Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.18 0.19 0.21 0.14 -0.03 -0.05 -0.16 -0.17 -0.2 -0.06 -0.25 -0.28 0.14 0.81 -0.17 0.43 -0.85 -0.54 0.53 -0.87 -1.84 -1.84 -0.78 -0.7 -0.02 1.41 0.71 0.6 -0.32 -0.03 -0.03 -0.24
-0.33 -0.82 -0.72 -0.78 -0.5 -0.75 -0.67 -0.3 0.07 -0.06 0.11 0.01 0.57 1.1 -0.24 1.13 -1.17 -1.12 0.75 -0.61 0.84 -1.57 -1.29 -0.91 0.64 0.54 -0.19 -0.78 -0.31 -0.35 0.78 0.91
-0.43 -0.38 -0.34 -0.26 -0.25 0.09 -0.6 0.01 -0.16 -0.26 -0.42 -0.49 0.83 1.77 1.03 0.96 -0.31 -0.59 0.43 -1.71 0.39 -1.44 -0.76 -0.7 0.77 0.37 -0.29 -0.58 -0.41 -0.47 -1.09 -1.07
-0.67 -0.99 -1.0 -0.5 -0.22 -0.38 -0.15 0.08 0.29 0.12 0.03 -0.34 0.49 1.26 -0.23 0.85 -0.97 -1.04 0.12 -0.44 -1.0 -0.8 -0.12 0.0 0.86 -0.31 0.44 -0.27 -0.22 -0.22 0.77 0.54
-0.53 -0.34 -0.6 -0.41 -0.55 -0.23 -0.7 -0.43 -0.25 -0.21 -0.21 -0.33 -0.55 1.65 -1.39 0.92 -0.92 -0.74 0.32 - -1.12 - -0.72 -0.68 0.25 1.87 1.03 0.12 0.21 -0.07 0.69 0.01
-0.32 -0.35 -0.17 -0.17 -0.16 -0.12 -0.23 0.14 -0.11 -0.09 -0.22 -0.36 -0.06 -0.82 0.12 -0.23 -1.18 -2.17 -0.88 -1.39 0.37 -1.49 -0.51 0.15 0.54 1.72 1.03 1.07 -0.92 -0.84 0.76 0.25
-0.55 -1.93 -1.2 -1.27 -1.25 -0.18 0.81 1.05 0.6 -0.13 -0.6 -0.38 -2.86 -0.47 -0.63 -2.38 -0.3 -1.35 -1.02 -3.58 2.67 -0.13 -1.83 -1.83 0.62 1.61 0.48 0.02 -0.16 -0.47 -0.1 -1.5
-0.81 -0.46 -0.23 -0.11 0.01 -0.28 0.01 -0.25 -0.6 -0.58 -0.78 -0.9 0.84 1.24 1.23 0.25 -1.44 -0.52 0.26 -0.1 0.74 -1.75 -0.77 -0.01 -0.11 1.53 0.85 0.57 -1.62 -1.42 -1.89 -1.87
-2.27 - - -2.28 - - -2.06 1.15 -0.78 0.48 -0.34 -2.11 -0.53 0.98 1.58 1.7 - - 0.97 - - - -2.68 -0.5 2.35 2.79 0.2 -1.04 -2.58 -2.47 -1.27 -
-0.38 0.07 -0.05 -0.16 0.2 -0.0 0.13 0.04 -0.19 0.2 -0.07 -0.47 1.05 0.46 0.52 1.1 -0.78 -1.65 1.25 - -4.19 - 0.43 0.49 -2.68 0.72 0.35 0.65 -0.43 -0.03 -1.27 -1.08
-0.51 0.05 -0.07 0.26 -0.05 0.03 -0.11 -0.02 -0.14 -0.16 -0.4 -0.22 0.53 0.24 0.44 0.63 -0.92 -1.29 0.38 -1.85 0.17 -2.78 -0.42 -0.07 0.96 1.16 0.92 0.75 -0.8 -0.73 -1.23 -1.28
-1.68 -1.4 -1.09 -1.18 -0.74 -1.39 -0.15 -0.33 -0.55 -0.63 -1.16 -1.11 1.4 -0.61 -1.72 1.61 -1.38 -0.72 1.28 -4.25 0.67 -0.35 -0.8 0.06 -0.96 1.26 -1.07 -1.33 0.77 0.97 0.95 1.0
0.03 -0.26 -0.2 -0.08 -0.28 -0.23 -0.1 0.12 0.23 0.13 0.19 0.08 0.41 0.82 -0.04 0.7 -0.74 -0.71 0.11 -4.16 -1.99 -4.62 -0.01 0.12 -0.3 0.96 0.28 0.24 -0.18 -0.07 0.51 0.41
0.1 -0.05 -0.05 -0.07 0.06 -0.05 -0.47 -0.07 0.18 0.19 0.31 0.27 0.49 -0.31 -0.99 0.47 -1.09 -0.74 -0.17 -2.37 -0.16 -0.6 -0.12 0.15 1.05 1.59 0.39 0.33 -0.75 -0.77 -1.1 -1.0
-0.56 -0.37 -1.39 -1.6 -2.48 -0.44 -0.72 -0.35 -0.11 -0.99 -0.49 -0.95 1.68 2.46 1.42 1.54 -2.74 -2.09 -0.72 - -0.48 - -1.17 -1.36 1.24 1.34 0.46 -1.53 -1.12 -1.36 -1.48 -2.15
-0.05 -0.36 -0.73 -0.9 -0.55 -1.03 -1.15 -0.56 -0.54 -0.57 0.04 -0.31 1.34 1.75 -0.59 1.56 -2.12 -0.88 0.78 -0.0 -0.45 -0.49 -0.89 -0.65 0.59 1.04 -0.06 -1.28 -1.19 -1.29 0.37 -0.16
-0.0 -0.13 -0.14 -0.08 -0.14 -0.16 -0.16 0.03 0.04 0.05 0.18 0.01 0.58 0.11 0.04 0.89 -0.16 -0.6 -0.35 -2.85 0.18 -1.65 -0.15 0.2 -0.35 1.12 0.28 0.44 -0.24 -0.02 -0.39 -0.41
-0.64 -0.9 -0.78 -0.65 -0.68 -0.78 -0.18 0.17 0.28 0.25 0.09 -0.29 0.98 0.77 -0.25 0.97 -1.69 -0.98 -0.06 -0.38 -1.23 -1.87 -0.88 -0.23 -0.31 1.43 0.64 0.19 -0.71 -0.56 0.95 0.64
-0.37 -0.31 -0.27 -0.25 -0.22 -0.19 0.06 0.29 0.25 0.24 0.16 0.02 0.05 0.84 -0.08 0.88 -0.53 -0.59 0.28 -4.76 -3.04 -7.17 -0.01 0.27 -0.96 0.16 0.96 0.53 -0.06 0.1 0.39 0.39
-0.01 -0.27 -0.35 -0.27 -0.31 -0.29 -0.51 -0.26 -0.46 -0.6 -0.51 -0.28 -0.32 1.22 -0.12 0.31 -0.76 0.29 0.72 -0.3 0.51 -3.0 -0.29 0.09 0.17 0.84 0.53 0.07 -0.23 -0.07 -0.02 0.4
-0.42 -0.71 -0.51 -0.42 -0.34 -0.3 -0.42 0.01 -0.19 -0.12 -0.34 -0.49 0.39 0.31 0.29 0.42 -0.52 -0.37 0.28 -1.49 0.76 -0.33 -0.07 0.17 0.14 1.21 0.27 0.14 -0.36 -0.34 0.23 0.45
-0.29 -0.23 -0.11 0.08 -0.2 -0.15 0.32 0.44 0.55 0.64 0.37 0.11 -0.05 0.51 -3.12 0.64 -0.93 -1.39 -0.2 -3.3 0.81 -4.93 -0.89 -0.88 0.3 2.16 -0.06 -0.04 -0.61 -0.63 -1.29 -1.3
-0.14 -0.23 -0.44 -0.22 -0.0 -0.18 -0.27 0.04 -0.12 0.0 -0.06 -0.23 0.58 -0.27 -0.92 0.43 -0.56 -0.92 0.43 -0.54 0.45 -2.4 -0.15 -0.1 0.94 1.52 0.48 0.5 -0.31 -0.33 -0.76 -0.88
0.4 0.15 -0.14 -0.21 -0.19 -0.34 0.08 -0.12 0.11 0.12 -0.0 -0.1 -0.23 0.31 0.51 0.57 -1.05 -0.38 0.97 -2.68 -1.61 -5.01 -0.72 -0.15 -1.35 1.26 0.34 0.07 -0.3 -0.29 0.87 0.36
-0.1 -0.02 -0.17 0.14 0.04 0.13 0.13 0.06 -0.04 -0.01 -0.04 -0.12 0.42 1.19 -0.33 1.23 -0.13 -0.53 0.46 -2.26 -4.17 -0.42 0.07 0.25 -1.87 0.13 0.03 0.06 0.04 0.1 -0.43 -0.53
-0.21 -0.41 -0.51 -0.25 -0.13 -0.22 0.13 0.26 0.21 0.27 0.08 0.02 0.29 0.68 0.43 0.42 -0.72 -0.81 0.68 -2.35 -2.14 -4.64 -0.33 -0.04 -0.99 0.83 -0.11 -0.58 0.01 0.05 0.89 1.04
0.34 -0.16 -0.75 -1.01 -0.79 -1.11 -0.72 -0.74 -0.65 -0.77 -0.52 -0.24 0.5 1.03 -1.24 1.68 -0.68 0.33 1.55 -2.48 -0.61 -7.71 -0.77 0.11 -1.8 0.77 0.47 0.04 0.5 0.65 -0.02 -0.03
0.23 -0.14 -0.33 -0.0 -0.2 0.01 -0.48 0.07 0.42 0.35 0.49 0.41 0.86 0.9 0.34 0.36 -0.98 -0.26 -0.04 -1.96 -0.64 -1.55 -0.16 0.69 -1.81 1.26 -0.93 -1.18 -0.5 -0.6 -0.45 0.12
0.01 -0.03 -0.58 -0.64 -0.6 -0.9 -0.57 0.11 0.16 0.18 0.32 0.46 -1.66 1.11 -1.91 0.21 -1.49 0.29 0.36 -2.8 -0.5 -8.54 -1.11 -0.62 -0.16 1.28 1.03 0.46 -0.44 -0.33 0.91 1.01
-0.3 -0.53 -0.85 -1.03 -0.89 -0.98 -0.39 0.17 0.39 0.36 0.31 0.26 0.16 1.16 -0.73 0.76 -1.72 -0.36 0.09 -3.95 -1.79 -7.05 -1.07 0.01 -1.55 1.5 0.68 0.06 -0.37 -0.34 1.22 1.08
-0.11 0.04 -0.04 0.19 0.02 -0.19 0.28 0.15 0.26 0.23 0.3 0.08 0.17 0.72 0.83 0.8 -0.39 -1.5 0.78 -1.79 -4.53 -3.4 0.02 0.13 -3.65 0.37 -0.1 -0.25 -0.0 0.14 0.16 0.06
-0.4 -0.55 -0.54 -0.42 -0.19 -0.61 -0.19 0.05 0.34 0.04 0.25 -0.15 -0.95 1.13 -1.62 0.61 -1.05 -0.87 0.38 -8.6 -1.18 - -0.76 -0.67 0.4 1.78 0.75 0.02 0.3 0.21 0.77 0.24
-0.36 -0.78 -1.25 -0.46 -0.37 -0.31 -0.72 0.07 -0.37 -0.42 -0.55 -0.55 -1.31 1.76 -1.74 0.12 -0.69 -0.32 1.49 -6.78 -1.2 - -0.64 -0.23 0.76 1.27 1.19 0.98 0.21 -0.07 -0.28 -0.47
-0.15 -0.23 -0.54 -0.34 -0.32 -0.58 -0.48 -0.18 -0.26 -0.46 -0.38 -0.36 -0.13 0.57 0.06 0.54 -0.73 -0.55 0.38 -4.16 -0.65 -8.08 -0.03 0.25 0.69 1.44 0.85 0.81 -0.3 -0.19 0.32 0.5
0.32 0.34 0.02 -0.4 -0.49 -1.12 -0.76 0.07 0.4 0.5 0.54 0.36 -0.28 2.24 -0.55 -0.69 -2.37 -0.32 0.45 0.68 -0.51 -0.3 -1.66 -1.65 0.16 1.22 0.17 -1.17 -1.31 -1.54 -0.75 -2.87
0.62 0.27 -0.24 -0.36 -0.4 -0.34 -0.43 -0.49 -0.5 -0.3 -0.34 0.1 0.39 1.6 -0.73 1.13 -0.91 -0.21 0.62 -3.47 0.21 -3.82 -0.92 -0.71 -0.11 0.22 -0.02 -0.6 -0.13 -0.15 0.9 0.39
-0.08 0.24 -0.08 -0.31 -0.2 -0.56 -0.45 -0.6 -0.35 -0.59 -0.21 -0.3 -0.26 1.01 0.5 1.41 -0.7 0.39 0.91 -5.4 -4.51 -4.51 -0.41 0.5 -1.98 0.47 0.98 1.12 -0.22 0.3 -1.06 -0.52
0.18 -0.61 -0.92 -0.42 -0.63 -0.78 -0.64 -0.2 -0.1 -0.19 0.32 0.13 -0.17 0.72 -0.1 1.17 -2.2 0.3 0.57 -1.66 -1.71 -6.21 -0.36 0.67 -1.36 1.55 0.52 0.23 -0.65 -0.54 0.12 1.03
-0.33 -0.39 -0.53 -0.11 -0.06 -0.07 0.1 0.08 0.14 0.02 -0.05 -0.11 -0.09 -0.35 0.92 0.02 -0.65 -0.32 -0.0 -0.84 0.45 -1.51 -0.39 -0.17 -0.83 0.98 0.99 0.93 -0.34 -0.46 -0.23 -0.0
0.03 -0.93 -1.17 -1.23 -0.97 -1.0 -0.43 -0.2 -0.54 -0.21 -0.7 -0.88 -1.13 -0.18 -1.84 -0.57 -0.89 -0.66 0.81 0.75 1.95 -1.02 -2.07 -2.04 0.72 1.85 0.88 0.55 -0.35 -0.32 0.46 0.02
0.24 0.05 -0.09 -0.11 -0.1 -0.26 -0.12 0.04 0.17 0.33 0.18 0.35 0.1 0.57 0.03 0.37 -0.74 -0.66 0.64 -3.61 -2.79 -3.9 -0.25 0.02 -0.99 0.83 0.35 0.21 -0.15 -0.1 0.59 0.64
0.13 -0.08 -0.33 0.03 -0.01 0.16 -0.11 0.28 0.42 0.38 0.15 0.09 0.5 0.26 0.45 0.22 -0.98 -1.17 -0.04 -0.95 -0.19 -1.23 -0.72 -0.41 0.23 0.85 0.84 0.7 -0.84 -0.79 -0.78 -0.5
0.14 -0.36 -0.5 -0.47 -0.63 -0.51 -0.56 -0.41 -0.03 0.11 -0.07 -0.06 0.15 0.97 -0.37 0.56 -0.8 -0.77 0.86 -1.1 -0.23 -0.03 -0.31 0.03 -0.07 0.8 0.22 -0.01 -0.07 0.14 0.42 0.35
-0.1 -0.17 -0.2 0.05 0.06 0.02 0.09 0.09 0.06 0.07 0.02 -0.02 0.34 0.74 0.54 1.01 -0.58 -1.19 0.87 -2.45 -2.15 -2.56 -0.21 0.19 -1.04 0.46 0.48 0.14 -0.34 -0.29 0.24 -0.09
-0.41 -0.25 -0.25 -0.22 -0.37 -0.36 -0.2 -0.11 0.11 0.15 0.16 -0.1 0.4 0.78 -0.61 0.67 -0.52 -0.45 0.13 -2.12 -0.83 -1.93 -0.02 0.11 0.32 0.35 0.77 0.58 -0.21 -0.15 0.5 0.35
-0.27 -0.23 -0.47 -0.41 -0.58 -0.69 -0.08 -0.05 0.12 0.24 0.45 0.35 -0.18 0.45 0.29 0.2 -0.9 -0.55 0.19 -1.26 -0.77 -1.62 -0.65 -0.41 -0.38 1.03 0.33 -0.21 -0.19 -0.13 1.24 0.97
-1.19 -0.44 -0.26 -0.72 -0.88 -0.58 -0.98 -0.78 -0.9 -0.97 -0.2 -0.45 -0.65 1.32 0.65 0.8 -0.67 0.85 0.48 - -31.84 - -0.4 -0.44 -0.53 1.04 0.54 -0.05 0.72 0.68 1.1 1.07
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-0.24 -0.07 -0.0 -0.15 -0.27 -0.26 -0.2 -0.1 -0.04 0.27 0.28 0.3 0.56 -0.99 -2.0 0.23 -0.71 -1.1 0.44 -0.62 -0.38 -1.59 -0.35 -0.39 1.35 1.93 0.18 0.39 -0.07 -0.11 -2.23 -2.36
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-1.81 -1.54 -1.51 -1.2 -1.02 -1.36 -1.13 -0.91 -0.9 -0.8 -0.99 -1.38 0.63 -1.0 0.06 0.1 -1.7 -1.18 1.21 0.64 0.79 -0.96 -0.66 -0.4 1.26 2.18 0.47 0.03 0.04 0.16 0.03 0.85
-0.02 -0.75 -0.79 -0.58 -0.3 -0.83 -0.29 -0.08 0.16 0.19 0.38 0.14 -0.31 -0.23 -0.17 0.25 -1.79 -1.81 0.88 -0.73 0.66 -1.38 -0.95 -0.45 -1.79 1.51 1.11 0.71 -0.55 -0.49 0.19 0.94
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-1.71 -1.67 -1.55 -1.04 -0.74 -0.96 -0.16 0.06 0.12 0.0 -0.24 -0.37 -0.02 1.7 -0.77 1.7 -2.65 -0.51 0.66 -10.4 -1.78 -3.39 -1.57 -0.78 -2.43 1.81 1.25 0.22 -0.36 -0.23 0.38 0.86
-0.15 -0.57 -0.14 -0.43 -0.05 -0.04 -0.18 -0.33 -0.34 -0.38 -0.32 -0.71 0.39 0.46 -0.13 1.1 -0.17 -0.21 1.33 -3.01 -0.32 -1.21 -0.43 -0.25 -0.52 0.01 0.65 -0.46 0.13 0.27 0.6 0.5
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-0.32 -0.19 -0.28 0.1 0.08 0.18 0.04 0.32 0.12 0.14 0.01 0.01 0.14 0.23 0.36 0.13 -1.02 -1.17 -0.21 -1.34 0.57 -1.17 -0.65 -0.44 0.67 1.09 0.87 0.74 -0.84 -0.72 -0.82 -0.56
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-0.12 -0.29 -0.31 -0.25 -0.21 -0.43 -0.33 -0.14 0.19 0.23 0.34 0.2 0.43 0.32 -0.21 0.78 -0.99 -0.82 0.3 -1.11 -0.22 -1.14 -0.61 0.02 0.72 1.47 0.06 -0.01 -0.49 -0.19 -0.4 -0.28
-0.16 -0.44 -0.28 -0.24 -0.36 -0.17 -0.34 0.31 0.06 0.3 0.4 0.19 0.73 0.93 -0.21 0.88 -1.37 -0.47 0.34 -1.25 0.4 -1.68 -0.47 -0.43 -0.06 1.75 -0.07 -0.29 -0.8 -0.98 -1.12 -1.02
0.13 0.07 0.28 0.02 0.23 0.12 0.18 0.19 0.25 0.18 0.23 0.02 0.54 1.11 -0.43 1.15 -0.62 -0.08 0.42 -0.84 -0.89 -3.59 -0.25 0.02 -1.78 0.37 -0.4 -0.15 -0.1 0.06 -1.18 -1.4
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-0.49 -0.44 -0.31 -0.18 -0.17 -0.11 -0.3 -0.1 -0.25 -0.07 -0.26 -0.55 0.56 0.44 0.57 0.78 -0.36 -0.62 0.49 -2.89 -0.08 -3.84 -0.1 -0.07 0.91 1.15 0.67 0.49 -0.27 -0.38 -0.43 -0.66
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0.15 -0.07 -1.97 -2.24 -2.7 -1.34 -1.11 -0.79 -0.73 -1.26 -1.04 -0.74 0.18 2.97 -0.2 0.24 -2.48 -2.33 1.31 -0.09 -4.07 -2.46 -1.96 -2.46 -1.69 2.26 1.22 -0.45 -0.92 -1.23 0.1 -2.98
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.