Heatmap: Cluster_199 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo107406	0.39	0.45	0.37	0.39	0.48	0.57	0.41	0.51	0.53	0.48	0.38	0.33	0.48	0.5	0.66	0.67	0.36	0.23	0.69	0.68	0.6	0.48	0.45	0.49	1.0	0.74	0.9	0.76	0.47	0.48	0.38	0.36
Smo107696	0.55	0.52	0.5	0.55	0.67	0.65	0.53	0.65	0.64	0.68	0.58	0.5	0.8	0.67	1.0	0.81	0.41	0.33	0.71	0.3	0.66	0.11	0.45	0.61	0.89	0.77	0.87	0.76	0.4	0.43	0.39	0.37
Smo111128	0.42	0.36	0.42	0.36	0.44	0.39	0.36	0.43	0.39	0.37	0.35	0.3	0.42	0.39	0.51	0.46	0.24	0.24	0.42	0.58	0.66	0.22	0.34	0.35	0.88	1.0	0.89	0.94	0.29	0.29	0.2	0.21
Smo117647	0.18	0.38	0.26	0.37	0.44	0.46	0.37	0.51	0.62	0.2	0.15	0.21	0.19	0.18	0.78	0.23	0.27	0.12	0.38	0.18	0.59	0.59	0.33	0.3	0.61	1.0	0.82	0.7	0.27	0.32	0.07	0.09
Smo118949	0.16	0.18	0.2	0.22	0.26	0.25	0.3	0.24	0.24	0.22	0.21	0.15	0.17	0.15	0.54	0.24	0.43	0.4	0.3	0.5	0.42	0.07	0.3	0.38	1.0	0.43	0.84	0.91	0.41	0.44	0.17	0.13
Smo124666	0.35	0.44	0.35	0.62	0.55	0.54	0.54	0.4	0.41	0.43	0.38	0.32	0.33	0.27	0.48	0.37	0.42	0.38	0.49	0.32	0.51	0.26	0.37	0.4	1.0	0.76	0.98	0.85	0.3	0.37	0.17	0.19
Smo145922	0.22	0.23	0.28	0.31	0.4	0.4	0.37	0.39	0.34	0.31	0.3	0.26	0.54	0.39	0.68	0.57	0.25	0.21	0.7	0.29	0.25	0.23	0.41	0.56	0.48	1.0	0.68	0.64	0.32	0.35	0.24	0.27
Smo148055	0.55	0.47	0.54	0.55	0.66	0.64	0.68	0.87	0.75	0.66	0.65	0.57	0.45	0.75	0.75	0.43	0.42	0.71	0.51	0.35	0.26	0.11	0.5	0.51	0.54	0.77	1.0	0.9	0.42	0.45	0.32	0.31
Smo166073	0.33	0.27	0.29	0.33	0.34	0.36	0.39	0.46	0.47	0.45	0.41	0.42	0.24	0.46	0.23	0.32	0.18	0.17	0.42	0.3	0.31	0.06	0.21	0.23	1.0	0.54	0.57	0.47	0.28	0.28	0.63	0.87
Smo169243	0.55	0.57	0.59	0.55	0.5	0.51	0.42	0.38	0.33	0.33	0.41	0.4	0.32	0.73	0.77	0.45	0.43	0.25	0.34	0.83	0.42	0.31	0.57	0.6	1.0	0.4	0.46	0.49	0.31	0.34	0.24	0.23
Smo170162	0.31	0.33	0.3	0.36	0.39	0.42	0.38	0.36	0.33	0.33	0.34	0.31	0.56	0.9	0.89	0.64	0.25	0.26	0.52	0.59	0.45	0.09	0.36	0.46	0.96	1.0	0.85	0.77	0.27	0.3	0.24	0.3
Smo187338	0.46	0.43	0.38	0.42	0.41	0.45	0.4	0.46	0.45	0.43	0.41	0.44	0.58	0.53	0.64	0.53	0.27	0.21	0.5	0.5	0.35	0.12	0.36	0.4	0.54	1.0	0.68	0.66	0.3	0.3	0.34	0.4
Smo227218	0.45	0.46	0.43	0.52	0.53	0.58	0.48	0.56	0.49	0.45	0.45	0.38	0.84	0.68	0.99	0.8	0.48	0.38	0.65	0.58	0.26	0.15	0.67	0.8	0.9	0.94	0.93	1.0	0.46	0.49	0.42	0.47
Smo233334	0.14	0.17	0.14	0.22	0.21	0.29	0.19	0.21	0.29	0.14	0.19	0.17	0.21	0.4	0.51	0.39	0.13	0.09	0.36	0.39	0.31	0.37	0.11	0.17	1.0	0.77	0.48	0.51	0.19	0.22	0.09	0.08
Smo2490	0.31	0.33	0.31	0.4	0.5	0.64	0.58	0.63	0.56	0.47	0.37	0.33	0.5	0.38	0.82	0.7	0.36	0.06	0.9	0.22	0.25	0.59	0.57	0.58	0.97	1.0	1.0	0.96	0.43	0.49	0.23	0.28
Smo266933	0.25	0.3	0.38	0.45	0.55	0.54	0.5	0.53	0.4	0.33	0.31	0.24	0.29	0.34	0.19	0.28	0.42	0.25	0.33	0.1	0.32	0.09	0.42	0.37	1.0	0.53	0.69	0.69	0.36	0.36	0.68	0.66
Smo267292	0.57	0.49	0.48	0.59	0.63	0.63	0.61	0.63	0.65	0.63	0.59	0.57	0.42	0.56	0.69	0.5	0.62	0.44	0.59	0.39	0.82	0.29	0.51	0.53	1.0	0.74	1.0	0.95	0.57	0.65	0.39	0.37
Smo269745	0.42	0.54	0.61	0.7	0.62	0.61	0.53	0.52	0.48	0.43	0.43	0.41	0.45	0.35	0.84	0.53	0.35	0.31	0.73	0.47	0.67	0.16	0.5	0.49	1.0	0.86	0.83	0.94	0.42	0.43	0.26	0.18
Smo270362	0.33	0.32	0.35	0.41	0.44	0.47	0.46	0.49	0.46	0.38	0.38	0.33	0.47	0.37	0.77	0.53	0.36	0.3	0.58	0.38	0.53	0.29	0.43	0.48	1.0	0.7	0.69	0.69	0.4	0.45	0.36	0.38
Smo404471	0.27	0.27	0.26	0.3	0.36	0.41	0.45	0.45	0.35	0.35	0.32	0.25	0.69	0.46	0.69	0.48	0.32	0.37	0.59	0.39	0.2	0.07	0.44	0.48	1.0	0.67	0.95	0.93	0.44	0.44	0.31	0.26
Smo406318	0.12	0.29	0.35	0.28	0.07	0.13	0.16	0.24	0.21	0.29	0.68	0.28	0.28	0.84	0.61	0.21	0.1	0.05	0.19	0.1	0.61	0.0	0.07	0.07	0.84	1.0	0.86	0.72	0.06	0.06	0.06	0.03
Smo406352	0.51	0.38	0.45	0.39	0.48	0.56	0.64	0.63	0.73	0.73	0.52	0.68	0.56	0.48	0.94	0.7	0.31	0.33	0.52	0.3	0.58	0.0	0.35	0.45	0.78	1.0	0.65	0.73	0.33	0.41	0.31	0.38
Smo406711	0.25	0.41	0.24	0.2	0.22	0.16	0.12	0.12	0.12	0.16	0.14	0.17	0.17	0.26	0.26	0.19	0.1	0.06	0.19	0.5	0.28	0.02	0.18	0.18	1.0	0.63	0.45	0.54	0.11	0.12	0.07	0.07
Smo407650	0.05	0.01	0.06	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.11	0.02	0.08	0.03	0.12	0.35	0.58	0.13	0.13	0.05	0.14	0.76	0.17	0.69	0.1	0.1	1.0	0.41	0.24	0.26	0.08	0.1	0.06	0.11
Smo409077	0.2	0.24	0.22	0.29	0.44	0.48	0.49	0.46	0.4	0.33	0.28	0.22	0.57	0.44	0.73	0.5	0.18	0.24	0.38	0.14	0.15	0.14	0.41	0.56	0.64	0.3	1.0	0.83	0.26	0.31	0.2	0.19
Smo409901	0.1	0.08	0.12	0.1	0.16	0.1	0.12	0.24	0.14	0.14	0.14	0.18	0.27	0.16	0.36	0.28	0.18	0.07	0.27	0.84	0.36	0.26	0.2	0.28	1.0	0.59	0.37	0.32	0.2	0.2	0.18	0.17
Smo411520	0.26	0.3	0.37	0.4	0.46	0.44	0.45	0.45	0.38	0.44	0.38	0.34	0.37	0.39	0.5	0.38	0.38	0.05	0.32	0.62	0.55	0.11	0.38	0.53	1.0	0.35	0.32	0.31	0.32	0.37	0.28	0.31
Smo411646	0.06	0.03	0.01	0.01	0.05	0.14	0.05	0.07	0.21	0.1	0.07	0.02	0.05	0.02	0.11	0.07	0.04	0.13	0.17	0.66	0.3	0.0	0.09	0.05	1.0	0.36	0.35	0.5	0.14	0.14	0.04	0.04
Smo413900	0.35	0.28	0.25	0.25	0.26	0.35	0.33	0.34	0.34	0.36	0.36	0.35	0.79	0.31	0.47	0.86	0.41	0.35	0.63	0.71	0.37	0.21	0.47	0.46	0.26	1.0	0.55	0.58	0.44	0.43	0.34	0.37
Smo416293	0.18	0.22	0.21	0.27	0.22	0.23	0.25	0.25	0.23	0.29	0.17	0.2	0.16	0.1	0.17	0.21	0.15	0.04	0.29	0.69	0.19	0.23	0.21	0.23	1.0	0.17	0.12	0.15	0.14	0.21	0.13	0.14
Smo417661	0.25	0.22	0.2	0.21	0.21	0.37	0.28	0.29	0.19	0.26	0.21	0.22	0.21	0.11	0.15	0.27	0.19	0.11	0.25	0.4	0.35	0.5	0.2	0.19	1.0	0.5	0.45	0.67	0.17	0.21	0.09	0.1
Smo418432	0.5	0.51	0.55	0.66	0.68	0.6	0.7	0.67	0.7	0.81	0.65	0.56	0.46	0.87	0.87	0.51	0.52	0.42	0.65	0.65	0.55	0.24	0.55	0.62	0.64	0.95	1.0	0.94	0.55	0.52	0.49	0.5
Smo419773	0.22	0.24	0.16	0.27	0.2	0.25	0.27	0.3	0.33	0.34	0.28	0.25	0.56	0.34	0.45	0.56	0.32	0.22	0.45	0.52	0.19	0.14	0.36	0.43	0.61	1.0	0.56	0.55	0.3	0.38	0.37	0.48
Smo419994	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.22	0.07	0.07	0.11	0.32	1.0	0.0	0.92	0.0	0.18	0.63	0.16	0.0	0.0	0.07	0.0	0.2	0.06
Smo421161	0.36	0.39	0.26	0.36	0.56	0.5	0.47	0.7	0.6	0.45	0.58	0.39	0.54	0.25	0.88	0.5	0.33	0.42	0.84	0.27	0.18	0.29	0.47	0.59	1.0	0.8	0.89	0.98	0.4	0.5	0.3	0.32
Smo426311	0.19	0.21	0.19	0.25	0.28	0.25	0.21	0.22	0.21	0.2	0.22	0.19	0.24	0.37	0.39	0.19	0.18	0.2	0.17	0.56	0.37	0.54	0.23	0.25	1.0	0.15	0.48	0.43	0.14	0.16	0.13	0.21
Smo431632	0.1	0.1	0.0	0.06	0.1	0.24	0.27	0.15	0.37	0.16	0.05	0.07	0.26	0.16	0.64	0.26	0.23	0.0	0.57	0.46	0.0	0.0	0.28	0.2	1.0	0.54	0.54	0.75	0.27	0.32	0.22	0.17
Smo431738	0.07	0.0	0.1	0.08	0.0	0.09	0.04	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.69	0.32	0.0	0.11	0.5	0.31	0.59	0.47	0.11	0.04	0.88	0.74	0.39	1.0	0.04	0.07	0.0	0.0
Smo439446	0.37	0.31	0.29	0.38	0.47	0.57	0.67	0.61	0.63	0.57	0.51	0.44	0.26	0.12	0.39	0.27	0.39	0.42	0.77	0.23	0.51	0.18	0.47	0.46	1.0	0.64	0.75	0.89	0.52	0.58	0.85	0.87
Smo440808	0.29	0.35	0.41	0.47	0.48	0.59	0.62	0.73	0.67	0.66	0.63	0.49	0.45	0.51	0.62	0.53	0.3	0.18	0.53	0.38	0.48	0.28	0.42	0.42	1.0	0.87	0.62	0.63	0.34	0.35	0.33	0.31
Smo441115	0.49	0.44	0.45	0.44	0.5	0.44	0.38	0.49	0.46	0.58	0.5	0.54	0.7	0.55	0.79	0.95	0.33	0.21	0.73	0.56	0.81	0.24	0.43	0.52	0.98	1.0	0.77	0.72	0.48	0.49	0.36	0.48
Smo447840	0.54	0.52	0.55	0.56	0.59	0.63	0.66	0.75	0.65	0.62	0.54	0.49	0.53	0.61	0.79	0.57	0.49	0.49	0.62	0.36	0.32	0.23	0.58	0.58	0.68	0.68	0.98	1.0	0.48	0.53	0.49	0.47
Smo447844	0.63	0.62	0.61	0.68	0.67	0.8	0.75	0.78	0.8	0.78	0.76	0.68	0.64	0.67	0.94	0.71	0.52	0.34	0.51	0.49	0.98	0.48	0.74	0.76	0.86	1.0	0.97	0.88	0.51	0.55	0.48	0.46
Smo67414	0.12	0.17	0.26	0.43	0.59	0.54	0.58	0.59	0.59	0.4	0.38	0.23	0.08	0.18	0.14	0.19	0.27	0.27	0.44	0.15	0.38	0.01	0.49	0.45	0.92	1.0	0.75	0.67	0.33	0.36	0.61	0.7
Smo68142	0.3	0.34	0.43	0.37	0.36	0.37	0.44	0.46	0.41	0.44	0.4	0.41	0.59	0.43	0.49	0.57	0.28	0.26	0.42	0.69	0.38	0.11	0.38	0.43	0.62	1.0	0.59	0.56	0.39	0.4	0.37	0.34
Smo75099	0.2	0.18	0.19	0.18	0.18	0.19	0.23	0.25	0.26	0.3	0.27	0.25	0.05	0.07	0.06	0.06	0.14	0.06	0.09	0.93	0.46	0.26	0.09	0.06	1.0	0.22	0.18	0.18	0.15	0.15	0.14	0.14
Smo76713	0.28	0.29	0.32	0.43	0.53	0.52	0.53	0.6	0.57	0.39	0.41	0.31	0.45	0.51	0.78	0.49	0.37	0.33	0.68	0.22	0.41	0.25	0.55	0.61	1.0	0.76	0.97	0.89	0.4	0.46	0.3	0.42
Smo77448	0.27	0.24	0.22	0.36	0.39	0.46	0.54	0.62	0.57	0.45	0.43	0.33	0.24	0.41	0.67	0.4	0.42	0.37	0.82	0.25	0.48	0.62	0.4	0.27	0.83	0.52	0.81	1.0	0.43	0.47	0.41	0.36
Smo78497	0.45	0.38	0.44	0.42	0.47	0.56	0.41	0.48	0.38	0.39	0.3	0.3	0.39	0.34	0.56	0.45	0.24	0.28	0.44	0.51	0.46	0.17	0.31	0.39	0.87	0.8	1.0	0.99	0.26	0.26	0.27	0.29
Smo79987	0.36	0.33	0.33	0.49	0.5	0.47	0.52	0.61	0.57	0.56	0.54	0.48	0.42	0.44	0.67	0.39	0.45	0.31	0.66	0.45	0.76	0.07	0.4	0.42	0.93	1.0	0.74	0.82	0.46	0.47	0.69	0.61
Smo81550	0.41	0.42	0.39	0.5	0.51	0.61	0.5	0.6	0.54	0.51	0.45	0.45	0.5	0.65	0.61	0.58	0.41	0.44	0.57	0.72	0.58	0.39	0.5	0.55	0.93	0.88	1.0	0.84	0.38	0.38	0.4	0.41
Smo85240	0.24	0.33	0.38	0.29	0.43	0.51	0.52	0.66	0.47	0.46	0.22	0.24	0.44	0.44	0.83	0.58	0.34	0.28	0.73	0.35	0.29	0.74	0.42	0.57	0.91	0.98	1.0	0.74	0.39	0.47	0.24	0.33
Smo85367	0.51	0.61	0.49	0.58	0.57	0.56	0.57	0.52	0.47	0.44	0.52	0.49	0.55	0.58	0.63	0.66	0.44	0.27	0.56	0.56	0.61	0.47	0.48	0.53	1.0	0.71	0.51	0.54	0.49	0.49	0.47	0.31
Smo85440	0.32	0.34	0.32	0.35	0.36	0.41	0.39	0.41	0.38	0.34	0.33	0.29	0.45	0.4	0.6	0.49	0.33	0.31	0.55	0.58	0.45	0.42	0.4	0.45	1.0	0.38	0.66	0.6	0.32	0.33	0.37	0.37
Smo85972	0.39	0.43	0.45	0.54	0.54	0.58	0.5	0.58	0.51	0.52	0.5	0.41	0.44	0.47	0.69	0.56	0.35	0.22	0.44	0.46	0.62	0.35	0.44	0.44	1.0	0.72	0.65	0.76	0.4	0.42	0.23	0.21
Smo88955	0.24	0.26	0.26	0.3	0.32	0.31	0.31	0.3	0.33	0.25	0.3	0.25	0.25	0.31	0.72	0.31	0.27	0.41	0.46	0.18	0.23	0.28	0.41	0.39	1.0	0.41	0.77	0.74	0.33	0.37	0.32	0.4
Smo89705	0.28	0.23	0.31	0.35	0.4	0.39	0.44	0.51	0.46	0.45	0.4	0.33	0.25	0.49	0.53	0.23	0.29	0.31	0.31	0.38	0.57	0.18	0.23	0.2	1.0	0.78	0.61	0.59	0.33	0.32	0.34	0.4
Smo97574	0.48	0.5	0.45	0.51	0.55	0.49	0.56	0.48	0.54	0.53	0.49	0.45	0.54	0.75	0.84	0.57	0.42	0.35	0.57	0.69	0.37	0.18	0.43	0.4	1.0	0.82	0.75	0.77	0.39	0.44	0.36	0.43
Smo98486	0.35	0.44	0.35	0.4	0.46	0.61	0.57	0.59	0.34	0.25	0.21	0.22	0.09	0.12	0.12	0.12	0.27	0.29	0.39	0.09	0.27	0.04	0.26	0.24	0.9	0.44	1.0	1.0	0.21	0.23	0.89	0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)