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Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.17 -0.67 -0.37 -0.06 -0.07 -0.23 0.22 0.95 0.82 0.9 0.8 0.58 -0.24 -1.09 -1.52 -0.24 -0.8 -1.47 -0.51 -1.91 -2.22 -2.82 -0.5 -0.61 -0.11 2.02 0.41 0.29 -0.12 -0.28 -0.41 -0.32
0.3 0.18 0.26 0.31 0.15 0.25 0.46 0.44 0.48 0.57 0.58 0.41 0.32 0.3 -2.49 0.55 -0.41 -0.69 0.51 -13.07 -3.72 -6.82 -0.63 -0.4 -2.02 1.03 0.4 0.7 -0.21 -0.41 -0.46 -1.12
0.33 0.04 -0.2 0.01 -0.02 -0.17 0.1 0.37 0.4 0.46 0.49 0.47 -0.07 -1.03 -1.23 0.09 -0.3 -0.97 0.41 -5.4 -3.72 -2.87 0.1 0.12 -3.03 1.54 0.27 0.24 0.06 0.05 0.27 0.5
0.25 -0.23 -0.36 -0.09 -0.47 -0.44 -0.17 0.29 0.57 0.92 0.88 0.66 -0.66 -1.22 -1.29 -0.66 -0.99 -1.52 -0.87 -0.44 0.08 0.97 -0.88 -0.56 -0.17 2.12 -0.57 -0.56 -0.86 -0.83 -0.34 -0.14
0.18 0.07 0.04 0.19 0.15 -0.09 -0.04 0.35 0.34 0.46 0.55 0.31 0.11 0.23 -0.07 0.42 -0.66 -1.77 0.4 -2.89 -6.29 -5.9 -0.36 -0.35 -3.58 0.98 0.47 0.39 -0.2 -0.07 0.38 0.7
-0.68 -0.52 -0.45 -0.29 -0.41 -0.4 -0.22 0.39 0.57 0.68 0.71 0.65 -0.0 -0.68 -0.63 0.11 -0.91 -1.57 -0.04 -2.96 -0.49 0.19 -0.51 -0.56 0.25 2.03 0.12 -0.07 -0.1 -0.35 -0.25 -0.43
0.44 0.14 0.1 0.29 0.19 -0.26 0.1 0.2 0.07 0.22 0.39 0.06 0.2 0.15 0.25 0.5 -0.31 -1.67 0.46 - -4.46 -2.28 -0.14 -0.31 -3.64 0.63 0.59 0.53 -0.12 -0.08 0.27 0.6
0.43 0.6 0.19 0.31 0.23 0.25 0.14 0.44 0.48 0.52 0.34 0.46 -0.08 -0.52 0.25 -0.2 -0.53 -2.1 0.33 -4.28 -2.79 -3.39 -0.41 -0.31 -1.25 0.94 0.43 0.76 -0.21 -0.19 -0.23 -0.41
0.39 0.22 0.28 0.33 0.4 0.12 -0.02 -0.02 0.06 0.18 0.36 0.39 -0.27 -0.12 -0.41 0.06 -0.94 -3.18 -0.48 -0.31 -2.53 -0.15 -0.42 -0.18 -0.5 1.78 0.32 0.53 -0.98 -0.63 -0.63 -0.2
0.95 0.53 0.24 0.28 0.19 0.02 -0.55 0.19 -0.18 -0.07 0.36 0.35 -2.18 -0.88 -2.0 -1.27 -0.05 -0.89 0.15 -1.7 -4.9 - -0.95 -1.25 -6.19 2.16 1.1 1.46 -0.12 -0.18 -0.42 -0.69
0.52 -0.29 -0.25 -0.19 -0.8 -0.35 -0.26 0.42 0.56 0.91 0.94 1.08 -0.79 -1.18 -1.27 -0.94 -0.78 -3.41 -1.17 - -4.63 - -0.72 -0.48 -1.42 2.27 0.82 0.61 -0.36 -0.6 0.45 0.46
-0.11 -0.06 0.02 0.15 -0.02 0.06 0.21 0.38 0.46 0.41 0.46 0.28 -0.26 -0.19 0.32 -0.02 -0.33 -0.99 0.03 -1.48 -2.37 -1.32 -0.34 -0.23 -0.85 0.86 0.69 0.62 -0.26 -0.32 0.14 0.12
0.56 0.62 0.33 0.14 0.06 -0.29 0.18 0.3 0.43 0.52 0.54 0.77 -0.28 -0.29 -0.39 0.54 -0.57 -1.12 0.28 -7.85 -5.17 -33.02 -0.34 -0.13 -2.16 1.29 0.11 0.59 -0.1 -0.05 -0.55 -0.53
-0.15 -0.3 -0.12 0.3 0.32 0.0 0.29 0.92 0.69 0.85 0.58 0.4 0.51 -0.88 -1.25 0.02 -1.64 -2.54 -0.35 -3.39 -2.33 -4.6 -0.8 -0.44 -0.13 2.27 0.31 0.2 -0.92 -0.99 -0.78 -1.0
0.5 -0.03 0.11 0.17 0.28 0.02 -0.2 0.7 0.72 1.26 0.99 0.91 0.85 -1.73 -3.9 -0.03 -2.92 -3.18 -1.59 -2.54 -5.43 -4.93 -2.28 -1.22 -1.49 2.43 0.43 -0.02 -1.73 -1.75 -0.48 -0.36
-0.13 -0.31 -0.2 -0.01 -0.11 -0.28 0.15 0.61 0.44 0.6 0.41 0.39 -0.26 -0.94 -1.71 -0.36 -0.81 -1.61 -0.38 -2.08 0.3 -2.41 -0.48 -0.36 0.63 1.82 0.61 0.57 -0.35 -0.55 -0.08 -0.37
0.73 0.4 0.15 0.22 0.09 -0.27 -0.43 0.45 0.39 0.53 0.49 0.59 0.02 -1.03 -1.26 -0.3 -0.6 -1.18 0.41 -2.64 -2.28 -4.45 -0.77 -0.58 -1.69 2.17 0.27 0.43 -0.49 -0.55 -0.55 -0.31
0.37 0.47 0.6 0.36 0.3 0.2 0.16 0.47 0.36 0.52 0.4 0.23 -0.14 -0.25 -0.86 0.14 -0.63 -1.06 0.06 -3.15 -1.83 -2.31 -0.08 0.16 -1.1 1.01 0.17 0.34 -0.32 -0.31 -0.24 -0.17
-0.14 -0.35 0.12 0.28 0.15 0.11 0.6 1.11 0.97 1.04 0.79 0.51 -1.08 -0.46 -1.07 -0.17 -1.19 -1.81 -1.23 -6.65 -3.13 -6.7 -0.95 -1.23 -2.52 1.79 0.82 0.86 -0.3 -0.48 -0.51 -0.42
0.34 0.01 -0.02 0.01 -0.01 -0.16 -0.23 0.04 0.35 0.47 0.64 0.5 0.29 0.43 0.48 0.46 -0.45 -0.84 -0.16 -1.28 -0.95 -0.93 -0.12 0.08 -0.93 1.13 -0.22 -0.33 -0.21 -0.07 -0.67 -0.83
0.42 0.27 0.17 0.03 -0.03 -0.14 0.08 0.23 0.46 0.61 0.74 0.75 0.0 -0.16 -0.09 -0.05 -0.38 -0.68 -0.36 -3.69 -3.38 -3.55 -0.15 -0.06 -2.29 1.27 0.29 0.56 -0.16 -0.1 -0.26 -0.19
0.27 -0.25 -0.58 -0.14 0.08 -0.09 0.05 0.69 0.67 0.75 0.69 0.59 -0.43 -0.66 -1.32 -0.12 -0.99 -1.91 -0.09 -1.92 -1.15 -2.75 -0.64 -0.43 -0.03 1.49 0.6 0.5 -0.51 -0.43 0.24 0.42
0.36 0.37 0.33 0.33 0.29 0.09 0.26 0.48 0.49 0.5 0.47 0.45 -0.22 -0.1 -0.45 0.15 -0.35 -0.96 0.37 -3.21 -2.55 -1.61 0.1 0.11 -0.18 0.73 -0.08 -0.07 -0.08 -0.12 -0.61 -0.93
0.21 -0.38 -0.12 0.0 -0.01 -0.42 0.03 0.58 0.74 0.82 0.87 0.55 0.01 -0.52 -0.3 0.11 -0.86 -1.97 0.21 -1.05 -7.47 -3.55 -0.54 -0.57 -6.08 1.22 0.37 0.34 0.01 -0.0 0.27 0.64
0.29 -0.29 -0.4 -0.09 0.12 -0.05 0.2 0.88 0.89 1.17 0.95 0.72 0.64 -1.08 -0.33 -0.14 -1.01 -1.71 -0.31 -3.62 -4.86 -4.61 -0.3 -0.04 -3.09 1.77 0.12 0.07 -0.54 -0.46 -0.58 -0.98
1.7 0.27 -0.55 -0.7 -1.0 -1.16 -0.6 0.38 0.64 1.37 1.24 1.26 -0.67 -0.59 -2.2 -0.93 -1.98 -0.96 -0.17 -2.7 -2.98 -5.3 -2.15 -2.04 -1.78 2.69 -1.48 -1.4 -0.27 -0.14 -1.56 -1.34
0.92 -0.74 -1.82 -2.33 -2.64 -2.65 -1.58 0.07 0.21 1.52 1.53 1.56 0.04 -0.26 -1.32 -0.78 -2.96 -1.56 -1.23 -0.31 -2.63 -1.96 -3.32 -2.71 -2.52 3.16 -1.55 -2.31 -0.9 -1.12 0.2 -1.22
0.3 -0.07 0.04 0.09 0.08 0.1 0.32 0.65 0.58 0.71 0.55 0.41 0.2 -0.03 -0.58 -0.15 -0.9 -1.28 -0.09 -1.06 -2.32 -2.0 -0.56 -0.45 -1.29 1.07 0.37 0.25 -0.37 -0.34 0.17 0.32
-0.13 -1.41 -1.18 -0.6 -0.54 -0.57 -0.15 0.63 0.94 1.24 1.11 0.67 0.03 -1.88 -1.59 -1.12 -1.12 -1.69 -0.42 -7.23 -3.58 -6.48 -0.97 -0.97 -2.59 3.09 -0.1 -0.4 -0.53 -0.75 -0.76 -0.33
-0.5 -0.6 -0.26 0.01 0.12 0.0 0.23 0.65 0.63 0.68 0.46 -0.02 -0.03 -0.38 -1.17 -0.13 -0.59 -1.53 -0.12 0.35 -0.66 0.9 -0.83 -1.57 -1.27 2.07 -0.18 -0.03 -0.5 -0.53 -0.97 -1.57
0.54 0.07 -0.2 0.05 -0.02 -0.17 -0.05 0.32 0.59 0.65 0.64 0.63 0.26 -0.8 -1.46 0.15 -0.7 -1.3 -0.21 -10.97 -6.73 - -0.13 -0.07 -4.61 1.6 0.63 0.48 -0.07 -0.11 0.06 0.45
-0.77 -0.7 -0.01 0.28 0.09 -0.54 0.12 0.97 1.05 1.3 1.05 0.61 -0.2 0.04 -2.1 0.05 -2.41 -2.56 -0.02 - -5.39 -9.67 -1.46 -0.74 -3.52 2.46 0.31 -0.21 -0.89 -1.07 -0.31 -0.61
0.03 -0.18 -0.3 0.08 -0.06 -0.35 0.06 0.36 0.6 0.75 0.57 0.63 0.26 -1.25 -2.14 0.09 -0.74 -1.22 0.23 -4.46 -1.97 -3.79 -0.03 0.0 -1.58 2.04 -0.0 -0.24 -0.25 -0.37 0.09 0.59
0.61 0.73 0.6 0.49 -0.21 -0.09 0.41 0.38 0.4 0.67 0.48 0.72 -2.93 -1.51 -1.17 -2.02 -0.04 -1.25 -0.16 -3.41 -0.6 -4.49 -0.99 -0.97 -1.41 1.84 -0.59 -0.61 0.43 0.43 0.05 0.29
0.51 0.24 0.01 -0.49 -0.66 -0.75 -0.58 0.1 0.35 0.56 0.95 1.42 -1.09 -1.11 -2.37 -0.59 -0.84 -0.76 -0.67 -3.23 0.29 -1.92 -1.15 -0.95 -1.18 2.05 -0.17 0.1 0.23 0.26 0.11 0.3
0.39 0.01 -0.06 -0.04 -0.08 -0.23 0.16 0.47 0.55 0.59 0.6 0.67 -0.34 -0.59 -0.18 -0.31 -0.41 -0.76 -0.17 -6.48 -4.92 - -0.17 -0.22 -2.8 1.22 0.92 0.68 -0.36 -0.51 0.43 0.5
0.02 0.04 0.35 0.48 0.58 0.48 0.39 0.75 1.14 1.12 1.11 0.67 -3.36 -4.34 -1.4 -2.31 -0.55 -1.74 -0.16 -2.79 -7.53 -4.09 -0.52 -0.35 -1.52 2.04 0.07 0.3 -0.64 -0.37 -1.09 -1.53
0.35 -0.01 -0.16 0.1 0.04 -0.04 0.03 0.48 0.52 0.63 0.57 0.61 -0.3 -0.38 -0.6 -0.54 -0.44 -1.54 -0.25 -3.81 -0.92 -4.07 -0.35 -0.45 0.53 1.49 0.16 0.18 -0.01 -0.06 -0.04 -0.18
0.24 -0.16 -0.23 -0.19 -0.34 -0.32 -0.25 0.22 0.39 0.55 0.63 0.69 0.23 -0.3 -0.35 0.32 -0.47 -1.03 0.12 -2.33 -1.15 -1.37 -0.04 0.08 -0.84 1.62 -0.28 -0.28 -0.09 -0.15 0.1 0.12
-0.46 -0.14 -0.08 0.12 0.12 0.06 0.45 0.88 0.83 1.02 0.86 0.73 -0.9 -0.78 -0.92 -0.68 -0.83 -0.9 -0.85 -3.61 -1.05 -3.32 -0.55 -0.61 -0.83 1.45 0.69 0.63 -0.33 -0.44 -0.15 -0.13
0.15 -0.21 -0.38 0.0 0.15 -0.37 0.07 0.47 0.71 0.84 0.66 0.65 0.55 -0.58 -0.28 0.58 -0.52 -1.26 0.08 -1.58 -1.54 -3.13 -0.34 -0.35 -1.2 1.53 0.12 0.03 -0.31 -0.32 -0.55 -0.62
0.07 -0.36 -0.14 -0.15 0.03 -0.1 0.26 0.46 0.72 0.75 0.79 0.53 -1.53 -1.75 -2.16 -0.94 0.25 -0.15 -0.29 -8.34 -2.54 -8.53 -0.59 -0.98 -2.31 1.95 0.5 0.4 0.67 0.51 -0.04 -0.13
0.42 0.4 0.09 0.14 -0.16 -0.16 0.18 0.2 0.33 0.47 0.4 0.73 0.06 0.17 -0.14 0.67 -0.73 -1.37 0.15 -2.67 -1.34 -4.01 -0.48 -0.2 -1.32 1.3 0.2 0.58 -0.22 -0.08 -0.67 -0.84
0.4 -0.15 0.1 0.19 -0.16 -0.22 0.23 0.91 0.86 1.11 1.03 0.93 -0.09 -0.02 -1.4 -0.5 -0.86 -0.92 -0.35 -4.21 -1.78 -4.45 -1.35 -1.0 -0.88 1.33 -0.24 -0.37 -0.22 -0.37 0.29 0.22
-0.24 -0.8 -0.29 0.27 0.06 -0.39 0.2 1.33 1.01 1.06 0.75 0.35 0.17 -1.65 -4.42 -0.73 -1.06 -1.77 -0.17 -4.58 -2.38 -5.47 -0.45 -1.09 -0.53 2.44 0.26 0.29 -0.15 -0.38 -1.56 -1.74
0.3 0.35 0.43 0.34 0.07 0.15 0.43 0.3 0.67 0.66 0.48 0.69 -1.09 -1.16 -1.18 -0.79 -0.7 -1.45 0.67 -3.25 -1.49 -0.98 -1.11 -1.44 -1.29 1.56 0.42 0.5 -0.14 -0.24 -0.01 -0.32
0.15 -0.14 0.03 0.21 0.25 0.12 0.26 0.72 0.63 0.66 0.55 0.4 -0.09 -0.5 -0.59 -0.02 -0.51 -0.94 -0.01 -4.1 -2.85 -4.61 0.19 0.24 -0.85 1.46 0.37 0.19 -0.39 -0.44 -0.39 -0.52
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0.45 0.55 0.48 0.51 0.23 0.14 0.13 0.07 0.21 0.34 0.38 0.58 -0.85 -0.78 -0.93 -0.5 -0.7 -1.97 0.34 -2.57 -0.51 -5.59 -0.6 -0.71 -0.08 1.54 0.66 0.69 -0.43 -0.3 -0.55 -0.44
-1.06 -1.66 -1.04 -0.36 -0.21 0.03 0.47 1.44 0.96 1.65 0.77 0.16 -1.2 -3.86 -2.87 -1.66 -1.75 -2.54 -2.07 -5.12 -1.83 -3.32 -1.57 -1.38 0.33 3.22 -0.18 -0.02 -2.07 -2.17 -2.17 -2.88
0.25 -0.63 -0.83 -0.36 -0.38 -0.31 -0.04 0.82 1.13 1.46 1.1 0.81 -0.44 -0.67 -1.35 -0.94 -0.58 -0.68 -0.26 -5.23 -2.93 -5.82 -1.56 -1.58 -1.1 2.53 0.19 -0.05 -0.82 -0.75 -0.95 -1.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.