1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_221 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.06 0.05 0.11 0.25 0.0 0.97 0.06 0.17 1.0 0.46 0.0 0.0 0.27 0.34 0.05 0.05
0.16 0.11 0.12 0.15 0.25 0.37 0.47 0.44 0.38 0.36 0.23 0.24 0.07 0.06 0.29 0.1 0.19 0.18 0.24 1.0 0.88 0.97 0.16 0.15 0.73 0.15 0.3 0.27 0.27 0.26 0.28 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.25 0.27 0.18 0.71 0.54 0.0 0.14 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.22 0.11 0.1
0.04 0.02 0.04 0.05 0.09 0.18 0.17 0.18 0.13 0.13 0.06 0.06 0.03 0.01 0.05 0.04 0.09 0.14 0.07 0.28 0.09 0.74 0.09 0.07 1.0 0.08 0.17 0.17 0.14 0.16 0.09 0.06
0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.07 0.03 0.03 0.04 0.04 1.0 0.32 0.5 0.02 0.02 0.31 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
0.23 0.21 0.25 0.23 0.26 0.27 0.38 0.25 0.29 0.26 0.24 0.19 0.26 0.36 0.57 0.25 0.47 0.68 0.28 1.0 0.77 0.69 0.32 0.33 0.79 0.17 0.43 0.34 0.38 0.35 0.42 0.53
0.16 0.18 0.17 0.2 0.29 0.32 0.31 0.27 0.23 0.19 0.15 0.14 0.27 0.11 0.72 0.31 0.23 0.26 0.43 0.68 0.44 1.0 0.26 0.31 0.81 0.08 0.16 0.14 0.25 0.26 0.23 0.31
0.29 0.32 0.33 0.34 0.39 0.38 0.35 0.36 0.33 0.33 0.31 0.3 0.58 0.49 0.59 0.73 0.31 0.38 0.47 0.99 0.8 1.0 0.4 0.47 0.4 0.83 0.51 0.54 0.33 0.34 0.24 0.22
0.23 0.23 0.19 0.22 0.24 0.25 0.19 0.21 0.23 0.27 0.23 0.24 0.49 0.39 0.32 0.53 0.21 0.19 0.38 0.41 0.65 1.0 0.38 0.54 0.94 0.43 0.28 0.24 0.22 0.27 0.23 0.24
0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.13 0.02 0.02 0.13 0.12 0.09 0.16 1.0 0.29 0.47 0.13 0.09 0.33 0.05 0.04 0.03 0.1 0.11 0.1 0.1
0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.08 0.08 0.06 0.57 0.4 0.4 0.05 0.05 1.0 0.03 0.03 0.04 0.07 0.07 0.07 0.07
0.04 0.04 0.04 0.06 0.07 0.08 0.08 0.08 0.04 0.06 0.04 0.04 0.25 0.01 0.05 0.19 0.16 0.24 0.17 0.91 0.51 0.41 0.16 0.18 1.0 0.17 0.15 0.15 0.11 0.12 0.19 0.22
0.2 0.24 0.23 0.21 0.22 0.2 0.23 0.19 0.21 0.2 0.2 0.19 0.16 0.22 0.15 0.21 0.21 0.28 0.54 1.0 0.4 0.29 0.25 0.21 0.7 0.18 0.21 0.2 0.21 0.2 0.17 0.16
0.04 0.03 0.02 0.05 0.08 0.07 0.05 0.01 0.07 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.11 0.11 0.01 1.0 0.73 0.07 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.05 0.05 0.02 0.01
0.12 0.11 0.11 0.12 0.08 0.16 0.13 0.17 0.17 0.15 0.15 0.15 0.23 0.06 0.07 0.21 0.14 0.17 0.39 1.0 0.29 0.84 0.17 0.15 0.86 0.21 0.17 0.18 0.15 0.15 0.12 0.1
0.09 0.02 0.04 0.01 0.02 0.03 0.04 0.08 0.02 0.04 0.03 0.06 0.17 0.09 0.12 0.21 0.14 0.13 0.31 1.0 0.18 0.33 0.09 0.13 0.38 0.09 0.16 0.1 0.13 0.18 0.15 0.16
0.27 0.26 0.27 0.28 0.32 0.34 0.26 0.31 0.33 0.34 0.32 0.3 0.5 0.23 0.4 0.36 0.22 0.17 0.27 0.79 0.38 1.0 0.36 0.41 0.68 0.42 0.25 0.24 0.23 0.22 0.18 0.2
0.06 0.11 0.18 0.21 0.19 0.21 0.33 0.16 0.17 0.14 0.13 0.11 0.08 0.05 0.09 0.1 0.36 0.16 0.17 1.0 0.53 0.51 0.14 0.17 0.72 0.35 0.13 0.14 0.19 0.26 0.23 0.16
0.12 0.18 0.18 0.22 0.2 0.22 0.25 0.25 0.29 0.19 0.24 0.17 0.08 0.09 0.1 0.04 0.15 0.0 0.21 0.13 0.47 0.45 0.31 0.29 1.0 0.21 0.35 0.27 0.16 0.18 0.1 0.09
0.09 0.19 0.06 0.12 0.27 0.24 0.37 0.35 0.31 0.14 0.13 0.11 0.13 0.12 0.12 0.06 0.16 0.24 0.07 0.08 0.26 0.41 0.34 0.27 1.0 0.12 0.39 0.43 0.12 0.19 0.09 0.1
0.02 0.17 0.01 0.01 0.05 0.05 0.09 0.05 0.09 0.16 0.13 0.02 0.0 0.03 0.09 0.02 0.09 0.09 0.11 0.38 0.11 1.0 0.04 0.09 0.66 0.2 0.25 0.22 0.06 0.11 0.11 0.08
0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.04 0.01 0.12 0.03 0.07 0.04 0.12 0.06 0.14 0.56 0.78 0.95 0.13 0.08 1.0 0.01 0.02 0.0 0.2 0.15 0.12 0.15
0.04 0.05 0.03 0.02 0.1 0.13 0.1 0.1 0.14 0.07 0.08 0.04 0.02 0.02 0.05 0.02 0.07 0.1 0.07 0.53 1.0 0.6 0.08 0.05 0.88 0.06 0.16 0.1 0.11 0.1 0.11 0.08
0.05 0.02 0.03 0.08 0.03 0.18 0.11 0.15 0.24 0.18 0.1 0.09 0.02 0.0 0.04 0.03 0.07 0.1 0.07 0.39 0.06 1.0 0.07 0.04 0.85 0.14 0.21 0.14 0.17 0.13 0.05 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.06 0.17 0.15 0.05 0.0 0.0 0.17 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.04 0.07
0.05 0.06 0.05 0.08 0.11 0.11 0.1 0.09 0.09 0.07 0.06 0.06 0.1 0.04 0.05 0.13 0.19 0.17 0.16 0.76 0.71 0.55 0.15 0.15 1.0 0.15 0.12 0.12 0.16 0.17 0.1 0.09
0.06 0.05 0.09 0.07 0.04 0.08 0.07 0.23 0.08 0.03 0.06 0.05 0.07 0.03 0.07 0.04 0.04 0.04 0.11 0.46 0.55 0.41 0.12 0.08 1.0 0.07 0.22 0.21 0.04 0.05 0.03 0.06
0.16 0.12 0.11 0.15 0.19 0.09 0.06 0.09 0.08 0.1 0.12 0.1 0.21 0.05 0.12 0.19 0.15 0.19 0.34 1.0 0.68 0.3 0.1 0.13 0.78 0.28 0.08 0.23 0.19 0.13 0.1 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.16 0.04 0.08 0.2 0.17 0.71 0.43 0.69 0.08 0.11 1.0 0.05 0.14 0.02 0.17 0.16 0.07 0.1
0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.05 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.17 0.17 0.1 0.01 0.04 0.11 0.93 1.0 0.77 0.05 0.09 0.51 0.59 0.31 0.12 0.02 0.04 0.02 0.01
0.04 0.05 0.01 0.07 0.0 0.04 0.04 0.01 0.03 0.03 0.02 0.05 0.22 0.14 0.21 0.21 0.11 0.06 0.37 1.0 0.68 0.14 0.15 0.33 0.87 0.39 0.27 0.25 0.07 0.1 0.12 0.11
0.05 0.02 0.03 0.04 0.08 0.07 0.06 0.07 0.07 0.27 0.14 0.06 0.09 0.02 0.03 0.08 0.04 0.0 0.1 0.16 0.25 0.79 0.04 0.06 1.0 0.04 0.09 0.06 0.02 0.03 0.04 0.03
0.09 0.05 0.02 0.03 0.08 0.05 0.02 0.04 0.01 0.08 0.09 0.1 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.42 1.0 0.26 0.01 0.03 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.01
0.09 0.09 0.08 0.07 0.1 0.12 0.11 0.08 0.08 0.07 0.1 0.07 0.03 0.04 0.16 0.06 0.11 0.09 0.13 0.74 0.36 0.43 0.07 0.08 1.0 0.12 0.14 0.16 0.08 0.09 0.07 0.06
0.12 0.11 0.09 0.11 0.12 0.12 0.11 0.1 0.12 0.11 0.12 0.11 0.1 0.08 0.1 0.1 0.07 0.03 0.11 1.0 0.48 0.68 0.09 0.09 0.59 0.29 0.3 0.25 0.07 0.06 0.09 0.11
0.16 0.2 0.2 0.24 0.22 0.27 0.21 0.22 0.23 0.23 0.2 0.22 0.37 0.18 0.22 0.41 0.28 0.27 0.35 0.39 0.38 1.0 0.33 0.35 0.66 0.37 0.29 0.28 0.32 0.34 0.31 0.3
0.19 0.18 0.28 0.34 0.38 0.44 0.36 0.37 0.33 0.35 0.26 0.2 0.22 0.39 0.35 0.17 0.32 0.24 0.26 0.55 0.8 1.0 0.39 0.36 0.65 0.2 0.46 0.39 0.22 0.25 0.26 0.33
0.12 0.1 0.11 0.12 0.15 0.13 0.14 0.12 0.15 0.11 0.16 0.14 0.03 0.01 0.02 0.04 0.23 0.29 0.09 0.81 1.0 0.4 0.13 0.1 0.76 0.14 0.12 0.17 0.3 0.24 0.17 0.1
0.27 0.25 0.28 0.32 0.42 0.36 0.36 0.42 0.36 0.36 0.33 0.27 0.32 0.24 0.38 0.45 0.29 0.16 0.38 1.0 0.36 0.82 0.33 0.32 0.84 0.41 0.31 0.22 0.28 0.29 0.27 0.28
0.12 0.12 0.18 0.15 0.15 0.17 0.13 0.14 0.13 0.12 0.13 0.12 0.31 0.4 0.36 0.22 0.24 0.57 0.21 0.85 0.62 0.87 0.25 0.24 1.0 0.08 0.13 0.1 0.21 0.19 0.23 0.29
0.09 0.08 0.06 0.07 0.06 0.07 0.05 0.06 0.08 0.09 0.07 0.1 0.32 0.15 0.11 0.43 0.13 0.12 0.24 1.0 0.54 0.1 0.15 0.16 0.79 0.13 0.08 0.08 0.19 0.22 0.23 0.28
0.37 0.39 0.36 0.39 0.39 0.39 0.34 0.32 0.35 0.33 0.33 0.31 0.34 0.48 0.41 0.38 0.26 0.22 0.29 0.62 0.37 1.0 0.34 0.34 0.8 0.25 0.31 0.31 0.24 0.24 0.27 0.28
0.14 0.14 0.05 0.09 0.16 0.14 0.12 0.13 0.16 0.18 0.22 0.15 0.03 0.03 0.06 0.09 0.1 0.1 0.17 0.18 0.28 1.0 0.07 0.08 0.28 0.39 0.58 0.25 0.1 0.1 0.16 0.22
0.16 0.15 0.16 0.24 0.13 0.22 0.17 0.16 0.15 0.18 0.13 0.16 0.23 0.2 0.26 0.45 0.13 0.11 0.33 1.0 0.33 0.34 0.17 0.24 0.59 0.29 0.3 0.25 0.18 0.15 0.1 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)