1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.24 0.2 0.34 0.29 0.31 0.41 0.34 0.34 0.23 0.25 0.24 0.17 0.28 0.25 1.0 0.35 0.23 0.1 0.4 0.56 0.53 0.67 0.31 0.36 0.24 0.48 0.62 0.48 0.22 0.22 0.2 0.21
0.1 0.18 0.16 0.17 0.41 0.34 0.33 0.23 0.19 0.24 0.08 0.12 0.19 0.21 0.96 0.18 0.31 0.55 0.32 1.0 0.14 0.81 0.42 0.5 0.97 0.15 0.59 0.72 0.31 0.38 0.17 0.09
0.18 0.18 0.16 0.18 0.19 0.21 0.22 0.26 0.22 0.24 0.2 0.21 0.29 0.3 0.72 0.29 0.2 0.2 0.26 1.0 0.57 0.82 0.2 0.25 0.7 0.59 0.45 0.42 0.2 0.21 0.26 0.3
0.2 0.11 0.13 0.2 0.24 0.23 0.26 0.2 0.23 0.2 0.17 0.16 0.31 0.5 1.0 0.53 0.15 0.25 0.13 0.2 0.0 0.61 0.36 0.43 0.02 0.29 0.31 0.32 0.1 0.17 0.09 0.1
0.36 0.33 0.47 0.34 0.36 0.51 0.42 0.45 0.49 0.37 0.33 0.28 0.75 0.56 0.97 0.88 0.39 0.64 0.61 1.0 0.66 0.56 0.56 0.67 0.57 0.5 0.79 0.65 0.38 0.39 0.45 0.53
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.91 0.03 0.0 0.05 0.0 0.26 0.0 1.0 0.03 0.0 0.26 0.45 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.55 0.66 0.53 0.62 0.59 0.55 0.46 0.48 0.54 0.47 0.51 0.47 0.48 1.0 0.94 0.66 0.42 0.49 0.41 0.41 0.31 0.85 0.55 0.53 0.43 0.25 0.32 0.3 0.28 0.3 0.33 0.36
0.29 0.28 0.3 0.31 0.25 0.31 0.25 0.26 0.32 0.24 0.25 0.26 0.54 0.9 1.0 0.58 0.31 0.38 0.44 0.15 0.5 0.86 0.39 0.4 0.53 0.46 0.45 0.4 0.31 0.32 0.29 0.34
0.39 0.35 0.35 0.38 0.43 0.37 0.39 0.39 0.44 0.42 0.46 0.39 0.58 0.73 1.0 0.65 0.4 0.26 0.5 0.66 0.58 0.62 0.43 0.44 0.42 0.84 0.6 0.68 0.42 0.42 0.56 0.59
0.42 0.39 0.35 0.46 0.44 0.51 0.48 0.58 0.62 0.75 0.67 0.65 0.72 0.89 0.94 0.68 0.45 0.38 0.53 0.76 0.71 0.93 0.61 0.74 1.0 0.69 0.38 0.43 0.52 0.56 0.47 0.48
0.21 0.21 0.24 0.23 0.31 0.32 0.33 0.33 0.25 0.2 0.21 0.18 0.16 0.24 0.86 0.18 0.19 0.11 0.18 0.59 0.23 1.0 0.13 0.14 0.17 0.28 0.4 0.34 0.14 0.14 0.17 0.15
0.36 0.38 0.36 0.38 0.38 0.4 0.4 0.38 0.39 0.41 0.35 0.37 0.59 0.63 1.0 0.62 0.44 0.43 0.57 0.48 0.54 0.68 0.55 0.59 0.63 0.26 0.25 0.23 0.43 0.43 0.49 0.57
0.17 0.16 0.16 0.19 0.18 0.22 0.18 0.18 0.19 0.17 0.16 0.17 0.44 0.66 1.0 0.52 0.29 0.23 0.45 0.45 0.29 0.7 0.37 0.44 0.47 0.31 0.17 0.22 0.27 0.27 0.27 0.27
0.22 0.2 0.21 0.23 0.23 0.23 0.22 0.22 0.22 0.21 0.19 0.19 0.31 0.64 0.86 0.34 0.21 0.22 0.32 0.76 0.32 1.0 0.24 0.27 0.49 0.24 0.23 0.24 0.2 0.22 0.17 0.17
0.54 0.55 0.54 0.57 0.52 0.62 0.47 0.45 0.45 0.44 0.54 0.44 0.46 1.0 0.86 0.35 0.3 0.69 0.31 0.5 0.28 0.95 0.31 0.32 0.23 0.15 0.29 0.23 0.27 0.26 0.35 0.48
0.37 0.42 0.43 0.43 0.39 0.46 0.42 0.45 0.41 0.38 0.42 0.32 0.55 0.54 0.77 0.59 0.28 0.19 0.38 0.52 0.28 1.0 0.4 0.46 0.64 0.39 0.51 0.51 0.27 0.3 0.38 0.45
0.32 0.27 0.24 0.31 0.31 0.32 0.33 0.39 0.32 0.34 0.33 0.3 0.67 0.33 1.0 0.59 0.3 0.45 0.45 0.52 0.71 0.81 0.55 0.75 0.68 0.97 0.61 0.5 0.38 0.4 0.36 0.36
0.08 0.06 0.05 0.1 0.11 0.12 0.13 0.11 0.17 0.13 0.09 0.07 0.08 0.06 1.0 0.1 0.11 0.03 0.06 0.4 0.18 0.85 0.05 0.09 0.1 0.02 0.05 0.05 0.07 0.07 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.03 0.01 0.01 0.12 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.39 1.0 0.0 0.0 0.57 0.25 0.44 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.29 0.21 0.28 0.44 0.44 0.28 0.44 0.25 0.21 0.18 0.17 0.4 0.5 1.0 0.34 0.18 0.32 0.42 0.87 0.21 0.93 0.32 0.38 0.55 0.35 0.65 0.66 0.22 0.24 0.11 0.12
0.2 0.22 0.16 0.23 0.4 0.23 0.16 0.18 0.16 0.17 0.17 0.19 0.77 0.71 0.63 0.65 0.24 0.31 0.52 0.62 0.87 0.57 0.51 0.55 1.0 0.29 0.48 0.28 0.3 0.27 0.27 0.45
0.16 0.19 0.21 0.17 0.23 0.24 0.2 0.13 0.16 0.13 0.18 0.11 0.06 0.01 0.96 0.12 0.18 0.08 0.07 0.68 0.19 1.0 0.03 0.02 0.03 0.06 0.13 0.18 0.11 0.15 0.05 0.02
0.09 0.01 0.0 0.03 0.01 0.05 0.07 0.01 0.1 0.09 0.06 0.01 0.19 0.12 0.55 0.28 0.12 0.01 0.69 0.37 0.05 1.0 0.04 0.02 0.0 0.06 0.05 0.1 0.07 0.06 0.02 0.05
0.15 0.16 0.18 0.2 0.25 0.3 0.26 0.23 0.2 0.14 0.17 0.14 0.27 0.2 0.72 0.23 0.21 0.13 0.23 0.61 0.33 1.0 0.2 0.18 0.38 0.29 0.49 0.66 0.17 0.2 0.14 0.11
0.1 0.11 0.11 0.12 0.1 0.12 0.12 0.09 0.1 0.08 0.1 0.09 0.09 0.08 0.98 0.11 0.11 0.01 0.1 0.73 0.27 1.0 0.05 0.06 0.24 0.17 0.12 0.13 0.09 0.11 0.05 0.04
0.17 0.18 0.18 0.2 0.17 0.21 0.21 0.15 0.17 0.13 0.18 0.16 0.08 0.02 1.0 0.12 0.21 0.1 0.14 1.0 0.13 0.88 0.02 0.02 0.04 0.09 0.13 0.15 0.1 0.13 0.05 0.05
0.46 0.45 0.4 0.53 0.59 0.64 0.61 0.52 0.45 0.38 0.45 0.34 0.52 0.61 0.91 0.41 0.33 0.16 0.34 1.0 0.29 0.9 0.44 0.39 0.46 0.52 0.75 0.87 0.29 0.29 0.2 0.22
0.47 0.44 0.41 0.48 0.4 0.45 0.43 0.52 0.6 0.65 0.56 0.52 0.64 0.5 0.91 0.47 0.32 0.25 0.57 1.0 0.23 0.82 0.48 0.46 0.45 0.71 0.53 0.45 0.35 0.36 0.25 0.32
0.11 0.1 0.03 0.14 0.0 0.08 0.13 0.0 0.08 0.16 0.03 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.77 0.0 0.31 0.43 1.0 0.03 0.03 0.69 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.05 0.06 0.07 0.1 0.09 0.08 0.06 0.08 0.07 0.08 0.05 0.07 0.05 0.81 0.14 0.11 0.07 0.04 0.02 0.11 1.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.07 0.06 0.06 0.04 0.04
0.1 0.22 0.13 0.17 0.18 0.25 0.19 0.12 0.24 0.19 0.14 0.17 0.16 0.18 0.81 0.21 0.13 0.07 0.19 0.39 0.33 1.0 0.11 0.06 0.41 0.29 0.23 0.18 0.13 0.14 0.04 0.03
0.4 0.34 0.24 0.35 0.32 0.36 0.37 0.34 0.35 0.36 0.32 0.4 0.54 0.64 1.0 0.48 0.44 0.55 0.42 0.41 0.33 0.63 0.41 0.41 0.47 0.17 0.18 0.17 0.43 0.41 0.46 0.51
0.05 0.07 0.09 0.08 0.11 0.08 0.11 0.05 0.13 0.06 0.1 0.05 0.06 0.04 0.52 0.06 0.07 0.02 0.09 0.32 0.07 1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.02
0.37 0.42 0.33 0.44 0.44 0.4 0.39 0.44 0.35 0.48 0.45 0.54 0.86 0.3 0.23 0.79 0.42 0.84 0.59 0.8 0.6 1.0 0.39 0.46 0.97 0.57 0.41 0.56 0.43 0.37 0.36 0.49
0.33 0.47 0.36 0.33 0.24 0.29 0.26 0.25 0.29 0.3 0.28 0.28 0.02 0.12 0.29 0.07 0.24 1.0 0.32 0.34 0.56 0.7 0.16 0.14 0.48 0.26 0.54 0.52 0.21 0.23 0.09 0.09
0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.33 0.36 0.73 0.16 0.03 0.02 0.17 0.91 0.02 1.0 0.02 0.07 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.01
0.33 0.26 0.24 0.25 0.27 0.36 0.31 0.32 0.21 0.28 0.24 0.21 0.24 0.23 0.73 0.26 0.22 0.23 0.27 0.66 0.2 1.0 0.19 0.19 0.14 0.33 0.4 0.41 0.17 0.18 0.14 0.15
0.25 0.3 0.18 0.38 0.33 0.48 0.24 0.29 0.23 0.26 0.33 0.25 0.6 0.39 0.74 0.78 0.32 0.39 0.63 0.63 0.4 1.0 0.43 0.55 0.7 0.39 0.4 0.44 0.49 0.49 0.18 0.21
0.39 0.41 0.4 0.36 0.38 0.36 0.41 0.3 0.29 0.31 0.39 0.34 0.81 0.67 1.0 1.0 0.42 0.35 0.65 0.51 0.76 0.97 0.39 0.37 0.89 0.5 0.41 0.32 0.32 0.35 0.28 0.26
0.06 0.06 0.02 0.08 0.16 0.24 0.08 0.08 0.04 0.04 0.03 0.04 0.23 0.29 0.74 0.4 0.07 0.08 0.05 0.6 0.05 1.0 0.04 0.04 0.05 0.0 0.03 0.09 0.04 0.05 0.03 0.02
0.1 0.12 0.15 0.15 0.17 0.18 0.19 0.14 0.18 0.13 0.15 0.12 0.08 0.04 1.0 0.12 0.19 0.11 0.07 0.59 0.21 0.73 0.02 0.01 0.07 0.07 0.12 0.19 0.09 0.12 0.11 0.1
0.2 0.19 0.19 0.26 0.22 0.3 0.23 0.27 0.28 0.24 0.22 0.23 0.26 0.32 0.55 0.27 0.13 0.33 0.26 1.0 0.44 0.67 0.15 0.24 0.19 0.1 0.15 0.16 0.16 0.15 0.12 0.16
0.29 0.3 0.29 0.26 0.45 0.34 0.38 0.34 0.31 0.37 0.31 0.28 0.47 0.44 0.97 0.57 0.32 0.32 0.5 0.91 0.39 1.0 0.39 0.42 0.63 0.75 0.84 0.82 0.33 0.34 0.29 0.32
0.34 0.35 0.36 0.48 0.53 0.55 0.45 0.39 0.43 0.39 0.27 0.3 0.53 0.67 0.8 0.86 0.38 0.37 0.68 1.0 0.69 0.66 0.48 0.56 0.54 0.55 0.72 0.76 0.38 0.42 0.31 0.39
0.11 0.15 0.21 0.27 0.29 0.39 0.46 0.42 0.32 0.23 0.2 0.14 0.38 0.32 0.86 0.39 0.27 0.25 0.39 0.93 0.26 1.0 0.37 0.48 0.45 0.15 0.25 0.24 0.28 0.36 0.16 0.09
0.27 0.28 0.3 0.32 0.39 0.34 0.37 0.28 0.34 0.31 0.32 0.27 0.7 0.67 1.0 0.82 0.33 0.54 0.67 0.76 0.64 0.89 0.52 0.54 0.67 0.59 0.69 0.67 0.38 0.42 0.34 0.42
0.18 0.09 0.1 0.19 0.26 0.36 0.28 0.33 0.32 0.26 0.31 0.18 0.53 0.35 0.93 0.52 0.19 0.38 0.43 0.48 0.24 1.0 0.3 0.48 0.43 0.66 0.65 0.52 0.27 0.27 0.19 0.16
0.06 0.08 0.08 0.08 0.06 0.1 0.07 0.04 0.09 0.06 0.04 0.05 0.13 0.3 0.66 0.15 0.1 0.24 0.2 1.0 0.26 0.77 0.12 0.11 0.08 0.03 0.03 0.05 0.07 0.08 0.05 0.04
0.39 0.36 0.32 0.39 0.35 0.44 0.33 0.33 0.32 0.26 0.23 0.24 0.75 0.29 1.0 0.63 0.31 0.21 0.55 0.5 0.08 0.9 0.32 0.39 0.8 0.24 0.27 0.32 0.27 0.27 0.15 0.13
0.16 0.21 0.25 0.29 0.34 0.35 0.37 0.3 0.28 0.21 0.22 0.17 0.09 0.12 1.0 0.14 0.24 0.13 0.16 0.5 0.23 0.84 0.11 0.09 0.34 0.15 0.47 0.57 0.18 0.22 0.09 0.08
0.13 0.15 0.15 0.18 0.19 0.18 0.2 0.16 0.21 0.16 0.14 0.17 0.08 0.2 1.0 0.19 0.36 0.11 0.2 0.47 0.15 0.85 0.19 0.1 0.08 0.12 0.11 0.09 0.2 0.21 0.18 0.18
0.27 0.3 0.33 0.26 0.36 0.39 0.32 0.29 0.34 0.32 0.28 0.26 0.41 0.47 1.0 0.4 0.36 0.44 0.39 0.37 0.17 0.42 0.38 0.43 0.1 0.27 0.29 0.36 0.32 0.35 0.25 0.3
0.37 0.26 0.34 0.34 0.49 0.3 0.24 0.4 0.33 0.28 0.39 0.28 0.43 0.85 1.0 0.5 0.31 0.33 0.36 0.42 0.43 0.86 0.35 0.35 0.63 0.68 0.86 0.73 0.35 0.33 0.38 0.32
0.41 0.44 0.51 0.55 0.48 0.52 0.47 0.47 0.4 0.4 0.37 0.36 0.56 0.55 1.0 0.67 0.32 0.27 0.42 0.45 0.48 0.81 0.4 0.42 0.32 0.29 0.38 0.32 0.27 0.29 0.24 0.25
0.11 0.12 0.15 0.17 0.17 0.17 0.18 0.14 0.19 0.13 0.14 0.12 0.08 0.06 1.0 0.09 0.15 0.1 0.02 0.65 0.14 0.99 0.02 0.01 0.07 0.03 0.07 0.1 0.07 0.09 0.04 0.04
0.31 0.33 0.3 0.36 0.27 0.34 0.32 0.39 0.39 0.33 0.33 0.31 0.44 0.71 0.8 0.42 0.29 0.24 0.45 0.48 0.39 1.0 0.34 0.36 0.77 0.53 0.48 0.37 0.29 0.3 0.37 0.37
0.29 0.19 0.18 0.28 0.31 0.41 0.45 0.49 0.44 0.43 0.33 0.35 0.23 0.28 0.72 0.23 0.28 0.52 0.35 0.55 0.46 1.0 0.28 0.3 0.87 0.2 0.32 0.3 0.27 0.3 0.24 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)