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Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.03 -0.07 0.13 0.17 0.23 0.1 0.14 0.1 0.14 0.32 0.22 0.09 0.19 -0.57 0.08 0.3 -0.29 -0.73 0.53 -8.17 -7.76 -5.87 0.41 0.34 -4.62 0.88 0.63 0.64 0.16 0.07 0.03 0.11
0.12 0.43 0.47 0.48 0.88 0.55 0.46 0.35 0.08 0.15 0.04 -0.2 0.22 -0.42 1.48 0.1 0.15 -1.01 0.39 -6.1 -5.0 -5.45 -0.1 -0.15 -3.18 -0.68 0.16 0.23 0.05 0.17 -1.09 -0.96
-0.01 -0.03 0.1 0.09 0.31 0.31 0.19 0.13 0.39 0.22 0.29 0.1 0.39 -0.35 0.06 0.63 -0.05 -0.58 0.46 - -5.77 -2.46 0.07 0.08 - -0.02 0.24 0.31 0.13 0.17 0.39 0.56
-0.36 -0.02 0.13 0.08 0.22 0.11 0.18 -0.01 -0.15 -0.24 -0.22 -0.36 0.41 0.69 0.54 0.66 -0.06 0.04 0.09 -2.63 -3.02 -1.71 0.38 0.42 -2.54 0.45 0.65 0.82 -0.17 -0.01 -0.58 -0.66
0.2 -0.17 -0.19 -0.19 -0.02 -0.29 -0.34 -0.03 -0.12 0.0 -0.06 -0.12 0.13 0.12 -0.54 0.48 -0.85 -0.95 0.63 -2.15 -0.99 -3.81 -0.32 -0.1 0.1 1.48 1.15 1.17 -0.52 -0.5 -0.24 -0.32
-0.08 -0.17 -0.28 -0.08 -0.08 -0.23 -0.16 0.04 -0.03 0.03 -0.03 -0.04 -0.12 0.07 -0.52 0.19 -0.5 -0.9 0.35 -6.15 -4.08 -6.58 0.02 0.19 -1.68 1.57 1.25 1.16 -0.11 -0.02 0.45 -0.01
-0.28 -0.08 0.07 0.04 0.08 -0.06 0.12 0.28 0.45 0.33 0.46 0.21 -0.27 -0.56 -0.2 -0.03 0.27 -0.5 -0.0 -2.56 -5.27 -5.5 0.5 0.45 -1.33 0.91 0.56 0.78 0.17 0.26 -0.29 -0.3
0.36 0.21 0.13 0.05 0.09 -0.17 0.07 0.07 0.1 0.16 0.16 0.24 0.22 -0.14 -0.26 0.67 0.3 -0.13 0.67 -6.14 -7.39 -4.55 0.41 0.33 -4.29 0.49 0.25 0.41 0.45 0.5 -0.67 -0.68
-0.36 -0.26 -0.07 0.18 0.39 0.48 0.46 0.42 0.12 0.04 -0.28 -0.46 -0.06 0.02 1.21 0.44 -0.09 -0.34 0.58 -2.38 -3.67 -2.35 0.18 0.21 -2.12 -0.03 0.43 0.49 -0.04 0.25 -0.59 -0.29
-0.87 -0.19 0.38 0.0 -0.05 0.21 0.19 -0.13 -0.06 0.04 -0.42 -0.55 0.63 -0.69 0.51 0.8 -0.48 -0.7 1.05 - - - -0.24 -0.02 -4.64 1.24 1.06 1.11 -0.43 -0.15 -0.14 -0.13
-0.11 0.11 0.13 0.04 -0.03 -0.18 0.09 0.26 0.21 0.29 0.4 0.22 -0.17 -0.69 -0.9 -0.04 -0.34 -0.53 0.24 -5.49 -5.34 -5.52 -0.04 -0.08 -2.88 1.16 1.07 0.94 -0.04 -0.11 0.49 0.61
-0.19 -0.01 -0.01 0.13 -0.01 -0.03 0.49 0.37 0.43 0.47 0.02 0.2 0.26 -0.45 0.35 0.57 -0.22 -0.51 0.66 - - -5.26 0.14 0.09 -4.22 0.48 0.01 0.45 0.52 0.51 -0.24 -0.1
0.02 0.04 0.18 0.05 0.18 0.08 0.15 0.3 0.28 0.28 0.24 0.04 0.21 -0.54 -0.83 0.4 -0.01 -0.24 0.12 -4.54 -2.19 -3.67 0.39 0.16 -2.52 0.55 0.69 0.77 0.17 0.3 -0.06 -0.1
0.31 0.23 -0.11 0.2 -0.08 0.22 0.08 0.16 0.16 0.31 0.1 0.19 0.35 -0.83 -0.32 0.49 -0.09 -0.78 0.4 -3.48 -3.91 -3.53 0.21 0.25 -1.13 1.03 0.67 0.65 0.06 0.07 -0.51 -0.46
0.16 -0.3 -0.32 -0.13 -0.1 -0.3 -0.01 0.3 0.22 0.43 0.39 0.22 0.25 0.35 -0.13 0.44 -0.92 -2.06 1.3 -3.58 -2.71 -7.47 0.14 0.42 -2.25 1.35 0.42 0.81 -0.12 0.07 -1.06 -1.1
-0.58 -0.37 -0.61 -0.4 -0.01 -0.09 -0.05 0.17 0.05 0.02 -0.08 -0.38 0.16 -0.42 0.69 0.37 -0.07 0.06 0.82 -5.08 -8.6 - 0.36 0.49 -3.17 1.07 0.85 0.65 0.29 0.18 0.14 0.12
-0.38 -0.32 -0.26 -0.03 -0.06 -0.24 -0.1 -0.18 -0.15 -0.14 -0.2 -0.36 0.43 0.51 0.46 0.42 -0.56 -1.42 0.26 -5.09 -7.35 -5.01 0.02 0.13 -3.3 1.93 1.25 1.48 -0.46 -0.31 -0.73 -1.27
-0.38 -0.1 -0.18 0.01 0.23 0.07 0.38 0.35 0.3 0.34 0.05 -0.14 0.42 -0.12 0.35 0.59 -0.1 -0.35 0.28 -7.74 -3.0 - 0.24 0.33 -3.47 0.75 0.66 0.82 0.09 0.27 -0.8 -0.53
0.12 0.35 0.29 0.41 0.35 0.22 0.21 0.15 0.29 0.19 0.21 0.07 0.11 0.15 -0.29 0.28 -0.39 -1.13 -0.53 -0.96 -2.15 -0.95 0.57 0.26 -1.27 0.52 0.45 0.76 -0.25 -0.02 -0.8 -1.21
-0.06 0.27 0.31 0.28 0.52 0.39 0.49 0.33 0.02 -0.07 0.07 -0.4 -0.03 -0.49 0.97 0.24 -0.01 -0.18 0.33 - - -7.35 0.32 0.3 -3.36 0.14 0.58 0.71 -0.03 0.04 -0.34 -0.65
0.09 0.12 0.21 0.22 0.26 0.23 0.02 0.09 0.13 0.07 -0.18 -0.17 0.22 -0.27 0.54 0.27 -0.06 -0.42 0.62 -3.58 -2.34 -1.12 0.14 0.23 -2.63 0.33 0.48 0.57 -0.08 0.15 -0.05 -0.12
0.11 -0.29 -0.36 -0.16 -0.13 -0.29 -0.37 0.01 -0.05 0.08 0.01 -0.15 0.45 0.26 0.12 0.39 -0.58 -0.91 0.87 -5.6 -4.0 -6.67 0.07 0.16 -0.13 1.14 1.14 0.94 -0.36 -0.4 -0.11 0.03
-0.14 -0.1 0.14 -0.02 0.1 0.15 0.19 0.42 0.54 0.52 0.4 0.04 0.58 0.0 0.05 0.78 -0.36 -1.23 0.41 -4.24 - - 0.44 0.37 -2.37 0.48 -0.04 0.29 0.23 0.32 -0.48 -0.39
-0.58 -0.6 -0.48 -0.41 -0.15 -0.52 -0.23 0.01 0.02 -0.04 -0.13 -0.45 0.66 0.65 0.07 0.74 -0.09 -0.35 0.61 -0.59 -3.09 -1.3 -0.09 0.11 -2.2 1.04 0.74 0.71 0.03 0.04 0.1 0.11
-0.27 -0.28 -0.13 0.21 0.08 0.09 -0.15 0.59 -0.07 0.31 0.32 -0.41 0.33 0.14 0.27 0.67 -0.4 -1.12 0.68 -2.73 - - 0.25 0.34 -1.32 0.38 0.51 0.48 0.13 0.17 0.31 0.01
-0.15 -0.14 0.08 0.3 0.33 0.3 0.34 0.18 0.13 0.04 -0.05 -0.21 0.35 0.22 1.1 0.57 0.03 -0.64 0.62 - -7.8 - 0.11 0.21 -4.03 0.24 0.35 0.35 0.07 0.27 -0.47 -0.38
-0.02 0.0 -0.1 0.1 -0.01 -0.25 0.03 0.24 0.14 0.28 0.3 0.24 0.28 -0.06 0.44 0.4 -0.16 -1.33 0.54 - -9.85 -8.05 -0.19 -0.22 -8.25 0.79 0.53 0.63 0.21 0.22 0.52 0.5
0.0 0.03 0.07 0.06 0.17 0.12 -0.2 -0.1 -0.17 -0.16 -0.28 -0.27 0.4 0.33 0.93 0.65 0.12 -0.43 0.59 -4.85 -5.11 - 0.41 0.32 -2.51 0.2 0.31 0.56 0.13 0.06 0.21 0.09
-0.11 0.06 -0.03 -0.02 0.04 -0.19 0.01 -0.02 -0.07 0.13 -0.08 -0.02 0.23 0.06 0.55 0.4 0.07 -0.51 0.48 - -4.75 -3.97 -0.15 -0.14 -3.43 0.79 0.9 0.88 0.29 0.28 0.18 0.04
-0.28 0.01 -0.11 0.19 0.14 0.01 0.3 0.17 0.13 -0.25 -0.21 -0.26 0.22 -1.13 -0.12 0.79 -0.16 -0.41 0.54 -6.11 - - 0.14 0.16 -1.35 1.34 0.9 1.1 0.43 0.14 -0.83 -1.04
-0.63 -0.3 -0.7 -0.35 -0.01 0.78 0.49 0.8 0.33 0.31 -0.19 -0.58 1.03 -1.0 1.13 0.81 -1.0 -0.7 -0.05 - - - 0.78 1.27 -1.79 -0.37 0.32 0.46 -0.26 0.22 -1.28 -1.13
-0.12 -0.3 -0.47 0.04 0.28 0.1 0.2 0.49 0.25 0.67 0.23 -0.0 0.26 -1.05 -0.12 0.61 -0.2 -0.05 0.41 - - - 0.24 0.43 -2.49 1.07 0.27 0.83 0.29 0.4 -0.82 -0.9
0.06 0.03 0.03 0.16 0.11 0.21 -0.15 0.07 -0.05 -0.08 -0.11 -0.18 0.28 0.26 0.37 0.49 -0.25 -0.37 -0.08 -0.59 -2.12 -0.6 0.18 0.26 -0.48 0.36 0.66 0.68 -0.18 -0.16 -0.51 -0.55
0.0 0.06 -0.1 0.15 0.13 0.15 0.13 0.14 0.25 0.38 0.09 0.09 0.21 -0.5 0.03 0.31 -0.03 -0.34 0.51 -7.1 -3.58 -8.24 0.14 0.1 -1.69 0.63 0.73 0.69 0.14 0.15 -0.08 0.03
0.14 0.13 0.3 0.07 0.21 0.1 0.07 0.05 0.02 0.06 -0.07 -0.05 0.42 0.15 1.0 0.54 -0.25 -0.71 0.81 -4.37 -7.63 -0.98 -0.3 -0.16 -1.6 0.26 0.61 0.6 -0.29 -0.38 -0.35 -0.14
-0.03 -0.27 -0.1 -0.11 0.11 -0.06 -0.07 0.18 0.42 0.38 0.33 -0.02 0.2 -0.33 -0.84 0.35 -0.61 -0.92 1.29 -2.44 -4.31 -7.65 0.56 0.39 -3.9 1.13 0.28 0.55 0.03 -0.05 -0.23 0.13
-0.09 -0.1 0.02 -0.11 -0.01 -0.27 -0.09 -0.24 -0.19 0.01 0.01 -0.29 0.5 0.79 0.73 0.77 -0.2 -1.16 0.32 - - - 0.05 -0.23 -4.36 1.03 1.2 1.28 -0.29 -0.12 -0.59 -0.56
-0.27 -0.37 -0.28 -0.18 -0.12 -0.11 -0.26 0.16 0.0 -0.04 0.1 -0.1 0.41 -0.11 -0.65 0.35 -0.42 -0.94 0.79 -2.84 -2.34 -5.0 0.15 0.36 -0.08 1.47 0.94 0.78 -0.03 -0.07 -0.24 -0.24
-0.12 0.11 0.21 0.08 -0.02 0.04 0.06 0.1 -0.06 -0.04 0.17 -0.21 0.17 0.42 0.01 0.24 -0.24 -0.84 -0.26 - -4.59 - 0.61 0.22 -2.45 0.9 1.21 1.36 -0.32 -0.07 -0.7 -0.29
-0.07 -0.42 -0.16 0.0 -0.17 -0.03 0.02 0.08 -0.1 -0.45 0.02 -0.4 0.45 0.07 0.17 0.34 -0.22 -0.45 0.66 -3.77 -2.18 -0.38 -0.17 0.11 0.08 0.97 1.05 0.81 -0.24 -0.24 -0.64 -0.25
-0.12 0.14 0.06 0.15 0.39 0.51 0.43 0.34 0.19 0.11 -0.06 -0.28 0.05 -0.05 1.07 0.32 -0.16 -0.71 0.47 -2.51 -3.15 -0.81 0.03 0.1 -1.28 -0.08 0.63 0.72 -0.12 -0.04 -1.26 -1.18
0.08 0.16 0.16 0.48 0.25 0.19 0.13 0.37 0.21 0.22 0.45 0.13 -0.64 -0.44 -1.83 -0.2 -0.21 -0.97 -0.55 -8.13 -1.11 -4.07 0.36 0.46 -1.0 0.63 1.16 1.33 -0.14 -0.02 -0.51 -0.68
-0.28 -0.14 -0.11 0.14 0.27 0.06 -0.09 0.45 0.41 0.46 0.17 0.05 0.01 -0.88 -1.33 0.36 -0.03 -0.71 0.39 -8.63 - - 0.23 0.15 -3.11 1.24 0.86 0.91 0.35 0.37 -0.37 -0.16
-0.25 -0.25 -0.36 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.21 0.11 0.02 -0.07 0.31 -0.1 -0.12 0.59 -0.43 -0.62 0.8 -3.57 -4.43 -8.66 0.41 0.74 -0.8 0.95 0.6 0.49 0.05 0.04 -0.05 -0.04
0.01 0.2 0.19 0.19 0.15 0.26 0.05 -0.0 0.03 0.07 0.04 -0.1 0.28 -0.17 0.52 0.56 0.11 -0.05 -0.19 -1.5 -2.03 -1.91 0.16 0.23 -0.01 0.08 0.25 0.2 -0.05 -0.02 -0.03 -0.36
-0.14 0.08 -0.16 0.07 -0.03 -0.13 -0.07 0.05 -0.01 0.03 0.16 -0.08 -0.17 -0.33 0.39 0.1 -0.27 -1.01 0.94 -2.26 -0.88 -2.18 -0.26 -0.15 0.2 1.18 1.06 0.77 -0.4 -0.32 -0.6 -0.54
-0.02 -0.06 -0.17 0.14 -0.1 0.14 -0.2 0.14 0.01 -0.06 -0.3 -0.2 -0.14 -0.12 0.29 0.32 0.04 -0.91 0.53 -3.08 -3.3 -3.37 0.25 0.23 -1.88 0.86 1.31 1.21 -0.01 0.01 -0.28 -0.43
-0.2 -0.4 0.1 -0.17 -0.29 0.13 -0.33 -0.24 -0.32 -0.22 -0.31 -0.48 0.5 -0.22 0.5 0.91 -0.25 -1.02 0.78 -1.47 -2.23 -0.69 -0.19 -0.3 -0.35 0.84 1.25 1.19 -0.26 -0.25 -0.74 -0.58
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-0.04 -0.36 -0.69 -0.18 -0.06 -0.14 -0.31 -0.19 0.05 -0.08 -0.24 -0.15 0.41 0.21 0.3 0.55 -0.55 -0.88 0.75 -3.86 -1.57 -2.12 0.01 0.35 -0.17 1.51 0.67 0.57 0.09 0.1 -0.36 -0.41
-0.23 -0.35 -0.33 -0.39 -0.27 -0.28 -0.33 0.12 -0.02 0.15 -0.04 -0.01 0.62 -0.07 0.49 0.75 -0.41 -0.9 0.3 -5.24 -6.96 -3.53 0.18 0.36 -3.3 1.86 0.65 0.84 -0.09 0.0 -0.36 -0.38
-0.43 -0.27 0.2 0.06 0.82 0.35 0.49 0.27 -0.11 -0.16 -0.01 -0.52 0.09 -0.69 0.69 0.24 -0.11 -0.09 0.33 -3.48 -3.09 -0.65 0.31 0.46 -1.61 0.25 0.83 0.75 -0.19 0.05 -1.17 -0.58
-0.09 0.17 -0.02 0.31 0.36 0.4 0.35 0.45 0.18 0.12 -0.0 -0.21 -0.25 -0.75 -0.35 0.2 -0.05 -0.27 0.07 -5.27 -2.51 -1.38 0.07 0.18 -0.69 0.78 0.64 0.97 0.13 0.03 -0.47 -0.5
0.01 0.31 0.21 0.34 0.38 0.14 0.22 0.05 0.21 0.26 0.22 -0.11 0.1 0.3 0.07 0.35 -0.41 -1.72 -0.43 -2.42 -3.33 -4.72 0.69 0.38 -3.44 0.84 0.82 1.07 -0.29 -0.09 -0.71 -0.94
-0.14 0.11 0.17 0.16 0.42 0.38 0.25 0.03 -0.26 -0.17 -0.47 -0.61 0.55 0.16 1.05 0.39 0.02 -0.31 0.57 -5.63 -5.92 -4.59 0.26 0.36 -1.68 0.16 0.75 0.76 -0.13 -0.0 -0.77 -0.55
-0.34 -0.03 0.03 0.17 0.57 0.34 0.31 0.53 0.32 0.33 0.25 -0.11 0.01 -1.4 0.65 0.46 -0.36 -1.26 0.79 -5.71 - -2.49 0.5 0.58 -2.51 0.63 0.65 0.34 -0.06 0.18 -0.9 -1.08
0.13 0.02 -0.2 -0.13 -0.08 -0.1 0.16 0.35 0.18 0.12 -0.03 0.24 0.13 -0.32 0.13 0.27 -0.16 -0.5 0.37 -3.44 -2.11 -1.79 0.2 0.2 -0.5 1.01 0.51 0.55 -0.02 0.01 -0.15 -0.06
-0.2 -0.34 -0.14 -0.02 0.05 -0.32 -0.38 -0.11 -0.26 -0.16 -0.26 -0.4 0.73 -0.44 -0.07 0.71 -0.23 -1.25 0.97 - - - 0.37 0.78 -4.42 1.41 0.84 0.77 0.16 0.24 -0.14 -0.07
-0.29 0.11 0.17 0.39 0.62 0.54 0.48 0.33 0.03 -0.03 -0.16 -0.41 0.31 -0.02 1.14 0.41 -0.49 -0.68 0.09 -1.32 -3.64 -1.36 -0.21 -0.09 -1.38 0.14 0.93 0.95 -0.58 -0.51 -1.2 -1.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.