1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.4 0.39 0.41 0.43 0.24 0.58 0.39 0.39 0.31 0.33 0.38 0.3 0.33 0.37 0.24 0.39 0.12 0.18 0.27 0.09 0.75 0.02 0.16 0.2 1.0 0.33 0.27 0.18 0.16 0.16 0.16 0.15
0.56 0.41 0.36 0.45 0.46 0.45 0.39 0.52 0.62 0.61 0.61 0.61 0.67 0.69 0.4 0.59 0.38 0.31 0.53 0.34 1.0 0.25 0.45 0.5 0.92 0.64 0.36 0.34 0.47 0.5 0.37 0.45
0.37 0.35 0.32 0.37 0.41 0.37 0.42 0.5 0.49 0.54 0.48 0.47 0.52 0.53 0.46 0.5 0.26 0.25 0.43 0.22 0.62 0.29 0.36 0.42 1.0 0.56 0.35 0.29 0.33 0.37 0.41 0.39
0.4 0.34 0.32 0.41 0.34 0.37 0.31 0.45 0.42 0.49 0.41 0.43 0.53 0.61 0.46 0.58 0.21 0.15 0.37 0.2 0.42 0.1 0.28 0.36 1.0 0.69 0.29 0.25 0.27 0.29 0.25 0.24
0.3 0.25 0.24 0.25 0.24 0.23 0.2 0.27 0.28 0.29 0.34 0.32 0.24 0.18 0.1 0.25 0.16 0.17 0.19 0.38 0.36 0.23 0.23 0.24 1.0 0.68 0.43 0.43 0.17 0.18 0.21 0.22
0.23 0.22 0.19 0.29 0.31 0.33 0.3 0.28 0.31 0.25 0.24 0.23 0.27 0.37 0.2 0.39 0.19 0.25 0.26 0.15 0.26 0.04 0.25 0.33 1.0 0.21 0.28 0.23 0.19 0.19 0.14 0.09
0.38 0.33 0.3 0.37 0.36 0.33 0.35 0.45 0.48 0.53 0.48 0.51 0.61 1.0 0.54 0.57 0.23 0.23 0.61 0.03 0.3 0.01 0.36 0.42 0.67 0.76 0.43 0.4 0.32 0.32 0.34 0.4
0.36 0.33 0.32 0.34 0.27 0.32 0.3 0.38 0.4 0.48 0.38 0.45 0.5 0.35 0.48 0.34 0.18 0.15 0.3 0.21 0.45 0.19 0.24 0.27 1.0 0.27 0.24 0.21 0.18 0.18 0.22 0.28
0.46 0.58 0.4 0.48 0.37 0.36 0.28 0.25 0.32 0.28 0.29 0.33 0.55 0.6 0.24 0.49 0.39 0.38 0.77 0.16 0.66 0.22 0.3 0.27 1.0 0.89 0.41 0.36 0.32 0.36 0.21 0.25
0.6 0.63 0.61 0.76 0.64 0.68 0.57 0.72 0.62 0.63 0.65 0.69 0.86 0.98 0.87 1.0 0.56 0.35 0.92 0.36 0.48 0.44 0.73 0.75 0.82 0.92 0.83 0.84 0.59 0.62 0.53 0.69
0.46 0.41 0.42 0.43 0.42 0.42 0.43 0.54 0.57 0.62 0.6 0.56 0.54 0.68 0.56 0.49 0.22 0.22 0.3 0.44 0.84 0.17 0.32 0.35 1.0 0.72 0.35 0.37 0.27 0.26 0.36 0.32
0.62 0.52 0.46 0.51 0.49 0.5 0.47 0.52 0.51 0.55 0.51 0.55 0.62 0.81 0.85 0.79 0.34 0.32 0.74 0.15 0.7 0.18 0.53 0.61 1.0 0.47 0.31 0.31 0.38 0.4 0.47 0.5
0.25 0.3 0.34 0.28 0.28 0.28 0.28 0.28 0.27 0.28 0.27 0.25 0.4 0.35 0.23 0.51 0.19 0.17 0.38 0.31 0.35 0.1 0.26 0.3 1.0 0.28 0.27 0.28 0.24 0.23 0.19 0.2
0.44 0.39 0.3 0.36 0.36 0.32 0.34 0.47 0.49 0.57 0.58 0.58 0.52 0.83 0.28 0.49 0.23 0.18 0.49 0.18 0.72 0.1 0.45 0.48 1.0 0.97 0.55 0.45 0.33 0.32 0.34 0.38
0.33 0.32 0.3 0.32 0.3 0.34 0.33 0.35 0.29 0.3 0.25 0.28 0.33 0.45 0.28 0.43 0.22 0.15 0.33 0.24 0.33 0.12 0.26 0.29 1.0 0.33 0.3 0.31 0.23 0.23 0.19 0.13
0.51 0.51 0.47 0.53 0.52 0.48 0.46 0.52 0.52 0.58 0.54 0.55 0.84 0.92 0.63 0.72 0.31 0.27 0.5 0.17 0.38 0.22 0.43 0.47 1.0 0.53 0.36 0.31 0.34 0.34 0.38 0.43
0.53 0.56 0.5 0.52 0.55 0.56 0.5 0.55 0.59 0.63 0.63 0.56 0.67 0.71 0.37 0.63 0.25 0.24 0.47 0.19 0.72 0.16 0.46 0.52 1.0 0.77 0.57 0.57 0.33 0.34 0.44 0.43
0.56 0.53 0.51 0.59 0.57 0.57 0.57 0.64 0.64 0.64 0.62 0.62 0.75 1.0 0.75 0.83 0.46 0.44 0.66 0.47 0.52 0.18 0.67 0.75 0.9 0.81 0.52 0.56 0.51 0.55 0.47 0.48
0.23 0.22 0.2 0.24 0.26 0.25 0.24 0.29 0.31 0.29 0.28 0.28 0.26 0.42 0.29 0.32 0.14 0.07 0.24 0.1 0.31 0.06 0.21 0.24 1.0 0.62 0.34 0.35 0.16 0.18 0.18 0.13
0.17 0.32 0.39 0.36 0.32 0.26 0.48 0.53 0.51 0.58 0.49 0.45 0.47 0.51 0.4 0.54 0.2 0.3 0.29 0.13 0.82 0.33 0.29 0.35 1.0 0.64 0.35 0.38 0.34 0.32 0.39 0.47
0.46 0.41 0.39 0.37 0.42 0.34 0.37 0.48 0.52 0.55 0.54 0.57 0.49 0.41 0.37 0.55 0.29 0.24 0.48 0.26 0.61 0.2 0.36 0.44 1.0 0.59 0.29 0.28 0.34 0.34 0.45 0.56
0.36 0.35 0.32 0.38 0.39 0.38 0.37 0.45 0.43 0.44 0.43 0.39 0.45 0.39 0.34 0.45 0.21 0.13 0.4 0.36 0.52 0.24 0.3 0.35 1.0 0.73 0.3 0.29 0.26 0.25 0.19 0.23
0.46 0.49 0.43 0.46 0.48 0.5 0.47 0.51 0.46 0.48 0.41 0.48 0.57 0.56 0.27 0.72 0.3 0.25 0.84 0.24 0.7 0.13 0.37 0.45 1.0 0.79 0.42 0.45 0.41 0.39 0.25 0.22
0.59 0.54 0.47 0.5 0.53 0.56 0.47 0.69 0.63 0.67 0.69 0.66 0.55 0.91 0.35 0.59 0.31 0.13 0.57 0.28 0.73 0.1 0.48 0.51 1.0 0.9 0.58 0.46 0.44 0.43 0.5 0.56
0.62 0.51 0.45 0.54 0.53 0.47 0.41 0.48 0.52 0.53 0.54 0.55 0.67 0.95 0.51 0.82 0.34 0.38 0.56 0.05 0.42 0.17 0.4 0.46 1.0 0.64 0.51 0.5 0.37 0.38 0.24 0.29
0.31 0.34 0.35 0.52 0.38 0.42 0.37 0.5 0.49 0.48 0.45 0.42 0.52 0.31 0.14 0.39 0.23 0.24 0.28 0.13 0.75 0.02 0.37 0.51 1.0 0.42 0.15 0.14 0.24 0.22 0.21 0.33
0.52 0.57 0.53 0.63 0.6 0.61 0.59 0.63 0.61 0.6 0.61 0.58 0.63 0.47 0.39 0.66 0.32 0.21 0.57 0.22 0.57 0.18 0.5 0.49 1.0 0.59 0.5 0.41 0.33 0.37 0.26 0.27
0.55 0.45 0.44 0.48 0.55 0.47 0.5 0.6 0.62 0.61 0.6 0.55 0.58 0.75 0.58 0.62 0.32 0.28 0.52 0.59 0.8 0.6 0.46 0.52 1.0 0.65 0.55 0.47 0.38 0.39 0.47 0.5
0.36 0.4 0.32 0.55 0.61 0.63 0.66 0.61 0.66 0.57 0.53 0.43 0.26 0.37 0.2 0.28 0.33 0.16 0.7 0.08 0.68 0.76 0.3 0.37 1.0 0.48 0.45 0.72 0.33 0.34 0.22 0.26
0.5 0.63 0.61 0.53 0.58 0.5 0.51 0.62 0.63 0.65 0.48 0.59 0.65 0.36 0.41 0.46 0.36 0.19 0.46 0.45 0.41 0.07 0.5 0.5 1.0 0.48 0.47 0.42 0.36 0.35 0.31 0.33
0.39 0.36 0.32 0.38 0.37 0.42 0.34 0.43 0.37 0.38 0.38 0.36 0.43 0.66 0.23 0.5 0.25 0.27 0.49 0.11 0.36 0.02 0.32 0.32 1.0 0.48 0.52 0.44 0.27 0.26 0.37 0.37
0.46 0.35 0.29 0.31 0.21 0.28 0.36 0.44 0.44 0.54 0.55 0.58 0.39 0.47 0.19 0.33 0.17 0.08 0.28 0.27 1.0 0.16 0.24 0.28 0.92 0.29 0.23 0.18 0.32 0.29 0.29 0.3
0.43 0.37 0.26 0.35 0.31 0.33 0.31 0.38 0.45 0.5 0.43 0.55 0.69 0.3 0.07 0.47 0.24 0.1 0.26 0.11 0.51 0.11 0.38 0.43 1.0 0.63 0.31 0.25 0.29 0.29 0.23 0.26
0.49 0.54 0.51 0.51 0.62 0.48 0.5 0.57 0.64 0.66 0.73 0.61 0.63 0.65 0.61 0.53 0.2 0.31 0.38 0.62 0.98 0.61 0.35 0.45 1.0 0.84 0.59 0.61 0.26 0.27 0.29 0.34
0.54 0.54 0.55 0.72 0.65 0.78 0.64 0.63 0.62 0.63 0.63 0.58 0.47 0.43 0.5 0.56 0.46 0.3 0.65 0.16 0.8 0.34 0.5 0.53 1.0 0.35 0.41 0.38 0.5 0.5 0.43 0.42
0.29 0.28 0.25 0.22 0.21 0.21 0.26 0.28 0.32 0.43 0.39 0.38 0.35 0.27 0.19 0.42 0.13 0.11 0.32 0.07 0.36 0.04 0.32 0.41 1.0 0.41 0.21 0.23 0.26 0.32 0.12 0.1
0.42 0.37 0.36 0.3 0.3 0.34 0.26 0.32 0.33 0.32 0.35 0.33 0.35 0.51 0.2 0.4 0.23 0.25 0.39 0.3 0.6 0.21 0.35 0.35 1.0 0.8 0.58 0.42 0.25 0.27 0.26 0.3
0.39 0.31 0.31 0.34 0.43 0.4 0.35 0.42 0.63 0.49 0.38 0.5 0.52 0.18 0.24 0.55 0.25 0.25 0.76 0.29 1.0 0.01 0.42 0.48 0.65 0.29 0.19 0.17 0.34 0.31 0.22 0.31
0.59 0.3 0.34 0.25 0.3 0.33 0.39 0.35 0.42 0.47 0.49 0.49 0.29 0.72 0.29 0.31 0.2 0.03 0.25 0.36 1.0 0.24 0.51 0.6 0.79 0.32 0.31 0.23 0.43 0.39 0.35 0.37
0.45 0.49 0.53 0.48 0.38 0.4 0.38 0.38 0.39 0.45 0.34 0.34 0.33 0.26 0.18 0.37 0.22 0.03 0.4 0.02 0.54 0.1 0.23 0.22 1.0 0.61 0.39 0.51 0.27 0.28 0.16 0.17
0.57 0.52 0.53 0.45 0.41 0.5 0.54 0.53 0.54 0.65 0.66 0.59 0.39 0.8 0.5 0.64 0.36 0.26 0.31 0.15 0.57 0.02 0.2 0.21 0.88 1.0 0.46 0.4 0.3 0.32 0.46 0.35
0.27 0.16 0.08 0.25 0.36 0.17 0.21 0.22 0.4 0.33 0.33 0.46 0.69 0.22 0.13 0.69 0.21 0.33 0.43 0.46 1.0 0.18 0.34 0.37 0.67 0.35 0.19 0.15 0.28 0.29 0.63 0.68
0.28 0.32 0.28 0.29 0.31 0.31 0.35 0.58 0.45 0.54 0.36 0.47 0.63 0.4 0.13 0.72 0.15 0.05 0.31 0.0 0.39 0.0 0.27 0.29 1.0 0.76 0.29 0.16 0.3 0.25 0.2 0.14
0.46 0.48 0.5 0.52 0.45 0.51 0.45 0.59 0.63 0.64 0.62 0.56 0.83 1.0 0.4 0.68 0.29 0.29 0.43 0.37 0.47 0.15 0.46 0.56 0.81 0.77 0.51 0.47 0.34 0.36 0.39 0.43
0.25 0.27 0.3 0.28 0.27 0.25 0.39 0.39 0.4 0.45 0.43 0.38 0.5 0.5 0.35 0.41 0.16 0.1 0.18 0.39 1.0 0.28 0.19 0.26 0.94 0.8 0.42 0.31 0.16 0.17 0.19 0.2
0.33 0.35 0.39 0.33 0.32 0.34 0.3 0.36 0.34 0.35 0.42 0.36 0.2 0.25 0.2 0.17 0.1 0.11 0.19 0.23 1.0 0.11 0.15 0.17 0.9 0.25 0.28 0.22 0.1 0.11 0.13 0.23
0.33 0.29 0.3 0.27 0.24 0.25 0.29 0.29 0.41 0.44 0.45 0.39 0.33 0.6 0.1 0.24 0.14 0.21 0.3 0.16 0.67 0.05 0.17 0.19 1.0 0.32 0.22 0.21 0.24 0.26 0.26 0.37
0.49 0.35 0.36 0.35 0.37 0.46 0.4 0.35 0.4 0.46 0.43 0.41 0.49 0.5 0.53 0.52 0.3 0.26 0.55 0.25 0.64 0.14 0.47 0.49 1.0 0.35 0.23 0.27 0.33 0.31 0.3 0.35
0.47 0.5 0.5 0.45 0.54 0.57 0.41 0.54 0.51 0.54 0.43 0.41 0.39 0.32 0.51 0.43 0.29 0.23 0.61 0.52 0.13 0.26 0.37 0.35 1.0 0.3 0.47 0.46 0.32 0.29 0.43 0.42
0.57 0.5 0.45 0.54 0.55 0.54 0.54 0.58 0.61 0.61 0.56 0.61 0.46 0.48 0.52 0.5 0.4 0.41 0.59 0.35 0.81 0.27 0.47 0.5 1.0 0.38 0.4 0.36 0.46 0.42 0.46 0.48
0.69 0.71 0.67 0.66 0.63 0.69 0.67 0.81 0.77 0.82 0.77 0.77 0.67 0.48 0.44 0.73 0.4 0.43 0.64 0.48 1.0 0.44 0.65 0.71 0.79 0.56 0.35 0.4 0.59 0.57 0.55 0.56
0.45 0.47 0.45 0.53 0.53 0.54 0.58 0.66 0.72 0.74 0.72 0.69 0.49 0.52 0.23 0.67 0.35 0.41 0.5 0.25 0.74 0.21 0.52 0.56 1.0 0.55 0.35 0.32 0.44 0.43 0.36 0.32
0.5 0.65 0.66 0.48 0.57 0.47 0.47 0.58 0.58 0.65 0.64 0.52 0.62 0.64 0.2 1.0 0.27 0.25 0.74 0.4 0.57 0.21 0.41 0.51 0.9 0.74 0.62 0.54 0.36 0.37 0.5 0.4
0.32 0.29 0.3 0.27 0.26 0.3 0.31 0.27 0.35 0.39 0.31 0.33 0.2 0.24 0.32 0.16 0.17 0.19 0.16 0.31 0.75 0.01 0.17 0.19 1.0 0.22 0.18 0.2 0.17 0.15 0.12 0.12
0.52 0.41 0.41 0.44 0.47 0.51 0.51 0.66 0.66 0.62 0.6 0.57 0.87 0.78 0.25 0.74 0.37 0.26 0.75 0.03 0.44 0.05 0.34 0.31 1.0 0.45 0.57 0.6 0.43 0.43 0.55 0.61
0.44 0.69 0.74 0.64 0.63 0.67 0.6 0.54 0.58 0.58 0.54 0.47 0.55 0.3 0.12 0.55 0.32 0.24 0.28 0.06 1.0 0.02 0.52 0.45 0.96 0.36 0.3 0.26 0.24 0.21 0.36 0.33
0.28 0.28 0.26 0.28 0.27 0.28 0.27 0.32 0.33 0.38 0.35 0.36 0.52 0.53 0.28 0.52 0.23 0.15 0.52 0.2 0.5 0.07 0.28 0.28 1.0 0.46 0.17 0.19 0.28 0.27 0.18 0.18
0.21 0.17 0.2 0.24 0.19 0.26 0.36 0.29 0.26 0.28 0.23 0.17 0.4 0.21 0.03 0.51 0.2 0.17 0.28 0.15 0.76 0.13 0.07 0.1 1.0 0.89 0.65 0.39 0.17 0.18 0.16 0.13
0.43 0.44 0.4 0.39 0.41 0.44 0.38 0.34 0.36 0.38 0.31 0.39 0.38 0.36 0.32 0.41 0.26 0.27 0.4 0.23 0.69 0.11 0.32 0.33 1.0 0.24 0.28 0.27 0.28 0.29 0.33 0.33
0.47 0.48 0.42 0.48 0.5 0.47 0.43 0.45 0.59 0.63 0.59 0.57 0.62 0.45 0.48 0.59 0.34 0.39 0.5 0.61 1.0 0.13 0.43 0.49 0.85 0.51 0.35 0.35 0.42 0.41 0.51 0.64
0.39 0.38 0.36 0.4 0.36 0.36 0.3 0.34 0.44 0.53 0.41 0.41 0.65 0.34 0.29 0.56 0.25 0.11 0.28 0.1 1.0 0.29 0.43 0.48 0.47 0.37 0.14 0.16 0.34 0.36 0.21 0.25
0.18 0.28 0.28 0.25 0.3 0.22 0.22 0.21 0.21 0.26 0.23 0.2 0.41 0.17 0.06 0.2 0.12 0.05 0.14 0.05 0.69 0.01 0.38 0.53 1.0 0.19 0.28 0.28 0.13 0.16 0.09 0.07
0.28 0.29 0.31 0.34 0.3 0.27 0.3 0.37 0.46 0.5 0.43 0.46 0.34 0.25 0.06 0.26 0.08 0.11 0.38 0.09 0.62 0.04 0.37 0.61 1.0 0.24 0.12 0.06 0.17 0.16 0.19 0.27
0.44 0.47 0.53 0.39 0.33 0.47 0.48 0.54 0.74 0.96 0.84 0.69 0.04 0.6 0.04 0.13 0.1 0.34 0.43 0.14 0.74 0.0 0.31 0.63 1.0 0.6 0.43 0.23 0.24 0.24 0.29 0.16
0.34 0.32 0.29 0.29 0.27 0.33 0.29 0.32 0.35 0.44 0.38 0.39 0.47 0.42 0.46 0.39 0.19 0.17 0.24 0.27 1.0 0.15 0.22 0.26 0.78 0.25 0.18 0.19 0.2 0.23 0.14 0.15
0.68 0.65 0.57 0.61 0.51 0.52 0.47 0.51 0.6 0.61 0.61 0.68 0.82 1.0 0.81 0.85 0.51 0.42 0.75 0.13 0.34 0.42 0.53 0.56 0.95 0.38 0.35 0.38 0.54 0.56 0.44 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)