Heatmap: Cluster_141 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.27 0.46 0.49 0.41 0.46 0.34 0.17 0.42 0.39 0.46 0.56 0.3 0.14 -0.47 -0.46 -0.07 -0.25 -0.51 0.07 -2.67 -3.12 -3.08 -0.24 -0.42 -0.59 0.47 0.44 0.54 -0.34 -0.34 -0.3 -0.22
-0.06 0.08 0.17 0.13 0.12 0.0 0.42 0.56 0.47 0.61 0.51 0.27 0.09 0.12 -0.25 0.24 -0.43 -0.72 0.12 -5.15 -5.23 -3.43 -0.14 -0.11 -1.89 0.91 0.65 0.61 -0.21 -0.19 -0.13 -0.29
0.01 0.23 0.39 0.51 0.64 0.68 0.59 0.52 0.67 0.24 0.44 0.03 -0.62 -0.33 0.29 -0.32 -0.75 -1.61 -0.48 -3.96 -2.64 -6.78 -0.74 -0.59 -1.43 0.83 1.25 1.14 -0.56 -0.46 -1.05 -0.72
0.1 0.1 0.13 0.39 0.51 0.35 0.23 0.44 0.65 0.46 0.43 0.3 -0.06 -0.53 -0.67 0.32 -0.32 -1.2 0.45 -3.51 -2.98 -3.72 0.12 0.16 -1.35 1.06 0.35 0.39 -0.13 -0.16 -0.71 -0.67
0.21 0.23 0.13 0.24 0.07 -0.01 -0.06 0.34 0.41 0.44 0.49 0.36 -0.07 -0.02 -0.38 0.23 -0.64 -1.07 0.07 -4.13 -2.16 -4.32 -0.31 -0.2 -1.52 1.3 0.67 0.64 -0.42 -0.31 -0.09 0.31
0.18 0.53 0.38 0.48 0.43 0.46 0.58 0.21 0.46 0.28 0.17 0.05 -0.64 -0.36 0.17 0.16 -0.46 -0.72 -0.3 -6.33 -5.59 -6.54 -0.5 -0.72 -4.0 0.85 1.21 1.39 -0.55 -0.46 -0.71 -0.75
0.23 0.19 0.31 0.51 0.44 0.25 0.41 0.54 0.4 0.49 0.42 0.15 -0.03 -0.02 0.38 0.04 -0.52 -1.19 0.15 - - - -0.35 -0.47 -5.81 0.5 0.83 1.01 -0.25 -0.21 -0.42 -0.36
-0.06 0.25 0.3 0.26 0.29 0.21 0.18 0.3 0.14 0.14 0.04 -0.01 0.16 0.08 -0.21 0.32 -0.33 -1.07 0.25 -3.32 -3.41 -4.27 -0.01 0.03 -1.13 0.81 0.83 0.99 -0.22 -0.15 -0.31 -0.14
0.24 0.12 0.09 0.17 0.19 0.18 0.14 0.34 0.28 0.28 0.28 0.2 -0.09 0.17 0.39 0.21 -0.14 -0.77 0.23 -5.54 -3.91 -8.16 -0.21 -0.19 -4.21 0.64 0.74 0.89 0.09 0.07 -0.16 -0.11
0.16 0.1 0.14 0.3 0.3 0.2 0.17 0.45 0.5 0.47 0.47 0.41 -0.14 -0.34 -0.1 -0.04 -0.41 -1.79 -0.0 -2.12 -1.99 -3.34 -0.13 -0.04 -0.16 0.87 0.54 0.42 -0.32 -0.2 -0.17 -0.13
0.14 0.08 0.41 0.38 0.47 0.15 0.61 0.88 0.82 0.91 0.85 0.48 -0.11 -0.59 -0.47 0.04 -0.54 -1.39 -0.34 -11.24 -9.6 -8.16 -1.2 -1.63 -7.41 1.4 0.24 0.43 -0.15 -0.1 -0.31 -0.48
0.42 0.29 0.48 0.28 0.25 0.09 -0.05 0.5 0.59 0.51 0.4 0.24 -0.02 -0.29 -0.53 -0.21 -0.16 -1.03 -0.09 - -3.82 -5.32 -0.06 -0.32 -0.99 0.99 0.78 0.65 -0.12 -0.02 -0.34 -0.4
0.46 0.07 0.08 0.31 0.17 0.1 0.25 0.61 0.61 0.76 0.72 0.65 -0.5 -0.97 -1.14 -0.72 -0.17 -0.53 -0.31 -5.13 -4.64 -6.46 -0.55 -0.7 -1.47 1.32 0.43 0.59 -0.0 -0.08 -0.05 0.33
0.33 0.01 -0.01 0.18 0.16 0.16 0.34 0.74 0.88 0.86 0.75 0.8 -1.89 -0.39 -1.93 -0.58 -0.6 -1.0 0.21 -2.82 -1.89 -4.1 -0.48 -0.26 -0.85 1.23 0.46 0.33 -0.18 -0.22 -0.17 -0.16
0.08 0.22 0.26 0.27 0.19 0.1 0.37 0.5 0.55 0.79 0.67 0.65 -0.04 -0.31 -0.49 -0.09 -0.4 -0.95 -0.17 -4.17 -2.91 -3.13 -0.11 -0.11 -1.2 0.76 0.47 0.53 -0.16 -0.15 -0.38 -0.3
-0.02 0.14 0.23 0.29 0.28 0.36 0.64 0.61 0.59 0.66 0.5 0.39 0.0 -0.52 -0.43 -0.09 -0.37 -0.87 -0.1 -1.69 -1.22 -1.71 -0.28 -0.25 -1.18 0.56 0.21 0.29 -0.19 -0.18 -0.17 -0.27
0.31 0.16 0.28 0.33 0.34 0.17 0.18 0.37 0.34 0.39 0.35 0.18 0.84 -0.1 -1.08 0.59 -0.91 -1.05 -0.11 -5.05 -3.95 -6.23 -0.34 -0.32 -2.8 0.86 0.91 0.85 -0.45 -0.39 -0.11 -0.07
0.16 -0.03 -0.07 -0.1 0.19 0.29 -0.09 0.27 0.21 0.32 0.39 0.23 0.32 0.21 -0.12 0.17 -0.37 -0.38 0.2 -2.35 -1.3 -2.23 0.05 0.05 -2.32 0.78 0.77 0.59 -0.46 -0.52 -0.1 0.14
0.29 -0.02 0.07 0.33 0.39 0.2 0.24 0.6 0.55 0.6 0.54 0.5 -0.28 -0.21 -0.48 -0.26 -0.42 -1.82 -0.17 -4.06 -2.48 -3.57 -0.42 -0.46 -1.55 1.04 0.85 0.57 -0.25 -0.26 0.02 0.22
0.58 0.24 0.12 0.16 0.07 0.01 0.04 0.38 0.55 0.53 0.72 0.64 -0.26 -0.43 -0.26 0.05 -0.61 -1.21 -0.01 -2.81 -2.11 -2.77 -0.22 -0.1 -0.23 1.06 0.34 0.42 -0.15 -0.1 -0.49 -0.52
0.27 0.27 0.18 0.33 0.37 0.26 0.24 0.45 0.43 0.48 0.44 0.37 -0.26 -0.53 -0.18 -0.06 -0.35 -0.87 0.1 -3.45 -1.48 -4.17 -0.16 -0.21 -0.5 0.74 0.56 0.49 -0.19 -0.21 -0.2 -0.22
0.32 0.19 0.1 0.25 0.24 0.12 0.09 0.32 0.4 0.48 0.49 0.36 -0.07 -0.1 0.28 -0.07 -0.64 -1.09 -0.31 -3.16 -3.18 -2.54 -0.25 -0.09 -0.31 1.01 0.64 0.57 -0.7 -0.45 -0.11 0.12
0.41 0.1 -0.05 0.12 0.22 0.16 0.3 0.66 0.67 0.8 0.78 0.81 -0.64 -0.58 -0.86 -0.49 -0.52 -0.88 -0.3 -1.69 -1.64 -2.4 -0.33 -0.38 -0.36 0.97 0.5 0.4 -0.25 -0.29 -0.35 -0.47
0.39 0.42 0.35 0.43 0.36 0.29 0.32 0.49 0.35 0.46 0.43 0.35 -0.16 -0.49 -0.29 0.03 -0.38 -0.94 0.19 -3.61 -4.9 -4.96 -0.4 -0.36 -3.18 0.78 0.76 0.96 -0.21 -0.15 -0.39 -0.42
0.48 0.44 0.34 0.42 0.37 0.32 0.41 0.57 0.49 0.58 0.42 0.5 0.2 -0.34 -1.0 0.08 -0.55 -1.03 -0.0 -3.56 -2.4 -5.1 -0.3 -0.27 -1.21 0.72 0.41 0.53 -0.14 -0.12 -0.47 -0.63
0.05 0.4 0.33 0.36 0.37 0.37 0.5 0.21 0.31 0.34 0.23 0.3 0.3 -0.19 -0.12 0.29 -0.37 -0.86 -0.45 -2.81 -3.76 -3.5 -0.29 -0.37 -1.49 0.46 0.79 1.12 -0.3 -0.25 -0.39 -0.34
0.37 0.12 0.19 0.34 0.3 0.21 0.41 0.71 0.77 0.82 0.85 0.69 -0.15 -0.35 -0.58 0.1 -0.47 -1.09 -0.13 -6.35 -4.24 -4.4 -0.28 -0.24 -2.69 0.61 -0.1 0.03 -0.2 -0.22 0.29 0.11
0.11 0.15 0.2 0.4 0.35 0.37 0.3 0.44 0.33 0.41 0.13 0.09 -0.2 -0.23 0.27 0.16 -0.49 -0.94 0.36 -5.99 -8.32 - -0.33 -0.27 -2.13 0.8 1.01 0.92 -0.3 -0.2 -0.22 -0.29
0.41 0.31 0.29 0.25 0.35 0.25 0.35 0.6 0.51 0.62 0.65 0.4 -0.22 -0.76 -0.74 -0.07 -0.68 -1.06 -0.24 -5.57 -3.72 -2.75 -0.19 -0.04 -3.13 1.2 0.64 0.73 -0.34 -0.32 -0.26 -0.29
0.7 0.46 0.32 0.4 0.41 0.4 0.42 0.6 0.69 0.76 0.74 0.71 -0.45 -0.09 -0.03 -0.35 -0.88 -1.12 -0.32 -4.41 -2.87 -3.44 -0.72 -0.63 -2.34 0.77 0.51 0.42 -0.7 -0.65 -0.4 -0.17
0.18 0.2 0.15 0.33 0.28 0.18 0.31 0.51 0.38 0.42 0.4 0.23 -0.3 -0.61 0.0 -0.04 -0.58 -1.3 0.02 -2.36 -2.4 -2.64 -0.32 -0.27 -1.96 0.92 0.94 0.82 -0.31 -0.28 0.03 0.04
0.24 0.44 0.46 0.48 0.52 0.43 0.42 0.47 0.36 0.38 0.31 0.2 -0.24 -0.36 -0.15 0.02 -0.39 -0.87 0.15 -5.95 -3.95 -3.37 -0.28 -0.43 -2.67 0.49 0.84 0.77 -0.3 -0.21 -0.17 -0.18
0.33 0.14 0.07 0.45 0.37 0.24 0.49 0.83 0.82 0.86 0.8 0.75 -0.56 -0.66 -0.76 -0.49 -0.72 -1.4 -0.36 -3.53 -3.53 -5.02 -0.45 -0.32 -2.04 1.1 0.46 0.36 -0.51 -0.54 -0.02 0.02
0.16 0.16 0.14 0.36 0.39 0.25 0.16 0.34 0.35 0.32 0.32 0.19 -0.25 -0.17 -0.03 -0.14 -0.56 -1.39 -0.2 -3.4 -2.38 -2.12 -0.35 -0.31 -1.19 1.16 1.07 1.13 -0.44 -0.38 -0.41 -0.45
0.2 -0.05 -0.03 0.27 0.35 0.22 0.22 0.24 0.37 0.41 0.48 0.21 0.02 -0.02 -0.56 0.27 -0.62 -1.22 0.27 -3.35 -3.23 -5.32 -0.11 -0.3 -1.59 0.69 0.8 0.86 -0.19 -0.17 -0.02 0.43
0.3 0.31 0.44 0.31 0.37 0.18 0.32 0.48 0.47 0.52 0.57 0.35 -0.33 -0.63 -0.66 -0.15 -0.64 -1.16 -0.08 -4.17 -4.13 -4.16 -0.57 -0.61 -2.18 1.1 0.86 0.96 -0.31 -0.2 -0.01 -0.03
-0.01 0.2 0.14 0.28 0.2 0.14 0.24 0.36 0.27 0.45 0.39 0.3 0.13 -0.02 -0.56 0.21 -0.52 -0.96 0.19 -1.74 -2.03 -3.28 -0.24 -0.18 -0.31 0.8 0.55 0.54 -0.3 -0.34 0.01 -0.01
0.28 0.36 0.35 0.32 0.35 0.24 0.37 0.39 0.51 0.54 0.56 0.55 -0.39 -0.64 -1.19 -0.14 -0.58 -0.91 -0.11 -1.69 -1.34 -1.81 -0.4 -0.47 -0.41 0.73 0.46 0.59 -0.19 -0.11 -0.32 -0.22
0.34 0.26 0.09 0.28 0.18 0.01 0.07 0.22 0.24 0.27 0.24 0.25 -0.09 -0.12 -0.12 0.18 -0.24 -1.05 0.37 -4.04 -2.22 -3.24 -0.18 -0.19 -1.99 0.67 0.59 0.73 -0.06 0.06 0.22 0.36
0.15 0.21 0.14 0.32 0.45 0.27 0.12 0.32 0.3 0.38 0.33 0.32 0.04 -0.18 -1.08 0.59 -0.6 -1.1 0.3 -3.22 -1.75 -3.05 -0.0 0.24 -0.0 0.85 0.29 0.32 -0.28 -0.31 -0.36 -0.3
0.45 0.34 0.08 0.48 0.43 0.28 0.09 0.29 0.34 0.32 0.32 0.36 -0.48 -0.32 -0.2 -0.25 -0.41 -1.2 0.1 -2.33 -1.73 -1.24 -0.28 -0.28 -0.49 0.38 0.92 0.56 -0.49 -0.35 -0.21 0.28
0.03 -0.01 0.29 0.36 0.42 0.38 0.48 0.72 0.58 0.5 0.6 0.19 0.06 -0.63 -0.7 0.14 -0.4 -0.85 -0.06 -5.44 -3.52 -3.16 -0.09 0.25 -1.47 0.79 0.56 0.6 -0.17 -0.16 -0.73 -0.47
0.19 0.02 0.07 0.32 0.49 0.37 0.16 0.51 0.57 0.52 0.47 0.16 0.12 -0.5 -0.2 0.07 -0.5 -0.93 -0.01 -3.74 -2.63 -5.32 -0.19 0.07 -0.34 0.57 0.66 0.67 -0.17 -0.13 -0.41 -0.39
0.26 0.41 0.44 0.61 0.57 0.42 0.29 0.45 0.19 0.26 0.16 0.16 -0.15 -0.63 -0.59 0.04 -0.23 -1.06 0.08 -1.99 -2.68 -4.0 -0.25 -0.24 -1.42 0.79 0.81 0.89 -0.15 -0.13 -0.58 -0.65
0.18 0.11 -0.08 0.13 0.27 0.2 0.29 0.31 0.36 0.37 0.41 0.19 0.12 -0.19 -0.14 0.28 -0.56 -0.87 0.12 -2.43 -1.13 -1.93 -0.25 -0.21 -0.36 0.74 0.51 0.42 -0.38 -0.34 -0.04 0.2
0.07 0.04 0.04 0.23 0.3 0.29 0.35 0.51 0.39 0.33 0.31 0.1 -0.54 -1.03 -0.22 -0.26 -0.58 -1.12 0.01 -2.37 -2.64 -1.77 -0.35 -0.43 -2.33 1.12 1.23 1.06 -0.4 -0.28 -0.02 0.2
-0.06 0.06 0.18 0.2 0.25 0.11 0.36 0.74 0.67 0.76 0.76 0.48 0.26 0.05 -0.56 0.11 -0.7 -0.97 -0.28 -4.89 -4.07 -4.69 -0.08 0.03 -2.94 0.83 0.26 0.24 -0.32 -0.32 0.1 0.16
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0.12 0.07 0.15 0.11 0.19 0.21 0.21 0.34 0.19 0.23 0.24 0.04 -0.22 0.01 0.27 -0.04 -0.3 -0.35 -0.04 -1.8 -2.14 -3.01 -0.07 -0.01 -1.02 0.82 0.93 0.96 -0.31 -0.31 -0.35 -0.41
0.22 0.35 0.18 0.38 0.35 0.29 0.2 0.35 0.38 0.38 0.41 0.31 0.08 0.07 -0.39 0.09 -0.32 -0.51 0.15 -1.4 -2.49 -3.92 -0.01 0.1 -0.21 0.59 0.29 0.28 -0.35 -0.22 -0.6 -0.49
0.35 0.27 0.1 0.39 0.34 0.15 0.13 0.38 0.36 0.42 0.4 0.33 -0.02 -0.35 -0.37 0.15 -0.53 -1.37 0.19 -2.73 -2.47 -2.75 -0.21 -0.21 -2.23 0.98 0.51 0.47 -0.27 -0.25 0.22 0.32
0.45 0.09 0.05 0.46 0.52 0.39 0.37 0.39 0.4 0.47 0.54 0.57 -0.17 -0.54 -0.08 0.02 -0.44 -0.72 -0.04 -3.59 -3.26 -7.18 -0.51 -0.68 -2.0 0.97 0.63 0.38 -0.27 -0.22 0.07 -0.01
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0.06 0.23 0.08 0.19 0.21 -0.04 0.34 0.34 0.32 0.42 0.23 0.23 0.09 -0.38 0.11 0.29 -0.36 -1.19 0.35 -5.75 -9.37 - -0.3 -0.32 -2.79 1.18 0.77 0.83 0.0 0.03 -0.11 -0.2
0.27 -0.08 0.03 0.21 0.35 0.08 0.17 0.43 0.48 0.55 0.56 0.41 0.15 -0.77 -1.41 0.38 -0.61 -0.83 0.37 -5.8 -5.07 - -0.33 -0.25 -4.01 1.36 0.36 0.43 0.05 -0.07 0.18 0.29
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0.16 0.15 0.14 0.28 0.35 0.23 0.09 0.28 0.22 0.22 0.24 0.1 -0.09 -0.36 0.08 0.05 -0.44 -1.1 0.18 -4.83 -6.65 -2.22 -0.22 -0.17 -3.69 1.2 1.03 1.21 -0.24 -0.23 -0.34 -0.37
0.29 0.17 0.22 0.17 0.33 0.09 -0.01 0.41 0.35 0.46 0.33 0.26 0.04 -0.21 0.02 0.19 -0.63 -0.87 -0.05 -2.56 -3.11 -2.65 -0.33 -0.15 -1.01 1.12 0.81 0.9 -0.49 -0.44 -0.39 -0.4
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0.16 0.12 0.08 0.16 0.22 0.1 0.11 0.21 0.17 0.16 0.15 0.1 -0.23 -0.4 -0.11 0.0 -0.51 -0.85 0.26 -2.82 -3.37 -4.17 -0.41 -0.36 -1.44 1.14 1.19 1.21 -0.3 -0.24 0.19 -0.08
-0.22 0.06 0.2 0.43 0.42 0.49 0.51 0.53 0.47 0.5 0.43 0.24 0.07 -0.46 0.14 0.33 -0.39 -1.33 0.21 -3.63 -7.85 - 0.04 0.08 -2.55 0.87 0.3 0.67 0.01 0.03 -0.72 -0.79
0.14 0.26 0.52 0.65 0.67 0.7 0.49 0.57 0.42 0.45 0.32 0.18 -0.64 -0.87 -0.23 -0.28 -0.61 -1.28 -0.5 -3.07 -2.54 -1.32 -0.09 -0.23 -1.39 0.68 0.86 0.98 -0.52 -0.49 -0.7 -0.77
0.16 0.19 0.08 0.3 0.31 0.18 0.15 0.67 0.79 1.02 0.83 0.7 -0.29 -0.91 -0.52 0.21 -0.36 -1.55 0.38 - -5.04 -6.78 -0.37 -0.5 -2.92 1.06 0.19 -0.05 0.1 0.06 -0.45 -0.16
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0.38 0.18 0.21 0.37 0.33 0.22 0.11 0.5 0.45 0.42 0.5 0.4 -0.27 -0.34 -0.18 -0.13 -0.53 -1.56 0.39 -3.72 -5.66 -6.33 -0.4 -0.47 -2.65 1.03 0.89 0.94 -0.12 -0.13 -0.39 -0.24
0.43 0.18 0.07 0.33 0.2 0.1 0.16 0.31 0.38 0.39 0.45 0.4 -0.18 -0.48 -0.16 -0.18 -0.29 -1.16 -0.05 -3.06 -0.84 -2.36 -0.17 -0.21 0.12 0.68 0.57 0.49 -0.41 -0.26 -0.0 -0.08
0.25 0.24 0.21 0.28 0.3 0.14 0.35 0.5 0.42 0.59 0.58 0.33 0.05 -0.38 -0.02 0.15 -0.6 -1.4 -0.04 -5.06 -4.92 -5.11 -0.1 -0.06 -2.64 0.9 0.74 0.81 -0.24 -0.08 -0.46 -0.35
0.47 0.53 0.56 0.51 0.57 0.46 0.4 0.41 0.52 0.35 0.43 0.34 -0.59 -0.72 -0.29 -0.2 -0.21 -0.52 -0.03 -8.26 -8.34 -5.16 -0.38 -0.59 -4.69 0.42 0.6 0.72 -0.05 0.1 -0.05 -0.1
0.44 0.26 0.35 0.38 0.39 0.09 0.2 0.46 0.5 0.4 0.5 0.43 -0.47 -0.21 0.21 0.08 -0.44 -1.65 0.19 -4.31 -1.87 -6.53 -0.45 -0.58 -1.8 0.76 0.8 0.67 -0.18 -0.16 -0.31 -0.2
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0.5 0.11 -0.11 0.25 0.24 0.06 0.18 0.32 0.54 0.48 0.65 0.65 -0.89 -1.26 -0.17 -0.75 -0.45 -0.82 -0.57 -3.47 -2.11 -2.82 0.14 0.27 -0.73 1.12 0.7 0.47 -0.47 -0.38 0.08 0.38
0.13 0.17 0.32 0.38 0.38 0.21 0.2 0.34 0.28 0.32 0.31 0.18 0.0 -0.84 -0.68 0.47 -0.34 -1.04 0.27 -4.48 -4.06 -4.84 -0.0 0.12 -1.98 1.08 0.76 0.98 -0.2 -0.23 -0.42 -0.42
0.2 0.17 0.21 0.36 0.33 0.43 0.49 0.66 0.75 0.75 0.68 0.63 -0.48 -0.57 -0.64 -0.16 -0.55 -0.57 -0.2 -7.38 -4.36 - -0.52 -0.51 -1.82 1.02 0.49 0.54 -0.26 -0.12 -0.3 -0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.