1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.3 0.26 0.2 0.3 0.31 0.3 0.32 0.33 0.36 0.37 0.36 0.34 0.67 0.36 0.29 0.46 0.23 0.22 0.27 0.0 0.22 0.02 1.0 0.94 0.28 0.16 0.17 0.12 0.32 0.33 0.27 0.32
0.51 0.38 0.37 0.3 0.34 0.33 0.23 0.16 0.23 0.27 0.33 0.33 1.0 0.35 0.22 0.29 0.16 0.25 0.06 0.02 0.04 0.12 0.32 0.58 0.05 0.05 0.17 0.17 0.12 0.22 0.11 0.12
0.19 0.28 0.36 0.22 0.22 0.28 0.15 0.23 0.23 0.26 0.25 0.19 0.88 0.1 0.0 0.44 0.15 0.23 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.51 0.17 0.13 0.17 0.14 0.17 0.21 0.14 0.13
0.28 0.27 0.31 0.26 0.13 0.3 0.23 0.33 0.25 0.34 0.39 0.28 1.0 0.4 0.05 0.46 0.05 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.65 0.19 0.05 0.12 0.12 0.15 0.08 0.08 0.3 0.33
0.23 0.23 0.2 0.19 0.19 0.21 0.19 0.17 0.16 0.19 0.17 0.17 0.52 0.07 0.23 0.19 0.15 0.25 0.09 0.0 0.0 0.43 0.86 1.0 0.09 0.21 0.16 0.2 0.19 0.2 0.11 0.24
0.1 0.13 0.12 0.13 0.07 0.13 0.11 0.08 0.16 0.1 0.14 0.15 0.49 0.32 0.02 0.35 0.19 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.87 0.05 0.13 0.07 0.05 0.24 0.25 0.23 0.25
0.12 0.15 0.2 0.14 0.15 0.16 0.15 0.15 0.15 0.15 0.13 0.16 0.47 0.76 0.07 0.26 0.16 0.11 0.05 0.02 0.07 0.0 1.0 0.87 0.27 0.27 0.3 0.27 0.13 0.19 0.17 0.13
0.13 0.17 0.25 0.24 0.18 0.2 0.22 0.23 0.31 0.26 0.21 0.19 0.57 0.28 0.21 0.65 0.17 0.1 0.28 0.32 0.15 0.59 0.76 1.0 0.29 0.35 0.19 0.22 0.23 0.3 0.15 0.11
0.1 0.0 0.08 0.11 0.0 0.06 0.0 0.04 0.04 0.13 0.05 0.05 0.98 0.0 0.0 0.35 0.2 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 1.0 0.4 0.0 0.23 0.0 0.0 0.25 0.25 0.1 0.14
0.04 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.07 1.0 0.0 0.02 0.17 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.13 0.19 0.75 0.04 0.02 0.0 0.0 0.4 0.01 0.0 0.02
0.24 0.2 0.25 0.2 0.22 0.22 0.22 0.22 0.33 0.29 0.28 0.34 1.0 0.11 0.04 0.51 0.1 0.09 0.1 0.04 0.21 0.2 0.26 0.27 0.05 0.09 0.05 0.04 0.14 0.14 0.06 0.05
0.19 0.12 0.08 0.11 0.04 0.1 0.09 0.28 0.2 0.07 0.04 0.14 0.04 0.01 0.0 0.05 0.15 0.12 0.33 0.0 0.02 0.0 0.8 1.0 0.03 0.09 0.07 0.25 0.15 0.09 0.17 0.06
0.05 0.06 0.08 0.08 0.1 0.1 0.07 0.07 0.06 0.06 0.06 0.05 0.5 0.05 0.03 0.14 0.05 0.11 0.1 0.08 0.01 0.01 0.58 1.0 0.3 0.05 0.07 0.09 0.1 0.12 0.08 0.07
0.18 0.38 0.47 0.43 0.42 0.37 0.36 0.19 0.17 0.15 0.15 0.12 0.77 0.15 0.0 0.69 0.28 0.25 0.38 0.06 0.22 0.0 1.0 0.91 0.23 0.19 0.36 0.39 0.2 0.21 0.1 0.22
0.2 0.21 0.21 0.21 0.19 0.19 0.18 0.22 0.25 0.24 0.31 0.19 1.0 0.22 0.08 0.41 0.19 0.12 0.39 0.09 0.01 0.11 0.53 0.64 0.16 0.25 0.14 0.1 0.27 0.31 0.14 0.19
0.09 0.14 0.15 0.13 0.12 0.08 0.12 0.07 0.11 0.09 0.13 0.11 0.99 0.01 0.04 0.16 0.09 0.06 0.03 0.01 0.0 0.01 1.0 0.83 0.03 0.11 0.03 0.04 0.09 0.11 0.06 0.1
0.18 0.19 0.26 0.27 0.23 0.27 0.29 0.28 0.36 0.32 0.25 0.22 0.72 0.05 0.01 0.2 0.18 0.14 1.0 0.0 0.01 0.0 0.52 0.75 0.03 0.17 0.15 0.17 0.26 0.31 0.34 0.2
0.27 0.35 0.43 0.43 0.48 0.51 0.43 0.4 0.37 0.37 0.37 0.29 0.79 0.22 0.04 0.54 0.21 0.1 0.06 0.01 0.03 0.01 1.0 0.45 0.17 0.16 0.14 0.17 0.18 0.21 0.18 0.18
0.15 0.18 0.21 0.15 0.17 0.19 0.18 0.15 0.18 0.14 0.18 0.21 0.55 0.46 0.1 0.38 0.15 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.82 0.05 0.06 0.07 0.11 0.17 0.21 0.19 0.19
0.71 0.98 0.51 0.32 0.36 0.24 0.28 0.19 0.26 0.12 0.22 0.25 1.0 0.12 0.05 0.23 0.16 0.13 0.08 0.0 0.04 0.0 0.1 0.12 0.02 0.03 0.08 0.05 0.31 0.38 0.05 0.04
0.19 0.21 0.17 0.21 0.23 0.18 0.2 0.14 0.18 0.24 0.3 0.23 0.61 0.1 0.01 0.3 0.25 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.01 0.14 0.11 0.12 0.22 0.24 0.24 0.23
0.14 0.24 0.35 0.29 0.27 0.22 0.2 0.09 0.17 0.23 0.13 0.23 0.68 0.81 0.19 0.44 0.28 0.31 0.25 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.04 0.11 0.24 0.2 0.18 0.21 0.13 0.17
0.18 0.23 0.2 0.23 0.11 0.22 0.22 0.21 0.19 0.22 0.26 0.22 1.0 0.24 0.11 0.46 0.15 0.07 0.13 0.01 0.06 0.03 0.7 0.31 0.31 0.16 0.15 0.15 0.21 0.24 0.17 0.17
0.33 0.26 0.3 0.26 0.29 0.29 0.17 0.26 0.32 0.36 0.32 0.27 0.99 0.11 0.04 0.96 0.2 0.21 0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.32 0.43 0.15 0.23 0.24 0.24 0.1 0.14
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.01 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.98 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.09 0.09 0.06
0.22 0.17 0.22 0.18 0.17 0.17 0.2 0.16 0.17 0.18 0.18 0.22 0.62 0.74 0.19 0.34 0.25 0.52 0.1 0.0 0.04 0.0 1.0 0.92 0.06 0.05 0.09 0.07 0.31 0.37 0.39 0.37
0.23 0.27 0.24 0.29 0.24 0.29 0.3 0.25 0.33 0.32 0.3 0.24 0.57 0.13 0.02 0.29 0.21 0.2 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.02 0.17 0.11 0.15 0.21 0.21 0.2 0.22
0.2 0.23 0.21 0.29 0.26 0.23 0.35 0.25 0.3 0.29 0.31 0.27 0.61 0.08 0.0 0.32 0.26 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.04 0.09 0.11 0.13 0.23 0.25 0.25 0.32
0.36 0.46 0.51 0.41 0.33 0.28 0.35 0.29 0.38 0.44 0.39 0.34 0.58 0.71 0.01 0.36 0.32 0.15 0.04 0.03 0.09 0.0 1.0 0.41 0.12 0.29 0.1 0.12 0.22 0.22 0.2 0.18
0.3 0.34 0.64 0.3 0.69 0.51 0.45 0.3 0.34 0.36 0.48 0.28 0.53 0.49 0.13 0.51 0.34 0.2 0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.61 0.02 0.17 0.15 0.18 0.27 0.32 0.27 0.26
0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.14 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.69 0.02 0.0 0.5 0.17 0.38 0.03 0.0 0.0 0.0 0.98 1.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.2 0.27 0.23 0.25
0.05 0.08 0.05 0.06 0.09 0.07 0.06 0.06 0.07 0.08 0.09 0.06 0.7 0.06 0.11 0.3 0.07 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.05 0.09 0.07 0.04 0.1 0.13 0.12 0.11
0.42 0.29 0.33 0.34 0.47 0.44 0.35 0.47 0.47 0.47 0.46 0.38 1.0 0.44 0.13 0.43 0.14 0.13 0.18 0.31 0.01 0.13 0.6 0.48 0.08 0.24 0.26 0.2 0.21 0.25 0.22 0.24
0.22 0.27 0.39 0.41 0.5 0.33 0.54 0.4 0.71 0.51 0.47 0.36 0.72 0.23 0.18 0.53 0.51 0.58 0.94 0.09 0.42 0.18 0.83 1.0 0.26 0.3 0.24 0.19 0.46 0.48 0.48 0.58
0.16 0.15 0.19 0.08 0.1 0.08 0.03 0.11 0.1 0.1 0.08 0.05 1.0 0.04 0.0 0.31 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.52 0.14 0.16 0.26 0.01 0.03 0.03 0.06 0.08
0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.02
0.04 0.05 0.12 0.14 0.14 0.15 0.12 0.07 0.07 0.06 0.06 0.06 0.58 0.31 0.19 0.19 0.21 0.2 0.08 0.07 0.04 0.06 1.0 0.91 0.38 0.08 0.11 0.17 0.16 0.18 0.09 0.09
0.1 0.09 0.06 0.1 0.09 0.15 0.13 0.21 0.25 0.14 0.13 0.17 0.27 0.01 0.0 0.27 0.06 0.08 0.06 0.0 0.05 0.0 0.84 1.0 0.06 0.18 0.21 0.09 0.24 0.13 0.17 0.16
0.18 0.15 0.15 0.13 0.12 0.12 0.14 0.26 0.24 0.16 0.17 0.19 1.0 0.3 0.05 0.44 0.1 0.07 0.31 0.0 0.03 0.0 0.39 0.89 0.49 0.23 0.31 0.15 0.15 0.16 0.19 0.13
0.1 0.11 0.08 0.13 0.14 0.11 0.15 0.11 0.14 0.14 0.14 0.12 0.5 0.06 0.0 0.25 0.19 0.13 0.26 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.05 0.11 0.07 0.07 0.15 0.16 0.17 0.15
0.18 0.24 0.35 0.31 0.39 0.39 0.22 0.25 0.28 0.26 0.28 0.2 0.81 0.06 0.02 0.79 0.26 0.26 0.15 0.18 0.05 0.19 1.0 0.6 0.26 0.18 0.17 0.22 0.43 0.44 0.34 0.23
0.34 0.27 0.3 0.28 0.3 0.28 0.28 0.25 0.27 0.32 0.38 0.28 0.54 0.48 0.14 0.57 0.26 0.23 0.35 0.42 0.22 0.18 1.0 0.85 0.19 0.31 0.18 0.17 0.3 0.34 0.37 0.36
0.15 0.15 0.14 0.24 0.26 0.21 0.19 0.22 0.26 0.2 0.2 0.18 1.0 0.08 0.13 0.61 0.23 0.12 0.3 0.04 0.02 0.0 0.35 0.33 0.08 0.26 0.21 0.26 0.23 0.26 0.24 0.3
0.27 0.17 0.26 0.35 0.61 0.34 0.61 0.54 0.73 0.93 0.57 0.31 1.0 0.04 0.08 0.89 0.67 0.82 0.51 0.01 0.37 0.33 0.69 0.79 0.86 0.31 0.02 0.16 0.65 0.53 0.52 0.71
0.1 0.11 0.14 0.14 0.13 0.12 0.06 0.1 0.06 0.1 0.08 0.15 1.0 0.05 0.04 0.52 0.11 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.25 0.63 0.17 0.05 0.04 0.05 0.11 0.13 0.05 0.03
0.29 0.21 0.24 0.25 0.41 0.3 0.32 0.39 0.31 0.37 0.38 0.31 1.0 0.21 0.18 0.59 0.24 0.22 0.43 0.05 0.05 0.08 0.56 0.57 0.19 0.35 0.2 0.26 0.38 0.32 0.36 0.46
0.31 0.41 0.39 0.38 0.44 0.4 0.48 0.34 0.4 0.44 0.32 0.35 0.4 0.26 0.18 0.4 0.33 0.26 0.29 0.17 0.0 0.0 1.0 0.55 0.06 0.12 0.15 0.14 0.33 0.4 0.46 0.52
0.04 0.07 0.07 0.07 0.13 0.1 0.12 0.17 0.16 0.15 0.12 0.08 0.5 0.12 0.11 0.22 0.17 0.07 0.19 0.09 0.14 0.06 0.74 1.0 0.44 0.22 0.22 0.23 0.22 0.26 0.14 0.16
0.09 0.11 0.11 0.12 0.09 0.1 0.12 0.08 0.11 0.14 0.1 0.11 0.88 0.04 0.02 0.11 0.16 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.7 1.0 0.13 0.03 0.04 0.04 0.2 0.18 0.14 0.16
0.48 0.6 0.31 0.21 0.21 0.11 0.17 0.16 0.16 0.07 0.14 0.2 1.0 0.06 0.02 0.24 0.11 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.01 0.04 0.09 0.04 0.34 0.27 0.03 0.02
0.08 0.1 0.11 0.1 0.09 0.1 0.08 0.17 0.17 0.21 0.19 0.16 1.0 0.02 0.0 0.54 0.04 0.11 0.03 0.01 0.0 0.03 0.6 0.66 0.06 0.13 0.11 0.07 0.09 0.09 0.09 0.07
0.18 0.09 0.03 0.06 0.03 0.05 0.03 0.11 0.16 0.38 0.23 0.22 1.0 0.01 0.0 0.69 0.05 0.03 0.23 0.0 0.02 0.0 0.12 0.06 0.34 0.26 0.04 0.01 0.12 0.05 0.13 0.12
0.7 0.41 0.3 0.2 0.2 0.18 0.06 0.25 0.09 0.14 0.24 0.24 0.82 0.01 0.0 0.46 0.08 0.17 0.14 0.0 0.0 0.0 0.48 1.0 0.4 0.24 0.23 0.4 0.21 0.15 0.23 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.01 0.12 0.06 0.02 0.01 0.01 0.0 0.17 0.21 0.27 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01
0.6 0.36 0.3 0.26 0.28 0.27 0.13 0.16 0.14 0.19 0.22 0.2 1.0 0.07 0.03 0.47 0.33 0.21 0.06 0.01 0.06 0.0 0.41 0.44 0.05 0.02 0.03 0.03 0.23 0.18 0.08 0.07
0.14 0.06 0.1 0.09 0.15 0.13 0.13 0.19 0.21 0.15 0.19 0.11 0.63 0.16 0.08 0.1 0.21 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.71 0.02 0.13 0.07 0.04 0.41 0.56 0.22 0.34
0.25 0.35 0.55 0.63 0.58 0.49 0.8 0.8 0.74 0.69 0.54 0.4 0.37 0.41 0.07 0.52 0.44 0.28 0.48 0.36 0.09 0.0 1.0 0.74 0.31 0.35 0.18 0.22 0.55 0.5 0.28 0.24
0.3 0.39 0.36 0.33 0.36 0.34 0.33 0.29 0.3 0.4 0.36 0.38 0.73 0.15 0.14 0.63 0.24 0.3 0.61 0.06 0.06 0.0 1.0 0.28 0.15 0.19 0.15 0.19 0.29 0.31 0.23 0.23
0.07 0.05 0.11 0.22 0.13 0.24 0.1 0.13 0.23 0.24 0.05 0.13 0.42 0.11 0.05 0.43 0.2 0.3 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.41 0.02 0.31 0.26 0.23 0.23 0.15 0.09 0.11
0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.44 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.04 0.03
0.46 0.46 0.47 0.45 0.39 0.46 0.58 0.42 0.49 0.58 0.62 0.49 0.53 0.44 0.33 0.53 0.38 0.33 0.34 0.35 0.23 0.29 1.0 0.65 0.24 0.19 0.14 0.15 0.36 0.41 0.32 0.34
0.09 0.04 0.09 0.1 0.05 0.15 0.15 0.05 0.27 0.04 0.07 0.09 0.59 0.1 0.05 0.28 0.32 0.48 0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.03 0.02 0.04 0.0 0.39 0.32 0.31 0.24
0.18 0.26 0.26 0.22 0.22 0.12 0.13 0.16 0.13 0.23 0.22 0.24 1.0 0.02 0.0 0.42 0.11 0.08 0.1 0.04 0.02 0.0 0.51 0.18 0.06 0.22 0.09 0.12 0.08 0.06 0.09 0.13
0.04 0.1 0.03 0.08 0.08 0.17 0.19 0.35 0.14 0.19 0.07 0.07 0.45 0.0 0.02 0.32 0.12 0.28 0.06 0.0 0.0 0.0 0.61 1.0 0.0 0.04 0.05 0.09 0.11 0.06 0.0 0.05
0.2 0.11 0.1 0.1 0.11 0.12 0.04 0.1 0.13 0.18 0.15 0.09 1.0 0.05 0.0 0.44 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.98 0.03 0.09 0.09 0.09 0.05 0.07 0.04 0.03
0.06 0.09 0.14 0.13 0.05 0.08 0.15 0.11 0.09 0.16 0.18 0.18 1.0 0.02 0.0 0.57 0.13 0.15 0.11 0.0 0.07 0.0 0.5 0.15 0.1 0.3 0.09 0.1 0.09 0.13 0.06 0.11
0.28 0.23 0.27 0.26 0.25 0.29 0.2 0.29 0.42 0.25 0.55 0.41 0.59 0.31 0.06 0.25 0.24 0.49 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.08 0.09 0.06 0.04 0.2 0.21 0.26 0.24
0.11 0.14 0.18 0.16 0.15 0.15 0.17 0.14 0.16 0.14 0.16 0.12 0.63 0.06 0.0 0.26 0.16 0.15 0.51 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.01 0.09 0.08 0.09 0.14 0.14 0.17 0.18
0.27 0.21 0.2 0.21 0.21 0.26 0.16 0.2 0.18 0.26 0.23 0.21 0.93 0.51 0.05 0.73 0.22 0.29 0.25 0.06 0.0 0.0 0.97 1.0 0.01 0.05 0.15 0.14 0.29 0.31 0.34 0.53
0.15 0.17 0.18 0.17 0.13 0.19 0.16 0.15 0.21 0.16 0.19 0.2 0.48 0.45 0.04 0.28 0.16 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.12 0.12 0.07 0.1 0.19 0.18 0.22 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)