1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.65 0.59 0.45 0.69 0.46 0.61 0.27 0.56 0.83 0.78 0.71 0.69 0.0 0.0 0.0 0.02 0.18 0.3 0.52 0.0 0.04 0.08 0.11 0.07 0.25 1.0 0.73 0.46 0.19 0.12 0.4 0.25
0.58 0.53 0.38 0.35 0.26 0.26 0.27 0.31 0.25 0.37 0.3 0.35 0.19 1.0 0.47 0.59 0.41 0.06 0.62 0.01 0.01 0.0 0.41 0.36 0.16 0.35 0.34 0.42 0.43 0.46 0.6 0.27
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.27 0.14 0.07 0.09 0.11 0.11 0.15 0.16 0.15 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.2 0.26 0.0 0.0 0.0 1.0 0.34 0.17 0.12 0.0 0.01 0.81 0.38 0.68 0.15
0.0 0.01 0.28 0.2 0.06 0.27 0.27 0.0 0.39 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.04 0.59 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.01 0.28 0.2 0.06 0.27 0.27 0.0 0.39 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.04 0.59 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.01 0.28 0.2 0.06 0.27 0.27 0.0 0.39 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.04 0.59 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.01 0.28 0.2 0.06 0.27 0.27 0.0 0.39 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.04 0.59 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.01 0.28 0.2 0.06 0.27 0.27 0.0 0.39 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.04 0.59 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.18 0.33 0.54 0.3 0.23 0.29 1.0 0.51 0.18 0.32 0.4 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.61 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.28 0.27 0.19 0.09 0.22 0.19 0.39 0.35 0.41 0.33 0.29 0.09 0.07 0.0 0.15 0.16 0.19 0.26 0.13 0.29 0.0 0.31 0.59 0.96 1.0 0.25 0.27 0.16 0.16 0.23 0.14
0.56 0.58 0.62 0.58 0.5 0.58 0.5 0.55 0.6 0.56 0.57 0.5 0.08 0.19 0.46 0.15 0.79 0.47 0.86 0.22 0.13 0.31 0.89 0.66 0.7 1.0 0.61 0.59 0.96 0.9 0.75 0.57
0.5 0.37 0.26 0.2 0.21 0.18 0.16 0.31 0.34 0.45 0.49 0.52 0.56 0.45 0.22 0.33 0.32 0.31 0.6 0.03 0.19 0.08 0.32 0.34 0.1 1.0 0.24 0.13 0.49 0.44 0.49 0.7
0.18 0.13 0.25 0.44 0.68 0.53 0.24 0.12 0.22 0.2 0.16 0.17 0.08 0.11 0.1 0.38 0.17 0.18 1.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.08 0.09 0.26 0.06 0.06 0.14 0.11 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 0.31 0.37 0.47 0.5 0.41 0.6 0.78 0.58 0.87 0.64 0.5 0.36 0.58 0.29 0.34 0.46 0.21 0.81 0.02 0.24 0.02 0.48 0.41 0.35 0.43 0.26 0.3 0.66 0.63 1.0 0.59
0.44 0.5 0.51 0.54 0.57 0.51 0.46 0.44 0.53 0.5 0.48 0.46 0.11 0.05 0.09 0.35 0.36 0.22 0.91 0.18 0.13 0.02 0.99 1.0 0.4 1.0 0.25 0.32 0.38 0.32 0.28 0.19
0.06 0.07 0.02 0.02 0.04 0.04 0.01 0.07 0.02 0.01 0.05 0.03 0.03 0.37 0.02 0.04 0.22 0.46 0.2 0.61 0.6 0.0 0.26 0.2 1.0 0.16 0.14 0.01 0.18 0.09 0.14 0.07
0.28 0.45 0.68 0.68 0.58 0.46 0.99 0.69 0.54 0.58 0.34 0.27 0.17 0.55 0.13 0.42 0.72 0.26 0.18 0.03 0.21 0.0 0.59 0.52 1.0 0.63 0.41 0.39 0.39 0.31 0.98 0.54
0.38 0.46 0.63 0.63 0.49 0.43 1.0 0.79 0.56 0.62 0.44 0.4 0.06 0.75 0.17 0.41 0.69 0.47 0.2 0.01 0.25 0.0 0.42 0.3 0.43 0.66 0.26 0.36 0.45 0.37 0.9 0.51
0.19 0.17 0.14 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.08 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.64 0.46 0.24 0.0
0.75 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.66
0.03 0.1 0.1 0.25 0.27 0.16 0.19 0.3 0.01 0.05 0.02 0.04 0.1 0.09 0.4 0.35 0.12 0.02 0.09 0.13 0.0 0.0 0.24 0.61 0.46 1.0 0.27 0.09 0.2 0.11 0.07 0.04
0.19 0.48 0.09 0.08 0.07 0.01 0.01 0.0 0.14 0.02 0.0 0.05 0.33 1.0 0.44 0.77 0.16 0.02 0.18 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.06 0.12 0.0 0.0 0.04 0.08 0.33 0.04
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.13 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.72 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.1 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.22 0.12 0.0 0.15 0.47 0.0 0.0 0.42 0.0 0.82 0.0 0.34 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 1.0 0.0 0.28 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.45 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.63 1.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.15
0.5 0.45 0.42 0.32 0.26 0.25 0.5 0.46 0.54 0.91 1.0 0.8 0.01 0.06 0.01 0.12 0.35 0.5 0.67 0.31 0.02 0.0 0.2 0.13 0.01 0.3 0.15 0.1 0.62 0.6 0.83 0.97
0.21 0.42 0.15 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.15 0.0 0.3 0.2 0.0 0.17 0.23 0.08 0.0 0.0 0.76 0.16 0.41 0.0 0.53 0.0 1.0 0.07 0.16 0.16 0.07
0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.46 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.33 0.34 0.3 0.29 0.28 0.35 0.35 0.41 0.46 0.42 0.36 0.23 0.28 0.11 0.51 0.4 0.33 0.39 0.12 0.11 0.05 0.37 0.34 0.09 0.37 0.25 0.22 0.42 0.48 1.0 0.66
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.02 0.03 0.08 0.0 0.02 0.03 0.22 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.08 0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 1.0 0.12 0.05 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.47 0.81 1.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.12 0.06 0.0 0.02 0.08 0.01 0.11 0.01 0.02 0.12 0.17 0.06 1.0 0.06 0.03 0.01 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.28 0.09 0.0 0.04 0.01 0.05 0.05
0.18 0.12 0.06 0.0 0.02 0.08 0.01 0.11 0.01 0.02 0.12 0.17 0.06 1.0 0.06 0.03 0.01 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.28 0.09 0.0 0.04 0.01 0.05 0.05
0.19 0.22 0.35 0.28 0.06 0.25 0.21 0.05 0.19 0.14 0.09 0.18 0.01 0.48 0.01 0.06 0.22 0.88 0.36 0.0 0.29 0.02 0.23 0.14 0.55 0.43 0.16 0.11 0.83 0.47 1.0 0.34
1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.22 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0
0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0
0.67 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.19 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.06 0.1 0.61 0.23 0.7 0.39 0.0 0.0 0.06 0.0
0.19 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.1 0.08 0.49 0.34 0.62 1.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.08
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.04 0.03 0.04 0.06 0.04 0.02 0.07 0.08 0.19 0.08 0.16 0.18 0.05 0.04 0.31 0.26 0.79 0.37 0.24 0.18 0.02 0.19 0.35 1.0 0.17 0.06 0.11 0.53 0.39 0.33 0.27
0.33 0.23 0.25 0.24 0.24 0.23 0.2 0.26 0.31 0.33 0.4 0.39 0.4 0.49 0.57 0.48 0.27 0.07 0.5 0.18 0.08 0.01 0.32 0.33 0.35 1.0 0.57 0.52 0.23 0.25 0.36 0.46
0.42 0.47 0.52 0.44 0.4 0.32 0.72 0.61 0.45 0.5 0.31 0.29 0.05 0.07 0.01 0.11 0.42 0.26 0.18 0.0 0.11 0.0 0.47 0.49 0.66 0.86 0.32 0.34 0.4 0.34 1.0 0.53
0.3 0.24 0.13 0.09 0.12 0.1 0.09 0.09 0.05 0.12 0.08 0.07 0.72 0.83 0.04 0.93 0.11 0.33 0.48 0.0 0.38 0.0 0.23 0.23 0.41 0.59 1.0 0.32 0.36 0.24 0.67 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.75 0.0 0.8 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.28 0.21 0.3 0.32 0.38 0.42 0.43 0.5 0.54 0.41 0.32 0.02 0.04 0.09 0.1 0.21 0.05 0.14 1.0 0.94 0.02 0.15 0.12 0.63 0.56 0.45 0.45 0.17 0.16 0.19 0.19
0.48 0.36 0.4 0.46 0.4 0.4 0.56 0.67 0.74 0.73 0.75 0.66 0.5 0.47 0.01 0.32 0.5 0.35 0.48 0.23 1.0 0.69 0.21 0.14 0.34 0.95 0.35 0.33 0.58 0.57 0.58 0.57
0.52 0.41 0.4 0.46 0.44 0.54 0.63 0.56 0.59 0.76 0.6 0.47 0.32 0.46 0.36 0.4 0.38 0.45 1.0 0.32 0.58 0.49 0.44 0.65 0.38 0.94 0.56 0.47 0.39 0.36 0.46 0.33
0.06 0.07 0.0 0.05 0.01 0.04 0.04 0.03 0.13 0.06 0.06 0.01 0.09 1.0 0.09 0.14 0.05 0.24 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.12 0.09 0.08 0.0 0.13 0.06 0.05 0.02
0.28 0.53 0.33 0.35 0.44 0.43 0.35 0.63 0.57 0.24 0.71 0.35 0.45 0.1 0.09 0.32 0.29 0.51 1.0 0.68 0.68 0.03 0.24 0.38 0.29 0.68 0.75 0.27 0.52 0.39 0.71 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)