Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-1.46 -0.87 -1.32 0.13 0.87 1.13 1.26 0.94 0.69 0.53 -0.39 -0.57 -2.24 -1.81 -0.35 -1.45 0.32 -0.75 -0.05 - 0.61 -2.99 0.13 -0.47 0.17 -1.0 0.54 0.55 0.35 0.56 -0.23 -0.48
-1.55 -1.89 -1.72 -0.97 -0.29 0.33 1.51 1.14 1.23 0.24 0.09 -0.68 -3.73 -3.08 0.09 -2.71 -1.51 -1.63 -1.86 -1.25 1.14 1.57 -2.02 -1.98 1.14 -1.42 0.99 1.52 -0.75 -0.71 -0.44 -1.23
-0.05 -0.29 -0.56 -0.22 0.34 0.65 1.21 0.77 0.65 0.37 0.21 0.17 -1.05 -1.64 -0.04 -0.45 -0.34 -0.87 -0.13 -2.37 0.23 -2.55 -0.41 -0.56 -0.95 -0.53 0.81 0.63 -0.41 0.08 0.54 0.25
-0.32 -0.35 -0.33 0.07 0.38 0.33 0.31 0.34 0.32 0.16 -0.12 -0.24 -1.08 -0.52 0.55 -0.86 -0.3 -0.35 -0.2 -1.01 0.95 -2.15 -0.17 -0.14 0.59 -0.42 0.82 0.8 -0.18 -0.01 -0.26 -0.36
-0.2 -0.31 -0.64 -0.28 0.19 0.31 0.36 0.62 0.55 0.54 0.17 -0.11 -0.63 -0.39 0.27 -0.14 -0.49 -0.51 -0.19 -1.05 1.22 0.4 -0.62 -0.75 0.71 -0.74 0.18 0.03 -0.2 -0.11 -0.54 -0.74
0.06 -1.88 -1.05 -0.91 1.15 0.94 1.21 1.25 0.35 0.18 -0.55 -0.91 -3.34 -2.9 -0.16 -2.04 -0.14 -1.99 -0.9 - 1.74 - -1.04 -0.81 -0.6 -1.29 1.49 1.35 0.03 0.25 -0.48 -1.32
-0.91 -1.26 -1.43 -0.88 0.17 0.82 0.94 1.08 0.82 0.63 -0.03 -0.28 -1.97 -2.78 -0.14 -1.74 -0.71 -0.09 -0.89 -0.73 -1.09 2.34 -0.53 -0.89 -3.01 -1.56 0.49 0.58 -0.36 0.03 0.15 -0.39
-0.04 -0.15 -0.19 0.03 0.02 0.15 0.33 0.57 0.59 0.59 0.4 0.48 -1.2 -0.82 -1.15 -0.9 -0.43 -1.51 -0.54 0.13 0.44 -0.07 -0.72 -0.94 0.91 0.53 0.21 0.39 -0.25 -0.37 -0.04 -0.03
0.15 -0.52 -0.35 -0.44 -0.1 1.16 1.01 0.84 0.7 0.81 -0.67 -0.13 -1.97 -1.24 0.08 -1.41 -0.2 -0.09 -0.77 -2.01 0.91 0.55 -1.23 -1.15 -0.21 -0.91 0.7 0.1 -0.31 -0.36 0.13 0.04
-0.69 -0.63 -1.3 -0.68 -0.25 0.82 1.11 1.1 0.93 -0.09 -0.19 0.26 -2.09 -1.59 0.34 -1.85 -0.5 -1.45 -0.55 - 1.42 - -1.37 -1.33 -2.58 -0.21 1.16 1.65 -0.11 0.13 0.38 -0.32
-0.19 -1.26 -0.98 -0.8 0.18 0.23 0.67 0.85 0.93 0.73 0.43 0.34 -0.57 -2.03 -0.5 -0.75 -0.68 -0.54 -0.66 -2.26 0.65 1.2 -0.44 -0.47 -0.73 0.09 0.32 0.39 -0.16 -0.28 0.13 0.02
-0.01 -0.06 -0.2 -0.16 0.32 0.62 0.68 0.9 0.54 0.69 0.31 0.09 -0.82 -0.78 -0.5 -0.22 -0.2 -0.24 0.01 -1.71 -0.19 -3.78 -0.04 -0.19 -1.41 0.06 0.27 0.33 0.01 0.23 0.2 -0.12
0.37 -0.88 -0.9 -0.64 -0.13 0.85 1.02 1.16 0.7 1.02 0.22 -0.09 -2.21 -2.08 -0.39 -1.25 -0.0 -0.35 -0.26 -5.91 0.46 -3.41 -0.33 -0.82 -1.39 -0.62 0.34 0.88 0.44 0.23 0.54 0.05
-0.29 -0.41 -0.02 0.15 0.26 0.69 1.09 0.84 0.77 0.53 -0.53 -0.35 -0.53 -1.23 0.96 -0.95 -0.25 -0.36 -0.66 -3.4 1.39 -4.65 -0.42 -0.73 -0.49 -1.2 0.56 0.63 -0.16 -0.08 -0.89 -1.05
-0.51 -0.9 -1.05 -0.63 0.22 0.95 1.18 1.26 1.04 0.77 0.38 0.16 -2.56 -2.64 -0.16 -1.73 -0.65 -1.13 -0.72 -2.71 0.84 0.02 -1.3 -1.59 -0.68 -0.82 0.67 0.76 -0.0 0.01 0.35 0.01
-1.1 -1.95 -0.74 -0.95 0.32 1.06 1.25 1.13 1.07 0.45 -0.28 -0.34 -2.35 -3.11 -0.4 -1.85 -0.57 -0.53 -0.7 -6.47 0.47 0.99 -0.85 -1.07 -0.31 -0.7 0.89 0.74 0.28 0.33 0.14 -0.1
-0.02 -0.88 -1.21 -0.09 -0.21 0.29 0.74 0.8 0.8 0.55 0.8 0.16 -0.94 -2.06 -0.24 -0.34 -0.54 -0.32 -0.0 -5.39 -2.54 -0.12 -0.46 -0.62 -2.27 0.72 0.6 0.56 0.51 0.12 0.29 0.68
-0.87 -2.04 -1.65 -1.35 -0.84 0.69 0.4 0.75 0.44 0.35 -0.49 -0.67 -1.8 -2.98 -0.24 -1.54 -0.9 -0.57 -0.2 -0.03 1.86 0.37 -0.49 -0.86 1.59 -0.74 1.09 0.79 -0.47 -0.34 -0.16 -0.64
-1.2 -0.45 -1.82 -0.41 0.23 0.79 1.22 1.13 1.04 1.05 -0.01 0.09 -2.38 -1.83 -0.81 -1.05 -0.37 -0.2 0.0 - - 0.39 -0.13 -0.84 - -0.36 0.56 0.55 0.32 0.53 0.59 0.4
-0.56 -0.76 -1.04 -0.37 0.83 1.05 1.06 1.0 0.74 0.35 -0.34 -0.26 -0.65 -2.37 0.92 -1.33 -0.37 -0.89 -1.13 -3.11 2.0 -0.87 -1.01 -0.98 0.19 -1.47 0.31 0.5 -0.38 -0.48 -1.21 -1.62
-0.53 -1.45 -1.85 -0.71 -0.5 0.53 0.81 0.75 0.71 0.89 -0.65 -0.53 -2.36 -2.98 -1.22 -2.15 -0.21 0.3 -0.71 - 0.75 1.55 -0.78 -1.1 0.78 -0.19 0.62 0.74 0.41 0.57 -0.24 -0.2
-0.37 -0.17 -0.3 0.09 0.36 0.53 0.58 0.48 0.3 0.45 -0.13 0.03 -0.68 -1.35 -0.33 -0.47 -0.62 -0.61 -0.03 -0.41 1.02 -1.96 -0.23 -0.33 1.13 -0.07 0.58 0.38 -0.12 -0.12 -0.95 -0.95
-0.92 -1.32 -1.61 -0.67 -0.53 0.22 0.62 0.98 0.65 0.74 -0.58 -0.72 -2.66 -3.16 0.73 -1.58 -0.03 0.02 -0.47 -3.96 -3.51 2.24 -0.68 -0.99 0.83 -1.9 0.86 0.74 -0.14 0.17 -0.02 -0.51
-0.14 -0.32 -0.48 -0.07 0.59 0.77 0.98 0.78 0.58 0.68 0.31 0.07 -1.4 -2.56 -0.29 -0.92 -0.25 -0.51 -0.41 -1.09 0.18 -2.63 -0.61 -0.84 -0.72 -0.26 0.76 0.93 0.05 0.09 0.21 -0.21
-0.45 -1.19 -0.86 -0.58 0.23 1.03 1.2 1.63 0.99 1.11 0.2 -0.22 -2.63 -2.39 -0.09 -1.55 -0.46 -0.18 -1.25 -4.69 1.65 - -0.78 -0.87 -2.93 -0.36 -0.01 0.5 -0.24 -0.1 0.07 -0.44
-0.92 -2.06 -0.78 -0.5 0.4 0.62 0.89 0.95 0.14 0.56 -0.21 -0.4 -2.4 -3.62 -0.25 -2.04 -0.53 -0.09 -0.65 - 0.86 -2.5 -0.86 -1.54 - 0.04 1.95 1.36 0.17 -0.29 0.73 0.61
-0.39 -1.81 -1.15 -1.13 0.08 0.87 1.33 1.43 1.45 0.31 0.59 -0.75 -3.56 -4.89 -1.21 -3.35 -0.42 -0.31 -1.43 - 1.16 0.1 -0.71 -0.64 -1.67 -0.69 0.98 0.39 -0.1 0.1 0.46 0.2
-0.87 - -0.06 -1.65 -1.89 1.33 0.91 0.9 0.21 0.79 -0.07 -0.88 -2.88 -4.33 -1.06 -1.42 -0.37 0.18 -0.64 - 1.81 - -0.16 -1.99 1.56 -0.5 1.32 0.78 -0.09 -0.4 -0.28 -0.69
-0.53 -0.72 -1.24 -0.79 -0.18 0.74 1.11 1.19 1.05 0.97 0.63 0.32 -3.26 -4.12 -1.01 -2.57 -0.52 -0.04 -0.71 -5.91 - 0.99 -1.02 -1.5 -1.22 0.55 1.1 0.96 0.08 0.12 0.12 -0.55
-0.23 -1.16 -1.51 -0.64 0.06 0.89 1.51 1.07 1.02 0.93 0.51 -0.16 -3.5 -2.43 -1.23 -2.27 -0.69 0.33 -1.09 -1.95 0.69 0.86 -1.04 -1.84 -0.45 -0.87 1.08 0.79 -0.26 -0.23 -0.69 -1.03
-0.34 -1.28 -2.27 -0.73 0.17 1.51 1.13 1.25 0.52 0.71 -0.13 -0.73 -2.63 -3.27 -0.38 -2.0 -0.59 0.47 -1.09 -3.32 -5.27 1.07 -0.65 -1.08 -0.88 -1.42 1.12 1.09 0.11 0.07 0.53 -0.09
-1.16 -1.14 -1.73 -1.16 0.17 0.94 1.06 0.89 0.42 0.31 -0.43 -0.79 -1.35 -1.38 0.68 -0.81 -0.23 -0.37 -0.34 0.17 0.52 1.31 -0.73 -0.99 0.43 -1.04 0.22 0.68 -0.38 -0.32 -0.07 -0.23
-0.14 -1.5 -0.18 -1.38 -0.25 0.52 1.11 1.14 0.47 0.6 0.1 -0.11 -0.65 -2.16 -0.32 0.1 -0.14 -0.42 -0.3 -0.92 0.65 -2.31 -0.37 -0.45 -0.29 -1.08 0.49 0.59 0.16 0.51 0.19 0.06
-0.34 -1.07 -0.83 -0.47 0.32 0.77 0.9 1.01 0.75 0.67 0.32 -0.03 -2.07 -2.7 -1.46 -1.62 -0.43 -1.05 -0.06 -0.09 0.51 0.7 -0.4 -0.63 0.05 -0.04 0.59 0.63 -0.08 -0.08 -0.2 -0.68
-0.48 -1.15 -1.55 -0.55 0.44 0.79 0.93 1.15 0.84 0.75 0.13 -0.07 -1.55 -2.63 -0.36 -1.22 -0.5 -0.76 -0.86 -3.4 1.45 -1.1 -0.57 -1.18 0.87 -0.72 0.68 0.58 0.03 0.13 -0.29 -0.65
-0.15 -0.27 -0.24 -0.13 0.19 0.8 1.02 0.99 1.06 0.84 0.45 0.38 -1.63 -0.93 -0.36 -1.08 -0.78 -1.23 -0.91 -2.43 0.31 0.25 -1.23 -1.12 -0.87 -0.27 0.55 0.43 -0.43 -0.24 0.32 -0.13
-0.54 -1.95 -2.09 -1.28 -0.51 1.1 1.14 1.36 1.12 0.62 -0.31 -0.84 -2.74 -3.25 -0.08 -2.33 -0.71 -0.55 -0.98 -1.65 0.75 1.12 -1.12 -1.61 0.11 -0.85 1.04 1.52 -0.35 -0.01 -0.54 -0.89
-0.39 -1.09 -1.31 -0.61 0.1 0.73 1.29 1.3 1.01 0.9 0.23 0.04 -2.66 -2.93 -1.06 -2.28 -0.73 -0.29 -1.15 -0.16 0.9 -1.7 -0.91 -1.54 0.4 -0.46 0.92 0.88 -0.28 -0.17 0.02 -0.55
-0.05 -0.37 -0.14 -0.07 0.36 0.14 0.24 0.16 0.19 -0.03 0.19 0.1 -0.58 -1.29 0.65 -0.34 -0.24 -0.18 -0.64 -3.24 1.26 -0.16 -0.57 -0.52 1.07 -0.43 -0.04 -0.07 -0.14 0.08 0.16 -0.05
0.21 -0.28 -0.6 -0.08 0.36 1.1 0.58 0.93 0.8 0.91 0.58 0.36 -0.85 -1.83 -0.55 -0.56 0.25 -0.18 0.16 - -0.18 - 0.18 -0.13 -4.12 -0.58 0.06 0.05 0.03 0.18 0.12 -0.27
-0.77 -1.05 -1.21 -0.42 0.28 0.53 0.97 0.69 0.41 0.54 0.14 -0.35 -2.7 -3.32 -1.89 -1.6 -0.42 0.08 -0.39 0.05 1.66 -0.51 -0.23 -0.44 0.19 -0.76 0.66 0.66 0.19 0.42 -0.32 -0.35
-1.09 -0.72 -1.01 -0.12 0.18 -0.33 0.54 0.44 0.87 0.38 0.06 -0.24 -2.28 -2.0 -1.58 -1.46 0.25 0.4 1.0 -4.3 -1.58 1.67 -1.02 -1.13 0.61 -1.33 0.41 0.47 0.22 0.36 0.28 0.33
-0.18 -0.7 -0.35 -0.28 -0.97 0.85 1.27 1.26 0.63 0.75 0.49 0.03 -2.29 -2.06 -0.41 -1.34 -0.48 -0.16 -0.63 - 1.57 -0.37 -0.33 -0.18 - -0.76 -0.15 -0.04 -0.01 -0.02 0.42 0.1
-1.48 -2.38 -1.77 -0.84 0.17 0.89 0.99 1.49 0.61 0.82 0.04 -0.99 -3.08 -1.97 0.61 -0.9 -0.3 -0.11 -1.29 -1.12 -2.24 0.55 -0.24 -1.59 -0.74 -2.17 1.58 1.39 -0.41 -0.07 0.17 -0.27
0.52 0.15 0.13 -0.16 0.46 0.44 0.67 0.67 0.81 0.75 0.8 0.54 -2.31 -2.28 -0.97 -2.45 0.61 1.23 -1.46 -2.96 0.73 -2.84 -0.55 -0.6 -1.56 -1.46 -0.5 -0.6 0.22 0.12 0.17 -0.22
-0.53 -0.68 -0.52 -0.35 -0.43 -0.36 -0.01 -0.04 0.15 0.32 0.13 0.14 -0.86 -0.55 0.96 -0.1 -0.01 -0.44 -0.27 -0.7 1.24 -0.24 -0.38 -0.6 1.61 -0.8 -0.73 -0.6 0.21 0.21 -0.03 0.06
-0.11 -0.81 -0.72 -0.44 -0.17 -0.16 0.35 0.27 0.54 0.07 0.26 -0.01 -1.35 -1.77 -1.82 -0.8 -0.45 0.46 0.22 0.04 1.26 1.21 -0.24 -0.23 -1.1 0.02 0.39 0.13 0.03 -0.06 0.02 0.07
-1.53 - - -2.79 0.04 1.18 1.45 1.62 0.62 -0.21 - -1.8 - - -0.77 - - - -2.87 -0.84 1.16 - -2.73 - -0.67 -0.43 2.35 2.95 -0.52 0.07 -2.86 -
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-0.55 -1.27 -1.88 -0.8 -0.3 0.33 0.22 0.57 0.28 0.57 0.06 -0.19 -1.08 -2.46 -0.68 -0.33 -0.58 -0.01 -0.3 -4.59 -0.81 1.07 -0.66 -0.65 1.04 0.97 1.06 0.86 0.06 0.22 0.1 -0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.