Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo103260	0.74	0.71	0.85	0.85	0.87	0.93	0.87	0.81	0.85	0.76	0.76	0.71	0.4	0.56	0.9	0.42	0.7	0.4	0.52	0.62	0.47	0.42	0.64	0.52	0.5	0.52	0.89	1.0	0.59	0.62	0.46	0.48
Smo108325	0.47	0.28	0.59	0.43	0.51	0.79	0.62	0.67	1.0	0.78	0.68	0.56	0.2	0.16	0.76	0.36	0.32	0.38	0.62	0.44	0.0	0.39	0.4	0.38	0.17	0.69	0.5	0.53	0.29	0.4	0.29	0.28
Smo109178	0.58	0.51	0.5	0.55	0.6	0.54	0.47	0.42	0.42	0.5	0.42	0.38	0.44	0.49	1.0	0.61	0.27	0.25	0.5	0.33	0.39	0.4	0.37	0.38	0.16	0.32	0.32	0.37	0.29	0.33	0.28	0.27
Smo111767	0.88	0.84	0.71	0.83	0.73	1.0	0.74	0.76	0.85	0.87	0.82	0.77	0.82	0.89	0.92	0.85	0.64	0.46	0.62	0.61	0.12	0.12	0.96	0.83	0.46	0.28	0.42	0.44	0.57	0.69	0.48	0.43
Smo118659	0.43	0.37	0.41	0.46	0.54	0.37	0.47	0.76	0.74	0.75	0.62	0.55	0.16	0.13	0.16	0.24	0.33	0.35	0.25	1.0	0.27	0.45	0.33	0.32	0.46	0.54	0.49	0.46	0.44	0.47	0.19	0.15
Smo118740	0.85	0.8	0.85	0.74	0.72	0.82	0.9	0.92	1.0	0.97	0.93	0.79	0.33	0.26	0.32	0.38	0.62	0.42	0.85	0.59	0.25	0.35	0.42	0.39	0.26	0.55	0.72	0.75	0.53	0.58	0.6	0.57
Smo126929	0.4	0.33	0.53	0.44	0.5	0.69	0.49	0.59	0.77	1.0	0.96	0.62	0.35	0.22	0.38	0.37	0.37	0.25	0.53	0.79	0.22	0.22	0.19	0.2	0.11	0.31	0.18	0.41	0.54	0.56	0.2	0.21
Smo128130	0.32	0.33	0.42	0.36	0.31	0.44	0.32	0.35	0.32	0.34	0.39	0.29	0.21	0.07	0.04	0.09	0.27	0.23	0.11	1.0	0.24	0.64	0.46	0.43	0.4	0.21	0.29	0.3	0.26	0.25	0.13	0.14
Smo128246	0.26	0.23	0.14	0.1	0.16	0.77	0.46	0.67	0.81	0.72	0.41	0.34	0.12	0.13	0.91	0.07	0.4	0.06	0.36	1.0	0.16	0.24	0.3	0.32	0.21	0.51	0.65	0.41	0.77	0.65	0.41	0.34
Smo135788	0.75	0.65	0.71	0.8	0.77	0.81	0.9	0.85	1.0	0.83	0.8	0.71	0.64	0.89	0.94	0.75	0.46	0.37	0.5	0.41	0.28	0.29	0.67	0.65	0.48	0.63	0.67	0.94	0.42	0.55	0.37	0.42
Smo142121	0.9	0.82	0.86	0.85	0.81	0.87	0.75	0.81	0.99	1.0	0.97	0.86	0.66	0.65	0.67	0.71	0.58	0.44	0.89	0.83	0.64	0.26	0.67	0.67	0.5	0.69	0.52	0.64	0.71	0.66	0.54	0.53
Smo153568	1.0	0.87	0.71	0.78	0.74	0.63	0.64	0.73	0.76	0.89	0.95	0.94	0.73	0.49	0.35	0.74	0.49	0.37	0.64	0.38	0.21	0.23	0.68	0.61	0.07	0.8	0.44	0.4	0.57	0.54	0.69	0.75
Smo166588	0.79	0.61	0.68	0.61	0.6	0.58	0.6	0.63	0.85	0.88	0.93	0.87	0.43	0.44	0.65	0.42	0.58	0.46	0.73	0.29	0.22	0.05	0.64	1.0	0.42	0.9	0.58	0.74	0.53	0.61	0.6	0.65
Smo170257	1.0	0.93	0.92	0.85	0.75	0.75	0.7	0.7	0.75	0.82	0.89	0.8	0.67	0.61	0.57	0.71	0.6	0.42	0.88	0.45	0.15	0.13	0.73	0.75	0.19	0.72	0.42	0.48	0.7	0.73	0.36	0.32
Smo174960	0.83	0.81	0.72	0.67	0.71	0.78	1.0	0.99	0.91	0.85	0.85	0.94	0.05	0.24	0.31	0.08	0.49	0.53	0.28	0.39	0.36	0.69	0.22	0.16	0.15	0.18	0.82	0.76	0.38	0.38	0.41	0.41
Smo269976	0.84	0.86	0.83	0.82	0.86	0.88	0.81	0.9	0.98	1.0	0.97	0.88	0.64	0.66	0.74	0.73	0.67	0.65	0.6	0.81	0.73	0.93	0.74	0.76	0.39	0.52	0.52	0.53	0.65	0.68	0.58	0.65
Smo402024	0.38	0.33	0.3	0.3	0.25	0.31	0.19	0.27	0.35	0.35	0.43	0.41	0.15	0.05	0.04	0.2	0.2	0.21	0.32	1.0	0.19	0.42	0.53	0.39	0.16	0.29	0.14	0.11	0.3	0.32	0.26	0.34
Smo402173	0.55	0.64	0.68	0.69	0.61	0.69	0.99	0.92	1.0	0.86	0.84	0.67	0.38	0.8	0.99	0.5	0.44	0.56	0.3	0.41	0.17	0.13	0.41	0.44	0.22	0.41	0.47	0.51	0.44	0.53	0.33	0.34
Smo403297	0.61	0.62	0.52	0.65	0.69	0.83	0.61	0.48	0.62	0.46	0.55	0.5	0.13	0.44	0.44	0.15	1.0	0.72	0.54	0.82	0.2	0.79	0.25	0.17	0.0	0.19	0.17	0.25	0.56	0.75	0.63	0.6
Smo403804	0.66	0.5	0.51	0.51	0.5	0.54	0.48	0.61	0.56	0.64	0.56	0.48	0.64	0.6	1.0	0.88	0.24	0.17	0.49	0.55	0.18	0.52	0.43	0.64	0.34	0.45	0.56	0.6	0.26	0.26	0.29	0.32
Smo404183	0.65	0.66	0.56	0.67	0.7	0.77	0.86	0.97	1.0	0.91	0.92	0.84	0.03	0.08	0.21	0.09	0.72	0.45	0.78	0.43	0.27	0.47	0.36	0.46	0.11	0.47	0.77	0.67	0.41	0.52	0.5	0.36
Smo406645	0.48	0.63	0.95	0.8	0.83	0.79	1.0	0.69	0.83	0.98	1.0	0.73	0.17	0.14	0.91	0.34	0.47	0.24	0.25	0.89	0.15	0.7	0.18	0.23	0.03	0.6	0.36	0.37	0.35	0.44	0.24	0.19
Smo410532	0.55	0.62	0.68	0.61	0.56	0.57	0.93	0.68	0.76	0.73	0.76	0.68	0.23	0.78	1.0	0.21	0.72	0.33	0.1	0.05	0.03	0.12	0.2	0.22	0.26	0.23	0.24	0.34	0.45	0.49	0.2	0.1
Smo411110	0.36	0.24	0.14	0.23	0.14	0.18	0.21	0.12	0.3	0.2	0.32	0.18	0.23	0.3	1.0	0.42	0.1	0.02	0.21	0.26	0.0	0.0	0.17	0.19	0.0	0.28	0.07	0.07	0.05	0.1	0.02	0.02
Smo414363	0.29	0.44	0.31	0.21	0.12	0.2	0.16	0.12	0.21	0.23	0.26	0.4	0.01	0.01	0.04	0.01	0.96	1.0	0.1	0.84	0.11	0.34	0.2	0.18	0.07	0.03	0.04	0.03	0.34	0.31	0.2	0.15
Smo414635	0.63	0.57	0.61	0.58	0.52	0.58	0.79	0.72	0.74	0.9	0.78	0.68	0.45	0.26	0.42	0.47	0.34	0.31	0.51	0.4	0.42	0.58	0.36	0.33	0.28	1.0	0.63	0.59	0.42	0.42	0.59	0.62
Smo420551	0.45	0.73	0.72	0.9	0.68	0.76	0.98	0.94	1.0	0.89	0.81	0.7	0.01	0.02	0.01	0.06	0.39	0.26	0.2	0.69	0.19	0.16	0.4	0.27	0.09	0.78	0.29	0.4	0.36	0.46	0.33	0.27
Smo423178	0.74	0.92	0.87	0.9	0.94	0.94	0.81	0.85	0.94	0.99	1.0	0.82	0.63	0.58	0.75	0.63	0.86	0.28	0.55	0.63	0.33	0.57	0.75	0.74	0.27	0.58	0.57	0.63	0.72	0.8	0.46	0.45
Smo424002	0.42	0.4	0.31	0.45	0.5	0.48	0.47	0.54	0.68	0.54	0.61	0.52	0.09	0.15	0.47	0.09	0.12	0.02	0.06	1.0	0.07	0.49	0.12	0.14	0.47	0.36	0.26	0.33	0.08	0.07	0.06	0.05
Smo426562	0.53	0.51	0.51	0.55	0.5	0.46	0.58	0.57	0.74	0.73	0.73	0.68	0.44	0.8	1.0	0.42	0.45	0.36	0.14	0.19	0.04	0.26	0.31	0.34	0.09	0.34	0.22	0.22	0.29	0.34	0.42	0.45
Smo430931	0.75	0.65	0.58	0.71	1.0	0.77	0.7	0.7	0.84	0.86	0.87	0.72	0.72	0.61	0.62	0.69	0.49	0.43	0.72	0.37	0.29	0.13	0.54	0.45	0.47	0.68	0.49	0.46	0.42	0.47	0.33	0.33
Smo437207	0.76	0.79	0.91	0.87	0.86	0.92	0.94	0.82	0.98	0.89	0.9	0.73	0.45	0.6	1.0	0.49	0.64	0.49	0.55	0.64	0.15	0.32	0.6	0.59	0.18	0.49	0.57	0.68	0.61	0.7	0.44	0.42
Smo437584	0.32	0.28	0.31	0.27	0.35	0.32	0.45	0.55	0.54	0.6	0.55	0.47	0.1	0.09	0.2	0.15	0.24	0.27	0.27	1.0	0.53	0.79	0.19	0.21	0.17	0.31	0.28	0.23	0.27	0.26	0.24	0.29
Smo437977	0.64	0.42	0.59	0.62	0.51	0.55	0.59	0.78	0.82	0.83	0.89	0.77	0.48	0.41	0.5	0.34	0.22	0.18	0.26	1.0	0.29	0.63	0.31	0.42	0.17	0.62	0.41	0.4	0.29	0.26	0.3	0.34
Smo438529	0.38	0.33	0.4	0.43	0.4	0.48	0.52	0.6	0.64	0.54	0.59	0.5	0.15	0.15	0.18	0.17	0.46	0.61	0.28	1.0	0.41	0.57	0.34	0.29	0.14	0.37	0.61	0.62	0.46	0.45	0.38	0.38
Smo439237	0.67	0.6	0.49	0.53	0.51	0.59	0.46	0.37	0.42	0.43	0.42	0.41	0.47	0.68	1.0	0.52	0.31	0.34	0.38	0.4	0.12	0.31	0.34	0.33	0.2	0.3	0.32	0.3	0.27	0.31	0.26	0.26
Smo444692	0.4	0.6	0.44	0.34	0.27	0.34	0.37	0.24	0.27	0.28	0.28	0.32	0.0	0.01	0.03	0.01	0.49	0.41	0.12	1.0	0.07	0.5	0.17	0.13	0.16	0.05	0.06	0.09	0.24	0.29	0.21	0.06
Smo54250	0.39	0.45	0.4	0.48	0.58	0.63	0.61	0.45	0.6	0.58	0.51	0.5	0.17	0.1	0.1	0.27	0.73	0.47	0.32	1.0	0.48	0.52	0.26	0.26	0.07	0.18	0.17	0.2	0.53	0.52	0.43	0.36
Smo63752	0.42	0.48	0.51	0.51	0.47	0.65	0.58	0.46	0.57	0.49	0.53	0.43	0.02	0.02	0.08	0.03	0.4	0.29	0.09	1.0	0.14	0.79	0.1	0.07	0.06	0.11	0.18	0.21	0.25	0.27	0.3	0.22
Smo73698	0.56	0.63	0.62	0.59	0.53	0.58	0.99	0.82	0.93	0.97	0.87	0.76	0.27	1.0	1.0	0.34	0.46	0.29	0.19	0.09	0.06	0.13	0.3	0.43	0.09	0.43	0.32	0.33	0.36	0.41	0.42	0.32
Smo75526	0.54	0.63	0.62	0.75	0.91	0.9	1.0	0.98	0.81	0.82	0.67	0.61	0.45	0.36	0.47	0.6	0.43	0.32	0.5	0.44	0.0	0.12	0.56	0.57	0.08	0.35	0.56	0.45	0.44	0.47	0.29	0.29
Smo75766	0.49	0.5	0.62	0.59	0.57	0.62	0.73	0.63	0.9	0.98	0.89	0.75	0.44	0.32	1.0	0.58	0.43	0.46	0.72	0.86	0.2	0.97	0.59	0.6	0.67	0.65	0.44	0.49	0.49	0.53	0.37	0.4
Smo76736	0.29	0.24	0.27	0.37	0.37	0.51	0.53	0.64	0.64	0.6	0.52	0.49	0.17	0.28	0.46	0.26	0.71	0.56	0.47	1.0	0.52	0.68	0.46	0.45	0.26	0.21	0.5	0.49	0.88	0.83	0.65	0.46
Smo77393	0.45	0.44	0.52	0.54	0.52	0.62	0.58	0.54	0.69	0.7	0.65	0.54	0.34	0.68	1.0	0.41	0.32	0.18	0.17	0.19	0.03	0.32	0.28	0.35	0.24	0.43	0.3	0.36	0.33	0.35	0.29	0.25
Smo77659	0.58	0.47	0.5	0.46	0.74	0.98	0.86	0.9	0.95	0.87	0.55	0.52	0.37	0.2	0.67	0.45	0.49	0.56	0.53	1.0	0.17	0.82	0.6	0.56	0.22	0.33	0.41	0.46	0.55	0.64	0.45	0.36
Smo78092	0.97	0.9	0.94	0.93	0.95	1.0	0.9	0.91	0.9	0.97	1.0	0.88	0.75	0.88	0.9	0.9	0.62	0.55	0.76	0.74	0.24	0.66	0.74	0.76	0.23	0.43	0.45	0.5	0.63	0.72	0.54	0.53
Smo78663	0.7	0.79	0.96	0.75	0.78	0.78	0.88	0.69	1.0	0.94	0.99	0.87	0.13	0.12	0.16	0.18	0.58	0.24	0.71	0.55	0.11	0.19	0.16	0.12	0.09	0.58	0.29	0.37	0.34	0.43	0.38	0.3
Smo79072	0.38	0.44	0.36	0.36	0.62	0.46	0.35	0.44	0.74	0.55	0.28	0.32	0.13	0.04	0.34	0.05	0.34	0.13	0.1	1.0	0.09	0.95	0.15	0.18	0.25	0.25	0.1	0.0	0.27	0.21	0.07	0.1
Smo84174	0.86	0.89	0.9	0.83	0.93	0.91	0.96	0.9	0.93	0.91	0.91	0.77	0.76	0.9	1.0	0.79	0.54	0.53	0.57	0.62	0.28	0.33	0.7	0.64	0.34	0.5	0.41	0.49	0.58	0.63	0.44	0.45
Smo84236	0.44	0.48	0.51	0.45	0.45	0.45	0.42	0.35	0.48	0.4	0.39	0.36	0.03	0.02	0.29	0.06	0.33	0.23	0.26	1.0	0.14	0.93	0.04	0.01	0.09	0.22	0.18	0.2	0.22	0.33	0.14	0.1
Smo89801	0.64	0.54	0.54	0.59	0.59	0.6	0.5	0.74	0.87	0.8	0.86	0.81	0.52	0.59	0.52	0.58	0.3	0.3	0.53	0.54	0.23	0.31	0.45	0.54	0.14	1.0	0.8	0.74	0.35	0.34	0.46	0.55
Smo90480	0.65	0.43	0.56	0.54	0.75	0.64	0.64	0.88	0.89	0.74	1.0	0.66	0.22	0.32	0.39	0.24	0.36	0.34	0.33	0.37	0.41	0.01	0.42	0.35	0.03	0.45	0.44	0.57	0.37	0.39	0.39	0.49
Smo90698	0.71	0.74	0.73	0.78	0.75	0.8	0.84	0.9	0.97	1.0	0.84	0.86	0.69	0.49	0.56	0.69	0.53	0.43	0.64	0.58	0.31	0.71	0.6	0.63	0.27	0.98	0.7	0.74	0.55	0.55	0.61	0.62
Smo92150	0.5	0.5	0.57	0.56	0.67	0.6	0.56	0.52	0.62	0.62	0.55	0.49	0.15	0.04	0.03	0.06	0.37	0.15	0.08	0.96	0.18	1.0	0.56	0.6	0.46	0.14	0.34	0.28	0.29	0.3	0.19	0.16
Smo93092	0.88	0.9	0.83	0.87	0.8	0.8	0.7	0.75	0.89	1.0	0.89	0.92	0.56	0.68	0.54	0.46	0.75	0.42	0.79	0.36	0.32	0.12	0.98	0.9	0.75	0.69	0.48	0.55	0.68	0.73	0.52	0.5
Smo93870	0.48	0.6	0.7	0.8	0.77	0.85	0.79	0.69	0.76	0.72	0.66	0.57	0.24	0.26	0.47	0.24	0.47	0.41	0.29	0.47	0.22	0.5	0.58	0.48	0.09	0.54	0.93	1.0	0.29	0.33	0.37	0.4
Smo93898	0.23	0.3	0.29	0.27	0.24	0.26	0.27	0.21	0.31	0.3	0.27	0.22	0.01	0.07	0.03	0.03	0.3	0.26	0.1	1.0	0.06	0.44	0.16	0.25	0.03	0.1	0.06	0.07	0.18	0.23	0.13	0.09
Smo97617	0.33	0.47	0.46	0.43	0.37	0.4	0.41	0.45	0.67	0.63	0.52	0.45	0.29	0.25	0.78	0.37	0.48	0.43	0.5	0.71	0.56	1.0	0.23	0.3	0.14	0.2	0.12	0.11	0.42	0.45	0.21	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)