1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.1 0.01 0.01 0.04 0.08 0.06 0.0 0.02 0.07 0.01 0.0 0.01 0.03 0.04 0.05 0.0 0.01 0.03 0.0 0.12 0.04 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.02 0.01 0.04
0.17 0.2 0.19 0.23 0.3 0.21 0.35 0.43 0.35 0.32 0.27 0.24 0.34 0.12 0.06 0.62 0.23 0.37 1.0 0.0 0.03 0.88 0.43 0.38 0.29 0.32 0.38 0.39 0.36 0.51 0.3 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 0.27 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.3 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.06 0.07 0.1 0.13 0.25 0.37 0.32 0.27 0.18 0.09 0.09 0.02 0.01 0.11 0.05 0.18 0.22 0.11 0.0 0.02 1.0 0.12 0.07 0.1 0.04 0.25 0.3 0.2 0.18 0.11 0.04
0.1 0.0 0.0 0.09 0.16 0.0 0.14 0.26 0.35 0.53 0.29 0.04 0.17 0.0 0.21 0.5 0.16 0.27 1.0 0.62 0.0 0.69 0.11 0.08 0.72 0.25 0.81 0.92 0.23 0.39 0.08 0.0
0.03 0.0 0.01 0.04 0.04 0.19 0.61 0.4 0.27 0.03 0.0 0.0 0.05 0.01 0.18 0.03 0.1 0.35 0.81 0.0 0.0 1.0 0.03 0.02 0.35 0.02 0.6 0.0 0.1 0.16 0.02 0.0
0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.13 0.02 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.1 0.38 0.04 0.0 0.27 1.0 0.06 0.01 0.48 0.0 0.05 0.34 0.13 0.14 0.11 0.09
0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.13 0.0 0.1 0.08 0.07 0.07 0.13 0.16 0.04 0.18 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.2 0.4 0.04 0.0 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.0 0.06 0.07 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.1 0.07 0.0 0.08 0.46 0.06 0.05 0.03 0.03 0.21 0.14 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.15 0.19 0.46 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.05 0.11 0.02
0.02 0.03 0.02 0.05 0.0 0.06 0.05 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.2 0.85 0.0 0.43 1.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0
0.08 0.03 0.04 0.04 0.06 0.11 0.14 0.15 0.18 0.23 0.19 0.13 0.09 0.06 0.09 0.11 0.1 0.08 0.26 0.06 0.03 1.0 0.12 0.13 0.26 0.2 0.17 0.09 0.11 0.13 0.28 0.32
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.19 0.0 0.02 0.0 0.12 0.09 0.0 0.19 0.06 0.03 0.1 0.39 0.0 0.07 1.0 0.03 0.06 0.0 0.05 0.26 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0
0.04 0.05 0.07 0.06 0.04 0.06 0.05 0.09 0.09 0.05 0.14 0.08 0.07 0.07 0.1 0.08 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.35 0.22 0.26 0.1 0.07 0.09 0.04 0.05
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.01 0.05 0.05 0.07 0.08 0.08 0.17 0.05 0.08 0.08 0.21 0.16 0.23 0.15 0.06 0.02 0.52 0.02 0.03 1.0 0.01 0.04 0.55 0.12 0.11 0.24 0.06 0.09 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.13 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.11 0.1 0.12 0.13 0.05 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.04 0.01 0.57 0.0 0.03 1.0 0.02 0.01 0.36 0.16 0.23 0.19 0.04 0.05 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.04 0.3 0.0 0.06 0.11 0.04 0.09 0.0 0.06 0.06 0.11 0.2 0.0 0.13 0.07 0.17 1.0 0.06 0.09 0.52 0.36 0.26 0.16 0.25 0.23 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.22 0.13 0.0 0.08 0.25 0.0 0.07 1.0 0.0 0.05 0.2 0.0 0.07 0.13 0.0 0.06 0.08 0.08
0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.03 0.04 0.01 0.04 0.05 0.02 0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.05 0.16 0.05 0.03 0.01 1.0 0.05 0.01 0.98 0.02 0.04 0.04 0.01 0.11 0.03 0.02 0.04 0.01 0.01
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.11 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.09 0.1 0.15 0.38 0.04 0.33 1.0 0.04 0.04 0.08 0.04 0.0 0.09 0.12 0.12 0.04 0.0
0.31 0.08 0.06 0.14 0.09 0.36 0.2 0.33 0.11 0.03 0.0 0.08 0.09 0.04 0.46 0.3 0.0 0.14 0.6 0.0 0.0 1.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.11 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.02 0.12 0.09 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01
0.31 0.26 0.25 0.28 0.29 0.3 0.22 0.3 0.31 0.28 0.27 0.23 0.3 0.32 0.32 0.33 0.25 0.22 0.29 0.24 0.41 1.0 0.33 0.38 0.45 0.4 0.42 0.39 0.23 0.22 0.2 0.2
0.02 0.02 0.05 0.03 0.05 0.12 0.11 0.09 0.13 0.05 0.05 0.04 0.02 0.01 0.06 0.02 0.08 0.16 0.05 0.04 0.27 1.0 0.04 0.03 0.26 0.05 0.16 0.12 0.13 0.12 0.13 0.06
0.09 0.03 0.08 0.05 0.24 0.17 0.28 0.27 0.38 0.3 0.17 0.36 0.05 0.1 0.19 0.1 0.13 0.26 1.0 0.07 0.05 0.65 0.06 0.08 0.37 0.21 0.3 0.4 0.16 0.19 0.08 0.06
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.05 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.14 0.0 0.07 1.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.03 0.03 0.11 0.05
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.21 0.13 0.0 0.04 0.39 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.33 0.07 0.87 0.0 0.0 1.0 0.21 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.37 0.16 0.2
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.23 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.35 0.0 0.86 0.2 0.12 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.03 0.1 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.12 0.05 0.08 0.0 0.05
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 1.0 0.01 0.01 0.06 0.03 0.06 0.06 0.02 0.02 0.01 0.01
0.07 0.04 0.05 0.08 0.1 0.11 0.03 0.11 0.1 0.04 0.1 0.04 0.03 0.0 0.11 0.02 0.03 0.02 0.13 0.01 0.04 1.0 0.02 0.03 0.03 0.19 0.11 0.05 0.04 0.05 0.04 0.04
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.6 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.05 0.08 0.13 0.12 0.32 0.19 0.22 0.28 0.09 0.18 0.12 0.05 0.05 0.04 0.05 0.12 0.18 0.99 0.21 0.03 0.7 0.1 0.07 0.3 0.32 0.69 1.0 0.15 0.18 0.07 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.1 0.37 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.12 0.05 0.0 0.05 0.06 0.0 0.07 0.41 0.12 0.38 0.84 0.0 0.14 1.0 0.11 0.12 0.0 0.0 0.0 0.51 0.1 0.06 0.0 0.05
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.13 0.02 0.02 0.05 0.03 0.11 1.0 0.03 0.06 0.06 0.06 0.0 0.03 0.02 0.02 0.08 0.05
0.07 0.03 0.02 0.06 0.0 0.11 0.12 0.18 0.24 0.16 0.19 0.12 0.01 0.01 0.03 0.0 0.07 0.0 0.04 0.01 0.18 1.0 0.04 0.04 0.36 0.06 0.17 0.0 0.06 0.07 0.07 0.04
0.03 0.06 0.04 0.02 0.07 0.2 0.11 0.18 0.1 0.21 0.19 0.05 0.06 0.09 0.07 0.07 0.09 0.1 0.07 0.09 0.3 1.0 0.08 0.1 0.1 0.19 0.12 0.14 0.13 0.1 0.08 0.07
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.02 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.16 0.26 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.05 0.11 0.08 0.08 0.04 0.11 0.05 0.09 0.09 0.06 0.04 0.05 0.18 0.05 0.29 0.16 0.07 0.08 1.0 0.56 0.04 0.73 0.42 0.23 0.19 0.02 0.04 0.04 0.19 0.08 0.11 0.11
0.04 0.03 0.01 0.05 0.07 0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.03 0.04 0.07 0.0 0.04 0.06 0.05 0.07 0.1 0.02 0.04 1.0 0.03 0.03 0.16 0.12 0.09 0.11 0.05 0.06 0.03 0.02
0.11 0.07 0.09 0.13 0.21 0.31 0.39 0.41 0.35 0.31 0.27 0.17 0.04 0.02 0.1 0.05 0.08 0.1 0.08 0.12 0.14 1.0 0.07 0.05 0.05 0.16 0.41 0.4 0.13 0.13 0.18 0.12
0.3 0.27 0.4 0.33 0.39 0.4 0.22 0.27 0.35 0.28 0.38 0.28 0.54 0.37 0.31 0.5 0.36 0.49 1.0 0.39 0.31 0.93 0.46 0.46 0.47 0.35 0.18 0.2 0.28 0.38 0.42 0.51
0.08 0.14 0.09 0.12 0.06 0.14 0.1 0.09 0.19 0.16 0.05 0.1 0.22 0.14 0.08 0.22 0.27 0.25 1.0 0.25 0.02 0.61 0.14 0.1 0.07 0.09 0.16 0.09 0.15 0.17 0.12 0.14
0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.01 0.02 0.04 0.17 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01
0.19 0.15 0.1 0.11 0.15 0.25 0.3 0.33 0.28 0.33 0.14 0.17 0.07 0.1 0.26 0.13 0.16 0.16 1.0 0.0 0.04 0.82 0.14 0.14 0.25 0.11 0.33 0.27 0.14 0.12 0.16 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0
0.16 0.22 0.23 0.19 0.3 0.17 0.23 0.23 0.21 0.19 0.16 0.21 0.43 0.24 0.29 0.64 0.31 0.28 1.0 0.01 0.1 0.36 0.36 0.38 0.05 0.14 0.12 0.17 0.37 0.34 0.25 0.38
0.03 0.02 0.03 0.01 0.05 0.01 0.02 0.05 0.02 0.07 0.05 0.03 0.08 0.08 0.03 0.09 0.04 0.01 0.43 0.0 0.05 1.0 0.03 0.05 0.0 0.08 0.04 0.18 0.03 0.04 0.06 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)