0.76 0.69 1.0 0.77 0.78 0.75 0.62 0.51 0.48 0.5 0.64 0.42 0.62 0.38 0.4 0.83 0.27 0.25 0.57 0.62 0.17 0.49 0.45 0.52 0.48 0.49 0.49 0.44
0.14 0.25 0.41 0.25 0.24 0.29 0.2 0.18 0.24 0.13 0.18 0.12 0.07 0.0 0.0 0.03 0.37 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.01 0.16 0.68 0.36 0.18 0.19 0.72 0.9
0.15 0.26 0.35 0.21 0.28 0.27 0.2 0.17 0.19 0.16 0.19 0.19 0.01 0.01 0.06 0.05 0.32 0.19 1.0 0.19 0.04 0.01 0.23 0.05 0.43 0.09 0.3 0.2 0.31 0.34 0.16 0.13
0.07 0.09 0.07 0.2 0.13 0.29 0.34 0.41 0.23 0.22 0.12 0.08 0.02 0.02 0.35 0.06 0.3 0.24 1.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.14 0.39 0.11 0.76 0.53 0.29 0.19 0.11 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)