Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.36 0.3 0.37 0.44 -0.39 0.89 0.31 0.29 -0.0 0.05 0.26 -0.07 0.08 0.23 -0.41 0.29 -1.36 -0.8 -0.23 -1.75 1.26 -3.93 -0.95 -0.67 1.67 0.08 -0.21 -0.81 -1.0 -1.02 -0.95 -1.03
0.14 -0.3 -0.49 -0.16 -0.15 -0.18 -0.37 0.03 0.28 0.28 0.26 0.28 0.41 0.45 -0.36 0.23 -0.43 -0.71 0.08 -0.57 0.98 -1.03 -0.17 -0.01 0.86 0.35 -0.49 -0.58 -0.12 -0.03 -0.45 -0.17
-0.22 -0.28 -0.42 -0.21 -0.04 -0.21 -0.0 0.23 0.21 0.36 0.17 0.15 0.29 0.3 0.12 0.23 -0.73 -0.78 0.02 -0.97 0.54 -0.58 -0.25 -0.03 1.23 0.4 -0.27 -0.58 -0.37 -0.22 -0.07 -0.12
0.08 -0.15 -0.26 0.09 -0.19 -0.03 -0.28 0.22 0.14 0.36 0.09 0.16 0.48 0.67 0.28 0.6 -0.87 -1.38 -0.06 -0.93 0.15 -1.91 -0.43 -0.1 1.39 0.84 -0.41 -0.64 -0.51 -0.41 -0.62 -0.65
0.05 -0.23 -0.25 -0.2 -0.26 -0.34 -0.51 -0.11 -0.03 0.02 0.23 0.16 -0.25 -0.68 -1.49 -0.2 -0.84 -0.76 -0.62 0.38 0.31 -0.36 -0.35 -0.25 1.79 1.23 0.56 0.57 -0.8 -0.72 -0.44 -0.38
-0.19 -0.24 -0.49 0.11 0.23 0.3 0.16 0.1 0.24 -0.1 -0.12 -0.19 0.04 0.49 -0.38 0.54 -0.48 -0.07 -0.04 -0.8 -0.02 -2.71 -0.07 0.33 1.92 -0.35 0.1 -0.22 -0.49 -0.49 -0.94 -1.55
-0.14 -0.34 -0.48 -0.17 -0.21 -0.33 -0.26 0.11 0.2 0.34 0.2 0.28 0.54 1.25 0.37 0.43 -0.87 -0.89 0.53 -4.06 -0.49 -5.15 -0.22 -0.01 0.66 0.86 0.04 -0.06 -0.4 -0.38 -0.3 -0.07
0.11 -0.0 -0.06 0.04 -0.27 -0.04 -0.14 0.2 0.26 0.54 0.21 0.44 0.61 0.06 0.54 0.02 -0.84 -1.19 -0.12 -0.63 0.45 -0.77 -0.46 -0.28 1.6 -0.29 -0.48 -0.66 -0.84 -0.89 -0.61 -0.23
0.14 0.49 -0.04 0.2 -0.14 -0.21 -0.59 -0.74 -0.38 -0.55 -0.49 -0.35 0.42 0.55 -0.76 0.25 -0.07 -0.14 0.9 -1.35 0.68 -0.93 -0.45 -0.62 1.27 1.1 -0.01 -0.22 -0.38 -0.2 -1.01 -0.7
-0.2 -0.13 -0.17 0.15 -0.1 -0.01 -0.27 0.08 -0.14 -0.13 -0.08 0.02 0.33 0.51 0.34 0.55 -0.29 -0.97 0.42 -0.92 -0.51 -0.65 0.09 0.12 0.26 0.43 0.27 0.29 -0.22 -0.15 -0.37 0.01
0.0 -0.18 -0.12 -0.1 -0.12 -0.11 -0.1 0.24 0.32 0.43 0.39 0.29 0.22 0.57 0.3 0.11 -1.05 -1.05 -0.6 -0.07 0.88 -1.4 -0.51 -0.39 1.12 0.64 -0.38 -0.29 -0.75 -0.84 -0.35 -0.51
0.24 -0.01 -0.17 -0.02 -0.1 -0.06 -0.15 -0.02 -0.03 0.09 -0.04 0.07 0.26 0.64 0.71 0.61 -0.62 -0.73 0.51 -1.78 0.42 -1.52 0.04 0.23 0.94 -0.15 -0.77 -0.76 -0.44 -0.38 -0.16 -0.06
-0.25 -0.01 0.19 -0.08 -0.09 -0.1 -0.12 -0.12 -0.13 -0.09 -0.16 -0.27 0.42 0.23 -0.36 0.75 -0.67 -0.83 0.34 0.05 0.24 -1.55 -0.21 -0.03 1.73 -0.08 -0.15 -0.11 -0.36 -0.37 -0.65 -0.6
-0.05 -0.2 -0.61 -0.33 -0.32 -0.51 -0.43 0.06 0.11 0.33 0.36 0.37 0.2 0.88 -0.69 0.12 -0.94 -1.37 0.12 -1.36 0.68 -2.21 -0.02 0.08 1.15 1.1 0.29 -0.01 -0.46 -0.5 -0.42 -0.24
0.11 0.07 -0.05 0.03 -0.02 0.13 0.09 0.19 -0.08 -0.05 -0.28 -0.15 0.1 0.54 -0.13 0.49 -0.49 -1.02 0.11 -0.37 0.08 -1.32 -0.26 -0.08 1.69 0.08 -0.03 0.02 -0.4 -0.4 -0.71 -1.23
0.05 0.05 -0.07 0.1 0.08 -0.04 -0.1 0.08 0.09 0.24 0.13 0.16 0.78 0.9 0.36 0.55 -0.68 -0.87 0.02 -1.57 -0.38 -1.17 -0.18 -0.06 1.03 0.11 -0.45 -0.67 -0.55 -0.55 -0.35 -0.18
0.03 0.13 -0.06 0.0 0.1 0.12 -0.04 0.08 0.19 0.29 0.28 0.12 0.38 0.45 -0.47 0.29 -1.04 -1.1 -0.13 -1.41 0.48 -1.73 -0.18 -0.0 0.95 0.57 0.15 0.15 -0.65 -0.59 -0.22 -0.26
-0.1 -0.18 -0.26 -0.03 -0.07 -0.09 -0.09 0.09 0.07 0.08 0.04 0.03 0.32 0.73 0.31 0.45 -0.41 -0.46 0.13 -0.37 -0.21 -1.76 0.15 0.32 0.58 0.42 -0.22 -0.12 -0.24 -0.15 -0.36 -0.32
-0.23 -0.3 -0.46 -0.16 -0.09 -0.14 -0.16 0.1 0.18 0.1 0.03 0.06 -0.09 0.61 0.07 0.24 -0.91 -2.05 -0.16 -1.4 0.21 -2.1 -0.34 -0.2 1.88 1.19 0.33 0.36 -0.8 -0.62 -0.6 -1.04
-1.28 -0.37 -0.1 -0.21 -0.38 -0.7 0.19 0.35 0.29 0.48 0.23 0.09 0.17 0.3 -0.07 0.36 -1.09 -0.46 -0.53 -1.64 0.97 -0.34 -0.53 -0.26 1.26 0.61 -0.24 -0.13 -0.32 -0.37 -0.11 0.16
0.09 -0.08 -0.18 -0.23 -0.05 -0.36 -0.23 0.14 0.26 0.34 0.32 0.38 0.18 -0.1 -0.24 0.32 -0.6 -0.84 0.13 -0.74 0.48 -1.1 -0.28 0.0 1.19 0.43 -0.61 -0.66 -0.36 -0.36 0.05 0.35
-0.07 -0.13 -0.24 -0.0 0.05 -0.01 -0.03 0.24 0.2 0.22 0.2 0.06 0.26 0.06 -0.15 0.26 -0.82 -1.52 0.07 -0.06 0.46 -0.63 -0.31 -0.12 1.4 0.95 -0.33 -0.38 -0.56 -0.6 -0.96 -0.71
-0.01 0.08 -0.13 -0.01 0.03 0.11 -0.0 0.11 -0.02 0.04 -0.19 0.04 0.28 0.26 -0.78 0.62 -0.65 -0.88 0.84 -0.96 0.59 -1.86 -0.35 -0.06 1.1 0.76 -0.17 -0.07 -0.2 -0.26 -0.88 -1.06
0.12 -0.01 -0.22 -0.11 -0.05 0.04 -0.22 0.35 0.21 0.31 0.34 0.28 0.03 0.75 -0.64 0.13 -0.8 -2.08 0.06 -0.94 0.44 -2.51 -0.18 -0.09 0.88 0.73 0.09 -0.25 -0.31 -0.35 -0.11 0.05
0.32 0.05 -0.14 0.12 0.09 -0.06 -0.26 -0.05 0.06 0.09 0.12 0.15 0.45 0.94 0.05 0.73 -0.55 -0.36 0.19 -3.36 -0.24 -1.5 -0.31 -0.11 1.02 0.38 0.05 0.03 -0.42 -0.38 -1.01 -0.78
-0.23 -0.1 -0.04 0.51 0.08 0.22 0.01 0.47 0.43 0.41 0.29 0.22 0.51 -0.25 -1.38 0.08 -0.63 -0.6 -0.36 -1.47 1.05 -4.15 0.03 0.48 1.46 0.19 -1.28 -1.4 -0.58 -0.72 -0.79 -0.14
0.06 0.19 0.07 0.32 0.27 0.28 0.24 0.33 0.3 0.25 0.29 0.21 0.34 -0.08 -0.34 0.39 -0.67 -1.29 0.19 -1.16 0.19 -1.5 -0.0 -0.05 1.0 0.24 -0.01 -0.28 -0.59 -0.45 -0.93 -0.9
0.01 -0.28 -0.32 -0.19 0.01 -0.2 -0.12 0.14 0.18 0.16 0.14 0.02 0.09 0.46 0.09 0.19 -0.76 -0.98 -0.07 0.11 0.55 0.14 -0.25 -0.07 0.88 0.24 0.02 -0.21 -0.51 -0.48 -0.21 -0.14
-0.33 -0.19 -0.49 0.26 0.41 0.47 0.54 0.42 0.52 0.31 0.23 -0.08 -0.8 -0.3 -1.18 -0.73 -0.47 -1.55 0.61 -2.54 0.58 0.74 -0.62 -0.32 1.13 0.08 -0.01 0.66 -0.48 -0.44 -1.07 -0.81
0.04 0.4 0.34 0.15 0.28 0.06 0.08 0.38 0.4 0.44 -0.01 0.3 0.43 -0.4 -0.22 -0.07 -0.4 -1.37 -0.06 -0.1 -0.23 -2.79 0.05 0.05 1.06 0.01 -0.04 -0.19 -0.42 -0.46 -0.65 -0.54
0.05 -0.08 -0.25 0.01 -0.03 0.15 -0.18 0.17 -0.04 -0.0 -0.0 -0.1 0.16 0.78 -0.73 0.4 -0.61 -0.5 0.38 -1.85 -0.07 -4.06 -0.25 -0.23 1.39 0.35 0.44 0.21 -0.48 -0.54 -0.04 -0.04
0.35 -0.04 -0.29 -0.23 -0.75 -0.35 0.01 0.28 0.29 0.59 0.6 0.7 0.11 0.38 -0.95 -0.13 -1.08 -2.1 -0.38 -0.4 1.48 -1.16 -0.55 -0.35 1.36 -0.31 -0.65 -1.0 -0.18 -0.3 -0.3 -0.24
0.25 0.04 -0.47 -0.06 -0.2 -0.12 -0.23 0.06 0.3 0.48 0.23 0.6 0.93 -0.29 -2.33 0.38 -0.59 -1.85 -0.48 -1.78 0.51 -1.77 0.06 0.25 1.47 0.8 -0.24 -0.54 -0.3 -0.34 -0.63 -0.49
-0.16 -0.01 -0.1 -0.08 0.2 -0.18 -0.13 0.08 0.23 0.29 0.43 0.16 0.21 0.27 0.16 -0.02 -1.43 -0.82 -0.5 0.2 0.85 0.17 -0.61 -0.28 0.88 0.63 0.11 0.16 -1.05 -1.01 -0.92 -0.68
0.0 0.02 0.04 0.42 0.28 0.54 0.24 0.22 0.21 0.22 0.24 0.11 -0.18 -0.33 -0.11 0.05 -0.22 -0.86 0.28 -1.76 0.56 -0.66 -0.12 -0.03 0.9 -0.62 -0.37 -0.49 -0.09 -0.1 -0.33 -0.35
0.03 -0.02 -0.21 -0.36 -0.45 -0.47 -0.15 -0.03 0.17 0.58 0.47 0.4 0.27 -0.06 -0.61 0.54 -1.14 -1.41 0.18 -1.94 0.34 -2.99 0.14 0.52 1.81 0.53 -0.46 -0.33 -0.13 0.16 -1.26 -1.5
0.17 -0.03 -0.06 -0.34 -0.3 -0.15 -0.53 -0.23 -0.18 -0.24 -0.11 -0.18 -0.1 0.44 -0.94 0.09 -0.7 -0.57 0.06 -0.32 0.68 -0.84 -0.12 -0.11 1.41 1.08 0.63 0.16 -0.56 -0.48 -0.54 -0.32
0.03 -0.32 -0.32 -0.16 0.15 0.07 -0.15 0.12 0.7 0.33 -0.04 0.37 0.42 -1.1 -0.71 0.5 -0.61 -0.61 0.99 -0.44 1.37 -6.15 0.11 0.3 0.74 -0.41 -1.02 -1.22 -0.17 -0.32 -0.78 -0.34
0.57 -0.4 -0.24 -0.66 -0.4 -0.29 -0.03 -0.18 0.09 0.24 0.3 0.31 -0.48 0.85 -0.43 -0.35 -0.97 -3.73 -0.65 -0.16 1.33 -0.71 0.37 0.6 0.99 -0.3 -0.37 -0.78 0.11 -0.03 -0.2 -0.1
0.35 0.47 0.6 0.45 0.09 0.18 0.09 0.12 0.13 0.34 -0.05 -0.06 -0.09 -0.44 -0.98 0.05 -0.67 -3.8 0.19 -4.35 0.61 -1.76 -0.6 -0.7 1.5 0.8 0.15 0.53 -0.4 -0.32 -1.14 -1.08
0.28 0.15 0.18 -0.06 -0.18 0.08 0.2 0.17 0.19 0.47 0.49 0.33 -0.26 0.76 0.09 0.44 -0.4 -0.85 -0.61 -1.68 0.28 -4.92 -1.2 -1.18 0.9 1.08 -0.04 -0.24 -0.65 -0.56 -0.05 -0.42
-0.41 -1.16 -2.15 -0.53 -0.02 -1.04 -0.81 -0.7 0.15 -0.12 -0.14 0.34 0.94 -0.69 -1.42 0.93 -0.79 -0.12 0.27 0.34 1.47 -1.0 -0.1 0.02 0.89 -0.02 -0.94 -1.23 -0.36 -0.33 0.81 0.92
-0.3 -0.12 -0.27 -0.22 -0.14 -0.15 0.04 0.74 0.4 0.65 0.08 0.44 0.88 0.23 -1.37 1.07 -1.2 -2.75 -0.16 - 0.19 - -0.33 -0.26 1.54 1.15 -0.27 -1.09 -0.18 -0.48 -0.77 -1.31
-0.14 -0.11 -0.03 0.01 -0.17 -0.02 -0.18 0.2 0.29 0.32 0.27 0.12 0.69 0.96 -0.37 0.42 -0.82 -0.83 -0.25 -0.48 -0.13 -1.77 -0.14 0.12 0.65 0.59 -0.02 -0.12 -0.57 -0.53 -0.4 -0.25
-0.53 -0.4 -0.26 -0.37 -0.41 -0.52 0.11 0.13 0.14 0.3 0.25 0.08 0.48 0.48 -0.05 0.17 -1.2 -1.9 -0.97 0.12 1.47 -0.39 -0.91 -0.49 1.37 1.14 0.22 -0.21 -1.17 -1.1 -0.92 -0.88
0.18 0.29 0.44 0.2 0.13 0.23 0.07 0.3 0.21 0.27 0.53 0.3 -0.55 -0.21 -0.55 -0.74 -1.5 -1.4 -0.64 -0.33 1.79 -1.36 -0.98 -0.76 1.63 -0.21 -0.06 -0.38 -1.56 -1.46 -1.16 -0.32
0.07 -0.13 -0.07 -0.22 -0.36 -0.33 -0.1 -0.11 0.4 0.5 0.52 0.33 0.07 0.94 -1.67 -0.39 -1.19 -0.59 -0.04 -0.92 1.11 -2.65 -0.86 -0.7 1.68 0.02 -0.52 -0.56 -0.35 -0.25 -0.24 0.25
0.26 -0.23 -0.18 -0.21 -0.13 0.16 -0.05 -0.24 -0.02 0.15 0.09 -0.0 0.27 0.27 0.36 0.35 -0.46 -0.65 0.41 -0.69 0.64 -1.52 0.21 0.25 1.29 -0.24 -0.81 -0.61 -0.31 -0.39 -0.45 -0.23
0.12 0.21 0.21 0.04 0.32 0.37 -0.09 0.31 0.23 0.29 -0.04 -0.1 -0.15 -0.44 0.21 -0.01 -0.6 -0.94 0.49 0.24 -1.76 -0.73 -0.25 -0.32 1.2 -0.52 0.11 0.06 -0.43 -0.57 -0.03 -0.07
0.16 -0.02 -0.18 0.08 0.11 0.08 0.08 0.17 0.26 0.25 0.13 0.24 -0.15 -0.11 0.02 -0.03 -0.37 -0.34 0.2 -0.55 0.66 -0.94 -0.13 -0.02 0.96 -0.42 -0.34 -0.49 -0.14 -0.27 -0.16 -0.11
0.14 0.17 0.08 0.07 0.0 0.13 0.09 0.37 0.29 0.38 0.3 0.28 0.09 -0.4 -0.52 0.21 -0.67 -0.55 0.03 -0.39 0.67 -0.5 0.05 0.18 0.32 -0.16 -0.82 -0.64 -0.1 -0.13 -0.19 -0.16
-0.19 -0.11 -0.18 0.05 0.04 0.09 0.2 0.37 0.5 0.54 0.49 0.43 -0.06 0.04 -1.13 0.4 -0.53 -0.32 -0.02 -1.01 0.54 -1.26 0.03 0.13 0.97 0.11 -0.54 -0.66 -0.22 -0.26 -0.51 -0.65
-0.1 0.28 0.32 -0.16 0.09 -0.17 -0.19 0.14 0.13 0.3 0.27 -0.04 0.22 0.28 -1.44 0.91 -0.96 -1.12 0.48 -0.41 0.1 -1.33 -0.38 -0.05 0.76 0.47 0.23 0.02 -0.58 -0.52 -0.08 -0.42
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0.05 -0.32 -0.32 -0.19 -0.12 0.01 -0.0 0.38 0.38 0.29 0.25 0.16 0.79 0.62 -1.01 0.54 -0.44 -0.96 0.57 -3.94 -0.2 -3.24 -0.58 -0.71 0.98 -0.19 0.17 0.24 -0.23 -0.24 0.11 0.27
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-0.22 -0.24 -0.33 -0.25 -0.26 -0.23 -0.27 -0.04 0.0 0.21 0.1 0.15 0.67 0.68 -0.24 0.67 -0.52 -1.14 0.66 -0.72 0.62 -2.14 -0.21 -0.24 1.61 0.49 -0.93 -0.77 -0.23 -0.26 -0.83 -0.84
-0.47 -0.76 -0.55 -0.33 -0.66 -0.16 0.28 -0.01 -0.19 -0.06 -0.35 -0.77 0.43 -0.48 -3.44 0.78 -0.54 -0.82 -0.09 -1.0 1.37 -1.17 -2.02 -1.56 1.76 1.59 1.15 0.39 -0.8 -0.72 -0.91 -1.19
0.21 0.26 0.13 0.1 0.17 0.25 0.06 -0.11 -0.03 0.03 -0.27 0.08 0.05 -0.05 -0.22 0.16 -0.51 -0.44 0.14 -0.65 0.91 -1.77 -0.2 -0.14 1.44 -0.64 -0.41 -0.43 -0.41 -0.33 -0.14 -0.16
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.