Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101378	0.45	0.54	0.53	0.55	0.43	0.5	0.53	0.33	0.44	0.37	0.29	0.41	0.04	0.07	0.04	0.06	1.0	0.81	0.28	0.16	0.93	0.21	0.37	0.23	0.47	0.03	0.13	0.17	0.7	0.72	0.52	0.38
Smo104218	0.4	0.35	0.36	0.32	0.29	0.29	0.33	0.3	0.37	0.38	0.42	0.45	0.02	0.06	0.03	0.07	0.9	0.64	0.15	0.34	1.0	0.1	0.38	0.24	0.37	0.15	0.18	0.2	0.88	0.75	0.86	0.85
Smo107348	0.61	0.56	0.76	0.74	0.77	0.89	0.98	0.88	0.83	0.68	0.7	0.62	0.06	0.24	0.19	0.1	0.8	0.55	0.29	0.37	1.0	0.44	0.35	0.28	0.61	0.38	0.98	0.99	0.69	0.64	0.57	0.52
Smo110114	0.53	0.58	0.62	0.5	0.38	0.33	0.59	0.78	0.81	0.81	0.74	0.64	0.0	0.0	0.0	0.01	0.77	0.97	0.62	0.12	0.65	0.0	0.51	0.4	0.55	0.29	0.32	0.27	1.0	0.88	0.39	0.52
Smo127459	0.65	0.57	0.61	0.61	0.61	0.67	0.91	0.95	1.0	0.98	0.94	0.88	0.01	0.04	0.01	0.03	0.7	0.42	0.15	0.08	0.85	0.13	0.35	0.19	0.24	0.48	0.85	0.87	0.74	0.67	0.71	0.62
Smo128732	0.55	0.49	0.58	0.56	0.54	0.65	0.83	1.0	0.91	0.92	0.88	0.89	0.03	0.04	0.03	0.06	0.84	0.51	0.21	0.4	0.87	0.06	0.45	0.23	0.41	0.27	0.33	0.34	0.81	0.65	0.62	0.64
Smo134339	0.7	0.62	0.71	0.66	0.71	0.66	0.74	0.71	0.74	0.69	0.78	0.71	0.04	0.11	0.02	0.09	0.76	0.62	0.22	0.23	0.85	0.05	0.45	0.31	0.58	0.65	1.0	0.99	0.74	0.71	0.61	0.62
Smo141946	0.78	0.71	0.59	0.56	0.52	0.46	0.47	0.44	0.56	0.53	0.59	0.7	0.52	0.41	0.29	0.6	1.0	0.75	0.83	0.18	0.68	0.01	0.79	0.81	0.74	0.4	0.33	0.38	0.97	0.99	0.69	0.64
Smo148450	0.43	0.42	0.42	0.49	0.54	0.55	0.61	0.64	0.63	0.53	0.51	0.5	0.08	0.22	0.22	0.12	0.41	0.38	0.31	0.42	0.55	0.19	0.3	0.26	0.56	0.5	1.0	0.98	0.42	0.47	0.33	0.3
Smo149722	0.67	0.65	0.68	0.74	0.74	0.79	0.75	0.68	0.71	0.68	0.64	0.72	0.01	0.05	0.01	0.05	0.7	0.44	0.19	0.16	1.0	0.04	0.4	0.21	0.57	0.14	0.26	0.3	0.65	0.61	0.52	0.45
Smo159042	0.36	0.35	0.4	0.42	0.45	0.53	0.59	0.45	0.47	0.38	0.39	0.35	0.1	0.15	0.14	0.11	0.65	0.39	0.2	0.29	0.75	0.37	0.29	0.21	0.42	0.36	0.92	1.0	0.53	0.51	0.41	0.35
Smo16497	0.38	0.36	0.42	0.37	0.38	0.45	0.5	0.46	0.46	0.44	0.4	0.41	0.05	0.04	0.02	0.06	0.77	0.87	0.26	0.18	1.0	0.16	0.42	0.23	0.38	0.44	0.65	0.82	0.73	0.71	0.41	0.3
Smo17067	0.44	0.46	0.46	0.49	0.4	0.53	0.51	0.42	0.48	0.44	0.4	0.43	0.16	0.23	0.21	0.17	0.68	1.0	0.27	0.51	0.53	0.55	0.34	0.27	0.37	0.13	0.27	0.29	0.56	0.51	0.43	0.38
Smo178693	0.53	0.54	0.63	0.61	0.58	0.64	0.73	0.74	0.71	0.67	0.74	0.63	0.34	0.34	0.37	0.44	0.98	0.79	0.69	0.18	0.89	0.33	0.62	0.55	0.38	0.6	0.44	0.59	0.94	1.0	0.64	0.5
Smo19706	0.43	0.31	0.32	0.22	0.19	0.15	0.22	0.25	0.35	0.37	0.52	0.5	0.02	0.04	0.01	0.06	0.48	0.52	0.12	0.26	1.0	0.04	0.25	0.22	0.57	0.18	0.16	0.21	0.57	0.5	0.41	0.37
Smo230318	0.41	0.51	0.5	0.59	0.52	0.71	0.56	0.53	0.62	0.52	0.44	0.39	0.0	0.0	0.01	0.02	0.87	1.0	0.4	0.15	0.99	0.16	0.07	0.03	0.09	0.18	0.18	0.19	0.44	0.47	0.36	0.32
Smo230434	0.65	0.65	0.65	0.68	0.71	0.82	0.93	0.76	0.77	0.68	0.63	0.63	0.19	0.34	0.33	0.31	1.0	0.82	0.67	0.8	0.63	0.65	0.6	0.6	0.85	0.38	0.91	0.98	0.85	0.87	0.65	0.55
Smo231982	0.73	0.78	0.79	0.84	0.87	0.95	0.98	0.84	0.93	0.79	0.85	0.83	0.39	0.42	0.43	0.5	0.94	0.62	0.51	0.62	0.77	0.64	0.49	0.39	0.86	0.66	0.92	1.0	0.87	0.88	0.77	0.6
Smo233811	0.4	0.41	0.42	0.48	0.46	0.57	0.63	0.49	0.55	0.5	0.46	0.45	0.05	0.12	0.1	0.06	0.6	0.46	0.16	0.07	1.0	0.45	0.22	0.17	0.52	0.11	0.33	0.34	0.48	0.43	0.31	0.26
Smo27993	0.26	0.3	0.36	0.31	0.29	0.3	0.32	0.26	0.32	0.31	0.3	0.33	0.0	0.03	0.01	0.04	0.75	0.61	0.18	0.31	1.0	0.06	0.39	0.23	0.57	0.05	0.15	0.18	0.71	0.66	0.44	0.45
Smo28055	0.27	0.19	0.2	0.27	0.25	0.3	0.32	0.33	0.37	0.41	0.4	0.42	0.03	0.05	0.08	0.11	0.31	0.87	0.21	0.14	1.0	0.41	0.14	0.16	0.23	0.16	0.18	0.2	0.46	0.46	0.4	0.32
Smo28777	0.82	0.83	0.81	0.86	0.84	0.92	0.85	0.69	0.74	0.69	0.73	0.79	0.05	0.06	0.03	0.1	1.0	0.97	0.32	0.22	0.67	0.3	0.37	0.21	0.26	0.12	0.46	0.47	0.7	0.6	0.42	0.4
Smo28797	0.61	0.37	0.26	0.26	0.17	0.18	0.25	0.39	0.44	0.59	0.63	1.0	0.06	0.02	0.02	0.04	0.39	0.44	0.1	0.66	0.94	0.36	0.2	0.12	0.58	0.22	0.11	0.1	0.6	0.41	0.47	0.35
Smo29306	0.27	0.23	0.26	0.26	0.25	0.26	0.29	0.31	0.34	0.33	0.33	0.34	0.0	0.02	0.0	0.04	0.95	0.86	0.17	0.13	0.87	0.06	0.4	0.24	0.12	0.04	0.08	0.08	1.0	0.85	0.74	0.74
Smo36490	0.68	0.56	0.53	0.56	0.61	0.57	0.67	0.58	0.72	0.71	0.68	0.65	0.18	0.16	0.22	0.19	0.68	0.49	0.37	0.02	1.0	0.36	0.39	0.34	0.76	0.57	0.75	0.82	0.62	0.63	0.49	0.56
Smo36935	0.44	0.65	1.0	0.69	0.84	0.6	0.8	0.53	0.45	0.5	0.34	0.49	0.01	0.03	0.0	0.03	0.43	0.15	0.18	0.08	0.34	0.01	0.35	0.21	0.78	0.09	0.45	0.8	0.44	0.38	0.34	0.21
Smo36999	0.25	0.21	0.19	0.13	0.08	0.08	0.13	0.12	0.18	0.25	0.3	0.35	0.0	0.0	0.0	0.01	0.34	0.21	0.13	0.05	1.0	0.01	0.09	0.04	0.16	0.06	0.07	0.07	0.36	0.34	0.34	0.32
Smo38729	0.46	0.42	0.49	0.47	0.45	0.56	0.61	0.56	0.56	0.52	0.54	0.49	0.08	0.11	0.1	0.12	0.62	1.0	0.22	0.12	0.32	0.13	0.37	0.26	0.13	0.22	0.47	0.47	0.59	0.51	0.59	0.53
Smo39422	0.32	0.35	0.4	0.38	0.41	0.44	0.46	0.44	0.44	0.35	0.4	0.35	0.05	0.03	0.03	0.09	0.66	1.0	0.23	0.28	0.86	0.54	0.38	0.27	0.65	0.07	0.41	0.33	0.68	0.61	0.51	0.39
Smo403595	0.82	0.69	0.62	0.68	0.7	0.74	0.9	0.78	0.93	0.86	0.86	1.0	0.11	0.27	0.66	0.2	0.95	0.54	0.6	0.04	0.2	0.0	0.48	0.35	0.5	0.3	0.68	0.65	0.9	0.85	0.72	0.65
Smo412250	0.49	0.42	0.46	0.46	0.45	0.55	0.65	0.63	0.64	0.58	0.59	0.56	0.02	0.08	0.03	0.03	0.61	0.44	0.21	0.54	1.0	0.12	0.29	0.19	0.79	0.38	0.88	0.97	0.65	0.6	0.37	0.21
Smo412433	0.49	0.52	0.49	0.39	0.4	0.58	0.74	0.82	1.0	0.94	0.76	0.77	0.25	0.19	0.2	0.21	0.41	0.57	0.31	0.55	0.24	0.09	0.26	0.19	0.82	0.29	0.51	0.48	0.52	0.51	0.43	0.35
Smo418211	0.62	0.47	0.62	0.61	0.56	0.55	0.76	1.0	0.95	0.89	0.89	0.91	0.03	0.24	0.1	0.1	0.91	0.11	0.37	0.62	0.55	0.01	0.41	0.39	0.57	0.27	0.66	0.58	0.98	0.98	0.71	0.54
Smo421204	0.55	0.62	0.6	0.48	0.52	0.53	0.46	0.51	0.6	0.55	0.58	0.54	0.16	0.22	0.11	0.07	0.56	1.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.3	0.31	0.42	0.18	0.14	0.1	0.32	0.26	0.16	0.12
Smo421627	0.67	0.51	0.65	0.67	0.43	0.65	0.65	0.73	0.87	0.84	0.8	0.86	0.03	0.06	0.1	0.05	1.0	0.35	0.26	0.0	0.01	0.0	0.4	0.24	0.06	0.15	0.38	0.51	0.97	0.88	0.83	0.58
Smo421631	0.67	0.51	0.65	0.67	0.43	0.65	0.65	0.73	0.87	0.84	0.8	0.86	0.03	0.06	0.1	0.05	1.0	0.35	0.26	0.0	0.01	0.0	0.4	0.24	0.06	0.15	0.38	0.51	0.97	0.88	0.83	0.58
Smo430901	0.68	0.64	0.74	0.8	0.77	0.89	0.86	0.78	0.85	0.71	0.72	0.72	0.06	0.11	0.08	0.07	0.81	0.64	0.21	0.65	1.0	0.61	0.33	0.21	0.39	0.26	0.74	0.81	0.58	0.53	0.55	0.55
Smo437219	0.88	0.56	0.5	0.39	0.35	0.37	0.61	0.5	0.82	0.94	1.0	0.97	0.08	0.32	0.08	0.67	0.59	0.7	0.21	0.57	0.3	0.23	0.33	0.25	0.25	0.23	0.4	0.67	0.95	0.99	0.41	0.43
Smo438000	0.47	0.75	0.69	0.55	0.48	0.43	0.48	0.56	0.62	0.58	0.55	0.44	0.01	0.03	0.02	0.08	1.0	0.57	0.45	0.06	0.16	0.0	0.61	0.39	0.44	0.19	0.26	0.32	0.83	0.72	0.57	0.55
Smo438125	0.76	0.55	0.53	0.41	0.37	0.42	0.36	0.63	0.66	0.83	0.73	0.81	0.02	0.06	0.04	0.13	0.82	0.37	0.48	0.27	0.55	0.02	0.35	0.32	0.66	0.63	0.44	0.33	0.96	1.0	0.46	0.31
Smo438339	0.7	0.51	0.5	0.5	0.44	0.49	0.56	0.64	0.76	0.81	0.71	0.85	0.08	0.08	0.01	0.1	0.97	0.88	0.32	0.3	0.93	0.1	0.39	0.24	0.37	0.27	0.22	0.22	1.0	0.74	0.66	0.54
Smo439330	0.8	0.68	0.68	0.7	0.84	0.88	1.0	0.89	0.96	0.81	0.8	0.76	0.33	0.72	0.41	0.35	0.83	0.65	0.57	0.4	0.84	0.32	0.58	0.7	0.68	0.7	0.98	0.89	0.74	0.8	0.73	0.74
Smo441673	0.65	0.73	0.78	0.88	0.81	0.9	1.0	0.77	0.79	0.77	0.66	0.74	0.03	0.05	0.02	0.05	0.93	0.51	0.2	0.29	0.98	0.06	0.47	0.28	0.7	0.27	0.45	0.47	0.69	0.61	0.54	0.44
Smo444022	0.58	0.56	0.63	0.63	0.68	0.72	0.75	0.66	0.7	0.65	0.64	0.65	0.1	0.18	0.14	0.14	1.0	0.51	0.34	0.55	0.74	0.38	0.4	0.29	0.27	0.39	0.77	0.85	0.83	0.79	0.66	0.49
Smo48330	0.52	0.45	0.5	0.49	0.51	0.56	0.65	0.68	0.64	0.67	0.66	0.56	0.05	0.12	0.02	0.05	0.49	0.41	0.15	0.13	1.0	0.1	0.27	0.14	0.52	0.3	0.5	0.48	0.54	0.45	0.61	0.63
Smo49217	0.3	0.33	0.33	0.29	0.3	0.3	0.42	0.26	0.3	0.25	0.26	0.28	0.05	0.07	0.03	0.08	0.73	0.85	0.21	0.19	0.93	0.1	0.28	0.18	1.0	0.05	0.16	0.17	0.56	0.48	0.55	0.52
Smo59774	0.25	0.21	0.25	0.22	0.2	0.2	0.21	0.24	0.25	0.24	0.29	0.26	0.01	0.03	0.01	0.04	0.58	0.45	0.15	0.42	1.0	0.07	0.29	0.18	0.49	0.05	0.16	0.15	0.54	0.44	0.48	0.48
Smo68404	0.52	0.45	0.5	0.49	0.51	0.56	0.65	0.68	0.64	0.67	0.66	0.56	0.05	0.12	0.02	0.05	0.49	0.41	0.15	0.13	1.0	0.1	0.27	0.14	0.52	0.3	0.5	0.48	0.54	0.45	0.61	0.63
Smo69311	0.26	0.29	0.24	0.29	0.23	0.34	0.33	0.29	0.4	0.29	0.27	0.34	0.07	0.1	0.04	0.08	0.78	1.0	0.37	0.57	0.48	0.39	0.39	0.28	0.21	0.03	0.13	0.11	0.65	0.67	0.65	0.65
Smo73051	0.42	0.33	0.57	0.39	0.27	0.32	0.36	0.53	0.4	0.35	0.16	0.32	0.0	0.02	0.01	0.03	0.69	1.0	0.35	0.14	0.24	0.06	0.33	0.2	0.54	0.15	0.61	0.69	0.75	0.62	0.35	0.2
Smo75361	0.63	0.66	0.72	0.66	0.64	0.69	0.75	0.62	0.72	0.71	0.67	0.74	0.0	0.06	0.01	0.06	0.82	0.7	0.21	0.12	1.0	0.03	0.45	0.3	0.68	0.14	0.38	0.46	0.75	0.7	0.55	0.52
Smo7638	0.39	0.38	0.34	0.37	0.33	0.38	0.41	0.39	0.44	0.48	0.39	0.45	0.03	0.06	0.08	0.05	0.49	1.0	0.2	0.08	0.21	0.05	0.27	0.18	0.37	0.05	0.15	0.16	0.52	0.45	0.29	0.28
Smo7665	0.5	0.44	0.54	0.51	0.56	0.56	0.74	0.69	0.62	0.55	0.63	0.52	0.08	0.16	0.11	0.11	0.92	0.97	0.29	0.16	1.0	0.22	0.41	0.29	0.31	0.17	0.51	0.54	0.79	0.75	0.66	0.56
Smo76801	0.77	0.73	0.88	0.72	0.75	0.85	0.81	0.94	0.95	0.79	0.82	0.77	0.01	0.02	0.04	0.04	0.77	0.66	0.38	0.26	0.84	0.07	0.45	0.33	0.91	0.3	1.0	0.8	0.76	0.67	0.97	1.0
Smo77713	0.38	0.48	0.56	0.49	0.41	0.39	0.65	0.62	0.65	0.65	0.64	0.65	0.0	0.02	0.0	0.02	1.0	0.69	0.12	0.29	0.76	0.11	0.37	0.18	0.3	0.07	0.32	0.31	0.68	0.6	0.56	0.62
Smo8028	0.67	0.75	0.77	0.79	0.68	0.82	1.0	0.59	0.71	0.63	0.6	0.64	0.05	0.07	0.03	0.07	0.6	0.16	0.19	0.1	0.88	0.23	0.26	0.2	0.59	0.07	0.34	0.29	0.49	0.47	0.36	0.36
Smo83318	0.62	0.55	0.6	0.62	0.64	0.72	0.77	0.7	0.79	0.66	0.66	0.68	0.41	0.43	0.31	0.4	1.0	0.45	0.49	0.28	0.36	0.12	0.61	0.51	0.53	0.47	0.51	0.62	0.86	0.82	0.78	0.74
Smo89281	0.8	0.42	0.43	0.45	0.44	0.38	0.75	0.92	0.91	1.0	0.91	0.98	0.02	0.04	0.02	0.1	0.59	0.61	0.25	0.76	0.54	0.06	0.3	0.16	0.72	0.44	0.3	0.29	1.0	0.86	0.76	0.54
Smo89955	0.4	0.45	0.45	0.38	0.36	0.48	0.45	0.45	0.46	0.45	0.34	0.31	0.11	0.16	0.25	0.16	0.96	1.0	0.41	0.01	0.59	0.05	0.38	0.19	0.55	0.13	0.28	0.38	0.78	0.69	0.5	0.39
Smo90107	0.5	0.47	0.48	0.43	0.47	0.49	0.61	0.5	0.56	0.45	0.55	0.48	0.14	0.11	0.09	0.17	0.72	1.0	0.38	0.14	0.52	0.18	0.44	0.35	0.14	0.28	0.44	0.46	0.69	0.63	0.61	0.56
Smo91229	0.55	0.47	0.53	0.51	0.48	0.56	0.59	0.65	0.66	0.64	0.64	0.63	0.03	0.11	0.07	0.11	0.8	1.0	0.3	0.18	0.28	0.16	0.42	0.27	0.09	0.23	0.52	0.48	0.77	0.71	0.61	0.62
Smo92382	0.23	0.19	0.2	0.13	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.05	0.05	0.11	0.0	0.0	0.01	0.01	0.88	1.0	0.62	0.27	1.0	0.04	0.35	0.22	0.22	0.07	0.06	0.07	0.72	0.78	0.54	0.89
Smo93085	0.88	0.74	0.61	0.6	0.56	0.53	0.56	0.5	0.51	0.49	0.57	0.67	0.22	0.3	0.23	0.44	1.0	0.65	0.77	0.06	0.6	0.13	0.55	0.47	0.83	0.49	0.74	0.71	0.84	0.89	0.44	0.37
Smo93906	0.64	0.66	0.73	0.75	0.78	0.84	0.85	0.72	0.77	0.75	0.73	0.69	0.2	0.21	0.16	0.18	1.0	0.79	0.28	0.33	0.54	0.23	0.41	0.32	0.25	0.3	0.48	0.59	0.71	0.66	0.59	0.57
Smo98081	0.51	0.55	0.54	0.58	0.64	0.67	0.57	0.59	0.47	0.41	0.39	0.42	0.25	0.24	0.16	0.32	0.89	0.98	0.69	0.42	1.0	0.49	0.67	0.53	0.72	0.47	0.63	0.72	0.82	0.85	0.65	0.61
Smo99098	0.82	0.78	0.76	0.78	0.79	0.97	0.9	0.87	0.95	0.83	0.76	0.78	0.49	0.53	0.38	0.6	0.81	0.7	0.69	0.41	1.0	0.33	0.63	0.61	0.73	0.64	0.92	1.0	0.8	0.9	0.79	0.79
Smo99396	0.41	0.45	0.54	0.51	0.53	0.6	0.75	0.66	0.6	0.53	0.55	0.49	0.05	0.14	0.03	0.06	0.71	0.86	0.21	0.08	1.0	0.11	0.29	0.17	0.34	0.18	0.87	0.96	0.61	0.57	0.63	0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)