Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo103099	0.33	0.39	0.19	0.44	0.42	0.3	0.08	0.33	0.15	0.57	0.35	-0.0	0.5	0.45	0.81	0.67	-0.14	-1.32	0.42	-2.68	-4.42	-5.18	0.03	0.14	-1.76	0.32	-0.3	-0.25	-0.3	-0.03	-0.92	-0.86
Smo104901	-0.08	-0.12	-0.14	-0.15	-0.05	-0.07	-0.08	-0.06	-0.16	-0.19	-0.21	-0.27	0.61	0.25	0.35	0.93	-0.15	-0.68	0.64	-	-8.43	-	0.24	0.26	-5.0	1.17	0.82	1.04	0.14	0.22	-0.53	-0.63
Smo105197	0.13	-0.04	-0.11	0.2	0.32	0.39	0.3	0.42	-0.14	0.16	0.1	-0.14	0.5	0.14	0.76	0.82	-0.59	-1.1	0.75	-2.57	-2.25	-	0.08	0.17	-1.99	0.91	0.29	0.42	-0.28	-0.11	-1.25	-0.93
Smo109782	0.21	-0.06	-0.21	-0.05	0.05	-0.11	-0.11	0.28	0.24	0.32	0.32	0.2	0.79	0.5	0.1	0.65	-0.65	-1.36	0.21	-3.33	-3.13	-1.82	-0.18	0.09	-0.67	1.12	0.44	0.17	-0.47	-0.48	-0.12	0.12
Smo118138	0.21	0.3	0.24	0.34	0.44	0.31	0.24	0.46	0.44	0.3	0.43	0.17	-0.29	0.43	0.76	0.24	-0.57	-1.75	0.42	-3.76	-4.68	-2.1	-0.48	-0.38	-2.01	0.73	0.59	0.84	-0.4	-0.23	-1.0	-1.08
Smo125022	0.12	-0.22	-0.34	0.11	0.1	-0.28	0.02	-0.07	0.2	0.29	0.18	0.27	0.84	-0.13	0.34	0.92	-0.52	-1.57	0.03	-	-7.17	-	-0.36	-0.09	-3.89	1.23	0.61	0.56	-0.05	0.01	0.44	0.31
Smo125024	0.13	-0.0	-0.25	0.13	0.18	0.01	-0.01	0.1	0.19	0.26	0.33	0.28	0.71	0.28	0.66	0.74	-0.56	-1.63	-0.14	-2.53	-2.29	-4.27	-0.46	-0.12	-0.88	1.14	0.5	0.59	-0.4	-0.33	-0.11	-0.45
Smo126827	-0.3	-0.22	-0.01	0.11	0.38	0.15	-0.2	0.16	0.25	0.29	0.14	-0.18	0.72	0.11	1.14	1.02	-0.23	-1.23	0.21	-	-	-7.35	-0.01	0.16	-2.7	0.77	0.42	0.27	-0.13	0.01	-0.38	-0.19
Smo132360	0.14	0.05	0.04	0.12	0.11	-0.05	0.12	0.23	0.16	0.2	0.31	0.18	0.21	0.5	0.41	0.34	-0.66	-1.08	-0.31	-1.96	-0.98	-1.5	-0.41	-0.19	-0.33	1.09	0.69	0.85	-0.84	-0.62	-0.41	-0.59
Smo133522	-0.02	-0.28	-0.27	0.17	0.36	-0.32	-0.09	0.08	-0.03	0.1	0.08	-0.03	0.6	0.21	0.35	0.82	-0.68	-1.19	0.52	-6.01	-1.73	-2.34	0.07	0.1	-1.32	0.8	0.71	0.64	-0.05	0.02	-0.11	-0.0
Smo139346	0.12	0.11	0.1	0.24	0.22	0.13	0.2	0.33	0.21	0.2	0.12	0.11	-0.23	0.49	0.28	0.13	-0.39	-0.92	0.2	-4.8	-4.08	-2.82	-0.17	-0.11	-1.12	0.9	0.86	0.85	-0.37	-0.28	-0.02	-0.18
Smo153166	-0.42	-0.3	-0.11	-0.05	0.33	0.15	0.06	0.59	0.22	0.19	-0.02	-0.21	0.42	0.22	1.23	0.34	-0.59	-0.65	0.29	-	-3.82	-3.57	-0.11	0.25	-2.33	1.02	0.72	0.74	-0.25	-0.23	-0.58	-0.6
Smo158876	0.06	-0.07	-0.11	-0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.1	0.04	0.07	-0.04	-0.03	0.72	1.07	0.23	-0.3	-0.26	0.23	-0.2	-1.0	-0.43	-0.13	-0.16	-0.51	0.35	-0.03	0.06	-0.26	-0.14	-0.65	-0.22
Smo168147	0.1	-0.03	-0.03	0.13	0.2	0.27	0.12	0.18	0.17	0.3	0.21	0.1	-0.05	-0.04	0.42	0.11	-0.2	-1.28	0.23	-3.35	-1.43	-3.21	-0.18	-0.07	-0.26	0.91	0.8	0.97	-0.17	-0.06	-0.85	-0.55
Smo173103	-0.44	0.13	0.11	0.43	0.32	0.27	0.32	-0.03	0.21	0.15	0.27	-0.08	0.59	0.49	1.35	0.44	-0.64	-1.74	0.83	-1.75	-3.17	-7.04	0.33	0.51	-1.69	0.04	0.33	0.52	-1.02	-0.44	-1.23	-1.66
Smo173189	-0.07	0.28	0.19	0.27	0.28	0.46	0.08	0.42	0.25	0.23	0.42	0.24	0.42	0.62	0.77	0.9	-0.27	-4.52	-0.24	-6.95	-4.47	-1.44	0.13	0.14	-1.38	0.77	-0.18	-0.22	-0.05	-0.03	-0.84	-0.93
Smo173599	0.07	0.22	0.31	0.32	0.32	0.17	0.28	0.21	0.18	0.18	0.2	-0.02	0.14	0.04	0.44	0.24	-0.33	-0.8	0.14	-1.78	-2.18	-2.96	-0.18	-0.12	-1.15	0.45	0.87	1.0	-0.48	-0.37	-0.46	-0.5
Smo174143	0.16	0.21	-0.34	0.35	0.38	-0.04	0.1	0.28	0.22	0.34	-0.01	-0.01	0.27	0.33	0.75	0.43	-0.27	-0.84	0.31	-4.27	-1.94	-5.51	-0.18	-0.05	-0.63	0.58	0.62	0.08	-0.18	-0.36	-0.01	0.04
Smo180402	0.18	-0.03	-0.09	0.06	0.32	0.18	0.02	0.15	0.09	0.27	0.22	0.03	0.18	0.0	0.68	0.45	-0.31	-0.75	0.22	-1.88	-2.62	-3.34	-0.3	-0.13	-0.63	0.7	0.55	0.74	-0.18	-0.01	-0.21	-0.18
Smo231540	-0.15	-0.11	0.08	0.11	0.03	0.11	0.19	0.2	0.13	0.19	0.2	0.03	0.23	0.69	1.08	0.31	-0.45	-0.46	0.11	-0.19	-1.63	-0.05	-0.15	-0.01	-2.54	0.45	0.08	0.14	-0.47	-0.39	-0.61	-0.58
Smo267388	0.14	0.22	0.3	0.31	0.44	0.4	0.08	0.28	0.38	0.3	0.17	-0.01	0.24	0.34	0.69	0.5	-0.52	-0.86	0.2	-6.54	-7.18	-	-0.11	-0.0	-1.83	0.95	0.43	0.75	-0.26	-0.23	-1.26	-0.94
Smo267866	0.22	0.29	0.23	0.22	0.48	0.08	0.28	0.19	0.33	0.54	0.51	0.12	-0.03	-0.19	0.62	-0.04	-0.57	-1.78	0.11	-1.26	-1.9	-0.33	-0.8	-0.88	-0.56	1.21	0.22	0.45	-0.43	-0.46	-0.63	-0.77
Smo271950	0.01	-0.17	-0.12	0.15	0.2	0.13	0.22	0.48	0.15	0.31	-0.03	-0.01	0.14	0.26	0.34	0.3	-0.4	-1.13	0.29	-2.84	-3.56	-6.33	0.09	0.24	-0.66	0.9	0.66	0.67	-0.15	-0.18	-0.22	-0.11
Smo403447	-0.04	0.28	0.35	0.49	0.57	0.49	0.16	0.25	0.23	0.2	0.08	0.04	0.04	0.13	0.8	0.29	-0.54	-1.6	0.19	-2.7	-1.94	-3.39	-0.36	-0.27	-0.67	0.82	0.71	0.84	-0.25	-0.25	-1.39	-1.8
Smo405204	-0.02	0.23	0.35	0.32	0.35	0.18	0.05	0.11	0.22	0.24	0.19	0.02	0.54	0.24	0.95	0.55	-0.15	-3.59	0.36	-4.6	-3.85	-2.12	-0.07	-0.04	-2.07	1.14	0.23	0.58	-0.26	-0.09	-1.15	-1.31
Smo405526	0.18	0.29	0.25	0.24	0.37	0.34	0.3	0.12	0.11	-0.06	0.06	-0.27	0.3	0.08	0.9	0.79	-0.24	-0.79	0.7	-1.69	-5.18	-4.29	-0.19	-0.2	-3.33	0.79	0.37	0.56	-0.3	-0.15	-0.87	-0.86
Smo405813	-0.6	0.29	0.43	0.66	0.13	0.01	0.86	0.82	1.15	1.19	0.95	0.75	-1.51	-0.71	0.78	-0.77	-0.88	-3.22	-1.7	-2.25	-3.4	-0.14	-2.25	-1.74	-1.06	1.64	-0.14	0.13	-1.37	-1.1	-0.9	-1.09
Smo409192	-0.42	-0.08	0.31	0.53	0.41	0.41	0.36	0.12	0.07	0.0	-0.37	-0.19	-0.08	0.5	1.34	0.66	-0.3	-2.0	-0.08	-4.4	-2.47	-1.0	0.06	0.23	-1.6	-0.36	0.66	1.26	-0.51	-0.06	-1.37	-1.51
Smo410323	-0.15	0.01	0.01	0.07	0.4	0.1	0.08	0.23	0.21	0.19	-0.07	-0.12	0.55	0.25	0.81	0.74	-0.06	-0.46	0.31	-4.78	-1.11	-3.29	-0.06	-0.07	-0.11	0.5	0.3	-0.0	-0.08	-0.11	-0.63	-0.67
Smo411166	0.0	0.24	0.17	0.35	0.4	0.38	0.19	0.43	0.37	0.37	0.29	0.19	0.33	0.14	0.3	0.37	-0.45	-1.17	0.12	-4.5	-4.04	-4.07	-0.39	-0.4	-1.11	0.87	0.69	0.64	-0.35	-0.38	-0.52	-0.28
Smo412612	-0.18	0.32	0.12	0.27	0.1	0.38	0.06	-0.21	0.2	0.2	0.01	-0.03	0.76	0.21	1.32	0.51	-0.12	-0.62	0.05	-2.77	-3.76	-0.78	-0.12	-0.27	-1.15	0.77	-0.03	0.4	-0.42	-0.36	-0.88	-0.86
Smo413327	0.05	0.17	0.24	0.41	0.44	0.37	0.31	0.45	0.3	0.19	0.18	0.2	-0.05	0.14	0.28	0.25	-0.5	-1.36	0.36	-3.19	-3.08	-1.8	-0.31	-0.42	-1.27	0.58	0.72	0.76	-0.3	-0.14	-0.43	-0.33
Smo41818	0.1	0.28	0.45	0.35	0.53	0.35	0.13	0.18	0.38	0.19	0.18	0.14	0.31	0.17	0.71	0.83	-0.5	-2.35	0.92	-	-4.91	-	-0.11	0.09	-3.71	0.54	0.23	0.32	-0.09	-0.01	-1.25	-0.8
Smo419763	0.01	0.2	-0.25	0.24	0.19	0.07	0.12	0.37	0.43	0.35	0.11	0.13	-0.14	0.59	0.87	0.0	-1.3	-2.91	-0.53	-3.13	-2.16	-2.66	-0.85	-0.75	-0.74	1.72	1.38	1.14	-1.33	-1.25	-1.25	-1.34
Smo424664	-0.22	-0.35	0.0	0.04	0.28	0.26	0.23	0.39	0.45	0.16	0.22	0.09	0.34	0.26	1.17	0.61	-0.42	-1.3	0.43	-	-6.41	-2.52	-0.2	-0.12	-4.76	0.97	0.47	0.75	-0.01	-0.04	-1.18	-0.9
Smo427525	-0.01	-0.25	-0.36	0.01	0.17	0.13	-0.04	0.17	0.2	0.0	0.2	-0.02	0.38	0.26	0.76	0.65	-0.23	-0.49	0.5	-2.55	-2.69	-2.86	-0.29	0.05	-1.85	0.97	0.58	0.85	-0.1	-0.01	-0.56	-0.75
Smo438486	0.08	0.26	0.48	0.46	0.43	0.34	0.19	0.08	0.01	-0.15	0.14	-0.21	-0.07	0.23	0.49	0.44	-0.11	-0.5	-0.06	-2.16	-2.02	-0.43	-0.14	-0.2	-2.37	1.05	0.32	0.94	-0.11	-0.05	-1.66	-2.47
Smo438869	-0.08	-0.12	-0.01	-0.05	0.12	0.07	-0.06	0.05	0.2	0.23	0.23	-0.08	0.22	0.28	1.08	0.32	-0.47	-0.4	0.32	-0.18	-1.3	-0.04	-0.47	-0.21	-1.54	0.6	0.33	0.29	-0.48	-0.39	-0.45	-0.49
Smo439324	0.01	-0.06	0.17	0.19	0.27	0.24	0.18	0.07	0.23	0.22	0.24	0.04	0.15	-0.32	0.74	0.36	-0.12	-0.8	0.02	-0.7	-1.29	-0.33	-0.17	-0.26	-1.44	0.74	0.31	0.59	-0.11	-0.02	-0.83	-1.04
Smo440330	0.18	0.32	0.37	0.39	0.39	0.27	0.06	0.15	0.15	0.08	0.17	0.03	-0.02	-0.15	0.48	0.31	-0.13	-0.92	0.22	-4.34	-2.95	-3.12	-0.31	-0.29	-0.65	0.75	0.72	0.83	-0.18	-0.01	-0.54	-0.54
Smo442892	0.15	0.39	0.11	0.38	0.39	0.36	0.12	0.22	0.23	0.19	0.23	0.19	0.37	0.45	0.87	0.33	-0.56	-1.75	0.29	-1.06	-2.91	-1.62	-0.0	0.08	-0.59	0.75	-0.1	0.08	-0.75	-0.47	-0.75	-0.86
Smo444316	0.01	-0.24	-0.22	-0.1	-0.05	-0.09	-0.27	0.12	0.16	0.17	0.22	0.03	0.72	0.48	0.38	0.88	-0.48	-1.21	0.64	-7.56	-3.41	-2.8	0.14	0.35	-1.47	1.15	0.23	0.31	-0.14	-0.02	-0.21	-0.25
Smo445019	0.23	0.31	0.11	0.32	0.34	0.55	0.36	0.16	0.06	0.2	0.0	-0.01	0.02	0.06	0.67	0.46	-0.31	-0.49	0.4	-2.19	-2.04	-1.02	-0.38	-0.35	-0.75	0.48	0.36	0.27	-0.12	-0.18	-0.53	-0.76
Smo78122	0.14	0.23	0.17	0.29	0.39	0.32	0.12	0.22	0.28	0.04	0.01	-0.08	0.01	0.16	0.78	0.24	-0.32	-0.4	0.4	-2.09	-1.5	-3.21	-0.01	0.22	-0.72	0.75	0.23	0.57	-0.18	-0.22	-1.13	-1.11
Smo80662	-0.22	-0.01	0.06	0.29	0.32	0.33	0.37	0.38	0.3	0.38	0.27	-0.1	0.03	-0.11	1.25	0.2	-0.48	-1.1	-0.01	-4.87	-8.25	0.04	0.02	-0.04	-1.07	0.22	0.43	0.46	-0.28	0.0	-0.9	-0.54
Smo81472	0.03	0.12	0.18	0.24	0.38	0.42	0.17	0.4	0.16	0.15	0.12	-0.13	0.26	-0.22	0.5	0.24	-0.34	-1.01	0.17	-3.29	-4.43	-3.47	-0.39	-0.15	-0.84	0.83	0.84	0.89	-0.39	-0.32	-0.32	-0.09
Smo81821	0.48	0.56	0.58	0.4	0.34	-0.08	-0.19	-0.26	0.1	0.17	0.25	0.17	0.36	0.22	0.71	0.5	-0.05	-0.78	0.43	-4.18	-4.47	-2.93	-0.1	-0.22	-1.79	0.84	-0.05	0.2	-0.13	0.03	-0.71	-0.47
Smo84888	-0.06	-0.09	-0.05	-0.04	-0.14	-0.26	-0.16	-0.09	-0.02	-0.04	0.11	-0.08	0.41	0.76	0.34	0.74	-0.22	-0.68	0.58	-3.02	-3.72	-2.29	-0.07	-0.07	-1.36	1.21	0.6	0.71	-0.06	-0.04	-0.39	-0.32
Smo85158	-0.41	-0.4	-0.24	0.01	0.26	0.11	0.23	0.57	0.59	0.52	0.46	0.16	0.24	-0.2	1.34	-0.06	-0.63	-1.15	0.74	-10.06	-6.12	-	0.0	0.24	-3.66	1.01	0.31	0.29	-0.09	-0.07	-0.54	-0.64
Smo87459	0.28	0.29	0.22	0.41	0.52	0.13	0.12	0.33	0.1	0.21	0.09	0.08	0.05	0.12	0.43	0.27	-0.44	-1.15	-0.22	-4.26	-2.94	-4.5	-0.29	-0.25	-1.72	0.94	1.02	0.87	-0.58	-0.49	-0.09	-0.22
Smo90562	-0.21	-0.05	0.19	0.26	0.21	0.16	0.39	0.35	0.18	0.19	0.11	0.04	-0.14	-0.42	0.86	-0.03	-0.39	-1.17	0.11	-2.16	-2.63	-0.71	0.03	0.23	-0.8	0.49	0.64	0.75	-0.4	-0.31	-0.18	-0.01
Smo96534	-0.09	0.07	-0.01	0.13	0.11	-0.05	-0.15	0.04	0.04	0.12	0.06	-0.0	0.62	0.17	-0.05	0.79	-0.67	-0.88	0.55	-1.37	-2.42	-1.95	0.06	0.26	-0.51	1.03	0.52	0.61	-0.4	-0.35	-0.43	-0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.