1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.31 0.0 0.17 0.15 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.06 0.31 0.21 0.0 0.49 0.81 1.0 0.0 0.13 0.22 0.4 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.1 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.06 0.31 0.21 0.0 0.49 0.81 1.0 0.0 0.13 0.22 0.4 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.1 0.06
0.16 0.08 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.07 0.04 0.03 0.05 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.27 0.52 0.15 0.02 0.14 0.09 1.0 0.03
0.16 0.07 0.03 0.01 0.16 0.01 0.0 0.12 0.05 0.01 0.05 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.19 0.08 0.13 1.0 0.13 0.03 0.17 0.1 0.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.51 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.09 0.25
0.12 0.28 0.25 0.07 0.25 0.17 0.0 0.15 0.12 0.16 0.13 0.21 0.11 0.05 0.0 0.24 0.08 0.98 0.04 1.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.12 0.11 0.0 0.0 0.07 0.1 0.07 0.41
0.3 0.27 0.25 0.27 0.29 0.36 0.23 0.19 0.15 0.19 0.25 0.24 0.06 0.09 0.09 0.43 0.07 0.5 0.16 1.0 0.04 0.57 0.22 0.31 0.35 0.12 0.11 0.17 0.16 0.26 0.25 0.17
0.35 0.45 0.5 0.48 0.64 0.55 0.47 0.48 0.42 0.38 0.34 0.29 0.63 0.52 0.2 0.68 0.46 0.35 0.69 0.93 0.63 0.45 0.88 1.0 0.82 0.8 0.65 0.71 0.51 0.53 0.53 0.46
0.33 0.25 0.29 0.3 0.31 0.24 0.33 0.44 0.41 0.47 0.48 0.34 0.2 0.12 0.14 0.3 0.32 0.23 0.54 0.12 0.76 0.25 0.4 0.41 0.46 0.97 0.39 0.47 0.5 0.54 1.0 0.62
0.24 0.43 0.43 0.49 0.47 0.57 0.64 0.34 0.41 0.36 0.31 0.25 0.37 0.1 0.45 0.61 0.73 0.71 0.74 0.86 0.2 0.28 0.63 0.51 0.28 0.49 0.21 0.41 0.78 1.0 0.58 0.34
0.32 0.34 0.34 0.41 0.53 0.35 0.27 0.35 0.4 0.34 0.41 0.39 0.69 0.48 0.29 0.7 0.28 0.46 0.52 1.0 0.71 0.57 0.57 0.67 0.65 0.57 0.52 0.51 0.44 0.34 0.28 0.27
0.07 0.08 0.03 0.1 0.13 0.09 0.03 0.03 0.0 0.03 0.05 0.01 0.02 0.01 0.02 0.1 0.15 0.19 0.22 0.3 0.0 0.0 0.21 0.22 0.09 0.1 0.08 0.05 0.09 0.04 1.0 0.19
0.27 0.3 0.29 0.29 0.32 0.36 0.3 0.28 0.29 0.28 0.27 0.26 0.23 0.07 0.14 0.34 0.51 1.0 0.49 0.9 0.49 0.33 0.46 0.37 0.6 0.47 0.53 0.57 0.64 0.56 0.28 0.24
0.61 0.35 0.18 0.19 0.11 0.13 0.13 0.1 0.1 0.13 0.15 0.31 0.32 0.32 0.55 0.48 0.34 0.42 0.96 1.0 0.83 0.33 0.33 0.42 0.42 0.38 0.19 0.14 0.19 0.19 0.17 0.18
0.42 0.45 0.48 0.48 0.45 0.57 0.42 0.53 0.51 0.55 0.46 0.41 0.53 0.72 0.38 0.66 0.49 0.36 0.65 0.24 0.46 0.25 0.95 0.94 0.82 1.0 0.77 0.62 0.61 0.63 0.75 0.63
0.16 0.1 0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.11 0.13 0.14 0.14 0.13 0.16 0.13 0.06 0.25 0.07 1.0 0.51 0.5 0.35 0.19 0.13 0.17 0.39 0.5 0.16 0.03 0.23 0.14 0.78 0.31
0.23 0.24 0.24 0.24 0.21 0.29 0.25 0.24 0.3 0.29 0.29 0.26 0.34 0.32 0.36 0.41 0.24 0.21 0.32 0.97 1.0 0.8 0.21 0.3 0.5 0.49 0.32 0.35 0.24 0.23 0.21 0.22
0.16 0.16 0.26 0.41 0.42 0.46 0.38 0.49 0.35 0.32 0.24 0.2 0.13 0.01 0.0 0.1 0.4 0.24 0.37 0.1 0.86 0.01 0.53 0.52 0.61 1.0 0.43 0.41 0.63 0.58 0.47 0.45
0.27 0.22 0.36 0.32 0.14 0.21 0.38 0.53 0.22 0.63 0.42 0.18 0.45 0.14 0.08 0.7 0.52 1.0 0.71 0.61 0.16 0.0 0.47 0.63 0.37 0.54 0.62 0.56 0.62 0.53 0.61 0.57
0.43 0.47 0.44 0.47 0.42 0.47 0.46 0.44 0.55 0.58 0.51 0.55 0.88 0.28 0.31 0.71 0.58 0.46 0.68 0.41 0.16 0.13 1.0 0.6 0.19 0.37 0.28 0.38 0.66 0.69 0.66 0.7
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.24 0.07 0.06 0.33 0.4 0.59 0.52 0.85 0.8 0.27 0.37 0.39 1.0 0.03 0.07 0.08 0.6 0.63 0.5 0.52
0.07 0.04 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.05 0.03 0.1 0.27 0.36 0.29 0.47 0.3 0.68 0.1 0.7 0.38 0.33 0.46 0.76 0.12 0.11 0.04 0.48 0.54 0.88 1.0
0.06 0.06 0.05 0.07 0.07 0.08 0.04 0.06 0.04 0.07 0.05 0.08 0.3 0.14 0.14 0.45 0.33 0.49 0.29 1.0 0.46 0.02 0.4 0.36 0.23 0.02 0.06 0.1 0.27 0.25 0.2 0.23
0.03 0.08 0.0 0.13 0.0 0.14 0.2 0.22 0.02 0.11 0.1 0.2 0.27 0.23 0.37 0.16 0.61 0.53 0.38 0.26 0.34 0.0 0.64 0.33 1.0 0.0 0.29 0.0 0.41 0.52 0.33 0.63
0.18 0.2 0.2 0.24 0.16 0.23 0.27 0.31 0.37 0.31 0.3 0.28 0.09 0.04 0.12 0.14 0.47 0.5 0.98 1.0 0.81 0.68 0.52 0.83 0.99 0.14 0.21 0.34 0.66 0.75 0.37 0.27
0.14 0.19 0.13 0.13 0.12 0.12 0.18 0.13 0.14 0.14 0.1 0.11 0.11 0.11 0.34 0.08 0.09 0.06 0.09 0.06 0.14 0.76 0.09 0.11 0.36 0.18 0.44 0.3 0.06 0.06 0.87 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.11 0.06 0.02 0.13 0.09 0.09 0.04 0.13 0.05 0.04 0.09 0.07 0.02 0.0 0.07 0.01 0.01 1.0 0.37 0.65 0.32 0.3 0.02 0.02 0.66 0.18 0.28 0.22 0.01 0.03 0.01 0.01
0.24 0.12 0.21 0.15 0.04 0.14 0.05 0.16 0.15 0.08 0.15 0.15 0.01 0.33 0.56 0.02 0.01 0.03 0.01 1.0 0.49 0.07 0.0 0.01 0.03 0.06 0.04 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0
0.15 0.09 0.11 0.08 0.21 0.4 0.69 0.23 0.21 0.47 0.54 0.11 0.0 0.07 0.04 0.16 0.45 0.0 1.0 0.52 0.0 0.0 0.35 0.31 0.43 0.28 0.0 0.12 0.47 0.39 0.18 0.17
0.32 0.29 0.31 0.26 0.26 0.23 0.37 0.22 0.3 0.32 0.5 0.41 0.1 0.37 0.31 0.19 0.42 0.54 0.47 0.01 0.07 0.21 0.23 0.25 0.28 0.17 0.18 0.19 0.46 0.56 0.99 1.0
0.42 0.38 0.34 0.36 0.28 0.44 0.38 0.48 0.42 0.39 0.4 0.34 0.36 0.58 0.71 0.46 0.22 0.21 0.39 0.95 1.0 0.52 0.29 0.33 0.53 0.43 0.54 0.39 0.26 0.29 0.38 0.4
0.1 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.43 0.07 0.2 0.98 0.0 0.34 1.0 0.26 0.0 0.0 0.22 0.34 0.66 0.0 0.2 0.17 0.0 0.67 0.55 0.07 0.59
0.33 0.34 0.24 0.24 0.26 0.31 0.4 0.22 0.31 0.4 0.44 0.32 0.16 0.39 0.32 0.29 0.55 0.54 0.53 0.19 0.22 0.43 0.31 0.33 0.46 0.17 0.23 0.19 0.4 0.56 0.96 1.0
0.01 0.01 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.25 0.29 0.3 0.31 0.04 0.48 0.0 0.72 0.0 0.66 0.34 0.95 0.94 1.0 0.14 0.39 0.22 0.97 0.32
0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.13 0.17 0.05 0.24 0.0 0.56 0.0 0.57 0.2 0.39 0.03 0.06 0.0 0.24 0.13 1.0 0.19
0.03 0.08 0.0 0.02 0.18 0.0 0.05 0.18 0.03 0.05 0.12 0.1 0.52 0.03 0.12 0.52 0.2 0.81 0.3 0.42 0.56 0.26 0.46 0.3 1.0 0.06 0.14 0.27 0.52 0.45 0.16 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.47 0.98 0.43 1.0 0.38 0.16 0.19 0.02 0.06 0.69 0.84 0.19 0.7 0.1 0.15 0.41 0.32 0.47 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.15 0.18 0.18 0.14 0.12 0.17 0.13 0.09 0.11 0.13 0.16 0.18 0.13 0.19 0.17 0.15 0.33 0.32 0.33 0.2 0.11 0.47 0.11 0.06 0.61 0.16 0.13 0.11 0.41 0.52 1.0 1.0
0.27 0.21 0.14 0.15 0.15 0.16 0.16 0.2 0.22 0.21 0.18 0.18 0.28 0.41 0.1 0.29 0.21 0.31 0.91 0.56 0.38 0.41 0.2 0.25 0.69 0.36 0.26 0.22 0.29 0.32 1.0 0.71
0.24 0.18 0.18 0.11 0.2 0.07 0.09 0.15 0.09 0.07 0.06 0.16 0.04 0.03 0.04 0.11 0.17 0.68 0.18 1.0 0.22 0.54 0.2 0.12 0.44 0.14 0.12 0.11 0.24 0.25 0.09 0.05
0.29 0.2 0.14 0.23 0.25 0.11 0.35 0.18 0.56 0.34 0.3 0.18 0.56 0.17 0.45 0.17 0.54 0.07 0.95 0.0 0.32 0.82 0.37 0.26 0.6 0.41 0.19 0.29 0.56 0.63 0.53 1.0
0.13 0.07 0.06 0.1 0.1 0.07 0.07 0.08 0.1 0.11 0.09 0.12 0.37 0.43 0.21 0.76 0.17 0.4 0.43 1.0 0.72 0.53 0.43 0.81 0.65 0.11 0.06 0.07 0.3 0.33 0.18 0.24
0.17 0.16 0.07 0.17 0.24 0.14 0.11 0.07 0.14 0.16 0.12 0.12 0.3 0.22 0.23 0.39 0.4 0.83 0.32 0.94 0.55 0.29 0.43 0.52 1.0 0.38 0.32 0.16 0.4 0.49 0.27 0.3
0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.06 0.09 0.01 0.11 0.87 0.17 0.7 0.0 0.0 0.83 1.0 0.15 0.01 0.03 0.0 0.07 0.11 0.03 0.1
0.18 0.21 0.12 0.14 0.22 0.25 0.32 0.35 0.16 0.32 0.28 0.26 0.22 0.01 0.06 0.29 0.27 0.02 1.0 0.59 0.45 0.53 0.38 0.57 0.47 0.72 0.31 0.15 0.51 0.52 0.33 0.49
0.28 0.16 0.13 0.21 0.21 0.17 0.16 0.17 0.17 0.34 0.23 0.23 0.46 0.64 0.34 1.0 0.38 0.78 0.68 0.73 0.9 0.65 0.37 0.81 0.9 0.17 0.08 0.08 0.6 0.67 0.38 0.57
0.16 0.14 0.12 0.11 0.1 0.09 0.11 0.09 0.14 0.19 0.13 0.21 0.27 0.59 0.24 0.7 0.52 1.0 0.66 0.54 0.06 0.11 0.45 0.55 0.2 0.23 0.2 0.15 0.58 0.65 0.95 0.59
0.61 0.49 0.46 0.52 0.51 0.46 0.41 0.56 0.68 0.67 0.7 0.7 0.37 0.45 0.3 0.8 0.47 0.55 0.79 0.52 0.43 0.18 0.88 1.0 0.4 0.33 0.22 0.23 0.54 0.66 0.69 0.8
0.39 0.55 0.37 0.52 0.41 0.4 0.49 0.54 0.66 0.75 0.48 0.6 0.54 0.3 0.39 0.71 0.6 0.49 0.97 0.64 0.11 0.26 0.75 0.76 0.21 0.6 0.48 0.41 0.81 0.85 1.0 0.98
0.61 0.25 0.22 0.16 0.18 0.17 0.2 0.21 0.18 0.31 0.35 0.47 0.23 0.73 0.19 0.5 0.21 0.5 0.64 0.74 1.0 0.34 0.19 0.22 0.19 0.15 0.2 0.17 0.35 0.37 0.49 0.44
0.29 0.32 0.27 0.26 0.26 0.27 0.24 0.21 0.21 0.2 0.24 0.21 0.42 0.32 0.13 0.53 0.28 0.58 0.43 1.0 0.91 0.16 0.6 0.57 0.65 0.12 0.12 0.14 0.31 0.28 0.34 0.37
0.21 0.19 0.15 0.15 0.17 0.14 0.12 0.15 0.16 0.16 0.17 0.15 0.17 0.52 0.7 0.31 0.52 0.47 0.66 0.28 0.28 0.21 0.37 0.57 1.0 0.22 0.16 0.14 0.52 0.54 0.83 0.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.3 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.33 1.0 0.32
0.17 0.12 0.15 0.21 0.33 0.15 0.14 0.19 0.13 0.13 0.13 0.13 0.36 0.35 0.53 0.37 0.39 1.0 0.35 0.6 0.15 0.38 0.41 0.36 0.08 0.15 0.25 0.33 0.4 0.35 0.39 0.38
0.16 0.17 0.08 0.19 0.2 0.22 0.15 0.11 0.23 0.12 0.14 0.18 0.37 0.16 0.25 0.42 0.29 0.54 0.43 1.0 0.43 0.03 0.28 0.27 0.68 0.29 0.57 0.4 0.31 0.28 0.29 0.32
0.22 0.06 0.07 0.09 0.09 0.16 0.19 0.31 0.14 0.2 0.23 0.19 0.07 0.19 0.36 0.15 0.14 0.55 0.52 0.14 0.09 0.82 0.12 0.12 0.22 0.1 0.23 0.06 0.21 0.23 0.73 1.0
0.33 0.21 0.15 0.13 0.1 0.12 0.14 0.13 0.14 0.29 0.19 0.2 0.1 0.39 0.11 0.32 0.25 0.16 0.19 0.02 0.52 0.06 0.12 0.08 0.41 0.17 0.09 0.06 0.27 0.23 1.0 0.37
0.46 0.55 0.45 0.55 0.64 0.65 0.48 0.47 0.49 0.48 0.48 0.49 0.4 0.3 0.4 0.5 0.26 0.56 0.43 1.0 0.43 0.66 0.45 0.47 0.67 0.27 0.25 0.28 0.37 0.34 0.39 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)