Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.31 -0.74 -0.05 -0.12 0.16 0.49 0.8 1.14 0.69 0.8 0.7 0.34 1.33 -1.29 -1.14 -0.19 -0.78 -0.19 -0.43 -2.7 -0.96 -1.01 -0.18 -0.04 -1.92 -0.45 0.18 0.26 -0.26 -0.27 -0.35 -0.43
0.25 0.69 0.83 0.68 0.7 0.94 0.27 -0.01 -0.26 -0.37 -0.31 -0.52 0.13 0.6 -2.64 0.04 -0.54 -0.92 0.1 -4.78 -3.96 -6.82 0.67 0.43 -0.66 -1.25 1.08 1.2 -0.48 -0.33 -1.04 -1.37
-1.1 -0.13 0.57 0.89 0.95 0.76 -0.42 -0.88 -1.45 -1.6 -1.5 -1.95 -0.32 -0.21 -0.89 -0.21 0.43 0.11 0.46 -0.58 -1.21 -2.04 0.69 0.4 -0.41 0.87 1.22 1.25 -1.07 -0.92 0.03 -0.73
0.16 -0.18 0.31 0.98 1.18 1.09 0.63 0.57 0.31 0.23 0.28 -0.06 1.74 -1.17 -1.13 0.6 -0.93 -1.53 0.08 -3.23 -3.3 -6.32 -0.51 -0.96 -1.34 -0.1 0.27 0.46 -1.11 -1.14 -1.28 -1.31
-0.03 0.43 0.6 0.66 0.42 0.4 0.69 0.27 0.5 0.28 0.31 0.1 1.34 0.91 -0.65 -0.15 0.67 0.04 -0.83 -3.36 -6.45 -7.76 -0.33 -0.74 -3.57 -0.68 -0.71 -0.21 -0.08 0.18 -0.37 -1.05
-2.31 -0.06 1.68 2.11 1.66 1.08 1.34 1.22 0.38 0.07 -0.7 -1.36 -0.73 -7.34 -8.07 -3.21 -2.59 -4.06 -0.29 -2.81 -1.86 -6.1 -0.31 -0.58 -1.04 1.88 -0.28 -0.32 -3.09 -3.57 -4.21 -3.3
0.45 0.75 0.76 0.64 0.52 0.51 1.16 0.31 0.63 0.75 0.55 0.71 -0.72 -0.89 -0.57 -1.17 0.65 0.71 -1.02 0.17 -2.05 -1.2 -0.32 -0.27 -4.4 -1.79 -2.17 -2.19 -0.3 -0.24 -0.71 -0.75
-1.0 0.68 0.78 1.28 1.42 1.13 0.96 0.32 -0.43 -0.96 -1.17 -1.13 -2.42 -3.13 -2.38 -2.08 1.09 0.46 -0.15 - - - 0.61 -0.07 -3.59 -1.06 0.96 0.93 -0.18 -0.16 -0.33 -0.09
0.43 0.47 0.44 0.31 0.43 0.54 0.21 0.11 0.4 0.41 0.23 0.27 0.38 0.07 -2.02 0.72 -0.6 -0.3 0.52 -5.04 -2.03 -3.6 -0.21 -0.18 -1.93 0.1 -0.0 0.32 -0.53 -0.38 0.13 0.27
0.46 0.38 0.2 0.47 0.54 0.48 -0.09 0.79 0.76 1.13 0.72 0.99 2.3 -1.14 -1.85 -0.37 -1.88 -0.83 -3.6 - -0.93 -5.17 -0.67 -2.03 -4.26 1.06 0.31 -0.48 -4.0 -1.88 -1.92 -1.71
-0.57 0.68 1.25 1.88 1.49 1.32 0.97 0.54 0.24 -0.07 -0.41 -0.8 -1.2 1.18 -3.4 -0.48 -2.38 -2.44 -4.95 - -3.99 - -1.93 -1.8 -1.53 -1.11 1.6 1.14 -2.98 -2.39 -1.94 -1.61
-1.59 0.22 0.67 1.19 0.78 0.83 1.01 0.64 0.89 1.26 0.55 0.2 2.44 -3.51 -3.29 0.0 -1.7 -0.9 -1.59 - - - -1.32 -1.12 -3.15 0.54 -0.95 -0.1 -1.37 -1.5 -2.24 -3.59
-0.68 0.36 1.23 1.93 0.89 0.63 1.0 1.48 0.61 -0.31 -0.73 -1.2 -2.69 -4.56 -4.38 -1.31 -2.01 -2.59 -0.56 -4.86 -0.3 - -0.46 -0.12 1.49 1.35 -0.55 -0.05 -1.23 -1.97 -2.43 -1.87
-0.17 0.64 0.66 0.75 0.66 0.76 1.19 0.73 0.67 0.41 -0.05 -0.02 -0.37 -0.97 -1.45 0.05 -0.46 -1.11 -0.74 -0.66 -1.77 -2.63 -0.25 -0.1 -0.78 0.08 0.14 0.26 -0.44 -0.29 -0.54 -0.58
0.16 0.77 0.94 1.01 1.11 1.03 0.35 -0.17 -0.64 -0.96 -0.76 -0.74 -1.45 -1.37 -1.42 -0.62 0.88 -0.36 0.28 -2.5 -0.78 -2.61 0.28 0.01 -0.34 -0.51 0.5 0.94 -0.14 -0.03 -0.92 -0.94
-0.01 0.09 0.35 0.51 0.54 0.43 0.14 0.06 -0.01 -0.16 -0.38 -0.35 0.25 -0.19 -0.79 0.61 -0.3 -0.96 0.61 -0.39 -0.44 -1.09 -0.23 -0.25 -0.44 0.09 0.29 0.59 -0.25 -0.03 -0.14 -0.14
-0.12 0.28 0.37 0.91 0.77 0.8 0.61 0.94 0.53 0.43 0.04 -0.26 0.61 -0.53 -0.82 0.65 -0.53 -0.82 -0.21 -5.67 -3.22 -0.08 -0.22 -0.21 -1.56 0.49 -0.05 -0.11 -0.49 -0.59 -1.25 -1.13
-0.35 0.3 0.44 0.63 0.3 0.63 0.83 0.58 0.38 0.32 -0.05 -0.14 -0.47 -1.08 -2.03 0.17 -0.27 -0.39 -0.67 -0.64 -0.39 -2.75 0.05 0.32 0.26 0.25 0.02 0.27 -0.26 -0.13 -0.26 -0.33
-0.48 0.0 0.28 0.41 0.56 0.6 0.39 0.24 0.12 -0.0 -0.13 -0.28 0.13 0.27 0.12 0.48 0.04 -1.2 0.14 -2.33 -0.23 -2.1 0.33 0.19 -1.26 0.94 0.07 0.29 -0.13 -0.15 -0.97 -1.16
-1.16 -0.19 0.86 1.54 1.76 1.51 0.93 0.58 0.18 -0.5 -0.67 -1.45 0.66 -0.23 -1.51 -1.46 -0.22 -1.36 -0.98 -4.31 -0.89 -3.22 0.12 -0.35 1.06 -1.48 0.21 0.0 -1.41 -1.44 -1.59 -1.65
0.15 0.24 0.52 0.75 0.75 0.68 0.39 0.2 0.03 0.06 -0.14 -0.32 0.19 0.12 -0.49 0.52 -0.34 -1.25 0.53 -7.89 -8.24 - -0.02 -0.16 -2.1 0.2 0.49 0.83 -0.22 -0.11 -0.14 -0.14
0.2 0.64 0.64 0.42 0.55 0.51 0.11 -0.37 -0.45 -0.58 -0.44 -0.61 0.09 0.34 0.1 0.53 0.12 -0.12 0.54 -0.75 -0.88 -0.36 0.83 0.96 -1.42 -1.01 -0.44 -0.24 -0.37 -0.21 -1.36 -1.17
-0.62 -0.66 -0.36 -0.02 0.19 0.37 0.37 0.59 0.36 0.09 -0.32 -0.54 1.59 0.84 0.33 -0.62 -0.49 -0.88 0.47 -1.37 -0.59 -2.54 -0.42 -0.35 0.58 -0.16 0.48 0.44 -0.15 0.01 -1.37 -1.64
-0.07 1.05 1.33 1.16 1.15 1.19 0.38 -0.5 -0.24 -1.07 -0.9 -1.06 -0.66 -1.11 -1.54 -0.25 0.66 0.67 0.59 -2.3 -0.78 -3.07 0.47 0.6 -1.93 -1.51 -0.14 -0.15 -0.76 -0.4 -1.22 -1.29
-0.81 -0.29 0.24 0.31 0.34 -0.06 0.65 0.67 0.36 0.16 -0.09 -0.47 1.82 0.67 -0.8 0.81 -1.26 -1.89 -0.27 -4.07 -2.64 -6.29 0.43 0.57 -0.94 -0.03 0.07 0.01 -0.08 0.06 -0.7 -0.85
-0.87 -0.05 0.92 1.6 1.85 1.73 0.42 -0.33 -0.88 -0.97 -1.45 -1.13 -0.13 -0.37 -1.43 -0.51 -1.24 -2.25 -0.93 -5.07 -1.15 -2.07 -1.66 -2.3 -0.25 0.29 1.66 1.66 -2.02 -1.98 -2.02 -1.68
-0.04 0.77 1.26 1.29 1.37 1.25 0.63 0.49 0.33 -0.02 -0.04 -0.32 -2.94 -2.25 -1.95 -2.59 -0.18 -1.0 -0.26 -1.2 -2.34 -4.42 0.21 -0.73 -0.25 -0.46 0.55 0.65 -0.53 -0.41 -1.05 -0.72
0.28 0.5 0.35 0.6 0.75 0.94 0.45 0.43 0.34 0.23 0.18 0.12 0.0 -0.9 -1.05 0.09 0.02 -0.71 0.04 -3.65 -3.59 -2.65 0.23 0.18 -1.36 -0.01 0.12 0.21 -0.49 -0.5 -0.0 0.26
-1.04 -0.35 0.32 0.76 0.94 0.89 0.77 0.63 0.25 0.25 -0.1 -0.35 0.92 -0.48 -0.83 0.73 -0.35 -1.43 0.43 -0.19 0.01 -1.15 -0.57 -1.08 0.62 0.22 -0.68 -0.47 -0.97 -0.92 -1.48 -1.42
-0.48 0.68 1.07 1.02 0.74 0.51 0.61 0.35 0.28 0.31 0.06 -0.14 0.6 0.95 -0.41 0.58 -0.62 -0.42 -0.94 -0.47 -1.08 -2.33 -0.23 0.06 -2.37 -0.64 -0.19 -0.27 -1.14 -1.06 -1.3 -1.06
0.07 -0.45 0.41 0.55 -0.58 0.34 0.57 0.27 0.23 -0.27 0.41 0.44 1.54 -0.61 -0.01 0.18 -0.26 -1.49 -0.77 - - - 0.17 0.93 0.39 -0.22 0.29 0.65 -0.5 -0.55 -0.42 -0.97
-0.71 0.14 0.64 1.0 1.14 0.91 0.28 -0.27 -0.34 -0.61 -0.65 -0.86 -0.19 -0.67 0.27 0.27 0.13 -0.82 0.64 -6.41 -3.16 -4.57 0.4 0.22 -0.99 1.05 0.67 0.8 -0.34 -0.39 -1.31 -1.49
0.3 0.74 0.84 0.45 0.2 0.07 0.33 0.62 0.68 0.05 0.35 0.04 1.67 1.42 0.02 0.26 -1.07 -1.05 -1.19 -1.32 -1.25 -3.04 -0.99 -1.0 -0.47 -1.89 -0.81 -1.63 -0.38 -0.58 -0.62 -0.63
0.19 0.33 0.29 0.21 0.26 0.26 0.31 0.39 0.44 0.38 0.31 0.1 -0.28 0.43 -0.52 0.16 -0.48 -0.36 -0.1 -1.71 -0.77 -1.02 0.27 0.29 -0.29 -0.49 0.09 0.11 -0.18 -0.12 -0.22 -0.4
-0.01 0.19 0.61 0.44 0.28 0.29 0.38 0.6 0.68 0.75 0.6 0.42 0.2 0.38 -2.75 -0.33 -1.21 -1.06 -0.09 -5.34 -0.71 -5.39 0.99 0.79 -0.4 0.04 -0.35 0.09 -0.67 -0.72 -0.98 -0.77
0.1 0.77 1.29 0.82 1.3 1.19 0.6 0.93 -0.02 0.15 -0.3 0.41 -6.44 -3.93 -5.33 -5.28 -0.07 -0.94 0.42 -2.47 -7.48 -8.18 -0.02 -1.23 -0.9 -0.83 1.39 1.24 -0.62 -0.94 -0.87 -1.82
0.37 0.42 0.72 0.71 -0.14 0.54 0.03 0.7 0.59 0.94 0.37 0.42 2.37 1.37 1.01 -4.5 - -3.19 -5.07 -4.61 -2.53 - -5.12 -5.08 -2.37 1.44 -0.33 0.05 -5.16 -5.64 -5.69 -6.74
-1.3 0.85 1.61 1.69 1.73 1.63 0.97 0.08 -0.68 -1.37 -2.07 -2.57 -3.8 -1.58 -9.22 -3.64 -2.4 -2.11 -0.63 -3.65 -2.03 -7.35 -1.89 -1.89 2.14 -1.58 1.24 1.2 -2.87 -2.58 -2.39 -1.58
-1.2 1.0 1.61 1.67 1.66 1.54 0.83 -0.1 -0.93 -1.57 -2.34 -2.68 -1.86 0.11 -6.77 -2.2 -1.57 -2.7 -1.47 -3.32 -1.33 -7.03 -0.98 -1.14 1.68 -1.87 1.26 1.2 -2.26 -1.92 -2.0 -0.86
0.26 0.39 0.39 0.46 0.45 0.37 0.23 0.15 0.03 0.11 0.04 -0.02 0.32 -0.39 -1.05 0.55 -0.23 -0.64 0.26 -0.67 -1.26 -1.19 0.05 0.07 -0.69 0.22 0.15 0.01 -0.31 -0.18 -0.01 -0.08
-0.06 0.99 1.13 1.3 1.09 0.73 0.61 0.23 -0.0 0.38 -0.07 -0.13 -0.49 -1.11 -1.81 -0.31 0.76 0.14 0.16 -1.94 -3.02 -2.06 0.73 0.0 -0.73 -0.79 -1.45 -1.51 -0.2 -0.25 -1.35 -1.7
0.17 0.18 0.31 0.65 0.94 1.07 0.67 0.52 0.41 0.42 0.22 -0.03 0.07 0.19 -0.45 0.43 -0.23 -0.24 0.0 -3.29 -3.3 -2.65 0.13 -0.19 -4.1 -0.25 -0.05 0.09 -0.3 -0.29 -0.76 -0.65
-0.48 -0.0 0.65 1.27 1.22 0.99 0.98 0.52 0.33 0.4 0.16 0.04 -0.24 -0.93 -1.43 -0.9 0.31 -0.24 -0.36 -8.68 -5.09 -7.18 0.52 0.47 -5.79 -0.73 -0.25 -0.07 -0.23 -0.31 -0.26 -0.1
-0.08 0.33 0.68 0.4 0.38 0.31 0.56 0.67 0.75 0.93 0.72 0.44 0.07 0.28 -2.95 -0.3 -1.26 -1.08 -0.31 -4.02 -0.5 -7.14 0.85 0.7 -0.84 -0.13 -0.27 -0.11 -0.65 -0.6 -0.97 -0.9
0.35 0.56 0.58 0.54 0.49 0.49 0.17 0.19 0.15 0.19 0.2 0.05 -0.43 0.11 -0.17 -0.1 -0.36 -0.74 0.06 -1.74 -0.71 -1.93 -0.32 -0.33 -0.64 0.01 0.56 0.77 -0.52 -0.45 -0.19 -0.29
0.29 0.27 0.29 0.23 0.29 0.31 0.03 0.26 0.02 0.17 -0.01 -0.02 0.35 0.35 -0.57 0.61 -0.37 -0.31 0.38 -4.48 -3.72 -4.95 0.11 -0.01 -0.41 0.33 0.37 0.41 -0.04 -0.16 -0.13 0.15
-1.31 -0.01 0.68 0.83 0.56 0.45 0.78 0.54 0.21 0.11 -0.13 -0.31 0.19 -0.46 -1.64 -0.02 -0.71 -1.0 -0.59 -0.87 -0.69 -2.29 -0.03 -0.12 0.74 1.2 0.35 0.48 -0.69 -0.8 -0.9 -0.57
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0.14 0.36 0.41 0.48 0.63 0.65 0.52 0.34 0.3 0.49 0.15 0.04 -0.01 -0.29 0.1 0.18 -0.13 -0.27 0.05 -1.78 -0.56 -1.06 -0.03 -0.03 -2.35 -0.37 -0.27 -0.01 -0.23 -0.2 -0.33 -0.35
-0.22 0.64 0.58 0.85 0.7 0.77 0.11 -0.61 -0.74 -0.74 -0.9 -0.82 1.1 0.21 0.35 1.25 0.95 -0.63 -0.36 -1.94 -2.92 -3.03 0.46 0.08 -1.6 -1.58 -0.02 0.31 0.02 -0.01 -1.24 -1.51
0.11 0.2 0.4 0.37 0.72 0.49 0.22 0.32 0.21 0.22 -0.02 -0.26 1.25 -0.61 0.29 0.71 -0.38 -0.65 0.2 -6.41 -2.77 -0.85 -0.52 -0.3 0.2 -0.13 0.31 0.1 -0.43 -0.38 -1.04 -0.97
0.0 0.45 0.59 0.48 0.32 0.08 0.4 0.67 0.76 0.34 0.64 0.33 1.84 1.2 -0.09 -0.25 -0.32 -0.86 -1.18 -4.84 -2.5 -5.98 -0.87 -1.31 -1.52 -1.63 -1.24 -1.49 0.25 0.03 -0.63 -0.31
-1.37 0.25 1.27 1.87 1.61 1.63 1.19 0.69 0.51 0.3 -0.22 -0.4 1.77 -3.21 -3.18 -1.61 -0.75 -1.93 -4.06 - -5.82 -9.18 -0.53 -1.42 -3.48 -1.49 -0.21 0.34 -0.82 -0.6 -2.18 -3.35
-0.72 -0.05 0.29 0.73 1.2 1.52 0.71 0.35 0.02 -0.27 -0.64 -0.74 -0.59 -0.12 -1.45 -0.29 -0.62 -0.79 -0.06 -1.47 -1.4 -3.38 0.01 -0.15 0.9 -0.11 0.61 0.77 -0.94 -0.88 -0.48 -0.17
-0.16 0.29 0.43 0.51 0.53 0.47 0.16 -0.56 -0.56 -0.54 -0.26 -0.37 0.51 0.52 -0.03 0.64 0.23 -0.76 -0.37 -0.89 -0.76 -1.56 0.26 -0.02 0.06 -0.52 0.54 0.3 -0.49 -0.36 0.0 0.03
-0.44 0.44 0.86 1.1 1.09 0.91 1.0 0.75 0.89 0.66 0.48 0.1 0.75 -0.15 -3.97 -0.46 0.22 -0.65 -0.69 -6.3 -3.01 -6.3 -0.71 -1.02 -2.37 -0.39 -0.21 0.16 -0.67 -0.54 -0.84 -1.03
-0.94 0.4 1.1 1.49 1.68 1.77 0.98 0.38 -0.9 -1.58 -2.07 -1.97 -3.29 -2.05 -2.87 -2.37 0.41 -0.43 -0.45 -0.77 0.3 -2.13 0.01 -0.44 0.96 -1.56 0.27 0.41 -0.93 -0.84 -1.27 -1.48
-2.29 -0.91 0.32 1.2 1.68 1.89 1.33 0.52 -0.18 -0.69 -1.31 -2.47 2.85 -1.22 -3.38 0.56 -3.02 -5.1 -1.94 -8.77 -5.64 -4.06 -1.02 -1.71 -0.06 -0.0 -0.47 -0.27 -2.49 -1.45 -3.3 -3.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.