Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.2 0.27 0.14 0.42 0.29 0.18 0.03 0.29 0.13 0.12 0.13 0.03 0.35 0.64 0.33 0.24 -0.52 -1.06 0.22 -1.7 -1.59 -2.78 -0.43 -0.35 -0.91 0.63 0.75 0.73 -0.54 -0.48 -0.34 -0.39
-0.17 -0.23 -0.07 -0.07 0.32 0.11 0.23 0.39 0.24 0.01 0.01 -0.16 0.17 0.15 0.85 0.49 -0.39 -0.59 0.28 - -6.08 - -0.15 -0.05 -2.78 1.08 0.96 0.82 -0.17 -0.16 -0.19 -0.22
0.11 0.13 -0.01 0.06 0.19 0.04 -0.04 0.18 0.11 0.19 0.09 -0.04 0.24 0.38 0.31 0.41 -0.47 -0.63 0.11 -5.18 -3.74 -1.96 0.14 0.2 -0.6 0.69 0.49 0.52 -0.23 -0.13 0.07 0.29
-0.14 0.05 0.1 0.14 0.3 0.2 0.02 0.02 0.15 0.05 -0.11 -0.24 0.32 0.98 0.94 0.84 -0.93 -1.0 0.07 -4.71 -2.64 -1.78 -0.54 -0.29 -0.39 1.22 0.72 0.8 -0.68 -0.51 -1.47 -1.4
-0.17 -0.11 -0.06 0.07 0.01 0.06 0.03 0.13 0.18 0.1 0.0 -0.08 0.49 0.75 0.51 0.46 -0.31 -0.36 0.21 -5.51 -5.48 -2.55 0.27 0.32 -1.93 0.79 0.69 0.53 -0.26 -0.28 -0.2 -0.04
0.05 0.06 0.07 0.23 0.2 0.16 0.03 0.15 0.19 0.12 0.01 -0.11 0.36 0.2 0.55 0.56 -0.19 -0.64 0.33 -1.88 -2.68 -2.37 0.04 0.01 -2.11 0.68 0.71 0.64 -0.28 -0.15 -0.38 -0.28
-0.4 0.0 0.07 -0.05 0.42 0.4 0.49 0.18 0.33 0.31 0.05 -0.29 0.17 1.21 1.03 0.92 -0.9 -1.01 0.49 -6.52 -6.82 -6.1 -0.95 -0.44 -1.87 0.39 0.96 0.8 -0.52 -0.38 -1.43 -1.04
-0.22 -0.16 0.01 -0.02 0.04 0.04 0.01 -0.01 0.02 -0.1 -0.16 -0.31 0.36 0.51 1.0 0.6 -0.36 -0.79 0.51 -2.54 -4.73 -2.61 0.11 0.15 -1.89 1.02 0.96 1.07 -0.35 -0.22 -0.99 -1.02
0.03 -0.02 -0.02 0.03 0.27 0.19 -0.29 -0.06 0.08 -0.14 -0.17 -0.45 0.37 0.37 1.19 0.54 -0.35 -0.77 0.28 -2.17 -0.7 -1.47 0.08 0.16 0.32 0.03 0.16 0.47 -0.34 -0.21 -0.42 -0.25
0.06 -0.16 -0.23 -0.05 -0.01 -0.09 0.05 0.14 0.08 0.01 -0.01 -0.05 -0.05 0.47 0.99 0.08 -0.38 -0.55 0.14 -2.3 -2.01 -2.59 -0.12 0.07 0.09 0.76 0.81 0.65 -0.39 -0.31 -0.0 -0.05
-0.26 -0.21 -0.14 -0.05 -0.08 -0.07 -0.4 0.12 -0.05 0.04 0.15 0.26 0.32 0.74 1.02 0.4 -0.5 -0.97 -0.04 - -2.53 -2.02 -0.15 0.14 -1.86 0.9 0.88 0.76 -0.35 -0.26 -0.08 0.33
-0.06 -0.28 -0.21 -0.02 -0.05 0.08 0.06 0.35 -0.1 -0.1 -0.09 -0.24 0.35 0.64 1.12 0.26 -0.41 -0.65 -0.02 -2.59 -1.41 -2.14 -0.23 -0.12 -1.28 0.96 0.87 0.6 -0.25 -0.39 -0.11 0.04
-0.05 -0.17 -0.11 -0.04 0.16 -0.02 -0.11 -0.06 0.12 0.02 0.16 0.02 -0.31 0.4 0.63 -0.2 -0.12 -1.24 -0.23 -1.43 -1.14 -1.57 0.23 0.26 -0.23 1.08 0.76 0.77 -0.28 -0.09 -0.34 -0.25
0.09 0.18 0.13 0.28 0.22 0.12 -0.1 0.11 0.04 0.09 0.05 -0.12 0.3 0.55 0.65 0.33 -0.46 -0.79 -0.06 -1.77 -1.71 -2.09 -0.21 -0.1 -0.21 0.41 0.69 0.69 -0.39 -0.2 -0.27 -0.18
-0.12 -0.02 -0.43 0.27 0.16 0.18 0.62 0.4 0.49 0.15 0.07 -0.22 0.36 1.07 0.98 0.94 -0.73 -1.52 0.52 -5.27 -3.46 -1.17 -0.92 -0.52 -1.94 0.35 0.84 0.47 -0.62 -0.25 -1.42 -0.74
0.07 0.08 0.1 0.22 0.25 0.19 0.13 0.19 0.2 0.12 0.15 -0.1 0.19 0.62 0.82 0.71 -0.59 -1.27 -0.12 -1.05 -1.5 -2.47 -0.15 0.08 -0.65 0.59 0.35 0.48 -0.41 -0.32 -0.56 -0.48
-0.29 -0.07 -0.07 0.03 0.31 0.35 0.2 0.13 0.01 -0.09 0.05 -0.41 0.06 0.09 0.36 0.48 -0.36 -0.56 0.22 -1.25 -1.54 -0.86 -0.14 -0.06 -0.8 1.09 0.85 1.16 -0.38 -0.23 -1.27 -1.36
0.07 -0.14 -0.09 0.05 0.15 0.07 0.08 0.13 0.33 0.29 0.35 0.16 0.27 0.53 1.37 0.15 -0.6 -1.14 -0.05 -1.35 -3.61 -3.17 -0.35 -0.25 -1.32 1.0 0.66 0.63 -0.66 -0.56 -0.71 -0.28
0.04 0.09 -0.0 0.16 0.18 0.24 0.11 0.32 0.26 0.24 0.27 0.05 0.12 0.5 0.73 0.46 -0.47 -0.85 0.13 -2.65 -2.26 -2.43 -0.19 -0.1 -1.2 0.89 0.42 0.62 -0.34 -0.25 -0.46 -0.43
-0.06 -0.12 0.01 0.07 0.28 0.23 0.05 0.32 0.11 -0.1 -0.0 -0.27 0.08 0.14 0.91 0.03 -0.54 -1.28 0.23 -0.72 -0.78 -2.14 -0.35 -0.23 -0.03 0.72 0.87 0.79 -0.5 -0.37 -0.49 -0.36
0.06 -0.09 -0.13 -0.04 0.15 0.29 0.11 0.18 0.03 -0.18 -0.09 -0.5 0.18 0.49 1.03 0.25 -0.63 -1.02 0.21 -2.75 -1.25 -2.78 0.11 0.2 0.41 0.58 0.69 0.7 -0.49 -0.31 -0.44 -0.48
0.11 0.08 -0.03 0.14 0.22 -0.03 -0.03 0.17 0.15 0.0 0.14 0.03 0.72 1.0 0.57 0.57 -0.91 -2.0 0.12 -3.32 -2.88 -4.85 -0.33 -0.28 -0.92 1.35 0.85 0.87 -0.79 -0.71 -1.01 -0.91
-0.13 0.13 0.3 0.12 0.19 0.21 -0.06 0.31 0.23 -0.07 -0.28 -0.03 0.64 0.6 0.85 0.58 -0.84 -1.71 0.23 -3.51 -4.66 -2.72 -0.2 -0.15 -1.62 0.89 0.96 0.97 -0.67 -0.39 -0.9 -0.38
-0.11 -0.32 -0.43 -0.09 0.09 -0.22 -0.0 0.32 0.37 0.29 0.33 0.09 0.34 -0.03 0.28 0.57 -0.71 -1.12 0.3 -2.24 -1.74 -2.24 -0.07 0.24 -0.51 0.96 0.84 0.78 -0.22 -0.12 -0.43 -0.33
-0.23 -0.02 0.01 0.07 -0.01 -0.01 0.02 0.04 -0.11 -0.0 -0.11 -0.27 0.3 0.61 0.69 0.49 -0.57 -1.07 0.02 -3.35 -1.34 -2.0 -0.13 -0.08 0.32 0.85 0.95 1.02 -0.59 -0.47 -0.51 -0.43
-0.17 0.06 -0.01 0.04 0.07 -0.23 -0.02 0.01 -0.06 -0.31 -0.01 -0.28 0.25 0.72 1.22 0.53 -0.62 -0.83 0.17 -2.93 -2.33 -2.5 -0.29 -0.13 -0.31 0.91 0.9 0.85 -0.57 -0.5 -0.34 -0.22
-0.16 0.06 -0.03 0.18 -0.04 0.02 -0.09 0.09 -0.01 -0.06 0.0 -0.14 -0.65 0.72 0.58 -0.04 -0.5 -0.89 0.02 -2.19 -2.25 -1.91 -0.19 -0.27 -0.01 1.53 0.95 0.88 -0.6 -0.55 -0.3 -0.19
-0.03 -0.1 -0.07 0.02 0.02 0.03 0.12 0.24 0.15 0.17 0.11 0.04 0.07 0.57 0.52 0.18 -0.48 -1.01 0.24 -2.99 -2.29 -1.94 -0.15 -0.12 -0.58 0.86 0.85 0.77 -0.38 -0.31 0.02 -0.02
-0.22 -0.22 -0.2 -0.05 -0.09 -0.01 0.28 0.42 0.45 0.45 0.42 0.24 0.1 0.64 1.11 0.1 -0.57 -0.69 -0.27 -5.0 -2.93 -3.2 -0.13 0.05 -1.15 0.84 0.66 0.63 -0.47 -0.47 -0.39 -0.11
0.11 0.08 -0.18 -0.04 0.25 0.21 0.07 0.15 -0.06 -0.08 0.02 -0.13 -0.01 0.38 0.86 0.44 -0.66 -1.25 0.22 -3.61 -3.02 -3.84 0.16 0.43 -1.27 0.82 0.94 0.9 -0.28 -0.19 -0.33 -0.32
0.08 0.22 0.15 0.19 0.11 -0.02 0.23 0.28 0.25 0.34 0.31 0.13 0.22 0.39 0.65 0.41 -0.44 -0.88 -0.01 -3.91 -3.5 -2.87 -0.1 -0.02 -2.71 0.91 0.68 0.71 -0.47 -0.31 -0.33 -0.27
0.1 0.11 0.03 0.14 0.1 -0.02 0.08 0.13 0.26 0.24 0.23 0.22 0.28 0.7 0.62 0.41 -0.55 -2.11 -0.14 -4.06 -3.45 -3.52 -0.28 -0.15 -1.12 1.14 0.88 0.96 -0.58 -0.49 -0.31 -0.54
0.08 0.28 0.03 -0.02 0.17 -0.02 -0.13 -0.29 -0.32 -0.24 -0.15 -0.43 0.46 0.7 0.63 0.48 -0.64 -0.59 0.01 -0.92 -2.31 -2.98 -0.12 0.07 -1.16 1.0 1.1 1.11 -0.54 -0.46 -0.62 -0.56
-0.23 -0.17 -0.05 -0.0 0.07 -0.07 -0.04 0.07 0.17 0.22 0.18 0.09 -0.07 0.56 0.43 0.09 -0.41 -1.11 0.05 -3.37 -1.73 -3.1 -0.06 -0.01 -0.55 1.34 1.01 0.94 -0.28 -0.16 -0.69 -0.43
-0.01 -0.16 -0.17 0.06 0.13 0.12 0.13 0.33 0.3 0.29 0.21 0.12 0.14 0.48 0.75 0.24 -0.42 -0.77 0.07 -1.75 -1.85 -2.58 -0.16 0.01 -0.16 0.84 0.51 0.53 -0.34 -0.28 -0.48 -0.53
-0.22 -0.09 0.15 0.2 0.28 0.37 0.16 0.27 0.05 -0.06 -0.14 -0.38 0.36 0.39 0.46 0.53 -0.56 -1.17 0.19 -1.6 -0.88 -1.65 -0.26 -0.21 -0.27 0.93 0.83 0.96 -0.45 -0.42 -1.04 -1.11
0.03 -0.21 -0.18 0.14 0.07 -0.04 -0.14 0.08 0.2 0.05 -0.03 -0.09 0.02 0.33 0.41 0.54 -0.42 -0.87 0.59 -3.18 -1.96 -3.49 -0.12 0.05 -0.9 1.09 0.87 0.89 -0.41 -0.15 -0.29 -0.06
-0.04 0.14 0.1 0.37 0.4 0.33 0.21 0.28 0.13 0.04 -0.03 -0.28 0.42 0.42 0.84 0.55 -0.87 -1.74 0.33 -2.96 -3.27 -1.29 -0.54 -0.42 -0.88 0.53 1.08 1.31 -0.73 -0.53 -1.55 -1.47
0.0 0.02 0.02 0.07 0.3 -0.13 -0.11 0.18 0.18 -0.03 -0.11 -0.18 0.12 0.16 0.43 0.2 -0.51 -1.07 -0.09 -4.59 -1.49 -1.69 -0.13 0.14 -1.49 1.15 1.18 1.06 -0.52 -0.54 -0.05 -0.04
-0.32 -0.27 -0.39 -0.09 -0.09 -0.12 -0.13 -0.01 0.15 0.06 0.02 -0.0 0.25 0.68 0.69 0.31 -0.26 -1.6 -0.86 -2.51 -2.09 -2.81 -0.17 0.16 0.29 1.85 0.6 0.63 -0.46 -0.43 -0.23 -0.75
-0.05 0.15 0.14 0.18 0.25 0.21 0.13 0.31 0.06 0.12 0.04 0.05 0.3 0.48 0.93 0.26 -0.58 -1.03 0.17 -2.49 -1.62 - -0.07 0.05 -0.5 1.01 0.68 0.56 -0.67 -0.57 -0.76 -0.68
-0.22 -0.07 -0.31 0.11 0.1 -0.02 -0.04 0.17 0.05 -0.13 -0.04 -0.21 0.29 0.68 0.94 0.49 -0.71 -1.49 0.26 -3.14 -2.55 -1.6 0.34 0.5 -0.87 0.92 1.1 0.96 -0.69 -0.47 -1.29 -1.11
-0.74 -0.68 -0.79 -0.52 -0.19 -0.21 -0.14 -0.18 0.16 -0.42 -0.75 -0.6 0.47 0.75 0.93 0.09 -0.78 -1.23 0.36 -0.97 -1.05 -4.32 0.2 0.35 -0.47 1.36 1.54 1.06 -0.53 -0.18 -0.87 -0.61
-0.03 -0.17 -0.15 0.15 0.02 -0.22 -0.23 -0.07 0.19 0.01 0.12 -0.14 0.38 0.31 0.98 0.42 -0.5 -2.13 0.24 -4.12 -2.46 -2.94 -0.1 -0.01 -0.27 1.35 1.04 0.82 -0.56 -0.47 -0.52 -0.4
-0.13 -0.03 -0.05 -0.04 0.28 0.01 -0.06 0.32 0.18 0.21 0.2 0.05 0.38 0.23 0.52 0.46 -0.47 -0.88 0.14 -1.91 -5.4 -5.67 -0.03 0.26 -1.46 1.07 0.57 0.51 -0.15 -0.16 -0.1 0.03
-1.41 -0.56 -1.18 -0.72 -0.39 -0.59 -1.93 -0.51 -1.05 -1.97 -0.97 -1.15 1.33 1.47 1.14 0.98 -0.43 -0.84 0.83 - -5.98 - 0.69 0.46 -4.67 1.58 1.0 1.15 -0.1 0.28 -0.85 -1.57
-0.07 -0.35 0.1 0.08 -0.04 0.07 0.15 0.32 0.33 0.37 0.19 -0.07 0.31 0.1 0.16 0.54 -0.63 -1.3 0.31 -3.36 -1.7 -4.15 -0.04 0.13 -1.33 0.96 1.07 0.83 -0.34 -0.33 -0.35 -0.31
0.07 0.04 0.02 0.0 -0.05 0.03 -0.14 0.0 -0.02 0.01 0.14 -0.17 0.67 0.43 0.59 0.69 -0.23 -0.67 0.4 -7.18 -3.43 -3.68 0.21 0.26 -1.59 0.68 0.67 0.54 -0.2 -0.14 -0.12 -0.02
-0.03 0.03 -0.24 0.06 0.39 0.13 -0.1 0.27 0.21 -0.04 0.01 -0.06 0.56 0.15 0.6 0.75 -0.84 -1.13 0.75 -3.3 -5.29 -2.02 -0.3 -0.11 -0.69 1.12 0.81 0.79 -0.53 -0.43 -0.75 -0.77
-0.93 -1.89 -0.52 -0.96 -1.71 -0.82 -1.15 -0.33 -0.22 -0.75 -0.73 -0.94 1.2 1.04 1.3 1.27 -0.7 0.07 -0.2 - -5.19 - 0.5 0.51 - 1.39 1.48 1.43 -0.82 -0.58 -0.37 -0.86
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-0.25 -0.1 0.02 0.18 0.32 0.26 0.29 0.3 0.16 0.07 0.05 -0.12 -0.14 1.03 1.02 0.12 -0.4 -0.72 0.17 -1.86 -2.78 -2.73 -0.31 -0.31 -1.09 0.57 0.85 0.77 -0.58 -0.52 -0.58 -0.32
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0.06 -0.09 0.02 0.06 0.08 0.09 -0.01 0.2 0.01 -0.06 -0.04 -0.12 0.04 -0.11 0.34 0.27 -0.21 -0.59 0.27 -3.79 -3.57 -3.19 -0.17 -0.05 -0.32 1.08 1.02 1.04 -0.24 -0.13 -0.15 -0.19
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0.04 0.3 0.14 0.27 0.35 0.08 -0.0 0.28 0.14 0.17 0.02 -0.12 0.39 0.55 0.59 0.57 -0.55 -0.72 0.22 -2.23 -1.91 -2.42 -0.2 -0.03 -0.99 0.85 0.6 0.83 -0.62 -0.46 -1.12 -0.82
-0.22 -0.22 -0.19 0.07 0.07 -0.0 -0.1 0.17 0.31 0.16 0.23 0.04 0.77 0.55 0.85 0.26 -0.75 -0.45 -0.27 -4.76 -3.2 -3.69 0.12 0.34 -0.91 1.18 0.75 0.45 -0.59 -0.46 -0.43 -0.22
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0.07 -0.01 0.01 0.22 0.21 0.06 0.2 0.3 0.36 0.18 0.14 0.01 0.23 0.15 0.62 0.64 -0.55 -0.95 0.39 -5.95 -3.43 -6.01 -0.12 -0.02 -1.01 0.65 0.84 0.49 -0.49 -0.37 -0.14 0.15
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.